4FTLA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
278
structure length
263
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 76
structure length 263
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ftlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ftlA01
3C5UA 3KF7A 3R9NA 4IM3A 4A06A 5E8TA 3C0HA 4M84A 3RHXA 2P3GX 3E8CA 4RFYA 5D12A 4M67A 3EFLA 3EQBA 3IDCA 2R7BA 2UW7A 4O7TA 1I44A 3PSCA 3GCVA 4V05A 3RK5A 3QCQA 5AJQA 4AA5A 2XH5A 3FKNA 5E8YA 2WZJA 3O23A 4A9RA 4J8NA 2OXXA 1YI6A 3FUPA 2UZBA 5KKRC 4AUAA 4RX8A 2IJMA 2QKWB 3IW6A 4B8LA 4GKIA 4FTTA 5IEVA 1WVXA 4EOQA 1KOAA 4O27B 4Y8DA 2F49A 1ZOGA 4QTBA 2CCIA 3F88A 4D4SA 5CZHA 4FNZA 1ZMUA 4D55A 5KMJA 3F61A 3ZYAA 3FKLA 3V5TA 3ZLYA 4ASEA 4IXPA 4FSZA 4QOXA 4W8EA 2NRYA 3FSFA 1Y6BA 1M2PA 2EB3A 3BHYA 2IZSA 5CXHA 5C26A 3T9IA 2XKEA 3L8XA 3PJ8A 4U9AA 5EQYA 4J96A 4RA4A 3KULA 2VWZA 4BDEA 1JSUA 3IGGA 1JOWB 3M2WA 5B7VA 2VV9A 3A4PA 3R00A 2X6EA 1SVEA 2OIQA 3D83A 2PVYA 4K0YA 3CIKA 4KWPA 4F08A 4MXXA 2B1PA 2DUVA 2VX3A 1YI3A 3CTHA 2PE1A 2VNWA 4G6OA 4U40A 5I9XA 4L7FA 3PIZA 1VEBA 4DCEA 4ZTRA 3H0ZA 2B9IA 4LI5A 1T45A 1JVPP 2GNJA 3PXQA 4RVMA 4MD9E 3WILA 3DK7A 4FTKA 3RCJA 1YOMA 1WMKA 4O0RA 5CAPA 3VRYA 1RE8A 4JDKA 4K9YA 3ORZA 3PWDA 2WU7A 3VUIA 4PPCA 3TUBA 1YWRA 3NNVA 2B9JA 2QHNA 3EHAA 4N0SA 5AP4A 4RLKA 4EL9A 3S0OA 2OIDA 5EYKA 3P5KA 4MHAA 4ZY4A 3F82A 5C9CA 4H36A 4G9CA 2CSNA 4M97A 1KE9A 3AT2A 4NTTA 2Q0NA 1MRVA 4ID7A 4GS6A 2C0OA 2ITPA 2YAAA 2YLFA 5LMAA 2XKCA 5HE0A 5A4LA 4WG3A 2V62A 1TQMA 1CDKA 5BNJA 5LJJA 5ETAA 4ASZA 4O6LA 4XOYA 1DI9A 1F0QA 2OF2A 5CU6A 5KBRA 4DT9A 4HVHA 3KXHA 3G15A 3HMNA 4EOMA 3UO4A 2J90A 2ACXA 3ZXZA 4PMSA 3I60A 3QCSA 3VBYA 5CXZA 3GU4A 3R8MA 3LLAA 2XF0A 4NWMA 4XP0A 4EBWA 5CAQA 4LL0A 5D11A 4IVAA 1RQQA 3H9FA 4CXAA 4EC9A 4NIFA 3QC9A 5JT2A 3O51A 2HZIA 1BMKA 5J9ZA 5J8IA 4J98A 3ALOA 4ZTNA 4ZZNA 4DGNA 3ZONA 5BVNA 5DYJA 3P4KA 2GTMA 4D4RA 5EH0A 4E5WA 3R7VA 3BQRA 5EW3A 