4YJQA

Syk kinase domain in complex with inhibitor gtc000224
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
270
structure length
264
Chain Sequence
YLDRKLLTLEDKELGGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery of GSK143, a highly potent, selective and orally efficacious spleen tyrosine kinase inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 264
sequence length 270
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yjqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yjqA01
5JKGA 4DT8A 3K5UA 4UMQA 2YDJA 3TUCA 3TIYA 5HO6A 4DLJA 2R0UA 2IPXA 2BALA 2C6TA 2XIRA 4FMQA 2F7EE 4MNFA 4YO4A 2JDOA 1H0WA 2G2FA 3EQDA 2IZUA 3CP9A 5GJGA 2OGVA 4ERWA 4F7LA 3NX8A 2IVUA 1UV5A 4FTOA 5E7RA 5I9UA 5IQFA 4DEHA 3B8QA 5M4CA 4KIKA 4O0TA 4I5MA 3D94A 4CMTA 5JRQA 2HOGA 2OJFE 3WIGA 3CPCA 1M7NA 4QMMA 4DBXA 4AZTA 3G51A 4ITHA 4D2TA 1P4FA 4KIKB 3TKIA 3BI6A 1J7IA 3P7AA 3QGYA 1J91A 3R7EA 2GNHA 4HYSA 3ZZWA 3UO4A 2VTIA 1ZYLA 2UW9A 1PYXA 4C4JA 2JKMA 3LPBA 1NVSA 3LAUA 3VWAA 2ZV9A 3NW7A 4FL3A 4AZVA 3U87A 1RW8A 2O64A 1A9UA 2VGOA 3I4BA 4PDPA 4RJ4A 4UEUA 1OI9A 4WNMA 5ANDA 3RAHA 3WARA 2VNWA 4DG0E 1IAHA 5HTIA 3U54A 2PYWA 5BVFA 4BZNA 5HG7A 3QA0A 1YW2A 4O7TA 4Y85A 3RWQA 5A14A 3VBQA 4IX5A 1SNXA 2XYUA 5CU3A 4FEWA 3DT1A 4L68A 3VHEA 1STCE 4WG4A 4FKJA 4Y73A 5LVOA 3OY3A 5IEXA 1PXNA 2ZM4A 4JDIA 3FMLA 4O0SA 5E92A 4I0TA 2J0LA 4QPAA 3AOXA 4D2RA 2PK9A 3I79A 4LG4A 4QQ5A 5KMKA 2EB2A 3U6JA 5LVPA 4AOJA 4QQCA 5IKWA 4BCHA 4C02A 4AOIA 4X2JA 3IDCA 5AM6A 4A4OA 5KMNA 4GVAA 2VV9A 3KULA 2WOTA 2YABA 4IZ7A 1GZNA 2OIBA 4GUEA 4R77A 3ORZA 4CFWA 2PZPA 4ZZNA 1PXKA 4BI2A 3TUDA 3JR1A 4F63A 4IX4A 5ANIA 5TKDA 5ACBC 3QC4A 2YM5A 3KULB 3OT3A 3ORLA 3O8UA 3HRFA 4JG8A 3ZLSA 4D0XA 5IPJA 3WYXA 4H3PA 5AP5A 4BCPA 2QOHA 3R63A 4O1PA 4WUNA 2ITPA 5FLFA 1IA9A 1SVHA 4G34A 2XCHA 2E9OA 4ALWA 1JAMA 3FXXA 4J8NA 2XEYA 4NH1A 3ZBFA 4IB1A 5ANJA 3BX5A 4CZYB 4E4LA 2BRHA 4C0TA 5J5TA 3FMDA 2QONA 2X9FA 3F69A 2C0TA 3QCSA 2IO6A 2J2IB 3P1AA 4G3FA 