4TKSA

Native-sad phasing for human egfr kinase domain.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
323
structure length
307
Chain Sequence
EAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELTSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPEEDMDDVVDADEYLIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Multi-crystal native SAD analysis at 6 keV.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 307
sequence length 323
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4tksA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4tksA01
4WSYA 5DR6A 2GHMA 4PUZA 5EQPA 2OXXA 3JS2A 4PX6A 1DM2A 4GVAA 5HZNA 4RA4A 3SX9A 3NVKI 4RZWA 4HCVA 4PWNA 4ZY5A 2QKWB 2QOCA 1KE8A 1ZARA 3R0TA 1ZZLA 4HZSA 5CANA 4O0WA 5HQ0A 4DF3A 3OP5A 4FKSA 4ZOGA 1QPDA 4PY1A 4CTBA 2HY81 3C50A 5AAEA 4E1ZA 4JQ7A 3ZO1A 4RIYB 3G15A 4KRCA 2IW9A 5E8ZA 3GU5A 3EH9A 2XK4A 3GBZA 4D4VA 4X2NA 4EK6A 1SM2A 3F88A 2HZIA 1XO2B 1OL7A 2V62A 4JR3A 2C6EA 4NFNA 4QYHA 4R3RA 4ZZMA 3FEGA 1L3RE 4GH2A 4DEIA 4FTJA 4MD7E 4OAUC 2IVSA 4F7JA 4DE4A 4Z7HA 2GU8A 3D7TB 3NPCA 2J0MB 1A06A 2JEDA 2NPQA 2OBJA 3GP0A 5CAOA 2JDOA 1U59A 2J0KA 4G5JA 4OLIA 4YC3A 4FNXA 4BB4A 3WF6A 4I6QA 3KMMA 5BUJA 3RPSA 4QQCA 4KAOA 3BHHA 3KB7A 4BDEA 3UZTA 2QNJA 3OG7A 4RJ7A 3LQ3A 3RK7A 1KOAA 1WCCA 3ZSIA 1QCFA 3WZUA 2VWYA 2YIRA 2KULA 3WILA 2C3LA 3L1SA 1XH6A 4O7VA 4BIDA 2I7QA 4CRSA 5CI6A 3BU5A 3QZFA 4DFYA 3LJ0A 2BZKB 1VJYA 3FC1X 5AFVA 3ZSGA 2QD9A 2HXLA 1NA7A 4GCJA 3UMXA 4XNEA 3QQFA 4IDVA 2GS2A 5IUIA 3I4BA 3UC3A 2OLCA 4G1WA 3MESA 3QAME 2PY3A 3R8ZA 4N6ZA 3PE1A 3U6IA 3A7JA 3QZGA 2IVTA 3W55A 4J95A 2C0OA 5L8JA 4I0SA 4D9UA 4YPDA 2V22A 5E1SA 3RCDA 3HAVA 1ZWSA 5BPYA 4FKUA 1JSUA 3TL8A 2CKPA 3POZA 3AMBA 2H34A 4JRNA 2C3KA 1H1RA 5IEYA 4FKPA 3QUEA 4QTAA 2B7AA 3O8TA 3ZO2A 4CQGA 4GG5A 4R7IA 3PIZA 4B4LA 2OXYA 2WELA 1UVRA 3NCGA 5FTOA 4QO9A 3H9RA 2XF0A 3VVHA 2P4IA 4AT5A 1OZ1A 2F9GA 2UZVA 1S9JA 2QU5A 3V04A 1FQ1B 2R7BA 3BHVA 3CD3A 4PMSA 2BIYA 3UIUA 5AUWA 5T6KA 4M68A 3NIEA 4YJNA 