4FV6A 4F63A 4Y5QA 4IIRA 4YZDA 4BTFA 5CASA 3QFVA 5EDRA 2R3JA 4KKHA 2JKOA 4F65A 4I24A 2O2UA 4QMWA 1CSNA 4QPAA 3FKOA 3NUNA 4L42A 3HMOA 3WBLA 3RPSA 3CQWA 1H1QA 3QZIA 3R8ZA 2XMYA 3DJ7A 4FIEA 4N6ZA 5ANEA 1CKJA 4I0TA 4EJ7A 3M1SA 1GJOA 4TWOA 2JIIA 4RSSA 2J0KA 4NCTC 4Y85A 4Q2AA 4FKJA 3KXXA 4BN1A 1SYKA 4IANA 4Q5HA 4RVLA 3GFWA 4MWIA 3AC1A 4LG4A 3IGOA 4QP8A 3RPYA 3WZUA 4XMOA 4W4VA 2FVDA 4D0WA 2ETMA 1OPKA 4DINA 4AZWA 5AUVA 4FT0A 4R7HA 2R3OA 4I23A 2XZSA 4BYIA 2FSMX 2XNMA 3E8EA 3OXTA 4FKOA 5AUZA 5FP5A 4JAJA 3DQXA 5IKWA 4C58A 4C2VA 4PL4A 2QU6A 3LVPA 1ZZ2A 3C4XA 3HDNA 4FT3A 1PF8A 3VUMA 4AF3A 1YVJA 4ANOA 3EQRA 1TKIA 2XP2A 2XNPA 3C4ZA 3DDQA 1MRYA 1YRPA 3BE9A 3PFQA 3TNWA 3VULA 2VWBA 4JOAA 4FKTA 2I1MA 3NNWA 3TV4A 4EH8A 4CT2A 1Q4LA 5EI2A 3WE8A 3PWYA 4WBOA 3D5WA 3F7ZA 3PXKA 5IA3A 2W96B 2ITNA 3OWPA 5FM3A 3D2IA 3T9TA 4ZZOA 3O17A 2YCRA 4JRNA 2J0JA 3R9HA 1YDSE 4ZTMA 4O7RA 3DKGA 3HUCA 5AP1A 4EH9A 5DGZA 1M52A 2ZMDA 2R3NA 3NYOA 3BBWA 4AGCA 3F2RA 4O84A 1OKVA 3OF0A 4JX3A 1ZYCA 5BMMA 5BYZA 3MYGA 4ACMA 5HE1A 2YIYA 3S2PA 2PVRA 5FXQA 1MRUA 3JVSA 4M12A 2J5FA 3GCPA 3IO7A 2ZV7A 4LV8A 2XK7A 3TACA 3BQCA 4NW6A 4BC6A 1H27A 5TKDA 3COMA 3ET7A 4U97A 1CTPE 5HICA 1XH6A 4MXCA 4AGWA 3UNZA 4BCIA 3M42A 4BCHA 3HMMA 4DEBA 4FL1A 4A9YA 3R71A 3GC7A 4I20A 2YJSA 3D7TB 2CKEA 3FAAA 4HVGA 2X8EA 4YHTA 3LFBA 4E4NA 2XK9A 2V5QA 2GNHA 3ANQA 3IS5A 4XV9A 2CMWA 4TRLA 5IQDA 3HP5A 4F7JA 3KK9A 4MD8E 2C30A 3DDPA 2XRUA 2R3MA 2VWYA 5AX9A 4B6LA 4Q5EA 2BDJA 4LM5A 1H26A 5DHJA 3U9CA 4DYMA 4ZJVA 5I4NA 3ORPA 4L46A 3QQLA 2ITQA 4RJ8A 4B4LA 4QP4A 3ZHPC 5I0BA 5JN2A 5L3AA 1H1SA 2QO2A 4JG8A 3E63A 3OXIA 1M14A 2YIWA 5CI7A 2X9FA 3I81A 3EFJA 3SKCA 5FXRA 5L6OA 3ZU7A 1L3RE 1QPDA 2UVZA 2NPQA 1Q99A 4FKQA 2R5TA 3PZHA 4NJ3A 3FY0A 4IB5A 4JVGA 4L45A 5HNBA 4BKJA 4RWIA 3BHTA 4F4PA 4RIYB 3QXOA 4KIQA 2Z7SA 1SVHA 2DQ7X 2XM9A 4EI4A 2CNVA 3NAXA 4FKPA 4YJNA 3RKBA 4O0SA 4DG3E 1IRKA 2VRXA 3CQUA 4R3RA 2ITVA 4U81A 