4WKQA 3RALA 4DA5A 3PE1A 2VO0A 1QPJA 1W83A 3DKCA 5IQDA 3IONA 5DLSA 5A3XA 1RQQA 4GJ3A 5AP4A 1M14A 5BX0A 4BC6A 1OECA 4ACDA 3NW5A 4EOSA 4U8ZA 4MF1A 4TL0A 2I1MA 3G0EA 4CZTA 4HVSA 2YLFA 3I5NA 3UODA 3WIKA 4EJNA 3UO5A 2B1PA 2R3JA 5CS6A 3WF9A 4BDDA 3V5LA 1FBNA 4YO6A 4C4IA 3RCDA 4MD7E 1RE8A 5J95A 3Q2MA 4FTQA 3ZLXA 3SC1A 3QRUA 3SW7A 5EW9A 2C5VA 3R8PA 3FXZA 3TNQB 2J5EA 3ORNA 4PTCA 4UMRA 4ZJVA 5IZFA 4YLLA 3W8QA 1G3NA 3O8PA 3VJNA 5M4FA 2YEXA 5HG5A 4L53A 3BU3A 4QYYA 4TRLA 5AFVA 3UIMA 3OT8A 3ALNA 4YLKA 3ZS5A 3QYWA 2C5NA 2UW5A 2W7XA 5BUIA 2I0EA 3AMAA 5LWNA 2Z02A 5HLWA 4CKRA 4AFEA 3KMWA 3SXRA 2HXLA 4G9RA 2ZB0A 4BB4A 2WMUA 2GCDA 3NSZA 4IVDA 3VHKA 1M2QA 4ANOA 4C38A 4U9AA 4XG9A 2IW9A 3SV0A 3VULA 1QPDA 2CCHA 2XNMA 1I44A 2FB8A 2ITOA 2BRBA 3BYSA 4S34A 4USEA 3QQKA 1S9JA 1WCCA 4WRSA 5DR6A 4L46A 4NU1A 4AW5A 2IWIA 2W1GA 2VTJA 1R39A 3B2TA 4MQ2A 3KEXA 2XK4A 1LEZA 4I94A 4CFXA 3LMGA 3BYUA 1H1WA 4JNWA 4Y5HA 5F94A 3Q9YA 1IG1A 4RT7A 1WBWA 1E1VA 1OL2A 2OJJA 3OBJA 5E4HA 4E5AX 5LVLA 4RVMA 4AGWA 3D0EA 3CC6A 4GSBA 4KKGA 3FMHA 5ETCA 5HICA 2B54A 2J0JA 5GZAA 4NL0A 2V62A 3E7OA 4HCTA 3SVVA 4PL5A 4BTKA 2YERA 2BDJA 3LJ2A 3VS7A 2HENA 3II5A 3VS6A 4F70A 2B53A 3OTUA 3ORPA 5H9BA 5B0XA 4L00A 4IE9A 3KXMA 4DG2E 3BBTB 5HNIX 4TYEA 3EZRA 5L2QA 1OIUA 3EIDA 4AZEA 4JDKA 4BDKA 5IDPA 3FPMA 4UMTA 2VX0A 4JT3A 4CLJA 3K2LA 4OTRA 5GJDA 5EHYA 3RNYA 4L6QA 4IX3A 4ZSLA 1TQIA 3F5XA 2WZJA 3E5AA 4ZSEA 4WOVA 4QP4A 5H8BA 4DFXE 3EQFA 5DT3A 4OT6A 3G6GA 2UW7A 3HRBA 2BAJA 2EXEA 3FI4A 4FSNA 3LLAA 1Q61A 2REIA 4AN2A 4IW0A 3WZEA 4EK4A 3F3UA 3IOKA 3KN5A 4EI4A 1YXTA 3ZC6A 1FQ1B 1KE9A 4R7BA 1WBSA 3LKMA 3RNIA 2ZV2A 2GMXA 4XLIA 4Z7HA 3KRWA 5KCVA 1H25A 4DCAA 4YC3A 4K8AA 1FMKA 1PW2A 4FZAB 5HIDA 1MP8A 2OICA 3AG9A 4LYNA 1O9UA 4XG3A 5DR9A 5C26A 2PE2A 1H0VA 1PHKA 3IECA 3AMYA 3QWJA 3TZMA 3F88A 3MJ2A 4TXCA 5D9HA 3FEGA 4QTAA 3EQPA 5CQUA 3R8UA 1Z9XA 4RFYA 3RP9A 4DFNA 1VZOA 4YU2A 4XP0A 4GH2A 5HBHA 3EN6A 3QCQA 1LR4A 4GK3A 3QLGA 1XKKA 4LMNA 5FBOA 3VS4A 3BE9A 4AN3A 