4AE6A

Structure and function of the human sperm-specific isoform of protein kinase a (pka) catalytic subunit calpha 2
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
339
structure length
319
Chain Sequence
SSDVKEFLAKAKEDFLKKWESPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHKETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA 2
publication title Structure and Function of the Human Sperm-Specific Isoform of Protein Kinase a (Pka) Catalytic Subunit Calpha2
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 100
structure length 319
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ae6A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ae6A02
3BCEA 5E7RA 4KIOA 4NJ3A 3EKNA 2WAJA 4PQNA 3HP2A 2B9HA 2OG8A 4BI2A 4DLIA 2QO9A 3R1YA 4XOZA 2EXMA 2WQBA 1SYKA 4UZHA 4B9DA 5TO8A 4EOKA 4PNKA 4MAOA 5A6NA 2R3FA 4N6YA 2AYPA 4RC3A 3SOCA 4NCTC 3LQ5A 5CLPA 2VWIA 3RPRA 5AFVA 3W2PA 5JQ8A 5J5TA 3RCDA 4RMZA 3E92A 4DH8A 2QU5A 3AD6A 1PW2A 2FYSA 2F2UA 5FDXA 2X81A 3PXFA 4FV2A 4FV5A 1ZZLA 3FMJA 4RGJA 5EM5A 1UNLA 2PVKA 4W9XA 4F0GA 4CVAA 4ZZOA 5GZ8A 5IQAA 2A19B 3I60A 2PVYA 5AUVA 2BDWA 2UW5A 1GZOA 5AA8A 3HAMA 2H34A 2QOFA 4BDAA 3GU6A 5JGDA 3MY1A 5ETIA 3CGOA 5KMKA 1YXVA 4RBLA 2P2IA 4LM5A 4TWPA 3VUMA 4IAIA 4MK0A 4QYGA 5IH4A 2W06A 4EH8A 4MXZA 1LEZA 1ZZ2A 3MTFA 5E90A 1T46A 3L9LA 5E1EA 3VNTA 1DM2A 3I5NA 5DE2A 4UYAA 4CZYB 5B2LA 3VRZA 4DFZE 4RIYA 5KBRA 3FC2A 5M57A 3QHRA 2O3PA 5AIKA 3WZEA 3IKAA 1XO2B 2UW9A 4IANA 5FRIA 3TNIA 2QKRA 4YZNA 1H25A 3F88A 2XB7A 5EQEA 4FL2A 4D58A 3FQEA 4MXYA 3VBTA 1Q8YA 4IAKA 1JBPE 4F6UA 3ANQA 3KU2A 1XH6A 5AP6A 4QMTA 3QZIA 1QCFA 4XBUA 4NH1A 3MJ2A 4JX7A 2NRUA 4FMQA 3KK8A 3OBGA 3GFWA 2W1FA 4DGLC 4JBQA 4RJ4A 5ANOA 2C6MA 2XF0A 3O8UA 4IAAA 5CZIA 2WMBA 4EH5A 2QO2A 3B2TA 4O0VA 3JY9A 3UNZA 2WTVA 3C5UA 4I22A 4IAZA 3LFNA 3VUDA 