4DH3A

Low temperature x-ray structure of camp dependent protein kinase a catalytic subunit with high mg2+, atp and ip20
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
336
structure length
333
Chain Sequence
VKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
publication title Low- and room-temperature X-ray structures of protein kinase A ternary complexes shed new light on its activity.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 108
structure length 333
sequence length 336
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dh3A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dh3A02
4CQEA 2FVDA 4FV6A 2Z60A 3EWHA 4GT5A 1ERKA 2GNGA 3CTQA 3LCTA 4IX6A 4LYNA 3UMWA 4ACHA 3OEFX 1ZLTA 3UPZA 5HIDA 4PP9A 3P86A 2ONLA 4UZDA 3TEIA 5DOSA 1Q8TA 2X7GA 2QO7A 4KD1A 5BMMA 4FTJA 3PJ8A 4JT3A 4E4MA 3GCPA 4NIFA 1XBCA 1VR2A 1WMKA 4MXCA 4V05A 4BWKA 1TQPA 3WARA 5M53A 1CKIA 2VTRA 1XQZA 3W2RA 4BGHA 4BKYA 2PVHA 3E8EA 3PXQA 4JBOA 2ETKA 1B39A 3R30A 4X2JA 4YJVA 3O23A 4FTCA 2RFNA 4TPTA 3LMHA 3NNUA 3ORLA 3RPVA 2Z7LA 4MYGA 2PVMA 2OZOA 4PMMA 3KEXA 3R8UA 4UV0A 4B6LA 5IZFA 4HVGA 3D7TA 3UIMA 3NIZA 3FBVA 3JS2A 5LWNA 2CNUA 5AUWA 5A4TA 2BDFA 3LVPA 3B8QA 2BUJA 4IB5A 5IQDA 3IDPA 3QZFA 3S0OA 3H0ZA 5TT7A 3KXNA 2VRXA 5E1SA 5CSWA 3U8WA 2UW6A 3ANQA 2O5KA 3OHTA 4WOVA 1GIJA 1Y91A 3LAUA 2H34A 5HU9A 4E5BA 1A48A 1XH6A 2B55A 4EOQA 4KB8A 1KSWA 4PRJA 3V5JA 2PMNX 1IG1A 4YJQA 4CMUA 4QYYA 2WQOA 3BHYA 5I9WA 5H8EA 4FK6A 2ZV7A 4MBLA 2QG5A 3HNGA 4XYFA 4EK3A 1P4OA 3G9NA 5F95A 3M11A 3NUAA 3TL8A 2YAAA 3WOWA 4YLJA 5B7VA 5EDRA 5T68A 2B1PA 3PVGA 3C4EA 4L00A 4NFNA 3PFQA 5KMKA 2OLCA 2HWPA 3AC3A 4I5CA 2X7OA 4YMJA 1FVVA 3FZRA 3R9NA 3KRJA 3PLAE 3BHUA 5ETIA 2Z7SA 4BCGA 1HCLA 4ZTMA 3FLNC 5CVGA 2VO3A 5D1JA 4C3RA 4EH9A 3IW8A 4O0VA 4ACDA 4D28A 4DG0E 4GFMA 3K54A 5IQEA 4JDHA 1FGIA 3U51A 1DAWA 3CY2A 1W83A 4FZ6A 2QOOA 4A07A 2XYUA 2CN5A 3DKGA 1JLUE 4DTKA 4AX8A 1H4LA 4FYOA 4RC4A 5FTOA 4RVMA 5E9EA 2H8HA 1LEWA 3FJQE 2AC5A 3LZBA 4FEXA 3W32A 3LFDA 4YJRA 