4FR4A

Crystal structure of human serine/threonine-protein kinase 32a (yank1)
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
360
structure length
350
Chain Sequence
ENEDVNFDHFEILRAIGKGSFGKVCIVQKNDTKKMYAMKYMNKQKCVERNEVRNVFKELQIMQGLEHPFLVNLWYSFQDEEDMFMVVDLLLGGDLRYHLQQNVHFKEETVKLFICELVMALDYLQNQRIIHRDMKPDNILLDEHGHVHITDFNIAAMLPRETQITTMAGTKPYMAPEMFSSRKGAGYSFAVDWWSLGVTAYELLRGRRPYHIRSSTSSKEIVHTFETTVVTYPSAWSQEMVSLLKKLLEPNPDQRFSQLSDVQNFPYMNDINWDAVFQKRLIPGFIPNKGRLNCDPTFELEEMILESKPKEKDMRKCDSSQTCLLQEHLDSVQKEFIIFNREKVNRDFNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human serine/threonine-protein kinase 32A (YANK1)
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase 32A
total genus 107
structure length 350
sequence length 360
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fr4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fr4A01
5AEPA 1X8BA 3FSFA 4LI5A 4BTFA 5EYKA 5ETIA 3ZOSA 4TWOA 1JKSA 3DGKA 3OD6X 4FSUA 5DVRA 5IZFA 2VWBA 3QKKA 5DN3A 3NUNA 1OIQA 3W18A 4CEGA 5GZAA 4ANQA 3I5NA 3DOGA 3NUPA 4D9UA 2VZ6A 3TV7A 5C27A 2BAQA 4O21A 4FOBA 3BKBA 2GHLA 5D1JA 5I5ZA 3U51A 2WFYA 5GIPE 4GT3A 4KRDA 3SXSA 4RJ6A 3ORZA 5E91A 3UOKA 4DT9A 5EW3A 4ZTLA 1M17A 4IBMA 3IOKA 5L2TA 5D7VA 1M14A 2C6OA 3MJ1A 4I5HA 5IA0A 4CGAA 4CG9A 2KTYA 3JXWA 4M69A 4F9BA 2CMWA 2OU7A 4O0UA 3RWQA 4UBAA 3JVRA 4FKUA 4O1PA 3W2CA 4C2VA 3RJCA 4TYEA 3WZUA 4F70A 4AZVA 1R78A 3TTIA 2WQEA 2QOOA 4YHJA 4A06A 3TV6A 5BUJA 3CJGA 4O96A 4ENXA 3BV3A 3QUPA 4H36A 3ZC5A 2O5KA 2XF0A 4RRVA 4R77A 4L68A 3QX2A 1YDRE 2C3JA 2IN6A 3OC1A 4U80A 4RIOA 3R30A 2XNBA 4QYGA 4FSWA 3QGYA 4FUYA 3GC7A 3S95A 3HL7A 3PIZA 4NIFA 3R7IA 2FSOX 4I21A 3LFNA 3LMHA 1JLUE 4J52A 4PPAA 3R1NA 3EFJA 4C4GA 5E1SA 4FR4A 5FBOA 5ITAA 4ZZOA 5M56A 4D2RA 5L2IA 4PL4A 3BYOA 2PE1A 4FX3A 4L46A 5E8YA 1REJA 3SAYA 3MVMA 5EM5A 2AUHA 2VTNA 3CCNA 1SM2A 3EQDA 3Q96A 