4FNXA

Crystal structure of the apo r1275q anaplastic lymphoma kinase catalytic domain
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
312
structure length
292
Chain Sequence
NPNYSFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLEVYEGQVSPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMAQDIYCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYGPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The R1275Q Neuroblastoma Mutant and Certain ATP-competitive Inhibitors Stabilize Alternative Activation Loop Conformations of Anaplastic Lymphoma Kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords ALK tyrosine kinase receptor
total genus 95
structure length 292
sequence length 312
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fnxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fnxA01
3FMEA 3QA0A 1QL6A 5HE2A 2G1TA 3OWPA 1PMVA 4O27B 4JDIA 3VW6A 4G2FA 4FTNA 4Q9ZA 3ATTA 3G51A 2IN6A 4O96A 2HY81 4BY9E 4QMYA 5F4NA 5HLWA 3ORTA 5HI2A 4A9YA 2YCSA 4F0FA 2F49A 1PXNA 3KULB 4QQ5A 3RAKA 5BVKA 2PE1A 3F3WA 4OBPA 2YM6A 3SRVB 3N9XA 4XG2A 4MF1A 2HOGA 4GK4A 4JIKA 2ZOQA 3ZRMA 4J96A 2YFXA 5AP4A 4D9TA 5M4FA 3TM0A 4WNMA 3HAVA 5F95A 5HO6A 3SA0A 1H01A 1B39A 1TQIA 1F0QA 1Y8GA 2OJ9A 4MNEA 5IU2A 1W82A 4E6DA 5JRQA 2W1CA 5HNGA 3VHKA 4XV3A 4KBAA 5CI6A 1WBOA 1YDSE 2IVSA 1K2PA 2QOOA 3PG3A 4F08A 1PXLA 3U8WA 3FE3A 3C0IA 3F2NA 4CCUA 3VC4A 4M68A 2X9FA 4XOZA 2YEXA 3CC6A 4MHAA 3SHEA 3OF0A 3OC1A 2PE2A 3SXSA 3RJCA 5JT2A 5L6OA 2EB2A 3F3UA 3MWUA 4CTBA 4IAKA 4F6SA 4EK6A 1OUYA 3WYYA 3ULIA 3PSCA 4FF8A 3PJCA 4FZ7A 4ANLA 4EOSA 4FT5A 1GY3A 3ORMA 5F1ZA 3RHKA 3RVGA 2W17A 5HORA 3MVLA 3WZDA 5K3YA 2NRYA 4IWDA 3NRMA 2C0OA 5IQAA 3HDMA 4FYOA 3ZO3A 4QMZA 2IJMA 3DNDA 5HX8A 2GTMA 4ENXA 3HAMA 1H00A 4FUXA 3GGFA 5HCXA 3OEZA 5EKOA 4Z16A 4X2GA 3DBFA 2P0CA 2RFSA 4KAOA 4FKQA 1SVEA 4A4OA 5DH3A 4NTTA 