4WG5A

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1) in complex with inhibitor uw1647
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
464
structure length
464
Chain Sequence
TAIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKEQISVDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMRMKGQDASMLDASAVEHEVDQVLDAVDFDKNGYIEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Calcium-Dependent Protein Kinase 1 from Toxoplasma gondii (TgCDPK1) in complex with inhibitor UW1647
rcsb
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Toxoplasma gondii
total genus 162
structure length 464
sequence length 464
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2014-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4wg5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4wg5A01
1MRVA 2E9UA 5JGBA 5B2KA 4XV3A 3ACKA 2JIIA 2R3QA 3CQWA 5C9CA 4F6WA 5CEKA 2QU6A 5AR4A 3TDWA 2RKUA 4IFCA 4M7IA 1Q24A 4A4LA 3BE2A 3S3IA 3VHEA 3MH2A 4AFEA 4MF0A 2J7TA 4RJ8A 2OF2A 3TV4A 5CAQA 2AC5A 1WBSA 3W1FA 3WE8A 5JRQA 3LVPA 4RX8A 3FI2A 3GI3A 2ERZE 4NKAA 5HE2A 5AEPA 4MEDA 4ACCA 4KBKA 4YTFA 4CLIA 3R00A 4TWOA 3R7YA 4AOTA 4WNPA 1YI3A 3KK9A 4LFIA 5IQIA 2GNJA 4M0ZA 4IZ5A 2W1FA 2YISA 4E5BA 2IG7A 1TQMA 1UU7A 4F1TA 4JR3A 2G2IA 4IX5A 2CKEA 3OT3A 4QMYA 5AP6A 5EW8A 2WMXA 4X7QA 5DT0A 3OUKA 4Y8DA 5DVRA 1SVGA 2UW8A 3VJNA 4KKEA 2PZ5A 2FA2A 4G3CA 4P5QA 2XUUA 2YITA 4BIDA 4OBOA 5FBOA 3UDBA 2HXQA 2H9VA 3RKBA 4XUFA 4KRDA 3LHJA 4S32A 4O82A 1JBPE 4FIJA 3BQRA 3UTOA 3R1YA 5IQCA 4JQEA 5FDXA 2YIWA 4ACMA 3GCVA 3UPXA 4Y5QA 3VS2A 4DGGA 1PXMA 5CSPA 2WMSA 3ZFYA 1WZYA 1YXTA 4C61A 2G2HA 5DNRA 2ERKA 3PXZA 2OSCA 2XZSA 3V8TA 5DLSA 2WMAA 3NYVA 4FIEA 5HE1A 3TUCA 2UZUE 5AFVA 4BCKA 4C4JA 2BDJA 4QTDA 3CD3A 4R6VA 4D2RA 4RIXB 5CAVA 1PHKA 2UVYA 4IM0A 2A2AA 5I9UA 3UOHA 4ACGA 4AG8A 3R8PA 4EHGA 4DGOA 3PDTA 3RGFA 2W7XA 4BKZA 3TKIA 4NU1A 3AOXA 3ZHPC 4CT2A 1GAGA 4WUAA 2XRUA 4CZUA 2YDKA 4I6BA 1W0XC 3R7EA 1XJDA 3COMA 3F3TA 5FEEA 1OIQA 1UVRA 4ZTRA 3FE3A 3BYVA 3CGOA 4XG3A 1H1WA 3FAAA 3LXPA 3VQUA 5EM5A 