4DFZE

Crystal structure of myristoylated k7c catalytic subunit of camp-dependent protein kinase in complex with sp20
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
350
structure length
347
Chain Sequence
GNAAAACKGSEQESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
publication title Role of N-terminal myristylation in the structure and regulation of cAMP-dependent protein kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 112
structure length 347
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dfzE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dfzE02
4FV6A 3LFEA 4D2RA 2P33A 4B99A 3D5VA 2R0UA 3SLSA 4EOIA 2CKEA 5JRSA 5L2WA 2GHLA 3E5AA 4FTLA 3I6UA 2VTHA 5AX9A 5FXRA 4PNKA 3R7EA 4FGRA 2WTWA 3MFSA 3H10A 3JVSA 4HVSA 3GOKA 3ZBFA 4ZLOA 4FG8A 3DS6A 4FSYA 2W4KA 1JBPE 3CJGA 4F99A 2VTRA 2VTLA 1XBCA 3OY3A 3VBTA 4OTIA 3ZLXA 4Y83A 5I0BA 4L67A 1QPEA 3VHKA 4JIKA 3DJ7A 4MD7E 3FI3A 2R3IA 4UEUA 3G6HA 3OWLA 2ITZA 5FUTA 2FSLX 3MA3A 5JMSA 4I6HA 4KSQA 3BKBA 5HIBA 5A9UA 4FV9A 4MCVA 3LFBA 3LXLA 3OT3A 1MRYA 4KBCA 4NL0A 1YI4A 5LVNA 3JVRA 4ZXTA 1OKVA 2WQEA 2GCDA 2OSCA 3UDBA 4D0WA 4EHEA 2PK9A 5ETCA 3ZTXA 5JFXA 3RAHA 4AGWA 4FC0A 1URWA 3PIZA 3PPZA 2J0IA 5CYIA 1V1KA 3MDYA 2QQ7A 3DKFA 3QZGA 5HICA 4D4RA 2IO6A 4PMMA 5FDXA 3CP9A 4DAWA 5LMKC 4FT0A 2WIPA 3P0MA 3QC9A 2BZHB 4FTTA 5ETFA 3DAEA 4E4XA 5A3XA 3S3IA 4W8EA 2XBAA 2H34A 3ZONA 4V04A 3DKCA 2QOCA 1OB3A 4YTFA 4Y73A 4FL2A 4JDIA 3UVPA 3V6SA 4F0GA 2JKQA 5BYLA 4GW8A 5T68A 3N4VA 3UP2A 4O82A 1YHSA 3ORNA 1NA7A 1YXUA 3VQUA 4WHZA 3WE4A 3GU5A 4O7YA 2P55A 4QYGA 2W7XA 4B0GA 4B8MA 4YJVA 5M57A 4BDIA 3PRFA 4RWKA 2HZNA 4XHKB 4LRMA 1H24A 3FJQE 4ZY4A 1APME 4GUEA 1ZRZA 1SVEA 2VNYA 2GQGA 3FYKX 4F6SA 4BKJA 4BCOA 4I23A 5CF6A 4O81A 5ANGA 3VUGA 3DK6A 4DGOA 4FIEA 4I93A 5IQAA 3W2RA 2W96B 4EC9A 1UNHA 2I1MA 3CPCA 3TV4A 2EB3A 4JX7A 4XRJA 3K3IA 4U7ZA 1Y91A 2XJ0A 5L2QA 4YSJA 4F70A 5F9EA 2VWBA 1IR3A 2YLFA 4WNKA 5KX8A 4BDKA 5C4KA 4M69A 4D55A 3U6IA 3BGPA 3NVKI 3KRRA 2GS7A 3IPHA 