4DLIA

Human p38 map kinase in complex with rl87
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
350
structure length
334
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Fluorophore labeled kinase detects ligands that bind within the MAPK insert of p38alpha kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 110
structure length 334
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dliA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dliA01
3HZTA 4V05A 4BCIA 2WOUA 2V22A 4ZSEA 4I5HA 4YZCA 4F6UA 4ZZNA 3E87A 4IHPA 4RC2A 2FYSA 5M56A 5DT4A 2WPAA 2XNMA 3OUKA 4X21A 4F99A 1A9UA 5FQDC 3AT2A 4GH2A 3SQQA 4Z55A 3SVVA 2R3OA 5FP5A 4IC8A 4W8DA 2B4SB 3SLSA 4DEEA 2XM8A 3OBGA 5KX8A 1IG1A 1T45A 3PRIA 5CEIA 5FEQA 3QTZA 3MH0A 3FZ1A 1SZMA 3OMVA 2W9FB 4IX4A 3RAKA 4FA2A 4DH7A 4M69A 4R5SA 1Q3DA 4OTHA 4YURA 1P4FA 5H8BA 3QZGA 4ZTRA 3BE9A 4C62A 3I5ZA 4I6FA 5CF6A 3O71A 2QOCA 3VUTA 4F0IA 3NAYA 4GEOA 4O7TA 2I40A 4EK3A 4NM3A 3PSDA 4MBIA 3CJGA 4AGDA 2PVJA 4DEDA 4FIEA 5HX6A 4L8MA 4FKLA 3TZ7A 1U4DA 2FH9A 3OCBA 4TT7A 2WU7A 4J95A 3JS2A 4HGEA 4R78A 3MVLA 3TT0A 2O0UA 5AUXA 2BTRA 4PDSA 5HNGA 4EOMA 3EQDA 4GS6A 4FX3A 2P2HA 5C8MA 4AW0A 5C8KA 4FV2A 3RAIA 2XBJA 3VS3A 3EFJA 2BRHA 1BL6A 3EKNA 3ORIA 4FOBA 5IPJA 1JAMA 4KIPA 2XKEA 3T9IA 1MUOA 4FKSA 5HLWA 3RBWA 5JFSA 4ASXA 2CNUA 4CTBA 3TDVA 4O81A 2HK5A 3LCKA 1XHAA 3P4KA 4ANQA 4C4FA 5LMBA 2GNJA 2LGCA 4ANSA 1PXOA 3FMHA 3RKBA 3HAVA 4PL4A 1KV1A 4TYJA 5DG5A 3DQWA 4RFZA 4EH8A 4R77A 3R22A 3NUNA 3DT1A 4NWMA 2IVVA 2YM6A 4EOPA 1FOTA 5LWMA 3BQCA 4A9YA 5CAPA 2QQ7A 4BRXA 1KUTA 5HE0A 2IZUA 5KE0A 4W4YA 3GCQA 3VUHA 1KSWA 4CVAA 2JC6A 4FSQA 2ETRA 1BI7A 2ZJWA 3DZQA 5E1EA 5BUIA 1OL1A 4NTTA 2BRMA 3LQ8A 4PPBA 1FVRA 4DINA 2V5QA 5HZNA 2UZEA 1TKIA 3P78A 4FTJA 3DZOA 3F69A 2O8YA 4OTQA 5CNOA 3DJ6A 4LV8A 3DTWA 5A9UA 3D9VA 2UW3A 2RFEA 3AXWA 3CTQA 5AV1A 3VS2A 2VU3A 3GC9A 4TWPA 4WNKA 4DEHA 4HVSA 2H8HA 1B38A 3DBEA 3MJ2A 5EH0A 2QODA 2YIWA 2XF0A 4BZOA 2OICA 3DAJA 3FY0A 