4F0IA

Crystal structure of apo trka
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
290
structure length
284
Chain Sequence
CVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPDKMLVAVKALKSARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The Crystal Structures of TrkA and TrkB Suggest Key Regions for Achieving Selective Inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords High affinity nerve growth factor receptor
total genus 93
structure length 284
sequence length 290
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4f0iA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4f0iA01
3R7IA 2JFMA 4JDIA 1JWHA 5IG1A 3UMXA 1URWA 4FOBA 3KRLA 5KNJA 3FJQE 2HZ4A 4E4MA 1LP4A 2GHLA 4WNOA 5FLFA 2XZSA 3JVSA 4B9DA 1KE9A 4BHNA 4CMUA 4NM3A 2C3JA 5AV2A 4CG8A 2YDIA 5AX3A 5FWKK 4MF0A 2XNOA 4I41A 3IDBA 3DZOA 2DWBA 5TR6A 2XNEA 3KA0A 4C61A 5CVFA 4EH9A 5LMBA 2QO9A 2VWIA 4BCNA 4C4JA 3EQCA 2BALA 4JOAA 1XBCA 2QU6A 2GTNA 2VNYA 3ODZX 3R6XA 3KXXA 4ITIA 5DIAA 5H3QA 4B8MA 5FBNC 2C1BA 4ZTHA 5L8LA 5IEYA 1J7UA 4BDAA 3MPAA 2JITA 5F4NA 3GC8A 4KBAA 1VYZA 2ZV8A 4DFYA 3MH0A 3QC9A 5AV1A 3IGGA 5CQWA 1MRVA 2YIQA 4CYIA 4IX4A 3KRRA 4MD9E 5E8YA 2BCJA 4ZAUA 3NUSA 3QA8A 4O22A 5FP6A 3GU6A 3SC1A 1JSUA 3LCSA 3PJ1A 4CQEA 2RG6A 2VWWA 3MBLA 4CFWA 1L8TA 3CS9A 5EYDA 5CSPA 2YM6A 3WZEA 5I9XA 3KGAA 4O7YA 4PDPA 2UZBA 4JG8A 4FL2A 2BZJA 4AF3A 3V5JA 2WTWA 3R9OA 5CU0A 1Q97A 5GJDA 3D5XA 4YTIA 5KHXA 3EN5A 4E8AA 4EONA 2BHEA 2BROA 1LUFA 4UALA 2GNFA 5AV0A 3SOAA 4O0SA 2I0EA 2QLQA 1UNGA 3EQPA 4MF1A 4O7RA 3MIAA 4K18A 4MH7A 2YAKA 4E93A 4X6QC 5DN3A 4E1ZA 3ZO1A 4BIBA 3FPQA 3V6SA 3NGAA 1GZ8A 3B8QA 3MV5A 1VZOA 1H01A 3FMHA 3AD6A 3NYNA 4BDJA 4Z16A 3MA3A 4P4CA 4WA9A 3Q3BA 2XKEA 3CPCA 2YZAA 3CGOA 3OEZA 3AC8A 3OMVA 3R7UA 5AUZA 1FVTA 4R1VA 5CLPA 5LVOA 3SA0A 3BEAA 3FSKA 1GZOA 3R8VA 3ZEPA 3WZDA 4FYNA 2YJSA 4U3ZA 4TY1A 4E6DA 5IQEA 4L9IA 4BIDA 3BE9A 4XG7A 5E8SA 3WILA 4IAYA 2VWYA 2RFSA 3GXLA 5E91A 4USFA 4AT5A 2I7QA 2CHLA 4FNZA 3DKGA 4PMMA 2X8IA 4DLIA 