4YZNA

Humanized roco4 bound to compound 19
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
274
structure length
269
Chain Sequence
PTLADNEIEYEKQIGKGGFGLVHKGRLVKDKSVVAIKSLILETEMIEKFQEFQREVFIMSNLNHPNIVKLYGLMHNPPRMVMELVPCGDLYHRLLDKAHPIKWSVKLRLMLDIALGIEYMQNQNPPIVHRDLRSPNILLQSLDENAPVCAKVADFGLSQQSVHSVSGLLGNFQWMAPETIGAEEESYTEKADTYSFAMILYTILTGEGPFDEYSYGKIKFINMIREEGLRPTIPEDCPPRLRNVIELCWSGDPKKRPHFSYIVKELSEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Characterization of LRRK2 Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable serine/threonine-protein kinase roco4
molecule tags Transferase
source organism Dictyostelium discoideum
total genus 84
structure length 269
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yznA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yznA01
2W5HA 1T46A 4KB8A 3Q32A 3IONA 4GRBA 2QU6A 5CF4A 4BBFA 5KHWA 3HMIA 4RVMA 4G3DA 1TQIA 2OJ9A 3O51A 2VTNA 4JLCA 3EFJA 3VS2A 3TUDA 1ZMWA 4KIQA 3OTVA 3W2CA 4D2WA 2YIQA 4FV9A 4JG6A 4EQMA 3REPA 4EBWA 5A4QA 4S30A 3LJ1A 4DH8A 4K77A 3DLZA 4BCHA 1JSVA 2R64A 3OS3A 3FMNA 3ORZA 1GZOA 4BCFA 5IH6A 2BRMA 3MBLA 4OW8A 4U40A 5HE2A 2GNIA 1AGWA 2R3KA 3FMDA 2RKUA 4AOJA 3AD6A 4NW6A 2J51A 4ZJJA 2IW8A 4A9TA 2V22A 3LHJA 4DEAA 4ZTRA 3F7WA 3VBQA 3I5ZA 4FSTA 2J0IA 3R8MA 5CI6A 5CZIA 4RX5A 4OBOA 3TNPC 4ZXTA 3TTIA 4CFFA 3W18A 4EBVA 4FTTA 3LFEA 4RWJA 4YSJA 2GS6A 2EVAA 4FTJA 4I23A 4IB5A 3BQRA 4BICA 5HCYA 1JSTA 4JG7A 4FSYA 2WB8A 4WBOA 1M17A 4NT4A 4YNOA 4EZ7A 4RJ3A 1J1BA 3M2WA 2LGCA 1EH4A 2YDJA 3E92A 2FSLX 3ZSIA 4CV8A 2Y6OA 4HGSA 5A6OA 4G9CA 1OKYA 3AT2A 3OXZA 4LG4A 4ZOGA 3U6IA 4CVAA 2Y8OA 3SOAA 2NO3A 2GNHA 3ZFXA 2CGXA 1QMZA 5IDPA 3LXPA 4U42A 5HIEA 5JEBA 4JX3A 1PXOA 2VGPA 4QMTA 2W9ZB 3I60A 4S31A 3FMLA 3MV5A 5IF1A 3FZOA 4IJPA 4ACGA 3LM5A 2UW0A 4J8MA 4ANBA 3ZLSA 5HD7A 3NIZA 4AP7A 5I9XA 1T45A 1IA8A 5AX3A 4CLIA 3GCQA 4DITA 4O0YA 4F9AA 1FQ1B 2BDWA 4YU2A 3OBGA 4RJ5A 3D83A 3OUNB 4WUNA 2C6IA 4M69B 4I24A 4FV6A 3ZZWA 2IJMA 2NP8A 3OCGA 4XHKB 4XOYA 3UTOA 4AA0A 5JFXA 2YCRA 3A2CA 2QKRA 1YWRA 3KQ7A 4ZTNA 