4X2KA

Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
GTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 100
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2014-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4x2kA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4x2kA01
5M08A 3D0EA 5C1QB 1RJBA 4JVGA 5IA3A 4CG8A 4FKSA 5JFXA 5IEVA 3SVVA 1GNGA 2VWXA 5CLPA 4G5PA 5ANEA 5KMLA 4EK3A 2VTSA 3QZFA 4O1OA 1Q8YA 1V0OA 5G6VA 1UWJA 3VW6A 4NU1A 3BV3A 4PL5A 4QO9A 5C27A 3QX4A 3FXZA 4C61A 3I6WA 2C6KA 3ZLXA 2NP8A 1H4LA 1YWRA 3QD0A 4FV0A 3A4PA 3QA8A 3UTOA 2XNBA 4FKPA 4IVBA 3NW5A 3COHA 1J7UA 1OKVA 5FQDC 1UNGA 4FL1A 4YZDA 5KHWA 3PVBA 1XO2B 1OPJA 2AUHA 1AD5A 4A4XA 3HEGA 3S4QA 5T3QA 4J8NA 3ZDUA 5A6NA 2VTOA 3DY7A 3QUPA 4FEQA 2XKDA 4TWOA 4DLJA 3O51A 4QP9A 4QQ5A 3IO7A 4ZY5A 1RDQE 2WGJA 4ZZMA 3VBTA 2YAKA 3FZTA 2GHLA 3V51A 5A9UA 4PQNA 3AT4A 4MF0A 3IKAA 3PWDA 3T3UA 4BYJA 4CFMA 2CDZA 5J5SA 4JG6A 5EG3A 4DH1A 5I9WA 4PTGA 2VNWA 4AN3A 4KABA 3P7AA 4EONA 3EQGA 5GZ8A 4DT8A 4ZSEA 5IISA 4UX9A 4IM0A 2O63A 2VD5A 3VO3A 4HGLA 1UKIA 2W5HA 3BCEA 4AZWA 4FT3A 4E5AX 5K5NA 2PULA 1DS5A 3WF8A 4H39A 1O9UA 3MVHA 2OBJA 4QYEA 1JKKA 4GUEA 2A19B 3Q2MA 4BZDA 4O7VA 4KIPA 5M57A 5AAEA 3R83A 2LGCA 3Q32A 3BYMA 3PJCA 4BCKA 5AUVA 4PDYA 2GQGA 4ASDA 4WNMA 4XHKB 3I60A 3OC1A 1J91A 4U45A 2FSMX 3OCTA 3RZBA 2RFEA 3DU8A 4ALUA 1CKJA 4EK6A 3BE9A 1YXXA 2OJFE 4CFNA 3L9LA 3DNEA 1STCE 3FV8A 3A7HA 3FKOA 4LOQA 2YHVA 5DFPA 3WF7A 3FE3A 4ACHA 5I4NA 2BRBA 2ZM1A 4FC0A 2R3MA 2ZM3A 3HZTA 3QC4A 3GCPA 3R2YA 4FTKA 2BILB 3FMKA 1B39A 4WRSA 4ZIMA 3R7IA 3DT1A 4IC8A 2BTRA 2X2MA 2BKKA 1OI9A 4PP9A 3EZVA 2C6TA 2G2FA 2PYWA 1ZXEA 2WTKC 4A7CA 4CMTA 4EZ3A 1ZYCA 4FKIA 4BI2A 4EZ5A 2OI4X 3C0IA 2RIOA 4USEA 2I6LA 1Q8TA 4YGAA 4D4YA 1W82A 4KA3A 3GEQA 3G15A 5EHLA 4XLIA 5EW9A 4YJOA 3Q04A 4UZHA 4YJUA 3FL4A 3LMHA 1XR1A 4ITJA 5HD7A 3UO4A 2QQ7A 3R04A 2C3LA 2V7OA 1IAJA 4K1BA 4KBCA 4NCTA 2J6MA 3T9IA 3EKNA 