4X2GA

Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
GTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
total genus 100
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2014-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4x2gA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4x2gA01
2WO6A 4M8TA 5DRDA 2HK5A 1OKYA 2JBOA 3MH0A 1SMHA 4RX5A 3A61A 2AC5A 2J0LA 4X21A 5KMNA 3PLAE 3MDYA 3WBLA 2VWUA 4A9RA 4IX6A 3UOKA 3GOPA 3QQGA 3SX9A 3IPHA 1UU9A 2QCSA 4N70A 4XV2A 3UYSA 2PUIA 1WBTA 5HIBA 2BCJA 5ETAA 2ITTA 1P5EA 4FZDB 5EYDA 5CSWA 1VEBA 5M44A 5I9UA 1H1RA 3FZRA 4C62A 1F5QA 4QYFA 3GUBA 4YZDA 5BVKA 4YR8A 4YJPA 2PZIA 4TTHB 4Q9SA 3PVBA 1PKGA 5JN2A 4EHZA 3NW7A 3EL7A 4JR7A 3U51A 4YHFA 3DBEA 4QQCA 1O9UA 2OJ9A 4FOCA 1XWSA 5KZIA 4F7NA 5IEYA 4UWYA 3CBLA 4RWJA 2YCQA 2VWIA 3B8RA 3CJFA 3E8CA 3Q4TA 2R7IA 5KBRA 5CTPA 2CNUA 3HA6A 4GSBA 1Q8UA 2FO0A 4D2VA 3GOKA 5A9UA 4MBIA 2GFCA 2VWWA 3OWJA 3PE2A 5CF4A 3IKAA 4YC8A 4ASEA 2P3GX 2XNNA 3G9LX 2A27A 3CKWA 4MCVA 4QYYA 3ZEWA 4F1OA 3KXXA 3TJDA 3MSSA 4WSQA 5CWZA 2YLFA 3D94A 4C33A 4ZMFA 4DFBA 4EOQA 2FVDA 3E93A 3NR9A 5D10A 3RPSA 1JQHA 2QQ7A 4HGTA 4WG3A 4WRSA 3RK9A 3CQUA 5AUZA 1H1SA 1UA2A 5EOBA 4NK9A 4A06A 2RL5A 2XJ1A 4G3DA 3DZOA 2P0CA 3NYNA 4L6QA 4J52A 4DFYA 3WF6A 1H1WA 3VF8A 2VAGA 1OGUA 3KB7A 4GVJA 3QC4A 2PZ5A 3KU2A 4DEBA 4IAZA 4AGCA 2PZPA 2YIYA 1TKIA 4G6OA 1H1PA 4HVIA 5E8XA 2R3PA 3HRBA 4ONAA 1PJKA 4AOJA 2C6TA 4EORA 3CE3A 4H39A 2QOLA 3D4QA 4B4LA 4UXLA 3TNPC 3ULIA 5L2QA 4I5PA 5HTCA 3LJ2A 3QAME 4AGDA 3PVGA 3SDJA 5HKMA 4C4GA 4IFGA 1H4LA 3U4WA 2GTMA 4FSYA 2ZM1A 4RGJA 4S32A 2OK1A 3ENHA 3AGLA 2ZAZA 4F4PA 4RQVA 4FA2A 3LIJA 3IW8A 4AWIA 3FDNA 5M4FA 1YRPA 1HCKA 1FQ1B 4UEUA 4DEDA 2VTJA 4XJ0A 5CU6A 5BVEA 4BRXA 3KN6A 4EYJA 2PSQA 4A4LA 5CVHA 5M4CA 4MNEB 4U81A 1H0VA 4KUJA 4YZNA 1U4DA 4FT7A 4U43A 4BDCA 3R01A 4KSPA 3EOCA 4F7LA 4FT0A 3C0IA 2VTOA 4LMNA 4XP0A 2WIPA 2SRCA 2XRWA 2YABA 4HVHA 4GCJA 4MNEA 