4XG7A

Crystal structure of an inhibitor-bound syk
Total Genus 86

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
273
structure length
266
Chain Sequence
YLDRKLLTLEDKELGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEAPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of spleen tyrosine kinase in complex with novel inhibitors: structural insights for design of anticancer drugs
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
total genus 86
structure length 266
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-12-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4xg7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4xg7A01
4CYIA 3AD5A 1RE8A 3KF7A 4HZSA 4JDJA 3LFNA 1SMHA 4B6LA 5AFVA 3W32A 4ALUA 2UZEA 4N57A 4FG8A 3WZKA 3CGFA 2PY3A 1PXMA 3DS6A 5M56A 4FZDB 3EN9A 4EOJA 4UYNA 4WNKA 3V3VA 4FSWA 1STCE 3QQHA 1ZZLA 1ZAOA 4KIPA 5BVKA 4EH3A 2VNYA 3M42A 3MB7A 2UW4A 4KS7A 3AQVA 4X0MA 3VN9A 3ZS5A 2W1ZA 5E90A 2WMTA 4DTKA 5G1XA 2X9EA 4ENXA 2H96A 4WKQA 3QRUA 4JXFA 5FDXA 2VWVA 5DIAA 1UWJA 3QZGA 4KIQA 3ORTA 2X7FA 3FKOA 4C4GA 2BVAA 3ZC5A 2O8YA 4AZFA 3DDQA 1YI6A 5H2UA 4IB0A 1FQ1B 3TZ8A 4FIHA 4DT8A 3R9HA 3UO5A 2WMUA 2RIOA 2UZLA 3BBWA 3I7BA 5DLSA 1L3RE 2C5NA 4H1JA 4DH8A 4UXQA 3GOKA 3PPJA 4ZTMA 1DS5A 4M84A 5CNNA 1PXKA 4GVAA 3ZTXA 4I1ZA 5CAOA 4HVIA 3DV3A 4YC8A 4PF4A 3HLLA 4ACMA 3ORZA 1V0BA 4IWQA 4YJOA 5EQEA 4OW8A 2PVHA 4AWIA 3UYTA 3D2IA 5LCKA 3R04A 5C8KA 4EK3A 1P2AA 2WTIA 3WYXA 2W1CA 5AWMA 2OH0E 3VBQA 5CF5A 1R0PA 5CS6A 4YZBA 1OI9A 4BDHA 2XNGA 3E63A 2PMNX 3Q60A 3TV4A 3QLFA 3H30A 3IGGA 4DEDA 3FHRA 4JIKA 4BYJA 3U87A 3F7ZA 3HX4A 4XEYA 4U6RA 5EM6A 3VRZA 5IUGA 5EFQA 2IVVA 3QC9A 4C33A 3FSKA 3DZQA 3OW4A 1U5RA 3DAEA 2Z02A 4AXAA 1OECA 2IVSA 5HTCA 3VO3A 4H05A 1ZY4A 2F57A 3DNDA 4H58A 4EK4A 3PVUA 4CMOA 4V04A 4JG8A 4N6ZA 4WUNA 4U79A 4NTSA 3EQBA 3V5JA 1W84A 3I6WA 1R78A 2X7GA 2F7EE 2GPHA 3F82A 2V22A 4AOTA 2W1IA 2W5BA 3ULZA 4BICA 4KS8A 4XG9A 4CMUA 4D28A 2EVAA 3DXPA 5FP6A 3P23A 4JRNA 5DE2A 3CQEA 4EZ3A 4YNEA 2PPQA 