4F0GA

Crystal structure of the roco4 kinase domain from d. discoideum
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
277
structure length
263
Chain Sequence
SRLPTLADNEIEYEKQIGKGGFGLVHKGRLVKDKSVVAIKSLILGDSEGETEMIEKFQEFQREVFIMSNLNHPNIVKLYGLMHNPPRMVMEFVPCGDLYHRLLDKAHPIKWSVKLRLMLDIALGIEYMQNQNPPIVHRDLRSPNIFLQSLDENAPVCAKVADFGNFQWMAPETIGAEEESYTEKADTYSFAMILYTILTGEGPFDEYSYGKIKFINMIREEGLRPTIPEDCPPRLRNVIELCWSGDPKKRPHFSYIVKELSEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Roco kinase structures give insights into the mechanism of Parkinson disease-related leucine-rich-repeat kinase 2 mutations.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase, signaling protein
source organism Dictyostelium discoideum
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase roco4
total genus 81
structure length 263
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4f0gA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4f0gA01
5AJQA 3IW6A 3C7QA 3DB6A 2VTTA 4HGTA 1ZARA 3E93A 4G2FA 5DT3A 5AAGA 3NS9A 4QMTA 5CQUA 3PXRA 3TIYA 1QPJA 4ZMFA 4OTFA 4OTWA 4X2FA 3V5PA 3OCGA 4FK3A 2XK4A 2W1IA 3TKHA 3GCUA 3R7VA 3VNTA 4AT3A 2ITUA 4DINA 1H1SA 4NM3A 2F9GA 5CX9A 4WIHA 1F0QA 3TIZA 5DFPA 2OLCA 2PUUA 5LQFA 4U81A 5IH6A 4AGWA 4FNWA 4O0TA 4KKGA 4S33A 5IQEA 5EH0A 3RNYA 4DH8A 4I0RA 3Q3BA 3DV3A 5EDPA 5HI2A 4QTBA 2WHBA 3LFNA 3DLSA 4ACMA 4D4SA 3OFMA 2ITXA 3PG3A 3EFLA 2JC6A 2PZIA 2XKEA 2XNOA 3NX8A 4XH6A 4LM5A 4TNBA 3F61A 3KN6A 2FGIA 4XV2A 3KXXA 3ULZA 3VBTA 4RVTA 4W4YA 3HAVA 4JJRA 3ZC5A 5HO8A 2ACXA 2ONLC 3SLSA 3PIYA 2DUVA 5HD7A 4AA0A 4APCA 1CSNA 2CGXA 1W82A 4ZAUA 5HQ0A 3V8SA 4I92A 2Q0BA 3VQUA 2WTIA 2HK5A 2R3FA 2YM4A 2IPXA 2W7XA 5TOZA 1BL7A 3UE4A 1YVJA 3QQUA 3BQRA 4TPTA 4IANA 4FKJA 4K77A 4RA4A 3ET7A 1GIHA 4Z16A 2Z2WA 1U54B 5FEEA 5KBRA 5D1JA 1E1VA 2R0UA 3KRWA 3FAAA 5EI2A 4IM2A 4K2RA 1OIUA 3QF9A 2QNJA 2GMXA 2QOHA 2BUJA 5IZFA 2X7OA 2YM5A 2ITNA 3OTUA 3UNJA 4XG6A 5IMXA 3DFAA 1XWSA 2GFCA 4DBNA 4X6RA 2BILB 3ZOSA 3CD3A 4G17A 2B9FA 5AP5A 4IB0A 4F08A 2HWPA 4NTSA 3PZHA 5FDXA 3QBNA 2JITA 1UNGA 5K5NA 2WU7A 3PP0A 