3I81A 2Z7QA 3UIXA 5ANOA 3TN8A 2PTKA 4TZRA 4EEVA 2XEZA 3QHWA 3N4UA 3L9LA 3OY1A 2OZAB 1JQHA 2HWOA 3MIAA 3SDJA 2VTLA 3UC4A 4BFMA 4DGOA 4F1TA 4DG3E 3UMWA 3DGKA 4D58A 3NVMB 3ODYX 2YISA 3C4XA 3GU7A 4II5A 4IJ9A 4C2VA 3SVVA 4ORKA 3GC8A 4I21A 2I0YA 3LFDA 4WG3A 4EH3A 3VS5A 4EJ7A 4BL1A 1T46A 2QKRA 4IMYA 4IIRA 3UNZA 4TYHA 5D7AA 5BNJA 4WNOA 3RPYA 4HNFA 3C5IA 5DYJA 3DBDA 4RIWA 3RCJA 1OPJA 5E8SA 2WU7A 4M12A 4FEQA 4EH9A 1O6LA 3OEZA 4IZYA 3PXKA 3D5VA 3TV4A 5KMMA 3V6RA 4M7IA 4UWYA 3O71A 1MQ4A 4N70A 5FM3A 4IM3A 4CKRA 3QTZA 2CJMA 3WIKA 4FEVA 5JFXA 4XJ0A 4L44A 4E26A 5L2QA 4DGNA 2QCSA 3EWHA 3ATTA 3PSCA 5HNIX 4MXYA 3R63A 3AT2A 5HBJA 4K2RA 2R7IA 4OGRA 4K1BA 2WQMA 4FMQA 1PMVA 1UWJA 3ZOSA 5IQBA 2VWUA 3HP2A 4CT2A 4ZJVA 1XBAA 1ZY5A 2XBJA 4Y46A 1U5QA 4IAKA 2WHBA 4JJRA 2ETMA 2XKEA 2EUFB 4I0TA 4FNYA 4QP3A 2RFDA 4XV1A 4QMYA 3KULA 2QG7A 2XKDA 4BCNA 2O64A 1XR1A 4RVTA 5M06A 5E8UA 1OL1A 3QTWA 2YITA 1I44A 5I3OA 4UN0C 3HV4A 3Q32A 4NZWB 3R8VA 5AUVA 4IEBA 4G3CA 5JFVA 4G3EA 2RIOA 3R8PA 2A2AA 4A4OA 1OB3A 4EJNA 1PXJA 2PUUA 4V05A 4H1JA 2W17A 4H3QA 4X7QA 3RPVA 1PKDA 1W84A 5M53A 3U55A 2OF2A 2J90A 4G3FA 3GU6A 3GFEA 2VTNA 3C4FA 3GFWA 3GOPA 4K8AA 3KXXA 4O6LA 3KRRA 4GL9A 4JLCA 4J8NA 3SXFA 2IZUA 2REIA 4IJPA 5CEQA 1SVHA 4RWIA 1FBNA 4OTDA 4EK5A 3KXHA 1G8AA 5LMKC 4USDA 3G0FA 4GRBA 2WXVA 4O7LA 2WMUA 3S1HA 3LFAA 1M14A 4RIYA 3ROCA 3EYHA 3FYKX 5LWMA 1JVPP 5EQEA 3R7IA 5AIKA 2OJFE 3LM0A 3G6HA 2B4SB 4GT4A 3LMIA 5K5NA 3RAKA 4QPAA 3FYJX 2WU6A 3FDNA 2UZEA 5TKDA 4DTBA 3NUUA 5D11A 4IZ7A 2BCJA 3ZONA 4C4IA 2PVRA 3FLSA 4LRKA 4QNYA 5CENA 3IGGA 4JNWA 1XKKA 4XH6A 2R3IA 4XRJA 3WZDA 4AT3A 1Y6AA 5AX3A 4UZHA 5HCXA 5BVDA 2CNVA 4I93A 4X3FC 4EHZA 4W4YA 5CT0A 1NVSA 1MQBA 4GVJA 4JQEA 5EW8A 2C6KA 3RHXA 4GU9A 3OWJA 1GZ8A 4PDOA 4YMJA 4YZMA 1UWHA 4X2GA 3JY0A 1LEZA 3MH0A 5HHWA 4AF3A 4UMRA 3BV3A 2J0JA 2UW7A 1YRPA 2RL5A 1WMKA 4CV9A 4FTIA 4P2KA 4NM0A 1WBPA 3GCVA 1ZYJA 3AOXA 2QR7A 3PY1A 2R3MA 3G5DA 2IN6A 3DPKA 3DTWA 3T9TA 4C8BA 1BYGA 2W99B 4H3BA 2X81A 3E5AA 4WIHA 