4D4YA

Focal adhesion kinase catalytic domain
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
272
structure length
255
Chain Sequence
YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPAMAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKFSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSATDCVKLGDFKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Allosteric Regulation of Focal Adhesion Kinase by Pip2 and ATP.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
molecule keywords FOCAL ADHESION KINASE 1
total genus 81
structure length 255
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4d4yA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4d4yA01
4G5JA 4MXCA 5DLSA 4P5ZA 5DGZA 4BIDA 2UZBA 5BYYA 3A4PA 4EWQA 2VGPA 4O0VA 4DEHA 2W5BA 1ATPE 4H58A 1BLXA 1Q4LA 3LFCA 4ACCA 1FPUA 4FGRA 3B2WA 5CF5A 3CR0A 4FTJA 3ITZA 2XP2A 3P7AA 2ZAZA 4ACMA 3KVWA 3VJNA 1PXNA 1G5SA 3LCOA 1ZYSA 2HXLA 2UUEA 3VHKA 4D4VA 3RI1A 4YJQA 1S9IA 3H9OA 4GCJA 2OI4X 3JYAA 3D5UA 2WHBA 2BRMA 2OIBA 2PZIA 4O2ZA 4AN9A 1DAYA 2XYUA 3AC1A 3C1XA 4JBQA 2V7AA 4ANOA 2A0CX 5ETFA 4BTJA 4CTCA 5EQEA 3DNDA 3KXMA 1G8AA 4DG2E 4TNDA 4L42A 4L68A 1Y8GA 3O71A 4Q9ZA 4P2KA 2GMXA 2O5KA 2I40A 3PIZA 5KMIA 2A19B 1KOAA 3GU8A 1X8BA 3FYKX 4GK2A 3NS9A 4HW7A 3TUBA 4BDDA 5FDXA 2XM9A 3AXWA 5CF8A 3VJOA 5CEKA 2BZHB 4OR5A 4AW5A 3U4WA 3U51A 5FP6A 4ITHA 4A9RA 2JIVA 4D28A 3RAIA 3Q4ZA 3SRVA 3MDYA 3N4UA 4ACDA 3PLAE 3ODYX 2VTSA 2XKDA 4Q5HA 3NWWA 1WBOA 1JKSA 4BKZA 1MQBA 4RGJA 1Q62A 1G3NA 2ITWA 3LFNA 4CQGA 4HVHA 1SM2A 3IW4A 3GFWA 2OIDA 3RM6A 4OAUC 3PPJA 2VZ6A 4DTAA 1GOLA 3DTCA 4A4XA 2OSCA 3S2PA 3W2SA 4FL2A 2GCDA 4U3ZA 5HIBA 4BCFA 1FVVA 4EH5A 3VHEA 2Z7RA 5EQPA 1Y8YA 2WIPA 4LFIA 2QR8A 4M66A 4E6CA 2B53A 3VS4A 2WTVA 2GTNA 2BMCA 3D14A 3UO4A 2UW7A 2YM3A 4CZTA 4FYNA 3PE2A 2VTIA 3KF4A 3D83A 2CKQA 4YTIA 3LXLA 2OJGA 4TYHA 4BYJA 5KMLA 3ZSGA 3WIGA 2ZOQA 3R1SA 4KSQA 3VBWA 3HECA 3ODZX 5E1EA 1H1WA 2C6OA 2C6KA 1JQHA 4CZYB 2J0JA 3A7FA 4AW2A 2R4BA 1NVQA 4I1ZA 3VRZA 3KRXA 4G34A 4RIYB 