4DFYA

Crystal structure of r194a mutant of camp-dependent protein kinase with unphosphorylated activation loop
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
337
structure length
310
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFATPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
publication title Structural basis for the regulation of protein kinase a by activation loop phosphorylation.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 94
structure length 310
sequence length 337
chains with identical sequence E
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dfyA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dfyA02
3MFTA 5AA8A 4BI2A 4GJ2A 2C6MA 3ORKA 5D1JA 4C4FA 3QUPA 3GFWA 5GIPE 2OF4A 2R7BA 2YACA 4FTNA 2JIIA 4MXAA 4H58A 3ZSIA 5M07A 3KL8A 3RCDA 3R71A 4PMTA 2RL5A 4IZ5A 4R3RA 2HZIA 3DPKA 2W1DA 5HG8A 3WF6A 4C58A 3EMGA 4I5PA 3OWKA 3IDBA 4MTAA 3EYHA 2J4ZA 3PJ1A 5L2TA 3GFEA 2OO8X 3R28A 2BROA 2ZDUA 4WG4A 4DEBA 2BCJA 3FI2A 3LXLA 3BIZA 3TV4A 4FL1A 4AG8A 5LXMA 2X39A 4Y83A 1SYKA 3GCUA 4ANBA 4QMOA 3WF8A 3WF9A 4ANQA 4CNHA 3GI3A 1YOMA 4Q5EA 5GZ9A 1M2QA 2C3KA 4RIWB 4D1SA 2UW7A 1VR2A 4QPAA 4ZTMA 4ZLOA 4U0IA 2FYSA 3B8RA 2BAQA 5HE1A 4FF8A 3ET7A 4FT5A 4L46A 3Q04A 3K5VA 4P2KA 3RNIA 4EWQA 3ATTA 1GZOA 3R0TA 1NA7A 3TN8A 4Y5QA 4NT4A 5EQEA 4EK6A 5HO6A 2UVZA 3MH2A 3W55A 1J7LA 2BRHA 4XG8A 5I4NA 2I0YA 2QOLA 5E8XA 4QP2A 3H0YA 3HEGA 3KK8A 2GS2A 2VO3A 5IEXA 2XCKA 2YM6A 5IQDA 2W5BA 2XNMA 3MB7A 4DG0E 2G9XA 3MA6A 1KUTA 5EHLA 4F9YA 2JKOA 2DQ7X 2I6LA 2OJGA 4NEUA 4GG7A 3PY3A 4G31A 5DT4A 1R3CA 3JVSA 3ZBXA 3I7CA 1FMKA 1LP4A 3IPHA 4MXZA 5HIDA 3BWFA 3NNWA 4O0WA 5CAUA 4KUJA 5ANDA 2GHMA 5E9EA 2YITA 2OIBA 5GIOE 2VWVA 4GU6A 3AMAA 4V04A 3SXRA 4F0FA 5IISA 3BEGA 1H8FA 4YMJA 5I9UA 4D55A 3CS9A 3TZMA 3GC0A 3LQ8A 4R7BA 4Z7GA 4OTDA 3GCSA 3UPXA 1ZMUA 4HYSA 4KBKA 4TPTA 1PXOA 4F1MA 3WE4A 2EU9A 1YWRA 2J0JA 1DI8A 2C5OA 3BHHA 3OP5A 3ZO1A 2QKRA 3UMWA 4EZ5A 5AADA 2BKZA 4HOKA 3C4ZA 3UC3A 2J5FA 3HV6A 3TV7A 4UYNA 1OUKA 2VGOA 