4YO4A

Crystal structure of dapk1 catalytic domain in complex with the hinge binding fragment phthalazine
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
294
structure length
280
Chain Sequence
TVFRQENVDDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELVAGGELFDFLAEKESLTEEEATEFLKQILNGVYYLHSLQIAHFDLKPENIMLLDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQDSLQHPWIKPQFEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of DAPK1 catalytic domain in complex with hinge binding fragments
rcsb
molecule keywords Death-associated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 280
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yo4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yo4A01
3CPCA 5L2IA 2JAMA 5AR8A 3BI6A 3MS9A 2PPQA 4PF4A 2BZHB 3SVVA 4UV0A 4CQEA 1XQZA 3LXLA 3U54A 3W8QA 4PL3A 2F49A 2GNHA 2UZNA 4Q9ZA 4ANOA 2OO8X 3OMVA 1KV2A 4GG7A 3FWQA 4LYNA 5FXSA 4MBLA 2WMAA 1ZRZA 4X2NA 3EZVA 4Y83A 4GYIA 4G6LA 4WBBB 5BVFA 4HGSA 4AW0A 3QFVA 3KMUA 4R5SA 4UWBA 2A27A 3S95A 4ZAUA 3U6IA 3KRRA 4RVKA 2PUPA 4LMNA 3FXZA 3OG7A 3PXZA 4BF2A 2OWBA 3BGZA 2XVDA 1FVRA 2V22A 3AC5A 2OZAA 1XBCA 4MVFA 3R7UA 4HOKA 3RI1A 5HI2A 4ERWA 4F7SA 5JGBA 3CSVA 4N70A 3FLWA 4OGRA 4P2KA 4O0VA 1U5RA 5CY3A 4JAJA 5D9HA 1VYZA 2C3LA 2QOKA 1YXSA 4LRKA 5AA9A 5CI6A 3TV6A 3R7IA 3U9CA 1OPJA 4FX3A 3VWAA 2OICA 2UW9A 3EWHA 4FC0A 4J96A 5EW3A 2FVDA 2W1ZA 3PY0A 5CEQA 2XNPA 2CNUA 3GI3A 3R9HA 4JR7A 2CGWA 4D1ZA 1GJOA 4QRCA 2WTJA 4C4EA 2QCSA 4BHNA 3RAIA 1A48A 2ZM4A 3R1YA 3KK9A 4BKZA 3UTOA 2OIQA 4KSQA 3F5XA 3CXWA 2ITXA 1H0VA 3NCZA 4OTIA 4QQ5A 3F82A 3P23A 5CQUA 5E8XA 3W33A 3BKBA 4V0GA 3GENA 3Q2MA 3ZLWA 4U79A 4FEWA 3LMHA 2PTKA 4J95A 3GQIA 5J8IA 5HORA 4DTBA 4EYJA 4C37A 4N0SA 4EHGA 1JPAA 2PVFA 5GIPE 3PXRA 2WTKC 2PMIA 5CSPA 5JZJA 4J53A 3TWJA 4F0GA 4O7VA 5DGZA 5DN3A 1GIIA 3C0GA 5CVHA 2BFXA 3TNIA 3ZFMA 4D5KA 4FSZA 2E2BA 4H05A 2X7GA 5DMZA 1JKKA 3DK6A 4Z16A 4FTQA 2C5XA 3RHKA 3VUHA 4BYIA 5M56A 3GC9A 3THBA 5JRSA 2GHLA 4CTCA 2BKZA 3JVRA 3QYZA 4BL1A 3PLAE 4RBLA 5EQPA 