3IG7A 2V5QA 4ITHA 4M13A 4XHKB 4ZSAA 3DBEA 3ANRA 1FVRA 3OEFX 4HPTE 4UMUA 4FGBA 4NM7A 4RWJA 3ZUTA 3C0HA 4EK8A 1QL6A 3KXHA 3KREA 4EC8A 4BDBA 3N4UA 3L8SA 2CHLA 3ZO3A 1R78A 2Z7QA 4TYIA 5FM2A 5LMAA 5KMMA 2E9UA 2ETRA 1M2QA 5IA1A 4H05A 3JVRA 2PTKA 5KMOA 1Z9XA 2WTCA 1QPEA 1K9AA 3OXIA 4ALVA 3EQBA 4WA9A 2JD5A 4AOIA 1UKHA 3DB8A 3HRFA 4YJQA 4AACA 4RIXA 3KN6A 1KV2A 4PP7A 4IQ6A 4PMSA 3FV8A 3TI1A 3EFKA 3PP0A 3FLYA 3R7OA 3IECA 3PJ1A 1WBNA 3QYZA 3P9JA 4I5CA 3RHXA 3ZRKA 2W5AA 4ZS4A 4JL9A 3G15A 5BVKA 2BDJA 4D5KA 4YBJA 3A7IA 1UWHA 4Y73A 3FSFA 3NPCA 3QA0A 4FSWA 4IVDA 4NYEA 4BWXA 5E8VA 4AT3A 2OIDA 4FEQA 4XJ0A 3KXMA 1Z5MA 2XNPA 3HMMA 2C5VA 3CTJA 5M4CA 2ITOA 4QMVA 1FVVA 3R7UA 2XP2A 3OMVA 2YISA 2J7TA 2PE2A 2X9EA 3AXWA 1WVYA 2XIXA 3A61A 3VN9A 5CVGA 3DCVA 3ELJA 4MXXA 2REIA 4QMUA 2J0LA 3CY3A 3GENA 3GXLA 2QOCA 2OK1A 4TW9A 3UOHA 4CZTA 3EFLA 4KINA 4EH9A 5IU2A 4J1RA 4C37A 3FPQA 3RI1A 1FOTA 1GNGA 4JDKA 4QYYA 4HVDA 1PMNA 4DEBA 2Y7JA 4FSZA 4BDFA 2EU9A 1OVEA 4FSTA 1OUYA 5HQ0A 3EZRA 1GIHA 3B8RA 3HECA 3O50A 2ZMDA 4Q5EA 5L6WL 2FSOX 2QQ7A 4IX4A 4MEDA 4MNEA 5CVHA 4XG8A 4APPA 5AA9A 5LWMA 2C6EA 4KB8A 4A9TA 2C1BA 3NVMB 5BUJA 4BR3A 5CX9A 2DUVA 2F7XE 2PUIA 3NNWA 2IG7A 4HZRA 3GU5A 1RW8A 1OECA 3R8LA 4XG3A 2UVZA 4KIPA 4BDCA 2VD5A 4ZXTA 5CEIA 3RWPA 3U9CA 4B8MA 5GIOE 3DS6A 3MPAA 5HLWA 4EOMA 2ITNA 3MWUA 4OTHA 3D2KA 4XV3A 4L44A 3G2FA 5DN3A 5A4EA 4FKUA 4L7FA 3SLSA 4DGNA 1R39A 1ZARA 4B0GA 2I7QA 3ZBFA 5EH0A 4V0GB 2HIWA 3QU0A 4JQEA 5CU6A 4JOAA 4X3FA 4OGRA 1ZMUA 4O2ZA 5FGKA 1XQZA 3KRRA 5BYZA 3WIGA 2HW6A 3ZDIA 3JY0A 3C0GA 3OXTA 2QOQA 3COIA 2C5XA 5DR6A 3I6UA 3KB7A 4KSQA 3IW4A 3MI9A 3GU8A 3ZM9A 3PXKA 4ANMA 1U59A 2RG6A 4ZSEA 1T45A 4A07A 4BDHA 5HO7A 4MNFA 3CPBA 4XUFA 3QQJA 4KRCA 2O65A 4BZDA 2WIHA 2XK7A 5CSWA 4IEBA 3CTHA 1SVGA 4GG7A 4HYIA 4I5MA 2PU8A 3ACKA 1SVEA 3TZ9A 1V0OA 4YP8A 