4TPTA

Crystal structure of the human limk2 kinase domain in complex with a non-atp competitive inhibitor
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
302
structure length
279
Chain Sequence
DLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of a Type III Inhibitor of LIM Kinase 2 That Binds in a DFG-Out Conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LIM domain kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 279
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4tptA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4tptA01
2OIBA 1H07A 3DB6A 4E93A 3CD8A 3UZRA 2CNUA 1JNKA 2OIDA 3GC0A 4AZSA 3BU5A 4Z7HA 4TWPA 5HVYA 3FLZA 4P5ZA 3GOKA 2V22A 1BI8A 4BZOA 3HECA 2VX1A 1TKIA 4ZSJA 4TT7A 5IPJA 4F7JA 4KKHA 2BRGA 3FMEA 3R9DA 3BHVA 2J0JA 3R7IA 2ZM3A 3BZ3A 5L2TA 4X2GA 3OEZA 2WMTA 3DFCB 4IAIA 3FPMA 1M17A 2WTCA 5EQPA 4DTAA 2BMCA 3HMPA 4C4HA 4XG3A 4MD7E 4MQ2A 2FB8A 4RX7A 2AC5A 4EH6A 3PPKA 3NAYA 3OW4A 1E1XA 2XK8A 3NS9A 4AFJA 2ZM4A 2R3RA 3JVSA 1BI7A 1TQIA 4BRXA 3L9PA 5L8LA 2P33A 4BI1A 3QC4A 4N70A 4GSBA 4EONA 3T9IA 4GU6A 4O91A 3NUYA 2RFNA 3R28A 5CQWA 3OC1A 3IW6A 3IO7A 4PQNA 5GJFA 4L44A 1APME 2J2IB 1PXLA 2FUMA 4E8AA 3QX2A 3UP2A 4IDTA 4G6OA 1JSVA 5CSHA 1QPDA 5B7VA 4QTAA 3QTWA 5CASA 2XF0A 2OJJA 2JIIA 4XV2A 5CU2A 5AIRA 4TN6A 3R22A 3VJNA 5I9UA 3V01A 4DH1A 2RG6A 4TYHB 1ZYJA 3JPVA 4XV3A 4MD8E 3JR1A 2GMXA 4L00A 5AP4A 4I23A 5AAGA 1UNLA 3GGFA 4IC7A 3MA3A 2WO6A 4O0RA 3HV6A 3OBGA 2OJIA 4GMYA 5IF1A 2JKQA 3BI6A 2GHGA 3ODYX 4M68A 4S33A 5J8IA 2XYNA 4Z16A 3EN6A 2IO6A 2JKOA 3NPCA 3SXRA 3FL4A 2ZDTA 4LMUA 1K9AA 1WVXA 4E4XA 4W4WA 3AC4A 4KD1A 5DRBA 1O9UA 5JH6A 4DLIA 4YJUA 3V5PA 4AFEA 3AC2A 3SQQA 5CAPA 2VTRA 1OZ1A 4AZTA 1WBWA 3QZHA 5L3AA 3IW7A 3TZMA 3ZDIA 4R3PA 3NYNA 5EYKA 2CNQA 2H9VA 2VTSA 3UYSA 4O83A 4NM3A 4O0TA 4FV5A 4F7LA 4YJSA 3TDWA 1KE8A 1S9JA 3LPBA 1XH5A 4F7SA 5B0XA 2IZRA 3FLNC 2E9VA 5B2MA 2XIKA 3CR0A 4I6QA 5IEVA 3IW8A 4DE4A 4ZOGA 5HCYA 5C9CA 4HYHA 2A1AB 3MJ2A 3QRIA 5HX8A 3OUNB 