2R4BA 2GDOA 4AGCA 3QD3A 3V6RA 1JSTA 3ZM4A 4DBNA 2O63A 1RQQA 5HQ0A 3CD3A 2W9ZB 4S34A 1ZMUA 2F2CB 4Y73A 5DI1A 5A4EA 4R7BA 5M53A 4RZWA 2ITNA 4CNHA 3LCOA 5B2LA 4JJRA 3ROCA 3T9TA 5IUIA 2QHNA 5CEPA 4HVSA 1OUYA 3VNTA 3C51A 3IOKA 3RPSA 1Q62A 3SLSA 4CT2A 3CTQA 3BLRA 5I9WA 1H26A 3ZEPA 2IVUA 2X6EA 3D5WA 2C69A 3R9DA 4E93A 4PP7A 3BX5A 1QCFA 3R7EA 3RCDA 1XJDA 5ANKA 2X7FA 3G15A 5FXRA 3WE4A 4O2PA 3LKMA 4BDGA 4RWLA 3DU8A 2Z8CA 4GEOA 3MH0A 3CTHA 4O1OA 4C2VA 3V6SA 5CEMA 2PULA 4I0RA 2BDJA 2P55A 3D9VA 4J8MA 2XMYA 3ZUVA 5CAUA 3R04A 3OCTA 2A1AB 1KOBA 4L8MA 1BLXA 4O2ZA 2HENA 4FL2A 3TKIA 5ANIA 4HCUA 2J4ZA 3HP2A 3NYNA 4IAZA 4AGUA 2YJRA 3RINA 3W8LA 3LM5A 4MNFA 3DDPA 4APCA 3FAAA 4PL4A 3H0ZA 4QOXA 4R1VA 4IB1A 4PMTA 4W8EA 5EHLA 4L46A 1K3AA 4KKGA 1ZMVA 2W9FB 1WVYA 3GXLA 3GBZA 4NJDA 4OR5A 5DRBA 1J7UA 3DQWA 3EN7A 5BVDA 3VBWA 4C4FA 3UZTA 2QO2A 1YWRA 2CHLA 3FZPA 4TL0A 4JQEA 4GFOA 3O2MA 4LI5A 4CV8A 4BTJA 1R78A 2WXVA 4ZK5A 3POOA 3OF0A 4CFMA 1YOJA 4FNYA 4FOBA 4WKQA 2JIUA 2VTIA 2NRUA 4DG0E 4F63A 2OF4A 5DOSA 3UYSA 3VUKA 2RGPA 4RIYB 4CLIA 1OBGA 5M51A 4BDIA 4JAIA 4AP7A 4F0IA 3ZC6A 1UU8A 3FZRA 4UWCA 3LQ8A 5FG8A 2GPHA 4GKIA 1M2PA 4FT9A 3FY0A 4KB8A 4F4PA 3AQVA 4KIQA 5HG9A 4UMTA 2JIIA 4M0YA 3VN9A 4IZYA 4OBQA 4ASEA 1NY3A 3PVBA 1DM2A 2WOUA 4QMPA 5IUHA 3H9OA 4M69A 4AWIA 2GHGA 2W1DA 4FL1A 5CS6A 4O7LA 4I20A 5EW8A 5LMAA 3P86A 3FSFA 3EIDA 3PXQA 1GNGA 5DLSA 4DGLC 4ZLYA 4KIOA 2YM8A 5FEQA 5LCKA 3NUXA 4ARKA 5KMOA 3F69A 4FTRA 3DPKA 4FT5A 1IA8A 3QQJA 4ID7A 4QTDA 5KCVA 4BIEA 5LVMA 3O7LB 5GZ8A 2GMXA 2R5TA 2VGOA 3BHYA 3HMIA 1ZOHA 1P14A 3R8LA 4I23A 3UOLA 2GQRA 2CLXA 1AQ1A 4V05A 2WMVA 3DB6A 3FI4A 4O82A 5CU2A 2I40A 2KTYA 4AA5A 4XG8A 4F1TA 3CR0A 4WNPA 3AC2A 2PZYA 3Q4UA 1JKLA 1UKIA 2BRNA 4FTOA 2XIZA 2PVHA 4YPDA 2PZIA 2XKCA 2VWWA 4HYSA 2J0LA 3EKKA 5HVKA 5M09A 5AEPA 4FV9A 3KXMA 5HE2A 3F66A 2C6TA 5AP1A 5EDPA 1H1RA 3MSSA 3Q6WA 2OJFE 2G1TA 4UEUA 1JAMA 1M52A 2QOIA 4LV5A 3OWLA 4G9CA 1OVEA 3OS3A 1SM2A 1UA2A 3CKWA 4MQ2A 4C33A 3CC6A 4AW5A 2J51A 4DE4A 2WMXA 2B9JA 3DFCB 5CWZA 3DBEA 1K2PA 2W5BA 