4CMTA 4FKWA 3ATTA 4O21A 4IH8A 4U5JA 4BI1A 4RWKA 2FSMX 1CM8A 1H08A 4O0WA 3TV4A 5LMKA 5M51A 4MXAA 4QP4A 4ITIA 1W98A 3MH0A 1LEZA 4EHEA 1MUOA 3R22A 3TDWA 3SDJA 2VN9A 4EJ7A 4O22A 4APPA 3EL7A 4K8AA 2ZDUA 3DJ5A 4W9XA 2R3OA 2W4KA 4FKQA 1XH6A 3EMGA 4WHZA 5E8SA 4B8MA 4DFZE 3P78A 4ZLOA 4FTOA 4YJVA 1TQMA 2EVAA 4PTGA 3O71A 4QTAA 3C4FA 2WMRA 3QUPA 4FG7A 4N6YA 4AZEA 5KMKA 2FVDA 4A07A 1OL6A 3QQJA 5CVFA 4ZS0A 4J95A 4AN3A 5EI6A 1H26A 4LV8A 5CEOA 1WCCA 3PY1A 4YJSA 4L00A 1BLXA 3O8TA 2X2MA 3DA6A 1GZKA 4XCUA 4I5PA 4R5SA 4FTAA 1RJBA 5D9HA 3WI6A 1RW8A 3QFVA 3VULA 3DNDA 3MIYA 3QX2A 4QTCA 4U42A 4DH7A 4RLLA 3Q2MA 4DH3A 4BDFA 1XBCA 3E5AA 5DWRA 5EM8A 1JKLA 2R7IA 4TY1A 3FC1X 1HCKA 1JSTA 3R8MA 3RCJA 5M55A 3WZJA 4F70A 3IG7A 1UWJA 2UZNA 3KVWA 3QYZA 4KA3A 4PP9A 2PMIA 1OPLA 4YZ9A 4F7LA 3HMNA 4NU1A 2O8YA 1BX6A 4QP8A 3KK8A 1GZNA 3LJ1A 2BKKA 4ZP5A 2JFMA 1VYWA 3L8PA 3A60A 2OU7A 2CLXA 4O1OA 3D7ZA 4JXFA 2OSCA 4DYMA 4KKHA 3F9NA 3CKXA 1Q3WA 3T8OA 2VO7A 3C4CA 4MNEA 3FY2A 4ALUA 4BF2A 1ZOGA 2BAQA 1XHAA 2X4ZA 3AXWA 2GTMA 2X8EA 3EN4A 3G9LX 2EB2A 3OXIA 4TZRA 3SHEA 1O9UA 1P4OA 2DWBA 4C38A 5J87A 4DFLA 3K2LA 3QHWA 4IAYA 4NM0A 3VUGA 4CMUA 5IQBA 4JBVA 4YJNA 2E9NA 4FGRA 5DYJA 3ZFMA 2BROA 5FTOA 3VQHA 4YNOA 5DHJA 5H2UA 2WQEA 5AAFA 4AACA 2C0OA 2WTWA 4WRSA 4XYFA 2WMXA 2RFEA 5CLPA 3N9XA 3VJOA 4J1RA 4FV4A 4G9RA 4EZ7A 1KV2A 3GC7A 4GG7A 4EWQA 2F7EE 3LQ8A 5HO6A 4M0ZA 2OFUA 2F7XE 2J90A 4Q9SA 2CLQA 5G1XA 3TKIA 1O6LA 3LCSA 2HAKA 3DKCA 4D2SA 5HNBA 5DLSA 4PL5A 3ZBXA 3KULA 3E92A 3Q96A 4WBBB 4TWNA 3HMMA 4MAOA 2UW0A 5LARA 5BX0A 3K54A 4EOOA 4D1XA 3F82A 2J7TA 3Q9WA 3FMJA 3QCQA 3ZLWA 3LCKA 3ZO1A 4GU6A 5DR9A 5HGIA 5B7VA 3NMUF 1PMNA 5EK7A 4PY1A 1SNXA 3KXNA 2VWZA 5A6NA 4BI0A 3KC3A 3U55A 3EZRA 4AGUA 4RQVA 3E8EA 4YZBA 2OJ9A 5M09A 4PNIA 4UN0C 5AUYA 4M69B 2HZ0A 2F2UA 3PRFA 4I4EA 5DT0A 4Q2AA 3W8LA 4G3FA 3I0OA 4FSQA 3D9VA 3ZUVA 2JDOA 4IEBA 3HAMA 2QHMA 3EZVA 2OFVA 4TL0A 4O83A 1XH4A 2IO6A 2QG5A 2VV9A 4BDKA 2OGVA 4ZK5A 3PLSA 4BWPA 3UVPA 3BHHA 2QOOA 4IWOA 1ZMWA 3D15A 4O84A 3F3WA 2WQBA 3QWKA 2YEXA 2E9PA 5L2SA 4OTRA 5M53A 2G2FA 1WBTA 2A19B 4GUBA 1P4FA 3BU3A 