3JUHA 2X6EA 2GNIA 4W9WA 4FOBA 5DNRA 4R3PA 3EFJA 3MB6A 5GHVA 2UV2A 4NM0A 5KMMA 2VZ6A 3KULB 5M4FA 4RC3A 3VF8A 4EWHA 4JBQA 1SVGA 2G2IA 3TV4A 1A06A 2YITA 3IDBA 3LM5A 4BBEA 3HYHA 4H1MA 4CFFA 4D4VA 3PPJA 3B8RA 3N9XA 3O8TA 4UXQA 5CVHA 5CEQA 2AC5A 3O7LD 3CKWA 3QAME 4GK3A 3RAHA 4GG5A 4HPUE 3UOKA 4A07A 4GVAA 1J7LA 2R5TA 2G9XA 4FIHA 2XNOA 4C57A 3EN5A 2EXCX 2ITYA 5TE0A 2XP2A 5AP3A 2X9FA 2H9VA 2XVDA 4TT7A 4AA0A 5KMIA 3PDTA 2QOOA 3L9NA 4L44A 3FQHA 4JQ8A 5AP7A 5J1VA 3P79A 3SXRA 4EI4A 2OF2A 3M1SA 3ULZA 3GBZA 1ZYSA 3VS7A 2QOQA 5ANJA 1H1PA 3A7JA 3DLSA 3DK3A 3A8XA 3D2KA 3FAAA 4RVMA 3ZUTA 2VO3A 4J99A 3EMGA 3F3ZA 2CN5A 4HOKA 4NZWB 2XKEA 1QPJA 3ORTA 4U41A 2OH0E 4C38A 1DAWA 3F9NA 3KMWA 3Q9XA 4F7JA 2HWPA 5FXQA 4E26A 4EBVA 4ZTRA 4K11A 3MTFA 2XK8A 2BKZA 4HJOA 2ONLA 5KMOA 1VYWA 1WBSA 2C3JA 5JT2A 3G33A 4FTTA 3CQWA 3AC4A 4NTSA 5AIRA 3FEGA 3VUKA 2XMYA 1NVSA 3ATTA 4OGRA 4EH4A 4XCUA 2EUFB 5KBQA 2OZOA 3U4UA 4BI1A 3PLAE 4QMZA 2QHNA 3QQUA 4AZFA 3D2IA 2WTJA 2OG8A 3OXTA 5AP4A 4RA4A 5M44A 3C7QA 3ZFMA 3HNGA 3PPZA 1XHAA 1V1KA 1GZKA 3R73A 2R3HA 1OZ1A 4DINA 4LFIA 2V7AA 4FSUA 1BMKA 1VYZA 1AQ1A 2XK4A 3PVWA 4GW8A 4BCHA 5HG8A 4ALVA 4BHZA 5I0BA 5CYIA 2BVAA 3N51A 5M4UA 4FUXA 4OTFA 4BWXA 2BHEA 3ZZWA 3MFUA 4J97A 3BLQA 4LQMA 2VTJA 4E5BA 4AT3A 4ANQA 2YFXA 3R9RA 4RWKA 2PL0A 2R3LA 3KF4A 2WQMA 4IBMA 4O82A 2AC3A 3G9LX 4FSQA 2XEYA 5LWNA 5CVGA 4G5JA 3P0MA 3W2RA 3TZMA 3W2CA 3MWUA 3BLRA 5HO6A 4APPA 5GJFA 5D10A 3BYVA 3R1NA 3B2WA 3GCQA 3MH1A 4BHNA 4EH2A 2FA2A 3TL8A 4H05A 4C4HA 4AW1A 2XK6A 3HP2A 3PXZA 5AV0A 4YJRA 4KIKA 4PUZA 4C3PA 4KINA 3ENMA 4LV5A 4E93A 4HVDA 3MY0A 3TI1A 5HLNA 1Q8ZA 3UP7A 3BLHA 5CF5A 3ZFXA 2P3GX 3DB8A 3LXLA 2FO0A 2Y6OA 1XH7A 3MH3A 3DBQA 4IB5A 5FWKK 2XK9A 5DWRA 3NNWA 3ZSHA 3NYOA 4RWLA 4LMNA 2HELA 4Z3VA 4UY9A 3OHTA 4FV5A 3C4ZA 4MXYA 4BCOA 2B53A 5K4JA 1YI6A 3COIA 3VS2A 4AZTA 2JITA 4TYJA 5F4NA 2PTKA 2OIQA 3S1HA 1VZOA 5FXRA 4M15A 2WQBA 1OPKA 1HCLA 3A61A 1B38A 