5HG5A 3EH9A 4UMPA 3RVGA 3V5QA 4O7WA 1OUYA 3C5IA 4C02A 2BFXA 4USEA 2VUWA 3W32A 3V01A 1FGKA 2BRMA 2ZV2A 5IA1A 5IPJA 2I0EA 5FXQA 1YDRE 2EU9A 2VO7A 4LL0A 2XB7A 3SV0A 3TUBA 4OAUC 2H8HA 3SVVA 4BDKA 3ENHA 4OT6A 4FIIA 4W9XA 3GCQA 2PSQA 5L6WL 4AOIA 3R2YA 3W2QA 5CF4A 3E88A 5K3YA 3THBA 2OH0E 2IN6A 3HLLA 3EB0A 3AXWA 1WBWA 3LFEA 4FUXA 3QTSA 4EHEA 4N6ZA 4L44A 1R3CA 2A27A 1YWNA 3KMUA 4XV1A 3TI1A 1LP4A 4CQGA 4DC2A 3KREA 4J7BA 3NCZA 4GFMA 5BYLA 3RBWA 3LQ8A 3BYSA 4EH3A 3LLAA 1PRYA 3FY0A 2C69A 2CNQA 4RX7A 1LEWA 5HU3A 3SXFA 4TYHA 4AW0A 4P4CA 3FMEA 3P79A 4BFMA 4DFLA 4GU6A 5AR8A 2J0LA 2UW3A 3EJ1A 2VGOA 1ZYCA 3WOWA 4JX3A 1JNKA 1CM8A 3O96A 5HICA 3DNDA 3UG2A 2UZNA 2VO6A 3R9HA 4ZJJA 4FC0A 4DCEA 2BZJA 4CFVA 4CV8A 3LQ5A 3H3CA 5CVHA 2O5KA 3HV4A 4F9WA 3DTCA 1CSNA 2W1EA 3PXQA 2BR1A 4A9YA 4YTCA 2B7AA 3K3JA 5HKMA 4AZWA 4PP7A 5M56A 3PJ8A 4BCFA 3EIDA 2EVAA 4YJUA 3H30A 5E91A 1GNGA 2QOOA 4ASEA 3SGCA 4UBAA 3RP9A 4FG7A 4Y85A 2A0CX 5FM3A 4O0VA 3VO3A 3UQGA 4DEAA 4O0RA 2X1NA 3E8EA 4QQ5A 4BDIA 3QLFA 1JSUA 1PW2A 3GVUA 1I44A 4GT3A 5FLFA 4XG2A 2ZV7A 3C4WA 3ALOA 3Q2MA 3VC4A 4O0TA 1P2AA 4EQCA 1OL6A 5HEZA 2ZM3A 4RT7A 4J98A 2C30A 3PIXA 2XM9A 1KE6A 2R3MA 4H39A 5IUIA 2H6DA 4RFZA 5DT4A 1Q5KA 4BVUA 4D1SA 4AWIA 3M11A 3PY0A 3Q96A 3E63A 4P5ZA 1Z5MA 3HUBA 3DQXA 3VN9A 2I0YA 4ALVA 2HZNA 2ZV8A 3QC4A 4GK2A 4GYGA 4FZ6A 3G90X 5J1VA 4U42A 4YJSA 3DAEA 3HZTA 4FGBA 3DAKA 3D83A 4G1WA 4AN2A 1RE8A 3C4ZA 4LOOA 4O1PA 3FYKX 2XNEA 3Q4UA 3GU8A 2JIVA 4BDGA 3DXQA 3DTWA 5EHLA 3MFSA 2RFNA 3T3VA 3F5UA 1WVXA 4YLLA 5ANEA 2XYUA 2C5VA 4S34A 4ZSJA 3PJ3A 2B0QA 1GOLA 2UVZA 5D9HA 5BYYA 3GFWA 2IZUA 5AV4A 4XLIA 5AUUA 1XH9A 1QPCA 2CDZA 2R0UA 3IG7A 3KK8A 3ZC6A 5HHWA 4E73A 5IH5A 3JY9A 3PE1A 2C47A 4F6UA 5CXZA 5KKRB 1U46A 5BQ0A 2W9FB 2XIKA 2FUMA 3DAJA 4YHJA 5ACKA 4R8QA 3FLSA 1XH8A 3DU8A 4DA5A 4XV9A 4Y5HA 3WF8A 4IAFA 4X6QC 3FQSA 3GCSA 2JD5A 4BIEA 3BE9A 3KU2A 4PL3A 4BN1A 3HP2A 2CGWA 4AUAA 3COKA 3DPKA 5I0BA 3RAHA 4DEGA 3GOKA 1ZMUA 4YO4A 4NEUA 4ASXA 4UXLA 5A3XA 5ETIA 5IZFA 2JLDA 3NSZA 1H1RA 2G9XA 3GU4A 4OTDA 5CT0A 4F99A 4EBVA 2FVDA 4JBVA 