4F9BA

Human cdc7 kinase in complex with dbf4 and pha767491
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
356
structure length
318
Chain Sequence
GVKKDIEKLYEAVPQLSNVFKIEDKIGEGTFSSVYLATAQLQVGPEEKIALKHLIPTSHPIRIAAELQCLTVAGGQDNVMGVKYCFRKNDHVVIAMPYLEHESFLDILNSLSFQEVREYMLNLFKALKRIHQFGIVHRDVKPSNFLYNRRLKKYALVDFGLAQGTHDTKIELLKFVQSEAQQVAPRAGTPGFRAPEVLTKCPNQTTAIDMWSAGVIFLSLLSGRYPFYKASDDLTALAQIMTIRGSRETIQAAKTFGKSILCSKEVPAQDLRKLCERLRGWNEVPDEAYDLLDKLLDLNPASRITAEEALLHPFFKDM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human CDC7 kinase in complex with its activator DBF4.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cell division cycle 7-related protein kinase
total genus 100
structure length 318
sequence length 356
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4f9bA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4f9bA01
3IS5A 3KVXA 2YWPA 3LFDA 3VS0A 5JRQA 4N70A 1OB3A 3MW1A 3FBVA 5BX0A 4G6LA 4IAZA 4RWLA 4TN6A 5DEYA 4RVLA 2YZAA 4CT2A 3BZ3A 5M07A 5CAQA 4FMQA 1PKDA 4UEUA 4UZHA 4FEQA 3D5WA 3ZRKA 2R3JA 3RP9A 4M66A 1ZRZA 3JVRA 4QD6A 3MIAA 4FF8A 2OO8X 2QR8A 2C0OA 2FSMX 1UV5A 4AZTA 1Q3WA 3NNWA 4WT6A 3WZDA 4I24A 5J9ZA 4CV8A 4A06A 2UW8A 1OIRA 1JPAA 3CQUA 3OCTA 4LGGA 2PVJA 1QL6A 4JDJA 2GHGA 3DY7A 3MFRA 2F7XE 2ITYA 2J0LA 1PYXA 2CGUA 1GZ8A 3G0FA 3C0IA 4K2RA 4D1SA 2YM6A 4ZAUA 5HLWA 4IVAA 2PE1A 5HU3A 5CTPA 4R3RA 1YDTE 5CQUA 3IOPA 4FTJA 3OW3A 4UXQA 2A19B 3CC6A 1IASA 2W1DA 4EH5A 1OKYA 4E93A 1QPJA 5IDPA 3DAEA 1VYWA 3GCQA 3I6WA 4EL9A 4L8MA 2YCFA 4LRKA 5AAEA 1GNGA 4M7IA 3C4FA 3UPZA 4C2VA 3FHRA 4QP1A 2UW3A 5C4KA 4FGBA 4XCUA 3FXXA 2E9NA 4N6ZA 4OGRA 5K5XA 1BI8A 4AZWA 3ZSGA 2P2IA 4O0WA 2GNLA 2J0JA 2WD1A 3VN9A 2X2KA 3LZBA 4MD7E 4RWKA 4F0GA 2PU8A 4PP9A 3RPOA 4H1MA 5GZ8A 4S33A 4EH7A 2WTDA 3AC2A 2XIZA 4F7NA 5CT7A 3OS3A 3HUBA 4PMSA 1W83A 3NW5A 2YM8A 4IE9A 1ND4A 4EC9A 4EK5A 4BBMA 3R1NA 1U4DA 3EQFA 4BCGA 4XEYA 3F2RA 4W8DA 5IEVA 4GH2A 4D9TA 4Y5HA 2XJ2A 2C4GA 2QOKA 3UDBA 2IZUA 3LIJA 3NLBA 4NJDA 4YBKA 2WFYA 3UP7A 3GC0A 4AE6A 2CPKE 4MYGA 3F69A 3VS7A 4P5QA 1VZOA 