5AUVA 3VF8A 3E8CA 4U3ZA 5LMKA 4JDHA 3I1AA 5AP1A 3NS9A 4AF3A 2BHEA 3F61A 4EKLA 1DI9A 2UZUE 2X7FA 2E9OA 5JN2A 4IANA 3D7ZA 4RIXA 2WMVA 4UWBA 1OKVA 2W1GA 3Q6WA 4AWIA 4EHZA 4WNOA 5DRBA 3THBA 1M52A 4PTGA 5GJGA 4B0GA 1REKA 4FTUA 4BI0A 3P79A 4FKPA 4C3PA 5A6NA 1GIJA 2QG7A 5ACBC 4BWXA 4FKGA 2QD9A 5KUPA 4QTAA 4YC6A 4P7EA 5HORA 3UO5A 3VULA 4WG3A 2Z7SA 2JDVA 4RBLA 2WMUA 4TZRA 1AQ1A 1PMUA 1W82A 2HZ0A 3EKKA 3GXLA 4E5BA 3EYGA 5IEXA 3VUMA 3OROA 3R2YA 5HE1A 1ZRZA 2RIOA 4R1YA 2WU6A 4ZLYA 2R5TA 1MRVA 4J71A 4C38A 3KU2A 3P08A 1Y8GA 4JDKA 5CF6A 4DBNA 3RJCA 1WCCA 2WKMA 2Y4IB 4FZDB 3MTFA 5HG9A 3NZ0A 4OTRA 4BL1A 3HL7A 4LOQA 1Q8ZA 2G01A 4JIAA 3O17A 1WVYA 4IFGA 4W4XA 5FP6A 2CCHA 1H08A 2WGJA 5CVGA 4IAAA 2FSTX 3LE6A 4PDSA 4TYHA 4UEUA 5EDQA 5EM7A 5FM2A 3RK5A 2Y0AA 2X2KA 3NEWA 4PX6A 4E5AX 5AX9A 4FVQA 3OT3A 4WG4A 4CFMA 3Q9YA 4EJ7A 2AUHA 2JDTA 1LUFA 3ZYAA 3MH1A 4PP9A 4CNHA 1JVPP 2ERKA 5CTPA 3P7CA 4FL2A 4HJOA 4MHAA 3UO6A 4DGLC 2W1DA 1XBCA 4ZSJA 5CYIA 5FG8A 3ORLA 4FE2A 4NTTA 3Q2JA 1OPJA 5AUXA 3EN6A 4EWHA 2R3MA 4FL3A 3LXKA 4GT5A 4DTKA 3FI8A 3IO7A 4UXLA 4I6BA 4JBOA 4K1BA 5CT7A 4DGMA 3EIDA 4O0UA 3R8PA 4MXXA 3VUTA 3RP9A 3FAAA 5GNKA 4IH8A 1GZ8A 4RVLA 4BY9E 1H1QA 1NXKA 4PL5A 2G2FA 3QRTA 2JBPA 4HVSA 2X1NA 4YUQA 1YXVA 4FV8A 5M4UA 4YGAA 5BMSA 4TPTA 2X2MA 4OT6A 2X4ZA 1Q24A 1MRYA 2DWBA 2XM9A 4IX3A 5H2UA 4C2VA 3GCUA 4QTDA 4YLJA 3MIYA 4GSBA 3SG8A 4FNYA 3DBDA 1U5RA 5J87A 3MA6A 3DXPA 4ASDA 4YC8A 4E4LA 3KN6A 4QNYA 1OB3A 1JKSA 1QPDA 3DKCA 5HQ0A 2CPKE 3E64A 3R71A 3QD2B 2HELA 4F7LA 2WO6A 2XNOA 4RSSA 5HCXA 5LMAA 3CQWA 3V5QA 3Q96A 1KE6A 4G3FA 4IAKA 5F20A 4FV1A 3GFEA 3MSSA 3NW6A 4G3CA 3F88A 5T3QA 2XIKA 4PMTA 4FKLA 3FZPA 5AP7A 5HLPA 4Q5EA 4F65A 5AADA 1JQHA 5JRSA 1XH6A 2V7AA 3KEXA 4NYEA 4M0YA 3FZSA 4N4SA 3RHXA 4EORA 1R0EA 4Z7HA 4EOSA 3PXKA 2E9PA 2ZVAA 3R8LA 4DBXA 4QMXA 5T68A 2UV2A 3PRIA 4O1OA 5BVWA 5DR6A 4BIEA 4JDJA 4DG2E 1Z5MA 2PZIA 3KN5A 3MPTA 2R3QA 4G3GA 4GG5A 5HKMA 3NW5A 5CU2A 2W4KA 4RZVA 4ERKA 4LOPA 3D5UA 4TW9A 4IDVA 5IISA 2GNLA 3P9JA 3VO3A 2AYPA 2ITZA 3GCVA 3MVMA 1IAHA 1XH9A 4FTIA 3ZBXA 