5AR8A 4X2FA 4X2JA 1JSUA 3DJ6A 3KFAA 3L9MA 2O2UA 2XKFA 5FWKK 3TKUA 1ZYLA 2J6MA 2W4KA 3ET7A 3FQHA 4YHTA 3VULA 3UQCA 2C1BA 1AQ1A 4ZXTA 4IZ7A 5HIDA 3R7VA 3POOA 5ANGA 4R3RA 2PZIA 3Q9YA 4QYHA 4DBXA 2XEZA 2X81A 5LMKA 5J1WA 4I6QA 4JQ7A 4JNWA 3P7CA 2CNQA 4RMZA 4KABA 4A9UA 4HVSA 4I6FA 2QG5A 1J91A 2VWWA 4M15A 1YHWA 4BC6A 5AP3A 3TG1A 4C59A 5H8GA 3F69A 2VTIA 5AP7A 4XG3A 3ZLWA 1TKIA 3EYHA 3QCSA 2WMTA 2EB3A 3BQRA 3FKOA 2W96B 5J5TA 1M2RA 5IQHA 1Z57A 4BKYA 3EQIA 3I60A 3ORLA 4YZ9A 4EUTA 4Z55A 4JQEA 2IO6A 4XP0A 3AC4A 3DB6A 3QQHA 5EK7A 4PDPA 1PXOA 3ZLYA 3ZM4A 2ONLC 4C33A 4D2SA 3IPHA 1XBCA 4I94A 4V0GB 3ZCLA 1YOJA 3R1YA 4L00A 4E93A 3RK7A 3U6JA 3OWJA 3ZHPC 4O7VA 1UU8A 4E1ZA 1LEWA 3TZ9A 5AA9A 3IW7A 4J8MA 3AMYA 4X2KA 2JIVA 3TNIA 5CU3A 4E5WA 4KRDA 4O6EA 2W5BA 4BGQA 1J7UA 2B4SB 3AC1A 4A4LA 4CQGA 5BMSA 4TNBA 2X8EA 1P4FA 4BDDA 3IDBA 1Q97A 3NZ0A 1FQ1B 4C34A 4F1TA 2KULA 4MBIA 4QP7A 3UJGA 4FA2A 5CEOA 4RX5A 2EXCX 4EOKA 1U54B 3CQEA 4YJTA 4ZSJA 2PVMA 2XBJA 3WZJA 3ZXZA 2ZB0A 2CLXA 1KE8A 4I22A 5A46A 2ITPA 5AUWA 2GQRA 4EH5A 3LFNA 3TN8A 4QTBA 4GV1A 2CGXA 4AW5A 3I7BA 2J50A 5IQIA 5HG7A 4BKZA 2YZLA 5KO1A 1QPEA 3MFRA 5EFQA 4FI1A 3ZM9A 2I6LA 3QLFA 5FEDA 4TRLA 5EHYA 2X8IA 4KIQA 3TEIA 2QHMA 3JPVA 5CSXA 3FXZA 4C4IA 3QCQA 4IJPA 3LMIA 5DRBA 3MBLA 3PXFA 3EQDA 4MBLA 4BVUA 4G34A 4U80A 4G6LA 3AT2A 3SW4A 3NIZA 1V0PA 2VX1A 3K3JA 1IG1A 3T3VA 4ACHA 5CLPA 3FMKA 3G0EA 2QD9A 4AZVA 4I6BA 3ZLXA 4O7LA 2I0HA 3FI3A 4TYEA 3ATSA 1PKGA 1XWSA 4O38A 4O1OA 2PVRA 3ITZA 1X8BA 4D2WA 5A4TA 2E2BA 3LXKA 4J97A 2OG8A 3NUPA 2PL0A 1XH8A 2J90A 2R3IA 3AMBA 3WBLA 4D1SA 4GUEA 4CKJA 3R83A 3FV8A 1GIHA 2ZVAA 4FC0A 4NT4A 2BHHA 4EHVA 3S1HA 2VTPA 4H1JA 3BYOA 4RQKA 4AAAA 3R8ZA 1H1SA 2BALA 5DIAA 1J1BA 3QRTA 3CLYA 4O0VA 4J7BA 2WTIA 3EQHA 4DGGA 3I1AA 4GG7A 3R71A 2GNGA 3KRLA 4I0RA 1M52A 4FSQA 4AN2A 4BI0A 5BX0A 5BYZA 4BYIA 3CKWA 3Q60A 4ITIA 3ZBXA 1HOWA 4CZTA 