1XO2B 2VUWA 3QQUA 2XNPA 3BBWA 3C4CA 2HY0A 3KC3A 2UZNA 5CNNA 4BDIA 5TR6A 2OJFE 2JDSA 5E8TA 4UALA 4EC8A 4C59A 3NDMA 4FSYA 4ZZOA 3UQFA 3LPBA 4AZVA 3E7OA 3BHVA 4O1OA 2OH4A 4J95A 4EBWA 4DG0E 5FG8A 2GNHA 4R1VA 4WBOA 4RWJA 3LLAA 3IECA 2BFXA 1WBPA 4TKSA 2EVAA 3SX9A 4IFGA 3TNIA 4LYNA 5J7HA 5M53A 3U4UA 2HYYA 4CD0A 5CSXA 4A9SA 3PA4A 4YPDA 2XKCA 4ZMEA 4HYHA 3FV8A 3QQKA 3MPMA 5DOSA 2Y6MA 3GT8A 2ERZE 3VJOA 3S00A 3AT2A 2R3HA 4FV9A 3WF6A 2H9VA 3F66A 3KMMA 4M68A 4CKJA 3O2MA 3II5A 2IPXA 2PZPA 5B2LA 4HGSA 3MH3A 2CLXA 2BRHA 3OD6X 5BVOA 4LGHA 4R3CA 5BVNA 2I7QA 5ANJA 3ETAA 3DQWA 3MFSA 2I0YA 3OBGA 3Q9YA 4OTGA 3R7VA 2YIYA 4D9UA 2OZAB 3ACKA 2QURA 1I44A 4RJ4A 5C9CA 4HYUA 1PJKA 2VTSA 2QOBA 1XJDA 2IO6A 2EB3A 5D9HA 1GIHA 5AWMA 4KIQA 4JJRA 4ID7A 4K0YA 4JNWA 3KN6A 4QP3A 3AGMA 2P55A 4JQEA 4DF3A 4I41A 4QP8A 4O7SA 4MQ2A 1IEPA 3WYXA 3AD5A 2YCRA 3ROCA 3QQGA 1JKKA 5KMKA 1URCA 1A06A 3FYJX 1E1XA 2XEYA 4FZFB 4UMQA 5GZ9A 4F0IA 3BYOA 3LFNA 4GIHA 4Q5EA 3PE2A 1FVRA 4MNEB 4BKJA 5JZJA 2OJJA 4RA5A 2PVRA 1M14A 2X81A 4L67A 4F0FA 2V5QA 2HOGA 4O7LA 4GRBA 2UW9A 3QD3A 4M8TA 3UIXA 5C01A 4IVDA 3PA3A 3WE4A 3LFFA 4IX5A 3C5IA 3G15A 2OFUA 4E4XA 2EUFB 3KREA 4YMJA 4FTLA 3WYYA 4D0WA 4WA9A 5IA1A 3MJ1A 4QMSA 2VV9A 4M12A 1H28A 4PNIA 2FB8A 3EZRA 4YUQA 3LFQA 5DVRA 4YSJA 5IQAA 4DINA 4QTEA 2JC6A 2R3KA 3D5VA 3R30A 4UYAA 3A8XA 5I9XA 4L00A 5L6WL 3R73A 2JIUA 4G3CA 4ARKA 2A27A 5L4QA 2C69A 2R3PA 4FKSA 4FSZA 4IZ5A 5E1SA 2YEXA 4RQKA 2BTSA 4WG4A 3DBDA 2W17A 4U45A 5H3QA 4FTTA 5EQEA 4MXAA 2BILB 2IVUA 2X1NA 1PKGA 3P5KA 4KKEA 3UG1A 4CTBA 2R3GA 3OROA 3RK5A 5ETFA 1OKWA 1EH4A 3ZUUA 5HORA 1S9JA 4DCEA 3DA6A 3LAUA 4QP4A 2OH0E 3EFKA 3R8MA 3VQUA 4BIBA 3V51A 4C57A 4HVDA 4Y46A 1Z9XA 2P0CA 2QNJA 3HDMA 1OL7A 4TZRA 4YO4A 4AW1A 5DLSA 5M57A 3PXQA 4G3DA 3TUBA 1YOLA 5JGDA 4GS6A 3VUDA 4DFLA 4PWNA 4YJTA 5DR9A 1OVEA 4BGGA 1PMEA 2X0GA 2FA2A 4UBAA 4U40A 4AOTA 4WG5A 3I5NA 3GI3A 2BZJA 3QYWA 4FTNA 3SW7A 4U44A 1JQHA 2PZIA 3ORLA 1MRYA 3TJDA 3E62A 3TV7A 4HVHA 1NA7A 1SYKA 1R78A 1MRVA 3VRYA 4RJ3A 3O23A 3TNHA 4UXLA 4IBMA 1ZOEA 3GCVA 2R4BA 3HYHA 3KY2A 3ROYA 3WOWA 