4GT3A 4W9XA 4XLVA 4O7VA 3PPKA 3KKVA 4C59A 4D4VA 4IB5A 4K33A 5J1WA 4FZDB 4TWNA 1DS5A 3HMNA 2VTNA 5HVYA 4AN9A 3FZSA 1OKZA 2OF4A 3UIUA 3E3BX 5KO1A 3GT8A 1FINA 4M12A 4AW0A 3COHA 4Q9ZA 5IUHA 4DCEA 1LEWA 3GOPA 3AC2A 3KXHA 4C4GA 5IQEA 3QLGA 3HP5A 4FSQA 4QQ5A 5BVWA 1NVQA 2JDOA 3TXOA 3WOWA 3LOKA 2YDJA 2CHLA 3BU6A 3CGFA 4KIOA 4RX9A 5C03A 5JSMA 3R63A 4FX3A 4GG5A 5IA3A 4CG8A 1CSNA 3ORIA 2PUPA 4AE9A 2C1AA 2UV2A 2IW6A 5DLSA 2WQOA 2J2IB 3U54A 4ZAUA 2YIWA 2RG5A 2WU7A 4KD1A 2J51A 3DU8A 1STCE 3BLHA 4LL0A 4TY1A 5CLPA 3R73A 4CT2A 2WMXA 5ICPA 1KE9A 5I9YA 5EI6A 3RNIA 2GNFA 3KGAA 4EOJA 2QOLA 3GC9A 3AXWA 4Q2AA 3RGFA 2H8HA 4GT5A 2YM4A 3DV3A 4YZNA 2BKKA 4IAZA 5J5TA 4OTHA 5IMXA 1R78A 3O8PA 5KMMA 3O17A 1AGWA 4PDSA 2BVAA 3ORTA 4FYNA 4PMTA 1U4DA 3GENA 5AP0A 3QLFA 3CJFA 4M0ZA 4BYJA 3L9LA 4FKGA 3ZC6A 4D0XA 2VN9A 2UZBA 4HCUA 4D2PA 4FF8A 3I0QA 4UB7A 2I40A 2IVSA 3NUNA 2QR7A 2QODA 3I0OA 4G9RA 3LJ1A 1Q8ZA 5AV1A 4FKLA 5EQEA 4DH7A 3VUTA 3NNWA 4GVJA 4ZTRA 1H01A 4ZSLA 1J7UA 2J0LA 4K77A 3NUPA 3VW8A 4QP2A 4Y5QA 3QRTA 5EHYA 4O84A 4G17A 2O2UA 2ETRA 2J7TA 3UC3A 2OU7A 2XIKA 4DFLA 5EDQA 3I60A 2C6LA 4A9RA 3Q2MA 1WBPA 4IVCA 4PDYA 4YHFA 5DMZA 3LLTA 3ATTA 3DY7A 4G3FA 3FZ1A 4ID7A 4QTCA 4DITA 2C6KA 1WCCA 3HV6A 5HU3A 3LXKA 4HW7A 3RTPA 1ZYCA 4FTRA 4GEOA 4LV5A 4RSSA 4QYFA 2PVMA 3HDMA 3IW6A 2WGJA 4WNPA 1G8AA 3W10A 3M42A 3VULA 3ZFYA 2C30A 4CCBA 3C9WA 1OI9A 3RVGA 4ORKA 2QKWB 3COIA 4WSYA 2ZOQA 4FR4A 4YTIA 2HWOA 3WIGA 1H00A 2WAJA 4BRXA 2HXLA 3DFCB 3ORMA 4EK5A 5LVOA 3RWPA 4HCTA 3QRKA 3ZLSA 2VX1A 2W9FB 4EHVA 2PE0A 5CEPA 4CQEA 4ENXA 1P4FA 3D5UA 4ZS0A 4K2RA 4LGDA 4DGLC 3WF8A 3OWKA 3W8QA 4CTBA 4GKHA 2PY3A 2BRBA 3AC4A 5ETIA 4CRSA 5G6VA 2OJJA 1YDRE 2C5OA 3MSSA 3LE6A 2WPAA 3R30A 4X3FB 4NK9A 3HMIA 3E8DA 4IADA 5A4LA 4Y95A 4DBNA 2QO2A 2YHVA 3IQ7A 3UZTA 3EQGA 3MFRA 4PPBA 4KKEA 3LPBA 4D1SA 1VYWA 2AYPA 2YEXA 2ZB1A 2HYYA 3QQLA 2O65A 4A4XA 3IDPA 4DH5A 2VTMA 4KAOA 3EQFA 1L8TA 2BAKA 3P08A 2X7FA 1TVOA 3RM6A 4AXAA 3MIAA 1OPJA 2JKKA 3GCSA 4QMUA 4A9YA 2XK9A 4KIKA 