4F99A

Human cdc7 kinase in complex with dbf4 and nucleotide
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
354
structure length
312
Chain Sequence
KKDIEKLYEAVPQLSNVFKIEDKIGEGTFSSVYLATAQLQVGPEEKIALKHLIPTSHPIRIAAELQCLTVAGGQDNVMGVKYCFRKNDHVVIAMPYLEHESFLDILNSLSFQEVREYMLNLFKALKRIHQFGIVHRDVKPSNFLYNRRLKKYALVDFGLAQGTHDTKIELLKFVQSEAQQRAGTPGFRAPEVLTKCPNQTTAIDMWSAGVIFLSLLSGRYPFYKASDDLTALAQIMTIRGSRETIQAAKTFGKSILCSKEVPAQDLRKLCERLRWNEVPDEAYDLLDKLLDLNPASRITAEEALLHPFFKDM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human CDC7 kinase in complex with its activator DBF4.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cell division cycle 7-related protein kinase
total genus 96
structure length 312
sequence length 354
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4f99A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4f99A01
3KL8A 3VWAA 1BYGA 3E92A 4YHTA 3L8VA 3IOKA 1JBPE 3EQGA 4XHKB 3MVHA 4QQTA 2WTIA 4AGDA 4BR3A 2C6KA 3GENA 3V6SA 1PF8A 2UVZA 2ZM4A 3IGGA 3P23A 5CNNA 3LMIA 3R7IA 3A60A 4AW2A 4NJ3A 4K6ZA 3R01A 2X6EA 2Z2WA 4DFZE 3LMGA 3LCKA 2RFEA 3E64A 4CQGA 5JT2A 2VWWA 2GPHA 5E8VA 3ALNA 4KNBA 4FZDB 4ZTLA 4FV5A 3TG1A 4C4HA 2C3JA 4EH4A 1PMVA 4G3DA 4I6BA 2PVKA 1WVYA 3KMWA 3UVRA 1JKSA 2GDOA 3D7TA 3DZQA 5HTCA 2R3HA 2OJFE 3HL7A 4RX7A 4LGDA 4GYIA 4E4NA 4RX8A 3WI6A 3FY0A 4HVSA 4ZMFA 3ZO3A 5GIOE 3BRBA 1GZOA 1Q97A 4EH7A 4IAIA 3QA8A 2UW4A 3KULA 2FSTX 2YAAA 1O6KA 2FB8A 2IW6A 1YHWA 2X39A 3ZEPA 5CLPA 3MFSA 4YJVA 3CD3A 3VS4A 4FTUA 1XH6A 4CD0A 3FMKA 4B6LA 3FZ1A 4BCJA 1ZAOA 4DEIA 4MD9E 4C59A 3TV7A 4BCKA 4GG7A 3HRFA 3PVGA 3UMWA 4FODA 3AMYA 4FEQA 4IIRA 1KV2A 2J9MA 4AFEA 4AOTA 3IW4A 4FTRA 3TZ8A 4Q9SA 5CI6A 2PZIA 3DK3A 4BI2A 3D2KA 3BQCA 2CSNA 3S0OA 3MIYA 4G1WA 4K8AA 2R3NA 2AC3A 4MVFA 3RK5A 4FV7A 3KCFA 4F0FA 3CTHA 4U79A 1M2RA 3UIBA 3R04A 2WMSA 4FMQA 4AX8A 1LPUA 3WOWA 1KOAA 3P7CA 4BIEA 3FL5A 5HX8A 3OW3A 3R1YA 5LXMA 5HG7A 5IEYA 4AACA 1Y8YA 3KEXA 3QQUA 2BTRA 4RA5A 3NVMB 4QYFA 2WMTA 5EW3A 2W06A 3CY3A 2OG8A 4IAFA 5FRIA 1OMWA 4BI0A 3PY3A 4W4XA 3ZXZA 2OSCA 5JZJA 5AP3A 