4GJ2A 4RIOA 4O0XA 3PXZA 3VW8A 4UMRA 3HV5A 4RX8A 4CTBA 1J1BA 2R9SA 2WTKB 2YIXA 2UZUE 2XIYA 4QMXA 3MY5A 2X2LA 5E7RA 3AT2A 2P2HA 4CLIA 5JK3A 2OZAA 5H3QA 4EQMA 4DGOA 3LXLA 4JBPA 2ZV2A 2R3GA 3LQ5A 4IBMA 4JVGA 4DCEA 2BZIB 1M14A 4U40A 4YHTA 2J51A 4I24A 2BZHB 2PE2A 3F7ZA 5K9IA 2JD5A 5JFXA 4JS8A 2GNJA 3O96A 4C4FA 5AUUA 3PE1A 2YIRA 4PUZA 5CSXA 3BV3A 2VWIA 2XS0A 2BRNA 4JRVA 3PXKA 2Y7JA 2GS7A 4QMZA 3S3IA 3U4UA 3GU5A 4RRVA 4HVGA 5IQCA 4NW5A 1R39A 3GU8A 3LJ2A 2F7ZE 2PY3A 3RNIA 4CG9A 4XBUA 5A4LA 4OT6A 4G3EA 3EFWA 4FF8A 4CKJA 4L7FA 3W2SA 4S30A 1ZMUA 3QD3A 2XNGA 4H39A 4P4CA 3DKFA 4IAIA 3WIKA 3ZXZA 5CSPA 4LOPA 2XK7A 4LUEA 3NUXA 3TUCA 1H0WA 4HCUA 2ZDTA 4KINA 4ACGA 1KV1A 4XG8A 4U80A 3O8PA 4W4VA 2UW5A 4UYAA 3NCGA 4AW1A 2GNHA 2XNPA 3P7AA 4ZZMA 5LMAA 5T6KA 3RPYA 4AWIA 2WO6A 4O7VA 1WBPA 3F3UA 3QTXA 3LKMA 1H27A 2W1HA 1JKSA 4FE2A 4U9AA 3GI3A 4CCBA 2B0QA 3PJ3A 4WD5A 2PE0A 3QCYA 4D1SA 4HVIA 4JG6A 5CF5A 1PXLA 4FKOA 4DGLC 5AR5A 3EWHA 3VIDA 2PU8A 3OROA 4FNYA 5EKOA 1QL6A 2YM7A 2ZV9A 4O96A 3CY3A 1G5SA 5CY3A 3TACA 2J4ZA 3COMA 3R28A 3UG2A 3OVVA 4RJ5A 3TUDA 4RJ8A 5FGKA 3VBVA 4FZDB 5EM7A 4XG7A 4BI2A 2PVRA 3W55A 2BHHA 4DEAA 3D5VA 2WELA 4FTKA 3BWFA 4YTHA 2HZNA 3MFTA 3O2MA 4G6OA 2W5BA 3B8QA 4M68A 5AV0A 2O2UA 3GCQA 4YZCA 5L3AA 1Q8UA 2UW4A 3ZLYA 2NO3A 4QMLA 1UA2A 2ITZA 3HMPA 5FBOA 3RK7A 3AD4A 4O82A 3BYOA 4O2ZA 4CZUA 4R78A 4QNAA 4BZOA 2VNYA 2BIKB 1JVPP 5JZNA 4IWQA 2R3IA 5HNGA 4FSYA 4FV5A 4I6FA 3WOWA 1Y91A 1G3NA 2YM3A 4JBQA 4A9YA 5E91A 4CNHA 4PDYA 4BCOA 1JLUE 2QOQA 2PWLA 2BKZA 5CU3A 5HVYA 5IKWA 4NKAA 3UOHA 2VWXA 4U41A 3EKNA 3IK3A 3V6SA 2BALA 1PJKA 4O6EA 5ANKA 2W1EA 3D0EA 3FMNA 1BL6A 3BE2A 2QOFA 3ORMA 3DKOA 2PL0A 5C9CA 2UZTA 4EOKA 3Q6WA 5LXMA 1Q97A 3ORKA 4MXZA 4O0SA 4JLCA 1SMHA 4QO9A 2JLDA 4GT4A 4D2TA 5JT2A 3JR1A 1FMOE 3FI4A 4LUDA 3P4KA 5EOBA 4OBOA 4ZEGA 1ZOHA 4UWCA 2FUMA 2X4FA 3C0IA 3P9JA 4YSMA 5IF1A 5EYKA 5DG5A 3OW4A 2ZM3A 4FT3A 4O6LA 3QCSA 2A2AA 4KIQA 4CQGA 3I79A 4CZYB 4E5BA 4HCVA 5CZHA 5TO8A 1LPUA 2XEZA 4EH6A 3EQPA 3FSFA 4FKGA 5EHYA 1V0PA 3SVVA 4AT5A 5JN2A 4GKHA 3BGZA 4JQEA 3DFCB 4FTCA 5CYIA 2YWPA 3ZDUA 4RJ7A 