4YLJA

Crystal structure of dyrk1a in complex with 10-iodo-substituted 11h-indolo[3,2-c]quinoline-6-carboxylic acid inhibitor 5j
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
347
structure length
346
Chain Sequence
VYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 10-Iodo-11H-indolo[3,2-c]quinoline-6-carboxylic Acids Are Selective Inhibitors of DYRK1A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 346
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yljA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yljA01
4HOKA 2I7QA 4B4LA 5CAPA 3ETAA 2I0YA 3NEWA 3NW6A 4L9IA 4F65A 4GFMA 5BVKA 2GQSA 5AA8A 4I94A 1XWSA 2GTNA 1XHAA 2W5AA 3KN5A 4J8MA 3FZPA 4M0YA 3NW5A 3NNUA 4FZAB 5BVNA 5L3AA 5M44A 5HTBA 1OMWA 5GJGA 3RPOA 3NWWA 3E64A 4JBPA 5HNGA 5GHVA 4DEGA 2JDVA 5M08A 1JSVA 1TQIA 2JC6A 2X6EA 1Y6AA 3PRFA 5C8KA 3OC1A 4TYIA 3POOA 3AXWA 1NY3A 4K0YA 5LMKA 3EQFA 3KFAA 4FEVA 2XJ2A 4GVJA 4YJOA 4YC6A 3R7IA 3UC4A 4Y72A 4XBRA 3PIYA 3AC5A 4LYNA 5HBEA 3U51A 2G2HA 3RP9A 3HKOA 3QD3A 5HTCA 3R63A 4NU1A 4FKQA 3TNPC 2BUJA 4USFA 2I1MA 3C4FA 4XHKB 3PWYA 2X4ZA 3R9HA 4D4RA 4IVAA 1SZMA 4FVPA 4KINA 3R00A 3I0QA 4HVGA 2XK3A 3EFWA 3V5PA 3OCGA 2OXYA 1JQHA 4DAWA 3Q32A 2JAMA 4AZFA 5M4UA 1MQBA 1WAKA 3UQCA 3OT3A 5BYLA 3WF9A 3GU8A 3BU3A 3VUGA 2FSMX 4FV4A 4RX9A 4I6BA 2UW3A 4FR4A 2H8HA 5EHLA 2QODA 2R3KA 5FEDA 3EN6A 4EWQA 1YW2A 1GNGA 3LVPA 4C35A 4JQ7A 4BCKA 5HNIX 3PVWA 2X81A 3W10A 3RHKA 4ZSEA 3IW6A 4FNXA 1BI8A 4A4XA 2GNHA 3FLSA 2YDKA 1I44A 4F7NA 4J7BA 4ASEA 4EOMA 3FKLA 2GS7A 4YZMA 2BZHB 3UMWA 4FTQA 4KBKA 2V7OA 4XUFA 5E8ZA 1WBTA 3RHXA 1KSWA 3QTXA 2YZLA 4F70A 3RALA 5CANA 4QPAA 1UU8A 4E6AA 5KHWA 2IJMA 5M55A 4YC3A 3FYJX 4QQ5A 4WBOA 4KIQA 5M4FA 4H05A 5EDRA 1OKYA 1YWRA 1WVXA 3P79A 1Y91A 3LW0A 4C33A 3QALE 4IACA 4ACMA 4FNWA 2R3MA 1Y8GA 4ITIA 4IZYA 3G51A 1M7NA 2PUIA 4PWNA 1LEZA 3O8PA 4RJ6A 4XG6A 3NNVA 4IM3A 4Q9ZA 5IQEA 2WTCA 3NCGA 2RKUA 3DKCA 4UYAA 1UVRA 3R8ZA 4E6DA 4EH8A 2GQGA 4F9WA 2IN6A 4UMQA 3DDPA 4PDSA 