3F69A 2QD9A 3QXPA 4XOZA 4KAOA 5DVRA 3WF6A 2OJGA 2PVYA 3O8UA 4ZS0A 3EQBA 2IW9A 3NCGA 5E92A 3ULIA 4XUFA 5CT7A 2FSLX 5DA3A 4FNYA 5EW8A 4M8TA 2PPQA 2WMRA 4RJ3A 1SZMA 3VQHA 4EH6A 5LXMA 3UQCA 5IQFA 2OFUA 3CC6A 3EJ1A 3QX2A 4YBKA 5FP5A 3ZHPC 5A4CA 4FOCA 5HZNA 2QI8A 3VVHA 5LVLA 2R4BA 1J3HA 2X6DA 4C4GA 1ZYJA 3SXSA 3DK6A 4BCNA 2PVRA 2XKFA 4LRKA 2DUVA 2B54A 1SNUA 2ACXA 1XJDA 3D7TB 4AW5A 3LMIA 3FWQA 4QMTA 3LJ0A 1MQBA 4Y5HA 1G3NA 1ZWSA 2R64A 2J0MB 2BFXA 3OMVA 4ANSA 3H3CA 2W5AA 3PG3A 4DEEA 4JQ7A 3R1QA 3LCTA 4JR3A 4A4LA 2E2BA 4C4IA 2Y9QA 3EQDA 4IB0A 3E7OA 2VO7A 1J1BA 4M0ZA 5CXZA 3Q5ZA 3TUCA 3KN5A 4F4PA 2PY3A 5IEYA 5IKWA 4EZ7A 4IZAA 4R3RA 2VTMA 4D2WA 2OXXA 2RSVA 4FTRA 1H07A 3OEFX 3R71A 4HGTA 4S31A 2ZDTA 2PVMA 4GT4A 4J7BA 3ANQA 1YXTA 4I0RA 1SVHA 1PXIA 4X0MA 4YJPA 5BX0A 1XH8A 4FV1A 2Q0NA 1H00A 3TKHA 2JLDA 4PMTA 1B6CB 3KC3A 4XV2A 4CD0A 4DFUA 2PZRA 4LG4A 2WTIA 3V5JA 3BHVA 3VHKA 3DNDA 3NVMB 3FPMA 4PTCA 3QRKA 2PVLA 1U4DA 2CMWA 3LFSA 3R00A 4QMXA 5AP1A 5F94A 3V5TA 4Z55A 3RPRA 2V22A 3DV3A 1UWHA 4PP7A 1F3MC 2R3JA 3Q2JA 2XCKA 1IA8A 2YM4A 4FTNA 4MBLA 3L9MA 4KS8A 5JSMA 3T3VA 3ZCLA 3OF0A 3Q9WA 3JPVA 4B9DA 4JDIA 3BU6A 5AP0A 4L00A 4Q5EA 5IQEA 3EWHA 4KIKB 4P4CA 3LXNA 3MVMA 4G3FA 5HLWA 4EOOA 5CEPA 2OFVA 3FQSA 3R63A 2QG7A 5HCXA 3TDVA 4IFCA 3UODA 1PRYA 3TV7A 3EZRA 4F6SA 4IX4A 3CTHA 5TR6A 3CTQA 4F63A 2WB8A 5E4HA 2QR8A 2ZV8A 3HMPA 2VGPA 4A9SA 3GENA 2J0LA 4RC4A 4XJ0A 1FBNA 2R7BA 4O2PA 4XMOA 4ZMFA 2P4IA 4M84A 4OTDA 3TG1A 4E1ZA 1JSVA 4D0WA 3GVUA 4D1XA 4RFZA 2WQNA 3OWKA 3E64A 4BTFA 5EKNA 4BDKA 4J1RA 4L9IA 3HMOA 5FXSA 3MS9A 5FD2A 3RP9A 4MXAA 3R28A 3I5ZA 4G3DA 2HZ0A 3KA0A 4CCBA 3F3UA 4M14A 4W4YA 4YHFA 3FSKA 4RWIA 2OF4A 4I94A 4U79A 4XG7A 3MESA 3U6JA 3HRCA 4OTWA 2W1IA 3R7EA 4RRVA 3LFAA 4YTHA 5FTGA 2WAJA 3ZUVA 4YZBA 4M0YA 1PXNA 3SLSA 3ZC6A 3R02A 5TT7A 4BIEA 2QG5A 5EYKA 4ERWA 2E9VA 1YDTE 4WNOA 5CU0A 2JDOA 3ZBXA 3DDPA 5K4IA 5E8XA 3HL7A 3O2MA 4GT3A 4JOAA 5JGBA 