4FKSA

Crystal structure of the cdk2 in complex with oxindole inhibitor
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
296
structure length
275
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the cdk2 in complex with oxindole inhibitor
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
total genus 77
structure length 275
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fksA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fksA01
1PHKA 1ZMVA 3L1SA 4GKIA 3PUPA 4D9TA 2QR8A 4FYOA 5DEYA 3LXKA 3BIZA 4KIOA 4OW8A 3R7EA 3TJDA 5JFWA 3IECA 3OW3A 5HORA 3IW8A 2JDVA 3H9FA 2VTQA 2R9SA 3ORIA 4H1JA 4EYJA 1ZXEA 2VTRA 3FMDA 2J0IA 4I1ZA 4PDSA 1V0OA 1OITA 3VQHA 4FK3A 2BIKB 2YACA 3AT3A 4YTIA 3UOKA 1UNHA 4CYIA 2W1CA 5I9VA 3QD2B 4FT9A 3EYGA 5JKGA 4AGDA 1KUTA 4I22A 3E8DA 4U0IA 4E4LA 3U6JA 3WBLA 2ZM4A 1Q99A 1YHSA 3F3ZA 2WZJA 3OOGA 5HLNA 2W4JA 3C50A 2YCFA 3WE4A 2X9FA 4YC3A 2YM4A 4C4HA 4RJ7A 4BI1A 5HQ0A 2DS1A 4BIEA 4FSTA 3R8PA 1OL6A 2B9JA 1ZWSA 3L9PA 1H0VA 4TY1A 1XQZA 2YITA 4XBUA 5T3QA 4BDHA 4ZTNA 2YWVA 2G2IA 3TNIA 1REJA 5EQEA 3ZC6A 3NUNA 3A62A 5K5NA 3IW6A 2PYWA 3FL4A 4PL3A 4MD9E 3OBGA 3DPKA 4M12A 2C1AA 3I7CA 4A07A 4F9AA 2UZDA 4C57A 2UZBA 2GQRA 1NVSA 2E9OA 2ITZA 4L9IA 4DH8A 5GHVA 4BCFA 4WOVA 3RNYA 3COMA 3RWQA 3OP5A 4ZSAA 4LM5A 3R9NA 4QMQA 4XOZA 2IWIA 5GZ8A 5BUIA 1BL7A 2C4GA 4U79A 4FKPA 2C0OA 3CP9A 2HWPA 2ZB0A 3A4OX 4FV0A 3WZKA 2BTRA 3RCJA 2R3MA 3KK9A 4JR7A 2Y4PA 3O7LD 4F9CA 3V5WA 4CKJA 3Q2MA 2ITUA 3QZHA 2PL0A 3IK3A 1XKKA 3HMOA 3FV8A 3OZ6A 4K11A 4YZBA 4D1SA 1LUFA 3QHRA 5CI6A 4HNIA 3E93A 4DGNA 1SVHA 5LXMA 3PVUA 4XH6A 3LJ2A 1W0XC 3QF9A 4OBPA 3ALOA 2HIWA 3LE6A 3ORPA 3QTQA 4ACGA 3GCPA 3D5XA 1PXPA 4HPUE 4OTGA 3WIKA 1KE7A 2XK6A 3LCTA 3LFNA 4R3RA 4ONAA 4L46A 2XJ2A 2Z7QA 3EHAA 4NM3A 4CT2A 2PUUA 4DF3A 4FTLA 4FIGA 4AW5A 1Q97A 3WARA 3ATSA 4JL9A 3Q96A 1IASA 2W1IA 2X6EA 4AGWA 2WB8A 3KN5A 2GNFA 4FF8A 4G6NA 2JBPA 4K18A 1A06A 1DS5A 4YGAA 5C8NA 1X8BA 3B2TA 1OIUA 3F3TA 3NW6A 