4XYFA

Crystal structure of c-met in complex with (s)-5-(8-fluoro-3-(1-(3-(2-methoxyethoxy)quinolin-6-yl)ethyl)-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-6-yl)-3-methylisoxazole
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
295
structure length
290
Chain Sequence
HIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of Potent and Selective 8-Fluorotriazolopyridine c-Met Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
total genus 93
structure length 290
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4xyfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4xyfA01
1TQMA 4CTCA 4FKVA 4AN2A 2X2MA 5HE1A 4OT5A 3BQRA 3A7GA 4X2KA 3O23A 3EN7A 3A2CA 3IG7A 2QO7A 2JDVA 4RWJA 2VD5A 3Q04A 3QCSA 3TDWA 1GIIA 4Z55A 2QVSE 3D0EA 2X81A 1QCFA 1PJKA 4KIPA 3ZHPC 4BCKA 4IJPA 2VWVA 2YHVA 4QP8A 4MBJA 3DBCA 5DOSA 4BWKA 5HG8A 3WIGA 3I0OA 3HEGA 3QAME 5FRIA 3ZS5A 3H9FA 4BBEA 4FIGA 3KF4A 3NW5A 4BTJA 1Q62A 3BU5A 4F1MA 2LAVA 3ZO2A 4DFLA 1H0VA 4TY1A 4AS0A 3MA3A 4GYIA 4BDIA 5E8ZA 3O7LD 2PE1A 4CNHA 3G90X 2WZJA 4U79A 3QTWA 4AX8A 5BUEA 5CQWA 3R9NA 1H01A 2ZB0A 2XIYA 3QYZA 4BHZA 5L6OA 3OXZA 2FH9A 4TN6A 5AP3A 4DFNA 4AAAA 3QKKA 4KS7A 4XG4A 4D2SA 4DFYA 1KUTA 5E8WA 5M4UA 1JAMA 2OFVA 5J1VA 2OG8A 3LXKA 2OXXA 3TKIA 2J0LA 3UPXA 3PLAE 4XJ0A 3BU3A 3FYJX 3R8UA 4FZFB 2HWPA 4LQMA 5AP1A 3R71A 3P08A 1M52A 2YLFA 5BVEA 2VTMA 5E8SA 2QO2A 5IF1A 2J5FA 2QOBA 3U87A 4RA5A 2HZ4A 2O65A 4NW5A 4KSPA 4H1JA 4XOZA 4Y95A 4B8LA 4C0TA 5I9YA 4JNWA 2XK7A 3FXWA 3OT8A 1Q61A 2G9XA 1STCE 4K6ZA 5AR8A 3AC5A 1ZRZA 3PA5A 4D1ZA 4M67A 1IAJA 3K54A 1ZAOA 2VGOA 3WE4A 4NFMA 1OUYA 4HVIA 2C6KA 3W1FA 3LPBA 4F0IA 2VTLA 3GU5A 4DEBA 1ERKA 3JXWA 1Y57A 2WMBA 3KC3A 3RWPA 4WNOA 4ZSJA 5JSMA 5IQCA 5M08A 3DCVA 3ERKA 4FSQA 3QUDA 3VBTA 5F4NA 4YJQA 1WBTA 4JQEA 3BEGA 3E8DA 3QWJA 4JIKA 3WARA 2Y6MA 2CGXA 3FZOA 4YO6A 4C7TA 4GH2A 4UALA 3WF5A 5LJJA 4CKJA 1NVQA 4AW0A 3QQKA 2UZEA 4JBVA 3R02A 2XM8A 4ITHA 4RC2A 3LHJA 4ZLZA 3F66A 3QZFA 3NSZA 4JDKA 2QG5A 4YURA 2DUVA 3GENA 