4EOOA

Thr 160 phosphorylated cdk2 q131e - human cyclin a3 complex with atp
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
299
structure length
294
Chain Sequence
GSMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPENLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An integrated chemical biology approach provides insight into Cdk2 functional redundancy and inhibitor sensitivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase, cell cycle
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
total genus 85
structure length 294
sequence length 299
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4eooA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4eooA01
3R21A 5CVFA 1YOMA 4BY9E 4FNYA 4F0FA 1YXSA 2SRCA 4XP2A 2J0LA 3C13A 3N51A 3A8WA 4FTUA 3EYHA 4XG4A 5FEQA 5L6WL 3DTCA 1PJKA 2WOUA 2YCFA 3PVUA 1ND4A 4DLJA 2JBPA 2GMXA 5JGAA 5HIBA 2ESMA 3OD6X 3U6IA 4MHAA 2EUFB 1WAKA 4XJ0A 4I4FA 3MFRA 3M11A 4JG7A 4GK4A 3PVBA 4MTAA 3V5JA 1YHVA 2P33A 5FQDC 4YNEA 2YM6A 3D7ZA 1H00A 5ETIA 3S4QA 3E88A 4AGWA 2PE2A 4MBJA 3UPXA 5CLPA 4RFYA 4NJ3A 3ELJA 3NVMB 4D2WA 1ZXEA 4DGOA 2W4OA 2WTDA 2YCRA 3R7VA 3TUCA 5JRQA 2UVYA 2B54A 3R1QA 4F09A 3QTRA 3KULB 2OJ9A 3MPMA 4FT5A 4RA4A 5HO8A 5HVJA 4GJ3A 4GRBA 4AA0A 4AQCA 2R3HA 5L8KA 4FGBA 3WBLA 4BGGA 5IA0A 4Q9ZA 2XS0A 3TKUA 3DB6A 3TZMA 4KB8A 5HTIA 3NR9A 2OICA 2W1FA 3GCSA 4K77A 4Y5QA 4BTJA 4ZSAA 2ITWA 3F2RA 3U9CA 4NM7A 4X6RA 4BBEA 4CFWA 3PLSA 4DLIA 4KD1A 2DS1A 3E87A 4FIEA 3QTIA 4IAZA 4BHNA 4G5JA 4EC8A 1SM2A 3TACA 3A62A 2BFXA 2GSFA 4PL4A 4Z9LA 4X7QA 2BIYA 4FZ6A 3OCTA 3EQRA 3KB7A 3QKMA 2QR7A 5DNRA 1YHSA 4XEYA 4AN9A 4FTOA 3EQIA 4IJ9A 3HVCA 4CZYB 3OP5A 4FKPA 2GTNA 4AA4A 3NW5A 4PDPA 3W16A 4QTEA 3OY3A 3I60A 3GUBA 4FKGA 4YBJA 3VIDA 4YJNA 5D11A 3ZO4A 3HMPA 4WSQA 2FVDA 3ZSGA 4E3CA 3EQPA 2YJRA 1SVHA 3CCNA 5HGIA 3D2KA 2C1AA 4YZDA 3ZLXA 2AC5A 3S1HA 3QZFA 4JX3A 4AN3A 4BDIA 1KE5A 3UQCA 4I6QA 3UOKA 3ZMMA 3R30A 3JR1A 5HLNA 4OW8A 3PIZA 5IQAA 2QHNA 2CCHA 3VRYA 2XEZA 3QTQA 5M55A 1A48A 3BI6A 4O81A 