4WUAA

Crystal structure of human srpk1 complexed to an inhibitor srpin340
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
370
structure length
344
Chain Sequence
LVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLSWDIQGKKFVAMKVVKSAEHYTETALDEIRLLKSVRNSDPNDPNREMVVQLLDDFKISGVNGTHICMVFEVLGHHLLKWIIKSNYQGLPLPCVKKIIQQVLQGLDYLHTKCRIIHTDIKPENILLSVNEQYIRRLAAEATVNPLEPKNAEKLKVKIADLGNACWVHKHFTEDIQTRQYRSLEVLIGSGYNTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEEYTRDEDHIALIIELLGKVPRKLIVAGKYSKEFFTKKGDLKHITKLKPWGLFEVLVEKYEWSQEEAAGFTDFLLPMLELIPEKRATAAECLRHPWLNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Identification of a Dual Inhibitor of SRPK1 and CK2 That Attenuates Pathological Angiogenesis of Macular Degeneration in Mice
pubmed doi rcsb
molecule keywords SRSF protein kinase 1, linker, SRSF protein kinase 1
total genus 117
structure length 344
sequence length 370
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4wuaA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4wuaA01
3T3VA 2BTRA 2VZ6A 4RLKA 1H1PA 5KKRC 3A4PA 2JKOA 4HVGA 3FZTA 4H58A 1W98A 4PRJA 3LCDA 3CP9A 5AUWA 2IPXA 2R3MA 2WTVA 4XRJA 2R3HA 4QPAA 3FL5A 2IW8A 2HWPA 3BHUA 3E64A 3ZO2A 4CKJA 3UPZA 4YURA 5AR3A 4FL2A 4EC8A 5IMXA 4QP7A 4DGNA 3DA6A 4C4HA 4JT3A 5KBRA 4JQ8A 3OXIA 4AZTA 3Q9ZA 1U5RA 3HMNA 3IG7A 3FKLA 4C4JA 5J9ZA 4M66A 5GHVA 2QR7A 3D15A 2WQMA 3ALNA 4F9BA 2UW3A 3F69A 4ANSA 4IAAA 3RALA 3DZQA 4BTFA 4II5A 5KMOA 2OJGA 3CXWA 3ELJA 3HA6A 5CU3A 3ATTA 4KS8A 4DFZE 4C37A 2WNTA 3JUHA 4ALUA 3Q5ZA 1XH8A 4I5CA 4F9CA 3P7AA 4RIWB 1K3AA 5CSVA 4JIKA 3IDBA 3V6RA 4QTEA 2PU8A 3VUDA 4KUJA 2IZUA 3HV3A 3ORKA 3H10A 2QKRA 2FGIA 4LGDA 4O38A 3WE8A 3O8PA 2C6KA 5C4KA 5IA5A 4FV3A 4WRSA 1JKTA 4ZOGA 3GFWA 3V04A 3Q4TA 3VUKA 5IQCA 3NWWA 3DFAA 2XMYA 1W7HA 1NA7A 2YCSA 5ETFA 4EOLA 3MVLA 1OPKA 4GIIA 2XKDA 4DGGA 1ZYSA 5DYJA 3H9RA 4KKGA 3L9MA 4BIBA 4CTBA 3TZ7A 4D2RA 3RPYA 1OIYA 1KOBA 3NR9A 4RG0A 3Q4UA 3LXNA 5GINE 3EZVA 2R2PA 4PY1A 3CTJA 5HHWA 5GJDA 3EIDA 1PXMA 3F5XA 4TPTA 3HV4A 4AE9A 4GG7A 4QMNA 1WBTA 4YJNA 5KE0A 1JWHA 2ONLC 4X2KA 3QC9A 4QT1A 3OF0A 