2I0HA 2XK6A 4K2RA 1RQQA 4ZP5A 3V8WA 4E3CA 4TYJA 5CT0A 4F70A 2GTMA 2UZEA 3FAAA 4XLIA 3LLTA 4IH8A 4DEGA 4Z7HA 2YHVA 5JFSA 3OC1A 5E7RA 5AR8A 4CV8A 4ZOGA 5DBXA 3EQHA 4C37A 4E6QA 4NH1A 4B9DA 5ICPA 3CXWA 4I0TA 1WFCA 1ZMUA 4NT4A 3MB6A 5CALA 3WF7A 5ITAA 2WTDA 4RLKA 4ENYA 4RVKA 2CNQA 4UMPA 3LXPA 3LCDA 1PY5A 4I93A 3TNWA 3VW6A 4QTAA 4E73A 5J9LA 1PKGA 4O7LA 1CKJA 4F09A 2C5VA 4EOQA 3W2RA 5JFVA 3Q2MA 3R9NA 2YIRA 3NR9A 3QTZA 5CI6A 5DFPA 5IISA 4ONAA 2VWVA 1Q3WA 2BRGA 3BE9A 3FLZA 4XNEA 3EQGA 4A9SA 4ALUA 2W1GA 3QA0A 3FQHA 4KABA 5LWNA 3KQ7A 4O0UA 1IG1A 2VUWA 4BCGA 5I5ZA 4CKJA 4C3FA 2X8EA 3ID6C 2HXQA 4FV2A 4LI5A 4PMTA 2V62A 3QKKA 4XUFA 2ONLA 4ID7A 1KUTA 2J90A 3OCBA 4DEDA 3PA3A 3QWKA 3CGFA 4FTCA 1XH9A 4M12A 2VTMA 1OPJA 2IJMA 3A60A 3MS9A 4G1WA 1G8SA 4WSQA 4U81A 5L3AA 3FSKA 4B8LA 3U55A 2JDVA 4M14A 4FTMA 3O8PA 1OM1A 1WBWA 2OJ9A 3P1AA 3VBYA 3QRIA 3OD6X 3ZONA 4ZS0A 2BRBA 5IPJA 2ITZA 4YC8A 3E7OA 2YERA 1J1CA 4RA5A 2PULA 4NTTA 4IM3A 3WF9A 5IH4A 3E8CA 3GOKA 3T3UA 5HVYA 3G5DA 2JDSA 2O8YA 3DFAA 3MPMA 3OFMA 3QTWA 4XHKB 3DAKA 2NRYA 3FLNC 5AP2A 5JZJA 3CCNA 3ORPA 3DV3A 2F49A 2UZUE 3FY0A 3ENHA 4RVTA 4DEIA 3NYVA 4QMUA 5D7VA 3OWJA 3KMMA 5DIAA 2BRHA 3EN6A 2VWIA 3UNKA 2C47A 4M0YA 4BCNA 1R0EA 2PWLA 2B9IA 4YMJA 3KXHA 4G6LA 3A99A 4GT3A 5JZNA 4FKRA 5LARA 4HVGA 3CBLA 2UW3A 3PXQA 3MGYA 3W33A 3Q4CA 5IA0A 5DG5A 4ZJIA 5FTGA 4MKCA 1KE8A 3L9NA 4GT5A 4IZ5A 5DR9A 3DKCA 2RF9A 3HVCA 4MXZA 2A4LA 4BDFA 3KXXA 1MRVA 4QP6A 3LMHA 1XH5A 3UMWA 3R00A 2GNIA 4C2VA 1U59A 4N0SA 3Q5ZA 4CLIA 5LVOA 3FXZA 4NK9A 1R39A 2P3GX 3Q9XA 2RSVA 3TZMA 1ZMVA 2B55A 2XYNA 2UZWE 2X2KA 2HWOA 4RWJA 2WNTA 2VN9A 4OBQA 3JUHA 4IM2A 1KE5A 5DR2A 4FTIA 5FXSA 3QQLA 2YABA 1OZ1A 4NYEA 4GIIA 3FMJA 4FT3A 1ZYLA 4BDIA 3D15A 4G3EA 3A7GA 4TL0A 4BCOA 1IRKA 3IS5A 4D5KA 4IAKA 1CDKA 4WHZA 3VQUA 2QHNA 2NNWB 3Q3BA 2ITPA 1TQMA 2H34A 4X21A 1PMVA 5J79A 5KBRA 3BEAA 4IWOA 4B0GA 3SHEA 1WBVA 4JXFA 4W8DA 4OT6A 1Q24A 4IWPA 3UDBA 3SX9A 3FPMA 4TKSA 1I44A 1MQ4A 3NAYA 3R8UA 4FZDB 2W4KA 4ITIA 5CQUA 2VTAA 4BKYA 3AT3A 4ZTRA 4DTKA 4D58A 