5DR6A 2PYWA 3ZDIA 4DGLC 3ZTXA 4L68A 2OJFE 4Q5EA 3GI3A 2VN9A 4IVDA 4YJUA 4FG8A 3UG2A 1H4LA 3ET7A 4Y85A 1WVYA 5EYDA 5J95A 2CNQA 2WMAA 5HKMA 5I9YA 4RPVA 1PKDA 3R8UA 2O5KA 2PK9A 2B54A 4KNBA 5AUTA 2Y6MA 4LRMA 4ZY6A 1FVVA 2HW7A 4O0VA 3ZLSA 2I40A 4O0XA 1IA9A 2VX0A 1ATPE 5AX9A 4JAJA 5CSWA 3I0OA 4ONAA 1AQ1A 4BCNA 3ZBXA 3R8VA 2QO7A 5BVWA 1BI7A 3B2WA 4DGOA 3QA8A 1QPJA 2VTHA 4YJSA 4UWYA 4NW6A 2OH4A 3G2FA 2FSOX 3HV3A 4PV0A 4D5HA 5IUGA 4Z9LA 5LVPA 2W1ZA 4HYSA 4LRKA 2BRGA 2W4KA 2EB2A 2NRYA 2PE1A 4R1YA 3MH2A 3PJ8A 3DLSA 1H0WA 3TDVA 3CP9A 2B53A 4CZYB 1ZY4A 4OTQA 5B7VA 4O22A 4H39A 4Q5HA 2PZIA 5AP2A 3FLYA 4F6SA 4FC0A 2QQ7A 3BQCA 4LUDA 1REKA 3GU5A 4KBCA 3DY7A 4RIXB 2BCJA 4RC2A 3R7EA 2PPQA 5BVEA 3L9MA 2XIYA 2OFVA 3C5UA 1U46A 2XIZA 3QLGA 5IQIA 3R04A 3F5UA 3TG1A 3VULA 4LGDA 4PQNA 2QO9A 3TV4A 4E8AA 5BVFA 4FYOA 5F95A 3VS7A 3MFRA 4I24A 2XNOA 3A62A 2I0HA 1WBOA 3E88A 3A7GA 3AMYA 2VO0A 4W4VA 4WUAA 2V55A 3VUKA 3FJQE 2QVSE 4MK0A 3MJ2A 2ITQA 1KE8A 5AUZA 4BWKA 4PMMA 4XOZA 5HHWA 3KN6A 3EOCA 3P4KA 2C6TA 2RGPA 4XEYA 2GNIA 4YNOA 1XH5A 4NJDA 3DAEA 3A4OX 3ZC5A 5ACKA 4DFXE 3P08A 3C4WA 3NVKI 2A2AA 2XCHA 2C5YA 2ITNA 5CU2A 2HENA 2OZAA 5KKRB 3BYVA 4C4IA 4OTIA 3QCXA 4QMYA 3D2IA 4OTDA 2C3LA 2OIQA 1YQJA 5CLPA 5GIOE 1ZXEA 1W98A 4CFFA 5IDPA 4O81A 5IA3A 4BF2A 3QRKA 2ESMA 5HG5A 1K9AA 3ACKA 2Q0NA 2R3OA 5B2LA 4IB1A 3OW4A 4YC8A 5BUIA 4E5BA 3U9CA 3DJ7A 3F3UA 4X0MA 4WG5A 4AW5A 3PXQA 3JVSA 3F6XA 3LJ2A 4UWCA 4XP2A 5EFQA 4BI2A 5JGDA 3PY3A 2UW6A 3HA8A 3LFCA 3MDYA 2QLQA 4IEBA 2FA2A 4U42A 5EHOA 4AAAA 2W1CA 3K54A 3OZ6A 4O38A 3ULIA 4C7TA 4E5WA 4X2KA 5KZ0A 5AV4A 4PUZA 4QP8A 2F2UA 3D5WA 4X3FC 2JBOA 1URCA 2CJMA 2FSTX 1B39A 2O2UA 2YWPA 3EFKA 4H1MA 3SOAA 3EIDA 3HRBA 3VHEA 4BBFA 3NX8A 5AAGA 5A4TA 2WNTA 2J5EA 3TNWA 4O7ZA 4YHJA 4D9TA 5CASA 4U3YA 1OPKA 5EI8A 3VIDA 5IU2A 2R7IA 5E90A 4DEDA 4X6RA 5HE1A 4I93A 1PMUA 4C8BA 4FA2A 4GSBA 5BUJA 5EDPA 3SHEA 4BBMA 3LMIA 2XKEA 4QTEA 1H1WA 3CGOA 3PLSA 5LWMA 4D1ZA 2HOGA 3Q6UA 4FV9A 4YGAA 1H01A 4FNYA 1JNKA 