3NNXA 4ANLA 4QPSA 4RC2A 5L2QA 5TF9A 3NVKI 1QPEA 4L6QA 3KRXA 4B8LA 3LCKA 4R5SA 2HW6A 4FL2A 4ZOGA 3UVQA 5C9CA 3NGAA 2XNPA 4C36A 4O0TA 4QTDA 2HOGA 5CT0A 3SXFA 5GJGA 4Y73A 5AADA 4Z9LA 1LR4A 1CM8A 1XKKA 3QCQA 2AYPA 4G31A 4ZTSA 3R7YA 3ETAA 3AG9A 3V5WA 4EEVA 5BUJA 4FKQA 2WMVA 4PWNA 1JQHA 3WYYA 3IQ7A 3S95A 5E7RA 2C6IA 2GCDA 2HY81 1MQ4A 4IB3A 4CRSA 3UIXA 2QNJA 2IVUA 2JIVA 3DKGA 4BR3A 5F20A 4FKLA 5IUHA 4QYYA 3NMUF 3KEXA 5J79A 5A4TA 4XBRA 3FLYA 5M4CA 1FGKA 3DXPA 1GIHA 1UU3A 4CKJA 3ZTXA 1Y8YA 5AMNA 2YIWA 4DT9A 5D11A 4HGEA 5IZFA 4RMZA 1H1WA 4IZ5A 4FEXA 5HG9A 2B9FA 4GIIA 3V8WA 1OL7A 5TOZA 5ACBC 1OKWA 4EH7A 4FV8A 2F57A 4NH1A 5DRDA 5LVMA 5DOSA 3O71A 2W1CA 1P2AA 3P08A 3BEGA 1XBBA 4CTBA 4YTFA 4RJ8A 5ICPA 4ZK5A 2YCSA 3CGOA 4FZAB 2R9SA 4FZ7A 5HU3A 3VC4A 2O3PA 1CKPA 3CXWA 4O21A 4X3FA 4CGAA 5AV3A 4EH9A 5AAGA 5FDPA 2VWYA 4I5CA 4KKHA 3AXWA 3QCXA 4PPBA 4EOKA 3F5UA 5CI7A 4JRVA 4A4OA 2Q83A 4DEAA 3AC5A 2CGVA 3P1AA 4W4WA 3RAWA 3QTRA 3G90X 3PE1A 3HRBA 2F9GA 2RL5A 2UW6A 3FMDA 3IS5A 1Z9XA 3R30A 3F3TA 4FIGA 4RBLA 3A62A 4X3JA 3ZO2A 4EKLA 3F61A 5CVFA 3U51A 4TY1A 3KVWA 4QP8A 3CTJA 4QNAA 2XIKA 1Y8GA 2JAVA 3DOGA 4TYHA 3ZFYA 4BF2A 3VBVA 3JS2A 1U5RA 3OY1A 3NUNA 3Q96A 3U9CA 5HBEA 4IDTA 2XK7A 2XNMA 4LOOA 4FTAA 2XZSA 3IDPA 4WNPA 4UWCA 3TEIA 2C5XA 3GQIA 3N4TA 4ZZNA 3Q53A 1ZOEA 5AR2A 3ZBFA 4CZTA 2XJ2A 5K0XA 4MXXA 2UUEA 2GMXA 4CEGA 3VBXA 5DYJA 4BDHA 2A0CX 1YHVA 2XB7A 3C50A 3LFCA 5AWMA 2WU7A 1KE9A 2IZSA 3C4EA 3QRJA 5AUZA 4CFVA 5IA5A 1LPUA 4FUYA 3V5LA 1SNXA 3BHTA 2DWBA 5CNNA 5EDQA 4D58A 3DAJA 4XOYA 5GIOE 3MFTA 4NEUA 2OIBA 4FIEA 1IAHA 2X8EA 4U40A 2JBOA 4HNIA 4MF1A 4ZXTA 2B9JA 4BDJA 3QA0A 2RFNA 4L53A 1I09A 3BX5A 5C01A 4M7IA 4FODA 3ODYX 3DBEA 4LGGA 2YWVA 4XH6A 1Y6BA 2YLFA 3KXMA 1PJKA 2X8IA 5I9UA 3P5KA 1JBPE 3MDYA 4QP6A 1GOLA 5CSPA 3C1XA 3EN9A 3ZOSA 3NLBA 4UWBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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