4YSJA 4W9WA 1X8BA 3H9RA 4TNDA 3R7UA 2GQRA 3BGZA 1ZY4A 2W06A 4C3PA 4D58A 4OT6A 3HV4A 1H07A 3AC5A 5ANDA 4CNHA 4FTUA 2I0VA 2QHNA 5JFXA 4GKHA 5FXQA 3QTRA 3E7OA 4KKGA 5CU3A 3R21A 1IA9A 2IVVA 1SMHA 4BRXA 4AE6A 5I3OA 3V5LA 3D7TB 3FLQA 2Y0AA 5EW9A 1XH9A 4E5AX 4O7NA 3PSBA 4EKKA 5GIPE 3DAEA 4TYEA 3G15A 4ONAA 4YSMA 3SX9A 3WYXA 1PMVA 1O6LA 5FDXA 5ITAA 1T46A 2BTSA 4YHFA 4BHZA 5CAVA 1Y57A 5KNJA 3AD6A 5CEIA 5BUJA 1JQHA 5AUZA 2OI4X 3L9PA 4FZAB 4MNEB 2QKWB 1M2PA 4BDAA 4KNBA 3OXIA 4P2KA 4XH6A 4FX3A 2XIRA 3EKKA 3H9OA 3R0TA 1RDQE 2DWBA 4I93A 4XLIA 1XH7A 2W4KA 3HV6A 4TT7A 2XCKA 5HG8A 3BWJA 2E9PA 1OGUA 3VJNA 1Y6BA 2R3JA 3P08A 4HPUE 3W16A 5BYLA 4RX8A 5FD2A 4QTEA 2A27A 2VO7A 2XIYA 4BKJA 4E8AA 4KBAA 4IAIA 5T6KA 1M2QA 4BZDA 1CDKA 1APME 1LR4A 1OMWA 4FGRA 2C0TA 3DA6A 2PY3A 1YXVA 3QD4A 4AU8A 2UZWE 1GNGA 4ZTSA 4E6DA 2HW6A 3UO5A 4JAJA 1YHVA 3QTXA 5BQ0A 1XKKA 2UVZA 5DWRA 4DINA 2HYYA 4BI0A 1OBGA 3GENA 4GVAA 4N57A 3ET7A 5HNIX 5AV4A 5G1XA 2C1AA 4FTQA 4FE2A 3PPJA 3QRTA 5J1VA 4IM0A 5L8KA 5J7BA 5IUGA 4NZWB 4U44A 4EYMA 4IZ5A 4YLKA 4RX9A 4G9RA 4D4VA 3FZOA 1KE6A 4DAWA 3OFMA 4MEDA 4FV2A 5M4FA 2EXEA 3UTOA 2YWVA 3U9CA 3ORTA 4FSNA 5IEYA 2OXXA 1CSNA 3GI3A 3DJ6A 3HYHA 4ZJVA 1RE8A 4M67A 5M51A 5FDPA 3QBNA 4I6QA 5EH0A 2E9UA 4K0YA 2JITA 5ANJA 4QTBA 4ZJJA 3NUUA 4IX4A 2YM6A 3OUKA 3KF4A 5EG3A 2CCIA 3SXFA 4CFUA 3QTQA 5J9YA 1KE5A 2G15A 3GOKA 5LVMA 3JPVA 2VTLA 3QGWA 4U5JA 3CKXA 4QMYA 3WBLA 4OGRA 1QL6A 4USFA 5HTCA 3D5XA 4F0FA 4L45A 1YDSE 4ANMA 2GHLA 4GV1A 4R7HA 2PMIA 4M7IA 4NKAA 3SXSA 3UQFA 4BCIA 2PZIA 1WBOA 4DYMA 3C4XA 2QQ7A 3MPTA 3FYKX 3EQDA 4IIRA 1XBBA 3L9MA 4AP7A 2BAQA 3DBFA 3GQLA 4RT7A 3AMAA 1JWHA 2QHMA 3HRBA 3ZBFA 3PY3A 4E3CA 3QL8A 4W8EA 4R77A 3NUPA 4YPDA 3FMEA 4TYJA 2YA9A 3CY3A 3KXZA 3W2OA 4E6QA 5AR8A 4TRLA 4Q5EA 3R9DA 3KCKA 3FMNA 4IC7A 4O22A 4TWNA 2ERZE 2XNPA 4CZUA 3FMDA 2I0HA 4AT3A 1UKIA 3EKNA 4OUCA 3DY7A 3BRBA 2UW5A 1PYEA 4BWPA 3Q04A 5M56A 4C36A 3LFQA 2WGJA 5HLPA 4O1OA 3UQCA 4HYSA 4QOXA 5C9CA 3AGLA 3RTPA 3DAJA 4CFMA 2QG7A 1F0QA 4C4EA 