4G34A

Crystal structure of gsk6924 bound to perk (r587-r1092, delete a660-t867) at 2.70 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
285
structure length
248
Chain Sequence
GRYLTDFEPIQCLGRGGFGVVFEAKNKVDDCNYAIKRIRLPNRELAREKVMREVKALAKLEHPGIVRYFNAWLEKNKVYLYIQMQLCRKENLKDWMNGRCTIEERERSVCLHIFLQIAEAVEFLHSKGLMHRDLKPSNIFFTMDDVVKVGDFGLGTKLYMSPEQIHGNSYSHKVDIFSLGLILFELLYPFSTQMERVRTLTDVRNLKFPPLFTQKYPCEYVMVQDMLSPSPMERPEAINIIENAVFED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of 7-Methyl-5-(1-{[3-(trifluoromethyl)phenyl]acetyl}-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine (GSK2606414), a Potent and Selective First-in-Class Inhibitor of Protein Kinase R (PKR)-like Endoplasmic Reticulum Kinase (PERK).
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3
total genus 85
structure length 248
sequence length 285
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-07-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4g34A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4g34A01
5DEWA 5CU2A 2GHGA 3EN7A 5G6VA 5J7BA 3PIZA 3RGFA 4DGMA 5KO1A 2EXEA 3HA6A 3NAXA 4TYJA 1JSTA 3GCVA 4BWPA 5H2UA 5EYKA 4BGQA 2OU7A 1KE6A 4C4IA 2W4KA 4FIFA 5FWKK 5M07A 5EFQA 2OKRA 1H01A 2C47A 3BGQA 3JY9A 1PMEA 4FIEA 4FV5A 4W4VA 4BCMA 4AN9A 3W2PA 2R0IA 5HVKA 1UKHA 1KSWA 2B52A 4J71A 3EHAA 5DEYA 2W0JA 1LR4A 2XNMA 2E9PA 1XHAA 5AUVA 5IKWA 1H1QA 4XH6A 2PK9A 3VAPA 5HNIX 5CU0A 1URWA 2JLDA 4YMJA 3QKMA 4YBJA 5JH6A 2F57A 3NCGA 2C0IA 4EH9A 4LV8A 5IH5A 2QOOA 2YEXA 1W7HA 2IW9A 5FUTA 3SG9A 3F5GA 4BRXA 2BHHA 3ALOA 3HA8A 5J8IA 4X2FA 2FSMX 2BILB 2UVZA 2HWPA 5EG3A 1J1BA 1OPKA 4PL4A 3WZUA 3A4PA 2RG5A 4QMLA 4M69B 3E93A 4OT5A 5CF5A 4FI1A 4XOZA 3MFUA 3ZUUA 4ZAUA 5FBNC 2V7AA 4BC6A 5AUTA 4FUYA 1XH4A 3K5UA 1YOJA 5A3XA 4B9DA 3ZTXA 5AV1A 4FTRA 1J7LA 3LM0A 4FNZA 3CPCA 3ALNA 5CANA 5BVEA 3D14A 2EVAA 1Q8ZA 3FKOA 2OJJA 3ZBFA 4I41A 5I9UA 5HTBA 3NSZA 3LKMA 3O8TA 2C69A 5F20A 4DGOA 3MVJA 1E9HA 2YN8A 5D12A 3OT8A 2JDTA 3IS5A 4ZMFA 4PRJA 3ORMA 5DA3A 4F0IA 2WMXA 2RFDA 2OXXA 1GIHA 1M2PA 3UVPA 4ZLZA 3WF7A 5IZFA 3I7CA 5IISA 3RJCA 4FV2A 3HAVA 3OROA 4QP4A 3R7UA 1XH5A 