3ZHPC 5F20A 3HECA 4IX4A 2UZDA 4M15A 4AN3A 1APME 4F63A 2OG8A 3UJGA 4QPMA 3S1HA 3RBWA 4Z55A 2ITQA 4BN1A 3L8VA 3ZO4A 4E73A 2ZV2A 2Q83A 2ERKA 4K11A 1GOLA 1WVWA 1ZARA 3LQ5A 5B2MA 2A1AB 5HU9A 4FEQA 1A06A 3NPCA 4TN6A 4BCFA 1YI4A 2I7QA 2BZHB 4YJVA 1OB3A 4FUYA 2HXLA 4FTUA 5HZNA 3ZS5A 3RINA 3BGQA 3OTVA 4O1PA 1OUYA 3V8TA 4LRMA 2C69A 4QO9A 3VF9A 5KMJA 3LLAA 4CZUA 4F1TA 2UW3A 4FTKA 4F9CA 4U40A 5HE0A 1PXNA 2FA2A 2C0OA 3NUSA 3PXZA 1I09A 1WBPA 1H27A 2PUPA 5CNNA 4EOPA 4FTRA 2Z02A 2C1AA 3HZTA 3KRLA 2OW3A 5J87A 3UGCA 2A2AA 4IAYA 3PVUA 5EM6A 3FZPA 3QGWA 2VWZA 5K3YA 3Q6UA 3A7JA 4U6RA 2YEXA 4G3FA 4RX7A 4O7YA 4DGGA 1IASA 1PY5A 1MUOA 2JAVA 4E20A 3EFWA 4H36A 3QD2B 3R9NA 3DDPA 4ALUA 3D5WA 5AADA 1JKSA 3IECA 4TW9A 3ZSIA 2YIWA 3WF7A 3FMEA 3CD3A 3NAYA 3KC3A 2PZYA 4BKYA 3NUNA 3T9IA 2E9VA 4O91A 2I40A 3VQHA 5B2LA 5H8EA 5FXQA 2E9UA 1R39A 3KK9A 4YPSA 4DCAA 3P0MA 4YUQA 4QTEA 3OBJA 2FUMA 4B9DA 4FTJA 2PVNA 2W9ZB 2F4JA 4WOVA 5BMSA 3QX4A 4L42A 4HYSA 3FMDA 4RJ4A 5E8YA 4U9AA 2I6LA 4ZTRA 4BY9E 2DWBA 4ACGA 3I7CA 3HDNA 4U3ZA 4BZOA 5AV1A 1Q8ZA 1OL6A 5IQDA 3NIEA 3DKOA 3CQWA 4J95A 4P4CA 4Y5HA 3ULZA 2GNFA 3QTXA 3PZHA 4H3PA 4CKIA 5IU2A 1JBPE 1G5SA 3OFMA 3Q2MA 3ZLXA 5L8JA 4YP8A 4GL9A 4ZTQA 3OBGA 2X6DA 1R0EA 4AZWA 5LVOA 3DA6A 4N0SA 4NEUA 1ZYJA 4OW8A 3RK7A 2WMSA 4XG3A 5JGAA 4QNAA 2OWBA 3AMYA 4M13A 5FEEA 3KFAA 4JVGA 2XB7A 5AP6A 4YLLA 3AXWA 1AGWA 4AN2A 1UU8A 1UV5A 3NWWA 4IEBA 3V51A 4UYNA 2WMWA 3FMNA 2VD5A 4FV9A 2P4IA 3WOWA 2W17A 4K1BA 2YM3A 5JQ8A 1PXPA 2CSNA 3C4FA 5HI2A 5M56A 2UZVA 4BCGA 4IIRA 1FGIA 3PSBA 2ZJWA 4XV1A 3TZ9A 1IEPA 4EOMA 2JFLA 1Y57A 3EN4A 3ZLSA 3LFEA 4O0RA 3TV4A 3OWPA 3DT1A 3CY3A 3FZOA 4QOXA 4L3JA 3PPKA 4QP8A 4FKSA 1H00A 2PVRA 2REIA 3RAKA 1PYXA 5DT0A 2BRHA 2W9FB 3EMGA 3F66A 3IW6A 3QFVA 3PA3A 4GJ2A 4ZTHA 2W1EA 4L44A 5BX0A 1DI8A 2HZIA 3RZBA 2BRBA 5CI6A 5KCVA 4EI4A 2Y9QA 3DK6A 3P79A 4GK3A 4PL3A 4QMQA 3D83A 2W4JA 4GUEA 3MYGA 4JR3A 4LL5A 2HZNA 2W06A 4RVKA 5D7AA 