4WNMA

Syk catalytic domain in complex with a potent triazolopyridine inhibitor
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
290
structure length
273
Chain Sequence
VYEVYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A Novel Triazolopyridine-Based Spleen Tyrosine Kinase Inhibitor That Arrests Joint Inflammation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 273
sequence length 290
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4wnmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4wnmA01
4JNWA 1XH5A 1QMZA 4BWPA 4IZ7A 3FMDA 4Q5HA 3CTQA 5ANEA 5J5TA 1PKDA 3EKNA 5E9EA 3VS0A 1M2PA 2ITWA 4EH3A 5BVFA 3EHAA 3ZS5A 3B2WA 4D5HA 2ZV9A 4JG8A 4EK6A 3MESA 1GAGA 5IEVA 5E7RA 5EFQA 1ATPE 2Q0NA 4BGHA 1QPEA 4XV3A 2AYPA 1OKZA 4FODA 4CFFA 5KHWA 2O2UA 2UZOA 2GPHA 4PDPA 2YM5A 5GNKA 5JGAA 1RW8A 1SNXA 4JX7A 4QMLA 2WGJA 4F7JA 2HXQA 2GHLA 4I0SA 4BKJA 3O71A 2VWXA 4XP2A 3D5XA 2ZJWA 2OXYA 4PDYA 4UWCA 4EQUA 3KA0A 4HPUE 4GFMA 3WYYA 3MI9A 3LQ3A 4TYGA 2BTSA 4JL9A 4FE2A 4YP8A 3FZOA 3QRKA 1JOWB 4N4SA 2V55A 3A4OX 3LM0A 4O86A 5C4KA 2QOCA 4IB1A 2YACA 2EVAA 3BWFA 4BIBA 2BDJA 3AMYA 3JXWA 1SVHA 1P5EA 4GS6A 4YU2A 3LLAA 2X9FA 3PRFA 4GVJA 4O22A 3EQCA 3UNJA 5DIAA 2PE1A 1FMOE 1FOTA 3NR9A 4FSTA 3IGOA 4M0ZA 5HVJA 4BCKA 2C69A 3BCEA 3E8NA 5TE0A 4MF1A 3L8XA 4UB7A 4BKZA 1OL1A 3GCQA 3A7FA 1IG1A 5EW9A 3MY0A 4EK5A 3HAVA 4W4VA 1OI9A 2UVXA 3C0IA 3I5ZA 3IW6A 4NFNA 4TYHB 3TZ7A 2CHLA 4WA9A 5JEBA 4C59A 4PTCA 1P4FA 2Y0AA 3V8TA 3RM6A 3E8DA 4ACDA 4CG8A 1ZMWA 3MWUA 1YI4A 5E8SA 2NO3A 4FGBA 3ZEPA 4C2VA 4O7YA 1K2PA 1J91A 5M08A 5AV3A 4FV5A 4I5PA 3HUCA 2B9FA 3CQEA 5CF8A 2EU9A 4BN1A 1O6LA 4B9DA 3BPRA 3QKKA 4X21A 5KZIA 4L01A 4NM3A 4MBLA 5CANA 1NT2A 1NVSA 3P0MA 2WHBA 1PXPA 3BBTB 1REJA 3Q5ZA 4RIYA 4EOMA 1A48A 4KIOA 5BVEA 1PMNA 3A8XA 3F82A 1SVEA 2HZIA 2QOQA 2Y7JA 3GU5A 2YISA 3SG9A 4FNXA 4RWLA 4NM5A 2OJJA 2YA9A 4FIGA 3QTXA 4GCJA 1Q8UA 4D2WA 2YERA 3QAME 5HTIA 2G15A 3EFJA 4FI1A 2XJ0A 3BHHA 3EN9A 4NIFA 