2VD5A 3BYOA 3PXFA 1ERKA 4PY1A 4E6DA 2YWVA 4EK5A 4BZDA 1FBNA 4FK6A 5DVRA 3MY0A 2FB8A 4XMOA 2H8HA 3RK5A 2WMRA 1H24A 3FY2A 4FGBA 3ZDIA 1YHSA 4R7HA 3IOPA 3AC5A 2VWUA 3LFBA 1FINA 1KV2A 4FZAB 2VX1A 2WPAA 4FKUA 3UQFA 4C38A 3QRUA 2XK8A 3L8SA 4L01A 4TRLA 5EDRA 4D1XA 3QUEA 3TUCA 3P23A 2PHKA 4J96A 3RHXA 3ZZWA 3HMIA 4FKJA 4G9CA 2YITA 1HCKA 1KE9A 1PXJA 3CQWA 4JQEA 5EDPA 5AUWA 4GFGA 2PUPA 1PMUA 4RT7A 4TN6A 3AOXA 3GUBA 3PVGA 4O86A 3CY2A 5CZHA 4OTIA 4PDSA 4IFGA 5IDNA 1JVPP 4FE2A 2QODA 4O0SA 2BROA 5DOSA 2ITTA 5DRDA 2WTKB 5AA8A 3NW5A 5K9IA 5LVNA 3BWFA 3UG1A 5A4EA 3PY3A 3F3UA 2HELA 4H1JA 4O1PA 3HL7A 5L2SA 3H4JA 3R8MA 3ALNA 5ANEA 3BWJA 4O0TA 3MPTA 3RALA 4R77A 5DMZA 5FG8A 1XR1A 2P0CA 3TN8A 2EVAA 2PMIA 1B38A 3NNVA 5FEDA 4EORA 4YSMA 4GSBA 5BVNA 3MIYA 4KBCA 4U3YA 4FV3A 2J5EA 4XG2A 1NXKA 5HIEA 1UWJA 3C13A 4JR7A 3V04A 2VU3A 2YACA 5C27A 3W32A 3I7BA 2J5FA 2C30A 4BICA 4YURA 4RQVA 3OCSA 3HX4A 5IQFA 3UOKA 4OLIA 4LL0A 1O9UA 2WEVA 5CU3A 4PMMA 4GU6A 2P2HA 1DS5A 2CJMA 2IN6A 5AIRA 4CFWA 5HICA 2W7XA 5DT4A 1Y6BA 4QTBA 4BHZA 3CD3A 4LL5A 4WUAA 5CANA 2X9EA 4QP2A 3SAYA 4ASDA 3TZ9A 1NT2A 3LIJA 3E7VA 3BYVA 5IUIA 2Z8CA 4IBMA 3MB7A 3ZRMA 3PY1A 1ZAOA 1BX6A 4CGAA 4X0MA 2ITVA 2R2PA 4TY1A 4FTOA 4MWHA 5ANIA 4J8MA 4CZUA 3Q6WA 3DGKA 2XB7A 4WG4A 3R63A 2O65A 3RAKA 5BUIA 3GI3A 4DG0E 4E93A 4NFNA 4E8AA 1CTPE 4CEGA 4QQTA 2PE1A 3F9NA 1PYXA 4FIGA 4EHEA 1A06A 2WO6A 2WQNA 4MNEB 3RPRA 2C1AA 4PDPA 5E4HA 5HEZA 2E9UA 2X8DA 4TTHB 3H30A 5HLNA 3NVMB 5HCXA 2W06A 4J53A 3ZH8A 4TT7A 3FKNA 5FEQA 5HVJA 1QL6A 2YLEA 3PG1A 5GZAA 4YO6A 1Q97A 5DA3A 2P33A 3TT0A 2YCQA 2R64A 1CSNA 3BRBA 1V0PA 2E9PA 3LMIA 2DQ7X 4KIQA 2PMOX 5K0KA 3BIZA 5TE0A 4D1ZA 2G15A 3ORNA 3OWLA 1LPUA 4YBKA 3ZSIA 2R3GA 4MXYA 2YIYA 4EH2A 2QOHA 2OZOA 4FTQA 4M7IA 5FUTA 4C36A 4DFYA 1MRUA 4X7QA 4WNKA 4M15A 3OEZA 4E7WA 5IQHA 3SG9A 4MWIA 3EQPA 3KL8A 2PVMA 2VO0A 3DB8A 4NKSA 4YTHA 2WEIA 2YAAA 1M52A 4QD6A 4LUEA 5HG8A 3CJGA 3OROA 2DS1A 3FLQA 4ZIMA 3W2PA 2CPKE 3QRKA 1PF8A 1UNGA 4DCEA 4IVAA 1GIJA 3OTVA 3WZEA 2GHLA 3R7VA 2BUJA 1YXSA 