5F95A 4B6LA 4DE4A 4JG6A 3PJ1A 3CGOA 5AV0A 4JI9A 4O6LA 5BMMA 1URWA 3K54A 4FKJA 1WZYA 1ZRZA 3NDMA 4WHZA 4ZY6A 2WMTA 3IW5A 4FSUA 4E5BA 3U6JA 3R02A 2J51A 3RPYA 4ID7A 3NW5A 2PK9A 5EW3A 1KOBA 4BDGA 1YOLA 2YM7A 1MQ4A 4UWCA 3V8WA 5AA9A 2R3HA 3UNJA 4KINA 3TDVA 5HCYA 2QO7A 1J3HA 4FNYA 3ET7A 3KXZA 4M69A 3N4VA 5EQPA 2IW8A 2QLUA 4Z3VA 3I4BA 3QHRA 4GG5A 3V6SA 4QTAA 1KE5A 3K5UA 4MKCA 5AP7A 3TZMA 2NNWB 3UYTA 4NCTA 3K3IA 3COMA 5IH4A 4G2FA 1LEZA 4O0UA 3ALNA 3GP0A 4FG8A 4ACHA 3MPMA 3ORLA 4YNEA 4I93A 5ETFA 4TWCA 4QMMA 3IGGA 4EHEA 1ZXEA 3W1FA 5K5XA 1IAJA 1B39A 2J6MA 1PMNA 4HYIA 4V01A 2AYPA 2XEZA 3UQGA 4ZY5A 2XZSA 3F61A 1AD5A 2FH9A 2VWBA 3FLNC 5FP5A 4FKQA 3WF5A 5DI1A 2OF4A 4ANQA 1SM2A 5EDPA 2GFSA 3GC9A 4ASZA 4HVDA 5CF8A 3LMIA 2VUWA 4L00A 1JKKA 3FI3A 3RPOA 4BDKA 2Q0NA 3JR1A 5DYJA 2BIYA 5JMSA 2PPQA 2P2HA 4DG2E 2YM8A 5CEPA 3DV3A 3R63A 4CFNA 2VRXA 3QYWA 3D7ZA 3MB6A 4X7QA 3C7QA 3FI2A 3OEZA 4RQKA 3VN9A 3ZRLA 4BHZA 4J8NA 1NVQA 3CIKA 2XK8A 5DH3A 3QRJA 1Y91A 4FKRA 4Z9LA 4C2VA 4IC8A 3W2CA 2ZVAA 4F99A 2UW8A 4IACA 3LQ3A 4XG6A 3S95A 4XRJA 1K3AA 3R00A 3AC3A 1Q61A 2OJGA 5EK7A 2B0QA 3E7OA 4CFUA 5M57A 3H9FA 4ZTLA 2IO6A 3DAJA 2CGXA 3VUGA 3P5KA 5JEBA 4E4MA 5AUUA 3F82A 4RZVA 5AM7A 2FSMX 2ITYA 3FY2A 5JRQA 5ANKA 4C38A 2VN9A 5L6OA 2XEYA 4Y8DA 3MTFA 2UVYA 4MXOA 3QXOA 4FK6A 5DWRA 3I6UA 1GZKA 4C7TA 4YPDA 3TWJA 4CG9A 4MXCA 3SVVA 3I7BA 4WUNA 5HLWA 3COKA 3FV8A 5I9XA 2W96B 4FV6A 3RPVA 3KL8A 2C6KA 2G2FA 4A07A 5KBQA 4BYIA 4GKIA 4NYEA 2VTNA 5TF9A 5CASA 2B1PA 1KUTA 4LYNA 4O1OA 2VGPA 3KMUA 3P7AA 4NFNA 4QP3A 1OBGA 3MY5A 1CMKE 2XA4A 1ZLTA 3TCPA 2W7XA 2PVYA 4X2GA 4X3FA 5JGBA 4EC9A 4IVCA 4K6ZA 3BV3A 4PP7A 2BZIB 3FKOA 1M52A 3R9RA 1OKZA 4BI1A 3A4PA 3D15A 4DEGA 5EI6A 3PTGA 1XH5A 4CXAA 1YWVA 5LVNA 4YLKA 3R30A 5E1SA 4B99A 3TUDA 1ZWSA 3QU0A 4FE2A 4EK4A 5FEDA 4IMYA 5FD2A 5BVWA 4C59A 5D11A 2ZV8A 2X7FA 4UYAA 3T3VA 4ZZOA 5FUTA 3K3JA 2X8EA 2A4LA 3F3VA 2CN5A 1RJBA 3E63A 2VV9A 3Q5ZA 4ZLYA 