2BRBA 3UDBA 4NL0A 4DH1A 3PPJA 3F2NA 2C6IA 4LFIA 3WI6A 3LQ8A 3MN3A 3D5UA 1UU9A 2VRXA 1FGIA 5EHYA 3KMWA 1W82A 4FUXA 4DFXE 3DFCB 4FZ7A 2ITWA 2I40A 2O8YA 3EN7A 4XV9A 4G5JA 1JAMA 4NW5A 2LAVA 5TKDA 4YZMA 3IW6A 4L43A 1JPAA 4K6ZA 3NW7A 5AR7A 3W55A 5I5ZA 3QZFA 1ZMVA 3DJ5A 4J71A 4C4GA 4QMMA 4YGAA 4IW0A 3PE2A 3PSCA 4CEGA 4WNPA 4Y83A 4PPAA 4BTMA 3SOAA 3RM6A 4BTFA 3EOCA 4ENYA 3FZSA 3PIXA 4RIYB 5DOSA 3FKLA 2UW3A 3HUBA 1DS5A 3ZXZA 3NUNA 5J7HA 1OUKA 4AN3A 2PVNA 1YHVA 2C6OA 4F09A 4XEYA 4DH5A 4BY9E 4GW8A 1ERKA 3NYXA 4J7BA 4L42A 2EWAA 2UW0A 3EQDA 5HG9A 4C02A 3FMMA 4XBRA 3PA5A 5D10A 5G1XA 4HGEA 3LM0A 1H1RA 3FUPA 4FG7A 3QUDA 4TXCA 1GZ8A 4R1YA 3S4QA 4EHGA 1JKLA 4G3EA 1CMKE 4W4XA 5L2SA 3P7AA 4FTMA 3R2BA 3ODYX 4CKJA 2W1DA 4DTBA 3EKKA 1PMVA 4C2VA 2J5FA 3PYYA 4QPAA 3OROA 2XVDA 3QALE 3H9RA 3NAXA 3UIUA 4PPCA 3ZC5A 3D7TA 3R83A 3EWHA 3NDMA 5AUYA 1YI4A 4FEUA 2GNHA 1S9JA 2NRYA 4LQMA 5JFXA 2LGCA 1NY3A 3DAJA 3Q2MA 5HBHA 3I7BA 2BCJA 3UO5A 5KMNA 4QQTA 3UNKA 4RSSA 2PSQA 4WKQA 5DT4A 2X2LA 4JBVA 4ZTHA 4DGGA 3NNXA 4HJOA 4QYFA 2GHGA 4K77A 5JH6A 4BCGA 4EK4A 4BIBA 4AA4A 2HXLA 3CY2A 3R7IA 3UO4A 4C33A 3DXPA 2C3KA 3V6SA 4FT9A 2VWYA 3W18A 3MFTA 3CEKA 4CTBA 3CSVA 3BBTB 2BMCA 4IWDA 4D4SA 3H0YA 5M51A 4PY1A 4J8NA 1I09A 3GEQA 4YSJA 5IPJA 3VBYA 2WMQA 3CTQA 3NW6A 2IVVA 2PWLA 4XCUA 3RK9A 4N6ZA 3QYWA 4FE2A 2IJMA 3QA8A 4Y72A 4AXAA 3A4PA 5HIDA 1KOAA 3FXXA 3OS3A 5DH3A 3O96A 4IAYA 4C3RA 4PL3A 5CEPA 1KE7A 4F9YA 3R01A 4O83A 5LMKA 3PPZA 3F3WA 2WELA 3Q6WA 4HCVA 1UU3A 1OIRA 3TKIA 5HCXA 4BHZA 2ZVAA 4G34A 3HRCA 3WF7A 5CAQA 3NUSA 4YJRA 2I1MA 1O6KA 2BZJA 1XH9A 2OZOA 3TIYA 3DGKA 2C47A 2E9NA 4FA2A 5HNIX 5CI7A 4GIHA 1HCKA 2ZM4A 4W4YA 3HAVA 4KNBA 2J4ZA 5JFVA 3NIZA 4RFZA 5LVMA 4F9CA 2BKZA 3DNEA 1TQPA 3DXNA 4I6BA 4U6RA 2B9FA 4BN1A 2G9XA 2J0MB 3UMWA 2G1TA 4XRJA 2OIQA 1B38A 1WVWA 3CIKA 3FL4A 3LPBA 