4S33A

Erk2 r65s mutant complexed with amp-pnp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
352
structure length
347
Chain Sequence
AAAAGPQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQSTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Multiple mechanisms render Erk proteins MEK-independent
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 112
structure length 347
sequence length 352
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4s33A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4s33A01
2PULA 4ZZOA 3DT1A 2W06A 4C3FA 5AIRA 4IVDA 3MESA 1YW2A 4FT5A 2WQMA 4JBPA 5FBNC 1NA7A 4PL5A 1H1RA 1UU7A 4D28A 5CX9A 4XYFA 4ZIMA 3B2TA 3LPBA 3A62A 1XBAA 3W33A 4FKIA 4FNWA 2OZAB 4WNPA 1KV1A 3DQWA 5L6PA 2QOLA 3MIYA 3ORKA 4RA4A 4IJ9A 4EOOA 3DCVA 5E92A 4RLKA 1BYGA 3WBLA 5HBEA 5DN3A 4YBKA 5A4TA 5IA4A 2X7OA 4K2RA 3FXZA 5A46A 4UZHA 3R8MA 3W2OA 4X21A 4PDPA 4FV2A 2QOOA 4DN5A 3C4WA 5CSXA 4D2RA 4AN2A 1VEBA 5E8SA 4QYEA 2W9FB 1BMKA 2XCHA 3ACJA 5DR2A 5TT7A 5IMXA 5LMBA 3II5A 4F6UA 4M7IA 3A7FA 4ZTMA 1V0BA 4A9RA 4TWCA 3H0ZA 4W8EA 4BYJA 4RQKA 3CD8A 4E93A 3C9WA 3OUNB 2GNFA 2P33A 3QTIA 4LG4A 3JS2A 1M14A 5IH6A 4YZBA 1CDKA 5EKOA 1S9IA 2OJFE 2W9ZB 4A9UA 3UIUA 4ANNA 4KIKB 3G9NA 5IQAA 2I0HA 4DGGA 3OWJA 3BE9A 4MNFA 3QQFA 4JQEA 2UZNA 4BDHA 4BDAA 4JDIA 5AAGA 2C4GA 1QPCA 4RIXB 1YWNA 4OTPA 1ZWSA 3C4XA 4ALWA 5IA1A 2DQ7X 3EN6A 4FKGA 3M11A 2XP2A 4GIHA 3OWLA 5GZ8A 3RK9A 3F6XA 3UG2A 3LM5A 3SX9A 2QODA 3ULZA 5JK3A 3LLAA 3R7IA 4TYHA 1WVYA 5EM7A 1H0VA 5T3QA 3POZA 3O51A 2JDVA 1J7LA 3LKMA 3DKCA 4QNAA 3U4WA 4J96A 4F9YA 3AG9A 4FGBA 4JBVA 3AC2A 5EW9A 2XNGA 3TKHA 4O83A 3R83A 2VTJA 2OIDA 4C34A 4DLIA 3MVLA 2QOKA 3PZHA 5F20A 4ACCA 5BVOA 3HRFA 3WF9A 2WIHA 4M84A 4I22A 4IACA 1VR2A 3E8EA 2IO6A 4L3PA 4RX9A 3AQVA 1R1WA 3KXHA 4W4XA 