4C4JA

Structure-based design of orally bioavailable pyrrolopyridine inhibitors of the mitotic kinase mps1
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
279
structure length
261
Chain Sequence
QSMSVKGRIYSILKQIGSGGSSKVFQVLNEKKQIYAIKYVNLEEADNQTLDSYRNEIAYLNKLQQHSDKIIRLYDYEITDQYIYMVMECGNIDLNSWLKKKKSIDPWERKSYWKNMLEAVHTIHQHGIVHSDLKPANFLIVDGMLKLIDFGIANQMQPDTVGVNYMPPEAIKDMSSKISPKSDVWSLGCILYYMTYGKTPFQQIINQISKLHAIIDPNHEIEFPDIPEKDLQDVLKCCLKRDPKQRISIPELLAHPYVQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords DUAL SPECIFICITY PROTEIN KINASE TTK
publication title Structure-Based Design of Orally Bioavailable 1H-Pyrrolo[3, 2-C]Pyridine Inhibitors of the Mitotic Kinase Monopolar Spindle 1 (Mps1).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 261
sequence length 279
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2013-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4c4jA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4c4jA01
3R00A 1BMKA 4R3PA 2JLDA 4XNEA 4I5MA 5M51A 4TYHA 5ETAA 4FKUA 4IM3A 3IW4A 3LFQA 3LCKA 2YERA 4FV1A 4KIPA 1GAGA 4C0TA 2OZOA 4GH2A 4CKIA 4EK6A 5HIEA 3UNKA 2CLXA 4F6WA 4YHJA 4N4SA 2YHVA 4BWXA 1M2RA 4YZCA 4R3CA 4FR4A 3PP0A 4FV3A 3W2QA 4O1PA 5J1VA 3ZO4A 3MIYA 3PZHA 2R0IA 2W4JA 4UMQA 3K5VA 3LMGA 4IVAA 3CIKA 4K11A 3V5LA 3TV6A 3Q2JA 2PMOX 3DCVA 4WSYA 5DHJA 4F7SA 2P2HA 3DK3A 4TYGA 5CQUA 5EOLA 2BAKA 2KTYA 3WARA 5DLSA 3FLWA 3E8EA 4KNBA 5A14A 5AP6A 5M57A 4G6LA 3FQEA 4HYUA 1KV2A 2C6LA 5IUHA 1P4OA 3BIZA 1FOTA 4WUAA 5FXQA 3PSCA 3R1SA 2VUWA 3HDMA 2GHGA 4ITJA 2O8YA 2RGPA 4JXFA 1JOWB 5FM3A 4R7HA 3ROCA 2QR7A 3ORNA 2GNJA 4QRCA 4YSJA 5A54A 5IUGA 3B8QA 2ZVAA 5J7HA 2Z60A 4JS8A 4RFMA 4X7QA 4FV8A 2BRNA 1LPUA 4DH1A 2RFSA 5CLPA 3MS9A 5J9LA 3DU8A 3TJCA 5C1QB 5KKRB 4AE6A 5DWRA 3VC4A 2YJRA 1OL7A 3A61A 4NSTA 4TZRA 4ZLOA 4XG7A 5HQ0A 1J7IA 5KMOA 4BGQA 2WTKB 2ITXA 3OF0A 