3LXKA 2OO8X 3QLGA 3FMKA 3WZDA 3BYUA 2H9VA 3D15A 1Q8UA 1M17A 2EB2A 5ANJA 2BKZA 4AZFA 3TZ7A 4O81A 4B0GA 2R3FA 4YZMA 5EKNA 4BHZA 4FODA 3MS9A 5EK7A 3Q2JA 2XK8A 2A4LA 2CHLA 2ZVAA 3N4VA 4K8AA 5CWZA 2Z60A 2I0VA 3AQVA 5FLFA 4C7TA 3QUDA 3F69A 4S31A 5AP0A 5HIBA 4DTBA 2QR7A 3MV5A 5C01A 3SOCA 4XYFA 2CLXA 2UW0A 4BB4A 4MXZA 2QURA 4O6EA 3D14A 1R0EA 3ENMA 4DEDA 1ZARA 3SD0A 4DC2A 1YXUA 5FDPA 4RVTA 4GL9A 4C02A 1Q62A 1ZYSA 4I5HA 5EI6A 4CMUA 4LOPA 3BU6A 4DHFA 2OJJA 4HGEA 3VW8A 3C50A 4KIPA 3TWJA 2GNLA 3DKCA 3QTZA 4PY1A 3THBA 3P79A 4FVQA 2JAVA 4FKGA 2AC5A 5LARA 1G8SA 2X9EA 3VF9A 4EK8A 3UODA 2X4FA 3LM0A 4TYHA 2YM7A 4GMYA 3BBTB 5FTOA 1M7NA 3MSSA 1WBNA 4RZWA 3RVGA 1BI7A 1Y8GA 2REIA 3TNQB 4PDSA 3MVJA 5HX6A 4FNWA 2VTPA 4ENXA 1KSWA 4FTUA 4W4YA 4IX6A 5E8WA 2HAKA 5CEKA 4FEVA 4DH7A 4F9AA 4K1BA 4PNKA 4K2RA 4ITJA 3R2YA 1WBWA 2CGWA 3DXQA 1PXKA 3D7TA 5CQWA 4RIXB 4BZOA 5J7HA 3V6SA 4C36A 3CE3A 3NR9A 4GEOA 4QRCA 4DFZE 5M4IA 2FSOX 3QHWA 4FT5A 4N6YA 4RIWB 5HESA 5HLPA 3HAMA 3DY7A 3FLZA 2RFSA 3F3UA 3MFSA 3PLSA 3QD2B 4AXAA 4F9WA 2QOHA 3NDMA 4MD7E 4D9TA 2LGCA 4J53A 3MIYA 1JSTA 2QD9A 4LGGA 4ZSAA 5K9IA 3KL8A 5GIOE 1GAGA 3HMPA 4DGGA 3ENHA 4DLIA 3LXLA 4UALA 4XH6A 3V6RA 4J97A 3JUHA 2WTKB 4MVFA 4EH6A 4BI2A 4R5SA 4ZEGA 4IAFA 3ZCLA 2BDFA 2WOTA 3PG1A 3Q5IA 4E26A 5M4FA 4ACHA 3SQQA 5AADA 1OL2A 3LMGA 5HVKA 2WEVA 4BBFA 3Q3BA 4Z55A 3GCSA 3KMWA 4FTAA 4D1SA 2WQNA 4DF3A 4AACA 4EKKA 2YEXA 4O86A 4RX7A 3L1SA 5D7VA 4HNFA 3SG9A 4D2TA 5BVEA 2B9FA 4IVBA 4O0VA 3EMGA 2ZM3A 5IQFA 4UX9A 2JEDA 4BCMA 4WG5A 4ZLYA 1Y8YA 4F7NA 5IUIA 4EUTA 4KS7A 2E9UA 2WPAA 3GXLA 4RRVA 3VF8A 4FV1A 3V51A 5L8LA 5CEPA 1Q24A 2QOIA 3R1SA 2QLUA 3QQKA 5CZIA 2PU8A 1K3AA 3KN5A 3PE2A 5CF4A 5HTBA 3LFDA 2WKMA 2GFCA 2RFNA 5AWMA 2Z2WA 3NEWA 4C62A 5HOAA 4DEIA 1LEZA 3GENA 5CU3A 5ETCA 3RHKA 2GFSA 2QOOA 3I1AA 3LLTA 1IA8A 2C5NA 2UW4A 3GEQA 4NKSA 4QMYA 4ZTQA 3W10A 4AZSA 2WTIA 4J71A 4X3FB 2ZB1A 4EOSA 5HZNA 4NKAA 1UU8A 3SXFA 