2XZSA 4CMTA 4X3FC 4FT0A 3B8QA 4PX6A 4LV5A 2ZDUA 5L2IA 4H05A 4X0MA 2VTHA 2QD9A 2YM8A 3BKBA 2QCSA 3EN6A 3E3PA 3KA0A 3QX2A 4U81A 5HKMA 5DIAA 2B9HA 4FTOA 2R7BA 3CTJA 3E5AA 3F69A 3K5UA 3MY0A 1APME 4QO9A 5M53A 2EWAA 2WTKC 4ARKA 3NAXA 2OWBA 5LARA 3NNUA 3LCOA 3OS3A 4GMYA 4NIFB 4ASXA 4RVMA 4FKLA 1QPCA 5EDPA 4RBLA 5IQEA 1REKA 3NDMA 5AP7A 5EQPA 3CQUA 2Z7QA 3BU3A 4J71A 3HX4A 4OBOA 1YHVA 3ZO4A 2F7EE 2XK3A 4FZ6A 5E1SA 5J7HA 4FTLA 5JEBA 4GT3A 5KUPA 4PTCA 3ZXTA 2FA2A 2QOBA 5JRSA 3Q3BA 5HIDA 3QCSA 2QR7A 1BUHA 4DEGA 4QPMA 3PWYA 3HECA 1H8FA 1JSTA 3HV5A 4W8DA 4XS2A 3DBEA 4JRNA 2IPXA 3IO7A 3DJ6A 2WTCA 3KF7A 4QPAA 4F1MA 2FSOX 2YZLA 3KN5A 4FZAB 4YJRA 2KTYA 2UW9A 3C4EA 3NYNA 5AR8A 4U45A 2BILB 2B53A 4E8AA 4DEDA 4R78A 3QD0A 3Q6WA 2QHNA 4BGGA 4UXLA 2O8YA 3VNTA 5DT4A 3BBWA 4YC3A 2IW8A 4GG5A 4UWCA 3EMGA 3FPMA 1OBDA 4EONA 1LP4A 3FL4A 4RX5A 5CENA 2ZOQA 3R1QA 5L8LA 1YXVA 1ZYDA 4GK3A 2P2HA 4Z16A 3HMOA 3P4KA 3I1AA 4O1PA 4FKSA 4ZMEA 3SKCA 3ZO2A 5T6KA 2ZMCA 3NX8A 4NJDA 4GUEA 2ZB1A 4RFYA 4HCTA 5GZ9A 4YO6A 1UKHA 2GMXA 2C6TA 3UNZA 4USEA 2E9UA 4V01A 5HCZA 4JX3A 2YWPA 4XOYA 4E6AA 3FHIA 4KBCA 4X3FA 5AUTA 3VW8A 3E62A 2R3PA 4D2TA 3SXSA 2FO0A 3G90X 3UIMA 1QL6A 2OXXA 4L43A 1ZZLA 3S3IA 5FG8A 1M7QA 4PL5A 4E4MA 4EOOA 2GS6A 2QC6A 4ITIA 4NWMA 3ZM9A 2R3IA 2UV2A 5CEKA 3BYUA 4HYIA 4AAAA 4ASDA 4NZWB 5M4IA 2YM4A 3GNIB 2BAKA 1LUFA 4WD5A 4CTCA 5KBRA 4ZJIA 1Y57A 1NVQA 5AAGA 4N6ZA 4RIOA 2C5NA 5KMNA 5I9XA 5I9ZA 4EHEA 1AQ1A 3OOGA 4QMVA 3R9RA 3ORNA 4II5A 3RBWA 4L3JA 4FGRA 4HCUA 5LWNA 2F2CB 4X3JA 1KE5A 3FJQE 3HUBA 5CVGA 5AIKA 3VUMA 1W0XC 2RGPA 3HV3A 3HYHA 3IW5A 4PF4A 3R7YA 3EFLA 3KVWA 3JPVA 5F95A 3SG8A 2JDTA 4K1BA 4WIHA 4I94A 2W1ZA 2XIKA 4C36A 4QP9A 2JBPA 4D4YA 3SAYA 2XKDA 5DOSA 4TNDA 2BFYA 2GS7A 2OIQA 5DG5A 4ZAUA 3QQHA 1KSWA 3VW6A 4GK4A 4IWQA 3MTFA 1Y6BA 1G3NA 4LRKA 4V05A 1Q8YA 3R2BA 5J5SA 3DDQA 2YA9A 5HICA 2WXVA 5AEPA 4NCTC 5HLNA 2Y6MA 2UZWE 3P7BA 1Q3DA 2P0CA 2HZNA 4CZYB 5HLPA 3NNVA 5TE0A 3DPKA 4OT6A 2R3JA 2BROA 3MTLA 3PZEA 1XBBA 3UDBA 3NVKI 3NR9A 4YBJA 1WBOA 5G6VA 4EOPA 3GEQA 3ATTA 1GOLA 3FKOA 3G9LX 3OTVA 