4WIHA 1TQPA 5HBHA 4FSYA 4OBPA 4CKJA 3QXPA 4IIRA 4IDVA 1DAWA 2R9SA 3MVLA 5CYIA 2W9ZB 4WG3A 1FPUA 3A99A 3PWYA 4BRXA 3FMLA 1GZ8A 3QRUA 4FZFB 5HTCA 2OF2A 5FG8A 1G5SA 2W4KA 5LCKA 5M06A 4F63A 3D9VA 3E8CA 5CXZA 3FHRA 2W05A 2X6DA 5IF1A 1ZY5A 1UV5A 3HVCA 1M2QA 2CGWA 3RK5A 1QPCA 3V01A 2R3PA 2JKQA 3PSBA 4DTBA 3OY3A 5DFPA 4E6CA 3F66A 3Q9YA 3ZYAA 3FE3A 4DN5A 2JBPA 4YZDA 5EYCA 5CVGA 3NSZA 3AD5A 4DE4A 5DT0A 1YKRA 3QD2B 4ZTNA 5E8TA 2JAMA 4DITA 3WZEA 3A7GA 1XBBA 2Z7SA 3BU6A 4GL9A 1U46A 3ZZEA 3HV7A 3LCTA 3UQCA 2YCQA 1SMHA 3R22A 4FYNA 4FT0A 4HCUA 4QP6A 3TZ8A 3JVSA 3KCKA 3ZH8A 2CCHA 2RG6A 4JG8A 5LMBA 3SVVA 1FMKA 4XYFA 5CF8A 2DUVA 3ZTXA 3R73A 4W4WA 3G6GA 4B6LA 4D9UA 3GC7A 1OM1A 5AX3A 2BKZA 4RIYA 4XHKB 3V8SA 2XCHA 2OJJA 5H9BA 4E3CA 2BILB 2YN8A 5FQDC 4NZWB 4E5AX 4CFFA 1YOJA 4BCNA 3AGLA 3JR1A 3BE9A 2WD1A 4A7CA 5HU3A 4EBWA 4OAVB 3SG9A 3QTSA 1KOBA 3ACKA 1Q5KA 4O2ZA 4FT5A 4W4XA 5CZIA 3D5VA 4UMUA 5BYYA 1H28A 4JVGA 2V55A 5AA8A 4XP0A 4II5A 2UW4A 4WUNA 4UZDA 4EK4A 4ASZA 3DJ5A 3E7OA 3DKOA 3OEFX 3IECA 3LXPA 4RWIA 3C4WA 4F08A 3NWWA 5DG5A 4BICA 4JQ8A 4IEBA 4ZTLA 5KHXA 2W5HA 4CSVA 3OWJA 4QP7A 3UG1A 2R64A 2XA4A 3R30A 2VO0A 4Y5QA 5GJDA 4AAAA 5BUIA 2B0QA 3I1AA 4V04A 4BWKA 4EHZA 3BHVA 3P7BA 4DFBA 3QTWA 4LOPA 2I0HA 3DB6A 2BMCA 3MI9A 3MPTA 3RAWA 4ZTHA 3WYYA 4CFNA 2OJIA 4DC2A 5HI2A 4TL0A 4ALWA 2W99B 4NCTC 4YC6A 4RC3A 3VUMA 4EUUA 3HV3A 4BCFA 4O7RA 4E4MA 4IVDA 3IW5A 3QRTA 4AW2A 5L2TA 5IQAA 2ZAZA 5IZFA 4IH8A 5E4HA 2J50A 3BLHA 4BTJA 3NAXA 4FSUA 3PY3A 3RM6A 2QO2A 5HICA 3ZO2A 3LOKA 4BDJA 4O7SA 3PPZA 1OKWA 1KE7A 1GOLA 3F82A 4EJ7A 5FTOA 3VHEA 3CGOA 3I81A 3JUHA 3NIZA 2PUUA 1OGUA 5IMEA 4HCTA 4G3FA 4E26A 2UZWE 3ZZWA 3BYMA 3SOAA 2BKKA 4AACA 4Q2AA 3EYGA 1Q8WA 3E8DA 3N9XA 5BVKA 4X3JA 1OIRA 1WCCA 2VTJA 1WBSA 3C13A 3D83A 2X9EA 3GC8A 4YP8A 4O84A 4F9YA 3FLQA 1PYEA 2PVJA 4DH8A 2O3PA 4YU2A 1M7QA 3QLGA 3KCFA 5C4LA 4OTHA 3M2WA 3COHA 4NKSA 5L6WL 