2DYLA 2C5OA 4FODA 5CU0A 2UW5A 3DV3A 4O81A 4FSRA 1BLXA 3DNEA 2PE1A 4XJ0A 3LM0A 5JZNA 2F9GA 2W99B 1F3MC 1UKIA 4A9YA 4AGWA 4C36A 4FBXA 3SLSA 1OMWA 2HWOA 2YDKA 3RINA 3ZO2A 4F6UA 2WD1A 4N6YA 3E7VA 3QD3A 1YI3A 2WTKC 1ZXEA 3RPYA 3CSVA 4G3GA 5J95A 2CSNA 3UJGA 5CNOA 1YHWA 3HMMA 5JSMA 2C3JA 4L8MA 4U40A 5HE0A 4B4LA 4C0TA 5M06A 3RI1A 1URWA 1J91A 2C68A 4GFGA 4C38A 2I1MA 4C4IA 2QODA 2XJ2A 5T6KA 5LCJA 1OIYA 4M67A 5CU3A 4BDBA 3P08A 3OW3A 4YU2A 4EK6A 5IMXA 3QD4A 4JBQA 3CLYA 4WSQA 4ANLA 1FVVA 4GJ2A 4CSVA 1H1QA 2ITZA 4XP3A 4IZ7A 5T3QA 3UIMA 2YHVA 3KXNA 4M15A 4ASEA 5K5NA 3V5WA 1ZOHA 3HEGA 3LXKA 4HNIA 5EM8A 4E4MA 1RDQE 5J7BA 4RQVA 3UOLA 3IGOA 5ANDA 4DT8A 4DGNA 2XKFA 2QOKA 3EKNA 3A8WA 4OTPA 4FV3A 4QMOA 2YITA 4RIWB 5FBOA 5HD7A 5IUIA 1FGKA 3V04A 4LMNA 1UV5A 3EHAA 3P7CA 4EKKA 4YHJA 4XNEA 1RJBA 4DINA 4Z55A 1GIIA 1WZYA 2WTVA 3CTHA 4I0SA 3COMA 4WUAA 1J7LA 4AN9A 5IQCA 4GIIA 3NDMA 3U6HA 5IA2A 3KXHA 4PMSA 3KRWA 1E9HA 5J9ZA 2WIPA 4GYIA 3JS2A 4WO5A 3RAWA 1Z5MA 1BKXA 4IW0A 2Z7LA 3GC8A 2XK4A 3FKLA 3KGAA 4FV2A 3V5QA 4F9BA 4PP7A 3OVVA 1QCFA 3Q04A 3W2SA 3PP1A 4I3ZA 4O1PA 4IANA 2F49A 3MI9A 2VZ6A 5FG8A 5LQFA 3GCSA 5BVOA 3MVMA 2DS1A 3RCJA 5M08A 1U54A 3BYMA 4G9CA 4FA2A 1OUKA 3C0HA 2YWVA 4GFMA 1JSUA 2I7QA 4F08A 2R2PA 4QMPA 3FZRA 4X2FA 2OG8A 5CEKA 4WRGA 4QYHA 1V0PA 3O7LD 4OTFA 5JGBA 1JKTA 2RGPA 3DTCA 4WIHA 4BTMA 3HA8A 3PIYA 3H0YA 3P9JA 1QPEA 2XEZA 1U5QA 5AUWA 4IJ9A 4E6QA 3SVVA 4YC8A 3KREA 3A60A 3KRXA 4IAAA 5HHWA 5HTIA 5CX9A 3LFDA 4BIDA 3FV8A 3RCDA 4FTKA 4JNWA 4G3FA 2CGXA 4DCEA 3LFEA 3TG1A 1L3RE 4NM0A 4FTIA 3ELJA 4QYGA 2FSMX 2WTWA 3EWHA 5HO8A 3SXFA 4EOJA 4EH3A 1ND4A 4QMNA 2PL0A 3A7FA 1OBGA 3GU7A 3V8WA 1M2RA 3EN5A 3THBA 5HORA 4FIGA 3C7QA 4LOQA 4IQ6A 1UNGA 5FEEA 3WARA 4JVGA 2GNLA 4CLJA 1PY5A 5DNRA 3CP9A 3ZUUA 2B4SB 4FMQA 5TF9A 3RK9A 3AC1A 4OBQA 3ZOSA 4YTFA 4FKRA 5DG5A 3PLAE 3MFSA 2YAKA 4CYJA 4BCPA 5FGKA 1H27A 4WNMA 4E5AX 5CS6A 3DKCA 3PA5A 3MPAA 5D11A 1HCKA 2Y6MA 3CBLA 5LCKA 5ACBC 3ZO4A 5DBXA 2WTIA 3KFAA 3G0FA 4CFUA 1XQZA 3SRVA 