4C59A

Structure of gak kinase in complex with nanobody (nbgak_4)
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
307
structure length
266
Chain Sequence
DFVGQTVELGELRLRVRRVLAEGGFAFVYEAQDVGSGREYALKRLLSNEEEKNRAIIQEVCFMKKLSGHPNIVQFCSAASIGKEESDTGQAEFLLLTELCKGQLVEFLKKMESRGPLSCDTVLKIFYQTCRAVQHMHRQKPPIIHRDLKVENLLLSNQGTIKLCDFGSATTISHYPDYSNFPIGEKQDIWALGCILYLLCFRQHPFEKYSIPPHDTQYTVFHSLIRAMLQVNPEERLSIAEVVHQLQEIAAARNVNPKSPITELLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of cyclin G-associated kinase (GAK) trapped in different conformations using nanobodies.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cyclin-G-associated kinase
total genus 70
structure length 266
sequence length 307
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4c59A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4c59A01
3B8RA 3VBWA 4DGOA 2X2KA 3QTIA 5CNNA 3Q9YA 2OJJA 4TYIA 4C37A 4FG9A 4LMNA 5FM2A 2WIHA 3G5DA 3H3CA 5AWMA 2R3PA 2BRHA 4D2TA 4D28A 4NIFB 4MNFA 3DTWA 4OR5A 4ZTRA 2WMWA 3R63A 4AX8A 3ULZA 4IM0A 2G2FA 4OTRA 4PV0A 3SLSA 4ANMA 2ESMA 2F4JA 3OVVA 4QTDA 1CTPE 1GZKA 2XK8A 3UOJA 3DK7A 4J97A 1Q41A 3NYNA 4OW8A 4MEDA 1NY3A 4BY9E 1ZRZA 3GUBA 2GHLA 2HK5A 4I23A 5ANIA 4D9TA 4M69A 4AW0A 4IWOA 4C4IA 3I81A 1LUFA 2XNNA 3N4TA 4Y46A 3KN6A 3UO5A 4JG7A 4M84A 4DTBA 5EDQA 5KE0A 5CEPA 4FNYA 1WBNA 3R04A 4HCTA 2VTRA 4QMSA 5D10A 1Q24A 3FL4A 4ZSGA 2RFSA 2V62A 5IA2A 3KN5A 4ZOGA 4C35A 2CGWA 3VS1A 5LMBA 1LEZA 3BRBA 3MY5A 2ITTA 3PFQA 4JDKA 4YJQA 2CLQA 3O8TA 4MVFA 2QLQA 2ETRA 2BZKB 2ZM3A 3HAVA 4A7CA 1NVRA 2C3KA 4DYMA 4QMYA 2JDRA 3LLAA 3N51A 5AUZA 3F82A 4GT4A 3R2BA 4ZTSA 1CKJA 5AUVA 5A14A 2BHHA 4AP7A 3CJFA 4KBKA 5FTGA 3LAUA 3POZA 4G3FA 4YJTA 2P55A 3HMOA 4NWMA 5IZFA 3FZOA 5TOZA 2XJ0A 2HW7A 5JZNA 3OTUA 4MXOA 2OFVA 2V5QA 5E90A 5EM6A 5LMKC 3IW5A 4DH8A 2R4BA 2ZMCA 5CU2A 4ZZMA 4Z7GA 1H26A 4FKTA 4RLKA 4C4GA 3UNZA 3KK9A 3QAME 3BBTB 3E64A 3I7BA 3FY2A 5EYKA 2C47A 2QOQA 5J7HA 2QC6A 4P2KA 2OSCA 2NNWB 3W8QA 3GC0A 5B2MA 4LMUA 2JIVA 5LXMA 4J96A 4JT3A 5KMNA 3NUYA 2GS2A 4QP1A 3MYGA 3ZXZA 3P9JA 