3DNEA 3DCVA 1H4LA 4IC7A 4F1TA 3EB0A 2ESMA 3BYOA 3QQHA 3UPXA 4LRJA 5C1QB 1PRYA 2FSMX 3DK7A 4BCOA 2WMWA 2J2IB 2KTYA 3IW5A 3K54A 4I6HA 5E4HA 3EMGA 2JITA 3HUBA 5HU3A 5EKNA 5IQDA 2GHMA 4IWPA 4GIHA 3ANQA 4P90A 2UUEA 4C58A 3JR1A 3QUEA 4X3FB 4GK2A 5BX0A 3NDMA 4I5PA 4H1MA 2PVJA 3ZRLA 4ANNA 4BDKA 5KE0A 5AAGA 3ERKA 3SGCA 3D9VA 2GQRA 2E9NA 1P14A 2VTHA 1BYGA 5TT7A 4IDTA 3T8OA 5AFVA 4ORKA 3EN4A 4LRKA 3ZUTA 5CU6A 4DEEA 3LLTA 4QTBA 1JPAA 2ITVA 2WTKC 4O6EA 4QPSA 3T3UA 3VQHA 3PIZA 5AA8A 5JFSA 3LPBA 2BUJA 5L6OA 3AC1A 4FSWA 4MQ2A 5IKWA 3NLBA 4EUUA 4XP3A 4ZY4A 1OPLA 5BUIA 3FY2A 1I44A 4FZ7A 2ITTA 4I21A 5BYYA 5I3RA 3IDPA 1V1KA 2WMQA 4C62A 2IW9A 3TACA 1YKRA 5IEVA 4KKGA 1KE9A 4FNWA 3TIZA 1IR3A 3QKLA 1H1PA 1JKKA 2IPXA 4LM5A 2VWIA 2RG6A 2UW7A 5E8TA 2OZOA 2QNJA 3F2AA 4FSMA 4Z9LA 2HY81 1XJDA 2YM8A 2B52A 4WSYA 2ZV7A 3MFSA 3QTXA 4GW8A 2J0LA 4AZTA 5HZNA 3QRUA 4HNIA 2XNPA 4KD1A 3FDNA 4HGLA 3FKOA 3FWQA 2ITOA 5M55A 3NNXA 2VTLA 4IX6A 3BX5A 3HA6A 3TDVA 2BRGA 5C03A 2UW5A 4BHZA 1L3RE 5M07A 2H6DA 1FVRA 3V51A 2Y6MA 4MVFA 3LQ3A 2FYSA 4OTPA 3QA8A 1H1RA 4XH6A 3MH3A 3HYHA 4TY1A 4LUEA 3V5PA 3UVPA 4E26A 3A62A 3FMHA 4G31A 4RWKA 5EW8A 4F7SA 4WRSA 4BR3A 1DAYA 3GCSA 5E9EA 1K3AA 3V8TA 3TDWA 4YJOA 3Q04A 2RFEA 1O6LA 1OL7A 4FODA 4PPCA 1FPUA 3G5DA 4QMUA 2QOBA 5HD4A 1PMEA 3C0GA 5CS6A 5IA5A 5LWNA 2C6LA 3LFFA 4RIOA 3LLAA 3BHYA 2G1TA 3D2IA 3ACJA 1YI4A 5M4IA 4O83A 3VAPA 4JQEA 1RJBA 4C36A 4YJNA 4WKQA 3ODZX 2WU7A 3R7UA 5LARA 5D41A 4X3JA 4BWPA 3QQFA 1VYWA 5JZNA 3W32A 3ZC6A 3W55A 3O23A 3HMPA 4RC3A 4ANMA 3HMOA 4CRSA 3BU5A 1ATPE 4M7IA 4ASXA 4BN1A 4XNEA 1FOTA 5JKGA 4LOOA 2F57A 5CSWA 2QOHA 4RMZA 3O96A 2C68A 4ERWA 1A48A 4IM2A 4MBIA 4DLIA 4E6QA 4NZWB 4G17A 5BYLA 2QOOA 2B4SB 3FPQA 3BLRA 5DFPA 4ASZA 3NYNA 4YZNA 3QQJA 5HX6A 5IDNA 5EI2A 2PUIA 3LKMA 5ANJA 3PXZA 4OTQA 2O63A 2SRCA 4ANQA 2CNQA 3DBCA 3OW3A 5L2SA 4AA4A 5L8JA 4ZSLA 3UNKA 4O7VA 4YPDA 3UZPA 3MH0A 3ZFMA 2YIYA 3FE3A 1ERKA 3IW6A 4DEGA 4DYMA 4TNBA 1GY3A 2GMXA 3BIZA 2OFUA 3FXXA 1JLUE 4F7JA 3COIA 3A61A 2JGZA 3EFKA 4E3CA 5AV1A 4ZY6A 3JYAA 4L3PA 4JR3A 1VEBA 