3NPCA 2BRMA 2CLQA 4ACDA 3C4WA 4QYEA 4C8BA 3QTIA 4FV4A 3SG8A 3FI2A 3A8XA 2FVDA 3ZO3A 5KNJA 3OG7A 4Y72A 3REPA 3VQHA 3ENHA 4CFXA 3NS9A 4O96A 4GKIA 4O91A 3RZFA 4BBEA 1PXKA 5F20A 1YWNA 4IIRA 4BDCA 2OH0E 4JLCA 4DLIA 3FAAA 1V0PA 4QD6A 1SMHA 5LVPA 3D7TA 2FUMA 2QLQA 2UW0A 5ANKA 3VF8A 2KTYA 3KXXA 3T3UA 4RZWA 5HX6A 2WXVA 3CC6A 1M52A 3JPVA 4R3CA 5HTIA 4BY9E 3KULA 3Q53A 2BHHA 1WVWA 3I1AA 4BZDA 3C5IA 4QMPA 3LKMA 2W1FA 5KZ0A 4UN0C 3ZUVA 1G5SA 4WO5A 2YM6A 4EC8A 5IQBA 3E63A 1FMKA 5TKDA 2Y4PA 1LEZA 2HCKA 1YW2A 1MQ4A 4H39A 1YXVA 5EM6A 1W0XC 1ZWSA 4ASEA 3FLQA 4BWKA 3C13A 2PTKA 2VWIA 1J1BA 3GNIB 4Z16A 4USDA 3QGYA 4EJ7A 3FI8A 4IANA 2QU5A 2YCSA 5KUPA 4F9BA 2C6TA 5A4TA 2X2LA 3H30A 4ZLYA 3WZDA 4HCVA 3ORZA 1S9IA 1Z5MA 3DBQA 3K5UA 2CNUA 2PZIA 3SXFA 4USEA 2IZTA 3TN8A 2BUJA 2XBJA 4BZOA 3VBQA 3QC4A 1U59A 5CTPA 3NUYA 4EHZA 3SKCA 3P1AA 4K18A 4R6VA 1PF8A 3P7BA 2PVJA 4X3JA 5KBRA 3RK7A 4JBQA 4A9TA 5KKRC 3F5GA 3HZTA 3NEWA 3MGYA 1VZOA 4RLKA 3MIYA 1UWJA 3TNWA 2XK3A 4L43A 2X1NA 5E4HA 4BICA 1J1CA 1GJOA 2YACA 2QNJA 2OJGA 3MS9A 4XV1A 3D15A 3NNVA 4MHAA 3CD3A 4KIQA 2OH4A 2YAKA 4OTDA 4UMQA 3BU5A 2ZDTA 4J7BA 1WVXA 3V5QA 3VUMA 3C4ZA 4IC7A 4YC3A 4XH6A 3PDTA 5FEEA 2H96A 2O63A 3L1SA 4GSBA 3VO3A 4DGGA 2XF0A 2C5NA 4XP2A 4AQCA 4O7ZA 3HA8A 2YABA 2PVFA 3IDCA 3G2FA 4YC8A 5I3OA 4XYFA 4QOXA 3LCTA 2XZSA 5E7RA 4IX3A 3QD0A 3VNTA 3Q9ZA 3WZJA 4FSZA 3H9OA 5IH4A 2V62A 1M2PA 4ANLA 3QRJA 5EW3A 4B4LA 5B2LA 1CMKE 4JBVA 3HA6A 3OTUA 2VO7A 1ZARA 4YPDA 2R3HA 4NJDA 3NYXA 4I6BA 2NRUA 3F61A 3S1HA 3EQIA 3QQJA 4NWMA 3BCEA 4J96A 5J95A 4D58A 4D2WA 2BILB 3HLLA 2O64A 1KOAA 3RZBA 1KV2A 3FLYA 3HV4A 1REKA 4WG5A 4AAAA 1XH8A 3BHVA 1RDQE 4OW8A 3SG9A 3EHAA 4MNFA 2XJ1A 4NTSA 4YC6A 1U54B 2VWYA 3COMA 2GNHA 5KBQA 3BQCA 3EJ1A 4JAJA 3OS3A 5TT7A 1WAKA 2C69A 4JX3A 4TYGA 5HD7A 4C37A 1ZYLA 2O5KA 2WIHA 3QQFA 3R28A 5LMKA 5BUJA 3CCNA 2B4SB 4JQEA 4D4SA 4IZAA 2P3GX 4QP8A 3TEIA 4O6LA 4RVLA 3EB0A 1M2QA 1BLXA 3VS5A 1JWHA 3Q04A 5FTQA 2IWIA 3BHHA 3PY1A 4DGNA 2NNWB 3SDJA 1YOLA 3BLRA 1JVPP 