2Z8CA 4C58A 4YPDA 4PMTA 4DFLA 2WFYA 4WD5A 2GHLA 2ZMDA 3GC8A 2WTCA 2F49A 2J6MA 3WIGA 5A6OA 5IA3A 3R28A 2B0QA 4MYGA 4D9UA 3F82A 2EUFB 4FEWA 2YCRA 3RK5A 3W16A 4G9RA 4NEUA 4FZDB 4Y95A 3JUHA 4O0VA 2ITOA 1QPEA 2VWYA 5ETCA 4FV8A 4U42A 4APCA 1I44A 5HX6A 4GSBA 4XG2A 4A7CA 3RZFA 4J99A 3ENMA 3BWJA 3VHEA 3DBCA 5E7RA 5CF6A 3C4ZA 5IQIA 3WYYA 2B53A 3V6SA 3E88A 5LCJA 3F3UA 3A8XA 4U45A 1PY5A 3GC0A 2XBAA 4ZJIA 1KE7A 2C5VA 4IAAA 4UYAA 1Q8YA 3W32A 4L3JA 4M14A 3LFCA 5JQ5A 5CSHA 4BCKA 2Z60A 4YMJA 3JY9A 4A9SA 3QL8A 4FVPA 4YJQA 3DK7A 3Q53A 2QOBA 3P7CA 2YJRA 4O2ZA 1JSVA 3RP9A 5FXRA 1OIUA 2OW3A 4QP8A 3PDTA 4I0SA 5AP4A 3VUGA 2P3GX 4EHVA 4ENXA 1XO2B 2OK1A 4B0GA 3QQHA 3FMHA 5KZIA 3HV6A 1P5EA 4AGCA 3JPVA 3PRIA 3I0OA 5M4FA 3FLNC 3UPZA 3MFRA 4DT9A 5I3RA 1Q97A 3SHEA 4DTBA 2QKWB 3HP2A 4EKKA 4BDFA 4J52A 2BRBA 2X2LA 4C4GA 4USDA 4FTCA 4NIFA 3RNIA 3G0EA 2PVFA 1JAMA 4RX5A 1OECA 2ITTA 3L1SA 5I9UA 2PL0A 2FSMX 4E1ZA 3FQHA 2CLQA 4JJRA 3ORMA 4HGSA 4I1ZA 2O0UA 4CSVA 3LMGA 4O6LA 4X2GA 3EQPA 3HV7A 1TQIA 3I4BA 3NLBA 1ZZ2A 2WB8A 1ZLTA 4D55A 3FMEA 4ALUA 2EXEA 3G5DA 2QR8A 4L44A 5H2UA 3TJCA 2PVRA 5B2MA 5HCZA 2HW7A 4DA5A 3G51A 4YLKA 4BTJA 2Z7SA 3NGAA 3BX5A 3HECA 3FSFA 4XP2A 4TXCA 3PG1A 4J95A 4ZY4A 5AX9A 5FLFA 4ZAUA 2PU8A 5HU3A 4JAJA 3EQFA 3FY0A 5CXHA 3R8PA 3R1YA 5CVGA 2RG6A 3NUYA 3M42A 4FEQA 3UIBA 2VWZA 3GCQA 4F09A 1JSTA 4IX3A 1NW1A 5ANEA 4HNFA 4IB3A 1WBVA 5TE0A 4WG3A 4E5BA 4PX6A 5TKDA 4WHZA 1OUYA 2R3KA 5DEWA 1SZMA 5DRDA 3RWQA 3ZEPA 2C30A 4W9WA 2J0KA 1OVEA 4YHFA 4EKLA 3COKA 3F3ZA 1ZYDA 3QD4A 1H1SA 3RMFA 4FV1A 1QMZA 4NJDA 2XKCA 5I9YA 3DGKA 3K3JA 3EN7A 3C13A 3PJ3A 1M7NA 3FEGA 4QMOA 5HE0A 3MH2A 5LOHA 3HP5A 3IG7A 3JR1A 3FMDA 3QQKA 4UMRA 3ORZA 2BR1A 4I0TA 4GK4A 2J90A 5GJDA 4C38A 3D2IA 1ZYLA 5LVNA 4BY9E 1FINA 3FZSA 2A19B 2HENA 3LQ5A 3PPJA 5D9HA 4UWCA 