4X3FA

Crystal structure of the intracellular domain of the m. tuberculosis ser/thr kinase pkna
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
287
structure length
274
Chain Sequence
PRVGVTLSGRYRLQRLIATGGMGQVWEAVDNRLGRRVAVKVLKEFSSDPEFIERFRAEARTTAMLNHPGIASVHDYGESQMNGEGRTAYLVMELVNGEPLNSVLKRTGRLSLRHALDMLEQTGRALQIAHAAGLVHRDVKPGNILITPGQVKITDFGIAKAVDMGTAQYIAPEQALGHDASPASDVYSLGVVGYEAVSGKRPFAGDGALVAMKHIKEPPPPLPPDLPPNVRELIEITLVKNPAMRYRSGGPFADAVAAVRAGRRPPRPSQTPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of the catalytic domain of the ser/thr kinase PknA from M. tuberculosis shows an Src-like autoinhibited conformation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PknA
total genus 75
structure length 274
sequence length 287
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4x3fA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4x3fA01
1J3HA 2W7XA 4O1OA 1PY5A 3GU8A 4GG5A 4NSTA 2BRMA 2X9FA 3AC8A 3E92A 4X0MA 3RAIA 1Q24A 2OG8A 4O0TA 4M67A 4F0IA 4OTHA 4PY1A 1T45A 5FTQA 3MW1A 4CT1A 1ND4A 4D1SA 3D0EA 4L9IA 2C6KA 2G2HA 3UGCA 1Z57A 4G17A 4TWPA 3ZZEA 4D1XA 2GU8A 1JQHA 2QOIA 2UW8A 3VBTA 4C36A 1J1BA 3R28A 5F4NA 2HZNA 4QTCA 3IQ7A 3D5VA 2XK7A 4PMPA 1Q8ZA 3DS6A 3EQBA 2ETMA 2JBOA 3CTJA 2VTHA 5HO8A 3GFEA 3ORKA 2Y6OA 3CJGA 3UQGA 4ALVA 2XYNA 1W82A 5CAUA 2R3IA 4GYGA 3U55A 5DEYA 3DTWA 4FKOA 1OUKA 1JKLA 2EB2A 2E2BA 2WIHA 3IW4A 3NYXA 4LRMA 1YHWA 3EJ1A 4LV5A 5CSXA 4OR5A 5CALA 5I9VA 3W16A 2OF2A 5FP5A 2R3NA 3ORZA 4ITJA 4C3RA 5J1WA 4OW8A 4GIIA 3C4WA 4FTAA 3TXOA 1WBWA 5EW9A 4Y5HA 3AG9A 2CLQA 1JAMA 2B9IA 4QNYA 3HMNA 5EYDA 4U8ZA 3OWKA 2WMUA 4D28A 3ZEPA 2IZUA 2X2LA 3MTLA 1H00A 5DGZA 2CCHA 3OWJA 4GCJA 3PXQA 4FTTA 4EK4A 3BHHA 5T3QA 1SMHA 3R9RA 5DEWA 4YLLA 4OTRA 3CJFA 3G6GA 3PVUA 3PTGA 5EHOA 3TN8A 3EQDA 3UPXA 3I5NA 3QUEA 4JBVA 4CKIA 1YHSA 4FSYA 4BVUA 3DBFA 1Q8WA 4YJQA 2YM5A 4FV5A 3QX2A 1KE7A 1JOWB 3UVRA 1O6LA 4MNFA 5DR9A 1OBDA 4JG7A 3CY3A 3PDTA 3MA3A 2I0YA 5HEZA 1M2RA 3DZOA 1R39A 3I5ZA 3NUYA 2CGXA 5IMEA 2H6DA 4QPAA 4ZS0A 1YXVA 1KSWA 1OIRA 4BZNA 5H8EA 2YIQA 4QMYA 4QT1A 