3QYZA 5HE0A 4IX5A 4BIDA 2RFDA 4MQ2A 2WQEA 3NGAA 4D1SA 3VBTA 3VUKA 2BR1A 3QQKA 4M66A 2QG5A 5IG1A 2BCJA 4ALUA 2C3JA 4O6EA 4EH2A 4J96A 3QX4A 3VF9A 5HO7A 4BB4A 2WMXA 3BLQA 2GQRA 2PVRA 4RX9A 4R8QA 3KMMA 3LXNA 1LUFA 2W0JA 2ERZE 2OJFE 2R3GA 2UW7A 3ORKA 4G3DA 5DT3A 3FZOA 4H36A 4UY9A 5BYZA 4RJ5A 4YJTA 3EFJA 1CM8A 1XH8A 2YJSA 1PXOA 2BDWA 4DAWA 4JQEA 4FSQA 4KB8A 3TACA 2QLUA 4FUXA 3VS4A 4B8LA 2V62A 4LRKA 5CT7A 4DF3A 4FSRA 4AW1A 4NK9A 5DA3A 2PSQA 1RW8A 1NW1A 3F2AA 3BWJA 3V51A 4UYNA 4UXLA 4XMOA 3ZLWA 3CBLA 2ERKA 3KKVA 3RHXA 5HE3A 4YZ9A 3ZC5A 4A9RA 5HCXA 3WF7A 2OXYA 4RPVA 4FODA 2HYYA 2XIKA 3LFSA 5CT0A 5CF5A 4G16A 3TNPC 3ZOSA 2F2UA 5J7BA 5JMSA 5LWMA 4UXQA 4DEDA 5CS6A 4D0XA 3M1SA 4HZRA 1Y91A 4DT8A 1K2PA 3DOGA 2ITUA 5EHOA 2R7IA 3FZPA 2ZV7A 3MTFA 3PIZA 3ET7A 5M56A 5LVLA 3R7OA 5M44A 3ZXZA 2YISA 3QUPA 2LAVA 4RJ3A 4DH5A 3UP2A 4PDPA 4X6RA 4ANLA 3ORPA 2VTTA 1YI4A 4XLIA 3VAPA 4BTKA 4NJ3A 5FM2A 2YITA 3S00A 5TO8A 3E5AA 4RJ4A 3QD4A 1IR3A 4MVFA 3ZUVA 3KL8A 5TKDA 3GOKA 3V5WA 4CD0A 2P55A 2XP2A 3FJQE 3VRYA 4C57A 4EK5A 4UMRA 5I3RA 3CXWA 4FZAB 2XRUA 1J7LA 3Q4UA 2GS7A 4DG2E 3QCXA 2VWUA 2WMAA 3SXFA 5BMSA 4M0YA 3F5PA 4O27B 5J5SA 4O7NA 3ZM4A 2A0CX 3FSFA 1XWSA 3SX9A 2P0CA 2C0TA 2IPXA 3A4OX 5DNRA 4UWBA 3L9MA 4C8BA 3OCGA 2C6IA 4PMPA 3NVKI 3OVVA 3FMNA 1H1QA 3RCJA 1RE8A 2C6DA 3GT8A 4F7LA 3R7VA 3C51A 3KXGA 1XH5A 2VAGA 3RJCA 3OG7A 5HVKA 4DEBA 2YIRA 4GMYA 4OBQA 5EQPA 2X2MA 4K1BA 4EQUA 1FMOE 5HBJA 3G0FA 5ANIA 3VO3A 3UO6A 4IMYA 2X4FA 5CAUA 3VS0A 2ETRA 3KRRA 4P2KA 2GFSA 2VX3A 3R83A 5J87A 4JDJA 1H0VA 1O9UA 4RMZA 5J9YA 4O86A 4GUBA 2X81A 5DGZA 4R1YA 5A9UA 5CEKA 2UVXA 2XNEA 3F3WA 3R7YA 3FXWA 3TCPA 3DKFA 3TM0A 4QQJA 3Q9ZA 3PJ3A 4XV1A 3RHKA 4L00A 2PK9A 3W16A 3W1FA 2QOHA 3WF8A 4D4VA 3ENHA 2YAKA 3DNEA 4EL9A 4NT4A 4CFUA 2BRMA 1URCA 4HVGA 3DBDA 3V3VA 3TNHA 5C27A 3ACJA 4RLKA 4O0YA 3ANQA 4YC8A 5DBXA 4TKSA 5HIBA 5L6OA 5DR9A 4IB1A 5LMAA 