3VBXA 4D9UA 5AUTA 3PRIA 2BDFA 3DK7A 4M84A 2QHMA 1CSNA 4EUUA 2I0YA 1Y6AA 5LMBA 4GL9A 2F2CB 2OWBA 3DKFA 3KMUA 4XLVA 3SGCA 4YP8A 1FOTA 4RIYB 3Q9ZA 4BI2A 2GHMA 3C4ZA 5EQEA 2JKKA 2F7EE 4BYIA 4I41A 2JITA 2HCKA 4TW9A 1M2PA 2HZIA 4W4YA 2QONA 5EW8A 4A07A 2XK7A 2OFUA 1OITA 3HMIA 3JXWA 4KS8A 2ERKA 3HUCA 3V01A 3ZRKA 5KUPA 3ZDUA 3MB6A 4TKSA 5H2UA 4C7TA 1QL6A 2RFSA 5EHLA 3QXOA 4R6VA 4Z7HA 3W33A 5IQCA 4F6UA 4DITA 2JLDA 3PE2A 3QLGA 3RK9A 5EG3A 2CNUA 3P9JA 5JGBA 2GNGA 3NDMA 3HNGA 3Q4UA 4ASXA 5AEPA 3HAMA 4L43A 5C8MA 4FOCA 2FA2A 3TIZA 5CU6A 4TYHA 3MH3A 2VTOA 5EOLA 1XH9A 3TNIA 2CHLA 5HX6A 2ITNA 5M57A 2HK5A 4F9AA 5K4JA 1ZZ2A 4DE4A 5AV4A 4CSVA 5ANJA 4QP1A 4GG5A 5AV1A 3UG2A 3FMKA 4FV5A 1Q99A 5AAGA 5I3OA 4S33A 1FVTA 3AGMA 2VTAA 3P1AA 1H25A 4IMYA 5HVYA 4NL0A 3NS9A 4FSTA 4AT5A 2VO6A 4FEVA 2UZTA 4XS2A 3ZUVA 2BZKB 4ASEA 2VD5A 4BGHA 3DXQA 3POOA 4NTTA 2FO0A 4M69A 4E7WA 1XBBA 3LZBA 4U44A 3EH9A 1GNGA 2J0KA 2OU7A 3FI2A 3EQFA 1PXPA 1UU8A 4LQMA 4RC3A 3V3VA 2OXXA 5CVHA 5J79A 2PSQA 2E9OA 3TT0A 2RFEA 1OL5A 3OT8A 3L8XA 2JAMA 4M3QA 5BPYA 5JK3A 4IHPA 4G3FA 4KA3A 2WTJA 3NYOA 1P14A 2OZOA 1LR4A 3DBFA 1G3NA 3FQEA 3DZQA 5D9HA 1JLUE 4JDHA 4F6WA 3BLHA 3ZRMA 3DV3A 3AD4A 2PMOX 4BIEA 3COIA 4XYFA 4C62A 2GFCA 4UY9A 3IW8A 2JDTA 4FUYA 5DHJA 4N4SA 3MIYA 4C4FA 3DK6A 2YAAA 3R7OA 5E8XA 4Z16A 3QX2A 1CKIA 5FUTA 3R1SA 3FPQA 4N6ZA 2WPAA 3Q52A 3U4WA 4FBXA 4YJSA 2WKMA 4R8QA 3LMIA 2XBJA 1PMVA 1JBPE 4Y72A 3LM0A 5BUEA 2ETMA 4OLIA 4JQ7A 3NNVA 2C30A 4E6DA 4E5AX 3AMAA 2KTYA 3EKNA 2BR1A 3QQHA 4RC4A 3SVVA 2UW5A 4H39A 5HO6A 3UTOA 1KOAA 3N4VA 4FEXA 4NW5A 1YDRE 2W7XA 2C6MA 2GPHA 3DK3A 4NM0A 4O1OA 4AW2A 5BMSA 5HI2A 2J4ZA 3TUDA 1WMKA 3F6XA 4USFA 2OIDA 3LMHA 3HGKA 2UVZA 2G9XA 4GU6A 5CNOA 5HBJA 3GT8A 3LFCA 4QP9A 3VS7A 3KK9A 3NX8A 2XK6A 1OKVA 2GHGA 5HE1A 4MWHA 4U81A 3BRBA 3ZLWA 4JR7A 3ORMA 3CS9A 2EB2A 4O83A 3VS2A 4Q2AA 3SOAA 4USEA 4YLKA 3HX4A 1Q3WA 1J7IA 1FGKA 4AS0A 3HMMA 3R8LA 4DBXA 4O0VA 3RZFA 1U5RA 3AC2A 4FGRA 2X7FA 5CS6A 3F2NA 3UIXA 4L00A 2IZSA 4AGCA 1RDQE 2BZHB 2Y9QA 5F1ZA 1WCCA 2QD9A 