4I6HA 3UO6A 5CNOA 2GS2A 4E93A 2Z7LA 4MXOA 2BIYA 4FIFA 3UIBA 4C4HA 5KNJA 5IQGA 3VUKA 3FC2A 4QMPA 2FH9A 4ALWA 1Q3WA 1OL1A 4QTBA 1ZZ2A 5AV2A 5K4IA 3FMHA 4WNMA 4XYFA 4E20A 4IACA 3BIZA 3VUHA 3ZU7A 1QPDA 2C4GA 3EL7A 4DINA 4PRJA 3RAKA 3QTQA 4QTCA 5H3QA 5AAFA 4EEVA 2HY0A 4EUTA 5CTPA 2E9NA 1FVVA 2W1IA 5HESA 4QQTA 4FTLA 4YR8A 3UE4A 2J5FA 5AWMA 3DKOA 4IADA 4GKIA 4G6NA 2B54A 1Y91A 3DKCA 4U3ZA 4X3FA 5F94A 4Z7HA 2PULA 4FUYA 2WTVA 3OCBA 5AR5A 2Q0BA 4JLCA 4C36A 4C58A 2IPXA 2PMOX 2XEZA 2X2LA 3T8OA 1BMKA 4E4MA 3AD5A 4ANMA 4A06A 4BRXA 5HX6A 3E93A 3TJCA 4FNXA 2OJIA 3QGWA 4IJ9A 1KE7A 4X2FA 3OF0A 2XK6A 5ITAA 1JWHA 4MQ1A 3DKGA 1U54A 2R3PA 2KTYA 3ACJA 5ANGA 4F65A 1JLUE 2BKKA 4DG2E 4CSVA 4Q5EA 4GYIA 3EZRA 2XK3A 4FKWA 1NVQA 4D2TA 4BTFA 4I20A 5HG8A 4GVAA 1F5QA 4A4XA 1RQQA 3TKUA 1SMHA 3FV8A 5EH0A 3EFJA 3KRRA 3BEAA 5KMMA 4HYSA 5DR6A 4PX6A 2VU3A 2RG6A 4HOKA 5IMXA 3UIMA 4FVRA 3LPBA 4C3RA 4DH7A 2P2HA 4F7JA 2BMCA 3FXWA 3I7CA 3EQRA 2V5QA 4ITIA 2DWBA 4TZRA 3D7TB 5GZ9A 4QMTA 1YRPA 4A7CA 4IWOA 4PL4A 3FEGA 2WMUA 3MJ2A 2RFEA 4KA3A 3VBXA 3BYMA 1FOTA 3DZQA 5HNBA 3VQHA 3NW6A 1IG1A 1H01A 4BCPA 3ALNA 3FL5A 2YJRA 3RCDA 2JKOA 4BHZA 4FSMA 4NM7A 4W4YA 4GUBA 4EZ5A 4N57A 5AUXA 3BLRA 3R0TA 1F0QA 1Q8UA 3FQHA 5CNNA 4R1YA 4LYNA 1FMOE 4E4LA 4M0YA 3IGGA 2XKDA 3K2LA 3QF9A 5DRBA 4JIAA 4V0GA 3RMFA 4KD1A 4BTKA 2VX3A 2QG5A 4RVLA 4FKLA 3UOJA 3M2WA 4X3JA 1IR3A 1WCCA 2XIYA 4FTQA 5E7RA 3U9NA 4BWPA 4JRNA 2XS0A 3BELA 3PJCA 1YVJA 3RHKA 2IO6A 2QOCA 3QQLA 4HCTA 4G2FA 4HW7A 4FK6A 1WFCA 3Q6UA 3WZDA 1GIHA 4ZS0A 1CMKE 2B55A 5CU4A 5I9ZA 4FIHA 4D5HA 4EOKA 4M66A 4H05A 3P7BA 2GHLA 3Q9WA 4RGJA 4AFJA 4O7SA 4CG9A 3U55A 3BX5A 1Y6AA 2VWXA 3A7FA 3HYHA 3KMMA 4C3FA 4C35A 3NNUA 3DBDA 3JXWA 4ZZOA 3RPRA 4CGAA 3QA0A 3IKAA 4WO5A 3Q9ZA 4CRSA 3C51A 2QO2A 3EYGA 2YM6A 3VRYA 4HVIA 1SNXA 3TUDA 4GUEA 2R3KA 4BDFA 4QYEA 4I5PA 3U4UA 1OITA 4PMTA 5HLPA 5I4NA 3BV2A 3CD8A 3LCTA 2UZDA 4YHFA 1OGUA 5JFVA 3UC4A 2X81A 2UW9A 2UZWE 4K8AA 2OJ9A 2BAQA 4FZDB 5DR2A 3NYXA 2XJ0A 1MQ4A 5CU6A 3ZSGA 4ID7A 1YXVA 2ITUA 4NH1A 4P2KA 4WBOA 4FV9A 4PMSA 2VTMA 