4A4LA

Crystal structure of polo-like kinase 1 in complex with a 5-(2-amino- pyrimidin-4-yl)-1h-pyrrole inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
290
structure length
290
Chain Sequence
EIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title 5-(2-Amino-Pyrimidin-4-Yl)-1H-Pyrrole and 2-(2-Amino-Pyrimidin-4-Yl)-1,5,6,7-Tetrahydro-Pyrrolo[3,2-C]Pyridin-4-One Derivatives as New Classes of Selective and Orally Available Polo-Like Kinase 1 Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE PLK1
total genus 81
structure length 290
sequence length 290
ec nomenclature ec 2.7.11.21: Polo kinase.
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4a4lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4a4lA01
4NM0A 4KKGA 4QO9A 4CT1A 3QXPA 3C0GA 4F99A 4G1WA 3VC4A 5CF4A 1W82A 4QQ5A 3GU6A 4UWBA 5E1EA 4ANLA 2E9NA 1I09A 2GHGA 3PPJA 5HVYA 2YWPA 4O83A 2WTJA 5J9ZA 1JNKA 3VQHA 4RQKA 1XH4A 3BHTA 4I6BA 2BZJA 2GTMA 2BKZA 2PL0A 2R3GA 4XG9A 5LMBA 5E7RA 4ZSJA 5IQCA 3I0OA 2YCSA 3HRFA 4UXQA 2SRCA 1KV1A 3UG2A 2FSTX 5JT2A 2EXEA 3OCGA 4I0RA 4RVLA 3AC4A 5AR7A 1OGUA 3ZO4A 2UUEA 4ENYA 4ID7A 4B8MA 4ONAA 1PJKA 2CNVA 2ESMA 3MPTA 4AE9A 4BCOA 4O2PA 3C0HA 4GKIA 2IN6A 4YJPA 1YXVA 2PTKA 2QOHA 3CQWA 4OTWA 4PTEA 4PL3A 1JQHA 3KEXA 3KXGA 2IZRA 2VTOA 5JFSA 4IB5A 4XS2A 3OBGA 3QXOA 4W4XA 3VS4A 2YM8A 4QT1A 4EZ5A 3QAME 3ZXZA 3U6IA 2QURA 4M67A 4QYHA 3OWLA 3FPQA 3MVJA 3PVGA 3THBA 2KTYA 1FMKA 4WBBB 3QGYA 2BUJA 3FLSA 2ZM1A 4OUCA 5CSXA 5HE2A 3RPRA 4QD6A 1H25A 4JLCA 4RA5A 1Z5MA 4YPDA 4FKJA 3PE1A 5AP5A 4QRCA 5AAEA 4JAJA 4DT9A 3P86A 3SD0A 3POOA 3QRUA 4FV6A 4AW1A 2HYYA 3U54A 5EW8A 2JITA 1JSVA 4F9BA 5KKRC 4Z7HA 4CQEA 3OROA 3KL8A 1H1PA 1O6KA 1BKXA 2QKWB 3O8TA 3RCDA 3FMHA 1Q3WA 4AS0A 3TZMA 3U51A 2WPAA 4KIOA 3KCFA 4EKKA 4BHZA 3E8CA 1YQJA 1V0OA 4HGEA 4HPTE 1LP4A 4JIKA 3TI1A 