1Z57A 2ESMA 4GV1A 4BZNA 2ONLC 3R9RA 2VAGA 3F61A 5AADA 5BX0A 2XCHA 4X2KA 3A60A 4TW9A 4EQCA 4YUQA 2Q83A 4Z3VA 2H96A 4IAKA 4MXCA 5HICA 3DS6A 2F7XE 2XA4A 4TYIA 4FTRA 3DBEA 4CZTA 2CMWA 4J1RA 3QD3A 3C4ZA 5BQ0A 2XK6A 4D5KA 3E64A 5IA5A 4GK4A 4LM5A 2C5XA 3A7GA 4FEXA 3ANQA 3BYUA 3FKOA 4IJ9A 4JR3A 1DI9A 1R1WA 1TVOA 1BYGA 4RLKA 5F20A 2CLXA 4RIOA 5LCKA 3BV3A 3ZRLA 4NIFA 4K9YA 4QTBA 4RIXA 3QL8A 2XP2A 3AGMA 3AC4A 2BAQA 4CMTA 5KHWA 5DPVA 3DAJA 4KNBA 3VBYA 3G90X 3UVRA 2C0OA 3FYJX 1PXIA 3GENA 2OW3A 4YP8A 3VUIA 3TKHA 5IA0A 1U4DA 2YAAA 4W4WA 2YZLA 2BTSA 1ZXEA 4D58A 2WAJA 2EXCX 4B4LA 4LGHA 5JQ8A 2WTDA 4S33A 5E8UA 2VRXA 4DEGA 3RWPA 5HNIX 5E8XA 1FMOE 4W4YA 1K3AA 2UVXA 2YACA 3ROCA 3ZLYA 5GJFA 2BRNA 3QD0A 3TXOA 3OOMA 3G15A 4ZS0A 5I9UA 3K5VA 4FTAA 5FXSA 4LOQA 3DK7A 3O2MA 4IB0A 2HAKA 3BHVA 5CS6A 3HX4A 4K6ZA 5IQGA 4K77A 3R22A 3DDQA 4WSYA 4ACMA 5CI6A 4BGGA 4C33A 4MQ1A 1XH7A 1ZZLA 4KS8A 4FV9A 3NYVA 4XV1A 4NT4A 3CPBA 3LMGA 3M42A 4MXYA 1U5QA 4FKQA 4LL5A 3BELA 3A61A 5DGZA 3JR1A 1YWRA 4V0GB 5L4QA 2C4GA 2E9VA 4GEOA 4F9BA 5L6OA 5M06A 5EW3A 5FG8A 5JEBA 2PUNA 4DC2A 3V04A 3ORLA 1OGUA 2QHNA 4JRVA 4S31A 5IUIA 5JFWA 4DE4A 1PKGA 4FT9A 2CNVA 3BU5A 1DI8A 2JFLA 3G6HA 4WOVA 4C7TA 3QBNA 4UB7A 2XK7A 5AUTA 3LIJA 2C0IA 1DAWA 3QQUA 4U6RA 3QD2B 4WT6A 3K2LA 4QNYA 3TV4A 4IFCA 1IASA 1M7QA 5M55A 3CJGA 3OT8A 1KUTA 1A06A 3P0MA 2BUJA 4J99A 1GOLA 4EZ5A 3UYSA 3FMEA 4IWQA 2XUUA 4W4XA 4XH6A 4YPDA 2QVSE 3GU8A 4PP7A 4QMUA 4Z7HA 2XIYA 3CIKA 4FV3A 5CU2A 3G51A 3QUEA 3A4PA 5EM6A 5IA3A 3DXQA 2YFXA 2VX1A 3KF4A 1UU7A 2JGZA 3MPMA 2OF2A 3PXYA 4JDHA 3E92A 4IHPA 4K8AA 2BDWA 4R5YA 4F7SA 5EFQA 5JGBA 4M14A 3Q32A 3LCTA 1XH5A 4GUBA 2QQ7A 4O1PA 3NX8A 4Q5EA 3KRWA 4IB1A 4FKSA 3PIYA 3AD5A 3DDPA 1W84A 4X6RA 3PJ3A 4O0VA 4RPVA 4IM0A 3RKBA 3UC3A 3PG1A 2QOLA 3ZCLA 5I5ZA 4I0RA 1JKLA 1ZYLA 2R9SA 3PFQA 4MHAA 2PVLA 5KZIA 3ANRA 3QD4A 4YMJA 5IU2A 5M53A 4D2RA 5A6OA 3HMMA 4H1MA 4AA4A 5KMIA 4R7HA 2FUMA 3HAVA 4TYHB 3ZSGA 4BI1A 3IK3A 4MXXA 5ANDA 4EH4A 4EOLA 4X2JA 4M67A 3KVXA 4LRKA 3RHXA 