4RIWA 4WUNA 2X8IA 5AR7A 3SV0A 1XJDA 2X7GA 5M44A 4CYJA 5KMJA 2XVDA 1YHVA 4AW0A 4OT6A 3C4WA 2WTKC 4C4JA 3FI8A 4GK4A 5FGKA 1WBTA 5ANEA 4OLIA 5AUUA 1CKPA 3COIA 1ZAOA 5FXSA 5IF1A 2BAKA 3MDYA 2RG6A 3ZUUA 2WMSA 4QMZA 4EOSA 5BPYA 3FC1X 4I23A 2RGPA 3OS3A 3IDPA 1FPUA 3KC3A 3OD6X 3S4QA 4AACA 4BI0A 4AZEA 1YXTA 3BE9A 4QTDA 5LJJA 2WMUA 4TW9A 3DLSA 4NM0A 3ATTA 4O0SA 3ZHPC 5BVOA 3GQIA 3ZO3A 2ITQA 3PWDA 3UOHA 4XEYA 4Z7GA 5LQFA 5CSPA 3JXWA 4XUFA 5CF5A 3MYGA 4L7SA 4ZS0A 4ANOA 4OR5A 3VBVA 4XV2A 3MESA 2XK7A 2R0UA 3OOMA 3NNWA 3LCOA 2J0JA 5FDXA 3A7JA 3LMGA 3RZFA 2WTIA 2XK8A 4I5CA 4JQEA 4CFWA 2B53A 2GS6A 3ZSGA 3GU8A 4F08A 3IQ7A 2UZNA 5HLWA 3EQPA 3QL8A 3R8VA 3FBVA 1YOJA 2VWVA 2C69A 4IFGA 4RFMA 1MRYA 3DQWA 5DG5A 3PIZA 4D2SA 5BMSA 4ZMEA 2WD1A 1H25A 3DKCA 3ZC5A 2UVXA 2YJSA 4FSZA 2CDZA 4W9XA 4YBJA 2XJ0A 1SMHA 4U3YA 4LUDA 5AWMA 5HE3A 4YZDA 2FSLX 4C7TA 5JGBA 2QLQA 1F5QA 3CQWA 4RX7A 2WAJA 1DM2A 4I5HA 1K3AA 3R28A 4QYYA 4IJ9A 4O7SA 1CKJA 2C5NA 1H28A 4IAAA 2WOUA 5IQIA 3NAYA 4YO4A 5IEXA 4EH9A 3I81A 3VBQA 2ETMA 3HA8A 1VYZA 2VTAA 5AA8A 3UO5A 1QCFA 3R9DA 3V8SA 3FYJX 1CDKA 5AP7A 1IAJA 2VTTA 4I5PA 2CNQA 4A9YA 2OSCA 4CMUA 2X39A 4O27B 1OUYA 2SRCA 2RL5A 3TDVA 1P2AA 5HTBA 4YZ9A 2F7ZE 4EOLA 3LXLA 4EH2A 1BL6A 4FI1A 4Z7HA 3R8ZA 4RJ6A 5FEDA 3FI4A 2GTNA 4RVLA 5IEYA 1RDQE 3EQFA 4FTTA 2UVZA 5E1EA 3A4PA 3A8WA 5E8VA 5L2IA 3FMKA 3F2AA 2C3LA 4DH5A 5CNNA 2O64A 2PZYA 5D41A 4F0FA 3Q9XA 4W8DA 4K8AA 4IAKA 5CALA 2GNJA 1TQMA 3DZQA 4OTFA 3BRBA 4XLIA 4B8MA 2WMQA 3NVMB 4XRLA 1Z5MA 1R0PA 4BVUA 5HZNA 4YC6A 3R63A 3N4UA 2YZAA 4WBOA 4U6RA 3S0OA 5AAFA 3OWPA 4IWDA 5L2TA 4O22A 3GC7A 3GCUA 4CQGA 5H3QA 2OFUA 5DGZA 4BTJA 5EHOA 2UW7A 1JKLA 2VD5A 3OEFX 4D9UA 3TEIA 3MB7A 3JR1A 2NPQA 4NIFA 5EM7A 3LQ3A 3G5DA 4ZS4A 3KRRA 2W0JA 2WELA 4H3PA 2XK9A 4YHFA 3ZFXA 3D2IA 5M57A 1ERKA 5DEWA 3SG8A 3GFEA 5E9EA 3I79A 5K3YA 4JXFA 4DFZE 4IMYA 4MBJA 2X8EA 3P23A 2RG5A 3GCQA 3KXXA 5DRBA 2WMAA 1KE6A 3ZDUA 4CFFA 3OT3A 4EOOA 5JGDA 4EK5A 3D4QA 4C36A 4K0YA 