3LFEA 2XB7A 4LGDA 4NCTA 4HGTA 1NA7A 3D94A 3LCSA 4JIAA 5IQEA 5IA4A 2BILB 1Q24A 2QG5A 4G5PA 2RG6A 4CXAA 4GVJA 5DR6A 4HZSA 4CT2A 5JGAA 5E92A 4I4FA 4UYAA 3OY1A 4C59A 4G6OA 1Q41A 5LVLA 3EN4A 4I22A 2R3LA 4O27B 4IACA 5JQ5A 1PXMA 4YZNA 3QGWA 2R3QA 3K2LA 1B39A 5EHYA 4F70A 4TYHB 2F4JA 3EN7A 3V04A 3VBYA 4FSUA 4CZTA 5FBOA 2C4GA 3L9LA 3T3VA 3G0FA 3QWKA 2CGWA 4OTDA 5IQDA 2R3JA 2GNIA 2ZDUA 5IQBA 3R8UA 3H0YA 2W9ZB 3DBQA 4F9BA 3F7ZA 4IZ7A 4IB1A 4Z9LA 3AG9A 5DRBA 2VWYA 4YNEA 1STCE 1XBCA 3RPSA 3QZFA 3H9FA 2C5XA 4XRJA 5CEMA 5AX9A 3M2WA 2IVTA 3PPZA 2Z60A 2VWUA 4ZTQA 5BVWA 5LMAA 5AV4A 3IW7A 4APCA 4ACGA 3F2AA 3BV3A 3QCSA 3G15A 1SNUA 3HRCA 5B7VA 5D1JA 5IA2A 3WIKA 3F3VA 4F08A 2XVDA 2CGUA 5I4NA 4I6QA 4QMVA 4D4YA 3PA3A 5JMSA 2VWBA 4XX9A 3DBDA 3L9PA 2I7QA 2HZIA 4BF2A 5BMSA 3R8PA 2JKKA 4FE2A 4MHAA 5HHWA 3LFSA 3UPZA 4BI2A 4U42A 1WCCA 2WIHA 3ANQA 1W98A 2XIZA 3A8XA 4TXCA 2CLQA 5AIRA 3A7JA 1YI3A 2FSMX 5JEBA 5AM6A 3D5WA 3F5PA 4D2RA 2QOKA 2V7OA 3R8MA 2ITWA 4FV7A 4AT4A 3CGFA 3TV4A 2PULA 5H8EA 4PY1A 4IZAA 2YITA 3EB0A 3LJ1A 4CRLA 4JDJA 3G33A 5K5XA 3AC8A 5CF4A 2WMWA 2WGJA 3EYGA 4F9AA 2UW4A 4F1OA 3SGCA 2VN9A 4IAZA 2F49A 4O7YA 3P86A 3ZM4A 4NTSA 1ZYSA 2C6TA 4EOJA 5B2MA 2YZLA 1G8AA 3LM5A 1BYGA 1DI9A 4QD6A 5M4CA 1UU7A 2HIWA 2Z8CA 5CT0A 5EDPA 1APME 3B2TA 4IEBA 2Y8OA 3GFWA 1ATPE 5HTIA 5I9WA 5HTCA 3EWHA 1V0PA 4DH1A 5L2WA 3O7LD 2BUJA 3M11A 4IMYA 4ZS0A 3Q9ZA 5BVOA 3E88A 3TL8A 2R3MA 4G3CA 1XJDA 5ANIA 5ETAA 4CEGA 3QXPA 3F82A 4FTMA 4Y95A 3UVQA 3QRTA 1H27A 3DGKA 4J99A 5DHJA 3A62A 5LOHA 4FYOA 3QRJA 4BWPA 3NRMA 3R9HA 4O83A 4OTGA 1UV5A 2VV9A 3LLTA 3Q9YA 2F7XE 4KB8A 2BRGA 4QP9A 3UIXA 3COIA 2UZVA 5DGZA 5IMEA 3PTGA 3DFAA 5CU4A 2I0VA 5BYZA 3D7ZA 4EQMA 4FG9A 3FL5A 3BHYA 4FKVA 2C6OA 3NNUA 3DLSA 4L7FA 2UVZA 4QP8A 4Y5QA 5HO8A 4D58A 4UX9A 3RGFA 2VX0A 3DK7A 3UQCA 3ZFXA 4X7QA 3TNHA 4CCUA 4FV1A 4HJOA 4M15A 3F9NA 4ANBA 4I0RA 3HP2A 3BWFA 5L6WL 1CKJA 4FZDB 2H9VA 1YI6A 3GP0A 1XH5A 3VQHA 4PDYA 3EZRA 1UNHA 3HEGA 4GT3A 4DF3A 