4DFXE

Crystal structure of myristoylated k7c catalytic subunit of camp-dependent protein kinase in complex with sp20 and amp-pnp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
350
structure length
347
Chain Sequence
GNAAAACKGSEQESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
publication title Role of N-terminal myristylation in the structure and regulation of cAMP-dependent protein kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 113
structure length 347
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dfxE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dfxE02
3PFQA 4YHJA 3AD6A 4Y5QA 2PVFA 4NSTA 2CJMA 3VBVA 4E3CA 3M1SA 4BR3A 5L6WL 4Q9SA 3D5VA 5A4TA 5JFVA 5E90A 3QX4A 4LOOA 3A7IA 3WI6A 5H8GA 3VBWA 4F9YA 4FIGA 3F9NA 4UZHA 1BYGA 1WAKA 3BELA 2W1HA 2WTKB 4IZ7A 4DG0E 1PYXA 1K3AA 1Q4LA 4EQUA 2OGVA 4BZNA 4DG3E 4EOPA 4JR7A 2VUWA 3TUBA 2BDFA 1NVQA 5HG7A 4U80A 4UMUA 4ARKA 2XNMA 2LGCA 5H8EA 4UXLA 4XV3A 4AN2A 4BIDA 3BWJA 2HYYA 3EQCA 4I5MA 5DMZA 3UZTA 4XG8A 1NVRA 4U3YA 4QMTA 5HHWA 3PRFA 3ALNA 5EI8A 1M17A 3TNIA 5CSXA 4K18A 4TT7A 3Q6WA 4A4OA 2PE2A 3UZRA 1H07A 3P23A 3EN7A 1H1SA 4BBMA 3ZLXA 3CPCA 4CT1A 4CD0A 5GZAA 4FKGA 4BYJA 2B52A 3HRFA 4MNEB 1W84A 4O0SA 5TE0A 5JGDA 3ATSA 2RKUA 4KKGA 4C8BA 2ITYA 5KMJA 3BBTB 2IJMA 3LMHA 3QD0A 4M67A 4Y8DA 5IU2A 1OVEA 3HV5A 2QR7A 4I41A 3VC4A 4NJ3A 5FXQA 4MBIA 3FWQA 4CRSA 3UG2A 2GQRA 2BZHB 5IA4A 4FKRA 3E93A 2UZEA 2Z7LA 4N6YA 5BQ0A 5LVOA 2ERKA 4C02A 5LMBA 2EXCX 4V01A 5AAFA 3UNZA 4USFA 4IZYA 4O7VA 3AT2A 5HLPA 4MF0A 3NUAA 4JQ7A 2QONA 2C4GA 4IX5A 3D5WA 4GYIA 2W9ZB 5I3OA 3UTOA 4EZ7A 3EN5A 4BTMA 4F1TA 2XVDA 2H9VA 3QTRA 5I9XA 3U6HA 4ACDA 3RPSA 1PXKA 5FBNC 4FMQA 4G9CA 4ITIA 4OTFA 5IMEA 2WEVA 1Y8YA 3EQBA 3BCEA 5CSWA 4QMWA 3VW8A 2HENA 1UNHA 3MPMA 2YCRA 2XBJA 4AZEA 4DFLA 3EB0A 3UZPA 4ZY4A 4RQKA 4FR4A 4CQEA 4RC3A 4OTIA 4OLIA 2XKEA 5K0KA 4L6QA 3SG9A 1URCA 1TVOA 2IWIA 3V3VA 4C35A 2X9EA 3TI1A 5EI6A 2R64A 3QXPA 3FZRA 4DFBA 4ENXA 5M4CA 2ONLC 5CU4A 3RJCA 2BALA 