5JFSA 4O86A 4BY9E 2XS0A 2P33A 2XK6A 3U8WA 1Y6AA 5CZHA 3R9NA 4RJ6A 5H8BA 1Q8UA 5CAVA 4FNWA 4BC6A 4EUTA 4IM0A 3CR0A 3HNGA 4UWBA 4E5AX 2ERKA 3Q32A 3TN8A 2E9OA 2ZYBA 3SW4A 5EM5A 3CP9A 4FVRA 1PY5A 5CT0A 2BDJA 3RKBA 4RIYB 4BI2A 3F88A 1IA9A 4QQJA 4JOAA 2VWVA 4DFUA 4J7BA 4PTGA 2BZIB 3VHEA 3NW7A 3OOMA 3TWJA 3F61A 3T9TA 5E8SA 3CE3A 4QYHA 4TL0A 2PMLX 2R3RA 4RFZA 2W5HA 5LVOA 4L45A 4CFWA 2IN6A 1V1KA 4CXAA 5ITAA 4FEVA 5FXQA 1FVTA 1F0QA 4JX3A 4F09A 4U3ZA 4YHFA 3RPSA 2CDZA 4F6UA 1OPLA 4D2PA 4MWIA 2VTJA 4TWCA 4PPAA 5IZFA 5EQYA 2HY81 1H4LA 3L8PA 5M55A 4HNFA 4FKOA 3E8CA 4IAKA 3HV3A 2ITQA 3HL7A 5DT4A 3ET7A 3E87A 4OAUC 4D4VA 2CKOA 4UWYA 3QA0A 4JQ7A 3E8DA 2W4JA 4BDJA 3SRVB 1F5QA 2IW8A 4ACGA 4D4YA 4EH4A 3F7ZA 1WBNA 2F57A 4EORA 3PA5A 2YM4A 2XJ0A 3EHAA 4RX5A 2R7IA 3PG1A 5KMIA 1NW1A 2BHHA 2BFYA 4JBOA 4XNEA 4JXFA 3MN3A 4TXCA 5HCZA 1GZNA 5BVWA 4CFUA 3QCYA 4E6CA 1V0PA 1UWJA 4EYJA 5L8JA 3TNQB 4MAOA 4U41A 5IQHA 1HCKA 5DN3A 5KMJA 2VWUA 5CYIA 4N57A 2ZV8A 4ZTMA 1WBOA 2H6DA 3BYSA 2W1CA 3HMOA 2QVSE 4FV8A 3CQEA 4I6QA 5GZAA 2W1HA 5CEIA 3FI8A 1FBNA 2RIOA 2YCSA 4RIYA 2A2AA 3E3BX 3PTGA 4FNXA 3ULZA 5M4IA 1LP4A 3CJGA 4S31A 2G2FA 2JITA 3N51A 4XHKB 2QC6A 2OBJA 4AGDA 4BIDA 4UWCA 3TNPC 2OLCA 4PQNA 2BCJA 2GFSA 2X4FA 2AC3A 5J79A 1ZYDA 4ANOA 4J8MA 2ONLA 4RIWA 2QQ7A 4WUAA 5DI1A 4FOBA 5C27A 1YVJA 1FMOE 1M7NA 1OIUA 5J95A 3EN4A 1H8FA 2WMTA 2XNGA 2VO0A 4FZDB 5F1ZA 4DTAA 3KFAA 3RM6A 2Z7RA 1REKA 4HPUE 2BUJA 3ZU7A 1YI3A 3B2WA 1JSVA 3SD0A 2WMWA 2XKFA 4EHZA 5IA4A 4ANBA 2DYLA 2W06A 3AOXA 3BI6A 4C3RA 3ODZX 3Q2MA 4AQCA 5I9ZA 3ZONA 3D7TB 2C6LA 5DT3A 3ORIA 4F6SA 3ZXZA 3DKCA 3EQPA 4E6DA 5IA0A 5C8NA 4Y8DA 1W8CA 3W2OA 3ITZA 5ANKA 4FTRA 2QCSA 4UMTA 3ORNA 4C38A 3RMFA 2Z60A 3R8PA 5FTGA 2YERA 3LKMA 1OMWA 4BN1A 3R8ZA 1NVQA 3WARA 2PVLA 2JFMA 5TOZA 1DM2A 1ZLTA 3HA8A 2YDKA 4MWHA 2FVDA 4QYGA 3ZM9A 1H24A 4LQMA 4EYMA 2ZAZA 4B8MA 4FTMA 2PY3A 1U5RA 3QQLA 5HZNA 3F5PA 1FGKA 4ZTLA 5I9WA 5M09A 2I0HA 4HGEA 3V6RA 3R8LA 1FGIA 2CJMA 4Q9SA 4XP3A 4I3ZA 5EI8A 5AR5A 3V01A 4BBFA 3EKKA 3FLSA 4QMTA 3RTPA 5BYYA 4Z3VA 4BDDA 1ZYLA 3LQ3A 3Q9XA 