4FSQA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
278
structure length
263
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 82
structure length 263
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fsqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fsqA01
4X3FC 4HOKA 5CU4A 4ZOGA 3CY3A 1Q61A 2C5YA 4O7WA 4WUNA 4CG9A 4MNEA 1PKDA 1UVRA 4IHPA 4RX8A 3HV3A 5DNRA 5E92A 4B6LA 3BBWA 4O0XA 4QMZA 3RWQA 4F70A 1NA7A 3RMFA 4FK6A 1SMHA 2R3LA 4N0SA 3ALOA 2GQGA 5CQUA 3QFVA 4F64A 4RGJA 5AP0A 2V55A 2PE0A 3EQBA 3ZUTA 4ACDA 5LMKA 4FTUA 5AIKA 2W1HA 3DS6A 4FUXA 4TNDA 3LFSA 2QOQA 3ANRA 3OT8A 4MXYA 5C27A 3WYYA 3R9OA 1XH7A 2DYLA 4IXPA 2QI8A 2W5BA 3RAWA 3LXNA 3VBVA 4AFEA 5EM5A 4JDKA 3EOCA 3DXQA 3ZH8A 4PPCA 4XS2A 3QALE 3COMA 4K9YA 1BI8A 4FEUA 5BVKA 1GZOA 1E1XA 1GZKA 3RM7A 5CEIA 2C5XA 2HWOA 2X2LA 2Y7JA 4C02A 1PMUA 4M69A 4YSJA 4CLIA 4C59A 3UJGA 3GOKA 3ZO2A 4QYEA 4U5JA 4H58A 4XLVA 5LQFA 4QMUA 3ZSGA 3VC4A 4DGMA 2PULA 3NYNA 3HZTA 5DR9A 2HK5A 3QA0A 4RWJA 3LCTA 5C9CA 4EYMA 1B6CB 2OK1A 5AA9A 3B2WA 3KCKA 3MFRA 4TYJA 3RCDA 2GFCA 4DG3E 3AMBA 3NLBA 3COKA 4BKYA 4YNEA 4EUUA 1PJKA 3CC6A 4P5ZA 5JQ8A 5C01A 2C5OA 3JXWA 2XM9A 3FQEA 4JG6A 5HX6A 5KHXA 1DAWA 3QRJA 4UEUA 3RGFA 1VR2A 2XK9A 5FBNC 5J9LA 3E3PA 1DI9A 5DEWA 2BRHA 4BCIA 1NY3A 3CE3A 4KB8A 4QP7A 1EH4A 2W1FA 3W1FA 4A4XA 4XUFA 3QUDA 4H1JA 2CGXA 2OH0E 3I6WA 4RVKA 4ZEGA 3SA0A 3QKKA 3MFTA 2ZB0A 4YTHA 3TNWA 3B2TA 4L44A 4F08A 3P08A 2W1EA 2B0QA 4BF2A 3ZZWA 1VYWA 3F5GA 2YACA 4GYIA 4E20A 3E8NA 5FUTA 4G17A 2XP2A 5HE0A 5EM6A 4WHZA 5BVEA 3BI6A 3MTLA 4PP7A 5E8SA 5KUPA 5ANJA 5HGIA 4NTTA 1G8AA 5LCKA 5ANOA 3BHVA 4FNWA 1YW2A 4N70A 4UYNA 2J0MB 3KFAA 4L43A 4P5QA 5CSHA 2QO7A 4ANSA 2R9SA 4C2WA 1I09A 4EH8A 4EQUA 4ASZA 3BWJA 4FBXA 4EORA 3DAEA 2WKMA 3QHWA 4XYFA 3TZ9A 1Q8UA 2B53A 3OCSA 3EIDA 4FT7A 4FOCA 2FO0A 4U3YA 2WQNA 3EQIA 3VQHA 3AGMA 4O38A 4LYNA 2R3GA 5HEZA 5JT2A 4ACMA 2VWZA 3UQGA 4ZTRA 2RG5A 5J95A 