4WRGA

1.9 angstrom structure of egfr kinase domain
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
326
structure length
289
Chain Sequence
AMGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKESPKNKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSVQLITQLMPFGLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDMDDVVDADEYLIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title 1.9 angstrom structure of EGFR kinase domain
rcsb
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 96
structure length 289
sequence length 326
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4wrgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4wrgA01
3R2BA 2YHVA 3N4TA 2FSMX 2OJIA 4QYHA 4Y95A 3OOGA 3EKKA 5DEWA 1JPAA 1Q41A 3DXQA 5AJQA 3TKHA 2GHGA 4OTPA 2XNGA 3NX8A 5KE0A 3RTPA 3H9FA 3T3UA 4GT3A 3RPYA 3QQJA 4K6ZA 1ZYLA 3U4WA 3PTGA 4ASZA 2AUHA 4C8BA 5IA4A 3W18A 2UZWE 3OP5A 2UW8A 3DKFA 3FHIA 4HNIA 3THBA 3OT3A 4DGLC 4FICA 3HUCA 2BFXA 3PE1A 1SNXA 3KK9A 3NW6A 4C2WA 4EWQA 1IAHA 4OTGA 4Y85A 2I40A 3LMGA 2BAQA 3BLQA 3BWJA 2ZOQA 4DLJA 4EOSA 1I09A 3NNWA 2O5KA 4JJRA 3R7YA 4Z16A 4EH8A 4PNIA 2UW5A 2C0TA 3ZUVA 3QQGA 3GEQA 2A0CX 5EDPA 3S1HA 1U59A 4EUUA 2Y8OA 3COIA 3MTLA 4D2WA 4X7QA 4FX3A 4U45A 5CENA 4CZUA 4E5WA 2JEDA 4LM5A 5FXSA 4FZFB 1GY3A 2WMVA 3NYNA 1REJA 3FLZA 5J9YA 2B9HA 4LMNA 2REIA 1CKPA 3EH9A 4RZVA 2A4LA 2W7XA 3FE3A 4C38A 1KV1A 1Q4LA 3NYVA 5K3YA 3NR9A 5AR7A 4PL5A 4ZTSA 1W82A 1LEZA 5ANIA 3ZHPC 2W5BA 3BWFA 2HCKA 4HOKA 3NAXA 4U81A 2JBOA 4NU1A 5FUTA 4U6RA 4O7WA 3PZHA 3ZH8A 1Q8ZA 2G2HA 4MWHA 3BEGA 4D2RA 2RGPA 2PMIA 3SC1A 3PP0A 3PIYA 4BTJA 4HGTA 3ZC5A 1JSUA 4CVAA 4BCNA 3IKAA 3A7JA 3A4OX 2W17A 3IS5A 4XJ0A 5IQAA 4FODA 4BDBA 2CGVA 2NPQA 5L6OA 2XCHA 4IX3A 5F20A 5CANA 4DINA 4LG4A 3BIZA 4QNYA 1T45A 2WTKC 3NSZA 4EKKA 3F3UA 4FTTA 4UWBA 4BCPA 3U6JA 3H0YA 4RA4A 4LQMA 4C33A 5EH0A 2NP8A 3D9VA 3DFAA 4FK3A 3R2YA 1YOJA 2YM7A 4K33A 4NKAA 4R3PA 1ATPE 4XX9A 5ACKA 5DFPA 3UIBA 5IQEA 3Q6WA 1B6CB 2YM4A 3WZJA 4AGDA 5M4FA 2CCIA 3R1SA 5E9EA 