4FV4A 2HIWA 3E62A 5HG7A 2UVYA 4ALUA 1MUOA 5GZ8A 5GJDA 3SVVA 5D9HA 4E8AA 1RDQE 2WMVA 4FK3A 2FB8A 2R2PA 5LVPA 1GIHA 4EUTA 5J79A 4H39A 2PSQA 1P5EA 1WBVA 5AM7A 2IPXA 2XJ2A 3F2AA 1QL6A 1WBPA 1YXSA 2ONLA 3QD0A 3QQLA 3RZBA 2VTAA 3PSCA 4K18A 2WELA 3ORNA 4UALA 3QCSA 2RFNA 3GXLA 1M2PA 3HA8A 4Y73A 5G6VA 3PXZA 4FTCA 5AP4A 4DGMA 4EK3A 2WU7A 4QOXA 4U41A 4G6LA 4ANBA 4EQMA 2PE0A 3PIZA 3G15A 2X7GA 4FF8A 3Q60A 4OTPA 2BTRA 4JX3A 2PPQA 3CCNA 4X21A 4UMQA 3TM0A 2B9JA 2VO0A 3FY2A 3GCVA 3ET7A 3HRBA 4FIFA 3FQHA 5E8WA 3VRZA 3WARA 3HKOA 3E87A 4AA0A 4FKVA 3H10A 3PIXA 3TKUA 3QKMA 4IQ6A 4XLVA 4IX5A 2GCDA 3TJCA 3WOWA 4F9YA 1H0WA 3WYXA 5HQ0A 4S33A 3QU0A 3UPZA 2R5TA 4G1WA 2UZLA 2JIVA 1XH4A 3C4FA 1UU3A 3HV6A 4GH2A 4OBOA 3W2SA 2WMRA 2QQ7A 2WOUA 4AQCA 4EKKA 4FT0A 4DG3E 1H26A 3TV4A 5LWMA 2PK9A 4EK6A 4EK8A 4FKLA 3SD0A 5L6OA 3CS9A 4Y72A 4O96A 1UU7A 5CZHA 5H2UA 4JJRA 3FV8A 2J2IB 5DMZA 2SRCA 4LV8A 1XR1A 4DG0E 1FGIA 1ATPE 1G3NA 4L00A 3PSBA 4GRBA 5ANGA 3TUDA 1G8SA 4L7FA 4FL1A 5A6OA 1LPUA 3EN5A 4E5WA 3I7CA 3V5LA 3BWJA 4Z7HA 4GFOA 4I4EA 4OTGA 4FVQA 4BKZA 2GSFA 2W1GA 2Y6MA 3C51A 4MKCA 3MV5A 3FEGA 4FTKA 5FM2A 4WD5A 1H4LA 5JFVA 4E3CA 4DCEA 3KGAA 3UG1A 1PHKA 5CU0A 3MFTA 4K2RA 2OH4A 4GS6A 1H0VA 2PY3A 3COHA 4ZY5A 3ZSGA 2OZAA 4W9WA 2EWAA 1UV5A 2ERZE 4EYMA 4FG7A 3QA8A 2YAKA 3MPAA 3KXZA 2UW3A 1LEWA 4XRLA 5C26A 1TQIA 3V04A 4CZYB 2PMLX 4UXQA 5E92A 1Q4LA 2WMTA 4TYEA 2KTYA 4RIYB 5DR6A 5HIEA 4BN1A 3DT1A 3R1QA 1A48A 4U81A 4BDBA 2XNMA 5IQDA 3DV3A 5FEDA 3P79A 2BDFA 5M57A 4FGRA 3R1NA 5FTOA 4U7ZA 4YJTA 3GC8A 2CGUA 4ZSEA 4AW2A 4ITHA 4MK0A 3ZLWA 3U6JA 3DKGA 1HOWA 5CEMA 2YJRA 3QGYA 2OIBA 5HICA 4FKGA 3FE3A 4K0YA 4J99A 3QKLA 2J5EA 3HLLA 4CTBA 2VTPA 5CY3A 3ZLYA 4DINA 4JLCA 2O63A 1W83A 5IEVA 1QCFA 3VBWA 4EORA 3DKCA 4IVCA 4TWNA 4Y5QA 5HIBA 4TL0A 5F9EA 3LKMA 3P9JA 4DTAA 3MI9A 4AT4A 2WMAA 4J97A 3MTFA 1AGWA 5E8ZA 4A9UA 2JKKA 3I6WA 3OCTA 4WSQA 4ZTRA 4LUEA 3EQFA 3KCKA 5E1SA 3SOCA 4GW8A 1H1QA 3BQCA 2HY0A 2UW5A 1GJOA 4U80A 3RKBA 5BPYA 1H1PA 2C3LA 2YCQA 3NIEA 5H8GA 5CNNA 3EFWA 2JGZA 4QP8A 2CPKE 4RC4A 5M56A 5AEPA 4YHFA 4DGGA 4EZ5A 