4DEIA 5CYIA 1SZMA 3HNGA 1K2PA 2BDJA 1UU3A 5LCJA 1KE9A 1CM8A 4RLLA 5E8ZA 3F2AA 5IA1A 3UTOA 3D2IA 3HMOA 3OZ6A 5AR3A 2UW5A 3HX4A 4USEA 3BU3A 4O27B 4H05A 3ZUTA 3FZ1A 4GW8A 4YJNA 3FI4A 2WQMA 4D9TA 3T8OA 4RT7A 3LMGA 3F7ZA 4AFEA 4NKAA 5ANJA 3FMLA 4S31A 2J0KA 2WZJA 3RCJA 4RJ6A 3ZC5A 1ND4A 5BYLA 4N4SA 4XOYA 2WEIA 3P7BA 1W0XC 2ITOA 4R5YA 4YJTA 1NXKA 2V62A 1Q97A 4OLIA 3ZLWA 3BYVA 4FKIA 5BYYA 4BDEA 1WCCA 3ORXA 1O6YA 5LVPA 2Z60A 4RJ3A 5AP1A 3DCVA 3DJ7A 3QKLA 4ZSEA 1J7LA 1H07A 3ZBXA 4IB5A 4FKPA 4TY1A 2IZTA 4I92A 4RJ7A 4M0YA 1OUKA 2QO2A 2WKMA 3EN7A 2GS6A 4USDA 3HMMA 3QYZA 2UZOA 3MH2A 5DE2A 5CSVA 1FVRA 3RCDA 2F2CB 2NRUA 4BWXA 2B53A 3R7EA 2WMRA 3O96A 2QLQA 1DS5A 3DXNA 4FIIA 1LUFA 4EH5A 1P4OA 4RC2A 2JAMA 3FLWA 3M2WA 2C68A 3AD4A 3QD0A 1BI8A 2ONLA 3U55A 2CLXA 3UDBA 3EFKA 2QI8A 3R7OA 1FVVA 4F9AA 3OXZA 3Q9WA 2WB8A 1ZOHA 1PMUA 2UW0A 4MBLA 4W4VA 4AW5A 3RAWA 2R2PA 3P78A 4MD8E 5BQ0A 5A54A 3QQKA 5IA5A 2W1DA 3VS1A 2DUVA 4PMSA 3CEKA 4YC6A 5EKNA 2WMUA 1LR4A 4OUCA 3VULA 4WKQA 5CENA 4AT4A 4O7LA 2W4OA 4ZLOA 4ZZNA 5CNOA 2QD9A 2VNYA 4BGHA 3D7TB 1H01A 3QZIA 2R7BA 4R3CA 1ZAOA 5GJDA 1SNXA 2X2MA 2YERA 3HUBA 4L7FA 5J8IA 3U9NA 3BYSA 3U9CA 4C57A 4A9TA 5FTQA 5CF5A 2G2HA 5HO6A 3HUCA 3ZOSA 2BALA 5M08A 3D7TA 5CANA 3C4EA 2X4FA 5J9ZA 2XNMA 5EW8A 2WTKB 1PXJA 4MAOA 3HRFA 4AQCA 5DOSA 3BI6A 5I9ZA 4AZVA 5J1VA 4R7BA 1JOWB 2O0UA 3QLGA 4LV8A 2XJ0A 3JVSA 1MRYA 3UIXA 5LOHA 2YN8A 3KEXA 4C02A 3ELJA 4DEAA 3II5A 4W9WA 1DAYA 5CEQA 2HELA 2VTLA 4F08A 4GV1A 5DEYA 3MI9A 4ENXA 5AAEA 3B8QA 3NYXA 3LCOA 4KBAA 4XS2A 3R9OA 4DGOA 3RMFA 2PUNA 2FSTX 3BZ3A 3FQEA 2DQ7X 5FTGA 4CGAA 4RWLA 4EHGA 3MWUA 4LOPA 2QKWB 3A4OX 3QRIA 3HP2A 3OG7A 1ZYCA 2IZUA 3LM5A 4AACA 5EG3A 5EW9A 1M2QA 2JIVA 4FZ6A 3HA8A 4QMYA 4BCKA 2GNHA 1NVRA 3DAKA 2WMXA 1UNHA 3GCUA 4O6EA 3FHRA 3QWJA 5JGDA 4F9YA 4X2FA 4YO4A 5EQYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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