2X9FA 3GU7A 4L52A 1Q5KA 3R0TA 1ZLTA 3EL7A 5LMKC 1ZOEA 5CSPA 5GIOE 4RJ6A 2JC6A 4XV1A 4I0SA 5AM6A 2BHHA 3HRCA 4BGQA 3HA8A 2BDFA 3GOPA 1SVEA 4CMOA 3DQXA 2QOCA 2XNMA 3NGAA 3QCYA 4XLVA 3LFEA 4CNHA 4IAZA 1H27A 5M44A 2FGIA 4PUZA 4BVUA 4NUSA 5J5SA 2YIXA 4W4XA 3DT1A 3LCKA 5KKRC 2WAJA 1YXTA 3TACA 3OW4A 1QPEA 3ATTA 3WZDA 1TKIA 3JY9A 4IZAA 4RIOA 5AX3A 4YTFA 3KY2A 4AGCA 4I6QA 3QD0A 4J95A 4G3DA 4UZHA 3A7JA 5HBJA 2QO7A 4ZTHA 2BCJA 3AC8A 3EKKA 3C4EA 2XK7A 2PVLA 3SXSA 2UW5A 4DTBA 2W9ZB 5KMNA 4R7BA 3ENMA 4AN2A 3ZBXA 2VWBA 4C34A 3EZVA 1GZKA 1YHWA 3DXPA 2R3HA 3EYGA 1BMKA 1WMKA 5LQFA 3OXZA 2AC3A 4RC4A 4C57A 5JRQA 4RMZA 4CQEA 3HAMA 4YLLA 2QOFA 3ZEWA 3PJ8A 4N4SA 3TEIA 3WZUA 4F65A 1BI7A 2XK4A 4BC6A 5I3OA 4O7RA 5IQEA 4GKHA 4UMRA 5JN2A 1LR4A 2REIA 2OW3A 1Y6AA 5E8TA 4IJPA 4C4GA 1OL7A 4FIEA 3HDMA 3UG2A 2W1IA 2C0TA 3OP5A 2BALA 4HGTA 3KK9A 4RQKA 5BUJA 2W1ZA 4FTRA 2OG8A 4O7VA 4UBAA 3R9HA 3RP9A 5EKOA 4D2PA 5CQWA 1OL6A 2C0OA 1UKHA 5GHVA 4NEUA 4IZ7A 3WARA 2ZMCA 2G01A 1PXKA 2X2MA 5E91A 5BVOA 4UV0A 3QCXA 4QMOA 4FSYA 2Z02A 3OF0A 4X3FB 3LCSA 2JBPA 4HYUA 1OMWA 3EFJA 3R7GA 4S30A 4YSJA 4ALWA 4QTEA 2XNOA 2G1TA 3BE2A 3F3VA 3OY3A 4K1BA 2BVAA 4RIXA 2BZJA 3COIA 1JWHA 4PPAA 2WMSA 1UU8A 5AWMA 2Z60A 3SQQA 3QLGA 3IECA 5M4IA 4U0IA 4JIAA 2Y0AA 5HO6A 2QR7A 1VEBA 3ZRKA 2HK5A 3ET7A 4EK4A 2QI8A 4EHGA 2YLFA 3Q60A 5CVFA 5D41A 4PDOA 5FWKK 4AF3A 3K5UA 5LMBA 2WTIA 2Y9QA 3PDTA 4FSWA 3G33A 2Q83A 2R0IA 3MPAA 1WVYA 4PTGA 4JG6A 4D1SA 4ZEGA 3S1HA 3KN6A 4O6LA 3EOCA 3MA6A 2XH5A 5C8NA 1Q41A 4DEEA 1YW2A 4FA2A 4MD9E 2XF0A 1XHAA 1PRYA 5C4LA 3NIEA 4ERWA 5L2IA 3FZTA 1MUOA 3OUKA 3DBDA 3DJ6A 3BKBA 3I0QA 3DTWA 4N70A 5HLPA 2C6LA 3ZHPC 4QMQA 4CFFA 2AC5A 3FI3A 3PZHA 4KIKB 2CKOA 2JIUA 2R3RA 4U44A 3DZQA 4E20A 4E4NA 3GCQA 5E8UA 1Q8UA 1JLUE 3M42A 3VS7A 2J51A 3P9JA 5AJQA 4A4OA 4DGNA 3MTFA 3VF8A 3RNYA 4IM0A 4JDHA 3RAWA 4G6OA 4AA5A 5CASA 5E1SA 2JKOA 3SC1A 4FG8A 5BX0A 5EYMA 4FZ6A 3DKGA 3TNQB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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