5AP0A 1E1XA 2XP2A 2Z7RA 3BHUA 3SRVA 1XH5A 4IDVA 3UOKA 4EQUA 3MWUA 4XG2A 5K0XA 5FD2A 5D12A 3ZRKA 1T45A 3EYHA 4ANOA 1RE8A 3V3VA 2WAJA 2VX1A 4RA5A 2YITA 3BI6A 3CQWA 3V5JA 4QMSA 1FOTA 4BDCA 3PP1A 5KZ0A 4YTIA 2WEIA 4PF4A 3R1QA 4UALA 2W06A 5FXSA 2I0VA 5HLPA 2JDTA 4PTCA 1Q8WA 3AGLA 5LMKC 3Q4UA 5IQFA 3E7VA 5TF9A 4EC9A 2X7FA 1O6YA 3L9LA 3QLFA 1PY5A 3UZRA 4L3JA 4AX8A 2QI8A 5HD4A 2YDKA 3ZTXA 3MFUA 2QONA 4X21A 1I44A 5EOLA 1UV5A 2XK9A 3JVRA 3TT0A 4YLKA 2UZEA 1IRKA 4H1MA 5A4TA 2QODA 3FC2A 3G51A 4X0MA 5IA4A 3A7FA 4PPCA 2RIOA 1CMKE 5FEDA 4BDGA 3VF9A 2C4GA 1H24A 4FBXA 3R7OA 3D14A 4OGRA 4CMOA 4E1ZA 1UKIA 4DT8A 3NUAA 2X6EA 5AV3A 4FEUA 1AGWA 5I4NA 1K3AA 4G1WA 5K5XA 4UY9A 2FB8A 3F5UA 2OF4A 3GCVA 4H1JA 5B2KA 3OOGA 3BLHA 4JIAA 2PZPA 2CDZA 3QTRA 4KBAA 3DKGA 5IDPA 4TN6A 4GSBA 4GK3A 3ERKA 3TNWA 4R3PA 5JQ5A 1ZY4A 4RFMA 1QMZA 2CGUA 4YO4A 3RKBA 1ZZLA 4V05A 1V1KA 4N70A 1E9HA 3P5KA 2XRUA 4RX5A 4Y95A 5BVDA 3MI9A 1GY3A 2C5YA 3FLSA 2WTCA 5F1ZA 4BIEA 3MH2A 4BDBA 3N4VA 4R77A 3GOPA 1PMVA 5J7HA 3FZSA 4F6WA 4CG8A 4YC8A 2GQRA 3LVPA 4EOQA 5EQYA 4UEUA 5C4KA 4JAJA 5FRIA 2J5EA 3OWJA 4QYFA 1UKHA 4CT2A 3RZBA 3KMMA 3LFFA 5ACBC 4BKJA 4EH2A 2Y6OA 5CF4A 4QTDA 2UVYA 3H0YA 3DBCA 4LOQA 4K18A 4LV5A 5AIRA 2CNQA 1Q5KA 1ZLTA 5CF8A 3H9OA 5AV4A 2VZ6A 3SXSA 1JNKA 3W2QA 4AS0A 3LCDA 3CGFA 3VJNA 3WILA 4DEEA 3Q5IA 4FKLA 4I94A 5FM2A 4BTKA 3ZM9A 4EHVA 3R02A 2RF9A 2B54A 3QC4A 2V0DA 2W9ZB 1R0PA 3EHAA 4KSPA 1XQZA 3ELJA 2C5NA 4MCVA 4ZTHA 3RTPA 3LFEA 3U4WA 4Y73A 1NA7A 1YQJA 4TYIA 3WE8A 4UXQA 3MTLA 5AUTA 4DEHA 3T3UA 1PXPA 3KCKA 5A6OA 1URCA 5CSHA 3UNKA 4IWDA 5E1SA 2J0JA 4NTTA 4QP2A 3FMEA 4HW7A 2R3NA 4AE9A 2P3GX 5C8MA 5BMMA 4ZZOA 4F9BA 3MVJA 4X2KA 4ERKA 2J0IA 4I5HA 3D5UA 1H1QA 3IW5A 5M56A 1M52A 4CV8A 4AFEA 4YP8A 3R8PA 3RMFA 4EOPA 3ZSIA 3V51A 3AC1A 3HDNA 1BKXA 2X9EA 3IPHA 3RWQA 1ZYCA 2QO2A 3ETAA 3RPSA 4FGBA 3I5ZA 1YXXA 3LXNA 4BR3A 1M2RA 3FZTA 4TTHB 3Q9YA 1Y57A 2X1NA 1AD5A 3RAIA 2P55A 2JDVA 3UGCA 3MVMA 3LM0A 2GU8A 2UZBA 1PRYA 2IZSA 2W4OA 3QGYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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