3GEQA 3QLFA 5DBXA 3IGOA 4IEBA 5AX9A 4YURA 3ZBXA 1YI6A 5BMSA 2A0CX 3BHUA 5AUWA 2BRBA 4C59A 1NA7A 4DBNA 4TWCA 3K54A 3I6UA 4GK4A 3F88A 4RQKA 3ZM9A 2IWIA 4O7WA 2RFDA 5HORA 3KULB 2R3HA 2GHMA 4C7TA 4YLKA 1XJDA 1FVTA 3NYNA 4HYUA 4V0GA 4H36A 4M68A 4YGAA 3C4EA 3NCZA 2P0CA 2Q83A 3NRMA 4XG4A 1RE8A 3AQVA 3S1HA 1XO2B 5I3OA 3LMHA 5KE0A 4ZTNA 4PP9A 4YTFA 3V8SA 1ZYJA 4FEVA 5EQEA 2BDWA 4OTFA 5D12A 4D5KA 2NNWB 3LMIA 1BYGA 3PP0A 5ANJA 5EM5A 5FRIA 5GZAA 2WQOA 4IX4A 2P2HA 4RA4A 3WI6A 2QD9A 3IW5A 3LQ5A 4KSPA 1R3CA 3VHKA 3DBEA 3TZ7A 3ZYAA 1YWNA 4EH8A 4L68A 3R71A 4OAUC 4BC6A 1M7QA 4F1TA 3CD8A 5BVFA 3T3UA 4M12A 2QONA 2UZWE 3PIYA 5KBQA 2JDOA 4KIOA 4CSVA 4R3PA 4E5BA 3G9LX 4YLJA 1R78A 4RJ5A 4LOPA 3RNYA 4IWDA 5CVFA 4XLIA 2PZRA 4L3LA 3S95A 4F99A 4BCOA 1KV2A 3KEXA 4R7IA 4C62A 4DG2E 4U42A 4S34A 2VTJA 3BEAA 5JN2A 3WIKA 4G3FA 1JBPE 4DN5A 1CKIA 2GS7A 4FZ7A 1Q5KA 2WTDA 3EQCA 5GNKA 2Y9QA 3OG7A 1SVEA 2HXQA 3HZTA 5DYJA 4E6AA 4F65A 2JDTA 3DAKA 4YP8A 4EHEA 4U40A 3FY0A 2JDVA 4O1PA 1Y6AA 3L1SA 2WTIA 4CZTA 2CMWA 4HCVA 5E8VA 5HLPA 5HX6A 4M69A 3AMAA 3ZHPC 2JDRA 4E6QA 3NCGA 3RPYA 4QP3A 1UWHA 2WO6A 2FH9A 4HYIA 3CQEA 3H9OA 4G9RA 4JAJA 4L3PA 1ZRZA 2WMBA 4I5CA 5B0XA 3TWJA 3ZOSA 4C37A 4CEGA 5AUVA 1EH4A 4K6ZA 4BCGA 4WG3A 1A9UA 2ZV7A 4PTGA 3RALA 1XH8A 3CY2A 3BYUA 1U4DA 5CEQA 4EOLA 1YKRA 3FXWA 3JS2A 2A2AA 3MB6A 4ACDA 3HA6A 4Y95A 4B0GA 4UYNA 1AD5A 5HCXA 3UNKA 2W5HA 4Z9LA 2OJFE 4C38A 4CFNA 2XUUA 1W8CA 2QOOA 2VTNA 2YIYA 1OUYA 3E3PA 4XX9A 3R8VA 4X6QC 4NIFA 4TN6A 1OI9A 2OK1A 3KN5A 4ITIA 4MXZA 3R2BA 3F5GA 5GIOE 4JNWA 2J7TA 3ACJA 2BR1A 3D5XA 4FZDB 4U43A 3HMIA 3Q3BA 5IISA 3I7BA 3MH1A 3KY2A 4FV7A 1W7HA 2Z7RA 4FX3A 4USEA 3A4OX 3IONA 4FV1A 4TTHB 3EIDA 4YZDA 3NDMA 3QQJA 1VZOA 3CR0A 3KMWA 3OCGA 2JBPA 3DB8A 2CSNA 2FO0A 5IQGA 4W9XA 1ZMUA 3KXMA 2ITOA 3MYGA 1OL6A 3TV7A 3PLAE 4M69B 4CCBA 2JKOA 2WTKB 4I94A 3LQ8A 5FQDC 3FPQA 3ZU7A 2RF9A 1PXMA 2P3GX 5JGBA 4W4WA 1JSUA 1WVYA 5HNBA 4Z16A 4ZSJA 2G01A 5FP6A 1REJA 3FYKX 3QRUA 2QKWB 3DNDA 3OTUA 2F7EE 4XOZA 2WHBA 3R8UA 3F2RA 4HZRA 3FC1X 3SDJA 4O84A 3VAPA 3GU5A 3R83A 3GC7A 2ITQA 2E9PA 