2CCHA 2F7XE 3HLLA 3LZBA 5FG8A 2P2HA 3EMGA 4KAOA 3TV6A 4BBFA 4EH2A 4AGWA 3Q60A 3VUHA 3WI6A 4A06A 4BZDA 5BVWA 3Q32A 1FGKA 3C5UA 4MQ1A 3EQCA 3H4JA 4ZZNA 5E8WA 4MF0A 1PXJA 3DGKA 4DC2A 3VHKA 4GFMA 3ZLSA 4RMZA 5AAFA 4TWOA 5CQUA 4FG7A 3UPZA 3LIJA 3GC9A 4RIWB 2PE0A 5AP4A 3NYXA 4GL9A 2PZRA 1JLUE 4NM7A 5AR5A 3SOAA 5CXZA 3T3VA 2X8DA 2X6DA 2YAKA 4DH7A 3IGGA 3OTVA 4FT5A 4IVAA 1H24A 4M68A 4TPTA 1FQ1B 4P7EA 5CSWA 2YACA 1JAMA 4M0ZA 4GH2A 1ZMUA 3KA0A 4QNAA 5D10A 1ZAOA 3UPXA 3Q4ZA 2PZPA 4PNIA 3E87A 5L8KA 5BQ0A 3E7OA 2A4LA 3G9LX 2H8HA 4PTCA 2C0TA 4AW1A 4BDAA 5IQEA 4LV5A 3M1SA 2HW6A 4M0YA 4LMNA 3DXPA 5K5NA 3FC1X 3ZLYA 5IA2A 4RWIA 3QZIA 5EOBA 3OD6X 4C0TA 3DNDA 5HE1A 1ZLTA 4XRLA 3TJDA 3VS3A 3HV4A 5DFPA 4FTCA 2UV2A 2CMWA 3KN5A 3F7WA 3NUNA 3PIXA 2XMYA 1ZZLA 3A7JA 2FSLX 3D94A 1NW1A 2YIWA 2FYSA 4YJUA 1XH8A 3LFCA 2A2AA 3NNVA 2A0CX 3P0MA 2IZUA 3MH0A 4BVUA 4K11A 2J5FA 2Y8OA 3PY1A 3R1SA 4G34A 3DOGA 4EH6A 3QWKA 4F9YA 2XA4A 5IMXA 2Z8CA 3GU4A 4FTJA 2QI8A 4GS6A 4RVKA 1H1PA 5AUYA 3MESA 4EHEA 4CXAA 4BI1A 3RINA 3VUTA 3A60A 1JKSA 1H1WA 2XEZA 2BZKB 2HYYA 3KL8A 4LMUA 4D58A 4ONAA 3KRLA 4IW0A 5EYMA 3GFWA 2JDRA 3OEFX 3MTFA 4MTAA 5BX0A 3RAWA 3A8XA 4JX3A 5A6NA 3GEQA 2OFVA 5CALA 1B6CB 4RJ7A 3QD3A 4B99A 4Z16A 3VUIA 2C6OA 2Y6OA 2PVMA 3TT0A 4GKIA 1Z57A 2JDSA 4XP3A 1TKIA 1YOMA 2WAJA 3TKHA 3WF6A 3EFKA 4BCKA 4BWKA 4DEHA 3UQFA 2BMCA 4O0YA 4ASXA 2C3IB 4L67A 2ITWA 2OJIA 3EN4A 4AOTA 4Q5HA 2VTTA 2XZSA 3MVMA 2GQRA 5AWMA 2V0DA 1CDKA 2O8YA 2JC6A 3UJGA 2Q0BA 2BKZA 5CWZA 4WNKA 3R0TA 2XM8A 3EKKA 4IZ5A 4G1WA 5CT7A 5FD2A 3L1SA 3R8UA 3TACA 4FKQA 3ZRMA 5EKNA 3IW6A 3GC0A 3QUPA 4JBPA 4BIBA 3L9MA 4IACA 3OXZA 1OPJA 4O0XA 3GNIB 3TDWA 3EH9A 3KRJA 2WMBA 4FEQA 5EYCA 4ALVA 1Y8GA 5HX6A 2X2KA 2QOFA 2QOQA 3F3VA 3LPBA 5T6KA 4WOVA 4ANQA 3TKIA 2CNVA 4KINA 4CTCA 4K1BA 2XM9A 3KFAA 3OMVA 3FMKA 4RWJA 4ASZA 3NNUA 4ACMA 2BHEA 4V01A 5HBJA 4WHZA 5C4KA 3OHTA 1PXIA 2BRGA 4ZTSA 3B8RA 4J1RA 3AC2A 3GUBA 4XHKB 4RIYB 1MP8A 4CT2A 2I7QA 4I94A 3W2QA 4E5AX 1QMZA 4WNPA 3Q2JA 2BDJA 5AEPA 5B2KA 4Q9SA 5J5SA 3IK3A 4OUCA 3R8VA 2GCDA 4O86A 1RE8A 2IZSA 3V6RA 5EW8A 4FKLA 5LCJA 4MD8E 3VRYA 3BLQA 2CKEA 4FNWA 1SZMA 1F5QA 