3CPBA 2BPMA 2Z8CA 4BDGA 1H24A 2X7GA 5CVHA 2VTOA 2YN8A 5IZFA 4B8MA 2GNGA 2VV9A 3E62A 4A9UA 4ANOA 4BKYA 1KUTA 5DRDA 5HBEA 4BY9E 3Q4ZA 1YKRA 4IJ9A 4QMYA 1T46A 4RX7A 3ROCA 5CU0A 3N4VA 5BVNA 3IDBA 3T9IA 4F09A 2GCDA 3ORTA 3GU7A 5CEKA 3VUTA 3MTFA 1WVWA 2JKOA 3BLQA 5IQDA 4BIDA 3ORZA 3OXZA 3BX5A 3KCKA 3KXZA 2HELA 4GUEA 4BHNA 1XQZA 5HE0A 5FUTA 4LMUA 5DH3A 4F6SA 1CTPE 3KGAA 5EG3A 4CRLA 3KVWA 5HIEA 2QC6A 3V5LA 3VS1A 4FIIA 3QQGA 3L8SA 3UYTA 3DKOA 3EFWA 3O23A 4PDSA 3CSVA 5FM3A 4OTDA 4QT1A 5AEPA 1OPLA 3U6IA 2VU3A 4CCBA 5L2WA 3KXNA 1BI8A 2XB7A 3RPSA 5CF4A 4DGOA 4NW5A 3MW1A 5DLSA 2VO3A 3C51A 1JKLA 2WD1A 3RINA 2VRXA 5EYMA 3NUYA 3R63A 5K5NA 5M4IA 3FMHA 1OPJA 5EI2A 3F3WA 1A06A 2VO0A 2OH0E 4HYIA 3ORLA 4S32A 2GTNA 3O50A 3QTZA 5K0KA 3O51A 4AU8A 4EL9A 3D5UA 4EOSA 5LCJA 1Z5MA 4EHGA 4PNKA 4TRLA 4N70A 5LMKA 4HGTA 4O1OA 3OCTA 2VTTA 3PYYA 5AIRA 5AV4A 5HG9A 3ZUTA 4PP9A 5HNIX 3WBLA 4FV4A 4ITHA 4K0YA 2YWVA 4WUAA 4F9WA 2W4OA 4JDKA 3TTJA 1GOLA 3EWHA 3FJQE 4GT5A 3VNTA 3ORMA 1JWHA 1RDQE 5A4CA 3D15A 2OIBA 3HLLA 4FKJA 4IX6A 4XV2A 3FLYA 4DBXA 4XBUA 4L42A 1TQMA 1H27A 3JUHA 2ITQA 3RK7A 5C1QB 5GIPE 2ZMCA 3GGFA 3MIYA 4GJ3A 2CPKE 3Q32A 3VUGA 3HAMA 3PXZA 5EM7A 4ENXA 2CN5A 5A6NA 3PXRA 4IAZA 1H1PA 2PMLX 2PTKA 5KMKA 4EORA 5IEYA 3NW5A 4ZSEA 3S2PA 3WZEA 4BZOA 4U40A 5I0BA 1S9JA 1UU3A 2YCSA 4RJ5A 5JSMA 5BNJA 3SG8A 1FVVA 2BDWA 2ZOQA 5FP6A 3DKGA 1OBGA 5E1EA 1JQHA 3Q6WA 2VO6A 4IE9A 5LXMA 1GZKA 3UOJA 3COMA 3FHIA 4U41A 4I6HA 5FDXA 4C61A 4UY9A 3LQ8A 1WBVA 3C13A 4XS2A 4BTJA 2CKOA 3OUNB 4CG9A 2YAKA 4JX3A 4ZMFA 4D1XA 3PSCA 3KRWA 1XWSA 3MA3A 4WKQA 1P4OA 3B2TA 3TWJA 2QOOA 4FG8A 3BLRA 3TKUA 1XH9A 2CLQA 3IECA 3W2RA 3WZDA 5HX6A 4V04A 2W7XA 2GS2A 3IGGA 5L6PA 4RGJA 4ZS4A 2VUWA 4X3FA 2J4ZA 5KMOA 4U7ZA 3QFVA 4CCUA 4RZVA 5L2TA 1SNUA 4G5JA 4EONA 3DGKA 3H30A 3M42A 4JRVA 5JFWA 2HCKA 3UPXA 4H1JA 4X2GA 4EYMA 4JG7A 3TM0A 4HNIA 3W1FA 4U5JA 2R3QA 1PJKA 2X6DA 3IOKA 4M69A 4YNOA 3JPVA 4O81A 2JKMA 2YM8A 5DEYA 2J7TA 3G90X 4KRCA 1H1SA 4OBQA 