4FUYA

Crystal structure of the erk2 complexed with ek2
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
348
structure length
329
Chain Sequence
PEMVVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKIDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the ERK2 complexed with EK2
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 329
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fuyA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fuyA01
2R2PA 3LJ2A 2WIHA 4E6QA 4YUQA 3W2OA 5CANA 3DKOA 2W1FA 5E1SA 5HG7A 4EHEA 5IUGA 2WXVA 3E87A 4IC7A 5GNKA 2GNLA 4U79A 5KBQA 3FL4A 1JPAA 1CM8A 2ESMA 3PWYA 4FTNA 2JKMA 4N70A 4QP6A 3V8WA 4E6AA 3G15A 2J9MA 1P4OA 2FUMA 2HENA 3ITZA 3R8PA 2IG7A 5M08A 4X3FA 4YLJA 3VS7A 4HGTA 1Z57A 4ZLOA 5L8LA 3PSDA 3LVPA 2WB8A 2J0KA 3Q9YA 4QMLA 4JDJA 3SAYA 4RVMA 2FSLX 3IK3A 3TIZA 1PXIA 3NNVA 4AGWA 3EQDA 4FEVA 2H8HA 1LEZA 4DTAA 1TKIA 3QUPA 2ITZA 4YSJA 1Q8ZA 3OC1A 1LPUA 3ZFYA 3ACKA 1ZMUA 3EYHA 1KOAA 3JUHA 4KUJA 3EJ1A 3AQVA 1YQJA 4M7IA 5CENA 3H0YA 3HMPA 1CSNA 5A3XA 3F2NA 3PZHA 2VX3A 5EYKA 5AUZA 2RIOA 3QZHA 4CFFA 4IEBA 4H3BA 5JFVA 2FSOX 3REPA 3RAHA 4F0GA 4BDHA 2EXMA 4EOQA 2YM5A 1MRUA 5AR4A 5AX9A 5JSMA 4OTGA 1U59A 4WBOA 3ZLXA 2CKEA 3UP2A 2NRUA 2WTWA 2YDJA 3CJGA 4I5HA 3CTJA 4AA5A 3U54A 3PJ2A 5CU4A 1RDQE 5EI6A 4TTHB 4UY9A 2PVLA 4BDEA 4FTJA 2AYPA 2Y9QA 3BHVA 4M3QA 3CPCA 4XEYA 1VEBA 3MFUA 4G9CA 3F3UA 3RHKA 5L2IA 5K3YA 5CWZA 2BKKA 2QO9A 2YACA 3TCPA 4G6NA 3CD8A 3FV8A 4X6RA 1M2QA 2BAQA 2W1GA 4G3GA 5DR2A 1JQHA 3IW8A 1YVJA 4MF0A 5EK7A 4EUTA 5BVFA 3QRIA 4NK9A 3UVQA 4FKIA 3T9TA 3F3TA 3ZLSA 1OL5A 3PWDA 4F7NA 3BPRA 5K9IA 4GKIA 3BGPA 3R1SA 2PK9A 3Q6UA 5CALA 4RT7A 3W18A 5AA9A 4J52A 3VF9A 5LQFA 4M66A 4RC2A 4BDJA 5HQ0A 3HAVA 3EH9A 1PXMA 3ZXTA 2JC6A 4HOKA 2R3MA 1QPJA 3LQ5A 3BLQA 3AT2A 4HZRA 4BCGA 4IAAA 4IQ6A 5HEZA 5TE0A 5HBEA 3ORTA 3PSCA 5HKMA 2P2IA 4FSWA 5K4JA 3MVMA 4O0YA 4BGHA 3F3ZA 3OS3A 4RX7A 4FKGA 5CU3A 4OBQA 1F3MC 3MDYA 5CLPA 3ZUUA 4BTMA 