3GVUA 2YHVA 5ANKA 4YLLA 3W8LA 4FKUA 2I0HA 4OR5A 4R7HA 3LCDA 3KGAA 4XLVA 3LAUA 5E8YA 3QYWA 2OICA 3A8WA 4C7TA 4Z3VA 4EH7A 2C5YA 5IA1A 2Y9QA 3KXGA 4FV3A 4FIFA 3AT3A 3O50A 3LZBA 3OVVA 3HRBA 4R3RA 3R9RA 3OFMA 4KBCA 5LXMA 3NAYA 3VS7A 2DS1A 1IRKA 5AR4A 5AP3A 1APME 3LVPA 4L45A 1NY3A 4RPVA 5HBJA 3EQGA 4YR8A 4KBKA 2JC6A 1H0WA 2PK9A 4J98A 1URWA 3C5IA 4Z16A 3LFDA 2XS0A 4MWIA 3ZM4A 4CFUA 3R7OA 5EHYA 3LQ5A 3RALA 3ZOSA 5FWKK 4O7TA 5F1ZA 2UW4A 4KWPA 4IAFA 2YAKA 3UDBA 1XH7A 2GS2A 3TZ8A 4JBQA 3ORPA 3V5JA 5M51A 5CU3A 2FB8A 3L8XA 4FK3A 1K2PA 3QTSA 4C61A 3SKCA 4XRLA 5AUUA 2F49A 3S2PA 3HX4A 5EDRA 4XBRA 3FEGA 3BYUA 4FTCA 2YJRA 2C0TA 2XB7A 4MXZA 5F94A 2H9VA 4ALWA 4C4EA 4KIPA 4R77A 1YHWA 3QZGA 4M97A 2EXCX 3I79A 2XIXA 3QL8A 2QKWB 3EJ1A 2DYLA 4KINA 5CNOA 1W84A 2QODA 4H36A 1ZXEA 4OAVB 1YI6A 2HENA 1PMVA 2NRYA 2P3GX 3FMMA 4GL9A 4XG9A 5CASA 4NU1A 4XS2A 2A0CX 2YITA 3VW6A 4L8MA 3HVCA 2BROA 4J8NA 4ZTMA 2QHMA 3OP5A 5F4NA 1YOLA 5IMEA 2WFYA 4IACA 2E2BA 2XIRA 5LMBA 3OY1A 4NCTC 5E8XA 3FKLA 3ZC5A 3RM7A 2ZOQA 3OCTA 4BTJA 5KBRA 4MTAA 4DCEA 5M4FA 4KAOA 3UYTA 2F7ZE 3VBTA 5KMOA 3E8DA 4G3EA 4EHGA 3DFAA 3GC7A 3TL8A 5M4CA 3FJQE 5FLFA 3QLGA 5ANIA 4D2TA 4ANLA 4ZMFA 2I7QA 4EOLA 3DGKA 3E3BX 2FA2A 2GU8A 4GU6A 4D2VA 2V5QA 3UO4A 4ZEGA 1LEWA 3RWQA 4RX9A 3IKAA 3WZUA 1ZMUA 4D1SA 5BVDA 4HGTA 2YIXA 4MD8E 2PVLA 2OJIA 3ZMMA 4R3CA 3TI1A 2Y4IC 5C9CA 3SD0A 3D15A 3C5UA 3IQ7A 4OTWA 2R3RA 2R3JA 3DAJA 5IA4A 5L2TA 3FSFA 3OY3A 1SNUA 4XV1A 5H3QA 4RJ8A 2ZM3A 4F0GA 3BHHA 3CP9A 3E62A 3IS5A 4RX8A 4J1RA 5DR2A 4XYFA 3T9IA 4GFMA 5M08A 2WTCA 4KKEA 2OF2A 3H10A 4AFJA 5CEPA 5HGIA 5CWZA 4FG8A 4UALA 5K4IA 2EB2A 2JKQA 5AAFA 3RMFA 5H8BA 5L2QA 3EN5A 3NVMB 3QGWA 4K11A 5EK7A 5GIPE 5CEKA 4UX9A 3MESA 3PIYA 1TVOA 2AC3A 2IZRA 3AQVA 4F08A 3FZTA 4J7BA 4C57A 2BDFA 3TZ7A 1REJA 2R3FA 4EQCA 4MXCA 4BI1A 4KKHA 4TN6A 4A4XA 4CLJA 3TXOA 2JFMA 5LVMA 3PVBA 5EI8A 3WZKA 4DH3A 4EC9A 1WBPA 5EH0A 2HY0A 3BELA 3DAKA 1F5QA 2O64A 3A4OX 3PSCA 1SVEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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