3NW6A 4YLJA 3MA3A 5HBJA 2I0HA 3KQ7A 4MD7E 4ZOGA 3WF5A 4IW0A 4X6RA 2YISA 2YIXA 3QALE 5HZNA 4BIBA 4ALUA 5ANKA 3TCPA 3PJ3A 4KS8A 4M66A 2IW9A 2R3QA 4C61A 1H0WA 1JPAA 4AZWA 5DEYA 5K9IA 3QTQA 3F2RA 4BHNA 4W4XA 3LJ0A 5B2MA 1CDKA 3R9RA 3OXIA 5I4NA 5HU3A 2W0JA 3D94A 4O91A 3IS5A 3V01A 3UMWA 5HESA 3JR1A 3BHHA 1FGKA 2ITPA 2QOCA 5AUZA 2XIXA 4FTCA 3ZRMA 3MJ2A 4I5MA 4TYHB 3P0MA 3DZQA 3KXGA 4LOQA 4QMVA 5KZIA 1FINA 1H00A 4Z7HA 2FSMX 4NM5A 2FSLX 4YJPA 3ZO3A 3Q9WA 4ANBA 1MRVA 3V5WA 3VN9A 3BV2A 2JGZA 3PSBA 3OFMA 5DR2A 2XCHA 3IGGA 2ZYBA 4GT5A 3TG1A 3DV3A 4FTQA 4IHPA 2VO6A 4I5CA 4KWPA 3WE8A 3PPZA 3OWPA 1RJBA 4QPSA 4D0XA 3VVHA 4TY1A 4Z9LA 4C35A 4FV7A 2BALA 4JLCA 3RAHA 4NM3A 4RWJA 4FKJA 4M68A 4XV3A 5A6OA 3SVVA 4Y8DA 5LVOA 4D4RA 4RIXA 2R3OA 3BYSA 4UWBA 3RINA 4XRLA 3TL8A 1YI6A 2RSVA 3I6WA 3KMWA 3M42A 3Q4TA 3BHUA 2W96B 3GENA 5M55A 3VJNA 4FEVA 4E6DA 3DDPA 4ZSEA 2HY0A 2V22A 4ZY6A 2VWVA 3LMIA 3QXOA 3BU3A 3UPXA 3D0EA 4IXPA 3DBCA 2PE0A 4RFZA 3VUHA 3DCVA 4U97A 3P86A 3GCUA 4RJ8A 4FKRA 4OTDA 3BPRA 1QPDA 3AT2A 4YLKA 4E4NA 2VO7A 3MESA 4HVGA 3CTHA 3OWKA 2VTTA 5DA3A 3A7HA 2R5TA 4OTIA 4BI2A 1OZ1A 3BE2A 4FT7A 1JVPP 2IW6A 1FBNA 4W4VA 3FV8A 2QOHA 3HV6A 2BIYA 4FIIA 4NEUA 4P7EA 3VUDA 2G1TA 1PJKA 2PMOX 3DBFA 3PXKA 1Q41A 4JJRA 5CASA 4H3QA 3S0OA 2PZYA 4J97A 3LCKA 2OK1A 4AGCA 4EQCA 3Q2JA 4MX9A 1WVXA 3BLHA 4BDDA 4QNYA 4JR3A 3N9XA 4MVFA 5CEMA 3RMFA 1ZMUA 1R39A 3IKAA 3NIZA 1PXKA 4JDJA 4R3PA 5IG1A 4C8BA 2WMRA 3U4UA 1Z57A 5CU0A 3CJFA 4D4SA 2UW0A 3F69A 2YM3A 3JY0A 3R7EA 3RKBA 1MUOA 4I1ZA 2YIQA 2OW3A 4AUAA 4EQUA 2Z7RA 1URWA 2HZNA 2XJ0A 4LMNA 5HVJA 3OTVA 3UIBA 1OPJA 4QTCA 4IDVA 4AACA 2C47A 2AC3A 1WBOA 3E3PA 4PTEA 5LVMA 2Z7QA 2VTRA 1Q61A 3O23A 5JRSA 5CALA 4RVMA 4DTBA 3PY1A 3CIKA 5C9CA 4HZSA 3QUDA 5DIAA 3Q6UA 2W7XA 3CQWA 4AOJA 4XRJA 1K2PA 2ONLA 3NS9A 5E8UA 1ZY5A 4N0SA 4MQ1A 4A9RA 4EUTA 4GKIA 5CYIA 3DFAA 1IR3A 3DTWA 