5HIBA 3ORZA 4EBVA 5HIEA 2PUIA 3ORPA 2UZNA 4G3FA 3F5UA 2QOHA 4D4RA 2VWUA 4UZDA 4EHGA 4WBBB 1UV5A 1KV2A 3PXYA 3QYWA 3KVXA 4MXYA 4I5HA 2W5AA 3V5QA 3M2WA 2R3JA 3HA8A 3RP9A 4KBCA 3VC4A 4TWNA 2W96B 3PZEA 5EOLA 4HGSA 3BRBA 4ZSAA 2YA9A 1PYXA 3TZ9A 2W4JA 2GNGA 3WF8A 4XBRA 4BCJA 4EZ7A 5J5SA 4WUNA 2IZTA 5CI6A 4YR8A 1ZZ2A 4XG6A 4RLLA 3BEAA 2GS2A 3MIYA 3NAYA 2I1MA 2YM6A 4AXAA 5IQIA 3ID6C 1FPUA 5CU0A 4O0XA 4RMZA 4O81A 2WEVA 4OTWA 4FK3A 3VQHA 5BUJA 3ZOSA 4RGJA 3K5VA 5IQEA 2PYWA 1Y8YA 2CLQA 4BICA 4PP7A 4XP0A 3E3PA 3RHXA 4EH6A 4WRSA 3U51A 4DFXE 1G8AA 4YLLA 4DITA 3A7JA 4G6NA 4E7WA 2PZYA 2C6MA 4PMTA 5FGKA 4R77A 4CXAA 4YHFA 2J0JA 3LFQA 4BCMA 4V04A 3MVJA 3NNVA 1J1BA 1ZXEA 3COKA 4NT4A 4QPAA 3D2IA 4AP7A 4NEUA 5IQFA 1PMUA 4EOSA 4O0YA 5ANOA 4DEIA 2XMYA 2PVKA 4Z3VA 2ESMA 3VJOA 4GFMA 4PDPA 3NNUA 3F9NA 4RX8A 2IW8A 4EK4A 4I92A 3QKMA 2EU9A 3A8WA 4IIRA 4BI2A 3E7VA 4V05A 2XNEA 4F0FA 4D4YA 4EQUA 4ALUA 4LV5A 2PZ5A 3QCQA 4YUQA 2IG7A 3I6WA 1DI9A 2OF4A 4P5QA 2C6EA 4CT2A 4YTHA 3ZRLA 3NNWA 5EYKA 1JSTA 3MFRA 5TKDA 2WTKC 4EQCA 2WMVA 3C4CA 5FLFA 4CFVA 3UYSA 3QU0A 1Y6BA 2PZRA 3ULIA 4MQ1A 4UXQA 4DAWA 4FGRA 3FKOA 4EC9A 3ZFXA 1WVYA 3LZBA 2R3FA 4M15A 3Q9YA 5L8JA 3V6SA 2BZIB 3LFFA 4UWYA 4H05A 4O6LA 3ALNA 3D5WA 4PL4A 3QRUA 3CXWA 4A9TA 3F3ZA 3D7ZA 4D58A 5IU2A 3BBWA 3CEKA 4EJ7A 4YSMA 3P0MA 3FHRA 4P4CA 5E1EA 3RPYA 4C62A 4IAIA 1RJBA 4ZP5A 5LMAA 2QG7A 2PVJA 3DBEA 2H8HA 3U4WA 1Q8ZA 4J97A 2W1CA 2OO8X 4LRJA 5D9HA 5EQPA 5FBNC 4WKQA 3E92A 4YZCA 3PPJA 5FP5A 4HGTA 2QR8A 4C59A 4UN0C 5E4HA 1G3NA 2WQNA 3OUNB 3V5LA 3ET7A 3Q5ZA 4ONAA 3V6RA 1UU7A 2JD5A 4ZIMA 2VX3A 4RX9A 5TO8A 4GFOA 1GOLA 3L9NA 3QZGA 3LLAA 3N4UA 4HVSA 2QU5A 3DKCA 3E64A 1H1SA 3UIUA 4CLIA 3Q2MA 1KE7A 3TIZA 1FVTA 2YFXA 4J1RA 4N0SA 3AGLA 2WNTA 4MF1A 3KXZA 4YNOA 2BVAA 2C5VA 3R63A 2YLEA 4ITIA 4D28A 3L9MA 3OCTA 5FM2A 4DLIA 4BTMA 2V7OA 4GW8A 3ZLSA 4BCOA 2PZPA 3GU7A 5CT7A 3FJQE 4OTHA 3EQHA 2X7GA 5FWKK 4F9BA 3WBLA 4DHFA 2FUMA 5EM5A 3ZEWA 3DDQA 3QC4A 4EH5A 5HHWA 4HCVA 5FDPA 4C4FA 4MBLA 3E7OA 3HUCA 