3C4CA 2B9FA 4L43A 1S9IA 3DFCB 3OCGA 3S95A 4AW5A 4C58A 3HEGA 3G2FA 4I4FA 4FKPA 4X2JA 3COKA 5DE2A 3BU3A 3RAIA 3WF5A 3EQHA 4DEGA 3VUHA 3ZC5A 5BUIA 5LVNA 3PP0A 4B8LA 4KAOA 4MQ2A 5IU2A 4FV7A 4YO4A 3QX2A 2XIZA 3FC2A 4EHZA 5L6OA 5M4UA 4MWHA 3QCSA 4U97A 4F9AA 5J7BA 2G2IA 2C4GA 4FUYA 4U43A 4IAIA 5CT0A 4ANOA 4PP9A 4QYFA 2PVJA 4FSMA 3FSFA 3IGGA 2BROA 4Z16A 3QWJA 3E64A 4O21A 4O7LA 3PIZA 2PUNA 4FZFB 5L2SA 2A27A 4C4HA 1M2PA 3AMAA 3QX4A 1W98A 3TTJA 4O81A 3COIA 3NR9A 4RX8A 4FZ6A 5CZHA 2QCSA 4KKHA 5DEYA 4L52A 1STCE 3ZO2A 4BF2A 3PA3A 4F09A 3MB6A 3DPKA 4FZ7A 4OAUC 4F4PA 3FQEA 4TYHA 2QLUA 3BIZA 1OZ1A 3PXFA 1JNKA 4I5MA 1M2RA 3DCVA 2VX1A 1JOWB 4YLLA 4BVUA 4IZYA 4LL0A 3FMKA 1W0XC 3KXNA 5A14A 3POZA 3RK9A 1WBVA 3KCFA 2C69A 4XOZA 1UWJA 4BCMA 3KN5A 2IZRA 4UMTA 1V0BA 2CJMA 2Z7QA 3W16A 4CLJA 3JXWA 3LM0A 4PDSA 1GIIA 4TYHB 3VS4A 5FDPA 4MD8E 4O91A 2XK6A 5CF8A 3I5ZA 5KCVA 3UC3A 2XYUA 4M12A 3EQIA 3VS1A 3R7VA 3LFQA 3SG8A 5HTIA 4LGDA 4WNOA 3DZQA 2O3PA 1XBAA 3L8SA 4XLVA 4ZZOA 1ZAOA 1WMKA 4ZJJA 4FV8A 3GQLA 3BLHA 5TOZA 2HXQA 3KRLA 2PVNA 4EBVA 4WRGA 4M97A 3F69A 2XNGA 1I44A 3TNIA 1YI4A 4ZJVA 4IAZA 4C36A 2WGJA 3IQ7A 1BKXA 4O0VA 5FXRA 4O82A 4ANNA 4YBKA 3QQHA 5BVEA 2A19B 3PRFA 4QP8A 4ACGA 4FT3A 4LYNA 4UYAA 1Y8GA 4EC9A 2UVYA 2W4KA 3FMLA 2CSNA 3LQ3A 3N4TA 4BL1A 3EQFA 4ZLZA 1XWSA 3GU6A 4J99A 5FLFA 3VRZA 3ZC6A 5BVNA 4FOCA 5DYJA 5HX8A 4FG8A 2J2IB 3R73A 4MHAA 2PMLX 5HU3A 5EOBA 4MEDA 4FC0A 2X81A 3AGLA 3PJ1A 4NCTA 2C1BA 3F2RA 4U42A 4HVIA 1XQZA 1CKJA 3GU5A 3B8QA 3H30A 4J96A 3SW4A 4QMNA 4YURA 4O22A 3GC7A 4UZHA 1OBGA 4CKJA 2W1DA 4V0GB 3UG1A 2CLQA 2XNPA 1XH5A 2A1AB 4PTCA 4BIDA 1PY5A 3LZBA 4IJ9A 2CLXA 2G2FA 3NW7A 3KY2A 4NKAA 4NM0A 1XO2B 3EHAA 3SHEA 3UNZA 5HORA 5IQCA 3NAYA 4DBNA 1YW2A 2ZM4A 4JOAA 4MNFA 4AQCA 3BELA 5CEPA 4EZ5A 4UALA 3QTSA 4YSMA 4E20A 4H36A 4PY1A 4FV5A 1O6KA 4QMOA 1J1CA 5FXQA 4RBLA 3RJCA 3FZOA 3KXZA 3CQWA 3MJ2A 4U5JA 2GNJA 4RZWA 4UMPA 4PQNA 3NMUF 4ZSLA 5CY3A 5I9ZA 3MH2A 2GU8A 3R9NA 3LMHA 3EN5A 1PMNA 