3R9HA 1IAHA 2VTSA 3ZUUA 1GY3A 3BU3A 3ORXA 5E8WA 4O81A 4DFXE 4RVTA 5A4EA 4K6ZA 3KRLA 3UG1A 4JOAA 4GFGA 2R3IA 3G2FA 4A4XA 1QPCA 4FIFA 2Y9QA 4W9XA 3MTLA 4XV3A 4Y8DA 1WVYA 2HCKA 4YZDA 2NNWB 4TXCA 4HYIA 3VC4A 4UX9A 3L8VA 4X6RA 4Z16A 5EQEA 3C0IA 3QGYA 2C3KA 4Y85A 1OL6A 3UO6A 3Q4ZA 4RX7A 4C35A 4YNOA 4BL1A 4AAAA 2XK8A 3F3WA 3BZ3A 3QTIA 3PUPA 2WTVA 1NXKA 2QOHA 2Z7QA 3QHRA 5AP7A 3UP2A 1PKDA 3F7ZA 2Y6MA 3DB6A 4NTTA 5FBNC 2QVSE 3EN9A 4FV7A 5JFWA 5H8BA 4CZTA 4I94A 2WTDA 3ATTA 3OZ6A 4L8MA 3GU4A 4C38A 5BUIA 2VWYA 3R8PA 5CALA 1REJA 4GKIA 4E7WA 4WHZA 2Q83A 5EYMA 2W1ZA 4KABA 2JDVA 4PMTA 2ZDUA 3AOXA 4ID7A 3UMXA 2ZMDA 1H1PA 3DV3A 3OTUA 4UMUA 4C34A 3FI8A 3M2WA 4IH8A 2YAKA 2C30A 4PL5A 3UZPA 2YCQA 1KOBA 1OVEA 2XNEA 3MI9A 4FSUA 2GNIA 3ID6C 3D5VA 3RM7A 4DGLC 3CP9A 3NVMB 2OF4A 4HVIA 4YJSA 2CDZA 2YJRA 3O8TA 5K4JA 3KC3A 2QO9A 3DZOA 2W17A 4HGSA 4I23A 3ZC6A 4P7EA 3FXXA 3QTSA 3A8XA 4CSVA 5EI6A 4K33A 5AIKA 4FKQA 1JNKA 2WPAA 3EL7A 4MD9E 5A4LA 4R1VA 3IO7A 4IJPA 5CT0A 4PNKA 3C4CA 4OR5A 2XEYA 4LMUA 3ORIA 5IA4A 4TNBA 3CXWA 1UNHA 4FBXA 4YJTA 2PPQA 3BLQA 5F9EA 4I5HA 3PA5A 4BTMA 2ITXA 2ITWA 4QQTA 5FEQA 5JQ5A 4D2SA 5LWMA 4P5ZA 2KTYA 4CCUA 4HW7A 3AD5A 1ZOGA 4RG0A 5CF5A 1Q8UA 1Q41A 2O65A 3DBQA 3KB7A 3LXLA 1CKJA 3OOMA 3BELA 4J95A 4YTIA 3VS3A 1DI9A 1UWHA 2OU7A 3IQ7A 3JUHA 3PJCA 4BICA 2E9OA 4WNMA 2I7QA 5M06A 1JKLA 3BHVA 5F20A 3ZC5A 1FBNA 2BRBA 2XM9A 3A62A 1Q99A 4FICA 3LFNA 4XG6A 5A46A 3FKLA 4FT0A 3UNZA 2PZYA 1FQ1B 1Q3WA 2J0JA 3GBZA 4GT4A 4NW6A 2HXLA 4O0SA 2ITNA 3C51A 5TF9A 4AZWA 4CLJA 3M42A 2WMTA 4G6OA 3SA0A 3QD0A 1WBVA 2WAJA 3F6XA 3IGOA 3W8LA 5AEPA 5C4LA 1OI9A 2JAVA 2R4BA 2ITOA 2YM5A 1V1KA 1XH4A 4EH6A 3OY3A 4JBPA 2J7TA 3K5VA 2C5OA 4ENYA 4ZZMA 5ICPA 1XHAA 3MB6A 5HD7A 3OEZA 3QX4A 5I9UA 2BAJA 1OPLA 2X1NA 3VS2A 2GHGA 2HXQA 3LJ1A 2VTAA 4M0ZA 4O82A 3FPMA 3GNIB 3KRRA 4FZ7A 3HX4A 2YHVA 3BGQA 4C2VA 3E8CA 3QAME 3O7LB 3NW7A 3FWQA 3Q6UA 5C4KA 1V0PA 3NAXA 2GSFA 4BDGA 4BTKA 5FGKA 4HVDA 1OL7A 3EQIA 4BR3A 4YURA 5HE0A 3A99A 5DFPA 4S34A 3OCSA 4W4WA 4X0MA 