4C4FA 4CSVA 1G8SA 3V01A 4H3PA 2B53A 4HZSA 4YC6A 2OK1A 4UXQA 5H3QA 3EMGA 4WSQA 3FY0A 2HAKA 2CGWA 4AW2A 1M2QA 4TYHA 4FTUA 3ZFMA 4ASDA 4Y72A 1YOJA 4OUCA 3VVHA 1WVXA 4Z9LA 2PVMA 4TYIA 4DTKA 5AV0A 2GS7A 4PMTA 1PHKA 2NP8A 4XBRA 1QPDA 4YSMA 3LXLA 4MXYA 4QMPA 3FMMA 2OJ9A 4C34A 4WBBB 5HCZA 5CAPA 5LJJA 3QC9A 4ACCA 4BDKA 5IA3A 1UNHA 3OTUA 4BBEA 3NUPA 1O6YA 1BMKA 3QYZA 3C4WA 4F1OA 1U46A 4UZHA 4C3RA 2UZVA 2UZBA 4A4OA 5BQ0A 2P2IA 4XEYA 3LJ0A 1NXKA 3UIUA 3KMWA 3ZFYA 5IA1A 4TWPA 3O2MA 3UVPA 2XK9A 5AUXA 2R64A 4E4MA 3A7IA 5F20A 3Q6UA 3CS9A 4FG9A 4WNKA 4L53A 5CU2A 3DOGA 3MH0A 5E8ZA 4H1MA 3WF9A 4J95A 2HXLA 4R8QA 5E1SA 3KRJA 4QPMA 4OGRA 3LKMA 1FQ1B 2GNHA 1OBDA 5ACBC 4AW0A 1ZWSA 2VWYA 3CKWA 3LE6A 4TWOA 5HNGA 4Z7GA 1CKPA 3GU4A 3HEGA 4BDHA 3OVVA 3VJNA 2O63A 4FKVA 4RX9A 5I5ZA 3RNIA 4F9AA 3FEGA 4X6QC 4QP8A 3DV3A 3MB7A 1X8BA 3PXFA 2FSOX 2QR8A 3LM5A 5CLPA 4E6AA 1SM2A 2AC3A 3Q96A 3QA8A 3RBWA 1A9UA 1CDKA 3DFAA 3ENHA 1YRPA 1NW1A 3DCVA 3BGPA 2PE0A 5CTPA 3CGFA 2Q83A 3HMNA 5EHOA 3FY2A 3K3JA 2V62A 2B7AA 5B2MA 1IRKA 5IKWA 4R7BA 4L43A 3CD8A 2VD5A 2V7OA 4LV5A 3EYGA 3QZHA 3POZA 3QCQA 4W4WA 5E8YA 3UO4A 2ZDTA 3C5UA 3RPVA 1PKGA 1W83A 4OTFA 3A61A 3R7EA 4MXZA 3DQWA 5CYIA 3N51A 4IB3A 4CT2A 3QX4A 3FC1X 2X8EA 4R5YA 2A2AA 3Q60A 1WCCA 1P14A 3C1XA 3R02A 3EZVA 4YJUA 3EL8A 4FIEA 5FQDC 2WXVA 3FL5A 3HP5A 3UDBA 2H34A 3HV5A 5AR4A 2VTLA 4AOIA 4TPTA 1NA7A 2BVAA 2CSNA 3UP2A 4EH5A 4BF2A 3R7GA 2F57A 3ORPA 3KB7A 2ITYA 4JIKA 3GNIB 1YWVA 3G6HA 4HOKA 3PG3A 4IZYA 4O0XA 3I81A 4P4CA 3Q4CA 4AZVA 4OAUC 2Y4IC 2REIA 1V1KA 2PZRA 4Y5HA 4O7VA 3ZXTA 2VX1A 3F9NA 2A27A 3ZONA 5HORA 4H39A 2OLCA 5IQHA 1DAWA 1I09A 2JIIA 4RJ3A 1IEPA 5EOLA 5HLPA 4BDAA 4USDA 5FD2A 4QMQA 5JMSA 4AQCA 4EEVA 1RQQA 5I9YA 3RCDA 2WMAA 3DB6A 5DR9A 1EH4A 1BI7A 3FXXA 3OWKA 2P4IA 4FT0A 5AP4A 5CEOA 1GJOA 4A7CA 4ARKA 5T6KA 2GQSA 3QWJA 4GK3A 5IQCA 3CTJA 3JVRA 2F2UA 1KOBA 3PVBA 3UMWA 4IFCA 4N6YA 2PHKA 3HVCA 2ZM1A 4FL1A 5TO8A 3V8SA 2BFXA 4AGWA 4U8ZA 4D2VA 4I41A 3ZC5A 