4CCUA 4BZNA 4OAVB 3QLFA 4C62A 4MK0A 5AP5A 5LVMA 3N4VA 3WE8A 2HCKA 1Q97A 2BRNA 2UZUE 4IWOA 4QRCA 1V0BA 1XH4A 3GCQA 4K9YA 4PTGA 3KU2A 4I93A 4HCTA 5M09A 1QMZA 4KUJA 4AS0A 2FGIA 2PZ5A 4L7SA 4DFXE 3UZPA 3WZDA 5E90A 4YHFA 4CZYB 4O82A 4JL9A 3RBWA 2YIYA 4K0YA 3VW6A 1JKKA 5AM7A 1M7NA 4Z9LA 4DEDA 3TUCA 4EHVA 4YJRA 1NVSA 3PVGA 3PXYA 2XKCA 4C35A 4D1SA 5A6OA 2H8HA 3R73A 4EH9A 5A6NA 2CKOA 5JT2A 5LVPA 2J0KA 3ZSGA 3PVWA 2GS2A 1YWVA 5A46A 5FXQA 5AA8A 2JFMA 3EH9A 5FBNC 4YSJA 3MY0A 3UZTA 3FQEA 4MH7A 3HDNA 4TKSA 3RM7A 3R01A 1PF8A 5CANA 3LMGA 1WBPA 4C58A 2HAKA 2X0GA 4UEUA 5A9UA 3Q9ZA 3Q53A 3A2CA 3ZRLA 4OTIA 1DAYA 1OPKA 5AEPA 3NUPA 5H3QA 5I9YA 4TL0A 3LFCA 4TTHB 1F5QA 1GZ8A 4X0MA 4HVGA 1X8BA 3CQWA 3ATSA 3LFSA 4R78A 4JR3A 4U81A 3KXGA 3I0OA 3ZMMA 3GQIA 3QZIA 4FX3A 4D2PA 4XS2A 4D58A 5HVKA 4O7SA 3OXZA 3LFQA 3O71A 5CAVA 3IDCA 2YDIA 2C5VA 2ZV7A 5EHLA 3PA3A 4YZCA 3DA6A 2UZBA 1W7HA 2QCSA 3V6RA 5IQHA 4DEAA 3VIDA 4EOKA 4FKOA 3L8VA 3MSSA 5AFVA 3BE9A 1FMKA 4QMSA 5BYYA 3FMKA 3Q9WA 3B2WA 4RT7A 4GKIA 4IVBA 4YC6A 4EWQA 4MD9E 2UW6A 1PXJA 3IQ7A 5TKDA 3QTQA 4PL4A 2Z8CA 4BGQA 3DXNA 5AJQA 5L6WL 2AYPA 3HP5A 3OOGA 3S95A 4NL0A 5AR3A 5DN3A 4ANOA 4ASXA 2J5EA 4D2RA 2IW9A 4J1RA 1BYGA 1SVEA 4FTLA 3NNWA 1H01A 3VUTA 1U4DA 3FQSA 1NA7A 3C4FA 2I40A 4JBVA 5KHXA 5FUTA 4FYOA 3CTQA 3VUMA 4UN0C 1BMKA 4C37A 2X4ZA 3ZXTA 4F09A 2R3KA 4R5SA 3DK7A 1XH9A 2WQOA 3Q5ZA 4ASDA 2VU3A 4QMWA 5CEOA 3BCEA 2G9XA 3E92A 3EN7A 3QUEA 2G2IA 2O0UA 2XK3A 3QUPA 3R04A 4E4LA 2A19B 4GFOA 3MA6A 4UMQA 3QXPA 3VS7A 4LI5A 4G5PA 2VWYA 4X3FB 3RP9A 4FEQA 1XWSA 2JD5A 4GG5A 2ONLA 3ZUTA 3F3ZA 3ITZA 3ZLXA 4YUQA 2VTLA 5HIBA 4TW9A 4UWCA 3HRCA 4DC2A 3BYVA 3CTJA 1CKJA 3KQ7A 2X8DA 2ZVAA 3PWYA 5DLSA 1YHVA 1OIRA 1NVRA 2QKWB 2OXYA 4FKJA 4R1VA 4LUEA 5AX9A 3TN8A 1IA8A 2WTKB 1MRYA 5AUYA 1JOWB 3BV2A 3V5JA 4GG7A 4ZLOA 3MFTA 5C03A 2JKKA 3MY5A 4O38A 3RHKA 2OK1A 4FL2A 4WHZA 4ACHA 4YTCA 5GNKA 5KMLA 3NCGA 4EH7A 4HOKA 3EQIA 2ERKA 4YZ9A 3BLQA 3NYVA 5TE0A 1T46A 2UZTA 3AGLA 3OMVA 5KZIA 4USFA 4FKPA 