1PXLA 5JZNA 2AYPA 4BKZA 3OW3A 4X3FB 3UIBA 4FA2A 2IN6A 4FV2A 4JJRA 5KMJA 1HCLA 1MRYA 1B39A 2GDOA 3V51A 3CR0A 3QD3A 5JGAA 1CDKA 3ZRKA 3RCJA 3MTFA 3DAKA 3EN9A 3G15A 3RVGA 1DAYA 5CZIA 1R0PA 3DNDA 3VBWA 4EYJA 3HRFA 4FT3A 3G0FA 4BB4A 4QQCA 3SDJA 4GIIA 2C68A 2UW0A 2B4SB 2Y8OA 4O7WA 2Q83A 5M09A 3UOHA 4YU2A 3LLTA 5E91A 1J7LA 4DF3A 4BDAA 1FINA 4FYOA 4U42A 4FV9A 4G6OA 4R5YA 4KD1A 4YJTA 1CM8A 1TQIA 1W98A 3U9NA 3QHWA 5J1WA 4PTCA 4QTCA 4FR4A 3OXIA 4GFGA 4X3FA 1E1VA 1SMHA 1UU8A 4RZVA 2YIYA 5AEPA 3NYVA 2RF9A 3W2QA 3VULA 2WOTA 3A8XA 3LFBA 2W1EA 5C01A 3D14A 4RIOA 4PNKA 2W1GA 2ZV2A 3R30A 4FKJA 4LL5A 3U9CA 3MY0A 3P9JA 2I0EA 3C4EA 3QRIA 4FZ6A 5D7VA 3ORTA 2OZAB 2R64A 1F3MC 5CAUA 4P5ZA 2QQ7A 5D12A 3RK7A 2WPAA 3OBGA 4DCAA 3IDBA 4FC0A 4TNDA 3Q6UA 2W1FA 3NX8A 4IM3A 4WOVA 2UVZA 5IQBA 1P14A 4ZK5A 3FDNA 4EOMA 5K5NA 1AGWA 4IW0A 2HY81 2OJJA 3E3BX 2WIHA 2XCKA 3VRYA 4CV9A 4ZY5A 5IH4A 4F6WA 4MAOA 4ANMA 3PRFA 1KOBA 2RG5A 2ZV7A 3Q4CA 2XZSA 5AM7A 2YM4A 4NL0A 4KRCA 5HVJA 4EORA 5KMLA 2VWYA 4O7RA 3CS9A 1AQ1A 3VF8A 3DQWA 3FL5A 3HL7A 4ZXTA 2IO6A 3FLWA 5CEQA 4FZ7A 3FMLA 4C02A 5CALA 5FM3A 5HOAA 3RTPA 2W9FB 2QONA 4IZYA 4WT6A 2XEYA 2VTNA 4HYIA 4D4VA 2B54A 4B99A 4X2GA 4YJPA 3U6JA 4E3CA 4WHZA 3MH0A 3NPCA 4XMOA 2OKRA 3VUKA 5CVHA 3RAWA 3U54A 3EYGA 5M07A 4ZLOA 1PXKA 3EJ1A 4IACA 5LARA 1OUKA 4ALVA 2DYLA 3CPBA 3CPCA 5LXMA 3SAYA 3LJ1A 2X7FA 4AZSA 5EDPA 1H0WA 5DMZA 5LOHA 3HP5A 2PULA 2BTRA 4K18A 5ITAA 4MEDA 1OB3A 3R7GA 3IGGA 3AG9A 4BZDA 4JT3A 2BZKB 3K2LA 1BL7A 3E62A 5G1XA 3TIYA 5A54A 5ACBC 4IZAA 3L1SA 3ZXZA 5BQ0A 1QPCA 4PWNA 5DPVA 4MF0A 4QYGA 4RFZA 3EQDA 3PPKA 2W5BA 4HPUE 3UE4A 4CFXA 5IG1A 3EOCA 3MFUA 4IB0A 1GZ8A 3PVGA 3JY9A 3P23A 3TNHA 3Q52A 1BX6A 5KMIA 5EKOA 4XLIA 4GCJA 2UZUE 3DXQA 4L00A 3W8QA 1JLUE 1UNLA 3S3IA 4QQJA 4E6DA 4Q9SA 5IA1A 2BRMA 4BIDA 4OTQA 1BMKA 3UTOA 4MVFA 3FHIA 4BGHA 3UP2A 3OWJA 2C0TA 3T8OA 2C4GA 3GQIA 3RM6A 2ZM3A 2CGVA 1YWVA 2OIDA 4Y5QA 4OUCA 4E4MA 3UQCA 4UMPA 4EQMA 1XH4A 1NVRA 4MXZA 2RFEA 1Q99A 4QMVA 3WZDA 5IQHA 3ZONA 