4AS0A 4CZUA 4Z3VA 4FGRA 5D11A 4AZSA 3FZSA 5AUUA 4HNIA 3K3JA 2OJGA 3BEAA 4AN9A 4LRJA 5AUVA 4U9AA 2BZHB 5C8KA 4AA5A 1J1CA 3LLTA 4H1MA 3I0OA 4KAOA 4ZZOA 3C4FA 4BDHA 2OH0E 4LYNA 3H0ZA 1J7UA 3QHRA 1FVTA 5IA0A 4LV5A 2J4ZA 1UU9A 3H3CA 3PTGA 2C6TA 5C4KA 1U5RA 5EI8A 4O96A 3O8UA 1G8SA 4M12A 3UG2A 5IH5A 4BR3A 5F20A 2VO7A 5J8IA 4CYIA 4MCVA 4IZ5A 2J9MA 4ONAA 1XBCA 1YOMA 4CCUA 4FZ6A 5B2MA 3FKOA 2PL0A 3ETAA 4FG7A 4AG8A 3VQUA 5EKNA 3TKUA 3DDPA 1Y57A 2EVAA 3UIUA 4BCOA 4HGEA 4IM2A 3LM5A 3P79A 5KMKA 2C3KA 4R7IA 2ITWA 2I7QA 5M08A 2JKOA 3TG1A 1JVPP 3PWDA 5GINE 3H9OA 4ASDA 4JR3A 2ETMA 2J5FA 2YCSA 4YJNA 4CTCA 4DINA 3FY2A 2E9VA 4UWYA 1OI9A 1OITA 1YHVA 1V0BA 3KREA 3OTUA 4HYSA 3RK7A 5JFVA 1WFCA 4O81A 1VYZA 5KE0A 3R2YA 4ZJVA 3HZTA 5FXSA 3GP0A 2CKQA 5DPVA 3KMWA 1B38A 1U59A 2WMTA 4M0ZA 5ANEA 4BBMA 4YJQA 4DGOA 1H8FA 5I9WA 2XYUA 4O6LA 2X8IA 2QHNA 3BGQA 3QQLA 3FC1X 3BV2A 4TWCA 4YTIA 2WEVA 1OZ1A 4NTSA 5CQWA 4BDCA 1UA2A 4AA4A 1PRYA 4GYIA 4ERKA 3R1NA 3QHWA 4I6HA 3G33A 3LZBA 3PUPA 2CKEA 1YI6A 4EWHA 4C4EA 2BPMA 4FTQA 2W1IA 4MHAA 3RKBA 1KE9A 2CPKE 2VU3A 3PY0A 2ITQA 4RWLA 2YM4A 5BUJA 2F7XE 3Q5ZA 5DRBA 4K33A 4WOVA 4EH5A 3QU0A 4BCIA 2ZJWA 4ZS4A 3LAUA 1BX6A 4QTEA 2UZNA 4IWQA 4U44A 4Y8DA 5AUZA 5HESA 1H24A 3VS2A 3ZO3A 4ALVA 1JKLA 2VX0A 2YM7A 3EHAA 3IDCA 1DM2A 4CZYB 2QONA 3AQVA 4FTUA 3TWJA 5FDPA 2WMVA 2ITNA 3U6IA 3HP5A 3RGFA 3HKOA 3ODZX 2Y8OA 2IVVA 2IZRA 3EJ1A 3HMMA 4FG8A 1R78A 1XH7A 3A62A 5KBRA 4BCMA 3EYHA 2ACXA 1Q3WA 2B9FA 4HOKA 5JKGA 3LFFA 4DLIA 2FGIA 2B7AA 3DLSA 3GUBA 4LG4A 3TV4A 4C4HA 4N6ZA 1RQQA 1WBWA 5CENA 3DAJA 2IG7A 1NVQA 5HHWA 5B2LA 3AC4A 3PYYA 4FTRA 2W7XA 3FPMA 3QLFA 4M3QA 3KVXA 3OXIA 4GJ2A 5AR7A 2A19B 2Z7QA 3S3IA 3VQHA 4DGNA 4QMMA 5CU2A 4E4XA 3PA4A 3Q96A 2WMQA 3HEGA 5LQFA 4FSZA 4DFZE 5DR6A 3WZUA 4ORKA 3TTJA 2C3IB 4I5PA 2J0LA 3DB8A 4BHZA 4DCAA 4FV0A 4GG7A 4IADA 4WSQA 3Q6UA 1P2AA 3RAIA 5ETCA 4B4LA 4GV1A 1F5QA 2QOIA 