4XG2A

Crystal structure of ligand-free syk
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
273
structure length
259
Chain Sequence
YLDRKLLTLEELGSTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of spleen tyrosine kinase in complex with novel inhibitors: structural insights for design of anticancer drugs
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 259
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-12-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4xg2A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4xg2A01
3G51A 3OCSA 2WQEA 3DDQA 3F9NA 3OWPA 3JY9A 3H9FA 5KHWA 4JX7A 1QL6A 4BDFA 4R7BA 2BR1A 3EZRA 1JWHA 2QC6A 3ZRKA 4EK3A 4DTBA 3MFSA 4R8QA 3AD4A 3TL8A 4BCJA 4AW5A 4FTKA 2A1AB 4O27B 5IEYA 2PK9A 1MQ4A 4FL3A 3U55A 2HZ4A 4BYIA 3OUNB 3F6XA 4TYHA 3RNIA 5IQBA 5FEQA 5D10A 3LFFA 3WE8A 4E7WA 4WNMA 5ANGA 3OROA 3MA3A 3Q96A 4F9WA 1WFCA 3IDBA 4QQJA 4CMTA 1PXPA 2ITYA 4YLKA 4EOLA 4HYSA 4HYUA 3HECA 4IZAA 4GVAA 4D55A 4EOIA 4TPTA 2ITNA 4F63A 2B7AA 3QGYA 3RTPA 5CAUA 3NLBA 1H8FA 2AUHA 4JS8A 5M4FA 3KXMA 5D7VA 5C4LA 1VEBA 2XK8A 3U9NA 4AE6A 2C5OA 2VTHA 5IH4A 4I5PA 2OK1A 4PMTA 1Y6AA 3Q2MA 5F4NA 2UZLA 3H0ZA 5HLWA 2JIUA 3ID6C 2EB3A 4RIWB 4E8AA 1PXLA 4J98A 4QYHA 5HE3A 2J50A 3UE4A 3P7BA 5I9UA 3E8NA 2W1ZA 4WNKA 4UZHA 1WBWA 3NUUA 4FC0A 3LXLA 4A9TA 4QP8A 4EUUA 3BKBA 3D2KA 4M84A 3A7JA 2IW8A 3FKNA 5LWMA 4FKSA 3BELA 2CHLA 3FYJX 4CFUA 5IMXA 4DEBA 5CASA 4QMLA 1RDQE 4LOQA 2WO6A 2R3KA 4FNYA 3DJ7A 4DCEA 3PVBA 2GS2A 2IZTA 2CGVA 2YCSA 1NT2A 5DI1A 2UZWE 5FG8A 2WOUA 4Y5HA 4BHZA 3OW4A 3SC1A 3NCGA 3FSFA 3LW0A 3GOPA 4HZSA 3ORZA 3IECA 3SXRA 1KE9A 1OVEA 3QQKA 5AUZA 2RIOA 3LAUA 3TT0A 3WZEA 3L9PA 3CIKA 3PXRA 1J1CA 4MEDA 5IA0A 4QO9A 5L2WA 2F7EE 1P14A 4AW1A 3KRRA 1MRVA 1OI9A 4FR4A 2YLEA 5J95A 4KKEA 3G33A 5JT2A 5LJJA 1OL6A 3UTOA 2EB2A 2VTOA 2H6DA 3D5VA 3KULB 3R2BA 4R1YA 3SX9A 4I0RA 4O7TA 4A7CA 4H1MA 4C4JA 2OXDA 1ZOEA 5T68A 2OGVA 4Z55A 4ZXTA 3FXWA 3EKNA 4RZVA 5AWMA 2UZVA 5IG1A 5KKRB 3NW5A 4UMUA 