2OG8A 3O0GA 2VTIA 3MVMA 1Y8YA 1H1WA 4UBAA 4ANMA 4EBWA 3OCSA 2VN9A 4F7SA 3EQPA 4BGQA 4FTOA 1TQIA 4O82A 4FKSA 3I0QA 2IVSA 4NU1A 5L3AA 2F49A 4Q2AA 3DQXA 3WZJA 3F5GA 3MFTA 4I0TA 3OT3A 4YLJA 2FH9A 3EN5A 2W1FA 3F5XA 1J3HA 3PJ1A 4E20A 4BL1A 3PXYA 4U3YA 4CYJA 3QZIA 5DFPA 5FEQA 5EYKA 4DITA 4DGGA 2C5OA 1OM1A 4HGSA 3IG7A 2VAGA 4CFWA 3QRIA 4S34A 4MH7A 2UZUE 4DBNA 3DPKA 1STCE 4EZ5A 4L3JA 4V0GB 2HYYA 2O3PA 5DEWA 2EUFB 3W2OA 1OKVA 2HY81 3BU6A 3QQHA 2ZV2A 2WEIA 3IDPA 3OY1A 5CU6A 1ZY4A 2RFDA 3LFFA 3D2KA 4NK9A 1PF8A 2YABA 4FZFB 4AXAA 1UV5A 5C8MA 2YDJA 4CQGA 2X9EA 2C6EA 2RL5A 4RIXB 4WNMA 4BBFA 3QU0A 2R3HA 1SZMA 1XKKA 2EXEA 3NUNA 2IW9A 3LXNA 4U42A 2R3JA 3W8LA 4U43A 5AP6A 3VBXA 2HWPA 2WFYA 1B6CB 2VTNA 4NT4A 4APCA 5AP2A 5BVWA 1WBTA 5JZNA 5HOAA 3HA6A 2X8DA 5KBRA 2QCSA 2WMWA 2ITUA 4FNZA 4G34A 3QC4A 1UU8A 1JPAA 2ITXA 2YCRA 3IW7A 3TN8A 3QTWA 3V04A 3R00A 3TEIA 3F3ZA 3ZSGA 5HBHA 2X0GA 4MWHA 4C4EA 4ZZMA 3VS2A 3DDPA 1YXUA 3QCSA 3EQBA 4S2ZA 2ZM4A 4JDIA 3SXRA 4UMPA 4DGMA 4Q5EA 4G6NA 5CSPA 2DUVA 3QRUA 4MNFA 3FLZA 4ZJJA 3SDJA 2C6IA 1TKIA 2XNOA 3DBEA 4PMSA 4O0RA 3KC3A 4XLIA 3MJ2A 3HYHA 5EI8A 4DLIA 4EJNA 2BKZA 2B4SB 4GSBA 4I94A 4I5MA 1URCA 2W4KA 4OW8A 1O6KA 2WTWA 3FUPA 3GFEA 3O7LD 3PRIA 4P5ZA 3NPCA 2WIHA 3C9WA 3ZU7A 2XP2A 4DCAA 2UW6A 3ZMMA 1CMKE 2W5AA 2IZSA 5DOSA 2QQ7A 3PPZA 2ESMA 2OU7A 3PZHA 3BU3A 1H26A 5HG8A 2H9VA 4L67A 4EQMA 3ATSA 5ETFA 4CVAA 2P3GX 5DHJA 1BLXA 5HI2A 2JDTA 3C4ZA 3E88A 2I0EA 3TTIA 3NS9A 4NEUA 2GS6A 4LOPA 5HKMA 3F6XA 3UTOA 3JR1A 2XK4A 4C3PA 4NW6A 4KSQA 2X8IA 1G5SA 3SW4A 3WF6A 4G6OA 1H1QA 4G3DA 4I23A 3NYVA 4XHKB 1WMKA 5AM6A 5ANDA 2P0CA 5E8TA 5B7VA 5A14A 2BTRA 5I9VA 4UYAA 5BMSA 4QP4A 4RVKA 4WG3A 2VX3A 2UVZA 3V5JA 3RHXA 5J1VA 1FINA 2WO6A 3UGCA 3V51A 5CASA 5C27A 3C0HA 4YC8A 4FTJA 4RC2A 1LP4A 3CE3A 4OLIA 5HCYA 4RIWB 3K5UA 5TF9A 4RMZA 5J8IA 5ANKA 2XK3A 3NLBA 3F3VA 2W9FB 4FYOA 2G2HA 2W1EA 2I0VA 1JAMA 2LGCA 3A4PA 5GJFA 5FP5A 3KXHA 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