3KRRA 4BGHA 4UN0C 5JFVA 3FC2A 2JKQA 2C4GA 3UQCA 2CPKE 3VUHA 3C1XA 4Q5EA 3GB2A 3PRIA 2BIKB 1CTPE 3EQBA 3OBGA 4U97A 5H3QA 1FPUA 4FUYA 2JKKA 1H1QA 4J52A 1QCFA 5JFSA 1OL5A 2R2PA 2WHBA 2J0MB 3UE4A 1OIYA 3PZHA 3FSKA 3Q4CA 2LAVA 4EWQA 3CJFA 3U4WA 4ZLZA 5M44A 3EJ1A 2F4JA 3CBLA 3HGKA 5BVOA 4JOAA 4FOCA 4QNAA 2QOCA 2RSVA 5CQUA 2JAMA 4GIHA 4JDJA 3TKUA 4DG0E 1ZOEA 4RIXB 3OT8A 4EOIA 3I6WA 2BCJA 2E9VA 3QHRA 1W7HA 4JDHA 3UIXA 5E90A 3MH2A 5IQHA 4F65A 1Q8ZA 2UZBA 5D11A 1FGKA 5CAQA 4FZFB 4XYFA 5D12A 3ORZA 3A61A 4FYOA 2YDJA 3IOPA 5IDPA 3PY0A 2C0OA 4KRDA 5CT0A 4TWCA 4CVAA 3I60A 2X8DA 4QP4A 4AA0A 2IVVA 5AV2A 2XYUA 4U7ZA 3MFUA 5EHOA 3DAEA 4FV3A 4F99A 4D55A 4HCVA 4R5YA 2B54A 3R9OA 2DUVA 3VBXA 4EYJA 2R3KA 4OTDA 3ETAA 1JLUE 4I0SA 5EHLA 2X9EA 4O21A 4W9WA 4C4EA 4NCTA 3W8LA 1SM2A 4BRXA 4NW5A 4DGLC 1YXTA 5KMKA 4O7ZA 1WBTA 2W1IA 2VX1A 2QR8A 1H26A 1W83A 3E8CA 5DBXA 3O23A 4EKLA 4P5ZA 3Q9WA 3EQFA 2QHMA 5DI1A 2VTOA 2OI4X 3DB8A 2GFSA 4MXOA 4QMPA 3IQ7A 3O71A 2O64A 4X21A 3GUBA 5HLWA 4YZMA 2QOFA 2BAQA 2GNIA 3RZBA 1PMEA 2VD5A 3PJ2A 3AC5A 2Z7SA 4FSWA 2R9SA 1VR2A 4MQ2A 5L8JA 4F6WA 3QTQA 4EK4A 3FHRA 1IA9A 4UB7A 3PG3A 3U9NA 3ZLWA 4S33A 3FI3A 4G31A 4W4VA 3NYOA 3W33A 3AC8A 3I6UA 4XJ0A 5HOAA 3ENHA 5ACBC 5CAOA 2VNWA 3VUGA 1J7LA 1O9UA 3F3TA 2VV9A 2R4BA 4IAYA 1Y91A 3OCGA 4FV9A 5LVPA 2PVHA 4PDYA 3I0QA 3LFBA 4EC9A 2V7AA 2XBAA 3KCKA 4FNWA 4XBRA 4JG6A 4QMXA 3W2PA 3IONA 3ENMA 2QQ7A 2BDWA 4DCEA 3PDTA 2Y6OA 3IW7A 3PPJA 2XK9A 4XG9A 3S2PA 1VYWA 5CZHA 4BC6A 3R7UA 4J8NA 4YHFA 4O7VA 4L42A 3OT3A 4M97A 4BDHA 2CN5A 1OKZA 3S1HA 1J7IA 4FL3A 3D0EA 2YDKA 4WT6A 4CMUA 1YOJA 3DT1A 3DB6A 1QPJA 4W4YA 5EYDA 4FC0A 1NVSA 3ZTXA 1OUKA 2ITQA 4EORA 1JKKA 1YHSA 3LLAA 4GRBA 2ZV9A 4QMNA 4ZY6A 5HEZA 5L6WL 2VWZA 3QA0A 2ESMA 1DS5A 4IJ9A 4ZEGA 2EVAA 4IE9A 2ETRA 3VS2A 4IVDA 5DR2A 4AT3A 3BV3A 3O0GA 4RZWA 4NM0A 4DCAA 2OFVA 3T9IA 3W55A 3TV4A 1GJOA 4NM7A 3QALE 5M06A 2WGJA 3HZTA 4WSYA 5IA4A 2HY81 4ORKA 4A9RA 4ANSA 3CGOA 4AGCA 3QWJA 5J9LA 1OBGA 4X2NA 1OIQA 5JFXA 4DF3A 1ZOHA 4QMMA 5C1QB 3NW7A 3HAVA 3QTIA 4YGAA 2PVLA 4AE6A 4NKSA 2OF2A 4N70A 