4V0GB 2J0MB 2ZM3A 4FTNA 2B9FA 4ITIA 2OXYA 2QR7A 5M06A 5F94A 1GZKA 4GG7A 5AP2A 2HXLA 3FLQA 3E3PA 2CKOA 4CKRA 1Z57A 4RC3A 5IISA 4KKEA 1Y6AA 3DFAA 2PVJA 2W1DA 3W55A 3CPBA 2SRCA 3COIA 1GZOA 3BHVA 1KUTA 4D4YA 2CNVA 4DFBA 3V5WA 4I6BA 3Q9WA 3ALOA 3ZUTA 4RJ6A 2VNWA 3CQEA 4BTKA 4GT4A 3EIDA 3KB7A 3ZRKA 2XK3A 3BHYA 2BTSA 1J91A 3BLQA 2WOTA 1OUKA 1UU9A 3GCVA 2X7GA 5AJQA 2OZAA 3JVRA 1GIJA 5JSMA 3PXYA 2C5NA 3VNTA 3QD3A 2JDTA 3FYKX 4AOJA 3PIYA 4AWIA 3P7BA 2VTIA 4I0RA 4MD7E 4CFNA 1PRYA 4E4XA 3DXQA 3E3BX 1UKHA 4QQTA 1H8FA 1Q5KA 4EH3A 3RPRA 2XK7A 3FLWA 2YLEA 3FV8A 2IN6A 3OW3A 3OUKA 4RIYB 3LFDA 4CCBA 3MY1A 4HW7A 5K4IA 4FK3A 1ZXEA 2GFCA 2QQ7A 4PF4A 4GYIA 4ANBA 4OUCA 4CQEA 4U6RA 4FT0A 4TTHB 4BKZA 4F64A 3OFMA 2I40A 2Z7LA 4GUBA 4KIQA 1SNXA 2CPKE 2E9PA 3FMKA 3QGYA 4MVFA 4WNOA 4YZMA 5FP5A 5HG9A 1XBBA 2R3MA 1JVPP 3ZDIA 3PPZA 3FZOA 5L6OA 3KEXA 3UO5A 1ZY5A 2G1TA 2R9SA 3LE6A 4Z7GA 4R7BA 3GGFA 2JAVA 3E7OA 3NAYA 1XR1A 3FXWA 3P5KA 3FHRA 3EN5A 3PWYA 4PV0A 3VS3A 3NX8A 4ZJJA 4F7SA 4KIKA 1Q4LA 3ORIA 2C6IA 1H25A 1MP8A 2BIYA 3BHTA 2ITNA 3AXWA 1LEZA 3PE2A 2J0LA 2VO0A 3AC3A 5HCYA 1IA9A 5HE1A 2JFMA 4L7SA 4UMTA 4EQUA 4ZMFA 4RIXA 4YJSA 5AUVA 2R3OA 3FDNA 4U7ZA 3POOA 2GNJA 3TL8A 5HBJA 2GQRA 3QC9A 4NCTA 5EOLA 4LOOA 4Y46A 1J1CA 2O5KA 5K4JA 4M68A 3CKWA 4RFZA 4F0FA 2B52A 3FE3A 4O7LA 2G9XA 4B9DA 4F63A 2HAKA 1WBSA 4L7FA 4NZWB 4QYYA 4S33A 4WUAA 1REKA 3K5UA 5J9YA 5FM3A 5A54A 3TUBA 4E73A 2IG7A 5KNJA 3COHA 3RBWA 4BRXA 5K3YA 4L68A 4WG5A 2CCIA 3BEAA 3C0GA 3DBFA 4JI9A 4DTAA 4XG9A 3EHAA 3MH1A 4BDCA 1BI7A 4TWPA 3PSDA 3LOKA 3PJ8A 3S4QA 3TG1A 3FLSA 4U97A 4DGOA 4GL9A 1M7QA 3ZLWA 4F99A 1YWVA 4BZOA 2YJSA 3IS5A 4FICA 3DB6A 4LGGA 5CSVA 4FV7A 3PJ2A 3UOLA 4UYNA 1W82A 3IGOA 2ETRA 2BVAA 2UUEA 5IQEA 5AIKA 3UNJA 4XV3A 2UZTA 1JLUE 3ZFXA 5J1VA 1PW2A 2UW5A 4R3RA 3PVGA 