3UIUA 1YHWA 4F0FA 4CGAA 4TT7A 1Q8WA 1H28A 4E73A 4BYJA 3L1SA 4AZVA 2VV9A 4IJPA 4EQCA 1MQBA 3ZCLA 3FZTA 4IWDA 1UU7A 2WTIA 4JBVA 3EQFA 1GZNA 4EH9A 1BL7A 1XH8A 3HUBA 4F9BA 4OBPA 5JKGA 3PDTA 5GINE 4BTKA 1XBBA 3UC4A 5E91A 4TTHB 3PPKA 3E87A 2X2LA 5F4NA 4ANQA 2BAKA 4V0GB 4EOJA 2YERA 4DGGA 3GC7A 5I3RA 3V5PA 3DTCA 4ZLZA 4MXCA 5A14A 3TT0A 4X21A 4X3JA 2E9VA 2XNMA 3E93A 3PVWA 4WA9A 1TQMA 1DAYA 3BGQA 4EK6A 5HNIX 4ITHA 4E3CA 1XH7A 4IZ5A 3QLGA 1YXUA 2HELA 2JKMA 1APME 4FVRA 3QUDA 3TV7A 4GYGA 4HPUE 4XP2A 1FGKA 3ZDIA 5CEKA 2VTHA 2BRBA 1REJA 2F9GA 1JNKA 1V0OA 2UZBA 2Y4PA 3IECA 5FD2A 1ZYCA 3OY1A 1J7LA 4FKVA 5LWMA 3FPQA 5E8UA 2QOOA 2ZDUA 4P4CA 2BPMA 2QODA 4BKYA 4JBPA 5FUTA 4FE2A 2JAVA 5EI8A 3CLYA 1T46A 1ZARA 2A2AA 3QZFA 3R22A 3PPJA 4BDJA 1OL7A 5ITAA 3MA3A 2W5HA 4JXFA 4QMNA 4BKJA 3Q52A 4KS8A 4YHFA 2WU7A 4QYEA 3ITZA 4OTGA 3IDPA 5AP2A 3DV3A 3TZMA 1LR4A 4QMWA 4FV5A 5KZIA 4NYEA 3OW3A 3W32A 2RIOA 2UZEA 3GU7A 2NO3A 3AD5A 3ULZA 5AIRA 2QD9A 4ZTHA 5IQEA 2C5VA 3LFAA 4RFMA 3I7BA 4DH7A 2O8YA 3D4QA 4QNYA 2CPKE 4Y8DA 4R7HA 5IA3A 5FDXA 5GIOE 4BB4A 3OY3A 2JKKA 4AZSA 3LFCA 3ORMA 3GP0A 4OAUC 2Y4IB 4JDKA 5BMSA 3AMYA 5GJGA 4D58A 3R30A 2XNBA 4S32A 5H8GA 4DEHA 1B6CB 3O96A 3DXPA 4PV0A 2VRXA 5TT7A 2JKOA 5DE2A 5EYDA 4BCPA 3GU8A 4FUXA 4ENXA 3F7WA 3QTWA 4IAIA 2BRHA 2F2UA 3OBJA 4ACGA 4M15A 4JVGA 5CASA 2VWXA 5IEVA 2XIRA 4OUCA 3OWKA 4D1XA 4DGNA 3R8PA 4DEBA 4AT3A 5IMEA 3QX2A 1H4LA 2ERZE 4F08A 5IQAA 5CF6A 3MA6A 5HCYA 1IG1A 2RG6A 3BQCA 4WNKA 1FOTA 3LHJA 3E8DA 2R3PA 5DEYA 5IKWA 3ZRKA 4C8BA 4RVLA 5IZFA 5E9EA 3TKUA 2IVTA 2IVSA 2PL0A 1QPDA 2HK5A 2R2PA 4U42A 4PPAA 3F3VA 1OKWA 2HAKA 3Q3BA 4XS2A 2PE2A 1IEPA 3FYJX 3ALOA 4GH2A 1DS5A 4KSPA 1PXIA 1S9IA 2IZRA 5HLWA 4K0YA 5F95A 2FSTX 1Y8GA 3F88A 4MEDA 4RX7A 4NIFB 4CQGA 4IC8A 3L9MA 2Z7RA 4DF3A 1Y8YA 3DOGA 4HVHA 3LJ0A 1GIHA 1W98A 4RC3A 5E8WA 3TCPA 2G2FA 5HTIA 4YJRA 3LQ5A 4X3FA 2XIYA 3IW4A 3P7AA 4CTBA 2J90A 2ITWA 2OBJA 4O27B 3SOCA 4F6SA 2V7AA 4C59A 1ZY4A 4BDAA 3BGPA 4M67A 3KXHA 2ITVA 4LGHA 3TN8A 2PU8A 4YZCA 3SGCA 5L4QA 5G6VA 4UALA 4DH5A 