4FKIA 3BU6A 4FOBA 2R3NA 3ZH8A 4CQGA 2OJ9A 3VS0A 2OZAA 3NAYA 4QP8A 2X7FA 2XA4A 5HLPA 3PSBA 5CZHA 5HG7A 2VU3A 5K4IA 3IW4A 4FV8A 1Q8WA 4G34A 4RPVA 5EG3A 4RQVA 3LW0A 1ATPE 3MFSA 1BX6A 4FSMA 3R8PA 3DAKA 2WMBA 3SW7A 3O0GA 4AZVA 4KS8A 5CXZA 1M7QA 3KC3A 3QQLA 2O64A 3MY5A 2YHVA 3OOGA 3W18A 5IA0A 2UW3A 3VBVA 4I1ZA 1EH4A 5CXHA 4G6LA 4FTRA 4JNWA 5HD7A 5TT7A 3LMIA 4MD9E 5CAQA 1YWNA 3GC8A 5L6WL 3H30A 3R9HA 3TUDA 3IDCA 4O0TA 2GFSA 4F1OA 3QZGA 5I3OA 1OL6A 1SNUA 4RJ8A 2UW0A 3ZUVA 1OBGA 3L9MA 3QUDA 4M97A 3CC6A 4BCJA 1ZAOA 3MVJA 3GU6A 3KVWA 3NPCA 3NRMA 3BHUA 1KE8A 1OKWA 1YWVA 3JPVA 3CGOA 3LXNA 4QNYA 5EKOA 2VTNA 5GJFA 5HNGA 5L4QA 3DXPA 4XG2A 3ZTXA 4CTBA 3P79A 4DFNA 4DH3A 3G0FA 3OW3A 4FV0A 5E8SA 2QR7A 2RF9A 3DFAA 3R22A 4OTQA 2HWOA 5DT3A 3RP9A 3W32A 4BKJA 4GFGA 4F4PA 5L2SA 3Q4UA 2PSQA 2YA9A 3SGCA 4CKRA 1P4OA 4PP9A 1OZ1A 3Q5ZA 2R3LA 3I0QA 4TYHA 2GTMA 2GHGA 4E1ZA 4EH2A 4QMSA 2C5NA 3HL7A 5KMOA 3WZEA 1TVOA 4OT5A 5HX6A 4QTBA 2HXLA 2HZ0A 2OJIA 3I81A 4HZRA 3RZBA 3ZZEA 2PZYA 4NW5A 4L8MA 2A19B 4EORA 4OBOA 3FMMA 3EN9A 3GU4A 3NIZA 4FUYA 4QMMA 3FQEA 3W8LA 2CN5A 1LPUA 3EZRA 3FMNA 3PP1A 3OD6X 3IOKA 4RWJA 4L01A 3TZ9A 3KMMA 2WTCA 4EH4A 2PVLA 3LAUA 3POZA 1M2RA 4CRSA 3MH1A 4MXXA 4XHKB 3KULB 4I4FA 4LM5A 2F7XE 2R3JA 2W99B 3MB6A 3OWLA 2BZIB 5EDRA 3SA0A 1H08A 3BPRA 3O71A 4FTJA 4V05A 1T46A 3R01A 2B53A 5A46A 3BZ3A 3UOHA 4BI1A 2VWUA 5CF4A 2XK7A 3DBCA 4U3ZA 4X3JA 2EXEA 3BLHA 2P2HA 2R3FA 4KIKA 1ZYCA 4Y46A 1H4LA 4ZTLA 1BKXA 3E8DA 3MPMA 4RA4A 4CZUA 4HPTE 1ZMWA 4HGLA 4CTCA 1REKA 2B55A 3PJ3A 2QU6A 4IB3A 1Q4LA 4U45A 5CVGA 4Y73A 2WTJA 3RPRA 5EYKA 4GFMA 1R0EA 5DWRA 3V5PA 3FL4A 3MA3A 4RJ3A 3EFWA 2I7QA 4BC6A 5CF8A 1H24A 1XHAA 4FEQA 4O2ZA 3KVXA 4IB5A 2AUHA 1Y6BA 3FZOA 3CY3A 3R00A 3MBLA 2XNBA 4C4HA 2JFLA 2VWXA 1ZYJA 4FKTA 5AUUA 1A48A 3PSDA 3R30A 4GCJA 5I5ZA 3V5TA 5C8MA 4B8LA 4QPSA 3TTIA 5IH5A 4E20A 1STCE 1JKKA 1YI4A 3S95A 1GNGA 3F9NA 3ZLWA 4DEGA 5BX0A 5FDXA 4BZOA 3S4QA 2X0GA 3GOKA 3OROA 3PXZA 4PDSA 4F09A 4WNPA 2W1EA 2ESMA 4A06A 4LG4A 4BGGA 2BVAA 5JGBA 4MX9A 3EH9A 