3BI6A 3RKBA 1VR2A 3S00A 5JH6A 4XCUA 4BIBA 3HV6A 5AR5A 3QU0A 2PE1A 4IX4A 4BI2A 5K4JA 5LWNA 2R7IA 2WB8A 4WRSA 3EYHA 4BDFA 5KKRB 1M7QA 3ATTA 1HCLA 4W9WA 3R1NA 4FKJA 5CASA 3SRVA 4CMUA 3RAIA 1Q61A 5AR4A 3HX4A 4HW7A 4HGTA 2UZUE 2QOFA 3AD5A 4WHZA 3P86A 3ZDIA 2GS7A 1G5SA 3HRCA 4G3CA 5LMKC 2HOGA 1ZMUA 3IQ7A 4IC7A 2QKRA 1GIHA 4JBPA 4YC6A 5E92A 5FLFA 1Q8YA 2B9IA 4OTGA 3VS7A 4E8AA 3M2WA 1JOWB 3D94A 1WVXA 1BMKA 2ITZA 1OL7A 3JPVA 4O22A 2XF0A 5IH4A 3G51A 3QWJA 3CD8A 4ZZOA 4U43A 2CHLA 5FP5A 2CGWA 2BFXA 2G2IA 5KZ0A 1MRUA 2YFXA 3QD3A 1BKXA 2VRXA 2HW7A 2VNWA 3K3IA 4J1RA 3HLLA 4PPBA 4C37A 4EH9A 5I0BA 3E5AA 4UMPA 2W99B 3TXOA 3P7CA 1H28A 2BRMA 2ITUA 2JIUA 2RFDA 3H4JA 3BHTA 3QALE 5AMNA 4YJTA 5FGKA 3QCXA 3PTGA 1QPJA 3EL7A 3Q9XA 4CZYB 2WELA 1H01A 3GQIA 5IUIA 4FEVA 2HXQA 4IAKA 1MP8A 1UKHA 3C4XA 5EG3A 3EZRA 4QTAA 5HNBA 2VTJA 3E3PA 4TZRA 5C03A 3Q60A 4DINA 3M42A 4MD7E 5AP0A 5GZ8A 3G0FA 2CCIA 4PUZA 2RFEA 4D2PA 5AA8A 3FPQA 4S32A 4E1ZA 3DBCA 3P08A 5L2QA 4FGBA 4GIIA 3R7VA 3VRZA 1XKKA 2C0OA 2WMBA 4WT6A 4RFZA 3FSFA 4D2TA 5FXRA 4FK6A 2BIYA 4L46A 2ITPA 3EQPA 4U40A 2WTJA 2CLXA 3JY9A 4F7JA 3QTXA 4YLKA 3CKWA 4K6ZA 3R28A 1WFCA 3EH9A 3F3WA 2PK9A 4CFVA 3KK8A 2WTDA 4YJSA 3PXQA 3CTHA 4I24A 4OBQA 5HG5A 3U9CA 4DH1A 1UU3A 2R3FA 2WTWA 3M11A 3VS0A 4Z7GA 4F9AA 4XNEA 2V22A 4B6LA 3MH0A 4ZXTA 5C9CA 1PXLA 1ZMWA 3RHKA 4EHGA 3BZ3A 1CKJA 4F6UA 3MI9A 1QMZA 4ALWA 4QPAA 3ZH8A 3TZMA 3UGCA 2GPHA 2JFMA 4KIKB 4XBUA 3OD6X 4MNFA 4BDBA 3DKGA 1K9AA 3RWPA 3ORZA 2YA9A 2V0DA 3OT8A 3QYZA 4AZWA 4D28A 3IS5A 2VTRA 2J5EA 3OF0A 4YTCA 4JDHA 2W5AA 4TXCA 4YZMA 2HZ4A 2ETMA 2RIOA 5EYCA 4BB4A 4ZTLA 1ND4A 3ORIA 1KSWA 4L3JA 2C6KA 5AM6A 4ZS0A 5GJDA 3Q6UA 3TN8A 3DXPA 1P4OA 4FKPA 4M8TA 2NPQA 5AV0A 4FYOA 4FTKA 4DC2A 4FEXA 1STCE 5FTGA 3FV8A 2QLUA 2V7AA 5D10A 3OP5A 4AUAA 5J5TA 1M52A 3IKAA 5TO8A 4FG8A 1WBSA 4GIHA 4IMYA 1GY3A 5AP1A 3OOMA 2J6MA 2PMLX 3CY3A 4BVUA 4D9UA 5BVDA 4UALA 3W32A 1LEWA 4ENYA 3DZQA 3IDBA 3KF7A 4AA5A 3CS9A 3QRJA 5EYDA 5AUVA 3CIKA 3D83A 3VAPA 3TL8A 2WNTA 4QYHA 