3RALA 4FL2A 4DGLC 4YJVA 4TWOA 2QURA 4FSNA 1WZYA 2C3LA 5J1WA 1V0OA 4BCPA 2X81A 4GK3A 3BGPA 3PJ1A 4HCVA 1RW8A 2C6MA 4R5SA 4OAVB 3C4FA 4FKOA 3M2WA 3LQ3A 3DNDA 4F1MA 4L00A 4N4SA 1URCA 2R5TA 2W1IA 3AMBA 3HRCA 3OCTA 5FWKK 4D2TA 4K77A 5HEZA 4GFGA 3KK9A 4DBNA 2EB3A 2PY3A 1H08A 4HPTE 3A7IA 3LXKA 1M2QA 3FLYA 4S30A 5EW8A 4GS6A 1OPKA 5CF5A 2YWPA 3DBDA 3QKLA 3DAKA 4LGHA 1PYXA 3DK6A 4MNEB 4TKSA 4XRJA 3VUKA 4E6DA 1MQBA 3ODYX 5HD7A 3QALE 5IEVA 1YI6A 3ZFYA 3QTSA 3MS9A 4IAZA 2IW8A 4WT6A 2JIVA 4I6QA 3HDNA 5TR6A 3E93A 4A9TA 3FPMA 3OTUA 3EFKA 3UBDA 3UYTA 3Q9YA 2C6EA 3AD6A 4HGEA 3OXTA 4IM0A 2Y9QA 4GVAA 4IANA 2LAVA 3LFSA 3OWKA 4FKQA 4GUEA 4IH8A 3HMPA 3PA4A 4BDJA 2OLCA 2BFYA 4RLLA 2XK9A 1LR4A 4D4RA 4EONA 3DLSA 5AV4A 5LVOA 1Y91A 3HRBA 3KRWA 3E8DA 4JT3A 2YIRA 3UNZA 4O7NA 4I5MA 2FSOX 2DS1A 3JXWA 5HD4A 3REPA 1FBNA 2XS0A 3F69A 4HOKA 4K11A 4TRLA 3CY2A 4R78A 4BBEA 3G6GA 4WIHA 2QCSA 3ZSIA 4C2VA 4F08A 5KHWA 1W84A 4RVMA 2X9EA 4G3CA 4BDIA 3S2PA 3AD5A 5GIPE 3EQRA 2JFLA 3D9VA 1PMVA 4EOMA 4FEVA 2RF9A 1JSUA 2A1AB 3NW5A 3KVXA 1RDQE 4FOBA 2XF0A 4QMXA 4KS8A 4M69B 4C7TA 2C68A 3V5JA 5KX8A 4X6QC 2HWOA 3HGKA 3ACKA 3EFJA 5LCKA 2FO0A 5EYKA 3VBXA 2XK6A 4C61A 3OHTA 1L8TA 1B39A 3VJOA 4FKUA 4GKIA 4NFMA 1W98A 3WF5A 4DEAA 2CGWA 4CD0A 4LGDA 4EOJA 1KV2A 4AFJA 1OGUA 2OXXA 2O2UA 1KOAA 3AMAA 5HICA 3LFQA 3W2PA 4JG8A 4J8NA 1OPLA 3CQWA 4WNMA 5E8TA 3EB0A 4M97A 4ZSEA 4WSQA 2BPMA 2XNBA 3E87A 4K9YA 4USFA 3A4OX 1XH8A 2JIUA 3LXPA 3H0YA 3M1SA 4QP1A 3F2RA 3HZTA 3HV4A 4RWLA 1TKIA 4RVKA 2YM8A 3WIKA 2ITXA 2OFVA 3ZC5A 5DT3A 4AW1A 4E4NA 1OKVA 4HJOA 1Q61A 4YZDA 3W2CA 4J1RA 3SG9A 3FL5A 4QMPA 3NWWA 4DYMA 4IVBA 4QT1A 4JQ8A 1PMEA 5IA5A 3QXOA 4GW8A 3QTZA 3EMGA 3UODA 4EOPA 4JIAA 2OGVA 4UV0A 4MCVA 3ZXTA 4MQ2A 3R9HA 2E9UA 4EH5A 4BICA 3GVUA 4E8AA 4FR4A 2VTHA 4EK4A 4V0GA 2VX3A 