4BDDA 3UTOA 2WHBA 4IHPA 2WU7A 3ACJA 4L7SA 2YCRA 1PYEA 4O6EA 3W16A 5FEQA 4EEVA 5IUHA 4F4PA 4O7SA 1H0VA 1R0PA 3OC1A 2Y4IC 4RRVA 3MVHA 2WOTA 3COMA 3ZLYA 3PY1A 3VW8A 3A7GA 5EW9A 3QX2A 5LQFA 1Q24A 2RSVA 3K3IA 4HYUA 1QPCA 4EUUA 1OB3A 3NLBA 3SVVA 4O22A 3SKCA 3AD4A 4O0RA 4XP2A 4FTIA 1X8BA 5E8YA 2PL0A 5A9UA 2R3MA 1OKWA 3R9DA 1BX6A 1Q99A 2UW4A 1JLUE 3F2AA 1ZOHA 4M97A 5LVOA 3KFAA 1DAWA 1UA2A 4K33A 2OFVA 4YPDA 1H07A 4QYEA 5M4UA 2Y4IB 1JOWB 2F7ZE 5CU0A 3DB6A 1H27A 5BVWA 5CAUA 2QURA 4FVPA 4RC4A 3JS2A 4CFUA 4D1ZA 2PVFA 3NYVA 5GNKA 4EOOA 3R1SA 4OT5A 3S00A 3ZC6A 3LCTA 5EOLA 4FL3A 2V7OA 3TNQB 4DYMA 5TF9A 2BDFA 2NPQA 4C36A 2C69A 2ZAZA 3D94A 2WTJA 3AMYA 3BLRA 3DNDA 4QQCA 3F3TA 4J53A 4QRCA 3NIEA 3PIZA 3R8VA 1MRVA 2ERKA 3UVPA 5HOAA 3D4QA 4H1JA 1CSNA 1YXTA 4MYGA 4ZY5A 3Q32A 2CKEA 1K2PA 2YM8A 4LI5A 3ZCLA 4X7QA 2CNUA 4RIWB 4GU6A 5DT0A 3F69A 4R3RA 5ANEA 4UMPA 4FKVA 3RWQA 2G15A 3QQHA 1H1WA 1UWJA 4G6NA 1DI9A 4DG2E 4BIDA 5IA5A 4QP1A 4BCIA 4F1TA 4FV1A 2QI8A 3BX5A 3TDVA 4ZK5A 4N57A 5EHLA 1I44A 4FKSA 1G8SA 3FZRA 1XKKA 2HXQA 4IVCA 2W99B 1LEWA 2Y0AA 2WTIA 3GU7A 4P5QA 4R7IA 4M12A 3TEIA 3VQHA 3C4CA 4U7ZA 2JKMA 3HKOA 4AZEA 4C8BA 3AC4A 2W96B 5DNRA 2X39A 4F08A 2QOKA 4WNKA 2C4GA 2IZTA 5M56A 2JAMA 2R64A 3Q60A 5AAGA 3HEGA 2WXVA 4F0IA 1W84A 1OIYA 3FLQA 5HLPA 5DRBA 1U46A 4XS2A 3C5IA 2VGPA 4E5AX 3UP7A 2BFYA 1Q3DA 4ID7A 4LRKA 3BHHA 3EHAA 4ORKA 5DIAA 1J1CA 1XBBA 3D9VA 5AR8A 2XK8A 3VS2A 5FXRA 5CEOA 4U0IA 4UMTA 5I9WA 1B39A 1ZRZA 5DI1A 2W0JA 3VRYA 4WHZA 4RA4A 3G51A 3GCSA 4NUSA 4W9WA 5EW8A 3IQ7A 3LFEA 4J98A 5JN2A 3F9NA 1SNXA 4CG9A 2BIYA 3OCGA 4A4OA 4GVAA 5AUZA 4EWHA 4AWIA 4HCUA 3ERKA 4O81A 1H8FA 2GS6A 1FINA 4D0XA 3BGQA 3QXPA 2I0YA 3QQUA 4D1SA 2Z7LA 3BELA 4QP3A 4C4HA 3E5AA 2GS2A 3IGOA 4YO4A 4R77A 3MA3A 4G16A 2YIQA 5GJFA 3COKA 4KBCA 2QNJA 4Y8DA 2QOIA 3JUHA 3UQGA 4ACMA 1XBCA 