3Q2JA 1ZYJA 3D7TA 3AOXA 1MP8A 4FSRA 3ELJA 2OK1A 4FVQA 3AQVA 3RINA 1W8CA 3RWPA 3FMDA 2W05A 3A2CA 1F5QA 2QOBA 1HCLA 1VEBA 2Z60A 2GQRA 4UMTA 5J87A 5DN3A 1BLXA 1V0OA 2R9SA 3BCEA 3DNEA 4XS2A 4YZBA 1Q3WA 3CTHA 3P1AA 4WD5A 3PYYA 1ND4A 4FYNA 3P79A 1MRUA 2QOFA 3VC4A 4AF3A 4C2WA 3QU0A 2WAJA 4E6CA 2Z7QA 1A06A 2WIPA 4ACHA 3F3UA 5FEQA 2YM5A 4EOPA 1Q8UA 4OAUC 1PHKA 1O6LA 4D1ZA 4JL9A 2ONLC 5IQDA 1YI3A 3MESA 1V0BA 3FLNC 4IX6A 3E8EA 3SRVA 1OECA 3KRXA 3VBXA 1QPEA 3FL5A 4AS0A 2J51A 4G34A 2YAKA 2Z2WA 1PXJA 3NAYA 3DKCA 2JD5A 4L53A 3U6IA 3R02A 4W9XA 2Z7RA 5JKGA 2B9HA 4GK2A 2OWBA 3DXNA 4XV9A 4YZDA 3D5UA 4FKQA 4FSYA 4C3PA 4D2PA 4O7WA 3AD4A 4RFYA 3RK5A 5IEVA 3UPZA 2P0CA 4FKLA 4R5YA 4EWQA 4I20A 3MVJA 2PYWA 1PKDA 2YFXA 4EH3A 5H3QA 4ANBA 4LL0A 5IA4A 4DH5A 4O84A 5D7AA 3MH1A 4JLCA 2OZAB 3UQGA 3Q2MA 4HPTE 5KKRB 2IVSA 3SXSA 4FTLA 2ETMA 3E7VA 3OW3A 3E7OA 4JG8A 4UWBA 3P23A 2XUUA 1WZYA 5AP4A 4ZTHA 1P4FA 4FI1A 4YJSA 2HW6A 4ENXA 3Q4UA 4AA4A 1YWRA 4RVMA 4ZTNA 1ZWSA 1ZYDA 3VBVA 4DHFA 4E26A 4BTKA 5JMSA 2RKUA 5J1WA 4G9RA 4FVPA 3A4PA 4BYIA 5EW3A 4EZ7A 3A7JA 2RG5A 4KINA 2UVZA 2VN9A 4MF1A 3OXIA 1YXUA 4YLJA 3C0IA 4G3GA 1KUTA 3CY2A 4QPMA 5HVJA 4F9YA 1RQQA 4OT6A 4JBQA 3A7GA 3GEQA 4LOPA 4KIPA 5CF6A 4D2WA 4EHVA 1SMHA 2Z02A 2J0KA 4XG4A 4I6BA 4QYFA 5CU4A 4DT9A 5HE2A 4UV0A 4I41A 3FZSA 3PJ2A 3OHTA 4OTFA 3PP1A 3W2PA 4CZUA 3OCSA 1OPJA 5JH6A 3EB0A 4KKGA 1BL7A 4FT3A 3H9FA 2W1EA 1UU7A 5BVOA 1IA9A 2E2BA 4R1YA 4BDCA 5E9EA 3EN6A 4XV1A 4L67A 2G2HA 4AOIA 4NCTA 3A8XA 3TZ8A 4APCA 2J2IB 3WZDA 3UIUA 5A4TA 1VYWA 4UALA 2ZDUA 1EH4A 3E93A 3VQHA 3HA8A 1ZZLA 3EQPA 5CX9A 3KKVA 3QL8A 5E1SA 4GVAA 3DPKA 1VJYA 4ITJA 3P7AA 3UG1A 4EOOA 4Z3VA 4Q9ZA 4NTTA 5J7BA 4M0YA 1R1WA 4ENYA 4PP7A 2Y6OA 2VX3A 2ZB1A 4Y5HA 2QOOA 5DPVA 1JKSA 2X8DA 3IOKA 4FTUA 4ZLOA 1O6KA 3DJ6A 4GIIA 5DOSA 4IX4A 4IACA 4F64A 3QXOA 4YJPA 3E8CA 3PA4A 2WTDA 4JQ7A 3ZM9A 3ORZA 4GFGA 3PA5A 3SG8A 3KULB 3VNTA 2BIYA 3GCVA 1G3NA 3HX4A 2X39A 2RL5A 3H9RA 3ODYX 4IBMA 4K2RA 5BYYA 4C7TA 4ZSJA 3LW0A 1YI6A 3FSKA 4CTCA 4EEVA 4F6SA 4G17A 5C8KA 4D2SA 2F7XE 2CJMA 1SVEA 2OJGA 