3WZDA 1CSNA 3ACJA 5J95A 3HL7A 3LFEA 2C6TA 3EFJA 2GS2A 3FLYA 1ZYSA 3UMWA 2AC3A 4V04A 4MD9E 2IVTA 3FMNA 4DH5A 4IM3A 4FTCA 2H6DA 1YOMA 4AN2A 4WHZA 4HCUA 3TKHA 2WQEA 3HDMA 2BZKB 3UP2A 3JPVA 4YJOA 3RM6A 3WZEA 3NUAA 2VGPA 4L53A 3DDQA 3CQUA 5AV4A 1J7IA 5AP0A 5I0BA 2XKFA 2Z7LA 3ANQA 5CSWA 3E62A 3TNHA 4F1TA 2Q0BA 4DFBA 4AA5A 4V0GA 4DGNA 4DEHA 1U5RA 5GZ8A 1Q3DA 4LQMA 3MS9A 4RVKA 3S95A 3DDPA 5LMKC 5HIDA 3V5PA 5IEYA 1IRKA 5JRSA 3C5UA 4D2PA 3W8QA 1XR1A 4DCEA 4RX5A 2R0IA 2RKUA 2ZB1A 3LHJA 3ZDUA 3TV6A 4XBUA 5KHXA 2W17A 4UMRA 5E9EA 2XF0A 1H28A 4L3LA 1H1SA 2UZNA 4DEGA 3TM0A 5BVEA 3H9OA 2B55A 2QO2A 1T46A 4E4NA 4LGDA 5FEQA 2WNTA 3FI4A 5ANOA 3DXNA 4ZMEA 5GIOE 5H9BA 1PYEA 3F7ZA 3Q9YA 4EOOA 3JS2A 4QP7A 1MRVA 5HLWA 4AGDA 4DFLA 2FVDA 2ZMCA 2C1AA 2ZV2A 4EZ7A 2ZOQA 4KRDA 3MY1A 4FKGA 4JNWA 5CU4A 5AP6A 3ZC5A 4CFWA 3MSSA 5C01A 1RQQA 1PXNA 1TQPA 2YA9A 4TWCA 2QNJA 3H9FA 3V51A 2Q83A 1YHWA 4CZTA 4C02A 1XO2B 3ORXA 3QQHA 4FIFA 4PUZA 3S4QA 2FUMA 3ET7A 4FI1A 5CS6A 5DR6A 3VJNA 3EN4A 2J51A 4FNXA 4DLIA 3FLNC 4L44A 2BKKA 3RK9A 2RG6A 2HWOA 2XIRA 4X3JA 3HECA 2HK5A 3OUKA 1XWSA 1YDRE 5TE0A 4O0UA 3VS6A 4C8BA 4CFNA 4EZ3A 4I24A 3BHYA 3OT8A 2ETRA 5HU3A 2W1CA 4MXZA 3ZM4A 2BRNA 3F3WA 3PA3A 5HO7A 3MPMA 1LUFA 1IA8A 4OW8A 2R3JA 5TO8A 2OH0E 3Q4TA 3LFAA 3N51A 3TCPA 2CNQA 2QONA 3F69A 3Q32A 3HV7A 1JLUE 5FM3A 4X6RA 3O0GA 4P7EA 3NYOA 3E8NA 3PUPA 3UIUA 3PVBA 3I7CA 4BCGA 4RSSA 3VQUA 2PULA 3KRJA 2J0MB 3BYSA 4LI5A 3WE8A 5AEPA 2X1NA 2ITXA 2PZRA 2XK8A 5TOZA 4AOJA 4MVFA 4LOQA 4NW6A 1KUTA 4MAOA 4D1SA 3G6GA 1Q97A 4JDKA 2FYSA 3QHRA 2REIA 4IIRA 1AQ1A 4O7ZA 2XVDA 4FODA 3Q04A 4IX4A 5H8BA 2G15A 2VWUA 3I79A 3PY1A 5CNOA 3S2PA 4G16A 4DGMA 4FT0A 5ETCA 1V1KA 2YIWA 3CQEA 3LXKA 3LMIA 2IVUA 3CTQA 1YDTE 4A07A 1K3AA 4GV1A 3WIGA 3K2LA 3FXWA 4AGWA 3PVUA 4BCJA 1NXKA 1OMWA 3QQGA 4UEUA 4RIXA 3E7VA 3WZUA 4D2WA 5L2QA 