3O71A 5HVKA 3R30A 4G31A 1U4DA 3PIZA 1WBPA 2OXYA 3JUHA 2BVAA 4E26A 3ZLSA 3DZOA 4AS0A 3TEIA 5L2SA 4R78A 1T45A 5ANOA 3G33A 3GC7A 3HV6A 3HMMA 2CGUA 4FSQA 3HMOA 1M7NA 3JYAA 3ORPA 3U6HA 2QOHA 3EKNA 4YU2A 4ONAA 4YURA 1FGIA 3BHTA 4PTCA 2YIRA 3CLYA 5D7AA 4C2WA 1FVRA 4FOBA 3HX4A 4M15A 3HMPA 5K0XA 3VBTA 4L45A 2QVSE 2R7BA 3LCSA 4Y46A 5IF1A 3ORLA 4M67A 5HQ0A 5LMBA 5I9WA 2RG5A 4D4VA 4FTCA 1WMKA 4OTIA 5H9BA 3O7LD 4WT6A 2Y8OA 2YN8A 4RIYA 3MDYA 3AGLA 4QQJA 3BV3A 5LMAA 4O7VA 1W83A 2HCKA 3UNJA 3F7WA 2JDVA 2OK1A 3OWPA 4FV6A 4WG4A 4FSRA 1ZYDA 2I7QA 3D5WA 5AA9A 2BAKA 2NP8A 3BBWA 3BZ3A 1OMWA 3UNZA 3ZLYA 4XS2A 2EUFB 3E5AA 2EXCX 2XK8A 1R39A 3NYOA 2WMTA 3ANQA 3PRIA 3QQFA 2UZLA 3TZ9A 1CTPE 4XOYA 4C4FA 2X2KA 2C6OA 5FTOA 2VD5A 1OZ1A 5DT3A 3IK3A 3U54A 3Q32A 4APCA 2BZIB 2JAMA 4GL9A 3QALE 2J4ZA 3ID6C 2FB8A 3LOKA 5D7VA 3LFQA 2FYSA 5BVKA 4C37A 3ANRA 5K9IA 4KS7A 2XNMA 4FKRA 4L6QA 4ITJA 3GUBA 4ZSEA 2CKOA 3MESA 3NNVA 4JBOA 1HOWA 2OG8A 5HE0A 1NT2A 3KRXA 4IHPA 3PVWA 2VTQA 2VTAA 4XJ0A 4C38A 5BVDA 3SA0A 3KA0A 3ORZA 4DT8A 3ZCLA 3E8DA 4HCVA 5JRSA 4CKJA 1BL7A 4GJ2A 2JGZA 3RPVA 3MH1A 3W2PA 4DGNA 2R0IA 3QCQA 3MFRA 3V8WA 4AXAA 4RA4A 5TO8A 5M4IA 3N51A 3UODA 4BTMA 5TKDA 1OIRA 5FDPA 1IAHA 4GT4A 4E1ZA 3IW8A 3JVRA 3R9RA 2Y7JA 3VUIA 1UWJA 2UW4A 2ITZA 3Q3BA 4TYIA 5I9VA 4CNHA 2RF9A 4QYHA 5DE2A 3TN8A 1XBAA 2PVYA 4OTPA 2Z02A 1DM2A 3D5VA 4OW8A 4F1OA 4DH8A 5TR6A 4F4PA 4O6LA 4PMMA 2PE2A 2B9FA 2XMYA 4YC8A 4HVGA 3KKVA 4ANNA 3CTHA 2F2CB 2XA4A 3VAPA 3LM0A 5LVOA 3BEGA 4MD9E 4DFBA 2C5NA 5J8IA 5KMOA 2HZIA 5AUZA 4GSBA 4LM5A 3MFUA 3PVBA 4ZTNA 4D2WA 4Z16A 4FBXA 5FQDC 4I0TA 4L00A 2XCKA 3QZIA 2BHEA 2GNFA 2X8IA 2UZTA 4X3FC 4C62A 4CZYB 5IA4A 4Z3VA 2EB3A 3GQLA 4PUZA 4BDHA 3UMWA 5EYDA 5FP5A 3LJ0A 3FLNC 3PA4A 2WKMA 3WIKA 3KMWA 3R22A 4R7IA 4FX3A 3G6HA 3VS6A 5AV3A 5AV0A 4EKKA 4I6QA 1JVPP 4DGLC 2E9VA 3PLAE 1B6CB 2J6MA 3EN7A 4DH1A 2W96B 1PMNA 3D7ZA 3P23A 3CE3A 4H3PA 1Q41A 4BCHA 2I0VA 3BHYA 5M4CA 5GNKA 4BI1A 5HX8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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