3QLGA 3QXPA 2YCSA 1NVRA 3C5UA 2QG7A 2OGVA 4X3FB 1P5EA 3JS2A 4LRKA 4JX7A 1BUHA 4X2JA 4MD9E 2VAGA 3D5WA 2WMAA 4AG8A 5L3AA 3D9VA 3NMUF 4DFZE 3BU5A 2OZOA 3FMLA 3GU6A 2EB3A 1Q8UA 2J2IB 3HMMA 4AZSA 2BDFA 3PXYA 5JFVA 4MBJA 1WVYA 4FIFA 4FV8A 1L3RE 2F2CB 3R7OA 5IMXA 5DEWA 1WAKA 3ETAA 4GH2A 5A4QA 3MBLA 2PTKA 3NUAA 2JDRA 3KXNA 3C51A 3W2SA 2W05A 5HNGA 4ZTRA 5IQGA 4TYHA 3ZTXA 2B52A 4DFLA 4YHFA 4ASDA 1U5RA 1Y6AA 1YXVA 3OXZA 5CNNA 3PDTA 4R78A 3UZTA 4RFYA 5GZ8A 4LRMA 3G15A 4X7QA 4GYGA 4F9AA 2OJ9A 3AMBA 1QPEA 3UO4A 5LQFA 3AMYA 5JT2A 3CGFA 4XV2A 4AT3A 4KIQA 3UC3A 2VTAA 4KRCA 4GEOA 5F4NA 4CYIA 4FKLA 3JPVA 3PIYA 3OZ6A 2BFYA 1FOTA 4FTRA 4CXAA 4FEUA 4HPTE 5CQWA 4TWPA 2QHMA 3ZCLA 5A4LA 4QPMA 3IO7A 1ZYDA 3Q5ZA 3R9NA 3V8SA 3ACKA 3ZYAA 4BBEA 4KAOA 3Q4CA 4ACGA 4FEXA 4WRSA 4D0WA 5AP0A 3L9PA 4O0YA 3N51A 1Z9XA 1IAHA 1Y6BA 5I9YA 4MXOA 1NT2A 4M67A 5AP7A 1KOBA 4DGGA 3ZLSA 3KULB 3VS3A 2JAVA 5EH0A 5J87A 4DGNA 2J5EA 3AD5A 3SW4A 1SVGA 3MFUA 3CKXA 4D2SA 2B55A 3F3TA 4QP8A 5HO7A 3KK9A 2YAKA 2VX3A 2XNEA 2JBOA 4GG7A 4EBVA 4IWOA 4GK4A 4IANA 4OR5A 2HOGA 2WEIA 4CKRA 4M13A 5BNJA 4JOAA 3NWWA 2R3JA 5AUTA 4NM0A 4FIHA 4R5SA 3DJ6A 3FXXA 4YZ9A 4RJ5A 3V51A 4F6UA 3HUBA 1YVJA 3I7CA 1R0EA 2XIKA 3FE3A 3HMOA 4RZVA 5FEEA 4BFMA 3FMNA 1UV5A 1YXUA 2G2HA 5I3RA 3OY3A 5HTCA 1ZARA 4Z55A 4IVBA 1GZNA 4K0YA 2WHBA 3OW4A 2GFCA 4ALVA 3QCYA 4RLLA 4X2KA 2W9ZB 2PU8A 4TW9A 2XKFA 1H28A 4YC3A 3COHA 3I7BA 2XRWA 3HAVA 5L6OA 2ZM3A 5CX9A 3DAJA 4Q5EA 4ZJJA 1WMKA 3D14A 3ZRLA 4DH1A 3OWLA 1KE6A 4NKAA 1YDSE 4EOPA 5LMBA 1A48A 4AW0A 1L8TA 3FI3A 4RA4A 3RWPA 2LAVA 1B38A 2BMCA 4FKOA 3PY3A 2J5FA 5BVFA 5FXQA 2C6KA 5CENA 4GVAA 4NW5A 1JKLA 3EQPA 4GVJA 5FG8A 3DB8A 4GW8A 5ETFA 3TKUA 3BI6A 3ULZA 3AXWA 3BBTB 3T3VA 5BVOA 5BQ0A 4YHTA 2R4BA 3H4JA 5LMAA 2UW9A 3PVWA 1APME 3NIEA 3U4WA 3TXOA 3UC4A 4XMOA 4BDEA 3RP9A 4O2PA 2GS7A 3LQ8A 4MWIA 5ANOA 2BAJA 3REPA 3WE4A 