2W1GA 4UN0C 3E63A 4KS7A 3F2RA 5KNJA 1CKJA 2UVZA 4L7SA 4HVGA 3O7LB 1LEZA 3ENHA 1ZYDA 3M11A 3RMFA 5A6NA 2VV9A 4HVIA 1OL2A 3DNDA 4ZAUA 2PE2A 4M97A 3FZTA 4ITJA 4CD0A 5I3OA 4GU9A 3D5UA 3KULA 4XG8A 2YIYA 3A4PA 2BAJA 4CKRA 3DZOA 2GU8A 3MGYA 3ZCLA 1UKIA 4UV0A 2GS6A 3PLAE 1PY5A 2Z02A 4FEQA 4PRJA 4QQCA 4Y73A 5EYKA 1OUYA 1BI8A 3WF7A 4EQCA 2HZIA 3BPRA 5IQFA 4G34A 4BGQA 3FMEA 2PUNA 4M66A 5A46A 4CNHA 4KSQA 1JAMA 1UKHA 3R1QA 3W8LA 4KIPA 1XJDA 2EB3A 2H34A 4PMMA 2BVAA 4V01A 4X2FA 5FLFA 5M51A 3DJ5A 3U87A 2QHMA 2X6EA 3L8VA 2OK1A 3NZ0A 5DOSA 4FT3A 2WZJA 4GU6A 3BE2A 4IVCA 5FDXA 2OZAB 4BWXA 3G90X 4FYNA 2OG8A 4X2JA 5JK3A 4EHZA 4USEA 5IQAA 3FLWA 4CFXA 4XP3A 1W98A 5K5XA 4D1ZA 2PU8A 4MBLA 5EKOA 3UNJA 3UVPA 1ZWSA 4HYHA 2QOIA 3R1SA 3VUKA 4Y5QA 4RPVA 2XNGA 4IWDA 4BDCA 4TYGA 4GKHA 2X9FA 1Q8ZA 4YPSA 4JRNA 2UZOA 1UA2A 1R78A 3FZ1A 4OR5A 4IAKA 2GHLA 4X6QC 3PA5A 3MB6A 3PA4A 3CEKA 3EQHA 3H4JA 4FTTA 4K2RA 3W55A 3RINA 4BKJA 2ZV7A 3QQJA 3P78A 3LFBA 4A9RA 4ZY4A 3WARA 3CY2A 3PJ3A 2PUUA 3RAHA 5KMMA 3OP5A 4JIAA 1B38A 4M12A 1YXTA 5AUXA 3BHHA 5M44A 1W7HA 5HICA 3H3CA 4E3CA 3ALOA 4UYNA 4NH1A 4XV9A 4ZS4A 3O50A 4DH1A 4JBOA 3SHEA 3TV7A 3GCPA 4ZSGA 4O0VA 1PXMA 4BDDA 5L4QA 3TZ7A 2W1IA 2PVFA 5C4LA 3FI2A 2PUPA 2GNFA 5CEMA 3MWUA 2H8HA 2W5BA 2YERA 3BU3A 2WQBA 2O63A 2UZDA 2XBAA 4ZTSA 4YP8A 2BILB 3ZZEA 4QP4A 3AT4A 5F94A 1JOWB 2JGZA 3OCTA 2BMCA 2XMYA 3FUPA 5I9YA 5IA5A 4RBLA 4EL9A 1OL7A 4C36A 3FEGA 2VTIA 3VUIA 2GSFA 2Y4PA 4GSBA 5IDNA 3AT3A 3L8SA 5CF8A 3EKKA 2JDTA 1JKSA 3PPZA 4C3PA 1HCLA 4J8MA 5D41A 3H0ZA 4BCKA 4GS6A 1IG1A 3SA0A 1PRYA 4ORKA 3VHEA 3D83A 4C4JA 4FTLA 4XHKB 5JSMA 4F7SA 3L9LA 1M17A 2HCKA 2OF4A 3FQHA 2W9FB 2QO7A 3QTQA 4BTKA 2XKCA 4FV4A 4RQVA 4C3RA 3CPCA 3VF8A 4CTBA 3BU5A 3IGOA 2YACA 5DNRA 3RNIA 5JGAA 4Q9ZA 2QCSA 4ANNA 4G6OA 4XP0A 2G2HA 3OW4A 2QG5A 4BBFA 5IZFA 3U4WA 4M0YA 2FSMX 5CF5A 