5JZNA 4AX8A 3FY2A 4E4LA 2DUVA 3CLYA 3DJ6A 3LCDA 3DCVA 5H8GA 1IG1A 4A4OA 4CG8A 4OLIA 5LOHA 4ANLA 3RAHA 4UZDA 3UDBA 4ERKA 4QMZA 2XCHA 1XBBA 3VIDA 3VAPA 5IA4A 2QO7A 3QRJA 3EQIA 4CMTA 5J9ZA 3K54A 3HMNA 2JBOA 4YHTA 3UNJA 2VTRA 3E3BX 2WZJA 2ZV7A 3LFQA 1FOTA 4QQJA 3DXNA 5JMSA 3O17A 4DH5A 1UNLA 5DNRA 1FQ1B 4O7RA 1YOJA 3FI8A 2CHLA 4C34A 3D14A 5IA2A 4NM0A 4NUSA 5IQCA 2G15A 2HW7A 5CY3A 5HCZA 4IWPA 2W5AA 3FMHA 3VJOA 4IX6A 4NJ3A 5FTOA 3EQHA 4YR8A 2YZAA 3TNPC 5HHWA 4D2WA 5CT0A 2PMNX 4QTAA 3H10A 4I4EA 1UA2A 3MDYA 1APME 4XG7A 5L2IA 4C2WA 4GEOA 1XBCA 3BI6A 4TNBA 5HGIA 3OT8A 4JLCA 4KNBA 3UOLA 2J0MB 1U54A 4OTRA 3R7EA 4PDYA 5GINE 1XH4A 4IM2A 5IEYA 4X2GA 4FTIA 5C03A 4AW5A 4CKJA 3KRLA 4J7BA 4NCTA 2RG6A 3NNVA 4ACHA 2DYLA 4I0SA 1XH9A 3NCZA 3E64A 2PPQA 4KBAA 4O38A 3KCKA 3FWQA 4LV8A 3QQUA 5HCXA 2QD9A 5HU3A 3FY0A 3GU8A 3ZM9A 4FSZA 3COMA 3LZBA 3HV5A 3NX8A 3MY1A 3NYNA 3FI3A 4AU8A 3R7GA 3IO7A 3MY0A 4GVAA 4A9YA 3PP0A 3DU8A 2OBJA 2OFVA 3C4WA 5H3QA 2XNNA 4WBOA 2Z7RA 5JN2A 5FXQA 1WBPA 3UG2A 3ZS5A 3QRTA 4DFYA 4O82A 3GOPA 3ZZWA 5H8EA 4DGOA 3IGGA 4RMZA 2A0CX 4PTEA 3OC1A 4YUQA 3E5AA 4MCVA 4MNFA 4DFBA 3G51A 1E9HA 4KIQA 2VWBA 4IAFA 4QQTA 2W1ZA 1KV1A 4TTHB 2B54A 4FZ7A 5I9WA 1K2PA 2YM8A 4KSPA 3ZONA 4FG9A 1BL7A 4I22A 4EOOA 4BF2A 4NYEA 3R8VA 4Q9ZA 1V0BA 3P08A 3MFUA 4FIEA 4ZXTA 3R7IA 5CF6A 4LL0A 3TEIA 5A9UA 3G2FA 1V0OA 3UO6A 2R3OA 4U9AA 2PL0A 2UW6A 3IW7A 3P9JA 3UP7A 5BUJA 3IW8A 4C4JA 3DNDA 3V01A 1H00A 4GK3A 3RPVA 1IA8A 3A61A 3JYAA 1J91A 3RI1A 4DEIA 3PA3A 4FGRA 4NW6A 2WELA 4AAAA 2PTKA 4FNZA 3RAWA 3BLRA 1WBVA 1NVQA 4GSBA 4YBKA 2OZAB 4QYYA 2J2IB 4JX7A 1GAGA 3ZLSA 4A4LA 3R63A 4V0GA 4C35A 2YFXA 4D9TA 3C5IA 3NVKI 5KO1A 5IMXA 4EOSA 4BHZA 3R1QA 2J7TA 4PWNA 5BNJA 4GJ3A 2UVXA 1BI7A 4ITHA 3OFMA 3CGFA 2OH0E 2CGVA 1YHSA 3P23A 3DTWA 2VO0A 3DBEA 3CEKA 4IAZA 4EBVA 2W05A 2C6DA 3HP5A 3S3IA 5L6PA 4BCIA 1UWHA 3VS6A 3CD3A 3ZRKA 3NWWA 1YHVA 3BGZA 4C61A 4G5PA 4FTOA 2C0IA 3DKOA 4AT5A 4I94A 5DT0A 4R7IA 4FK3A 4WUAA 4D2TA 3QALE 1J7IA 2R5TA 1JPAA 1L3RE 2XM8A 5IMEA 5J1WA 