4R5YA 2DQ7X 4R7HA 5M56A 1IA8A 4O7VA 3LHJA 4TY1A 5JFWA 3BHTA 5DI1A 4C36A 4IVBA 4RX7A 4FTJA 2BKKA 3NUYA 5I0BA 1OUYA 3A7IA 3QTSA 4KBCA 4F64A 2WTKB 4G17A 2IVVA 3FBVA 2J0KA 4YZDA 3MA6A 4FV7A 4FV2A 4ZTLA 4MXOA 2OFUA 4LQMA 5LWMA 4JIAA 2WU7A 4MXYA 3A4OX 4UZDA 2RSVA 3RK9A 4GKIA 1U59A 5E91A 3ZXZA 4B8MA 2QHNA 3GCPA 1BYGA 5I9ZA 4DTAA 3DFCB 5HQ0A 4JDJA 5HOAA 1Z57A 2QR7A 5FM3A 5EQEA 4BCJA 1OPLA 4PPCA 5H8GA 4TPTA 5EK7A 4FTIA 4NW6A 5CU4A 5DHJA 5EM8A 4DGMA 4IXPA 3PJ2A 4XMOA 4AXAA 2X4FA 4G6OA 4APCA 4I0SA 1JKSA 4OUCA 2ZB1A 4QYFA 2BFYA 5DGZA 2BFXA 2FSMX 2XBAA 4U3ZA 5K3YA 2CLQA 3W2RA 3CD8A 2YLEA 2JKOA 4HPTE 3U9CA 3Q4UA 4FSTA 4BZOA 4R7IA 3EYHA 2HW7A 3EFKA 3EZVA 4AACA 3DB6A 4NZWB 4D2WA 4F9WA 2XIYA 2LGCA 2VX3A 2YM8A 4MBLA 4GS6A 1VYZA 3QKKA 4XCUA 3NYVA 3KXHA 3R8ZA 3MB6A 3CIKA 4YURA 4ZMEA 3VS5A 2QC6A 4F0IA 2QKRA 3OHTA 1H26A 3P79A 1WVWA 4FNWA 4YZ9A 5TT7A 5AUZA 4BGGA 1GIJA 3IGOA 3OP5A 4YC6A 4FG7A 4G2FA 4PL3A 3E8NA 2JLDA 3R7VA 3M42A 2YIYA 4BL1A 4V0GA 2WMWA 4IZYA 5M44A 4O84A 3UVQA 3RAKA 4O0VA 2F57A 3DFAA 4XOYA 3JY0A 4CD0A 3RVGA 1SM2A 4KIQA 3HV6A 4V0GB 2R3RA 5C8KA 2Z7QA 5KHWA 3F7ZA 3PWYA 1WMKA 3FMJA 5CT7A 4GT3A 3QALE 3TKUA 3C4XA 3TZ8A 4R5SA 4YUQA 3QTWA 1BMKA 2XKEA 3IW6A 4EUUA 3O8TA 4JBOA 4CSVA 3HA8A 5B2LA 3FV8A 3PXQA 4IFGA 2I7QA 4D4YA 3H10A 1GY3A 3Q4CA 2A0CX 3BCEA 4OBOA 4FNXA 3R83A 4DH8A 4BKYA 5BQ0A 3Q6WA 4AQCA 4YLJA 5DA3A 5AP1A 3A8WA 3QRIA 5KMLA 4NFNA 2XP2A 3NPCA 3QTRA 5CEOA 3H9FA 3BPRA 2W5HA 1TQPA 4U43A 3MWUA 3LCSA 4I5PA 3DA6A 2WMVA 3NEWA 4J1RA 1YWNA 5CAOA 3PZHA 3FLYA 1OM1A 4FTTA 3ZM9A 2E9PA 3NUPA 4UN0C 4OAVB 2BZIB 4JOAA 3PXRA 1YI4A 3HVCA 3TCPA 3HP5A 2W06A 4A07A 5DBXA 4IIRA 1MQBA 3CR0A 3NUNA 2XK9A 2J51A 4RIWA 1M52A 1XH6A 5GNKA 3ZEPA 1OKZA 2C5YA 5HX8A 1ZOGA 2C4GA 4U45A 4DFUA 4PX6A 4I22A 3A8XA 2ZMDA 3DK3A 5EW3A 2YAKA 3SQQA 3ZEWA 4AGUA 2SRCA 4TWPA 5JSMA 5KX8A 4RIWB 5EKNA 3NIEA 2X2MA 4IB3A 3Q04A 5IISA 1JBPE 1YOMA 4HZRA 3SXFA 3L9MA 4A9RA 3HMIA 2ZV8A 2VWXA 4BHNA 3TNWA 3EN5A 5HHWA 4QP3A 3QQUA 4AW1A 