2PUUA 3C4CA 3MYGA 2YIXA 2W5BA 4AF3A 3F3WA 1JLUE 3QTIA 4K33A 3Q9YA 3IGGA 3BLQA 4IAFA 4X3FA 5DHJA 3V04A 4A9UA 5I3OA 1XBBA 2QOBA 4G6LA 4B99A 4RFZA 2Z60A 4TWNA 3OHTA 5M4CA 4XP0A 4JBQA 4BDHA 2YWVA 5FGKA 5KMOA 2B4SB 2GMXA 2QHNA 2EXCX 4K6ZA 1JOWB 4BB4A 5LCJA 3FUPA 3O7LD 5BNJA 3UYTA 2YITA 1O9UA 1GIJA 3BX5A 4HZRA 4F0FA 3U6IA 4JVGA 2XEZA 4TYHB 1Q8WA 3BWJA 4KKGA 2C6KA 3EQCA 1UKIA 4OTFA 4MXCA 3TNHA 2J4ZA 1A9UA 2UVXA 2JITA 4GRBA 4AOIA 4QP4A 4LMNA 2UW8A 2AC3A 5IQBA 1XH6A 4I41A 1XH8A 2CPKE 5AP1A 4AZVA 1V1KA 4CFMA 4L7SA 4XRJA 5HIBA 4FSWA 5EQPA 2R3NA 1ZMUA 1M14A 5AR4A 4BI1A 2YZAA 4EQMA 4NH1A 1YDRE 4FK6A 5LVMA 2ZDUA 3DXQA 5IUIA 2VGOA 4NYEA 2IWIA 4O82A 1BKXA 4QMVA 1WBNA 2WMWA 3MPAA 3QFVA 5FQDC 2YCQA 1AD5A 4GW8A 5ETAA 2OBJA 4ZSJA 3E7VA 2CNUA 2Q0BA 4BDCA 2CHLA 1V0BA 4BI0A 5HNBA 1OL6A 2Y9QA 4I22A 2BZKB 4V01A 2VWXA 3KK9A 3PG1A 4FKPA 4CYJA 3MVLA 4LRJA 3BPRA 4OTPA 3PIXA 2UZLA 2X4FA 3HV5A 3Q9WA 3R83A 5HESA 1H0VA 4YTFA 2C0IA 4L52A 4YBKA 4FEXA 2UZEA 4NM7A 2C68A 4TKSA 1SNXA 4YZ9A 1W84A 3MBLA 4M3QA 4IB0A 1FQ1B 4NW5A 5M57A 4GIHA 1NW1A 1WZYA 5IQGA 2BRMA 2ZM4A 2VTPA 4W4XA 2Z8CA 2PZPA 3SD0A 2KULA 5A14A 2CGWA 5D9HA 3ZEPA 3HAVA 5K5NA 1F3MC 5EHYA 1TQPA 5DLSA 1Q3DA 2P3GX 3KF4A 2ZOQA 3MW1A 4F4PA 5C1QB 4EZ3A 5M4IA 4B0GA 1JPAA 4TL0A 4CFWA 3FXWA 4KIKA 4XG7A 4JDKA 1M2QA 5AV1A 3S3IA 3T9TA 4JQEA 2UW7A 4JJRA 5CSXA 3AGLA 4YPSA 4PMPA 4RIYB 4FTKA 4XG8A 4E73A 4EK5A 3LMHA 3PG3A 4BL1A 2VTLA 4MWIA 5GJDA 5KMMA 4FI1A 4QNYA 4QMTA 2C6IA 4BGHA 4CNHA 4GMYA 5HVYA 4RRVA 2VWBA 3SDJA 5A46A 4DN5A 5FDXA 1YOMA 3DB6A 3LXKA 5HG9A 4P5QA 4YLLA 1YXUA 1ZMVA 3O7LB 5HI2A 3HUBA 4LUEA 3TTIA 4EONA 3HMIA 3JY0A 3ZFMA 2WQBA 3R1NA 1Q62A 3TUDA 4PTCA 2EXMA 3WF6A 5ICPA 4AU8A 4ZMFA 2YIQA 3ENMA 3OCBA 4U6RA 3ZM4A 3I1AA 4QYYA 2VWUA 3U4WA 4C3RA 2FGIA 2GDOA 3I81A 2IW9A 2CKPA 2B1PA 3O2MA 4FT5A 3ZBFA 5DT0A 3ZO4A 3EN5A 3MB6A 4DYMA 2CN5A 1ZYJA 4FV6A 3Q52A 4DH7A 3R22A 3TEIA 3O96A 4IAIA 1OIRA 3L8PA 2EWAA 3BV3A 1Q97A 3KEXA 5E8XA 3VBVA 3VWAA 3R9RA 4A7CA 5K3YA 3DCVA 4F0IA 