5FBNC 4ENYA 4U5JA 5KO1A 4E73A 2WHBA 3OTVA 5GJGA 3OWJA 3GU6A 4ZZNA 2IVVA 4DG2E 2W1HA 2WAJA 1ZAOA 2QVSE 3ZRMA 5AADA 3IKAA 3EQIA 4E5AX 3JXWA 1OECA 4FTLA 4JOAA 5HLWA 5CENA 2GNLA 1ND4A 3RWQA 3UZRA 2F7ZE 2OZAA 4J53A 4CFNA 4AT4A 5C27A 3R9DA 3ZC6A 4D2VA 2VTHA 3OXZA 4NTTA 4W4VA 4ZMFA 5IUIA 3ZDIA 2WTCA 3NUNA 3CJFA 3SW7A 3ROYA 2QURA 3O7LB 3R1QA 4R7HA 3VRZA 1TQPA 4FTQA 4FUYA 4M69A 4XNEA 2WQBA 2XYNA 4ZJVA 4B6LA 4PTGA 2X7GA 4TWOA 3JY0A 3MH1A 3QZHA 4ZZMA 2X39A 1KV1A 3FYKX 3FMEA 4YJRA 3DXQA 3ZUTA 4OUCA 5EOLA 2WZJA 2R3LA 3BWFA 3ZU7A 3L1SA 4C38A 1XH4A 3UE4A 1CSNA 2BAJA 2PPQA 4D4SA 2FO0A 3S3IA 4FTOA 4K2RA 4YJQA 2EVAA 3KCKA 4C0TA 2QU5A 1H01A 1MUOA 3DNEA 3F3ZA 4UMTA 3NW6A 4IIRA 5J79A 3JVSA 3FI2A 4GYIA 3MDYA 2X1NA 4H1MA 4YNEA 4AGUA 4BICA 5EI6A 3O2MA 4YLKA 5AP5A 2CGVA 3U51A 4BKJA 5D12A 4BDDA 4F0IA 4YJVA 3O7LD 2VWZA 1FGKA 4I41A 4TXCA 4FTRA 3RK7A 4EBWA 4C61A 3ULZA 3RK5A 5IQGA 4ZK5A 4FSZA 4DEDA 3RAIA 4E26A 4RA4A 1UV5A 3F9NA 4J8MA 4AGDA 4OR5A 4OTFA 2NNWB 2BZIB 3QRKA 4CRLA 3REPA 4AF3A 3TL8A 4LMNA 2CKEA 4J99A 3NNXA 1TQMA 3QTSA 4JVGA 3GU8A 4BI0A 4FSQA 4FKJA 4FA2A 3S95A 1U54B 2XUUA 5CS6A 4DCEA 4ACGA 4BZNA 4L01A 3QZGA 4IC8A 4O0TA 2VO0A 3B8QA 5HVKA 2PUIA 3UGCA 3LXPA 5G1XA 4J71A 3FLZA 3TV7A 3N4TA 1YXXA 1O9UA 5TT7A 4RJ7A 2WEIA 2GHLA 3RINA 4ZTQA 3T9TA 2OIDA 1O6KA 3QD2B 3ZXZA 2PHKA 2VWIA 1OPJA 4C57A 2YIXA 4FL3A 3AGMA 3D0EA 1OIQA 3BYOA 5EQPA 2C3LA 3Q53A 2JDRA 3NW7A 4UMRA 5AP2A 3G2FA 3C9WA 4D5HA 4U97A 4E8AA 1Y6AA 1SYKA 4RQKA 4JRVA 2EWAA 3NVKI 2V62A 4YTCA 2PK9A 1XHAA 3A7JA 1FOTA 4CYJA 2ITQA 4XP3A 4MXYA 4ZLYA 3EN6A 4IADA 3SOCA 2BKKA 4J96A 4MXAA 4O0WA 4ASDA 2X8DA 4BB4A 2RSVA 4BBMA 1KE5A 3OOGA 2ITWA 4CTCA 3QRIA 1XJDA 5ETCA 5J1VA 5DRBA 5CF6A 1MQ4A 1KWPA 3H4JA 1LP4A 3LJ2A 3UJGA 4CZTA 4TTHB 2ZV2A 4W9WA 2G01A 2GS7A 4G31A 4I5PA 2JEDA 5CAOA 3D4QA 3D5XA 5ANJA 3EFKA 1BLXA 3AT2A 4NSTA 3IOPA 3ORMA 3ZC5A 4A4XA 1YXUA 4TNDA 4OBPA 5AR7A 5K5NA 1LEZA 5TR6A 3UYSA 5CVHA 5L2IA 4GH2A 2C0IA 5BVOA 3FKOA 4G16A 3BGZA 1W83A 3MI9A 1LUFA 3KGAA 5F94A 4HYIA 3POOA 3UC4A 1BKXA 4R78A 4R5SA 5HG8A 4I6FA 3SHEA 3SD0A 4AZVA 2GNIA 4D2SA 2I0HA 3Q60A 4O91A 5ANOA 3TWJA 