2Q83A 1UU7A 5F9EA 1U5QA 3EOCA 3EKKA 3VUGA 3O0GA 4I6FA 4YZCA 4ZTSA 5J9YA 4FKVA 2OSCA 3FZRA 5LVPA 2HZNA 2YA9A 3KXGA 3EWHA 4LRKA 4IFGA 4BIBA 3L9LA 5A4EA 4USEA 4WD5A 4XP2A 3NMUF 4PQNA 4L3PA 3UIXA 2A19B 1PMUA 2PZ5A 2Y4IB 1IAJA 4D5HA 5DFPA 4C3FA 5FEDA 4Y72A 5HGIA 3FLQA 4FL3A 2IVVA 4QMSA 5LOHA 2GHMA 4Y83A 2XIYA 1O9UA 4J7BA 3PJCA 4OTHA 4RA5A 4HVIA 3EZVA 2KTYA 3BYOA 3BGZA 3BHVA 2OZAB 3KF4A 2YWPA 4FOBA 1OPLA 5AV0A 3QQFA 4F6SA 3KXZA 2WIHA 2WMAA 3OOMA 4G5PA 4A4XA 4BIDA 5KNJA 4W4XA 2G2FA 5A14A 4HCUA 3TN8A 3CP9A 1H01A 2XK4A 3DTCA 4XHKB 4RIWA 4CYIA 3EQHA 4FK6A 5FP6A 3B2TA 1SZMA 3G5DA 4NW5A 1OB3A 2JDTA 2F7EE 2VWWA 3C0IA 3G0EA 2C68A 3OTVA 4ITIA 4UWYA 3NW6A 4W9WA 5F4NA 5C03A 3VAPA 2RIOA 3KREA 1UVRA 1LUFA 3VHEA 1ZOEA 2BIKB 2ZB0A 5CEQA 3OCBA 4UEUA 4P5ZA 2WTKC 3EH9A 4RC4A 4K6ZA 4CFXA 2W1FA 3LFFA 4JS8A 2WAJA 4FTOA 4Y73A 3SC1A 3GB2A 4CCUA 5IA1A 2F2CB 3VW6A 3BGQA 4UB7A 3EFWA 4C61A 5A4CA 3TXOA 3UZTA 4WRGA 3ZO4A 3IW7A 5HBEA 1KOBA 4ZMEA 3D94A 4DGMA 5AM7A 3ZLXA 2PULA 2XNEA 4MYGA 3L9NA 3GOKA 2HOGA 4UY9A 1K2PA 3V5JA 2RG6A 4EHEA 4MQ2A 4FYOA 4ZIMA 4K18A 5IQAA 4FE2A 4XRLA 4ALWA 2C3IB 4L52A 3DK6A 2A1AB 3O71A 5CSVA 2EU9A 5HE3A 2C6OA 2WTCA 4ZLOA 3H9RA 1Y91A 4O7VA 4CTBA 1OUYA 3LQ5A 3SG8A 5AUWA 3DK3A 3W1FA 5HU3A 3ZUVA 2F7XE 5JMSA 3Q9YA 3RWPA 2B7AA 4QNAA 2PUNA 1WZYA 3R7UA 4QTAA 2V0DA 2PUUA 3TKHA 3QGWA 2PWLA 3W2RA 1BX6A 1R78A 4KABA 5K4IA 2C6MA 4G9RA 4JIAA 4KINA 2VTLA 3EN7A 3FZPA 4I0RA 3NPCA 3ZC6A 4F0FA 2UZWE 5BVFA 4GVAA 3A7GA 3V5LA 4CRLA 2G15A 4XV2A 2HZ4A 3DU8A 1UU3A 4X3FC 4RX9A 4M7IA 4F0GA 4X3FA 2W06A 4PDYA 4X2FA 4BVUA 3ZUUA 3CTJA 2PHKA 4P5QA 2HELA 3LOKA 5ETIA 2CGUA 2UUEA 2PVKA 3GU6A 3MY1A 4EJNA 4BCQA 3R30A 4YP8A 2XM8A 5LWNA 1GOLA 2EXMA 3C4FA 5BX0A 2YZLA 4G3EA 2VAGA 4I41A 3CKXA 4I4EA 3ZBFA 1R1WA 1XH5A 4XEYA 4ACGA 3BU5A 4O7WA 5DIAA 2Y4IC 2HYYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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