1ZWSA 3EQRA 3DBDA 4KABA 1JSUA 4YJRA 5C03A 4L01A 1LR4A 2C6DA 3ZLWA 4GRBA 4FA2A 3TZ9A 3FI3A 3ROCA 3VULA 2YIXA 3ZBXA 4C4FA 1SZMA 3ORXA 3RI1A 5EDQA 4BZNA 2PVMA 3LXKA 4I93A 3A4OX 3AC1A 5C8MA 3ZH8A 3HMIA 5CU4A 4IIRA 5CU2A 4H3PA 1SVEA 5AIRA 1Q8ZA 3ZDUA 4BFMA 5BPYA 4O83A 1OIRA 4DG0E 1WBVA 4FZ6A 3RP9A 5CI6A 5CALA 4TNDA 3ZZEA 5AUUA 5C8NA 4DGMA 5FUTA 3CS9A 4Y8DA 3RAKA 2FSTX 5HNGA 3GCSA 4EH8A 5CENA 1OUKA 2R2PA 1UWJA 4O6EA 3EJ1A 2PHKA 4GYGA 2I0HA 1KE7A 3AC2A 2H9VA 3TTIA 4RX9A 2XNGA 4H3BA 4L42A 4FKLA 1JKSA 3HA6A 3BHHA 3GOKA 2R3QA 3FMNA 4OT6A 5E8VA 3MESA 3QC4A 2GSFA 4HPTE 5JH6A 1PXIA 1ZXEA 3VW8A 4E6DA 2EXEA 2UW9A 4FEVA 3ZEWA 4RRVA 3HV5A 2HY81 1IA9A 3TZ7A 2VWYA 3QBNA 1CTPE 2YIYA 4RZWA 3AOXA 3E7VA 3JUHA 5AM7A 1JBPE 2C6IA 3W2PA 3O23A 2C0IA 1XH8A 3FWQA 4JIKA 4X7QA 1M2QA 2REIA 3ELJA 4S30A 1M17A 3OT8A 3R21A 2R3NA 4X3JA 3ZUUA 1U5RA 2PE2A 2G15A 3QUDA 5M56A 4HVHA 5FLFA 2GNGA 2PVNA 2QG7A 2OKRA 4TYIA 4QMZA 5HG9A 4IAKA 3TV7A 4CTCA 5CLPA 5E1EA 5ETAA 4NIFA 4C4HA 4D58A 4GUEA 5FM2A 4PPAA 3SW7A 2VNYA 4D2VA 4L7SA 5HG7A 3EIDA 3DK7A 4AQCA 2VAGA 3DS6A 3R9HA 1J7IA 2VWWA 4HGLA 4JG7A 1UU8A 3LIJA 4XG4A 2ZMCA 1Y8YA 4EONA 4YTIA 3M42A 2YM6A 1YW2A 2X2LA 3HX4A 4TW9A 4TWCA 4UXLA 2B55A 1WBPA 2XKCA 1ZAOA 3GUBA 3BBWA 3HV3A 3P86A 3FKLA 4N0SA 4N6YA 5A4TA 4KA3A 3LJ0A 2FH9A 5JQ5A 3EQBA 3LCOA 3SOCA 4NM7A 3QYWA 1XJDA 3LMGA 4EHGA 4C57A 1OPLA 4Z7GA 4MBJA 2XEYA 3HGKA 3DZOA 4M66A 4IX5A 4OTRA 3W8LA 4FT0A 3F5GA 4ZJIA 1LUFA 3C13A 3DBEA 3DU8A 4JBPA 4LRJA 4AZWA 1PRYA 1YRPA 2RSVA 2IVVA 3KFAA 5B2KA 4RA5A 4IVCA 3UC4A 4BTKA 5FGKA 3CD8A 3NUSA 1Z57A 1QMZA 4I1ZA 3UGCA 3FYKX 3LJ2A 4FX3A 4C3RA 2Z7SA 3C50A 4XP2A 5A4EA 2BKKA 4C33A 5HORA 5AR5A 2BZJA 4AA0A 1H24A 4Q9ZA 5C8KA 1GZKA 3I4BA 5I3RA 3BCEA 4BBMA 2CN5A 3TEIA 3QF9A 2FO0A 3QUEA 3S3IA 4QT1A 3KQ7A 1R0EA 4S31A 4BVUA 4ZY4A 4XP3A 4PL3A 3LFSA 5KNJA 2PMNX 1IR3A 1YHWA 2WZJA 4S2ZA 3VBTA 3ZO2A 3UDBA 3PP0A 4E1ZA 4KIPA 3SAYA 1UU3A 2VTLA 2VTJA 2FSOX 4HGSA 4V0GA 4AN2A 2PYWA 2FVDA 4CFMA 3Q4CA 1TKIA 5FQDC 4C7TA 