5I0BA 3PJ1A 4QMYA 1FBNA 2VAGA 2XK3A 4U8ZA 4LYNA 2Y4PA 3FHRA 3O71A 4IZ7A 3HLLA 4O7LA 2R7IA 2DYLA 3FQSA 4IFCA 2R0UA 4G34A 3TZ9A 3Q4CA 4DFBA 2WIPA 3R21A 3FV8A 4AP7A 3EJ1A 4GK4A 4LV5A 5A4EA 4NM5A 2IW9A 3LZBA 4XV2A 4HPTE 3COHA 4DFUA 3MFTA 5F1ZA 4BDEA 2BRMA 1W8CA 2VTAA 3AC5A 3UBDA 4E6CA 1H00A 3UOKA 3OCSA 4X3FB 2PUUA 1L3RE 1WBPA 4G9CA 4TWCA 1JVPP 3CQWA 3V5QA 3L9LA 5FG8A 4L00A 3VNTA 5EQEA 1PYXA 4AQCA 1NVQA 3D94A 4WD5A 5IG1A 5TF9A 3G9LX 4RVKA 3BBWA 2UZVA 4EOMA 3C4ZA 4HVIA 4V04A 4E3CA 3A60A 1PXJA 3G0FA 1YHVA 4EHEA 3DDPA 4G3GA 3MB6A 5HORA 2A19B 1KOAA 2CLQA 4RIWA 3MY5A 4M14A 4BZOA 5BVDA 1M7QA 2LGCA 3PE1A 3QL8A 5FGKA 1XR1A 2AC5A 3OBJA 1OUYA 3SRVA 3ORXA 4NIFB 5AV4A 3OCTA 2YIYA 5DNRA 2PYWA 4J1RA 5LMBA 4WSQA 3FSFA 3BRBA 3RI1A 1HCKA 5L2TA 2AUHA 5ETAA 4QP9A 4QMQA 4CGAA 3QLFA 3VVHA 3KRXA 4ACHA 4XG6A 4JBOA 4XOZA 2ZMDA 4CFUA 4FV8A 3QYWA 3U4WA 1Y8GA 3DKGA 4JBVA 1XWSA 3EZRA 5IQHA 5C1QB 5AWMA 2WTWA 4Y83A 3FWQA 3R02A 4KAOA 4L3JA 4FSUA 4AUAA 4DH5A 4F6UA 3CSVA 2REIA 4MH7A 5FP6A 2YIQA 2OF4A 5L6WL 1M2RA 5FXSA 4F9YA 4E7WA 3H0YA 5IU2A 4XG2A 4LRKA 4GT3A 4PMPA 4BDIA 1TVOA 2QO2A 4DCAA 4UWYA 3KXNA 4DT8A 4PUZA 4GEOA 4XBRA 4I20A 5H9BA 5CF8A 4BCPA 4RIYA 3MA3A 3C0GA 2CJMA 2V7OA 4RFZA 3UQGA 4E4MA 1Q97A 2VWVA 3AD6A 4Z7GA 3VJOA 2XIYA 3MB7A 4RA5A 4H1JA 3TKHA 4EK8A 2JDSA 4DH7A 2XK6A 3C7QA 4RVTA 3DLSA 5EYCA 4HYUA 4Y72A 3ZFXA 2Y6MA 3K3JA 4YBKA 1PW2A 5EH0A 5FLFA 3R73A 2CNVA 5K9IA 3COKA 1KSWA 3EQCA 4PV0A 2F4JA 3DJ6A 1J1BA 1X8BA 2CGWA 3A7GA 1QPJA 2C30A 3OWPA 3W8LA 4D2PA 3MH2A 3N4VA 5FTGA 2W5BA 4L67A 3ATSA 5HG9A 3GCVA 4H36A 5M4IA 4HYHA 3NUAA 2VTRA 1ZYLA 2JBOA 3BIZA 3BYMA 4MHAA 3TV4A 3ZOSA 5BYYA 3V8WA 2W1EA 4FZAB 4YZ9A 4F9AA 5HOAA 3KXXA 2PVNA 3GCUA 4EZ7A 2YCQA 3QQKA 3IW5A 2X2MA 2VO6A 2H9VA 4GU9A 4Z7HA 3KQ7A 3WZKA 3ZYAA 3W2PA 4PDYA 4I1ZA 1JPAA 4UXQA 3BGPA 1ZY5A 4XG4A 4BDGA 3LFNA 4NZWB 4GMYA 1PMVA 3GXLA 1PMUA 4LFIA 3WIGA 4O7NA 3FZOA 3C4EA 4GKIA 4HPUE 5CEMA 3HP5A 1GZKA 3DCVA 3ZBFA 5HESA 5AUYA 2IW6A 3QUPA 4ZAUA 3QALE 1PXNA 4GG5A 5M4FA 2YLEA 4L6QA 1XBCA 5CVGA 2CCIA 5AX9A 3WARA 2OZOA 5DFPA 5HO6A 5BQ0A 5EHYA 3IW7A 3TUBA 2OH4A 2BTSA 3O8UA 