2GQRA 4D4RA 3LFEA 3LJ1A 3NWWA 3ZZWA 1YW2A 5AV3A 3PXQA 3AD4A 3BHHA 4PTEA 3ZO2A 4KS7A 4DCAA 5BYYA 5AP5A 3CQWA 5AIRA 3VBVA 3JY9A 4BCKA 4EC8A 3U9NA 2PZIA 3S2PA 2PMNX 3GCSA 2QCSA 3D7ZA 2VTQA 3F9NA 1X8BA 2QOBA 3Q4TA 3WIGA 4YSJA 4RWKA 3GFEA 3DK6A 4D28A 3OWJA 5CI7A 2YITA 3DV3A 4EOOA 5CF6A 3QKKA 4CTBA 2XMYA 2O5KA 3TTJA 1PHKA 2W9ZB 4H58A 3V3VA 5EDQA 3DKFA 1Y6AA 5HGIA 4YNEA 3ZSIA 4ENYA 3VS7A 4GG7A 4RJ7A 1IAJA 3LMHA 2O63A 1OVEA 3EFLA 3TCPA 5HORA 5FTGA 3QZFA 4CKIA 4YHFA 5I9VA 4JJRA 4ENXA 4IVAA 4C59A 3NDMA 1OPJA 2CLQA 4G3DA 2JKMA 4O91A 4PL4A 4M0YA 5C4KA 5DOSA 4NL0A 1R3CA 5DI1A 3VHEA 3GU7A 1ZWSA 3DJ6A 4LRJA 2EWAA 2KULA 3TACA 2C5YA 3UVPA 4E20A 3PJCA 5AAGA 3UOJA 2WIHA 2J7TA 4BL1A 4I24A 3EQRA 4O7LA 2WMTA 4GVJA 3BCEA 4AGDA 4OAUC 4F63A 3A8XA 5JQ5A 4BTFA 1Y6BA 5J87A 5M07A 4N6YA 3DT1A 3HA6A 3LQ8A 1B39A 5AUVA 3Q9WA 2J0LA 4FMQA 4JIAA 4OBOA 4Y85A 4ZTLA 4YC6A 4BICA 5CAQA 4WNPA 3NUYA 4EORA 3PXZA 3KXMA 1OPLA 4PUZA 4YJTA 3C4XA 4L8MA 4MQ2A 5ANGA 2BIYA 5HHWA 3ID6C 3DLSA 3RAKA 4FSMA 4EEVA 4ANQA 2XVDA 3E8CA 4WRGA 5J7BA 4V0GA 4J8MA 5KE0A 3IO7A 4G5JA 4BBEA 3BYOA 4YJUA 4BVUA 5ICPA 2VTLA 1AQ1A 2VTHA 4YTCA 2PVYA 4AZTA 4EK8A 4E5WA 3UMWA 1OL7A 1WFCA 2ZV9A 4JBQA 4F7NA 1GIHA 3EQIA 2YLEA 4ID7A 1P4FA 3TNIA 4WIHA 4CZUA 3FY2A 2YEXA 3WF9A 1M14A 2GFCA 1RDQE 4QO9A 2X81A 5DT4A 5JGAA 3FMDA 4DTBA 4ZMFA 2BZHB 3QHWA 4J52A 5FTQA 3C51A 2KTYA 3P7BA 3EQGA 3RJCA 1IAHA 2IJMA 2R3RA 5AR5A 2R64A 3BGQA 3FQEA 3FMJA 3U4UA 4FE2A 1U59A 4F65A 3R7GA 3F3UA 1OM1A 3PJ2A 4QOXA 3DOGA 1VR2A 4YJQA 3NMUF 5EW9A 4UBAA 5FEEA 3QX4A 4FV8A 2R7IA 3P86A 5AR2A 3CTJA 4MBIA 1Q8ZA 4GIIA 1WBTA 2XYUA 4RJ8A 3FKNA 4S2ZA 4X2GA 2R3LA 4UMUA 2OICA 2YCQA 1UU9A 3HMIA 5DEYA 5IMXA 1CMKE 3I6UA 4FIHA 5K9IA 1GAGA 3LXLA 3W55A 4AT3A 2OBJA 2RG5A 4TWCA 4C3PA 2GHMA 3AMBA 3RCJA 1H08A 2OIBA 2Z7RA 3OVVA 3GEQA 2J90A 3TG1A 3BLQA 4YURA 3LVPA 4YLJA 4DEAA 5IMEA 3DZQA 4ZS4A 3C4FA 3G5DA 3HMOA 4RX7A 4AFJA 4EQUA 5CALA 3VRZA 4FT5A 3QRIA 2PE1A 4FKUA 3POOA 3DTWA 2UZDA 3KRJA 5CTPA 3EQBA 4JR7A 4TYHA 2UUEA 3AT2A 3B2WA 