4M69A 4XP0A 4AOTA 5AP6A 3R2BA 4WT6A 4USDA 2VX3A 3FEGA 2X1NA 3E64A 2J0MB 3PXQA 5EYCA 4D4SA 3QC4A 4EOQA 1VEBA 5D1JA 4U44A 4I20A 3U6HA 2J5FA 3LPBA 4BCNA 4QP6A 1R0EA 1R78A 5AM7A 3RPOA 3O96A 2UW4A 2B7AA 4TNDA 5KE0A 2OJIA 3MH0A 5DA3A 1OL2A 5LMBA 4FEXA 3NWWA 3R1YA 3DLZA 4FG9A 4U41A 4ALVA 3HUCA 2WXVA 3ZSHA 1XBBA 3PWYA 2CGVA 1J7UA 2H96A 2QOBA 1PF8A 3DJ6A 4O83A 4DLJA 3E63A 4FTQA 4JBQA 2I1MA 5CSXA 5HCXA 1OECA 3VS0A 5DMZA 3TNHA 3TDWA 3AD6A 3LFEA 4WSYA 4KS8A 2CKEA 4YJRA 3F5XA 3A61A 3PPZA 3Q4ZA 4FV5A 3WZJA 4E3CA 2XCHA 4K77A 4C0TA 2KULA 2JKMA 2Z2WA 5HO7A 1GIHA 3BV2A 2ETKA 5LCKA 1XBAA 3U9NA 4I6HA 5M55A 5FWKK 4FKTA 2X81A 3NX8A 1OI9A 4O96A 5KO1A 2IZTA 2XBAA 4FSMA 4TZRA 1BKXA 4PTEA 4PX6A 5FDPA 2X7FA 5HE0A 3VBXA 3VUHA 1UKIA 3FMJA 4BF2A 4BICA 4BDFA 2PTKA 3LIJA 4W4XA 3UMXA 3U6IA 3R00A 2R3GA 2CHLA 1GZOA 3F7WA 3LXNA 4BWKA 4FVQA 4Q5EA 4DA5A 2CCHA 4GEOA 5EFQA 1ZYCA 4RG0A 5C27A 5LVNA 5LVPA 4HZSA 2XNNA 3GU6A 3GNIB 1GIIA 3HA6A 2FH9A 3HYHA 3U54A 4MNFA 1H8FA 4NFNA 4E5WA 4FT7A 3CY3A 3F9NA 2PMLX 2IPXA 3IW4A 5HG9A 4KBCA 4L7FA 4RC4A 3FHRA 4EJNA 2V7AA 4Y73A 5TKDA 1PXMA 4CFXA 1QPJA 3RM7A 2OWBA 2QVSE 3VJOA 5C8KA 3KULB 1CTPE 3QKMA 4FEWA 1OL1A 4TNBA 3BGZA 3BI6A 1AGWA 2HOGA 3Q9YA 4IAZA 2P2HA 4YLJA 4CNHA 2PVYA 2XP2A 2BR1A 3D14A 3VUDA 4ZZMA 4DFBA 2OJFE 4FSRA 2PVLA 4UBAA 3WF9A 2PZPA 3DBQA 4IQ6A 4LV5A 3ZTXA 3FLNC 3PIYA 2P2IA 4L67A 4FNYA 3D9VA 3MH3A 4QPSA 4YJUA 2F9GA 4EOIA 2X7OA 5FBOA 2OGVA 3OWLA 5C8MA 3U55A 5IA0A 3TNPC 4NJDA 5L2SA 1B39A 1RE8A 5H9BA 2GCDA 4L3JA 5I3OA 4D2WA 4ZJVA 3FXWA 3R73A 4KBKA 4QP1A 4X7QA 3V5TA 2QOFA 3ZLXA 2WQMA 3OCTA 4AZVA 3FSKA 4GCJA 4FV7A 3DB8A 5DR6A 3C0HA 4DBNA 2PVMA 5HIDA 3DGKA 3Q3BA 2IG7A 2C3KA 3I1AA 3ZSIA 3MPAA 2VN9A 2R0IA 3P7AA 2OZAA 1CSNA 2YDJA 3BYOA 3QAME 5EM5A 5AP0A 4AF3A 1LEZA 3P4KA 3LXPA 4P90A 3F69A 2VX1A 2CGUA 1U54A 3BGPA 4FKGA 4TYHA 4NKAA 1UVRA 4XNEA 4CLIA 4IM2A 1Z9XA 4DH7A 4CGAA 3FL5A 5EKOA 2J0KA 3CTQA 2ZVAA 2W17A 3DB6A 3VS2A 4V04A 3IS5A 4AUAA 4DGOA 4Q5HA 4C2WA 