5M56A 4C0TA 4PPAA 3GP0A 2XK8A 3UE4A 3JR1A 3AC8A 2JFLA 3HA6A 4DGNA 3P0MA 3BE9A 3CR0A 2UVZA 3NW7A 2PTKA 3UTOA 4TRLA 1PKGA 1BUHA 3DZOA 3PTGA 4RA5A 3LM5A 3VUTA 4A9TA 3Q3BA 3ZLXA 1VJYA 3PLAE 4S31A 2BRNA 3IO7A 2H9VA 4IX5A 2CSNA 3JUHA 3AD6A 3NUNA 3KMUA 4FUXA 5DMZA 5J9LA 5CEMA 2XYUA 3HL7A 4WUNA 3ZDUA 4UV0A 4MXYA 4C37A 3VAPA 1OKWA 2RG6A 4E4XA 4M69B 4KKHA 5CI7A 5IA4A 4C3FA 4RWLA 4CG9A 1XQZA 4I0SA 2B9HA 3COIA 3HMPA 3NAYA 3R8MA 1H27A 1RE8A 2HZNA 3RWPA 5CAVA 2BHHA 3UOLA 4CMTA 4D2WA 5M09A 2WAJA 4HCVA 4NIFB 1BMKA 2VWVA 2XZSA 3ATTA 4OUCA 4IQ6A 4QQJA 4U44A 3CQUA 4EI4A 4X2NA 3BEGA 3V5LA 4HVSA 2WQNA 3GNIB 2RFDA 5E9EA 3KXZA 5GJFA 1OVEA 3AOXA 4OAUC 4R78A 2RFNA 1KOBA 3FHIA 3ZRMA 4IH8A 4AUAA 3VO3A 1P14A 3IK3A 5IH4A 3MH1A 2PUPA 4MNEA 3VS2A 3NAXA 3GFEA 5BMMA 4N0SA 5CY3A 3E5AA 3EWHA 1NVRA 4Q9SA 4AA5A 4KWPA 5HOAA 2CNVA 1OL2A 3UOJA 2OFUA 4XV3A 3AT4A 4EK8A 3CY2A 4H3QA 1ZRZA 2PE0A 2WGJA 4P2KA 4IX6A 4J99A 4UB7A 3WF7A 4BTJA 2JIUA 4BVUA 3BKBA 2UVYA 3I4BA 1UWHA 3NUUA 3ORZA 2HYYA 1YKRA 3VBYA 3QGYA 2ITZA 4GYIA 5A3XA 3IS5A 4A9RA 4PY1A 2GCDA 4CFNA 4E4NA 4BCJA 2QNJA 5L8KA 4GG7A 3KVWA 4YZCA 5JSMA 4M68A 1FGIA 1Q8TA 3V8WA 1J1CA 4BCPA 1T45A 4KRCA 1GIIA 4J96A 3U4UA 3EN7A 2YAKA 4DEBA 5HCXA 3VS5A 3TNQB 3ANRA 1S9JA 2YABA 5IUHA 4FIIA 2X7FA 3BIZA 3RM7A 4OBQA 4U40A 3B2TA 3COMA 3EQRA 5CU6A 2JIIA 3NUXA 5I5ZA 4ZLOA 2J0LA 3GOKA 3Q9ZA 3OXTA 4HYHA 5KKRC 4UWBA 1LR4A 3B8QA 5IEYA 4GFGA 2ERKA 4CFUA 2BVAA 3JS2A 4YJTA 4ALUA 2X2KA 2OIDA 2W17A 3O71A 2SRCA 4IAKA 2Y7JA 2ZV2A 3G0EA 3FMNA 4FICA 4I6FA 3CPCA 4GT4A 5EYMA 4D9UA 2W9FB 4UN0C 1VYWA 2ITPA 3QLFA 3QYWA 4FV8A 1Q4LA 2OF2A 2W1GA 3UVQA 3CJGA 2BRHA 2OSCA 4F7JA 5ETCA 4KS8A 4U45A 2PVYA 4JL9A 5AM7A 3W2QA 2R3IA 3WE8A 3QRIA 4UMRA 3LQ5A 1FINA 3KULA 2XNGA 3F7ZA 4FKOA 3HUCA 4L53A 1YDTE 4CTCA 3V8SA 5EQYA 4YLKA 2YN8A 2OXDA 3BHTA 4IXPA 3E92A 5AX3A 3HRFA 3Q9XA 2JIVA 5J87A 2C6OA 1HCKA 3H30A 3QD0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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