3OZ6A 4ZP5A 5HVKA 4HVSA 2BUJA 3NVKI 5H9BA 5CXZA 3MJ2A 2IPXA 2XIXA 5HESA 4IWQA 3KXMA 4X2JA 1I44A 4DFLA 4MXCA 3W2CA 1FQ1B 4G17A 2OBJA 5BYLA 4HYIA 4ZLOA 4F63A 3MY0A 3Q4ZA 4YPDA 1IAJA 4IX5A 3P7CA 4PUZA 4DFNA 4KNBA 4RZWA 3Q9YA 4TY1A 2P2IA 1H01A 1M17A 4TRLA 4Y46A 4TZRA 4GMYA 3Q5ZA 5C9CA 2WQNA 3NUYA 1GZNA 2W5AA 4FK3A 4RVTA 5AV0A 4ANMA 4ANQA 5KMLA 5IQHA 3UQFA 3ZSIA 1U54B 5F20A 4H1MA 3JVSA 4XBRA 5IUIA 2YLFA 3V6SA 3PWDA 3TNHA 2WAJA 3P0MA 5I0BA 3NLBA 3NMUF 1T45A 4IADA 3QD2B 2UZEA 2VWXA 1Q61A 3A61A 4PPBA 5AR8A 3W2PA 4TYIA 1PHKA 2ITQA 4BCOA 3CY3A 4EORA 3CQWA 1ZMWA 4PX6A 5AP5A 5AAEA 1M14A 1H24A 2JKQA 3OBJA 5GJGA 5CYIA 3QTZA 2RGPA 4WNKA 3OWKA 5EM8A 5EYMA 5A4CA 5E4HA 4FNWA 4DF3A 1LP4A 3AD6A 3DZOA 2OGVA 3TJDA 1PMEA 4CYJA 3IS5A 3MTLA 3DB8A 4E4XA 5KMIA 4TNDA 4BDEA 1ZOEA 4YLLA 5AP1A 1PMNA 4GVAA 4ZZNA 4IM3A 3UPZA 4CD0A 4GUBA 3TCPA 1ZOGA 3E8DA 3B8QA 4C36A 3S00A 4JT3A 4CCBA 4RWJA 3C4CA 3HV7A 4NIFA 4V01A 2B9HA 4ZLYA 1ZLTA 3K5UA 3VS1A 2WXVA 3P08A 5L3AA 3PYYA 3VUKA 3O50A 5C1QB 1QPEA 4LGDA 3VQHA 4IXPA 4BGQA 3SKCA 4EOKA 3EHAA 1NT2A 1OPKA 4MK0A 5CU0A 4O7SA 2W17A 3D0EA 3OVVA 4FODA 4OBQA 2PUPA 3KU2A 5I9YA 3ETAA 4R5SA 4ZK5A 3SHEA 3PFQA 1J1CA 4RFMA 1B39A 4TYHB 5D12A 1XWSA 1JPAA 2C47A 4DFZE 2PYWA 2VAGA 3U6HA 4U9AA 2HIWA 2R3PA 4ACDA 5IA5A 2X2KA 3EQCA 2X1NA 3EQDA 2PMIA 5CT0A 2UZLA 5E8UA 4AGDA 4JRNA 4IC7A 2PTKA 3ZO1A 5BVFA 3CQUA 4IEBA 5B0XA 3TTJA 3QCQA 4RIOA 2XNBA 3UNKA 4I6HA 2XKFA 3SDJA 4DFBA 3K3IA 4MNFA 1MRVA 4MVFA 4C3PA 3MA6A 1XH7A 5D10A 4YC6A 5IH5A 1EH4A 4BVUA 4PL3A 3ZUUA 2YDKA 3SG8A 2O8YA 2C6IA 5A6NA 2XRUA 4I21A 2YLEA 4PNKA 5IDPA 1YQJA 2VWWA 3DA6A 5LMKC 3VHKA 5I4NA 4IBMA 3ODYX 4Z3VA 3FSFA 4C4GA 3QKLA 4DGNA 2VN9A 2VX3A 2V62A 4LYNA 3QRKA 4LOQA 4XOZA 3H10A 2RFDA 2Y8OA 2W1CA 4E4LA 5M08A 4EK5A 2GNLA 4I1ZA 3VUGA 4ALUA 3EN7A 4UMPA 3DKGA 5KCVA 5HNIX 3CR0A 2WTIA 3FZRA 4GT4A 2PMLX 4L01A 2V5QA 2VTSA 3IW4A 4G6LA 4QNYA 5AR7A 5M07A 1Q97A 3NNUA 4L42A 5CSXA 2ZDTA 4CLIA 4FZ7A 3EN6A 3CKWA 4X2FA 5L2QA 5K0XA 4ENYA 3WF8A 2PVFA 4FF8A 2WHBA 3QQJA 2BRGA 3K2LA 3GC9A 