4H3BA 4MBIA 4FVRA 5IEYA 4LMUA 4O91A 2C6TA 2W1IA 4X2KA 2JBPA 2YDJA 3VAPA 4KKHA 4YJVA 4DLJA 1URCA 4I0RA 2VN9A 2WB8A 4RJ5A 1ND4A 3BWJA 4BTKA 4ZSLA 5J1WA 3E8NA 5DEYA 5DVRA 3PE1A 3RM7A 5C8NA 3UPXA 2GQRA 2XM8A 4OTFA 1PKDA 3RPVA 4PDSA 2ITVA 3MB7A 2QD9A 5HTIA 1XHAA 3JPVA 4PMTA 5C9CA 3EJ1A 3S1HA 3U9NA 4BWKA 3TXOA 2W1HA 3GC8A 1YHSA 2R4BA 5CENA 4OW8A 3NCZA 2RIOA 4IB1A 3E8EA 3R6XA 3PY3A 5F4NA 4ACCA 4O7TA 3A2CA 1A06A 4F65A 3OW3A 4H58A 3AT4A 3QD2B 4GCJA 4G3CA 4QYHA 3OUKA 2W17A 4XX9A 4A9RA 4E20A 1FBNA 2VO0A 1SM2A 4NTSA 4X0MA 1O9UA 2OJ9A 3QRJA 4PTEA 4NM3A 5M55A 4ANOA 4MQ1A 4DTAA 3UQCA 4GIIA 2W4KA 3K3JA 3Q4TA 3QWJA 3ENHA 2I0EA 5AM7A 3W2SA 2ZV8A 4YC6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3BCE A;  5E7R A;  4KIO A;  4BJJ B;  4NJ3 A;  3EKN A;  2WAJ A;  4PQN A;  3HP2 A;  2B9H A;  2OG8 A;  4BI2 A;  4DLI A;  2QO9 A;  3R1Y A;  4XOZ A;  2EXM A;  2WQB A;  1SYK A;  4UZH A;  4B9D A;  2X0Q A;  5TO8 A;  4EOK A;  4MAO A;  4PNK A;  5A6N A;  2R3F A;  4N6Y A;  2AYP A;  4RC3 A;  3SOC A;  4NCT C;  3LQ5 A;  5CLP A;  2VWI A;  3RPR A;  5AFV A;  3W2P A;  5JQ8 A;  5J5T A;  3RCD A;  4RMZ A;  3E92 A;  4DH8 A;  2QU5 A;  3AD6 A;  1PW2 A;  2FYS A;  2F2U A;  5FDX A;  2X81 A;  3PXF A;  4FV2 A;  4FV5 A;  1ZZL A;  3FMJ A;  4RGJ A;  5EM5 A;  1UNL A;  2PVK A;  4W9X A;  4F0G A;  4CVA A;  4ZZO A;  5GZ8 A;  3NFG B;  5IQA A;  2A19 B;  3I60 A;  2PVY A;  5AUV A;  2BDW A;  2UW5 A;  1GZO A;  5AA8 A;  3HAM A;  2H34 A;  2QOF A;  4BDA A;  3GU6 A;  5JGD A;  3MY1 A;  5ETI A;  3CGO A;  5KMK A;  1YXV A;  4RBL A;  2P2I A;  4LM5 A;  4TWP A;  3VUM A;  4IAI A;  4MK0 A;  4QYG A;  5IH4 A;  2W06 A;  4EH8 A;  4MXZ A;  1LEZ A;  1ZZ2 A;  3MTF A;  5E90 A;  1T46 A;  3L9L A;  5E1E A;  3VNT A;  1DM2 A;  3I5N A;  5DE2 A;  4UYA A;  4CZY B; 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