3UVQA 4CT2A 3NUNA 3P4KA 4FKRA 4YNOA 5CF6A 3DK7A 3G90X 4EJNA 4F7JA 1FMKA 2BALA 2X81A 4ANQA 2YIRA 4FV8A 3HRCA 4NIFB 3SKCA 3DFCB 3QTZA 4NH1A 4CFVA 4ZJVA 3BHYA 5CYIA 4F1MA 3BV2A 2WKMA 4IZAA 4X3FA 2QU6A 3HVCA 4AGDA 3EQRA 3DAEA 3ZUUA 4BTKA 4EQUA 5LMAA 5DRBA 5HTCA 3SW7A 4FBXA 4DH3A 4FG8A 3QALE 2WFYA 3MJ2A 5HCYA 4MXXA 2OXYA 3W2OA 2IW8A 4NW6A 2PULA 1H25A 3MESA 3HRFA 3NW7A 3W8QA 2OXXA 4E6DA 5E8TA 3QRTA 4DGLC 1JKKA 4P5ZA 4M97A 5AR2A 5HE1A 3KMUA 5CU6A 4MYGA 3A7FA 4KKGA 3CKXA 3PG3A 4R7BA 1CMKE 5FLFA 5AP2A 3KKVA 4PMTA 2UW7A 3GP0A 3VUDA 4O7NA 4O0UA 5AP7A 4EONA 1YXUA 4FZ6A 5K5XA 2RG6A 4MBIA 4MF0A 2QC6A 4F6UA 5LQFA 3KRXA 1YDSE 4C34A 3DTCA 4M7IA 4CCUA 1OIQA 2J6MA 4FKPA 4FV9A 3IDCA 3L8XA 2NRYA 4J8NA 5C01A 3Q4ZA 3V5WA 4FVPA 2OJ9A 3TKHA 4ANLA 5EW3A 4MWIA 3CQWA 3EB0A 3L9NA 3SW4A 4H05A 2EXCX 2QO7A 4BRXA 4CFWA 4F9AA 4YJOA 4E73A 4R1VA 4BCQA 2VO3A 2YACA 3C1XA 5CSWA 3FQSA 4B4LA 4O22A 1YXXA 3C9WA 5CS6A 3DJ6A 4M8TA 4G6NA 3MVHA 3IDPA 1H28A 2GS2A 5E1EA 3ULZA 3UTOA 5JK3A 3VRYA 1ERKA 3F3ZA 4Y83A 3MIYA 2YIXA 3RP9A 3BLQA 3HNGA 3ZM4A 3FQEA 4IACA 4RPVA 3UMXA 3EFJA 3ORTA 4L01A 3ZDUA 1OKWA 4EK5A 3VUHA 3U54A 3KK8A 3V5TA 4ZAUA 3F61A 4XBRA 3ANRA 3ZTXA 4J8MA 2VO7A 4RQVA 2G9XA 4RWKA 2O2UA 3MSSA 3R8ZA 3S4QA 1ZOHA 2RGPA 3KFAA 2C4GA 4WNPA 2ITPA 3OS3A 4QNAA 4HVDA 4FSZA 1URWA 4TYGA 2R4BA 2YLEA 4EJ7A 2VD5A 4DEEA 4Y8DA 3BEGA 4MCVA 4R1YA 3Q9ZA 2CHLA 4E1ZA 5CVGA 1B39A 3V01A 1P2AA 4GJ3A 3W8LA 4F9WA 4DF3A 4YJPA 2WTCA 4E20A 2GHLA 3B8QA 5CT0A 4ACHA 4II5A 3C0IA 3L8SA 4FICA 4BTFA 4MXOA 4RFMA 3C13A 3QUDA 4O0WA 1H8FA 3I81A 5TF9A 2PVKA 4RIXA 5D1JA 3Q2JA 1VYZA 3WZDA 1AQ1A 3L8VA 1O9UA 4I5MA 3W32A 4BCPA 4DEGA 4E4MA 3M11A 2EU9A 3MS9A 4IB1A 4RJ6A 4O7YA 1OZ1A 5IUGA 1B38A 5AFVA 1P4FA 2DQ7X 2O5KA 3QQUA 3FI8A 3AC5A 3D4QA 5EI2A 2BZJA 2HCKA 3BYMA 4GU9A 4PDPA 1MRYA 2BIKB 1GNGA 2P2IA 4DEBA 3HECA 4F4PA 2J9MA 1KE5A 3HDNA 4QD6A 2W99B 4KIPA 4QMMA 3M2WA 4RC2A 4U6RA 5KZ0A 5IA1A 5JFXA 4A06A 5IQAA 1XWSA 5HVJA 3BU6A 2C68A 2BZHB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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