4X2NA 1WFCA 4DCEA 3CSVA 5CT7A 4LUEA 4CTCA 4FK6A 3ORXA 2WU7A 4FNYA 1H4LA 1UA2A 5BVEA 3R9NA 4F7JA 2ACXA 2IZRA 4IAIA 3I5ZA 2ITYA 5CF6A 3FZOA 4AW2A 4JL9A 3DAJA 3JY9A 1KE6A 5AUXA 4F7LA 3C50A 3KN5A 1W84A 2CN8A 1REKA 2XCKA 4IDVA 3CS9A 4JBQA 4MAOA 3PJ2A 4DE4A 4RIWB 5FXQA 3OCBA 3DBCA 3QCXA 3A7HA 5CX9A 1VEBA 3ZO2A 1J7IA 1ZY4A 1YWRA 3G9NA 4RJ3A 3CJGA 3FLZA 4BIBA 3DZOA 3LMGA 3MW1A 3PY3A 3UG2A 2Q0NA 3PSBA 4D5KA 5E4HA 5EM6A 2GNIA 5F20A 4WG4A 4AS0A 4FODA 3V5QA 2J5EA 3O8UA 4S30A 4GFGA 2ETRA 4IACA 4M13A 3ZFYA 4AX8A 2XIXA 3IONA 3LCOA 4GIIA 4DFXE 4XH6A 4C4EA 3ODZX 4GSBA 4L46A 2PVJA 3KXNA 2WELA 2XB7A 2ZAZA 3Q9XA 1O6YA 2BRGA 3P9JA 4Y72A 3PZHA 4B0GA 4AXAA 3UTOA 2JKKA 5C03A 3NGAA 3UZTA 1U46A 3UOHA 3UODA 4G5JA 5ITAA 3PY1A 2XF0A 2YISA 2UVYA 2R7BA 3WIKA 1WBSA 4OAUC 2NRUA 4BZOA 5KCVA 4YTIA 3UVQA 5ANJA 3NYXA 4EOJA 2R3GA 3MTLA 5HD4A 2WTJA 2OSCA 4HGEA 3A8XA 2RG6A 5FG8A 5CF4A 1R78A 2WPAA 4H3PA 1RJBA 2UZTA 4PMSA 3DY7A 5I9WA 3E92A 5BVNA 2GNHA 3BLHA 5IMXA 4D1XA 3PUPA 2I7QA 2BDFA 4RIOA 5GIOE 2F2CB 2ZV7A 4LOOA 2YWVA 5GZAA 2XNPA 1MRYA 3DV3A 3PE1A 1Z9XA 3SDJA 2OO8X 4H1MA 1URCA 2I40A 4TYHA 4ZSLA 2RFNA 4IW0A 5EYCA 3A99A 4IE9A 4R3CA 1R0PA 4HYIA 1B6CB 1XH7A 2E9VA 3F6XA 3E3BX 3H9RA 3BHYA 3CP9A 4ONAA 1O9UA 4IEBA 4PTEA 4BCGA 5M51A 2GQSA 4BWXA 1WCCA 3LFEA 5KHXA 3UNKA 2B9JA 2V55A 3LPBA 4U40A 2C6LA 4F6UA 1OL1A 4DG0E 2GS2A 4UMQA 4IVAA 4DN5A 2WHBA 4I5CA 4BICA 2YIYA 4XYFA 2PZRA 3JUHA 3WZKA 4A4XA 3DJ5A 2C6OA 2PZYA 3GT8A 4RJ5A 3NPCA 1H0VA 3MVHA 3NR9A 2A4LA 3UE4A 5M07A 4XOYA 2C69A 3F88A 3EFLA 2CNVA 2ITOA 5L6WL 3LLAA 5DVRA 4QP4A 3DKOA 4FSMA 4IMYA 2GNJA 3D5VA 2E9NA 5IA5A 2WMVA 5IA1A 4NL0A 4JQ8A 5I9UA 1DS5A 4FNZA 4ZZOA 4F9YA 2P4IA 5AMNA 4KNBA 4QMSA 4YSMA 4PL4A 4BKJA 4J1RA 4RQVA 2VX0A 4HCVA 4LRJA 5KHWA 4CFUA 4DITA 4EYMA 5BQ0A 2UW6A 3FMHA 1AGWA 4OBQA 4NM5A 4MXCA 1WBVA 2CLQA 2UW3A 4QPAA 3WIGA 2REIA 2IVTA 2R3QA 2WZJA 