4PQNA 1M2QA 2CLQA 3MVLA 1MP8A 3L9NA 3Q5IA 4YHJA 2RKUA 5H8EA 1E1XA 3BCEA 3FHIA 2ITXA 3KCKA 4QYFA 5CAQA 4HOKA 4XNEA 5LVNA 1CKPA 3RPSA 4BDBA 4TT7A 4V04A 4O1PA 3MDYA 3BWJA 2ETRA 1V1KA 2XCKA 3Q6UA 2GQGA 2P4IA 4IAKA 4QPAA 5LMKA 4XG8A 4ALWA 3BYSA 3ANRA 4FUXA 3ZONA 2BMCA 2JFLA 3HEGA 4FZAB 4DEDA 5HLWA 4JIAA 5DVRA 4HCTA 4BZOA 2QURA 4M0YA 5TO8A 2J2IB 4P4CA 4IX4A 4AZFA 5IEYA 5E9EA 4II5A 3VUHA 2BTRA 5HG7A 2BCJA 3UP7A 4CLJA 1WBNA 4NKSA 5BNJA 1F3MC 4IACA 2OJIA 1IG1A 3ORPA 4B4LA 4ZTSA 4O0RA 3MVJA 3PPKA 2W99B 3MN3A 5EI2A 4BKYA 3DS6A 4R3PA 4NCTC 3SLSA 1HCLA 5I3RA 4IM2A 3G0EA 1FVVA 1OUKA 4WG3A 3EN4A 2XYUA 1U4DA 1R0PA 3TNQB 4J96A 2R2PA 3QX4A 3W2SA 2PWLA 1YVJA 2YERA 4UMRA 4FSQA 4WO5A 1G8AA 4ZAUA 2VX1A 1K9AA 3WILA 1KSWA 1OKYA 1Y8GA 3EOCA 4G3CA 4J71A 2PVKA 3R7EA 5EHYA 1JKKA 3WZDA 4BWKA 4E4MA 3QRUA 4YMJA 4C8BA 5CALA 4DFUA 4N6YA 4X2GA 1U46A 4RA5A 2HZ0A 3VWAA 2ONLC 5KHWA 2C0TA 4ZZMA 4C2WA 4EWHA 4GH2A 5FTGA 1NY3A 4RX7A 3KGAA 3R7IA 3PPZA 5AR5A 3ANQA 3LHJA 4YHTA 3U55A 4OTFA 2YM5A 2W4JA 3Q4CA 3FZ1A 3UC4A 4K0YA 3FBVA 3FMHA 1JNKA 3OEFX 4QP2A 4BDCA 3OC1A 5LWMA 2W9ZB 4NFMA 4ZEGA 4FMQA 4IVDA 4J8NA 4FC0A 3OBGA 1IRKA 4NCTA 3KQ7A 3R01A 4YO4A 4ZMFA 2Q0NA 1JKLA 2Z8CA 4FKUA 3FLZA 3LFFA 3V51A 4YZCA 2WIHA 1V0PA 3ENHA 4MXZA 2OW3A 5DEWA 4MD8E 3K3JA 4LV5A 4EOIA 3LQ5A 4B6LA 5GINE 1SZMA 4QTCA 2FB8A 3D94A 5AR3A 4FKOA 1JAMA 4EBVA 3MW1A 4BB4A 4PTGA 3ZOSA 3VAPA 2QKRA 2UW6A 3ZUTA 2EXMA 3FLWA 2IZRA 5G6VA 4WBBB 4WG4A 2I0HA 2VU3A 3UZRA 4O22A 4B0GA 1Q3DA 2ONLA 3BV3A 1Q8UA 5FM2A 1O6YA 2JDOA 3H0ZA 4JDKA 1FBNA 1UNHA 1YW2A 4YJUA 1ZMVA 4W8EA 2HOGA 4FTKA 4AE6A 4AW5A 3GGFA 4F1OA 4DC2A 1ZRZA 1XHAA 2R7BA 4HW7A 1QPDA 3QUEA 3ZRLA 4DEEA 2BVAA 2WFYA 3BEGA 3FY2A 4CVAA 2QG7A 5DGZA 4ZSGA 2ITUA 1ZY4A 2JKMA 4GIHA 5K4IA 2C5YA 2WOTA 4R78A 3H0YA 5HU9A 2F9GA 2Y4PA 3BHTA 2WO6A 3HV5A 3I6UA 4JAJA 1R39A 2JIVA 5CEKA 4F0GA 3ALNA 3EJ1A 4NIFB 1O6KA 5ETCA 4NYEA 2KULA 4GT3A 4QMYA 5ANEA 3V8SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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