3VS5A 3LLAA 5IQCA 4XOYA 1W0XC 3RK7A 3UO6A 4IMYA 2QO7A 3OUNB 3EYHA 5HGIA 5BUIA 1BL6A 4AW2A 3WBLA 5A6NA 5IA3A 4EWQA 3TKIA 2J5FA 4FIGA 4USEA 1WBOA 3NIEA 3A61A 4RJ5A 5K9IA 4L7SA 3ZRLA 2J2IB 3EH9A 3PXZA 4BCPA 3HUBA 3ODYX 3MESA 4ANNA 4PTEA 5AP7A 3WF6A 4M8TA 3UODA 4DGLC 4ITHA 2F2UA 4DGNA 3H9FA 2C6TA 3MI9A 3QF9A 4LOPA 4B8LA 4W8EA 3R7GA 3QQKA 4L46A 4FSMA 3U55A 5J9ZA 5KO1A 3FMMA 5HVKA 2X4ZA 5CVHA 3FMJA 4ANMA 5JGDA 4CG8A 3W2RA 4JBVA 4P4CA 2QOBA 3UIBA 3TM0A 3BHYA 4C4HA 3D5WA 3IW4A 2XK8A 3O51A 4JL9A 5LMKA 4X2KA 2YIYA 4U44A 5D9HA 3D7TB 3LCOA 1XH7A 2O65A 3I7CA 3VNTA 4KB8A 3G5DA 4O0UA 1H08A 4Q5EA 2C3JA 4F1OA 5J79A 4KKGA 5DFPA 1REJA 5IQHA 4TXCA 1RQQA 4CTCA 3PZEA 1CKPA 1WFCA 3UP7A 2I0YA 4C4IA 4R3CA 2DYLA 2FYSA 3A2CA 4LV8A 4EHVA 3JY0A 3F88A 4FT9A 2WZJA 4FZFB 4O1OA 4HCTA 2UZWE 2NP8A 3W55A 3EYGA 4FEXA 4DC2A 4YR8A 5J9YA 1Y8YA 3DKGA 4LQMA 5L3AA 5LQFA 4ZTNA 4O81A 3VF8A 4QD6A 3NCGA 4GYGA 1PKGA 3KKVA 4V01A 5BVDA 3KCFA 4DBXA 3L1SA 2YIQA 4TW9A 3FPQA 3RTPA 3ZBXA 5A14A 2W4KA 2X6EA 3FXWA 4ZIMA 3VUKA 4GKIA 3F2RA 4KUJA 3NYNA 4GVJA 4FIJA 3Q32A 3CGOA 3F3ZA 1Y6AA 3BBTB 3BI6A 2X1NA 5E8ZA 5ACBC 3SLSA 3KY2A 4IC7A 4I23A 4QYHA 4F64A 4FV2A 2C6IA 3OWJA 4FKWA 4AGUA 3F61A 3QUEA 4UWCA 1OUYA 4IZ5A 4L01A 4FOCA 3BQCA 1WBWA 2OICA 3UMWA 5CAQA 5DRBA 4IADA 4BGGA 3M1SA 5ICPA 5M07A 1VZOA 3P86A 4AFEA 1XH6A 1CSNA 3TNHA 1UA2A 3DB6A 4DE4A 3PYYA 4GJ2A 1YOLA 3G15A 2XH5A 4G3GA 5M53A 4GU9A 4QPAA 5KMJA 4OTWA 4S31A 3FY2A 3A7HA 3EFKA 1YQJA 5EI8A 4LGDA 2C6DA 2BTSA 2QOQA 3FXZA 3UC4A 1JKKA 3N51A 4RWLA 1J91A 4ZSJA 3GU8A 2PUIA 1M14A 4FV0A 3ZO2A 2BZIB 3TZ9A 4Z3VA 2J6MA 4TYGA 1YWRA 3IDCA 4IWOA 2IW9A 2J0JA 3EFJA 2E9PA 4C02A 2R3JA 2BZJA 3CJFA 3HV6A 2G9XA 1H27A 4XX9A 3I81A 3P78A 5AUZA 4TZRA 2BMCA 3BWFA 4WRSA 5AP4A 4F7LA 4B0GA 5KX8A 1H07A 4IANA 1J7IA 3V5PA 1MQ4A 3UNZA 3GCQA 2G1TA 4LMNA 1KV1A 3GQIA 4JAIA 2R3NA 3FZ1A 1GZKA 1CMKE 4G3FA 3WZUA 4RA4A 3C0HA 3TT0A 4F6UA 5ETAA 2YLFA 3V8SA 4I92A 2OIDA 3MY0A 4QP2A 2FH9A 2ITXA 5CI6A 4NYEA 3L8VA 3PXYA 2Y8OA 3FLYA 4UMPA 1H25A 3CBLA 4FIIA 3UZTA 