3V5PA 3ZTXA 4NU1A 4JBVA 5F4NA 4I6HA 1JOWB 3IG7A 4MXOA 3DBDA 5H8GA 2KULA 3IS5A 3FC1X 1CTPE 4R7BA 3KU2A 2WXVA 5EHLA 2ITQA 2R3RA 5A6OA 2IJMA 5J95A 4OBOA 4KA3A 4YHJA 4FIJA 4CTBA 2IW6A 1UKHA 2P3GX 5EOBA 3BV3A 4RWJA 3AT4A 4AW0A 4QP3A 3MH2A 3QF9A 3W1FA 4J8NA 5DE2A 4ZSAA 4IBMA 4KWPA 5AP6A 1G8SA 1ND4A 3IPHA 3PXYA 4R1YA 4IDTA 3FMLA 2YJSA 4D0XA 3D4QA 3NGAA 1OECA 1P14A 2P0CA 3ITZA 3OXZA 4ZIMA 4C4IA 2X9EA 5FTGA 3K3JA 1ZXEA 3TNQB 2JIUA 3UC3A 2XM8A 3ELJA 1UVRA 1H1QA 2IVUA 3IDBA 4UWCA 4XCUA 2WMRA 5HO8A 4KIKA 5IQBA 2JDRA 4Q9ZA 3HA6A 4WUAA 4CFFA 4EHZA 5FUTA 3BV2A 4ACGA 4YJNA 5EHOA 4JVGA 3D94A 2O0UA 1XWSA 1PF8A 3V04A 5CEQA 2EWAA 2FO0A 4DE4A 2WMWA 3FQHA 3LFBA 4USDA 2UZBA 3C5UA 4YTCA 4BY9E 3PXRA 3O8PA 4RVLA 3LE6A 4YC6A 3H3CA 4O2PA 4IE9A 4MVFA 3CEKA 5AADA 3EN5A 3ULZA 5TOZA 5CAUA 5IDPA 4I0SA 3MESA 4TZRA 3OD6X 5CI6A 3QLGA 1T45A 2ZAZA 3TNIA 4KINA 3CKWA 2Y4PA 4FF8A 3UNJA 3ZYAA 2HY81 3FMHA 3KXMA 1XBAA 5CS6A 4JQ8A 4R3RA 1Q61A 4ASXA 4B8MA 1ZARA 4F1TA 1JVPP 4DEBA 1A06A 1Q4LA 4IQ6A 4ZSGA 1H1WA 1R78A 5A9UA 4IM3A 5KHWA 4FTIA 3GVUA 3BBWA 3GCUA 5FQDC 3OVVA 2B53A 4ERWA 1YVJA 3HRFA 5HE2A 4O6LA 3Q60A 2R3HA 2VWIA 3GXLA 4GK4A 3CIKA 1O9UA 4H1MA 4QTAA 3R8MA 4DF3A 3I81A 2IG7A 2OGVA 4TTHB 2XK4A 3BU5A 2IN6A 3HAMA 3V3VA 4RA5A 3EFLA 4P5QA 4WG5A 4FSYA 3FL5A 3CJFA 4UXLA 2WTIA 4PTGA 2YCSA 4MH7A 1GIIA 1PXMA 3R83A 4ZK5A 3PG1A 4JX7A 4A7CA 4AFJA 5JT2A 4QTCA 5AM6A 4QD6A 4UEUA 4ASEA 5CY3A 3TT0A 3P7BA 5L2TA 3DK6A 3GC0A 3ZO2A 3WZDA 4FYNA 1P4FA 4KSPA 3OOGA 3R7GA 4FKTA 5FWKK 4DLJA 3Q2MA 4D2VA 5J87A 2PUIA 4QMWA 4FT7A 2X9FA 2E2BA 4AN2A 4BDFA 5M44A 3T8OA 1BL7A 5HLWA 4BZNA 5JMSA 2IVTA 3VQUA 4N0SA 4AZSA 4E6CA 2VTIA 2WZJA 2VTTA 4FKSA 4IAFA 2OFUA 4ZTLA 5I9YA 5EHYA 3G5DA 2V7AA 3NEWA 2OJ9A 2YWPA 3SRVA 3MN3A 1IAJA 2G2FA 4M13A 3TTIA 3UIXA 1NY3A 4L9IA 1H8FA 3TV6A 2W1FA 3ZLYA 2QODA 4WRGA 2WMQA 1BL6A 4YC3A 5DEWA 5E91A 5DPVA 3DLSA 3QTUA 4TN6A 2VGPA 4QMMA 2OJIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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