2R9SA 3FL4A 2CHLA 2XJ1A 2P0CA 4JX3A 4I6FA 3DQXA 3BU6A 3ZUUA 4D4RA 4A9TA 2VNYA 2V5QA 2UZEA 1Q24A 1WAKA 4QPAA 4DLJA 2IVVA 1SYKA 2WHBA 3ORIA 4RWLA 1YXXA 5ANIA 4I92A 5H2UA 1CMKE 2ZVAA 4GFMA 3RZBA 5GINE 4EKLA 5IUIA 4HYIA 3QUPA 2O5KA 3SW4A 4D28A 1YVJA 4QMWA 2JIIA 5HX6A 4F4PA 4TNBA 3ZUVA 4CKJA 4BCFA 3RGFA 1ZRZA 3EQDA 3T3UA 3BYOA 3V5QA 4AE6A 5HNBA 4KKEA 3H10A 3MPAA 2VN9A 4K33A 3P7AA 5KBQA 2X0GA 1VYWA 3DAKA 1PYXA 3TEIA 2VO0A 3R28A 3R7UA 3R21A 2JKOA 2R3IA 3NIEA 3TNWA 4MD8E 4ASZA 4JG7A 5HD7A 3EWHA 3WF5A 3UGCA 2B9JA 3E3BX 3MJ1A 4U41A 3FZPA 4EK5A 4OTDA 4IDVA 2OWBA 3FHIA 1SVEA 4AT3A 5LVNA 5HOAA 5AUTA 1VYZA 5L6OA 2KULA 3EQRA 4EYJA 4FR4A 2ZM3A 4RA4A 4KKHA 4WUAA 5E8XA 4WRSA 1F5QA 3QRJA 4XNEA 4RZVA 3V6RA 4LMUA 5BUEA 4FL2A 3R9RA 2CPKE 3VBYA 2YLFA 1QL6A 5GHVA 1PMEA 4FSUA 3ZSGA 4FTUA 1XH9A 2PWLA 3BLQA 3GNIB 3UP7A 1XQZA 1QPDA 2WIPA 5LMAA 3W33A 1JWHA 3TUDA 3ORMA 4O6LA 1F3MC 3VBVA 1YOLA 2BAKA 1FVRA 5CNNA 3LM5A 4O6EA 5IA3A 4G3GA 2VU3A 3UO4A 2W9ZB 3OW3A 4HVSA 1XHAA 2CCIA 1S9IA 5AP3A 4DHFA 4IAAA 3I4BA 3EKNA 3D2IA 4GL9A 2JIUA 3OTVA 4LGHA 1UV5A 2C5VA 2V62A 4OBPA 5AWMA 3TNQB 4AACA 3FQSA 2UZVA 2WTVA 3I5ZA 3UVQA 4JBVA 3K5UA 1JPAA 4RWKA 2R5TA 4KBKA 4O0RA 4R1VA 5AUYA 1CM8A 2J2IB 1OKWA 1XBAA 2YAKA 3UDBA 2WFYA 5CYIA 2B9FA 2IO6A 3BWJA 3ZZWA 5HLNA 2C6OA 3NCGA 2VWZA 2F7ZE 2VTPA 3CJGA 4MF1A 4EBWA 5HNIX 1W8CA 4AF3A 1SZMA 4B4LA 3FI8A 4E93A 2F9GA 4U7ZA 1RW8A 4WD5A 4RLKA 4NUSA 2GNHA 4M13A 4IAFA 2ZAZA 4OTRA 4AG8A 3TNPC 2Y6OA 3E8EA 4HGTA 2ZMDA 4OGRA 3W16A 5FTGA 3O51A 3NS9A 1OI9A 1QPCA 3R2YA 4XYFA 4S33A 3IQ7A 4FBXA 2WMBA 1DAWA 2ZM4A 2EB2A 3BELA 1XH6A 2YZAA 3DTCA 3FLZA 3NNVA 2XK4A 2GS7A 2YDJA 3I6WA 4XP2A 4ZJJA 3MIAA 4BCHA 4GFGA 3CBLA 2Z2WA 4FZ6A 1YW2A 4GK4A 4RFYA 5HCYA 4BDIA 1JKLA 4D1XA 3NDMA 3V5WA 3T9TA 3SKCA 4O7RA 3ZM9A 2UZUE 3G9NA 4DT8A 4EH2A 2QOBA 1J3HA 2WMSA 3LPBA 3NIZA 3HMOA 