1DI8A 4Y95A 5IQDA 2I40A 4JL9A 3FL4A 2VTOA 4PDSA 2UVZA 4QMOA 1PMNA 3ALNA 2Z2WA 5IA2A 4DFZE 4FKLA 4GKIA 2HENA 4I20A 1WBVA 3A8WA 2BVAA 2X0GA 3OW4A 4OTWA 4DITA 3C0GA 4FSYA 2ESMA 5L2IA 4JDKA 1PKGA 2A0CX 2JIUA 3MS9A 1NVQA 4FKWA 3W33A 2PUIA 3FV8A 4WRSA 3RTPA 2B1PA 1M2RA 1IA9A 3E8EA 4E5WA 3KF4A 4MF1A 4U79A 4EK3A 3QQJA 3DAEA 5JSMA 3TEIA 2PK9A 3UP7A 3JR1A 2WMAA 3PJ2A 3I79A 1JSVA 5IMXA 5HIEA 5BVNA 4L01A 4QMVA 5FEQA 1Y91A 2XZSA 3FI4A 4BDDA 5ETIA 5IA3A 3NZ0A 1ZOEA 4FK6A 5F9EA 3OT3A 4C37A 4RIOA 1YKRA 5B7VA 4IBMA 4QP4A 4BICA 2C6LA 4CT1A 4EKLA 4CVAA 4P5ZA 1LPUA 2OZAA 3AT3A 2W4KA 2XK3A 3O50A 4I92A 1VR2A 1ZLTA 2QR8A 1PYEA 4FSNA 4X3FB 2ZM4A 3POOA 4YZCA 2J51A 4AFJA 3R73A 4EYJA 4YURA 3VW8A 4ZSEA 2CKQA 1P4FA 4PL3A 3L9NA 3WE8A 2FYSA 5EFQA 2CPKE 3COIA 5HI2A 2WB8A 3NW5A 4PP9A 2XP2A 3KA0A 3QALE 2UZWE 2ZV7A 2XRUA 3QX4A 4QP7A 3D14A 4NWMA 4PL4A 3MN3A 5BVKA 4GIIA 1WBOA 3DB8A 3PRFA 4F7SA 1FMKA 2I0EA 3UYSA 3SXSA 4UYAA 4B8LA 3UIBA 3PVUA 2QURA 4NCTC 4LG4A 3VJOA 5CASA 4MKCA 5I3RA 4U9AA 5A4EA 5IMEA 4O21A 3MJ2A 3C4CA 1ZMVA 1YI3A 2BMCA 5FM2A 3COKA 3FSFA 5AP5A 3ITZA 4F0FA 1YHSA 4GK4A 4BI0A 3HVCA 1BI7A 2HZ4A 2R4BA 4K11A 5AX9A 1STCE 5K4IA 2CHLA 4IWQA 3VS2A 5IEVA 1UV5A 2XK9A 5BUIA 5K0XA 3PLAE 3SRVA 2AC3A 4HGTA 4YTFA 4FSWA 4IXPA 4ANLA 2GTMA 4HVIA 3QX2A 3RMFA 5LJJA 4QMPA 3QYZA 4YU2A 4D0WA 1S9IA 5J9YA 4XG4A 5D12A 2VTHA 5FDPA 1ZOGA 3NYVA 2XM8A 2OH0E 4YJTA 4I5HA 2G2IA 4RX8A 5EM8A 3SLSA 3W16A 5CAQA 4M8TA 4ZZNA 3REPA 5C1QB 2E9VA 4BDJA 3I7CA 1FINA 4ENYA 4F9YA 5IQHA 1YQJA 4HCUA 3NGAA 3Q04A 4UEUA 3MV5A 2UW6A 3E87A 5GHVA 4AGUA 2ZDUA 4EOJA 2BTRA 2OKRA 2BKZA 5IQGA 2XMYA 1JLUE 4L3LA 4DT9A 4XBRA 1LEWA 5CU4A 5F1ZA 3EQBA 3VQHA 4Z9LA 2HELA 1WVWA 3BHUA 3D2KA 3TNWA 5LVPA 4L3PA 3F5XA 1RE8A 2OJJA 5EDPA 1AD5A 3TJCA 1XH5A 2H6DA 2BAQA 2P0CA 3NCZA 4NJDA 4ONAA 2ITQA 3NUXA 3PDTA 3OXTA 5CT7A 2WMWA 1H00A 4O84A 3QWJA 3G51A 5IF1A 1UNHA 5IH4A 2W5BA 4UMPA 1MP8A 3V51A 3DQXA 3QHRA 3BEAA 3Q9ZA 4W4WA 5FRIA 4X0MA 1Q8YA 5JQ5A 3R22A 3IONA 1M2PA 5AUYA 4BRXA 3Q5IA 