2F4JA 1V1KA 3R6XA 3D7TA 3QCYA 4GU9A 5H3QA 2DQ7X 5L8KA 2PVYA 4QP1A 4LRMA 5FEEA 3KY2A 4BKJA 4FGBA 5AV2A 4ASXA 5LVOA 2HWPA 3W2PA 2X8DA 5FP5A 1IA8A 1P14A 1GJOA 5FGKA 3S0OA 2C30A 2XKFA 4J8MA 4XCUA 1JAMA 3TNQB 4GKHA 4KABA 3EQIA 4MNEB 3OXZA 5CNNA 4ZSGA 3V5JA 5M4CA 3DJ7A 5EG3A 3WF5A 3ZU7A 5FXRA 4FIIA 4FTTA 3Q6WA 5HD4A 1OIQA 3O17A 3DK7A 5H8EA 4AGDA 2ZDTA 4F9BA 3U8WA 4DH3A 5HG9A 4IHPA 2W1ZA 4ZJIA 4BDAA 5HX8A 3R28A 3V5TA 4BGHA 4PTGA 3OUKA 3EN6A 3AGMA 2EXCX 2UZDA 4IZ7A 5CXHA 4D0WA 4CMTA 2R3LA 3T9IA 5M4IA 4HVDA 2QI8A 3BPRA 2SRCA 4EOJA 3NYNA 4ANBA 4CEGA 4AQCA 3I7BA 3HYHA 3VBYA 5AFVA 1UWJA 2GQSA 2JITA 3QKKA 3RI1A 1H25A 5D41A 4HGLA 2OZAB 5AX9A 1U4DA 4YGAA 3HX4A 2XH5A 4R77A 4QMTA 3NMUF 4E6QA 4JAIA 4FKJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3R00 A;  1BMK A;  4R3P A;  2JLD A;  4XNE A;  4I5M A;  5M51 A;  4TYH A;  5ETA A;  4FKU A;  4IM3 A;  3IW4 A;  3LFQ A;  3LCK A;  2YER A;  4FV1 A;  4KIP A;  1GAG A;  4C0T A;  2OZO A;  4GH2 A;  4CKI A;  4EK6 A;  5HIE A;  3UNK A;  2CLX A;  4F6W A;  4YHJ A;  4N4S A;  2YHV A;  4BWX A;  1M2R A;  4YZC A;  4R3C A;  4FR4 A;  3PP0 A;  4FV3 A;  3W2Q A;  4O1P A;  5J1V A;  3ZO4 A;  3MIY A;  3PZH A;  2R0I A;  2W4J A;  4UMQ A;  3K5V A;  3LMG A;  4IVA A;  4JMQ A;  3CIK A;  4K11 A;  3V5L A;  3TV6 A;  3Q2J A;  2PMO X;  3DCV A;  3KIO C;  4WSY A;  5DHJ A;  4F7S A;  2P2H A;  3DK3 A;  4TYG A;  5CQU A;  5EOL A;  2BAK A;  2KTY A;  3WAR A;  5DLS A;  3FLW A;  3E8E A;  4KNB A;  5A14 A;  5AP6 A;  5M57 A;  4G6L A;  3FQE A;  4HYU A;  1KV2 A;  2C6L A;  5IUH A;  1P4O A;  3BIZ A;  1FOT A;  4WUA A;  5FXQ A;  3PSC A;  3R1S A;  2VUW A;  3HDM A;  2GHG A;  4ITJ A;  2O8Y A;  2RGP A;  4JXF A;  1JOW B;  5FM3 A;  4R7H A;  3ROC A;  2QR7 A;  3ORN A;  2GNJ A;  4QRC A;  4YSJ A;  5A54 A;  5IUG A;  3B8Q A;  2ZVA A;  5J7H A;  2Z60 A;  4JS8 A; 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