3PJ1A 4FTNA 4UWCA 3DJ7A 5J1WA 3UPXA 1DI8A 3JYAA 2PPQA 3TV6A 3H0ZA 1X8BA 3OVVA 4IWOA 5EQPA 5IA3A 4FZDB 4W9WA 4U0IA 2FSLX 2ERZE 3EN7A 3H30A 5AUXA 2HIWA 2CDZA 3A61A 5E8XA 2A4LA 2GNFA 2QOLA 3RHKA 3C4EA 4E4MA 3QQLA 1VEBA 4RA4A 5JT2A 4IAZA 4AW0A 4FKQA 2YM7A 3RPOA 3ZO1A 3IGGA 4J99A 2VGPA 1YDTE 5I9VA 4FT7A 5K5NA 4C59A 4FKOA 2C1BA 2OFVA 1QMZA 2UZNA 2ETRA 4FK3A 3RI1A 1QPEA 2KTYA 3KN6A 1NT2A 3LZBA 2XB7A 4RA5A 4C34A 2PWLA 3E63A 4S30A 4XEYA 3KL8A 2FO0A 3D2IA 2WQOA 3OW4A 1KWPA 3QL8A 4FX3A 4YJUA 2CGXA 3U6IA 3E64A 2BIKB 4DTKA 3LFAA 3ZDUA 3E8CA 5D7AA 1G8AA 4JI9A 4BKJA 3QUPA 3SRVA 4DTBA 4JG6A 5AV4A 4F99A 4BIEA 3D83A 4JIKA 3WF6A 4ANLA 3EJ1A 3NGAA 4B4LA 4DG3E 4DF3A 3SRVB 3LQ5A 1ZZLA 2W05A 5EYKA 3VRZA 1UVRA 4EH3A 2ITZA 3Q2JA 3KVXA 5DYJA 1FPUA 3UMXA 5A4CA 1H1SA 3QFVA 4F6SA 4KS7A 5C8MA 4J71A 4F9CA 3UBDA 1FVVA 4AW2A 4B0GA 3EH9A 2OW3A 2C6DA 4QMTA 2DWBA 3DLSA 3UZPA 5J1VA 3RCJA 3FZOA 4ACHA 4C2WA 4BDGA 3VUMA 4ZY6A 3Q5ZA 3TZ7A 3U9NA 4D2VA 3NDMA 3Q9ZA 5CF6A 3OXZA 3ZUTA 4LL0A 1OKWA 3KREA 4FT3A 3MH0A 3KXXA 4QMNA 2XNGA 4IFCA 3G6HA 4JDHA 3AT4A 4QT1A 1IR3A 4R78A 2B4SB 4WA9A 3GB2A 2W99B 3M11A 3W2CA 1PXLA 1WZYA 3VUKA 5ANKA 5DIAA 1T46A 3OS3A 4H36A 3EFLA 1GOLA 1CTPE 2JBOA 4N0SA 2P3GX 3NCZA 3NWWA 3PA5A 3DPKA 2XK8A 3NS9A 4HCUA 4L43A 1P5EA 4XRJA 4F9AA 3F5PA 4XG8A 3GCQA 2O2UA 1IEPA 5BVKA 2BROA 4I0RA 4UXLA 2UZWE 5TOZA 3V5TA 5DRBA 3HEGA 3WZKA 2O65A 3TI1A 4AT4A 1YXSA 4FV1A 3FKNA 4AE6A 2B7AA 3PSBA 5FUTA 4QOXA 4JS8A 4AP7A 4NJ3A 4ANBA 1OGUA 2YZLA 2HELA 4JAIA 4ZSJA 5L6WL 3BRBA 1P14A 4M0ZA 4S31A 5CYIA 3QBNA 3LIJA 2HZ4A 4EOQA 2F7ZE 5CY3A 5LOHA 3LFCA 5E8ZA 3MY5A 4M66A 2GHGA 3SX9A 4HGTA 5GINE 2OJIA 2GTMA 4O7NA 3C7QA 3QGWA 5KUPA 4K11A 4IMYA 5DE2A 4CYJA 3UYSA 3IDPA 4NM0A 5E8WA 1CM8A 2ITWA 4EORA 4EQCA 5H2UA 1Q3WA 3R0TA 3EQCA 3R7UA 5BPYA 4A9TA 2XKCA 2IG7A 2YJSA 2XJ0A 5BVDA 2ITNA 1O6LA 4X21A 5IQBA 2GU8A 1W98A 3GFWA 4LUEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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