2VWBA 3BHUA 3OT8A 5HE3A 4J8MA 5IUGA 3AT3A 2FGIA 4NM7A 4Y8DA 3PRFA 4HYHA 4KBCA 4EORA 4OLIA 4UEUA 3WF8A 1UU8A 2VU3A 3FZRA 2JKOA 4ZSJA 3SXRA 5EKNA 3PVBA 5HESA 5KBQA 5HO8A 4AAAA 2W5BA 2CHLA 2PMIA 2OH0E 3LM0A 1U54B 4TYGA 3GU7A 1SVEA 5EM5A 3KF7A 4KAOA 5AR3A 3GCPA 3HA6A 3ENHA 4MBIA 3FKNA 4EL9A 3OOMA 5D10A 1OL1A 4FVQA 3KQ7A 3QHWA 4Y5QA 5L8LA 3CGFA 3SKCA 3W8QA 4O0XA 4HVDA 4KKHA 2W1FA 4NWMA 1AQ1A 5KO1A 3CE3A 3UQGA 5E90A 3TDWA 3IDBA 1Q3WA 3GQLA 4ZLZA 3DTWA 3H10A 2BHHA 1SNUA 1WMKA 4RJ5A 3EL7A 5EYCA 4Z7HA 2H34A 4WUNA 2B1PA 3PY1A 4RIOA 5GNKA 1XH6A 4P2KA 2WZJA 5JGAA 4HYUA 3V3VA 2FVDA 4G17A 1GZNA 2WEVA 3BU3A 3UG1A 4IC8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2PUL A;  1W2C A;  4ZZO A;  3DT1 A;  2W06 A;  4C3F A;  5AIR A;  4IVD A;  3MES A;  1YW2 A;  4FT5 A;  2WQM A;  4JBP A;  2XAM A;  5FBN C;  1NA7 A;  4PL5 A;  1H1R A;  1UU7 A;  4D28 A;  5CX9 A;  4XYF A;  4ZIM A;  3B2T A;  3LPB A;  3A62 A;  1XBA A;  3W33 A;  4FKI A;  4FNW A;  2OZA B;  4WNP A;  1KV1 A;  3DQW A;  5L6P A;  2QOL A;  3MIY A;  3ORK A;  4RA4 A;  4IJ9 A;  4EOO A;  3DCV A;  5E92 A;  4RLK A;  1BYG A;  3WBL A;  5HBE A;  5DN3 A;  4YBK A;  5A4T A;  5IA4 A;  2X7O A;  4K2R A;  3FXZ A;  5A46 A;  4UZH A;  3R8M A;  3W2O A;  4X21 A;  4PDP A;  4FV2 A;  2QOO A;  4DN5 A;  3C4W A;  5CSX A;  4D2R A;  4AN2 A;  1VEB A;  5E8S A;  4QYE A;  2W9F B;  1BMK A;  2XCH A;  3ACJ A;  5DR2 A;  5TT7 A;  5IMX A;  5LMB A;  3II5 A;  4F6U A;  4M7I A;  3A7F A;  4ZTM A;  1V0B A;  4A9R A;  4TWC A;  3H0Z A;  4W8E A;  4BYJ A;  4RQK A;  3CD8 A;  4E93 A;  3C9W A;  3OUN B;  2GNF A;  2P33 A;  3QTI A;  4LG4 A;  3JS2 A;  1M14 A;  5IH6 A;  4YZB A;  1CDK A;  5EKO A;  1S9I A;  2OJF E;  2W9Z B;  4A9U A;  3UIU A;  4ANN A;  4KIK B;  3G9N A; 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