4X2NA 2OICA 3POZA 3UOHA 2Y0AA 2YCQA 2O2UA 3C4EA 2NO3A 3F5GA 3GCVA 4EH7A 3KA0A 2C3LA 4EHEA 1QPJA 3V04A 4FK3A 3V8TA 4DA5A 5G1XA 2XNOA 3AMBA 4YZ9A 5HE3A 2DUVA 1TQIA 1YKRA 5AV1A 4EOQA 2C5XA 1OPLA 2W4KA 4FICA 5JQ5A 2WB8A 3DXQA 5CT7A 1GIJA 4CYJA 2AYPA 3RAKA 5BUIA 3MBLA 4DGLC 3EN7A 4W9WA 2J0LA 1HCKA 2P55A 3BGQA 2X7FA 2OIBA 3OXIA 5L8JA 4GK2A 3WE4A 1IAJA 3DXPA 5DBXA 3NRMA 3R1NA 2W1EA 5FM2A 3HNGA 4PP7A 3OWJA 5EKNA 4QOXA 5AV2A 1LEWA 4KRCA 2F2UA 3RWQA 4D4YA 3TIYA 4X2GA 2WXVA 1R1WA 2O3PA 3IDCA 4OTQA 3RJCA 3MY0A 4B7TA 5IH6A 4YO6A 1UNHA 4IFGA 4KB8A 1Y8YA 1DS5A 4I6QA 4RIXB 4WRGA 2OF2A 4ZS0A 2ZV8A 3KRLA 2I0HA 3QZFA 1BL6A 4ALVA 5IA4A 1MP8A 2E9PA 3P1AA 3SGCA 4H1JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3UTO A;  4AU8 A;  5BUJ A;  4CG9 A;  4K9Y A;  3PRI A;  5LOH A;  3PXR A;  4FTO A;  3GU4 A;  1ZOH A;  4R77 A;  2QR7 A;  5IQG A;  2ITY A;  2CJM A;  1OIY A;  3QC9 A;  3Q5Z A;  4ZJI A;  2HEN A;  2ONL A;  4AGC A;  4J99 A;  4WNK A;  3AGM A;  1WBT A;  4BI1 A;  4FKU A;  3GCS A;  1KE9 A;  4YU2 A;  4FGR A;  1G8K A;  2IG7 A;  3C5I A;  2Y8O A;  2VD5 A;  5CAL A;  4OTF A;  4M8T A;  2VTT A;  2XNE A;  3G15 A;  4ZTM A;  3L9P A;  1TFF A;  3CD3 A;  5FTQ A;  2NRU A;  4W8E A;  2R3L A;  1ZYJ A;  2PYW A;  4C4E A;  4C4G A;  5HCZ A;  4F6S A;  5HIE A;  4D55 A;  4WNP A;  5E8T A;  3RVG A;  3BZ3 A;  4IJP A;  5AAG A;  4Q9S A;  4X7Q A;  2C6E A;  4EWQ A;  4FEU A;  4JQE A;  2PHK A;  3OCS A;  2CGW A;  1XKK A;  4E5A X;  4DED A;  1Q61 A;  2F2C B;  5M4C A;  4XG4 A;  3PPK A;  2IVS A;  2CKE A;  3PSC A;  5CSH A;  5EW9 A;  4UMQ A;  2PZI A;  3H0Y A;  4G9R A;  5BNJ A;  3ZTX A;  4G6L A;  4CEG A;  4JR3 A;  3V8W A;  2J0K A;  3UZT A;  2JAM A;  3D14 A;  4BR3 A;  1P2A A;  1MRU A;  3E92 A;  3TKI A;  2RSV A;  1FQ1 B;  4K0Y A;  4TYE A;  5HOR A; 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