2OBJA 3QL8A 4XUFA 5FP5A 5DVRA 3TG1A 4HCTA 3OWLA 4FKTA 5AM7A 4BDDA 4IC8A 5AP1A 3WI6A 3I4BA 3UNJA 4D4YA 5HLNA 4ZS0A 3ETAA 3BV3A 4PUZA 1TQPA 4BCNA 5L6PA 4F65A 4L8MA 2WTVA 3QRJA 1K9AA 1I09A 5DI1A 1Y91A 4CQGA 3WZDA 3PPZA 4AA0A 4C35A 3PUPA 2OJ9A 5F1ZA 5LXMA 3MI9A 3GVUA 4QP7A 1YOMA 4EKKA 4I0TA 4DG2E 4DN5A 3GOKA 3DAKA 3MVHA 3H3CA 1NW1A 1Q8UA 2RF9A 3DK7A 5IUIA 2I0EA 3OHTA 5EYCA 2RFNA 2UW8A 3PG1A 5HG9A 4JI9A 1YHSA 4UMQA 3E3BX 4NSTA 4QP3A 3ZUVA 4U3YA 3FI4A 4L00A 2RFEA 4L44A 5CQWA 2HW6A 4DFBA 1R0EA 4KKEA 3AXWA 4HYHA 4FKLA 3GXLA 2EXEA 3HDNA 2OJIA 2UZEA 3W2QA 4WIHA 5CU6A 5CXZA 2VTSA 3QTRA 4OLIA 3B2TA 4I94A 3F6XA 1NXKA 5EHOA 5EKOA 2O63A 3EFJA 3FQSA 2XVDA 1APME 2C6TA 3NYNA 4R3RA 5HI2A 3ELJA 1E9HA 1UKIA 3ZSHA 3FDNA 4ZTHA 5LMKC 1SVGA 3R21A 4FNXA 2P4IA 2VGPA 5IUHA 2PZRA 4MVFA 3LLAA 2PZYA 4QQTA 5J9ZA 5EDQA 3GCQA 3AD5A 3IO7A 3OW3A 2OG8A 3R1NA 4FIFA 3R7GA 4JVGA 4ZP5A 1QPDA 1X8BA 4WUNA 3RI1A 5DBXA 3QD4A 5AMNA 1M17A 1XHAA 4RIYA 5I9WA 3WYYA 4LGGA 3MPMA 3UPXA 2I0HA 4FIIA 5FTQA 2G15A 4EK8A 4LOOA 3FHRA 3JPVA 3MH3A 4I21A 3NYVA 4MXYA 3ZRLA 3FXXA 1R0PA 3DKGA 1HOWA 4WO5A 2Y4IC 2WMVA 4KRCA 3R7IA 3ODYX 4IACA 1TVOA 3R83A 4G16A 3MFTA 3LE6A 4FK3A 4O27B 4FSTA 4RIYB 3W8LA 5GZ9A 5LMKA 4TNDA 3TT0A 2ITXA 2DYLA 4MYGA 3NGAA 4L68A 3C51A 2C6KA 4U8ZA 4EORA 5A54A 3OCSA 3QQFA 2F57A 2BFXA 4L3JA 2PWLA 4X21A 3VBXA 3OVVA 2QI8A 3JVSA 3UP7A 2OIBA 3RALA 3RBWA 3A8XA 2QD9A 2W9FB 3I60A 4CZYB 2R3JA 3P9JA 4RJ7A 1GIHA 3LCOA 2B53A 4FT5A 3MBLA 4FKQA 2XM8A 4FL2A 4L45A 2ZV9A 2R3HA 5L3AA 3EN4A 4DTBA 1KE6A 2YISA 4O96A 4D0XA 2PMNX 4J7BA 2C5XA 2I7QA 2X8EA 3IDCA 3KK8A 4FV9A 2JDSA 4WA9A 4NM3A 4D5HA 4H05A 3C4XA 4FTMA 4PDYA 4RQVA 1PF8A 4TT7A 3MA6A 3BBTB 4GU6A 4FVPA 1KV2A 3GQIA 4WUAA 3WF7A 3W8QA 5D7AA 5IEVA 1U54A 1UVRA 1YHVA 5J7HA 3R7YA 3CTQA 4O38A 4K9YA 4GRBA 3V04A 2BMCA 1JSVA 3QBNA 2R3LA 4RFZA 2IO6A 3A7FA 3NUXA 3OBGA 2PUPA 4OR5A 3D14A 2PVYA 2CDZA 3DLSA 4PMPA 3R6XA 3W33A 3PDTA 5DT4A 2FYSA 2XNOA 2Y4IB 1T46A 2HY0A 3FZ1A 4XG4A 