3FLWA 2UW8A 3UJGA 4I93A 4RLLA 5A4LA 1ND4A 1WBWA 3JPVA 2VO0A 3QA8A 4IAAA 4DT9A 3IG7A 1QPCA 3D5UA 4G1WA 2QR7A 4RWJA 4FTRA 2WMSA 4L43A 4E20A 4XOYA 5EM5A 3TJCA 4IIRA 2OZOA 1PY5A 3HDNA 3SOAA 2OO8X 2JDVA 3L8VA 3KGAA 1YWNA 4KBKA 2J0JA 4PTGA 5KNJA 2AC5A 5M06A 5K3YA 4EZ7A 1JWHA 3FZTA 5AV0A 1QPDA 3A4PA 1R0EA 5HCZA 3GU8A 5TR6A 2Y9QA 2G9XA 5EI8A 2W4JA 2YFXA 3I6WA 4BDDA 4D1XA 4ASDA 5BVKA 2X9FA 2H6DA 5FUTA 3LFNA 3V6RA 2YIYA 5AAFA 2ZOQA 3U55A 4KNBA 3PVWA 3MGYA 2BPMA 4CT1A 1B6CB 4DFNA 3C0HA 2RFSA 2ZV9A 5HU9A 3I5NA 1E1VA 4FSRA 4DAWA 2PUPA 3OW3A 2OH0E 4AN3A 2ZYBA 2IW8A 2WKMA 3POZA 4AP7A 2Z7SA 3ERKA 2XKDA 2J0IA 3TTIA 4BDHA 2QOQA 4QMWA 2EB3A 3ZUVA 2GHMA 3R28A 4E8AA 2J5EA 3VJNA 3C5IA 4NIFB 4CG9A 4AACA 5CI7A 3P23A 3EL7A 5CSVA 4RZWA 3CQEA 2BHEA 4ZEGA 4R7IA 2WZJA 3DBCA 4L53A 5HG5A 2ZV2A 1JKKA 2J7TA 5CAVA 3OXZA 5HE1A 4JI9A 2QOLA 2DWBA 3P5KA 5JZJA 2ZV8A 3MA3A 4X2NA 2OXXA 4LUEA 3ZBFA 3WARA 4GIHA 5H9BA 4YZMA 2WTJA 3QC4A 4C4HA 4F6SA 3F5UA 4QTCA 4UMRA 4DGMA 4YSJA 3MSSA 2UZUE 2HZ0A 3GCPA 4Y83A 5HGIA 3TNIA 2I0HA 4S33A 3WZKA 2PMNX 3ZTXA 3UOHA 5EKNA 1OBGA 1CMKE 2C5VA 1ZMVA 4O38A 4EWQA 1OMWA 2YM5A 3KXGA 5E7RA 4B9DA 4F0FA 5AX3A 1AGWA 3I7BA 2Y4IB 5G6VA 4NUSA 4USEA 5FLFA 4BICA 1JLUE 2R3GA 4LRJA 4XV9A 5E1SA 2HY81 1ZMWA 1ZY5A 3RPOA 3THBA 4B0GA 4CGAA 5IQGA 4YJUA 3QYZA 4OTFA 3AC1A 4PF4A 5AP2A 4C61A 4EBVA 4NL0A 4O84A 3FPQA 2ERKA 2VTMA 3FSFA 4DN5A 2VTHA 3COKA 4FKRA 4PNKA 2BFYA 3CKWA 5H3QA 3O96A 4NK9A 4UY9A 1OM1A 3HMPA 3VWAA 3FMKA 3FPMA 4JR3A 3DOGA 2W1GA 4YJSA 5I9UA 1OVEA 1ZOHA 3LPBA 5M57A 1T46A 3NIZA 2UVXA 3BV2A 3LFDA 4RVMA 5LWNA 1YXTA 2NRUA 3GC7A 3LCOA 4RT7A 2Y7JA 2PZ5A 3O51A 3V3VA 3L9NA 3T9TA 2UVYA 3WILA 3FI8A 4U40A 4CLJA 2EVAA 3NCGA 3E8DA 4RIXA 1OIYA 4D4VA 4JG7A 3ZO4A 3E3BX 5IUGA 4CFVA 5KKRC 4GUBA 2XIKA 1K2PA 1PYXA 4U97A 1CTPE 2ITXA 4S31A 2UUEA 3LFCA 4IWQA 1W8CA 4KABA 3WYYA 2JD5A 4D4SA 3QUPA 5AEPA 4RZVA 5DEYA 5KO1A 4W4VA 2JIUA 4LQMA 2GFCA 4L00A 4J97A 3F3WA 2VO6A 3UBDA 1PKGA 3R1QA 4OW8A 4IDVA 