3H9FA 2ITXA 2W1IA 3S2PA 4KD1A 1BUHA 4ZTNA 4KRDA 4XH6A 4ZSLA 4IE9A 4FV5A 4PPCA 5E8YA 4AQCA 3K3IA 2OZOA 3F88A 3SHEA 2UUEA 2DS1A 4EH7A 3PJCA 3VUTA 3UPZA 4FKJA 2FSOX 4MNEA 3SVVA 3F2AA 4E26A 2UVYA 3BHTA 5FM2A 3DBFA 1YRPA 3ORNA 4QYEA 4U79A 4I3ZA 5EDPA 5HKMA 3DKGA 2AYPA 3SXSA 2F9GA 2XIXA 3VO3A 4AA5A 3TDVA 4ANOA 4TYHB 4GFOA 3C7QA 3NS9A 4BYIA 2RSVA 4X2NA 3PZEA 2RG5A 5CSPA 4LI5A 4ZZMA 4FE2A 4CV9A 3W2SA 1G3NA 4JDHA 3ZLYA 2V0DA 2ETRA 3D2KA 3VC4A 3IQ7A 3FDNA 5DGZA 3ULZA 3EJ1A 4CEGA 3PRIA 3PXKA 5FEDA 5AP3A 3LE6A 1OPKA 1URCA 1W82A 1YXTA 4UMPA 2PMOX 3VS2A 5ANGA 1Q5KA 5CEKA 3QC9A 3ODZX 4U44A 3VJNA 2XZSA 3UQFA 2IZTA 3IECA 4JVGA 2WIHA 2PUPA 3DZQA 5CLPA 4K18A 5D7AA 4FNYA 5TR6A 4ACMA 3LM0A 3AT2A 4I0RA 3QZHA 4FV1A 5K0KA 4QPMA 3FMLA 3OXIA 2BRGA 2F2CB 3SC1A 4C0TA 4GKHA 5HNBA 2OG8A 2Z7QA 4FIJA 3BYOA 4CCBA 4BRXA 3V5QA 4KIKB 3FHRA 2LAVA 1RW8A 3OOMA 3DLZA 3ROCA 1IAHA 5AAEA 4IVAA 5FWKK 2QOKA 3R9OA 3W2OA 4FZ6A 3UQCA 2WTDA 3DJ7A 4E6DA 3F3ZA 4JQ7A 2BTRA 3FZ1A 4M14A 4E6CA 3VF9A 1U59A 3VVHA 4MAOA 2WB8A 2J5EA 5A4TA 3MTLA 4RIOA 2VTTA 3GCVA 3PJ2A 3MS9A 4DFUA 3A2CA 3P1AA 2P33A 2X6EA 3GNIB 2BRMA 4YO6A 3OBGA 4RLKA 1XKKA 4CKIA 5A4CA 1AQ1A 5JRQA 2VO7A 4ZS4A 2YIYA 3W10A 3E3PA 4J97A 5AIRA 4TYEA 2IPXA 3RGFA 4UXQA 5HORA 2ITOA 5CASA 4AGDA 3R9NA 4R3PA 3IONA 5FRIA 4BHNA 4F7NA 3PG3A 3R83A 1ZOGA 3PLSA 2B0QA 3OW4A 4LUDA 3NMUF 4U8ZA 3COHA 3TKIA 3FYKX 2QLQA 2YCSA 4Z9LA 5CNNA 3E7VA 4C8BA 3LCTA 4RX8A 4H05A 3COKA 5A6NA 1UU3A 4BB4A 3AC3A 4KWPA 2YJRA 3BKBA 3HKOA 5D9HA 1JOWB 2YERA 2QCSA 3RM6A 4ZZOA 1G8SA 4M0YA 3DXQA 3G0EA 3OWJA 1ZYDA 3QCSA 2CNUA 2WQNA 3WARA 2GQGA 2Y4PA 3FAAA 3L8XA 3F3VA 2Z2WA 3ULIA 1Z5MA 3VULA 3FI4A 3LCOA 4E73A 4BBMA 4BR3A 3QTUA 4MQ1A 2WQEA 1UU9A 3VHKA 2OIDA 5K5NA 4FTMA 3FL5A 4OBPA 3UZRA 3BV2A 2FUMA 1QPDA 5JGAA 2UZNA 3ZBFA 3ODYX 4L44A 4QMWA 4YTCA 3LFSA 5B0XA 4BBEA 5BVFA 4N6YA 4QQCA 3RPYA 5CEMA 5E1SA 4LGHA 4F7LA 4FZFB 3R6XA 3OUKA 5CU6A 3UJGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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