2Z7LA 3NEWA 4FICA 1G8SA 2G2IA 2PY3A 3QQJA 3F5PA 3FAAA 3I5NA 3UMWA 2J6MA 4EBWA 2GFCA 3U8WA 4ZZOA 2ITQA 1CSNA 3MH1A 3TCPA 1LR4A 3BYVA 3O2MA 3B8QA 1FMOE 2B55A 2JAVA 3PPZA 3FI2A 4W4WA 3RGFA 3COHA 2HENA 3TTJA 3WF6A 4RA4A 3DK7A 4CEGA 5IDPA 2QOCA 5HTCA 5KE0A 5J79A 3W2RA 2XIKA 4BTFA 4L7SA 3O8PA 1YI3A 3KQ7A 4PX6A 5F95A 4O7NA 3F69A 2W5HA 5M53A 1ZYDA 3L8SA 5C9CA 2IVVA 4QMUA 1MUOA 1ZMWA 3OY1A 4M66A 4BGGA 3K3IA 4EZ5A 5E8XA 5J87A 2HXLA 3DV3A 2UZVA 3MFTA 2CN5A 4G5JA 4AZTA 2IPXA 5EW3A 4A9UA 4F99A 5EM6A 4D9UA 3V5WA 3ZLYA 4ANNA 4FZDB 2XNPA 3CP9A 3F5XA 5LMBA 5HE3A 3KB7A 2C3KA 1JSVA 2XP2A 3P7BA 1Q5KA 1Q8WA 1TVOA 3HVCA 3QTRA 3WYYA 4E26A 4YC6A 4EK3A 3R7EA 1OKVA 1P5EA 1XHAA 4FKGA 4HJOA 1IR3A 3GBZA 5FUTA 3PSDA 5T68A 2FO0A 3WI6A 1FOTA 3CY2A 2WMUA 3IPHA 4Y83A 4B9DA 4WIHA 2O3PA 3QQHA 4C58A 3U55A 4OAVB 4YZNA 1OPKA 2RFDA 4FUYA 5L6WL 4DTBA 1O6YA 2ONLC 4TW9A 5CF6A 5HKMA 3V5JA 4AFJA 4QRCA 4D9TA 3EL8A 4FT5A 2BR1A 2WHBA 1GIJA 3Q32A 4ACMA 4OTIA 4FTAA 3HDMA 3OUKA 3O0GA 4EH4A 3MB7A 5BVOA 4O22A 3NVMB 2I0YA 4LMUA 4N57A 2JLDA 2WU6A 2OI4X 3OOGA 3ANQA 4EI4A 3TDVA 3VS0A 2VO3A 4FIFA 1PXIA 4LL0A 1Z57A 3ORNA 1IAHA 3PE1A 1XH9A 4QMLA 4YC8A 2VTQA 4WA9A 2YJSA 5KCVA 3G6HA 4ZSGA 4ACHA 1OPJA 5E1SA 3A61A 4PL5A 3C4WA 3UZPA 3KXHA 2ITUA 4AW5A 3QQLA 4JXFA 4R1VA 3KY2A 5HG9A 2ITYA 2QOOA 3VS1A 5J7BA 3DKOA 1OL6A 4QMQA 2GMXA 2QD9A 3OFMA 4BCQA 3DJ6A 3WF7A 4CG8A 4LUDA 4N4SA 2FB8A 3ODZX 1I44A 4O0UA 4TYEA 5C8MA 4YZBA 2JIVA 3SXSA 5CF5A 4R78A 2LGCA 4W4YA 1YVJA 5I4NA 3QRKA 5KZ0A 2JITA 2UZWE 2UW5A 2XKDA 2EVAA 5B2KA 2QODA 2NRUA 4XG3A 3R1QA 5AAEA 4FE2A 2XCHA 3EMGA 5IA5A 4FI1A 3PDTA 3E88A 3Q4TA 2C6OA 3EQRA 4FODA 4L46A 2Y4PA 4AE6A 3EN5A 3EFJA 2B0QA 3RZFA 5DE2A 1R1WA 2XIXA 4WNPA 4Y72A 4LYNA 4DCEA 4CLJA 3A99A 3KL8A 4YJVA 5L2QA 2JDRA 2YWVA 3NZ0A 4IVBA 1OPLA 1ZY4A 2I7QA 1FGKA 1U46A 2CGUA 5K4IA 4FTQA 2JFMA 3FQSA 3G33A 5CX9A 4XV2A 5AIRA 4DH7A 2R3MA 5IUHA 3HDNA 5LCKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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