4KAOA 4N6ZA 3VULA 5KMOA 4F63A 4HVGA 3MH3A 5TO8A 5FEDA 2R2PA 2QLUA 3DDQA 3GOPA 3HECA 4FG8A 5AA9A 4U41A 1YDSE 3PRFA 1R1WA 2XNNA 3OZ6A 3R7IA 4YJQA 3QTQA 1RW8A 3DKFA 3DQXA 4GT4A 4ZSJA 2UW5A 3IOPA 4GK3A 3VBTA 5IDNA 4QPSA 3ZONA 4AU8A 4FIGA 3VIDA 3ETAA 3AMAA 3C4CA 1VZOA 5DMZA 1H24A 2XRWA 1V1KA 3ODZX 3ZXZA 3PG3A 4J7BA 3WE8A 5JFVA 2NP8A 4K6ZA 4YHTA 4V01A 4GMYA 4O2ZA 4DFYA 4DE4A 1BMKA 3KVXA 3PVGA 3I79A 2F9GA 4RBLA 3L1SA 4BKJA 2ITYA 1GIJA 3KMWA 4RIYA 3SXFA 1GJOA 5HKMA 3UE4A 3R00A 5JT2A 2C47A 4FTLA 5A6OA 4OUCA 4C36A 4EC9A 2BRNA 3RI1A 4XP0A 2UZTA 4HOKA 4N0SA 1U54A 3GC0A 4EOOA 3FC1X 2B53A 3OCTA 5AWMA 2BAJA 2R64A 2Z2WA 4FZFB 4IC7A 5CU2A 1PXKA 2IN6A 3DXNA 3F3TA 5AV3A 3EZVA 5EYDA 4IW0A 4QYFA 4XG3A 2GNLA 5GZAA 2QI8A 4AN2A 2ZMCA 2HW6A 5KZ0A 2OXDA 3BHTA 3VUGA 3CE3A 2PZYA 2QU5A 3JR1A 2ESMA 2EU9A 1PF8A 2BMCA 4J96A 3KXXA 4EH4A 2P4IA 4BKZA 4MF0A 2QHMA 3FHIA 4R7HA 4C8BA 2C6LA 4CZUA 2YCSA 4G9RA 3BYMA 2BKKA 3NVMB 3PXRA 3UZRA 5BNJA 2I1MA 3I81A 2C0OA 3ORXA 4L68A 1H08A 3SRVB 4H3BA 1KE7A 4K0YA 4PTCA 4G17A 5GZ9A 2W1HA 4R1YA 2WIPA 3IDBA 4OBPA 3LXKA 2GTNA 2EB2A 5E8WA 4A9SA 4BCQA 1OKVA 1XH6A 3TWJA 3RVGA 4AW2A 4A07A 1S9IA 3AD4A 3FUPA 3TV6A 5JN2A 3I60A 4BDKA 3IW5A 3UZPA 3GCVA 4MWIA 4MNFA 5J8IA 5GJDA 1XH9A 1H1RA 3RPYA 1WBTA 3QFVA 3U9NA 3S0OA 2OSCA 2BIKB 3D4QA 3BYSA 3REPA 3KN5A 1J3HA 3Q4ZA 4PNIA 1QMZA 4MF1A 5A4QA 5HICA 3E7VA 4NEUA 2CGVA 3OXTA 3GQIA 4BY9E 1OECA 2O63A 2WQOA 3O8UA 5HU3A 4FV8A 4S2ZA 3GOKA 1CSNA 3FMDA 5BVDA 2XS0A 4KRCA 4DFXE 4MNEA 1NVRA 2J0MB 2XYUA 3G9NA 5FM3A 4FIIA 3BGZA 1Q3WA 3OBJA 1M17A 2XM9A 3FDNA 2B54A 2OJFE 3KRLA 4FL1A 2WTKB 2RSVA 3DDPA 2J51A 4I0TA 3BU6A 3BELA 5JGBA 4FSTA 1REJA 1VYWA 2Q83A 3VUKA 4Q9ZA 5CQUA 5CAOA 2BHHA 2WMUA 5LCKA 1KE5A 3BX5A 4YO6A 3UMWA 4U6RA 4XHKB 2DQ7X 1Q8TA 2XNPA 4UN0C 4ZTHA 3PZEA 4MVFA 2A27A 4NU1A 5JQ8A 1PMNA 1YOJA 2OFUA 4FKTA 4ANLA 3QF9A 4GUEA 2ZMDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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