4WNOA 5KBQA 4H3BA 5CSHA 4C35A 5HZNA 3BGQA 3TTJA 4UV0A 2Z60A 3LVPA 5L2TA 4FTTA 5HVJA 1O6LA 2OJJA 2AC5A 2RG6A 3GU6A 4IH8A 2W5BA 1R0PA 1R39A 3P5KA 4RWIA 4F1TA 3CR0A 1ZYSA 2Z7RA 5I4NA 5HESA 2V7OA 2XB7A 2ZAZA 3RK7A 3UYSA 3ZDUA 4CQEA 4CKIA 2EXEA 4EHVA 3MA6A 1SYKA 3UYTA 5M4UA 3DU8A 5AAEA 5J1VA 3GQLA 4L3LA 3EKKA 4DFNA 4G3FA 5F1ZA 4B7TA 1VJYA 4GT5A 3SLSA 5CF8A 1FVVA 2OH4A 3MFRA 1MP8A 5KMLA 5KZIA 3HUCA 2CGUA 3FMJA 4F9AA 2W9FB 2VTJA 2OF4A 5I3OA 3CLYA 3KGAA 3OW4A 2IVUA 1GIJA 1UV5A 1YI3A 5L3AA 4D0XA 4XP0A 2WQNA 1XR1A 1M17A 3ZRKA 3EN5A 4E5BA 4FL2A 4ITJA 2XNMA 2PSQA 4KKHA 4A9SA 5FXRA 4OTHA 4BICA 2A0CX 3KFAA 3LFSA 3G2FA 4R3PA 1BL7A 4H58A 4MNFA 3TM0A 2OK1A 2BAJA 3ID6C 4C37A 2QOOA 1ZRZA 5CAPA 4OGRA 3RCDA 4AZTA 3DKOA 4DEEA 5L2QA 3F5PA 4KSPA 1FQ1B 2BIYA 2C6OA 3GCQA 3I5ZA 4L46A 5DEYA 3WYXA 5E4HA 1U59A 3QD4A 1J91A 4K18A 4FNZA 5FQDC 2AYPA 3F82A 4D4VA 4B0GA 1YDTE 4UMPA 1YXSA 2XRWA 4O7LA 2WIHA 3BEAA 5JN2A 3SA0A 4O7YA 3OY1A 1GZKA 4YJSA 4OTIA 1TQMA 3EZVA 4QYHA 5ANJA 2E2BA 4L67A 2CLXA 3A62A 3Q60A 4HVIA 4PPAA 3CKWA 3C4WA 2WMQA 5EDQA 4IX4A 4M0ZA 4CMOA 3HEGA 5KE0A 3W2CA 3F2AA 4EH9A 1H0VA 3D83A 3MS9A 3E88A 1IEPA 2YM6A 1GNGA 3OMVA 3E63A 3CEKA 5AV4A 2X8IA 5M55A 1MQ4A 3OROA 4NW6A 1X8BA 5EI2A 3IDBA 4GEOA 4MWHA 5FLFA 4CRLA 4BI1A 1OPKA 2REIA 2ERKA 5E8UA 4LI5A 4RC3A 2UW5A 4O83A 2NPQA 4GSBA 4O7TA 1NY3A 2YISA 1YI4A 3DBCA 3NCGA 2ETKA 4W9XA 4GKHA 5H2UA 3GBZA 1WBPA 2OKRA 3A7JA 5IUHA 5CS6A 4R1YA 4FVPA 2JFLA 2PU8A 2BHHA 4FEWA 3OZ6A 4GW8A 4FT9A 4AW5A 3LXPA 3KY2A 4FVQA 4OLIA 4S30A 4YPDA 2PYWA 4Z7HA 3UIUA 3QAME 4LOOA 1BI7A 3W2QA 3AMAA 4XG3A 3RMFA 4BN1A 4LG4A 2G2FA 1S9IA 1UNHA 4LGGA 3ZC5A 4ZSAA 3QYZA 1TKIA 1BL6A 5JH6A 3GU7A 2C5YA 4FKUA 5DLSA 4JG8A 3V8SA 3PWDA 5DA3A 2YN8A 2W5HA 4KKGA 3U55A 4E5AX 3V5WA 1ZY4A 2OIDA 4I4FA 3DKGA 3HLLA 2BKKA 4IANA 3L9MA 5HX6A 4EK3A 4XLIA 4FIFA 4KS8A 3MDYA 3SDJA 3MPAA 3B2WA 4EOSA 3N4VA 3GOKA 3DDPA 4C38A 3OXIA 3RJCA 5F94A 4FV1A 2J51A 3ELJA 3QF9A 4KIKB 4FIGA 4IZ7A 2W0JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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