4FV3A 3DDQA 4KKHA 3ZC5A 4I92A 3AC4A 3GENA 3Q9YA 4QP2A 3DJ5A 5AV0A 5CAQA 4L8MA 4QPSA 3ZM4A 4DTBA 3PUPA 4OW8A 4FZFB 2VNYA 4F1TA 3UC4A 4Q9ZA 2XJ0A 4KBKA 3NW7A 5AEPA 5IUIA 1Z5MA 3IO7A 1PXKA 5EK7A 1BX6A 4RA5A 4TPTA 3UYSA 2ZM3A 4FTKA 2UW8A 3B8RA 4CYJA 2UZEA 4DEBA 4QMNA 3MA6A 3RNIA 5IH6A 4L9IA 5DI1A 2UZDA 5IA4A 1JSTA 4ANQA 3BE9A 5JZJA 2H8HA 2H96A 5K3YA 4D9TA 1PW2A 2WQBA 3EYHA 4XG3A 4WBBB 4APCA 3IG7A 3PA3A 4O0TA 5M53A 4Y72A 4HCVA 3QWKA 2E9OA 4NIFB 3FLZA 5CAVA 3PIZA 4IZ7A 4XG6A 4FZDB 2EWAA 4D2RA 3TNIA 5IQEA 5HI2A 3T9IA 3GU4A 2I40A 3MJ1A 4EI4A 4O21A 2W1GA 3FZSA 4CCBA 3HUBA 4GIHA 3FE3A 2WXVA 5AUXA 1H01A 3OUNB 3C50A 4NCTA 3G15A 1OGUA 2IW9A 1A9UA 3QZFA 4J8MA 4O7SA 3TUCA 1PMEA 3FL5A 4I22A 4OLIA 5CAOA 3ZEPA 4FIIA 2JDSA 1OIYA 2C0TA 4ZY6A 4EC8A 2ZOQA 2X2MA 3NCGA 2NRYA 4FV7A 3KULA 4FZ7A 3R00A 5TR6A 4YMJA 5L8KA 2W4JA 4GKIA 4ZAUA 1TQPA 5AR8A 3GBZA 4D4RA 5IQBA 1BUHA 3VS3A 4AOJA 3C0IA 4KNBA 5AX9A 5IQAA 4JS8A 4BKJA 4QMYA 2PZYA 2W4OA 5CANA 4IDTA 4CRSA 4EC9A 3QA8A 4PWNA 5L2IA 2Z02A 4IM0A 3AT4A 4NW5A 2ITQA 4FI1A 4DFNA 3ZDIA 3BEAA 3CQUA 2PMIA 5CNNA 3GC7A 5IU2A 2B9JA 3NYVA 2J51A 5H9BA 2JITA 5HG8A 5ETCA 1QCFA 5DGZA 4RWKA 4Y85A 3RI1A 3NGAA 4PMTA 4P90A 4TYGA 4XH6A 5HG7A 3ODZX 1PXOA 3GU5A 3DBDA 4GG7A 2R3IA 3DTWA 2BRNA 4K77A 4OTQA 3U4WA 5T68A 1V1KA 5A4LA 3EMGA 4YPSA 4IWPA 3WI6A 5JSMA 4CEGA 4ZTNA 3Q5IA 3U51A 3S1HA 3WF7A 5CEQA 5C4LA 3LLAA 4JBQA 2E9PA 4C38A 3LE6A 1LEWA 4JJRA 4L7SA 4JG8A 2CPKE 3BYVA 3E63A 5BUEA 3C51A 5JEBA 2Q0NA 3I7BA 4PTCA 2I7QA 4EBWA 1ZOHA 3H0YA 4DGOA 5M4FA 3HNGA 4MBJA 5DT4A 1DS5A 1M17A 5BPYA 2W0JA 4FVRA 3S4QA 4BDKA 3DFCB 5DH3A 4OTDA 5KNJA 1XQZA 4DEHA 3FLQA 2BFYA 2E9VA 5M44A 3F3UA 5F1ZA 1Q8YA 4E8AA 3HUCA 4IZ5A 3TNHA 3BRBA 3FYJX 5CU0A 4GVJA 3P7BA 2XK6A 4J99A 1J3HA 1XH4A 4C61A 4TNBA 2XMYA 3UO5A 4XG7A 3EFKA 3F61A 2YZLA 5LARA 4FSMA 2UW0A 5D41A 4IAKA 3W10A 1YOLA 3QWJA 4KIKA 5FQDC 2B7AA 5JH6A 2G9XA 2BRGA 4L68A 3UOKA 3SRVA 3DJ7A 4LGHA 