3I0QA 4BN1A 4JVGA 2GFCA 1K9AA 4YZCA 1U54B 3B2TA 3OCSA 3ZBFA 4ERKA 3UBDA 3LIJA 5DRDA 4DG3E 5BVFA 3OG7A 5CX9A 4AX8A 3A7IA 3E7OA 4IDVA 3EQDA 2WKMA 2BKKA 1NVRA 5AV0A 2IW6A 1FVRA 4QP9A 3EQFA 3GXLA 1G8SA 4EKKA 1YXUA 4C59A 2X0GA 2W96B 4AZTA 1LP4A 4YUQA 2GMXA 2WFYA 3C7QA 5TE0A 3VS4A 2R4BA 3FLZA 3UQFA 1ZYLA 2UZBA 3L8XA 3P0MA 3OCGA 3ENMA 3ZLYA 4D2WA 3AC8A 5GZAA 4YZDA 1W8CA 4Y83A 4L6QA 3EQHA 2CDZA 2CGWA 4S2ZA 4D2PA 3CR0A 3QA8A 3FDNA 4PTGA 2A1AB 3HMPA 3QX2A 4FV1A 4K9YA 5EM8A 2JFLA 3CPBA 5GJDA 3WOWA 4BIEA 4H3QA 4KD1A 1OL1A 5E8XA 4MTAA 3UTOA 4EK6A 3W8QA 4GL9A 3NW6A 5E8WA 2HZIA 5AADA 4MAOA 4BCMA 2IZUA 4IZAA 4AN3A 5A4EA 3NW5A 4C3RA 4I6BA 4BDFA 4JBOA 4IVDA 1YHWA 3AT4A 3SD0A 4NIFB 3LJ0A 5HO8A 4QTEA 4I0SA 5AUTA 3AC5A 4FT7A 4AA5A 4C58A 5CEOA 4PL3A 4QMZA 2DWBA 3FLNC 4F9YA 3KMWA 3F3WA 4IHPA 4QMQA 3BE9A 4F9WA 3VS1A 2BROA 4IEBA 4UZDA 5KZIA 5JGAA 5K0XA 3POOA 5ANJA 1DI8A 2UZOA 5IZFA 4KRCA 2XVDA 4F0FA 1UNLA 1Q8WA 1IAHA 4K1BA 5AP0A 5AR5A 2R3FA 4B9DA 4XRLA 2WQBA 4GT3A 4IH8A 5HNIX 5CZHA 2OZAA 4AACA 4ZTRA 2WO6A 3VBWA 1XHAA 3II5A 3OXZA 3DAJA 2V7OA 1ZYSA 4FV8A 3NUUA 4ZJVA 4UALA 1ERKA 1MQBA 2XKEA 3VF9A 4UMRA 3VJNA 2Y9QA 4QYEA 3NUYA 2VO7A 2YAKA 3PXRA 2IVTA 1FPUA 3F9NA 4BWKA 3LM0A 4XG8A 4C7TA 2VTNA 3HL7A 3EQIA 4G2FA 2WTKB 1I44A 4E6CA 2QD9A 3I6UA 4X3FB 1Q8TA 3ZFXA 4F6WA 1M2QA 4FA2A 2GNJA 3PRFA 5ACKA 5CEPA 5DT0A 4YC3A 5KCVA 2F9GA 4YBJA 4C2WA 4FKVA 4FK6A 3QA0A 1ZYDA 2WTKC 1KE5A 3KGAA 3P7BA 4LM5A 4RJ6A 4X3FC 4ZS0A 1LEWA 4OBOA 4EZ5A 1MP8A 3RHKA 4ANOA 5HCYA 2R3IA 4J71A 1JWHA 3LMHA 4BCNA 5FTOA 2CN5A 2C0TA 3BHTA 5CALA 4ZTLA 4BB4A 1XH8A 4RIWA 2YITA 3DBEA 4RIOA 4EI4A 4ANBA 3G33A 3NMUF 1JSTA 5AUXA 3D2KA 2Z8CA 2W9FB 4AW0A 2JD5A 4JQEA 4N0SA 3AT2A 4WG4A 2HOGA 2QKRA 2UVZA 4PQNA 4R5SA 3AXWA 4EOKA 3UO4A 5HOAA 3SDJA 3PP1A 2AUHA 2PU8A 3KRXA 4UEUA 4B8MA 4ERWA 3BQRA 3FKLA 3ZONA 2JBOA 5IU2A 2I0EA 2RFEA 3NNUA 4Y85A 3SRVA 3D9VA 3SV0A 2XMYA 3IOKA 3A8WA 3D5UA 5CSHA 3VS2A 3NRMA 3ZXTA 4ASDA 5AP6A 3UOJA 3COHA 3OHTA 2VTTA 3KVWA 3TKHA 3ZRKA 4RFMA 5HTBA 5JQ5A 4GCJA 