1GOLA 4HVDA 2GNLA 2VO3A 2VRXA 2VD5A 4FIEA 3KXXA 3BYUA 5I3OA 3TDWA 5CT7A 4BDAA 4BCQA 4YO4A 3ODYX 2QD9A 3TM0A 1W84A 3IW8A 4IFCA 3CP9A 2XK4A 1SNUA 4XG2A 2RF9A 5LVLA 2GQRA 3FLSA 1ZAOA 2C3LA 4U45A 2ETMA 2Y4IC 4W4YA 4BCNA 3KU2A 3NAXA 3KKVA 4HYUA 1IA9A 5DRDA 3IDPA 5D7AA 3MPMA 3V5LA 2PVYA 3CY2A 4FI1A 2RG5A 4Y46A 2DS1A 2JD5A 2XB7A 4DFUA 4RT7A 1E1XA 2WQBA 4FV1A 4O0XA 4YUQA 3DT1A 3QTWA 4JBVA 3FYJX 3GCQA 2C1BA 3FAAA 1KWPA 2ZV2A 3GXLA 1MRUA 2PY3A 4KA3A 4RWIA 3VRYA 4B8LA 2R3HA 4C4JA 4FTJA 4E3CA 4O7YA 4DFBA 2QKWB 2GS2A 4XLVA 4BBFA 3FC1X 4JBQA 3FJQE 1BKXA 2EVAA 1QCFA 2IJMA 4F64A 5K4IA 2WTKC 3D7TB 4FT3A 4MBIA 4C4IA 5CF5A 1Q99A 5TR6A 5D10A 5CU3A 3QRIA 5FTOA 4O0VA 1ZLTA 5HVKA 2G15A 3COMA 4C57A 4GFOA 4H39A 4IC7A 3TWJA 2ITWA 3OP5A 2UW5A 4HVHA 4XV1A 4FTAA 1P2AA 3FLWA 4N4SA 1PMUA 5FRIA 2XKDA 4EORA 3GQLA 2SRCA 5AAEA 5M06A 1UU3A 2W06A 3MWUA 4APPA 1PYEA 1Y57A 3KULA 4J8NA 3TKIA 4HYSA 2X81A 3PE1A 2HW6A 4XCUA 3SGCA 3EJ1A 3DZOA 3QFVA 4RMZA 2YEXA 4C62A 2E9PA 2QVSE 2UV2A 2GNFA 3MH0A 2WZJA 3BU6A 3DB6A 4AN3A 2ZMCA 4U5JA 5IDPA 3D5VA 1IRKA 2C68A 2YZAA 4I22A 3E8DA 4C58A 5CVHA 1H25A 4ZS0A 4EK3A 3R71A 4D55A 4F0GA 2JFMA 2ZVAA 2EXEA 4ONAA 4XUFA 2BROA 3VC4A 5AP5A 3UQGA 3ZLXA 4XG6A 3O50A 4PV0A 3RPVA 4J71A 5HIDA 1YQJA 3SDJA 5C8KA 4YTHA 2V7AA 3A61A 1JBPE 4H58A 4KIPA 4ZSGA 5BMSA 1P4FA 1Y91A 2X8EA 4Z16A 2BKKA 1Q8YA 3QHRA 4FODA 3TJCA 3BQRA 3LQ5A 3B8RA 5FP6A 2BRMA 4G5PA 4Y83A 4YU2A 4A4OA 2YACA 1T45A 4I4EA 4EWQA 3KMUA 2W4OA 3OHTA 3ORKA 5C26A 3BHVA 3Q32A 5FGKA 3FMEA 2YITA 4YGAA 2NPQA 3C4FA 3W2OA 5IH5A 4YP8A 4NZWB 5CZHA 2B9IA 2QO9A 2BKZA 5AP4A 5JFWA 2Y8OA 4Y85A 4Y5QA 3VS6A 3P78A 4U40A 2B0QA 3PLAE 4B9DA 3ZUTA 1YHSA 1F3MC 5BX0A 1OMWA 4KIKB 5CZIA 3C0GA 2YM6A 2R3GA 3OWJA 3MY1A 5KUPA 4F63A 4EH4A 3UE4A 4QTBA 4F6SA 4M3QA 3TEIA 4E6CA 2W1FA 5G1XA 3QU0A 2R7IA 2ZM4A 1PXNA 3L8XA 4FV3A 3MH3A 5AV2A 3LCDA 3H9FA 4L9IA 4JQEA 