4U80A 4YPDA 4U45A 4AFJA 3EWHA 3PRIA 3NNXA 4FTQA 2X81A 2PE1A 4WD5A 3R8PA 3UGCA 3RK7A 4CFWA 1O9UA 5E8TA 3NW5A 5EI8A 1SNXA 4YZ9A 4HGEA 3T8OA 3E92A 3SQQA 2PUIA 3ORXA 3JS2A 4CFVA 5JFWA 2WQEA 3GC0A 3RPYA 4YJPA 3OW3A 4RIYA 2WEIA 4OTFA 2WELA 2PVKA 4GJ2A 5IUHA 5HLWA 3KK9A 2JKQA 4A9SA 2GS7A 4E4NA 5DFPA 3QCQA 4ZZNA 5IQGA 4I6FA 2GTNA 2W4KA 2GHLA 3HKOA 4O6LA 1GZNA 1YQJA 3CBLA 4EZ7A 4RIOA 2OLCA 5IDPA 1Z9XA 4I93A 2ITVA 4BYJA 2HYYA 3NX8A 3FKNA 4IX3A 3ZYAA 5I4NA 5EQEA 2OSCA 3DKCA 5T3QA 4BZOA 4DCEA 3P0MA 3A7GA 3KXMA 4MHAA 3G5DA 3GQLA 3WZKA 2FA2A 3R1SA 2PVHA 4MWHA 4I4FA 2WNTA 3TKHA 5JFSA 3M42A 4LMUA 2PPQA 4CGAA 3KF4A 2VO3A 5LOHA 5AUTA 3UZPA 5E8UA 4K33A 3UIMA 1OECA 4G34A 4I20A 1WZYA 2ERZE 5EDQA 1WAKA 4BWPA 4D28A 1UU3A 1XHAA 3DU8A 4M0ZA 4RX9A 3MYGA 3R02A 2FB8A 4G3CA 2YIYA 2WTKB 4C34A 4YC3A 5CSWA 4UYAA 2OJGA 3LCDA 4IVCA 4A9YA 1OPJA 5M4UA 2FH9A 2YM8A 2C6IA 4HVDA 3ZMMA 5BNJA 1GOLA 3ID6C 3AD4A 4BRXA 1IA8A 4D2SA 4DFUA 4ENXA 3EQPA 3LFAA 4G6OA 3V5WA 4RVLA 3MA3A 4UXQA 2CLXA 4V05A 4JQEA 4X21A 2WU6A 4XJ0A 5M57A 1PXLA 3BV2A 3FZPA 3QYWA 4GRBA 3QBNA 1U5RA 3QCYA 4LOQA 4BHZA 3R7IA 4FKLA 3FV8A 5DG5A 3F5UA 2O5KA 3GU6A 3D5UA 3HMIA 1CKPA 4IADA 4X6QC 4LG4A 3FWQA 1O6LA 3ATTA 3VRZA 4ANOA 4FEWA 2UZNA 3QZGA 3R1NA 4FOBA 2IO6A 2PMLX 4I0TA 2JAVA 5AR2A 4PP9A 5LMAA 5BMMA 2HOGA 4FNZA 2PSQA 5HZNA 3ORNA 2R4BA 2WMBA 4OBQA 5CEKA 3P78A 2R3FA 4X0MA 2JDOA 4IM3A 2B54A 3ITZA 3R71A 2WEVA 3NYXA 1PYXA 5EDRA 1P5EA 3W33A 3H9FA 2X7OA 4QTBA 2YDJA 3GU7A 3R2BA 3OXIA 2W05A 4CMTA 4FIEA 4NSTA 3MIYA 4BZNA 1TQMA 3O7LD 4CRLA 5AMNA 3D7TB 4YP8A 4RLKA 4RVTA 3RK5A 4K8AA 3EN7A 3SC1A 2IVUA 2QOKA 1ZLTA 2ZB1A 3SXFA 3VIDA 1KE9A 4M97A 4FTNA 5CU3A 4I94A 4I5CA 3CEKA 4NT4A 5AP6A 1YXSA 4ZP5A 4AX8A 5H3QA 5CQWA 3FC2A 4CV8A 4DEAA 3LQ3A 5GJDA 1FVTA 4BTKA 5J8IA 4NEUA 3U9NA 4XLIA 3V6SA 2ITWA 5HE3A 5A4CA 4JQ8A 4Q5HA 2BROA 2WHBA 4C4HA 2GNIA 3WF8A 1ZY4A 2OFUA 3ZOSA 4IJ9A 3F2RA 2VWUA 5KE0A 4PMSA 4FT0A 