5CAVA 5J9ZA 3KF4A 1YRPA 3OROA 5JFWA 2Y7JA 3OCBA 4E4MA 1PMNA 3MIYA 3IW8A 2EWAA 2XK3A 4LRMA 2Q0NA 5AP3A 3QRJA 5J87A 3SX9A 3JUHA 3FLZA 3NPCA 3KRLA 3VUTA 2C30A 2VTSA 1SVHA 3EQBA 4FKIA 4K33A 4AOIA 4L00A 5HVJA 3DKCA 3EYGA 4RIWA 3EQDA 3FLYA 2HY81 4CFWA 4MAOA 4MQ1A 3BEGA 3PSDA 5IEXA 3BE2A 4AGWA 5BNJA 3Q9XA 2ETRA 4QYGA 3PJ1A 1Q3WA 5AR2A 4A4XA 4AGDA 5FRIA 4YJSA 3U6JA 3ZBXA 4TPTA 4PUZA 3OT3A 3RMFA 4FT7A 4MF0A 2YDJA 3W2OA 3CEKA 5CI7A 3FXWA 3RBWA 3UVPA 2YITA 3CY3A 3MI9A 4C58A 3LVPA 5EKOA 4DA5A 3IW7A 4XOZA 4BCHA 4YUQA 4XLIA 3R8VA 2W5AA 3O8PA 3WZJA 3SXFA 5T6KA 2OLCA 5GJFA 2BDFA 4FSWA 3LXPA 4EHVA 3VW6A 2XEYA 4X2JA 4TYJA 1BUHA 4F1MA 5A6OA 3UQGA 5EM6A 3R21A 3SC1A 1JQHA 4RJ6A 2PYWA 3ALNA 5CAOA 2ZAZA 4RMZA 4U44A 2J7TA 5AAFA 2B0QA 2XKEA 2UZOA 3QKLA 4FZDB 2XUUA 1JSUA 3EQCA 4EOIA 3NNXA 2V0DA 4UMQA 5LVLA 3P7BA 5CSXA 5AUYA 4DITA 2FYSA 1F5QA 3CE3A 5C8MA 3DBDA 5L8KA 2EXEA 3DJ5A 3MPMA 3R01A 2WEIA 4XRJA 2R64A 2UZVA 4ZSEA 4IFCA 1R0PA 4QP1A 4IM3A 5AP4A 3UBDA 3VF8A 4CMUA 3FMEA 3ULIA 2XBJA 3I79A 1IA9A 5HO8A 4RLKA 5T68A 3PA3A 4RX8A 4FZFB 2XA4A 1SYKA 3H9FA 3T3VA 5HBHA 4EH8A 2CGVA 3TDVA 3F61A 5EM5A 4FSTA 2YISA 4RGJA 3LZBA 1ZLTA 2OG8A 3LCSA 4X6RA 5D7VA 3R28A 3VBQA 3VQHA 4ANMA 2YN8A 4E6QA 1Q8ZA 1O9UA 3VS6A 4BZNA 1RJBA 5KMJA 4YSMA 4TNDA 4X2GA 5EHOA 4B6LA 2RFSA 3MV5A 2X2KA 3POZA 4FT3A 4M8TA 4BY9E 3OD6X 4CMTA 3RPYA 2R7IA 4TNBA 5L2TA 2VX0A 4YHTA 2C3KA 1FPUA 5J1WA 3SV0A 4YR8A 2JEDA 2R0IA 2ZV2A 3FQEA 5HO7A 3R9RA 2Y0AA 3FBVA 5LQFA 4DEEA 3IOPA 2WGJA 4ITJA 4P7EA 1O6LA 3MFRA 1TQPA 3NRMA 3LLAA 3R7YA 4ZSLA 1OKVA 3A8WA 2B53A 2WTCA 4IJ9A 5CZHA 2BZJA 5HU3A 5IH5A 2JDRA 5JQ5A 4PDYA 5IQHA 4W4YA 4R77A 1VJYA 3JR1A 3BU6A 4U41A 4DLIA 2ITQA 4QTBA 3N9XA 3DZOA 2XNOA 4CFFA 1WVXA 1UWJA 2C1AA 3CIKA 4QTCA 2BMCA 4W4XA 4Z7GA 4K6ZA 3FI2A 1G5SA 5HOAA 5EDRA 5HLPA 5J1VA 5IMXA 4OTPA 3PJ3A 4AZWA 2YIXA 3Q5IA 2VX1A 3I60A 1Q41A 4ASDA 3NUAA 4BZDA 3BWJA 4QMZA 4L7FA 2SRCA 4YLKA 4D0XA 5I9XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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