3I81A 4BRXA 4F9WA 4JT3A 1PXIA 4A9YA 2WTVA 4XLIA 4IB0A 4MBLA 3BHHA 2GCDA 4U43A 5KMMA 3DZOA 5EM6A 2VTAA 2HW7A 1Q99A 4K18A 2OXXA 1PXJA 5FGKA 4LOPA 3HAMA 4CNHA 4A4XA 5HCXA 2VTPA 3SHEA 2I6LA 3R9OA 4XRJA 3F2AA 4XRLA 4W4VA 3QTZA 4OBOA 3HRCA 4AGUA 3HMPA 4GK4A 2ETRA 3ZUVA 5AR3A 5D1JA 3I4BA 4Y83A 2WMXA 2JKQA 5L6PA 4BDEA 3PDTA 3WZEA 3NUXA 5HBEA 3ULIA 4NL0A 2WEVA 1QPDA 2V55A 2A4LA 3RALA 3TKUA 5HO7A 2WB8A 5DRDA 3WF9A 3DFCB 2C5YA 3EN9A 2HELA 3JPVA 2BROA 4G6NA 4L3JA 4LFIA 4O0RA 2RFSA 4YLLA 4E5BA 4FVQA 2BRGA 3LCDA 4F08A 2W9FB 3DU8A 3ATTA 4MXXA 4RQVA 2R0IA 4DA5A 5T68A 3RCDA 3BLRA 1WVWA 2QONA 2ITOA 4ZY6A 1M2RA 2VX0A 3ORPA 3UVRA 2F49A 4U42A 2XUUA 4PL5A 4OBQA 4C2WA 3NGAA 3W8LA 4ALWA 4M13A 4GYGA 4AWIA 4BZDA 2BALA 4AN9A 1NT2A 3LLTA 5E7RA 5BMSA 2VTNA 3A2CA 5BVKA 3CXWA 5EHYA 2AUHA 4FT0A 5KX8A 4I20A 4H3BA 3FC2A 4HVSA 1UNHA 2IZSA 5DG5A 5HG7A 5CLPA 3CKXA 2ZVAA 3D94A 3DK3A 4IIRA 1H1QA 4U9AA 2J4ZA 4AA0A 4CCUA 4CMOA 2QKRA 4KKGA 3OT8A 4JBVA 4E4LA 3BCEA 3PVWA 3VBXA 4EOOA 1NVSA 3QAME 4HVIA 2YZLA 5E4HA 5H9BA 3TZ9A 4FSRA 4RJ8A 2GS6A 4PP7A 3QD2B 1LUFA 5A4QA 4K77A 5JQ8A 3VUKA 3BGZA 1WBWA 4HYIA 5H8EA 3QGYA 4RX8A 3R7EA 4BKZA 5B7VA 4UX9A 1ZYCA 4FIFA 4FV4A 1DI8A 3OHTA 4XG3A 5TT7A 2GQSA 4U7ZA 4ALVA 3UMWA 5BUJA 2C68A 4KIPA 3QKMA 1OBDA 3VBTA 5CX9A 3GXLA 3KKVA 3VNTA 3H4JA 5DRBA 1LEWA 5IQIA 4CMTA 2W1ZA 1LEZA 3A99A 3C4XA 5DGZA 4ANNA 4O0UA 4C4FA 3ORMA 4NYEA 1PMNA 2GSFA 2J5EA 3Q3BA 4I5CA 3CS9A 3DAJA 2QOFA 4JRNA 2XB7A 2W05A 5HHWA 2C6MA 5BYLA 3WBLA 4ASDA 4D2TA 4EQUA 5M08A 1ZAOA 4U6RA 4YC6A 1P4OA 2Z02A 3LOKA 1AD5A 3HZTA 4DHFA 3D2KA 4ZZNA 2P2HA 2OIBA 5FDXA 5J9YA 2RKUA 5EG3A 1H00A 1GIJA 1R0PA 2IVSA 3HX4A 5CEKA 3QXOA 4IJ9A 4KIKB 2Z7LA 5KHWA 5KUPA 5CI7A 5IF1A 1Y8YA 4M69B 4P5ZA 5EDQA 5HOAA 4PY1A 2YLFA 5AV1A 1A9UA 1F3MC 5M4UA 3F2NA 5ANGA 1YKRA 3P7CA 4P2KA 4A9TA 4K6ZA 3KVWA 3MDYA 1XBAA 3HUCA 4J99A 4ITIA 4ALUA 1MUOA 4IB3A 5AR8A 3KRLA 4JG7A 4CRSA 2PZRA 4CFFA 2UW5A 3LHJA 3RM7A 4FT5A 5I0BA 2C1BA 5JGBA 3KCFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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