3Q60A 2QO7A 3NNWA 4GIHA 3IGGA 5IA3A 3GQIA 2RFNA 1STCE 4E6DA 3KA0A 2CNQA 3BHYA 3EFLA 4XUFA 4PMMA 4ZSLA 4ASEA 4L46A 4GFMA 2C3LA 2NRYA 3FLYA 3LFBA 4OTQA 3I1AA 2O8YA 2VTNA 4O27B 3II5A 4MD7E 3FZPA 4BBFA 5HZNA 4O38A 3HECA 4AAAA 1OIYA 2C4GA 3IK3A 4S2ZA 3TXOA 5HCYA 4C4FA 4EOKA 4U9AA 5CF8A 5DEYA 3UOKA 3PSBA 4AGCA 5L6WL 4D1SA 5AIRA 3FEGA 3QCXA 3OROA 4QP3A 5AP7A 4NKAA 1YWVA 3W18A 3MVLA 3RK9A 3C50A 3NSZA 3MH2A 4JJRA 4K0YA 4KIKA 3M11A 4LGGA 5AUWA 3COKA 4FKUA 1PRYA 3DNDA 1PF8A 3OOGA 5LCJA 3HZTA 3EZVA 4MXZA 4PDSA 4D0XA 5ITAA 3PVUA 1WBSA 1G8AA 4N6ZA 3R9RA 1KE5A 3OY1A 1RW8A 3ZZWA 3VW6A 3LFQA 3V51A 4RJ7A 5DBXA 3FPQA 4ZY4A 4RJ4A 5LWNA 3JY0A 4F9AA 3PVBA 4GL9A 1J7LA 4LRJA 1J1BA 2VTJA 3IGOA 5HG8A 4QMXA 1H24A 3IKAA 3R1QA 3ZS5A 4FK6A 4D4VA 3MSSA 3NNVA 3HLLA 3NUSA 5D12A 3H0ZA 3QA0A 2GMXA 5KMMA 5L3AA 4BN1A 4FV1A 2VO3A 4RWKA 2X9FA 3QRTA 2W4OA 4FV8A 3O2MA 3T9IA 3G9NA 2W1CA 5FXRA 1H07A 4HGLA 5HBJA 4F7LA 3DJ5A 2BRMA 1NW1A 4MNEB 4A06A 2BMCA 4PNIA 1KV1A 4ACMA 2C0IA 5AP2A 4DITA 4ZZOA 2Z7SA 3LXKA 1FMOE 2A19B 1FOTA 5CI7A 4PDOA 2ITPA 3Q4ZA 2DS1A 4BCMA 3F3ZA 4FC0A 3VBTA 3LCDA 4N70A 5C03A 1KE6A 3VO3A 3E5AA 3M42A 3E88A 3QKKA 4FIEA 4YZMA 3V5PA 2R2PA 2X0GA 5L4QA 3IQ7A 4O1OA 3UZTA 4KABA 3OMVA 1KSWA 3G33A 2WMTA 2P2IA 3G51A 5LARA 4BHZA 5AP1A 4LV5A 4O7NA 4I5HA 2PPQA 3TV4A 2BVAA 3MVMA 4TW9A 2E9VA 5E8SA 4IM2A 4PTEA 5KUPA 3WF7A 3TL8A 5BMSA 4FV6A 3HV4A 2HY0A 2XIYA 5AJQA 3QKMA 2HWOA 5L2IA 3NR9A 2GQSA 4IW0A 1OPLA 4F1OA 4O6LA 2B54A 2CCIA 4WRGA 4C4HA 4YU2A 4O7SA 4BYJA 2VWVA 2Z8CA 4F4PA 3HA6A 5EYMA 2VNWA 3QD3A 5BVKA 4BR3A 2PMOX 4CFMA 3VF9A 2XKEA 5LJJA 3KXZA 3R71A 4FEXA 4W8DA 2QU5A 3B8QA 3LVPA 5A3XA 3CD3A 4ASDA 4X2JA 5F4NA 3V5QA 3DKGA 3W2CA 3WOWA 4E4NA 5DFPA 4RBLA 3LFDA 2R3HA 1REKA 4FSUA 3IS5A 4TTHB 1QPCA 3H30A 3UMXA 2I0HA 4W4VA 2QCSA 3Q5ZA 2JITA 4ANOA 1IAJA 3SOCA 2YZLA 3W16A 1W82A 4FKOA 4A9UA 5I5ZA 4U3ZA 3GGFA 4A4XA 5HIEA 2QO2A 3EKNA 4FT7A 4X6QC 3SD0A 5LCKA 3BGPA 4D58A 2X6DA 4M12A 2FA2A 4RX9A 2QU6A 2WMBA 3F3VA 4CZYB 4EK8A 3HEGA 2R3RA 3EQIA 3D9VA 2B52A 4RIXB 3TWJA 4B7TA 3GNIB 5K4IA 3IG7A 3G0FA 