1Y91A 3NAYA 4FGBA 5AX3A 3CY3A 3DK3A 5T6KA 4JT3A 4YTIA 3ZZWA 4AT3A 3TXOA 2PVNA 3E5AA 3OWKA 4ARKA 5KKRC 3G6GA 4M69A 5HG9A 4HYUA 5E8TA 2XYUA 4BHZA 2O2UA 4RIXB 1B38A 3IONA 4WNOA 5KE0A 3UIMA 3WZDA 3R2BA 5DOSA 3FMKA 2JC6A 5AAGA 5IISA 2PULA 3NCZA 3OUKA 1K3AA 4TYEA 2FUMA 3EJ1A 4P90A 2BZHB 4NFNA 4F09A 2FO0A 2X4FA 4ZOGA 4F0IA 2R0IA 2GNFA 4LRJA 3Q9WA 3QD0A 5GIOE 3F69A 2WOUA 2XRWA 3LQ8A 3MDYA 4LUDA 4OAUC 2ONLA 5BUEA 3S1HA 2NRUA 5F94A 2CKQA 2CCHA 3ITZA 1JAMA 3NVKI 2BRMA 4OTRA 4FTAA 4DG0E 4AU8A 4YJNA 2Y7JA 4F7SA 2PZIA 2YN8A 1V0OA 4OAVB 2IJMA 2R3OA 4AFJA 5GHVA 3QL8A 3I4BA 2CGUA 4KBCA 4XG6A 4AT4A 4MKCA 5FG8A 4AS0A 4XV1A 4PL5A 3QFVA 5CVFA 2B53A 1JKSA 3LW0A 1KE8A 2YACA 3DU8A 1PXLA 3G2FA 4FX3A 4IAIA 4ACHA 3TJCA 1UNHA 3AD4A 3BYVA 3F7WA 4BCGA 3Q5ZA 2Y4PA 4ACCA 5M57A 5ANOA 3SW7A 1CKJA 4J98A 4OTPA 3NX8A 2VX0A 1YWVA 2UUEA 2VTOA 3DJ6A 3L8SA 4NTTA 5L8KA 4R78A 2BHHA 3R21A 3ZXZA 2HIWA 4M0ZA 2JIVA 2OJJA 3CXWA 4HYHA 5D1JA 4FOBA 3R8MA 3RP9A 2B4SB 3BCEA 5CSXA 5EOLA 5HE3A 3FZTA 4AOIA 5FTQA 1ZMVA 3FUPA 4WBBB 1S9IA 3LQ3A 3FZSA 1GZ8A 4K2RA 3TZ7A 2WB8A 1DAWA 5AP1A 5EW3A 3UYSA 1F3MC 3PIYA 4GV1A 3PG3A 5HU9A 2ESMA 3DBCA 3QQGA 1CM8A 1R1WA 3EN7A 3OCBA 3MVHA 4Z9LA 4CV9A 5IDPA 3DKCA 2XK6A 3LXPA 3VS7A 4MD7E 2ZMCA 4C4FA 4FKJA 4M69B 2PMIA 3NR9A 2RFSA 4GIHA 4FL3A 3R83A 4AAAA 3TUDA 4RVLA 5DA3A 4YC6A 3ZOSA 5HZNA 5CAVA 1EH4A 2R3KA 1WMKA 3DAKA 5HVYA 4EOQA 4JIAA 4QMYA 4DEIA 1Y6BA 2ITTA 4G34A 1WBTA 4L52A 5AM6A 3SXFA 4CKIA 3C51A 4DN5A 3MV5A 5ITAA 2C30A 3R71A 4PPAA 1JSUA 1U5QA 1UVRA 1H4LA 2DS1A 2IG7A 1F0QA 3G9NA 4R7HA 4FKTA 3TWJA 3GVUA 3I5ZA 4FYNA 3AC4A 4HGSA 4IWPA 4XH6A 5KHXA 2AYPA 3UVPA 3MVMA 4EBVA 3ZRMA 3SXRA 2JFMA 3UE4A 2BKZA 1XBBA 2PZPA 4LV5A 4AZVA 3QXOA 5IA2A 3QTUA 3L9LA 3RI1A 5AR8A 1L8TA 4FVQA 3CS9A 4GW8A 4DH7A 3CD3A 3MFTA 1BX6A 3Q9YA 2QU6A 5I0BA 3LVPA 4AA0A 4TY1A 1NW1A 3D15A 4FTRA 2LAVA 2VAGA 2PUPA 4EEVA 1YRPA 3DJ5A 3DA6A 4P7EA 1OIRA 5EG3A 3UNJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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