4K0YA 2HIWA 5T6KA 4YSJA 2VWZA 2X1NA 5L4QA 2GQGA 5L2WA 4PNKA 2R3NA 3IGGA 3DAKA 4X3FC 4J96A 3QRKA 4DN5A 1OPJA 4TL0A 3UO5A 2XK4A 1OMWA 5HBJA 4CMOA 1Q62A 4R7IA 2HK5A 3BGQA 4IB1A 5DBXA 3ZO2A 3MWUA 3R8VA 4L42A 4H3PA 3CTQA 4UV0A 1MQ4A 4F6SA 3D9VA 1PKDA 2P2HA 1XR1A 2Y0AA 3A2CA 1YWVA 3UQFA 2HZ0A 4F6WA 3GU7A 3TZ8A 2I0YA 4OUCA 4GT5A 4G9RA 4HYSA 3QGYA 3C51A 4FVRA 2YIXA 3QC9A 4MXXA 4C34A 3P78A 4CCUA 4YUQA 4JVGA 1YRPA 4IZAA 2WU7A 5LJJA 4F7NA 2ZM4A 4JBQA 4BBEA 3REPA 4UN0C 4UWBA 3Q4TA 2DQ7X 2VTQA 3RM6A 1JSVA 5M4FA 1S9JA 2O5KA 5DRDA 2XKFA 4AW5A 5HE2A 1WBTA 2ZVAA 4BWXA 2R4BA 3PE2A 4FNYA 4AGDA 5CF5A 3MFTA 2GNJA 3C4CA 5CU2A 2YM8A 4NCTA 3V5TA 4LMNA 4EHVA 3BU3A 5JGAA 1KWPA 3A61A 2CN5A 2C0TA 2X2KA 5E8YA 3UVQA 2VO3A 3RPRA 2YIQA 4TTHB 3H30A 4W4XA 2VO0A 3SHEA 2JDVA 2BMCA 2GNLA 4X2KA 3NRMA 4BDAA 3LFBA 2UUEA 3Q5ZA 2CLQA 2WD1A 4RWIA 3T9IA 3ZM9A 3E62A 2C1AA 3B8RA 4NWMA 3FMKA 2OJIA 3G33A 3VUIA 4V04A 2JIVA 3HMOA 3OROA 2CCHA 2GNFA 4Q9ZA 5I9WA 3LCDA 3L9LA 3OCBA 1EH4A 4FIJA 4MD8E 3OW4A 5CVHA 3D14A 1IRKA 4MKCA 3GC0A 3P5KA 4FC0A 1LR4A 1W8CA 1UV5A 1YDRE 3HRBA 4RIWB 5I9YA 1H1QA 4HZRA 1JSTA 4D4RA 4RSSA 3OXTA 4BTJA 4JOAA 1JKSA 3F3ZA 3FDNA 4MAOA 4YHTA 4F7SA 5CAOA 2OBJA 1UWHA 4QMQA 2Y6OA 2C6EA 4L3LA 3UQGA 3U55A 2VTAA 3L8XA 4L9IA 4O0WA 4A9RA 4FA2A 4YO4A 2X7GA 3MFRA 4XH6A 3RMFA 3VS2A 1TQMA 4FSZA 4OAUC 5EYKA 3PXFA 3MVJA 2CGVA 3SQQA 4TWPA 3GOPA 1PXNA 3KRRA 4BCOA 3HMPA 5HVKA 3FL4A 4R8QA 1PW2A 4LFIA 3DJ5A 1Q8ZA 3JXWA 5DLSA 2UZOA 4NT4A 3ULZA 2Y8OA 3IOPA 3QLGA 5ACBC 3CLYA 1R0EA 3PPJA 4F63A 4N70A 1ERKA 1OKZA 1OITA 4XS2A 3S2PA 4EBVA 3UJGA 4O0VA 1PRYA 2W9FB 3PXZA 3G9NA 2ZM1A 1OB3A 4MCVA 5FQDC 3CJFA 3DZOA 3F82A 4PNIA 3HECA 4GCJA 4RX8A 4X3FB 4RBLA 5GNKA 5IUHA 4BDDA 3R1YA 3ZLSA 2GQSA 5IQGA 3ZXTA 2X7OA 4WSYA 3MJ2A 3IW7A 4GK2A 2NRYA 4XUFA 2ZV9A 5AR8A 4B0GA 3VS5A 3GUBA 3FEGA 4O7SA 3RNIA 2Q0BA 3V04A 4EK3A 4BDIA 2J50A 5IUGA 5JFXA 4C2WA 4IFGA 2XP2A 5FUTA 1Z57A 3L8SA 2QO7A 3AMBA 2OZAA 2DWBA 4R6VA 2BTRA 3OWPA 4K11A 2QQ7A 2PVRA 1J1BA 4FV4A 3S0OA 5EQYA 