3ZLSA 1O6YA 4IFCA 2GFCA 2JITA 1VEBA 2XNBA 4AOIA 1WVWA 3BZ3A 3KRWA 5TO8A 1IEPA 3DV3A 3RNIA 2ZM4A 4MYGA 5JFWA 4GUEA 2R5TA 1QPDA 3FV8A 4F7LA 5FM3A 1UWJA 1FVVA 4O22A 4O27B 4NL0A 5LMBA 4LGHA 2X81A 2VGOA 1H1RA 4TYGA 4U3YA 4CRSA 4ALWA 3AMYA 1NVSA 5AP5A 4JT3A 3RCJA 3UQFA 3E8CA 3G90X 4FV8A 5LOHA 3H30A 1W0XC 5JZNA 4RIWB 4ZJJA 3MJ2A 4FKOA 4XOYA 4QP9A 1TQMA 3HZTA 4JX3A 3QRTA 4UMQA 4K9YA 1Q8WA 4QP2A 4YZCA 5FEDA 5BVWA 2J0IA 3RK9A 4QP3A 5AV0A 3NUYA 2F57A 4RSSA 5E1SA 3K3JA 4FV0A 4EH2A 1WAKA 3FC1X 4ZMEA 4IEBA 1J91A 5C03A 4M7IA 3M42A 4O38A 2Q0NA 2FO0A 4AE9A 4D1XA 3PZEA 4O7YA 4FKSA 4FVRA 4LOQA 5FDPA 2E2BA 4PP7A 3GQIA 4UZDA 4WNKA 1ZY4A 3HVCA 4AZEA 5KNJA 1Q8YA 4H1MA 1YHVA 4IZAA 4AZWA 2CMWA 4ZSEA 2ZVAA 2FA2A 5I3RA 4GJ3A 4FTJA 3GUBA 2YLFA 3KXNA 4ZIMA 2X4FA 4IWPA 4DTAA 4KINA 3QF9A 4I5CA 4BI1A 5M08A 2BTSA 4FKJA 3OS3A 4U7ZA 5M4CA 1WBSA 4RJ5A 4D2PA 4EONA 4NIFB 1XQZA 3ORKA 1YXTA 5CEMA 5HU3A 2P55A 2PUUA 2J0LA 3NWWA 2BUJA 2J2IB 2WFYA 3DBCA 4WNOA 4YO4A 3A8WA 1OIUA 5ACBC 4MQ2A 1P5EA 1PXOA 2C5XA 2V5QA 4GEOA 4GT5A 1KE5A 2QOBA 5D9HA 1CKJA 4DT9A 4Q9ZA 4RIWA 4CYIA 5IH4A 4O7ZA 3GGFA 3CEKA 3UGCA 1NY3A 5KBRA 2WO6A 5F95A 5L3AA 5TF9A 4QMSA 4KKEA 1OMWA 4GSBA 4QQCA 4WOVA 4GRBA 3MB7A 3E64A 1PMVA 3IGOA 4XP2A 2VWUA 1UNLA 2GTMA 5AP4A 4G17A 3QX2A 2F2CB 4FSQA 3BKBA 3QTWA 1KOBA 5E4HA 3WE4A 2X39A 3ZU7A 1XO2B 5GJDA 4D4RA 3V3VA 2WQNA 1FQ1B 3GB2A 2VO6A 3PY1A 3OY3A 1Q62A 3FZOA 3Q60A 4ZSJA 5J9ZA 3Q2JA 4ANLA 3NNVA 4DBXA 2ZV7A 4FF8A 3R9DA 3KA0A 5DBXA 4OTFA 2B0QA 4I6QA 4FOCA 3PJ1A 3BHHA 3W55A 3R1YA 2HWPA 5BVEA 1XJDA 4F9AA 2NRYA 3R30A 3FMMA 4F0FA 4BICA 1FINA 2X7FA 5HICA 2F2UA 2OH0E 5C8KA 2CN5A 5KZIA 4O7SA 4YSJA 5KCVA 2ITWA 1JBPE 5B2LA 3QCSA 3PIXA 3RPOA 5EKOA 4HVIA 3BBWA 3N4VA 4UEUA 2PMLX 3QKMA 4YGAA 4C4IA 1STCE 2WELA 3UBDA 2XK8A 3SVVA 2RSVA 4YU2A 2WMUA 1VYZA 5AA9A 3DXPA 4DE4A 1OIRA 2XNEA 3NNXA 5IDNA 3O8PA 3D14A 1WCCA 2XBJA 3UVQA 2VV9A 2ACXA 3ANRA 3JPVA 2JFLA 2W1DA 4M3QA 1H0VA 4PP9A 4QMOA 3TM0A 3AT3A 4IB1A 3N4UA 3UIMA 4CRLA 2GSFA 3CP9A 4L43A 2C3IB 5CAVA 4O1PA 