4XJ0A 3WOWA 3R8VA 5DA3A 4KIQA 2OI4X 1U54B 4FV4A 4PRJA 5F9EA 4FTRA 3BGQA 3TV4A 3QFVA 5HLWA 2XYNA 4PMTA 5CYIA 3KB7A 5AP5A 1YXSA 4D1XA 2AUHA 5AUVA 2B1PA 3W2SA 4PDPA 4BCIA 4P5QA 2ITYA 2W1EA 1Y6AA 2ITWA 1JLUE 3CQEA 3DLZA 3WILA 5KX8A 3I81A 4FVQA 5T3QA 3QQLA 2FB8A 4G3EA 2WTDA 1GZKA 4IDVA 2J5EA 5DG5A 2UW5A 3U9NA 3VQUA 5BVDA 5CAPA 2QR8A 1W8CA 4DEDA 4X6QC 2HWPA 4JG6A 4IX5A 4KA3A 1H4LA 4LRJA 2OZAB 4H1JA 4PMSA 3TI1A 3QCYA 3ANQA 3EQCA 4MKCA 3H10A 2GDOA 1H25A 2F2UA 4MBIA 4CXAA 2VGOA 1CKIA 3KL8A 5L6WL 2VWIA 3D5UA 2WMBA 4M0ZA 2PE0A 4EH5A 3HUBA 4HJOA 3UOHA 1Q4LA 5DRDA 3JVRA 1UNLA 3OTUA 4EK4A 3SOAA 5C8KA 1WBSA 2DQ7X 5FDXA 2O65A 2XIYA 2XKFA 3KN6A 2F4JA 5ETFA 4AACA 2W1IA 1A06A 2GPHA 3EFWA 3RPSA 4HVDA 5BUJA 3K2LA 4FKRA 3IOPA 3G0EA 4DYMA 3PE1A 1YWNA 4GFGA 3P08A 4KSQA 5BVKA 5IEYA 2F7XE 3ROYA 4RJ3A 2GQRA 4EYMA 2XBJA 3K5VA 4EK6A 2R3RA 2ZV8A 4U7ZA 1FVRA 4B99A 4D58A 4ANQA 4AT4A 4IX3A 3EQRA 4F63A 2HY81 2F9GA 4XH6A 4BCHA 4ZTSA 3O2MA 4FG7A 5AAEA 5FP6A 2F7EE 4Q2AA 3S4QA 2QHMA 3DJ6A 4U0IA 3QQUA 4C3PA 3ATTA 2GTMA 3VWAA 3TJCA 4EH9A 2EU9A 3C5UA 1NVRA 3PJCA 3FLYA 4R5YA 4XMOA 2YABA 3QUDA 1JWHA 4OTWA 5BYZA 4JIAA 4DLIA 3QF9A 3FYKX 3QXPA 3RKBA 4NFNA 4CT1A 5CS6A 4MXAA 2Z7LA 3VHEA 4FG9A 5JFSA 4UX9A 2WMXA 2JEDA 1W83A 3LIJA 3FPQA 2UZUE 4TPTA 3FQHA 5M06A 4CVAA 2PUUA 1ZYLA 3IW4A 3KMWA 5CF6A 4RIXA 3CIKA 4E4MA 2AC5A 4ANLA 5HG8A 1Z5MA 3V5WA 2GS2A 4IBMA 4A06A 3ZDUA 4O0SA 4AW1A 3PLAE 2VV9A 3R71A 4BCPA 3PE2A 4G3FA 3BYSA 4RC3A 4DH5A 2YIWA 1YOJA 2W5BA 2YZLA 2C3IB 1O9UA 4I93A 4YJOA 3U6IA 4U81A 4N6ZA 4BICA 3HL7A 5DR6A 3FYJX 3I7CA 5AUTA 4TKSA 3C0GA 4RIXB 4C8BA 1KWPA 3OY1A 3U6JA 3LCTA 3MPTA 3MW1A 3KXXA 3MIYA 5IISA 1OM1A 3N51A 5I3RA 4CTCA 2CNUA 4QQ5A 4QMWA 4JX3A 4L7FA 3LW0A 4BKJA 2OH4A 3A4OX 4O7WA 2BZJA 4FUXA 4FA2A 4HYIA 3ORMA 2I6LA 4GKHA 4YTFA 2NNWB 3WZEA 3BYMA 3KULA 3G51A 5J9YA 4QTBA 4QTEA 4IDTA 5KBRA 4CRSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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