5BQ0A 3QQFA 4I0RA 4FVPA 1PXNA 5JFXA 4CLIA 4BCOA 5E1EA 3UPZA 4NSTA 3KC3A 3GEQA 4QTEA 2BAKA 3RHXA 4WA9A 3JY0A 3QLGA 5L2IA 4H58A 2BDJA 4KB8A 3LQ5A 2QURA 3KXXA 4D4VA 3NWWA 4IFGA 2VGPA 3CKXA 3DAKA 3KVXA 4CFVA 4DFLA 3A7HA 1JWHA 3HV3A 3I79A 5D41A 3U54A 1ZLTA 2W1DA 2OU7A 4TYGA 1OKZA 3MFRA 4FT3A 3SHEA 2CJMA 4AQCA 5ITAA 4H1JA 2F7XE 3BQCA 4U79A 3L9NA 1YXTA 2Z60A 3PVUA 4B0GA 1I44A 4EQUA 3I5NA 3MVLA 5AR2A 5F95A 2V0DA 5JMSA 4ZZOA 4IBMA 5CF8A 3DZQA 2YCRA 2VWIA 4IHPA 1YWNA 3VHKA 5ANOA 4O7LA 1Q41A 1ZY4A 2B55A 4TYHA 5HKMA 4XBRA 5LXMA 3COHA 2Q83A 3KK8A 1UWHA 1V1KA 3VUIA 1YI6A 3EQDA 3G33A 3R7UA 5I3RA 2Y4PA 2OF2A 3BU3A 4RPVA 2CGWA 1P2AA 2YIRA 5J5TA 3U6JA 3PSCA 4X6RA 3ZM9A 2XNOA 3R1YA 5DEYA 3GT8A 3O0GA 5DA3A 3LLAA 2FVDA 1KV1A 4HVSA 3EFWA 3UVPA 2UW0A 4FV1A 4EOIA 4H3PA 5KCVA 2CN5A 3UOJA 4QP2A 1OB3A 1CM8A 4YJOA 3DBEA 4K18A 3LZBA 2OSCA 3W2OA 4K6ZA 4JR7A 2JDRA 3TV7A 3CPCA 4IE9A 5BVDA 3DJ6A 4J99A 4GK3A 2BIKB 2B7AA 4R6VA 1LR4A 1V0OA 1JAMA 1PMUA 4AOJA 4J71A 2VO0A 4X6QC 4FZFB 3VF9A 5IA5A 5K4IA 4G6LA 5KKRC 3MIAA 4BCFA 1Z9XA 5FDXA 3SXSA 4ID7A 5IQIA 2YIXA 3R9HA 5LWNA 1HOWA 3RWPA 5IZFA 3FMLA 2VTAA 4Q9ZA 5LMAA 2ITVA 2IWIA 4BBMA 5IEYA 4L3PA 2O8YA 4UXLA 2XIZA 1KE7A 4FKGA 2PZIA 3D0EA 5E91A 3ZLSA 5KMMA 5IQDA 4RJ8A 3V5LA 3QZFA 3EQRA 3TV6A 4OAUC 3G9LX 3P23A 2GQGA 2RFDA 1G8SA 3IW4A 4IWPA 5AP0A 4N4SA 4E3CA 1XJDA 3NCZA 4NM7A 3KF4A 4GV1A 3EJ1A 5CU6A 1EH4A 2WQNA 5EK7A 1CDKA 4BDFA 5IH6A 2QOQA 5IA1A 5AM6A 3NW5A 2Z7RA 4M66A 4TNDA 5CSXA 3NSZA 3VW8A 4EUTA 3U9NA 4UMTA 3U87A 4QPAA 1GZOA 2PVFA 3R02A 2VTQA 4O7TA 2ITPA 1VEBA 4FT0A 2QD9A 4CTCA 5JKGA 5E92A 2C47A 4ZY5A 4PPCA 3I6WA 4I5CA 2VRXA 3R1NA 2C69A 5HCXA 4TYIA 3ZFYA 4CFWA 4B9DA 5TOZA 5F94A 4Y46A 4Y83A 3FLWA 1PYXA 2VV9A 4KIQA 4G34A 1W98A 4FF8A 4J95A 2W1FA 4KRDA 5A14A 2O2UA 1OECA 4CG8A 4ONAA 4DG2E 4EL9A 2PVNA 4RIWA 4RLKA 3R9RA 3BEGA 3VQUA 5BMMA 3VUGA 1BX6A 2GTMA 4HNFA 4RVTA 5CENA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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