1LR4A 2YZAA 3BHTA 4QMWA 3FMDA 4O0UA 1XBCA 5JT2A 4FBXA 5AR5A 3KVWA 3PSBA 4QP7A 4D0WA 3C13A 4OBOA 1JVPP 3C4ZA 5DIAA 5EW3A 4FKRA 1YXSA 4R78A 2KTYA 3SXRA 2C5VA 4K8AA 3WIKA 1M2PA 4I6BA 4HW7A 2J0JA 4XBUA 3KREA 5IF1A 2YACA 4I4EA 4BHNA 5I9UA 4FUYA 2FSOX 2DS1A 3AC5A 3O51A 5CI6A 3EL8A 4GUBA 1XH6A 5HCZA 4EBVA 2XNNA 2VTRA 3GOPA 2IVSA 4AQCA 3MIAA 5CEQA 4APCA 1FPUA 4MXOA 4PY1A 5B0XA 3DT1A 2HZ0A 4YJPA 3RMFA 3BQRA 4E8AA 2YIYA 5CSWA 3E62A 5CTPA 1R78A 3HMIA 3ZTXA 1G8AA 3EFKA 3KULB 4BI0A 2UZTA 5IZFA 4IWOA 4II5A 4N6YA 4D5HA 3KL8A 3QTIA 5I9WA 3TNIA 3RBWA 3I0OA 2XNOA 3I7CA 1XR1A 3BBTB 1W7HA 4KBCA 3A7GA 3EQCA 2ONLA 1V0OA 2J6MA 1UWHA 3FYJX 4OT6A 3LHJA 3WYYA 4FT0A 5CYIA 2ERZE 4IDTA 2QU5A 1UU8A 2IG7A 2X1NA 3ELJA 4A9UA 2OF4A 3MN3A 5FBOA 2UUEA 4BB4A 4I0SA 3ORPA 3V04A 4QP4A 3Q96A 2PWLA 5ETFA 2FGIA 4DF3A 2R3LA 3R21A 2ESMA 4FTRA 2JC6A 4NZWB 4O1OA 5LCJA 3D0EA 3CTJA 4FNYA 3RAHA 4DEEA 2W9ZB 2WTCA 3P4KA 3PVUA 5AR2A 4ZTRA 3KXZA 2IO6A 4MVFA 5IQIA 4RQKA 2DUVA 3QTUA 4P90A 3WI6A 3FSFA 4OTIA 3SRVB 2NNWB 3DDPA 2UZLA 3G9LX 2VTHA 2VTOA 2W1EA 4ZSAA 3C50A 1K9AA 3LQ8A 2R0UA 1YXVA 2G2IA 1PMEA 3DJ7A 3TNWA 3F88A 3OXIA 5GZ8A 5D41A 3Q52A 3OWJA 4FR4A 2J9MA 4D1ZA 1WBOA 2EXEA 3CD8A 4R7HA 4D9TA 4FL1A 3L1SA 3DBQA 4JIKA 3ZYAA 2EXMA 3F3VA 1ZMUA 2ETKA 3KULA 4O0XA 4RJ6A 5IKWA 3SOCA 3TTJA 2PUNA 4AW1A 3EQRA 3TI1A 2H8HA 4L46A 4R5YA 2F49A 4N4SA 5M09A 1OPJA 3UC3A 4BHZA 2EVAA 4MF0A 4MCVA 1KWPA 4A06A 4FE2A 4GKHA 3E8NA 2PVRA 3QRUA 4CFFA 2QO7A 3BYVA 3KF4A 3TDWA 3UOLA 2XB7A 3LXLA 2RG5A 2ZMDA 4O0SA 3TACA 4O7NA 1VZOA 2J50A 4UZHA 4QMUA 3B8RA 3IDCA 3VAPA 5CU6A 2J5EA 4JAJA 3SXFA 1OL5A 2C1BA 2F7EE 3DQXA 4NYEA 2B9JA 1ERKA 3ZDUA 1H1PA 4I5MA 4IMYA 4LMUA 3NZ0A 4F0GA 4F9BA 5LQFA 3JS2A 2YWVA 4ASEA 2PUIA 3SGCA 3MS9A 3G5DA 2VTJA 4BYIA 1BKXA 3LAUA 5LCKA 2GNLA 4DFLA 1Z5MA 3OEZA 4FIGA 4JL9A 3LKMA 3OT8A 4KRDA 5T68A 4AGWA 1UNGA 2JKOA 2VWZA 2W05A 5F4NA 5GHVA 3SRVA 5J5SA 1P4FA 3EQIA 3LE6A 3LFNA 3PXFA 4BY9E 3V8SA 4ZJVA 4OT5A 4USDA 4YJVA 1UU3A 3L8VA 5IA1A 2XZSA 3QYWA 4QPAA 5M44A 2BTRA 2IVVA 3CGOA 