2ZM4A 2WU7A 1SYKA 3O8TA 3WZKA 2Y4PA 3Q4ZA 5HLPA 2ACXA 3LOKA 1YVJA 4XS2A 2XYNA 4F7SA 1R39A 3O51A 2QR8A 3P78A 4QP4A 2ITZA 4CV8A 3QTUA 5J87A 5J7BA 2BZKB 2QOIA 2J0LA 2BZHB 3F2NA 3KA0A 3V8SA 2ERKA 3CP9A 4LM5A 4AA5A 4BDCA 2EVAA 3C4ZA 3QCXA 3WF6A 3R1SA 2W9FB 3MH2A 3TM0A 2W5BA 4PPBA 4ZTNA 2ONLC 3UP7A 3GU4A 4I6QA 4C3FA 5FD2A 3ZM4A 4EOJA 5B2LA 3R83A 2Q0BA 4FODA 4AZFA 3WYYA 3C0HA 2UZDA 4YUQA 1SVGA 1UV5A 2XBJA 5AUTA 2VU3A 3DQWA 4DAWA 3QRUA 1J7UA 2WMTA 3UZRA 1TQIA 3PVGA 3BU3A 3K3IA 3MIAA 4JQ8A 4GV1A 3ZTXA 5CF8A 5IISA 3KVXA 3ZLXA 5KMJA 4BR3A 4MD7E 3I79A 1YI3A 4N6ZA 3ORPA 4AOJA 3UC3A 3FL5A 5CSPA 1FGKA 2CKEA 2QOOA 2ZM3A 3PA5A 4FIEA 5FRIA 4C58A 5JRQA 1E9HA 3VJOA 5IQIA 5HBHA 3FMHA 3OWJA 5EDRA 3TJCA 4B9DA 5JRSA 2V5QA 4NUSA 5HTIA 4EC8A 3Q6WA 3Q9YA 2QO9A 4TYJA 5A9UA 2PUPA 4MX9A 2NNWB 3I5ZA 5HZNA 4O0YA 4RT7A 4CSVA 3AQVA 1Q62A 5KMLA 2XNMA 4I6FA 2WFYA 2C0OA 4MXOA 3ZC5A 1QPEA 2PVFA 5EHYA 3DBFA 2IPXA 5JK3A 2GNHA 3BQCA 5IH5A 4D9UA 5HKMA 3D0EA 4IJ9A 2W05A 4FMQA 2GHLA 2VTIA 5ANJA 1O6LA 1VJYA 4IQ6A 3KXHA 3UVPA 2VX1A 2YM7A 4FZDB 3N4TA 1E1VA 2BAKA 3AMBA 5IH6A 5KBRA 3POOA 5C4KA 5J5SA 2QOBA 3Q60A 4D2PA 4EH4A 5H3QA 1APME 3TWJA 2BAJA 3C5UA 3HRCA 4ZSGA 5KO1A 3TNHA 4EKLA 1IG1A 3AC3A 3Q4UA 4O21A 4PP9A 4D1XA 2HK5A 3R2YA 5CYIA 3Q5ZA 5K4JA 4AGUA 2CN8A 3A8WA 3TJDA 5AV4A 5IQDA 3A7HA 3IGGA 2XRWA 3OC1A 3OXTA 4C62A 4D5KA 1Q3DA 3IW8A 3AGLA 4ZTMA 4O81A 4RPVA 4U44A 3PA3A 5AR3A 4QTDA 2AC5A 1U46A 4QYGA 2UZEA 3MS9A 3OT3A 2XF0A 4AFJA 4FG8A 5TF9A 1ZRZA 2W0JA 4QMPA 5FP5A 3R8UA 4D28A 5CEPA 3DK6A 5DEYA 4WT6A 3RJCA 4M0YA 2QLUA 3RHKA 4M12A 4O7RA 2UZOA 1SNUA 1MRYA 3U51A 4FGRA 2Z8CA 1F0QA 1YWRA 3TTJA 2F2UA 2G2FA 4XH6A 4O7WA 5EYMA 3BIZA 2UW6A 2QONA 2WIHA 3ITZA 3QYZA 4U7ZA 2WTIA 4NCTA 4XRJA 5D41A 3VWAA 3K54A 3NIZA 4PWNA 4QMUA 3FSKA 2AYPA 4X2FA 3OD6X 4BHNA 3V8WA 4FOBA 4YR8A 3UYSA 5LARA 3FZRA 2IZRA 3ENHA 4NKSA 3SLSA 4EEVA 1XKKA 3F61A 4RLLA 2OZAA 5IQCA 1H28A 2Y4IB 3DY7A 3LCDA 3KCFA 3VRYA 3VUKA 1XBAA 4DFXE 2IJMA 3PSCA 2R3MA 4R6VA 3UIBA 5B7VA 