2PUPA 5HO8A 4D0XA 4MAOA 3W2RA 4HOKA 2JFLA 2R2PA 4FV8A 3VUIA 4RLKA 1KE5A 3RP9A 1ZY4A 5J9YA 2XIYA 1M14A 3ORMA 3BBTB 4FA2A 3DKGA 4QYEA 3EQCA 5EM8A 3VW8A 3BLHA 2VU3A 3GEQA 5AP3A 3LFQA 5DT3A 4ZSGA 3SVVA 3PLSA 3R01A 4E73A 3R1QA 4OTWA 4PPCA 2F7EE 2VWZA 3VWAA 3F7ZA 2JDOA 2QG5A 3FZOA 3GU4A 4C3PA 4ZSJA 3VVHA 1OKWA 2VTMA 4JDIA 3PZHA 4JAIA 4P5QA 3DJ5A 2O65A 3UE4A 5JFXA 2YA9A 4PRJA 3QA0A 4FTOA 4L68A 4P4CA 4QMWA 2ZMDA 4D0WA 2YJRA 4MBLA 3UJGA 2RKUA 3D5WA 3DBEA 2Y6OA 5BYYA 4U7ZA 4YO6A 1FBNA 2W1DA 5J95A 5AAEA 4JS8A 3NSZA 4BZDA 2WQEA 4I24A 1SNXA 4O0XA 3KN6A 3QTUA 2Q0BA 4M84A 4UZDA 5ANKA 2HENA 5CLPA 3FPQA 3V3VA 3NUYA 2FYSA 3SRVB 4M14A 5HLPA 4JQ7A 1Y91A 3HKOA 4IFCA 4ZXTA 3W18A 2RF9A 3P79A 5C1QB 2EWAA 1ZYSA 2IJMA 4J97A 5EG3A 3ZONA 4AS0A 1L8TA 3UO4A 3FHIA 5J9ZA 4ZY5A 2I6LA 2XS0A 4D28A 3OW4A 5HE1A 1YDTE 4ZK5A 3BU6A 5HVJA 3JYAA 4ALUA 4TTHB 3EB0A 4LGGA 4UY9A 4UN0C 5I3RA 5JGAA 3R02A 4O21A 4LOQA 5CEQA 4EOMA 3UG1A 2A2AA 4YNEA 2WOTA 3UOLA 2UZTA 4IWOA 5LCJA 4YLLA 4E1ZA 2WTVA 2GHLA 2EB2A 4C02A 2XKFA 4F1OA 4DTAA 2WIHA 2C47A 3D7TA 4W4VA 3FI2A 4WO5A 1DI9A 2OH0E 5JMSA 1UU3A 2E9VA 4NTTA 3IW7A 5M4FA 4N70A 1U59A 2AC5A 3NEWA 4AU8A 4EONA 4GYIA 4CEGA 4UXLA 5DYJA 4BDBA 2W99B 4O1PA 4PTCA 5BVWA 4ZTLA 3Q2JA 3UYTA 4D55A 2PVNA 4C4IA 5L2QA 4W4YA 3NUXA 2JDSA 4G16A 3UOJA 5E8SA 1JVPP 3FMMA 3MGYA 3SOCA 3K5UA 4OTDA 3GFWA 4Q2AA 4O82A 5LMAA 1FQ1B 4A4LA 2ITYA 1BMKA 2WHBA 3O17A 3CXWA 2R3HA 4LGHA 4KUJA 3FXXA 2FSTX 3E7VA 3W10A 3P0MA 4QMUA 4FEUA 2F7XE 4AP7A 3W2CA 4F09A 1BI8A 2HYYA 1L3RE 4E6AA 5EHLA 2VUWA 1XBCA 4BKYA 4BGQA 2Y6MA 3UP7A 5L2WA 3LW0A 3TV4A 3PYYA 3VIDA 5JT2A 4F0GA 2NP8A 4ACCA 2XA4A 1KOAA 1HCLA 4MD7E 4YZCA 4A9RA 1YRPA 4PQNA 3ENMA 2CNVA 4C34A 3S95A 1IG1A 4S32A 4I4EA 4CTBA 4KKHA 2Q83A 5CU0A 1O6YA 4L01A 5BX0A 4UX9A 2WQBA 4ANBA 4PWNA 4IAFA 4GT3A 2FSMX 4YC8A 3QTWA 2VNWA 4FVRA 3R7OA 4BYIA 1H1RA 2JIVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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