3OCGA 4IWPA 2GSFA 2R2PA 2XJ0A 4H3BA 5AUYA 1FINA 4ACCA 3WF6A 3LJ1A 4JJRA 3GOPA 4QTAA 3V8SA 5KBRA 2YIRA 3EIDA 4A9RA 1JLUE 3HGKA 3GU8A 5HKMA 4AT4A 2VV9A 3MYGA 4O91A 3ODYX 2HW7A 4X6QC 3HP5A 4EUUA 3S00A 2UZVA 2PVLA 4NYEA 3LW0A 2XNMA 3GB2A 4AACA 1JWHA 5ACBC 3D7TA 4XRJA 4TL0A 3AD6A 5DT3A 1PYXA 5D11A 5IDNA 3HEGA 3KREA 4XP3A 1Y57A 4M8TA 2X39A 4YJOA 2JIIA 3VO3A 3ZEPA 1M14A 3MVMA 4NEUA 5M55A 3LKMA 2CGVA 5J9LA 1OUKA 2IWIA 4MF0A 2IW8A 3TL8A 5K0XA 3S3IA 2R3RA 3EHAA 4FGRA 1PYEA 2QVSE 2ESMA 3CKXA 3U55A 4DFLA 3Q04A 1GZNA 1IASA 4YU2A 2F7ZE 3P79A 2VGOA 3Q2MA 1DAWA 5E92A 1PHKA 3OUNB 4DT9A 4IXPA 4KB8A 3ZRKA 3ZFXA 4F6WA 4XG9A 1BMKA 2JDSA 2VTJA 5IA3A 4D1ZA 5DHJA 3LCSA 4BCNA 4PUZA 5H2UA 4E73A 5A4CA 5I3RA 2W4JA 4IFCA 5HTIA 3W18A 1W7HA 4F63A 1OVEA 4OW8A 5CY3A 3VBVA 3OXZA 5K4JA 4YHJA 4KSQA 4YZBA 3ENMA 4TNDA 3RAIA 3B2WA 2UV2A 4HVIA 1H1WA 4Y83A 3HV3A 3MH0A 5T68A 1OIYA 3V5PA 2X4ZA 4HW7A 3E87A 3TUBA 2VGPA 4DEAA 5HIBA 4G31A 4UZDA 4ZY6A 5BMMA 4LGGA 2JIUA 4FICA 3KQ7A 4NIFA 4HNIA 3QHWA 3SG8A 4RG0A 4HJOA 2O0UA 2W06A 3VRYA 3BBWA 3DFCB 2V22A 2BZHB 5CNOA 3QQGA 4NWMA 4W8DA 3G15A 2FA2A 4GKHA 4RZVA 1LR4A 3R8VA 3AGLA 2EWAA 5LVNA 4CFNA 1XBBA 3PDTA 3E7OA 3FDNA 4OTQA 4NZWB 4EJNA 4EWHA 2DYLA 2YCFA 3VBQA 4XUFA 3R30A 5CU4A 3FBVA 3BYSA 4K6ZA 4PP9A 1Q62A 4WRSA 3ZUVA 5E90A 3ORZA 2XIYA 4NJ3A 3UYTA 5J79A 4FIJA 2YIQA 3COHA 2IVUA 3MY0A 4BGHA 4ZAUA 3M2WA 2HWPA 3NVKI 4FL2A 4I93A 4XS2A 1G8SA 3TIYA 2OI4X 4UMUA 5A4EA 5TT7A 4FK3A 5M57A 5KZIA 4JLCA 1H25A 3U51A 3R21A 2Y4IC 3ORIA 3BYUA 4FV9A 4ACGA 4P7EA 3VS7A 3NUSA 4FTRA 4K2RA 2WEVA 4OT5A 5H3QA 1OBDA 5DT4A 1FMOE 3DBDA 2VWZA 3GU7A 4TWCA 3RPRA 3KU2A 4PNIA 2HXQA 1OIRA 2NP8A 2UW0A 3EN9A 3JVSA 2BRBA 4IQ6A 4LRKA 3ROYA 3UMWA 2OFVA 5JK3A 5HESA 4N4SA 3DA6A 4MTAA 3D14A 3KEXA 4FKPA 4O21A 4E26A 4G1WA 3TV7A 1VR2A 5EW9A 3V6SA 3KRWA 3UIMA 5DR9A 2GTNA 3A61A 2WOTA 1REJA 4LGDA 4JBVA 3DZQA 2UZEA 