4FTAA 4W4YA 5EYDA 3PLSA 1BUHA 4ZY6A 4A07A 5JMSA 4I4FA 1YOMA 4DFYA 3PXYA 4AX8A 5HX8A 3ZRKA 2VV9A 3VW8A 3F3UA 2C6EA 3K54A 2VWYA 1U5QA 4ZTLA 5IQBA 2OF2A 4LOQA 2W7XA 5FEDA 1L8TA 5EM5A 4DC2A 3AC1A 4XV1A 5HVYA 2FA2A 3OOMA 4JR3A 4O7ZA 5BMMA 2R3PA 4GU6A 2YEXA 4S31A 4P4CA 4BKYA 2ITTA 2R3RA 3ZH8A 5E9EA 1UU8A 3ZFMA 1GZNA 4HGLA 1YHSA 2WKMA 2P33A 3K2LA 4BRXA 3I5NA 3NRMA 3TT0A 3KCFA 1IASA 2ZM3A 5CSPA 4E20A 5IA3A 4IZYA 4QP6A 4C33A 4EWQA 4J52A 4IAIA 4MF1A 4YZMA 5HNGA 5AA8A 2PWLA 2PE0A 4FZ7A 4U40A 3LJ1A 4FTMA 3UIMA 2DUVA 3EFWA 3ZZEA 3VUTA 5H2UA 2G2HA 5ANGA 4MNEA 3HUBA 4PMSA 4F9WA 5AP1A 4NM7A 3ZCLA 4ZY5A 1JOWB 1JSTA 3MY1A 4ANBA 2C6MA 3QTWA 4KBCA 3BWJA 5E8ZA 3DXNA 3CC6A 3HRCA 4F1TA 4JDKA 4DFLA 3EMGA 2FSTX 5HTIA 4F64A 3OROA 2OZAB 1SM2A 2YIWA 3DJ7A 5M06A 2B7AA 3WZDA 1OL2A 3V51A 4RC4A 4PDSA 5EDQA 4DBNA 3A61A 5I9XA 3QTZA 5KUPA 4BCQA 4O0RA 2I6LA 4EKKA 5LWMA 2VX3A 4GRBA 4BHNA 4M69B 3I1AA 5CAUA 5HU9A 2H8HA 2WMBA 2EXCX 1PXIA 5IDPA 1F3MC 4RT7A 2C47A 2ONLA 4N6ZA 4O2PA 5GZ8A 3CLYA 3IW6A 3BLRA 2WOUA 2XNNA 4KSQA 2HY0A 1DAYA 4HCUA 1KE8A 4GVJA 4EUUA 4PNKA 5T6KA 5HD7A 3QD0A 4O27B 5CWZA 5FUTA 1H0WA 1HOWA 2GHMA 4G1WA 3P4KA 4QP1A 5A6OA 2WELA 2XS0A 2QOIA 4OLIA 2R3JA 2J5EA 4OGRA 3FI8A 4IVCA 4E4XA 4I0SA 3PPKA 3PRFA 4RRVA 2VRXA 3QYZA 3ORZA 2FSLX 3VHKA 3KK8A 5C9CA 4DTBA 3SX9A 5F4NA 1Q62A 4FTTA 3UC3A 4GFGA 4EOQA 3F7ZA 2WTKB 2QD9A 3DGKA 1IA8A 3EQGA 3LFCA 3HMOA 5CT0A 5L8LA 3IGOA 2GTNA 4PMMA 5L8KA 2NRYA 1YVJA 3Q6UA 4LRMA 4K77A 4EQUA 1RDQE 3Q3BA 3I0QA 4YBJA 3EQBA 5CU4A 3TNHA 4BCKA 4HGTA 5B2KA 4GT5A 4HNFA 2VGOA 4A06A 4CLIA 3DQWA 3C4CA 3DJ5A 3GC0A 3DAEA 5GZ9A 4P90A 3DTCA 4QMZA 2RIOA 4IX3A 1ZXEA 1R3CA 3FXZA 4X2JA 4ENXA 3B2TA 3KXGA 3V5PA 3GOPA 3OY3A 3OWLA 1XH9A 3KMUA 5TOZA 3ZONA 4RVLA 5IZFA 4MEDA 3BX5A 3EQPA 2WTJA 5A6NA 3NNUA 3JYAA 1JQHA 2IZRA 4ASEA 1ATPE 4AW5A 1WCCA 3EFJA 4IJ9A 4K18A 5ANKA 2F2UA 2YM8A 3G6GA 4R3PA 4FGBA 2RFEA 4MXOA 3UODA 4FKTA 5FTOA 3GT8A 4BGGA 2J2IB 2I1MA 4ZSLA 1A06A 3ZLSA 1A9UA 1H0VA 5FEQA 3BE2A 3U6IA 1ZZ2A 4QNAA 1OKYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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