2HZIA 3PVGA 5CT7A 2OWBA 2Y8OA 3UQCA 3S95A 4NM0A 4QTCA 2OJGA 5KMJA 3HMNA 3AOXA 4JIKA 4YGAA 3CTQA 2C6KA 3DPKA 3MGYA 5ETCA 5A4QA 4TKSA 2WMRA 4IC7A 4CXAA 2OIDA 4G16A 4B7TA 2W17A 4M12A 3PLAE 2W05A 3NW7A 2WMXA 5DYJA 3E8EA 4H3BA 3FI8A 1XBAA 3NYXA 5H2UA 3S0OA 4Z9LA 2V22A 3EZRA 2XS0A 2X2MA 4PNIA 4U5JA 3VF9A 2CCHA 5KMMA 4PTCA 4MWIA 5BUIA 1BL6A 4MNFA 3TUBA 3SGCA 2JDOA 4QP2A 3EQFA 3NR9A 4E4XA 4FT7A 3TEIA 4I22A 4CEGA 4D2VA 5IA2A 5J79A 2R3FA 2XIKA 1E1XA 1Q24A 1REKA 2WNTA 3F3TA 3QUPA 2GNLA 3Q04A 1RE8A 5EM8A 4BKJA 4EWHA 2R3NA 1EH4A 2OJFE 4M68A 4GUEA 4I21A 3PY1A 3V8SA 1SVHA 1XJDA 2UZLA 3JS2A 2QOKA 4OTDA 4KINA 5EQPA 2CGVA 4FTIA 5DR9A 4MXZA 2W1DA 1OPKA 2XKFA 1PJKA 1U54B 3LAUA 3D5UA 3FLYA 1BL7A 4RFMA 5LMKC 2XB7A 1YWVA 2IZSA 3I81A 4LGGA 3NNWA 3KEXA 3QZGA 5HVYA 4K33A 3UQFA 5GIOE 3KU2A 2HELA 4C02A 5EYKA 4FTTA 5A4LA 1YXSA 4J7BA 2IZUA 2PL0A 3ERKA 1ZYCA 3KY2A 4R8QA 5HE2A 2R3OA 3WF7A 1G8AA 3QCQA 1PY5A 4CLIA 3R0TA 3L8XA 4BYIA 5HNBA 3TNHA 3ACJA 4RJ6A 3MTFA 4UEUA 3PSDA 3VJOA 4D5HA 4E73A 3RZFA 4NCTA 3TT0A 1YVJA 2E9NA 4A07A 4NJDA 4FKOA 4ZTQA 2OH0E 4BCIA 5L8JA 2PZRA 5JRQA 3ZLWA 2XKCA 3PA5A 2V7OA 2Y6OA 4X2FA 5HI2A 2ONLA 2OXYA 5EKNA 1H00A 2VO3A 2ZM1A 2VWVA 3EN6A 3BYMA 3OS3A 5ITAA 1PXMA 3MVMA 4BBFA 4BDBA 4E5AX 2RKUA 1SVGA 4LMNA 3VUHA 4KAOA 3E87A 4FKJA 3C4WA 4FG7A 3TTIA 2VV9A 4ZIMA 2W9FB 1XBBA 3EOCA 4N57A 1H07A 4JX7A 5A46A 2PZ5A 3BHUA 4KIKB 3SW4A 3BKBA 3DFAA 4BIEA 4ACCA 1IA8A 4MWHA 5D9HA 5DNRA 4BCJA 2Z7SA 3EQHA 3GNIB 3PRFA 4I6HA 3C9WA 4W8EA 3TNWA 5A6NA 3H9FA 4W4VA 3UIMA 3U54A 3WE8A 2BKKA 3T3VA 5TKDA 3LFDA 3QA0A 3BLHA 4FTMA 4ALWA 4FG9A 2IG7A 4QMSA 5EOBA 4OBQA 3IW5A 4QP7A 5E4HA 3FZTA 2YISA 3R00A 4FSTA 3VS4A 1H24A 4Z55A 3PRIA 4TWNA 1OL1A 4XX9A 4YJVA 4CTCA 5EM5A 4JXFA 4GFGA 1NW1A 3KN5A 3VQUA 2JKOA 4ZJVA 3R9DA 5IH6A 5IF1A 4J71A 5L2IA 2PWLA 4HZSA 2XM8A 4BBMA 2W06A 1SNXA 3K3JA 2B9JA 3RK7A 3FZPA 5C8NA 4KABA 1QL6A 3AMYA 4AZWA 4BI2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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