5FGKA 3DLZA 4GFGA 1NW1A 4I6FA 4YTCA 1KE6A 3JY9A 3TI1A 3C4EA 3O8UA 1YKRA 4FOCA 2GNLA 2VO0A 4I5CA 2B9FA 4BZNA 4EH9A 5HX8A 3PXKA 2R3GA 4OT6A 5C4LA 5T3QA 3BX5A 4Z9LA 4YJPA 3JS2A 2LAVA 2VWWA 3LFNA 4JOAA 4E6CA 3UYTA 3V01A 4EH3A 5K5XA 2PU8A 2YIRA 4O7TA 5AADA 4GFMA 4BCJA 5CI7A 4P90A 3Q6UA 1Q62A 4E20A 1YXXA 4J8NA 4YJSA 4N57A 4F4PA 3HUCA 3MTFA 4AZFA 5CANA 2PVYA 4QMZA 2CGWA 1FVVA 3HV3A 3N51A 1DAYA 3Q96A 4FTNA 4U3YA 5FDPA 3NAXA 4BTKA 3IECA 1MP8A 4Y85A 3RMFA 3UIXA 4IE9A 3NYVA 5CEIA 4BWXA 4GS6A 1PW2A 4TT7A 4B9DA 4AN2A 5CEMA 3UNJA 5HU9A 3DJ6A 4NYEA 5CAVA 2B9JA 4P4CA 3ZH8A 3ENMA 4BDJA 3TZ8A 2BROA 4RJ4A 4ZSJA 2WMAA 2BMCA 2R3KA 3KN6A 4K8AA 1JKTA 3UOKA 4FKJA 4D2VA 3I6WA 3VUHA 3W1FA 2E9PA 2Y4IC 3QQUA 4ERKA 3BV2A 3RCDA 2XIXA 5HBHA 5D10A 2YDIA 4L46A 1OVEA 3F66A 4Q9SA 4GG7A 2CKQA 1CDKA 2QVSE 2ZAZA 3LLAA 3F3UA 2UW9A 3BBWA 4I3ZA 4ZZMA 1VYZA 2B9IA 2C6IA 2R3FA 3BWJA 3O7LB 3PIYA 4B6LA 3CTHA 4O0WA 4IWDA 3Q6WA 2G2FA 3MJ2A 3BHTA 3KU2A 4IBMA 1NVRA 4L7SA 4JRVA 2CN5A 2G1TA 4FV2A 4MVFA 3M2WA 5CF5A 4JDJA 1FGKA 3G6GA 2XIZA 3Q5IA 2C5VA 4UYNA 2CNQA 1IA9A 3AQVA 1JKLA 4RZVA 5DVRA 4I5PA 4ZTHA 1PYEA 3JXWA 4IEBA 2VO3A 2XK4A 2Y6MA 3C1XA 4ANBA 5C8MA 3QA8A 5B2KA 4LGGA 3D5WA 5JEBA 4AW5A 1OBGA 1SVHA 1H26A 3OHTA 5IQDA 5HG7A 4CNHA 2YJSA 2ZMCA 4XRLA 3EQRA 4YU2A 2VO6A 4ZSAA 4AOIA 4TN6A 2ITXA 5E1EA 4BDHA 5FD2A 3BV3A 3UJGA 4IMYA 4RG0A 4EYJA 4FKWA 3I5ZA 2ZM3A 4CCUA 2IJMA 1SVGA 3B2WA 3G5DA 2Q0NA 3SXSA 3KL8A 4V0GA 3KF7A 4RBLA 4A9UA 2G2IA 3BE9A 1Z9XA 4TRLA 1RQQA 2J4ZA 3F3VA 3U51A 4YUQA 4GL9A 5HG5A 2OJFE 4GU9A 4YPSA 5DH3A 3ZBXA 4AT5A 4RFMA 4Z3VA 4QMYA 4FKRA 3GU6A 2YJRA 4YNOA 3Q2JA 2QD9A 3JUHA 2J9MA 4E3CA 2I6LA 3DBCA 1YI6A 2EWAA 5ANEA 5M4IA 5CAQA 2P2HA 4WA9A 3ZXZA 2ITWA 4EH7A 5EI8A 1CKPA 3OW4A 3QXOA 4E5BA 5JQ8A 2W1DA 4CYJA 4F65A 3EN7A 4PP9A 3HMOA 2RFEA 3H9FA 2IW8A 4DFXE 3UOJA 1W83A 3OCBA 1OIYA 2IVTA 3DQWA 4QO9A 3C0GA 4EUUA 4KNBA 4QPAA 4D5HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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