3BWFA 4FYOA 4IFGA 5FDXA 3TV4A 5LVNA 4FGRA 1OKZA 4U40A 4GL9A 4TWCA 4IAZA 3RPSA 5HTIA 2W06A 4G5JA 4K0YA 4YJOA 4TN6A 4ZSEA 3ZSIA 4FZAB 5JFVA 4E73A 5A6OA 2BZHB 3FMEA 1PXMA 2BR1A 4LGDA 3DDPA 3RBWA 4JR3A 4I1ZA 3D5WA 3F66A 4MTAA 1GAGA 1W8CA 2GHGA 4W4XA 1OBDA 4GU6A 4PMMA 3UNJA 3NEWA 1U59A 4U7ZA 3VS4A 4QMMA 2QU6A 4A06A 5L2WA 5K4JA 4C3FA 1OL1A 5E4HA 5IA0A 4HNFA 4WKQA 1YWRA 2PTKA 3ENMA 4RPVA 3JVRA 4GT5A 5DRBA 5AP2A 2VUWA 3Q4ZA 5HIBA 3DK7A 4F6WA 2HZIA 2RG6A 4YLLA 1WCCA 4CZUA 4DBNA 3KRWA 1OL2A 5EM8A 1R1WA 3UVPA 2C6DA 5T6KA 3Q96A 3MN3A 1J1BA 1ZY5A 1ZYSA 3GI3A 4KSPA 4FR4A 4EK5A 3DOGA 4FKOA 3L9NA 3UC3A 2B1PA 4GW8A 2A19B 3QQJA 5KX8A 1XBBA 4NIFA 3WZUA 2UV2A 3TV7A 2A2AA 3QTSA 2XK3A 3ZLXA 4CSVA 5BYYA 3FQSA 2UW5A 5ACBC 2Q83A 1B39A 5DE2A 1QL6A 4MKCA 4ALUA 5BVNA 1MRYA 5EOLA 4O7LA 1X8BA 2J4ZA 4XRLA 4BN1A 3LXKA 4MD7E 3V6RA 4ANMA 5C26A 3V04A 3LKMA 3PJ2A 1GIJA 2YFXA 3BCEA 4NM0A 4BDAA 3EJ1A 2H34A 2W1DA 5D7AA 2FSTX 2WTIA 1YRPA 3NRMA 2XNBA 5B0XA 4E5WA 5BVFA 3PFQA 4AGCA 4MXCA 3UG2A 1I44A 4O22A 4EHZA 2HW7A 4V04A 4DF3A 5HIDA 1CKIA 2F7ZE 3W2SA 3ZTXA 5AAFA 4EZ5A 2O65A 3R8MA 3E8EA 1XBAA 4K6ZA 2YWPA 1OVEA 4MBLA 1SM2A 3VS2A 5HVKA 2ONLA 5KMNA 5M08A 2XKEA 5BVDA 4D55A 3OC1A 2O2UA 2Z60A 3EH9A 3ZZEA 3POOA 1CM8A 5I9WA 1OBGA 1ZMWA 3TKIA 5EHYA 3KULB 2WTKC 2OICA 5EM7A 1M2QA 2YIQA 3BGQA 5CF5A 3W32A 1ZYJA 1RW8A 3FKLA 3FMJA 2F7EE 4HCUA 3DLSA 5LMKC 3LPBA 4OTWA 2C68A 2F9GA 4DH3A 3UNKA 3LLTA 2WGJA 5CY3A 1PRYA 5GJFA 2WMQA 1HCLA 4ITHA 2R7IA 4II5A 3HRCA 1RQQA 4FKUA 4K18A 3ZS5A 2W1ZA 2WIPA 5IUGA 3ZO1A 5L4QA 5BVOA 3R28A 1SNUA 1JBPE 3CR0A 4QMOA 4D9UA 2YWVA 3UP2A 4C2VA 3BYSA 5DT3A 2G2FA 4L67A 4BKZA 4LM5A 3U54A 5IQFA 4U79A 4Z55A 3I4BA 4NM3A 2OJIA 3ZCLA 4RBLA 4U42A 4RX7A 3TIZA 2QQ7A 2VTPA 4FYNA 3K3IA 5J7HA 5LXMA 4ZK5A 4USDA 4BDGA 4RFYA 4CKIA 1PHKA 2XEZA 2XIKA 2V22A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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