4MYGA 3OW4A 5G6VA 1H0VA 3LFEA 2OU7A 5GINE 2UUEA 3E63A 3FMEA 3L9LA 4XLVA 4K11A 2VTQA 3HUCA 3UODA 3IW6A 2XNMA 2YACA 3BLRA 3RK7A 1XKKA 2QOLA 1YDSE 4GV1A 3AC5A 3I0QA 4GFOA 3FHRA 2G15A 5L2QA 2B9FA 3SX9A 2C5YA 3JUHA 3MS9A 4GG7A 3MPAA 3FZRA 2YM7A 2W5AA 4E5AX 4FT0A 3QQJA 3K5UA 3R01A 1WBVA 5AV1A 1AQ1A 5C9CA 3T3VA 4BDGA 5DNRA 3D5XA 3PSDA 2LAVA 3NUAA 4O21A 3BHHA 5AAFA 3DK6A 4HCVA 4BKYA 5CSWA 3AG9A 3R7GA 4OTWA 3PJ8A 2HY81 5CQUA 3BE2A 3LFNA 4C8BA 2QR8A 1M7NA 3GU7A 4AN3A 3QUEA 4TXCA 3F88A 3L9NA 4USEA 3LM0A 1H01A 2XH5A 3WE4A 4BWXA 3ZH8A 3WIKA 3UPXA 4RWJA 5JSMA 2RIOA 2R3IA 4XG9A 3EYHA 3O17A 4FKGA 1Q3DA 3BQCA 3I0OA 5IA5A 2IZTA 1GZNA 2CMWA 3QUDA 1YW2A 2PMIA 4TNBA 1WBWA 2HZ0A 5FDXA 3R9HA 4DE4A 5HO6A 4DF3A 5HX6A 4EKLA 2X6EA 3BHUA 3RBWA 3OTVA 2UZDA 5I9XA 3ZO1A 4YNEA 4QYEA 2W5BA 3MH3A 4IAIA 5HG7A 3E87A 3EWHA 3Q6WA 5CSXA 3ROYA 2W1GA 4IB5A 2YN8A 1OL5A 4R3RA 1FINA 5DR2A 2ERZE 1OMWA 5I9VA 1E1VA 1ZYLA 4FKVA 4XG2A 3OXTA 1M2RA 5GJDA 4C57A 2BRNA 3QZHA 3NW6A 4WNKA 4B6LA 3CIKA 3FY0A 4BZDA 2YIQA 4ZAUA 5CEQA 1FGKA 3Q4TA 2H8HA 4YO6A 1GOLA 3P7CA 4JRNA 1PXMA 2XZSA 4Q5EA 3W2SA 3Q5IA 3IPHA 4IZ5A 4GK4A 4JDIA 4ACGA 2IZRA 4WSQA 4MQ2A 3RVGA 1BL6A 1WVXA 2WU6A 1OL6A 4H36A 5EHYA 4YC8A 1ZMWA 3V6SA 3VUHA 4O6EA 4M66A 3LQ8A 4FKIA 4HGTA 4HYIA 4HW7A 4RX5A 2V7OA 5M44A 4U41A 3G15A 2XCHA 1PXNA 3DAEA 4TWNA 2YHVA 5H8GA 5CAQA 3D14A 4FEUA 4JQ8A 5BMMA 3MPTA 4ZLYA 1YOLA 5B0XA 3W1FA 4YSJA 2R3GA 2ZV7A 4MWHA 2Y4PA 4QMUA 3RZFA 3N4VA 3NNXA 3QTZA 3WF9A 4G3CA 3CLYA 3MBLA 3QX4A 4Y8DA 2GHGA 3I60A 4TNDA 5LVMA 2F9GA 1TQIA 3F2RA 1UVRA 2JBPA 2WU7A 5FXQA 4IB3A 4FIFA 1B39A 5KMLA 5H8BA 2WQNA 3POOA 4NIFA 2B9JA 4XH6A 1JVPP 1OUYA 3K3JA 3ZBXA 2XBJA 3ZU7A 5G1XA 5EQEA 4D5KA 1RJBA 3KF7A 4F9BA 4ZSAA 4FZAB 2GNGA 2FVDA 1Z9XA 4RMZA 4I4FA 3AC3A 3FKNA 3PVWA 4L45A 2UZOA 1A9UA 4KA3A 2OIQA 3TNHA 4R7HA 3EFJA 4UN0C 4H1MA 4B0GA 4EHGA 3V8TA 1Q97A 2WTJA 3MVHA 3NMUF 3P4KA 2I40A 1TQPA 4ACCA 3VN9A 2VWYA 3TZ7A 1AGWA 4BDDA 2PVMA 4O0UA 4Y85A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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