1ZMVA 3B8RA 3G0FA 4ZK5A 4CYJA 4DH1A 3QQUA 1XH4A 4FKLA 3WF8A 2CHLA 3KK8A 4AW1A 5IQDA 4GW8A 3BHVA 4AFEA 2OZOA 3CTQA 3VJOA 3WE8A 4RVMA 4UXQA 4M3QA 3PP0A 4WRGA 5DA3A 4TTHB 4FTKA 4D28A 1YHSA 2ZV9A 2W5AA 5EQYA 1W0XC 3MY5A 2BKKA 4PRJA 5KMNA 3UZPA 1MQBA 3R7UA 2HYYA 5HBEA 4FV5A 3ULZA 2JBOA 4R7BA 2UZOA 2FB8A 3BYMA 4N0SA 5EG3A 2XEYA 2Z7SA 5E8XA 3PVWA 1PXMA 4RC4A 4QMVA 3WILA 4C62A 4EONA 3HVCA 4JX7A 2JAMA 4FBXA 2Z7LA 4AU8A 4KIPA 2CPKE 5L8JA 4DEBA 3SXFA 2C3JA 5HVYA 4O7RA 3E64A 3ALOA 5AUZA 3RP9A 3OY1A 4O2ZA 2G2IA 3FUPA 3I0QA 1CTPE 5IA4A 4PDSA 4XV9A 4JDJA 4QO9A 1PW2A 3WF7A 5BYLA 5JGBA 2BKZA 3KVWA 3P78A 3P0MA 4PDOA 1H07A 2XRUA 3QZIA 4HPUE 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FME A;  3QA0 A;  1QL6 A;  5HE2 A;  2G1T A;  3OWP A;  1PMV A;  4O27 B;  4JDI A;  3VW6 A;  4G2F A;  4FTN A;  4Q9Z A;  3ATT A;  3G51 A;  2IN6 A;  4O96 A;  2HY8 1;  4AXE A;  4BY9 E;  4QMY A;  5F4N A;  5HLW A;  3ORT A;  5HI2 A;  4A9Y A;  2YCS A;  4F0F A;  2F49 A;  1PXN A;  3KUL B;  4QQ5 A;  3RAK A;  5BVK A;  2PE1 A;  3F3W A;  4OBP A;  2YM6 A;  3SRV B;  3N9X A;  4XG2 A;  4MF1 A;  2HOG A;  4GK4 A;  4JIK A;  2ZOQ A;  3ZRM A;  4J96 A;  2YFX A;  5AP4 A;  4D9T A;  5M4F A;  3TM0 A;  4WNM A;  3HAV A;  5F95 A;  5HO6 A;  3SA0 A;  1H01 A;  1B39 A;  1TQI A;  1F0Q A;  1Y8G A;  2OJ9 A;  4MNE A;  5IU2 A;  2XAM A;  1W82 A;  4E6D A;  5JRQ A;  2W1C A;  5HNG A;  3VHK A;  4XV3 A;  4KBA A;  5CI6 A;  1WBO A;  1YDS E;  2IVS A;  1K2P A;  2QOO A;  3PG3 A;  4F08 A;  1PXL A;  3U8W A;  3FE3 A;  3C0I A;  3UDT A;  3F2N A;  4CCU A;  3VC4 A;  4M68 A;  2X9F A;  4XOZ A;  2YEX A;  3CC6 A;  4MHA A;  3SHE A;  3OF0 A;  3OC1 A;  2PE2 A;  3SXS A;  3RJC A;  5JT2 A;  5L6O A;  2EB2 A;  3F3U A;  3MWU A;  4CTB A;  4IAK A;  4F6S A;  4EK6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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