4FSMA 5TO8A 5CXZA 3ORNA 3ZC6A 3ZO4A 2XYUA 2QU6A 4IMYA 4M69B 4BIDA 3V8WA 3R1SA 3PVGA 2C6IA 5AX3A 2YJRA 4F9YA 2O8YA 5BVWA 3VS7A 5BYLA 2WU7A 1M52A 5EFQA 1LPUA 2J50A 2UZOA 3RALA 4CZTA 5D41A 2YJSA 5DH3A 4PL5A 5FLFA 4AFJA 3HV5A 3RAWA 4GL9A 5LCKA 5L2WA 1M2QA 4FZDB 4AP7A 3FDNA 3NCGA 5J8IA 3QZIA 1KE9A 2F9GA 3D4QA 2YIYA 2QODA 3G2FA 2XNPA 3TZ9A 4QQCA 4TNBA 4GMYA 4YBJA 5CWZA 4C7TA 5HX8A 2XK3A 3HRFA 4NIFB 3CR0A 3LXNA 4IEBA 2C1AA 4NM7A 5E8XA 5C8MA 3UNZA 3VHEA 3EHAA 3MB6A 2X1NA 4DTKA 2OLCA 4Z3VA 1R3CA 3IW6A 3C4XA 3I1AA 3VW8A 3WF9A 4A9TA 3TUCA 3KREA 5FM2A 3RTPA 4AGUA 2OZAB 4R1YA 4M15A 4PL3A 5HLWA 1VYZA 2BFXA 2ZB1A 5IDNA 5KKRC 1MRYA 4DEHA 3R83A 2UZWE 3UG2A 4S33A 5JFSA 4FG7A 3D7TA 2H34A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5AEP A;  1X8B A;  3FSF A;  4LI5 A;  4BTF A;  5EYK A;  5ETI A;  3ZOS A;  4TWO A;  1JKS A;  3DGK A;  3OD6 X;  4FSU A;  5DVR A;  5IZF A;  2VWB A;  3QKK A;  5DN3 A;  3NUN A;  1OIQ A;  3W18 A;  4CEG A;  5GZA A;  4ANQ A;  3I5N A;  3DOG A;  3NUP A;  4D9U A;  2VZ6 A;  3TV7 A;  5C27 A;  2BAQ A;  4O21 A;  4FOB A;  3BKB A;  2GHL A;  5D1J A;  5I5Z A;  3U51 A;  2WFY A;  5GIP E;  4GT3 A;  4KRD A;  3SXS A;  4RJ6 A;  3ORZ A;  5E91 A;  3BL7 A;  3UOK A;  4DT9 A;  5EW3 A;  3W0R A;  4ZTL A;  1M17 A;  4IBM A;  3IOK A;  5L2T A;  5D7V A;  1M14 A;  2C6O A;  3MJ1 A;  4I5H A;  5IA0 A;  4CGA A;  4CG9 A;  2KTY A;  3JXW A;  1ST0 A;  4M69 A;  4F9B A;  2CMW A;  2OU7 A;  4O0U A;  3RWQ A;  4UBA A;  3JVR A;  3BLA A;  4FKU A;  4O1P A;  3W2C A;  4C2V A;  3RJC A;  4TYE A;  3WZU A;  4F70 A;  4AZV A;  1R78 A;  3TTI A;  2WQE A;  2QOO A;  4YHJ A;  4A06 A;  3TV6 A;  5BUJ A;  3CJG A;  4O96 A;  4ENX A;  3BV3 A;  3QUP A;  4H36 A;  3ZC5 A;  2O5K A;  2XF0 A;  4DHI B;  4RRV A;  4R77 A;  4L68 A;  3QX2 A;  1YDR E;  2C3J A;  2IN6 A;  3OC1 A; 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