1IAHA 2OZAB 1PXMA 2YZLA 3MI9A 4HVIA 3S0OA 5GIPE 4R3RA 4IW0A 4AOTA 2A2AA 4S33A 2E9PA 2O64A 4G6LA 5AR4A 4ASXA 2GNFA 3H4JA 5HD4A 2XZSA 2WTCA 4LQMA 5HCXA 3L9MA 3EN7A 3RALA 3WE4A 1UNHA 2XBAA 1PMVA 2YM5A 4GK3A 4BWPA 4E73A 2OF2A 4CVAA 1UU9A 3AG9A 4QP6A 3HZTA 3PVWA 4LUEA 4P2KA 3C4XA 5TOZA 1NW1A 3O96A 4WKQA 4LGHA 3V5QA 4YMJA 4R77A 4IFGA 4J8NA 5C9CA 4EBWA 3PZHA 2X8EA 3FQSA 5CTPA 4AG8A 1WZYA 5GHVA 2B9IA 3QKLA 1WVWA 3NEWA 1V0OA 2RFNA 1H1PA 3A61A 3COMA 5F20A 1NVQA 4O7VA 3KREA 2LGCA 1FMOE 4DEEA 4CT1A 4QOXA 5JKGA 3E3BX 2XKFA 3VS3A 1SNXA 3WOWA 4CFNA 2R7BA 3UVQA 1JQHA 4DFUA 2UVXA 4EK8A 3DAEA 1W82A 2QNJA 3VQHA 2JKMA 3U4WA 4UALA 2WB8A 5CQUA 3RGFA 5CVHA 4G3GA 1PY5A 2J2IB 3FV8A 1QPCA 3DKFA 2BROA 3KRXA 4Y46A 2R4BA 4Z9LA 3UMXA 3ZSHA 4E6CA 2UZUE 4F7LA 2NO3A 2XEZA 4Y95A 4BWKA 1OKZA 3ET7A 3F2AA 3C51A 4QMTA 1Q5KA 2JDOA 2XYUA 3R22A 4A06A 1PXOA 3PLAE 2HENA 5EKOA 4DH8A 3MY0A 5TKDA 4XG3A 4LRKA 3WZJA 4DGGA 2YAKA 4JR7A 4K77A 2H34A 2X8DA 4M68A 4UZDA 4AWIA 2UUEA 3RPVA 2OG8A 4BTJA 3TNWA 4CMUA 4ZSJA 2YISA 4EBVA 3UMWA 3HRFA 2PVHA 4IZ7A 3V01A 3OEFX 3BYMA 2XM9A 3G6GA 4L6QA 5E7RA 4EH9A 3UO4A 5DRBA 4CCUA 3R7YA 3RBWA 3PXZA 3R8ZA 4RGJA 4CEGA 2I7QA 5BMMA 3RAIA 4X2GA 3WI6A 1ZMVA 4Q9SA 5H8EA 5DMZA 2O2UA 3AXWA 1YWNA 5BVEA 4ANLA 2Y8OA 2YEXA 2ZV7A 3C9WA 3WF8A 4APPA 1ERKA 1KV1A 5L8LA 5FEDA 4BKJA 3AC8A 5L6WL 3ZM9A 1RW8A 4L52A 1ZOHA 1ZYDA 4RC4A 1JNKA 5BYLA 1YKRA 3BBTB 5I9VA 4FOCA 3EFWA 4ZS0A 4NU1A 5I9WA 3DGKA 1OECA 3POZA 3O17A 3VUIA 4JJRA 4X21A 3SG9A 4K9YA 5BVWA 4JG8A 4CZYB 3W1FA 4KIOA 2YWVA 5DWRA 3COKA 4D4SA 4F6WA 3QAME 4F4PA 4PUZA 4QP9A 5HTBA 2DYLA 4NW6A 5HLNA 1G8AA 4LOPA 4DE4A 3D5XA 4U0IA 1F3MC 2QQ7A 2HIWA 2I40A 3W10A 3UNJA 5IDNA 2PU8A 5FTGA 3U6IA 3DDPA 4FKJA 4LMUA 4CFFA 5K5NA 4WIHA 4G31A 2GFCA 3R73A 3W18A 3KMUA 4BCGA 1RQQA 4E4MA 5KMOA 2BILB 4HYHA 5G6VA 3U9CA 4CLIA 4RIXA 4R3CA 4XLVA 4EZ7A 3D94A 5EYKA 5H8BA 3R8MA 3BWJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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