5AP1A 5IH6A 4RGJA 1NY3A 2W4OA 1UU3A 2OJIA 4QP1A 4QYFA 4DEGA 4HGEA 2YM3A 1OIUA 1W98A 5F4NA 2C69A 4CTCA 2PVYA 4PDYA 5J1VA 4BZDA 2H8HA 3JXWA 5K4JA 4LGGA 4USFA 3FLNC 3KRLA 3VS0A 4X6QC 3PXQA 2XJ2A 4YZDA 2FVDA 5EG3A 2CGXA 2PU8A 3BBTB 3IG7A 5HCZA 4KBKA 4CFFA 2RGPA 4S33A 2OIQA 4B9DA 4DAWA 4OTQA 5A3XA 4FKQA 2CSNA 4N4SA 3FLQA 3KN6A 1PW2A 4RPVA 3TT0A 3TDVA 3VS3A 3HP5A 2PUNA 2LAVA 2ETKA 5HVJA 3VUHA 4EONA 4FIFA 3CCNA 3DJ7A 1YWVA 3ZFMA 3QRJA 4CMOA 3M2WA 4EQCA 3HKOA 1H25A 2YLFA 4HVHA 1W7HA 1XH8A 3E3PA 4U81A 4DHFA 3R28A 3TKUA 4DH3A 4C59A 2GNGA 4F7NA 1J7UA 4KIPA 3ROYA 3SKCA 3TKIA 4LOQA 3QC9A 2YDKA 3MSSA 5EHLA 3TNPC 3W8LA 4CCUA 2NO3A 3KRXA 5A4QA 3DBFA 3Q9XA 1CTPE 4K33A 5CU3A 4IACA 1Y6BA 1Y8GA 4O82A 4MK0A 3WIGA 5B2KA 3ACKA 4E4NA 5KMJA 3F5PA 2OSCA 5AR3A 2CDZA 2G1TA 3IGOA 4IB3A 5J8IA 3TJDA 2PHKA 5DEWA 5F95A 2OK1A 4I0RA 3AMYA 3CQUA 5L6PA 4TNBA 4CCBA 2IZRA 3QTQA 4FIJA 3KXZA 4IHPA 4YHFA 5IQAA 2Z60A 3Q6UA 4YBKA 1U46A 3BRBA 3UGCA 1FOTA 5HESA 3RKBA 5AUUA 3VBVA 2YCFA 1J1BA 2CCHA 5ACBC 2WQBA 3OTVA 3K2LA 4NSTA 2XEYA 3NUAA 4O96A 4J98A 1FMOE 2UW8A 3SV0A 4PL5A 1P5EA 3TACA 4U7ZA 5AUXA 4DEAA 2OICA 3CJFA 5A6NA 1FVVA 4JDIA 3UOLA 4X3JA 5AAGA 1OKVA 4XLVA 3ZM9A 4D2PA 4U3ZA 1OIRA 1YXXA 2HK5A 2JDTA 4KSPA 3EL7A 3F3TA 3RP9A 2IW6A 2UW9A 4BTMA 1YOLA 4BDHA 4U5JA 3V8TA 5I5ZA 4JAJA 3GB2A 3HRBA 3WZKA 2RG6A 4TWCA 1PHKA 3DTCA 4YLLA 3TZ7A 3IOKA 3LE6A 5K9IA 2I1MA 4FSRA 3LFEA 2BRGA 3V01A 4F64A 3O17A 4CXAA 3E7OA 3QFVA 4ALUA 3R21A 4M69A 2VGPA 3K3IA 1PJKA 3CY3A 5AV2A 3FI2A 3T9IA 3TUCA 5LVNA 2VTSA 3EIDA 4GK3A 4AW2A 2X7GA 4FVPA 3LMGA 1ND4A 4D9TA 5AA9A 3HV7A 1PMEA 5E8XA 4EK8A 3FZ1A 4G6OA 3NUYA 3ZLWA 4FKOA 2W4JA 2WEVA 3RALA 3LXKA 4RQVA 2I0HA 3ZRLA 3FI3A 4C0TA 4HJOA 3GGFA 3OWPA 5HG9A 5TE0A 3HUBA 3V3VA 1FPUA 3FWQA 4AA0A 4NYEA 5EI6A 2HZ0A 4ZS0A 3CGFA 3Q4UA 3FBVA 3W18A 5HICA 4PDPA 4USEA 2XJ0A 4PNIA 4DN5A 5AA8A 4FKRA 2PUPA 4OTHA 3WZJA 3P86A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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