4EOJA 5AA8A 5LVNA 3FJQE 3Q4TA 2A19B 3F3TA 1OL6A 3ETAA 3HRFA 3BYOA 1DAWA 4OBPA 1MQ4A 5I0BA 3HV4A 4X3FC 1Z57A 1QPCA 2GNHA 3PUPA 4F7NA 2C3KA 3P9JA 5H8EA 5I9YA 4U43A 3T9IA 3E5AA 3NAYA 4YLLA 4IBMA 3F6XA 4BRXA 3FWQA 5GJGA 2WPAA 5ANEA 2EWAA 3I6UA 2W4JA 3QTZA 4CV9A 4JG6A 4RJ7A 4CMOA 4M14A 5IU2A 3EL7A 4WIHA 2JIIA 3PJ2A 4GT4A 4RJ4A 4J1RA 3PY0A 5EHOA 4GU9A 5FEEA 3IDBA 4OTHA 4F0IA 2UZDA 3FHRA 4QQJA 5HLWA 3D5WA 5HLPA 5CSXA 3NUSA 2I0EA 2YDIA 2YDJA 3L9PA 4KD1A 4FT7A 4OW8A 3I81A 5M55A 4BTMA 3HNGA 3SKCA 4ITJA 1PY5A 3EN6A 1Q5KA 5KX8A 4G3GA 2WTKB 4FEUA 3R04A 3FZ1A 3LFSA 4HGLA 4ZLOA 3QC4A 3EFJA 2WOTA 3FQSA 3V5TA 4BBMA 4C3FA 2VTIA 3CKWA 3AD6A 2I6LA 3HA8A 4WHZA 3TZMA 5EHYA 2W1FA 5M07A 4WA9A 4FKTA 4YHTA 3EQPA 3GFEA 4TW9A 4DH1A 4TKSA 4FEQA 3BE2A 5E90A 4CG9A 2JKKA 3DAEA 4IM3A 4O2ZA 1Q8TA 5JH6A 3EQHA 3F82A 3G0EA 2PMOX 3C7QA 1QL6A 4UYNA 5K4JA 4PRJA 1L3RE 3WBLA 3U6IA 4BCMA 4F7JA 4RJ8A 1UKIA 5KMIA 3E92A 3PXKA 2B4SB 3KRXA 4LL0A 3Q5IA 2BHHA 2V7OA 4HNFA 3QGWA 2Z2WA 2XIYA 5E8UA 4ZSGA 3ZSGA 2Q0BA 4AN2A 5KHWA 3P7CA 4YZBA 3CJFA 2X2LA 4EOQA 5FWKK 1ZXEA 3TEIA 2RFNA 4YZMA 2CKQA 1OKZA 4C02A 1Z9XA 3U55A 3VBVA 3HP5A 4XH6A 3AC1A 1ZOEA 5AM6A 3MPAA 1O6LA 3ZXZA 3SLSA 5C8NA 4FIEA 3SW7A 4Q2AA 4ACDA 1ZYCA 1JSTA 5A3XA 3PXZA 1Y8GA 3FZRA 4A9YA 4DITA 5CEPA 4XEYA 4FSMA 4FV6A 1J1BA 2R3QA 3BX5A 4Y8DA 1YDRE 1P4OA 3VBTA 5IA2A 4TWCA 1TQIA 4PTEA 4C62A 2W0JA 3QD4A 4RZWA 3EN7A 5HO6A 4A9SA 5HTCA 1WZYA 4DFUA 5FD2A 3A62A 4AG8A 2O3PA 3DBFA 5DVRA 5E8VA 1HCKA 1H08A 4YURA 5EDRA 4FKPA 2PE2A 1GZKA 3W2SA 3BU5A 2EB3A 2YAAA 3KF7A 3NNUA 3QRJA 2WTVA 4IJPA 5HG8A 2JDOA 4FYOA 4Z7HA 3CPCA 3ZZEA 2BVAA 4OTDA 3OCTA 3W32A 4X2GA 1TKIA 4MQ1A 3OVVA 1E9HA 4CG8A 4E4XA 1MQBA 2XIRA 4IE9A 3KQ7A 2WNTA 3GU5A 3I5ZA 3GCUA 3A7FA 4XV9A 3NS9A 2FB8A 5A54A 3NPCA 3B8QA 4BGHA 5IH6A 5D1JA 4RPVA 3GC8A 3VNTA 3NUAA 4FEXA 2XNPA 4G6LA 2H9VA 4BCFA 3BRBA 4WT6A 2HOGA 2ITVA 2UVYA 4ASDA 5HO7A 4IZ5A 4LOOA 2HAKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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