1OL6A 4LV5A 2UZVA 3TZ9A 4BDHA 4M97A 3FXXA 4BI1A 3EQRA 3HEGA 4IE9A 4O6LA 4D2SA 1LEZA 3QKKA 2C3LA 1OZ1A 3RPYA 3L1SA 4O0XA 5TR6A 2YDIA 3FZPA 2I0HA 4QMMA 4ZTSA 4FKUA 4R5YA 3VUGA 4YNEA 3KMUA 2EB3A 2ZOQA 3HV7A 3FMLA 4YLJA 2QO9A 5E91A 1YHSA 5IPJA 5DA3A 2JKQA 3BU6A 1ZOEA 4ZY5A 3ZDUA 2BZKB 4IVBA 3LCKA 4O81A 4O91A 4S2ZA 5ANDA 4E6QA 4F09A 4PY1A 4FEUA 2EXEA 2XK3A 3OG7A 4WA9A 1CMKE 3ORLA 2QU5A 5AAGA 3O51A 4O96A 1R39A 2WXVA 2BKKA 3V8WA 1I09A 2BRGA 5EDRA 3UIXA 4RIYB 4I4EA 1A48A 5DR6A 3HUBA 4AFJA 2QOKA 2ZB0A 4KKEA 3EFKA 1KOBA 2GDOA 3O8TA 3WF6A 5E8SA 4AW1A 4QRCA 5H2UA 5LVLA 4E5BA 5AV4A 3QWKA 5F9EA 3POZA 4BDGA 4EOKA 2OK1A 3C5IA 2F7EE 5EKNA 4RFMA 1H24A 3UE4A 4EH5A 4Z55A 5DT4A 4C7TA 4GT3A 2VTLA 4H1MA 3QAME 4FL1A 4U45A 3F2RA 5CAPA 3GCUA 3O96A 3E63A 2J0KA 3FSKA 1ZZ2A 4CEGA 2BTSA 3BKBA 4XP3A 5E8WA 3ZLWA 4BDJA 2YIWA 2XEZA 1Q3DA 3E8NA 4YJVA 3IW4A 4CFXA 4HGEA 4PDOA 4QPSA 3PY1A 4MWIA 4BYIA 3LQ3A 4AS0A 4MTAA 3LMGA 4IX6A 3OCGA 2Y7JA 3L9NA 1OL1A 1FVRA 4KKHA 3QKMA 4O0YA 4RFYA 5ETCA 5M08A 2YJRA 4KB8A 3DFCB 5KHWA 4WOVA 4BI0A 1U54A 4K1BA 4C4HA 1J1CA 1YOJA 3UO4A 5FDXA 4DEGA 1Q3WA 4BCIA 5ACKA 2REIA 3NYXA 3LKMA 3VF9A 3R7IA 2R5TA 3EN4A 3W8LA 2O65A 1TKIA 3LMIA 1MRYA 2WTVA 2UZDA 2OXXA 4O7YA 2E9PA 3TTIA 3TIZA 1TQIA 4H3BA 3HNGA 3QTWA 1YXUA 4LYNA 1KV1A 3UIBA 4I6BA 3UIUA 2BRHA 4IWOA 4UB7A 4XRLA 2RFSA 3W2CA 3GCQA 3VHKA 4DH5A 3Q96A 5ANKA 4TYIA 1ZYDA 3DJ7A 4BWKA 1X8BA 3LIJA 4M69A 1BL7A 2Y9QA 5CENA 2A1AB 4PF4A 4F4PA 2J9MA 2PVMA 5E8VA 2VX3A 3HP5A 4BC6A 1DAYA 3IGOA 4ANMA 5JZJA 3QXOA 5AV3A 1T46A 2OI4X 4EJNA 5A4QA 3KN6A 3CGOA 1QCFA 4KBKA 4AE9A 4EONA 3UBDA 3GC7A 3MTFA 4AGCA 3T8OA 3BLRA 5L3AA 4IC8A 5LVMA 4UMTA 4YHFA 3PLAE 4FBXA 4M0ZA 3ANQA 1UNLA 1XBCA 3IW8A 3F2AA 3FZTA 1FVVA 3BQCA 3COMA 4L45A 4M66A 5CVGA 3BQRA 5HIBA 3ZYAA 4K33A 4WG5A 4ID7A 4EK5A 3QYWA 3VN9A 2XJ0A 4FTCA 5DRBA 2PVKA 3LAUA 4DCEA 1VJYA 3ZFYA 4CV9A 3MJ1A 4XOYA 4I0RA 3RWQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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