2F9GA 3FLWA 2A19B 2WQBA 3VS7A 4P4CA 2OF2A 3G0FA 4GJ3A 4QQJA 3Q5ZA 4L52A 4AW2A 5A4LA 3SDJA 1KE7A 5AP6A 3BRBA 3A99A 3E7VA 5C4LA 3W2RA 3AGMA 4ASDA 2IO6A 2C68A 3R7OA 3S00A 3ZLXA 1OGUA 5M53A 5C01A 3ET7A 3U55A 4ZJIA 4W9WA 3M11A 1QL6A 4MQ2A 2ZV9A 4YZNA 3QD2B 3TNIA 1OL7A 1GZOA 1RW8A 5IDPA 2GNJA 2O65A 5EHYA 5IPJA 1ND4A 4CFVA 2F49A 4O81A 5C03A 4QTEA 4L42A 4HNFA 4AFJA 4AZSA 4II5A 5IQHA 1OUKA 4I1ZA 2HENA 3LFAA 4P5QA 4IH8A 5TR6A 3TXOA 3F3ZA 4FEVA 5KMIA 3LCOA 3PSBA 4YJOA 1YQJA 2ZAZA 4FIGA 4R1YA 2Y9QA 1Q8TA 2PTKA 2YM4A 3COIA 2XYNA 3C9WA 3N9XA 4OBPA 3CS9A 5HG7A 5E8YA 3Q4TA 4IMYA 5I5ZA 3TN8A 1SVGA 3AMAA 1H1RA 5L3AA 3CSVA 4D0XA 4MD7E 4DFZE 2UW0A 3RWQA 3FUPA 5AUZA 4PPCA 4D55A 3ODYX 4Z7GA 1O6LA 2UW9A 2CCIA 4YTFA 4JR7A 3VNTA 3PJ2A 1AQ1A 2RFSA 3LFBA 4O0RA 1UNHA 4M67A 3RAIA 3ORTA 4JQEA 4E6CA 3NW7A 4XLIA 1KOAA 5DT0A 1TVOA 5BUJA 3E64A 3ORKA 5JEBA 4U40A 2XNGA 5M57A 3QC9A 3MH1A 4BCIA 2EXCX 4OTPA 3DU8A 3GVUA 3VS0A 2B9FA 2VTLA 3U8WA 4HVSA 1YXTA 3ORNA 4FZDB 4D2RA 5KNJA 3ODZX 3VC4A 2WOUA 3AT3A 3QYWA 4KWPA 1OKVA 2YISA 4C36A 3KCKA 1OL5A 3FWQA 4AT4A 2CGWA 3BV3A 4EOLA 4TYGA 3QCXA 4D1XA 4NYEA 4DG2E 3DBEA 4FNXA 1T46A 5A6OA 4BKJA 5TOZA 4LYNA 4CG9A 4OR5A 1H26A 5JGBA 3HUBA 3KGAA 4DF3A 2GMXA 3EFJA 4U80A 3EYHA 5F1ZA 2QG7A 3Q9ZA 4R8QA 4H58A 3FI8A 3BWFA 3BYUA 4TY1A 4G16A 2YAAA 4EK6A 3QWJA 4NEUA 4WNMA 5HESA 2CNUA 3V04A 1TQPA 5FXQA 2XJ1A 2R3KA 5IF1A 3QHRA 3HDMA 1YVJA 3KF7A 4ZEGA 3SQQA 4L3LA 3KREA 4PPAA 3EFWA 2HCKA 3RPRA 3MW1A 4ZY4A 1OBGA 5KZIA 3VUKA 3F2NA 1R0PA 3F3WA 3KEXA 4I20A 2OH0E 3ZO1A 1JKKA 3OS3A 4G3FA 5LMBA 3OY1A 2PMOX 3CQEA 1ZY4A 3IECA 3W2OA 1ZY5A 2UW7A 3F5XA 2Q83A 1P14A 2R7IA 4EUTA 4TN6A 5KBQA 3RM7A 3U6JA 4GG7A 4V05A 1U59A 3GFEA 4FNYA 3BYSA 2W7XA 3OW4A 4F0GA 3JPVA 2QU5A 2XK9A 5A9UA 2G15A 3FL4A 3HUCA 5G1XA 3SD0A 4FTIA 3H0ZA 3UQCA 5IQIA 1PXOA 3G6GA 5LWMA 3DTCA 3HZTA 5IG1A 2ETMA 4DT9A 4TYHB 2Y6MA 4GMYA 4IFGA 3TZ8A 4DEAA 4K18A 2HY0A 5ANIA 3BI6A 3DNEA 2R3QA 4IAFA 2GS7A 3L8VA 4YU2A 4RJ6A 2VX1A 3NR9A 3FMHA 2XBJA 2BKKA 2EWAA 2UW4A 4USEA 4Z7HA 1F3MC 4JX7A 4IDVA 2PWLA 4QTCA 4X7QA 3V6SA 5TO8A 3BLHA 4FT9A 3RI1A 5KMMA 4BR3A 3E8EA 4LUDA 5DI1A 3QKKA 2CLQA 4HPUE 3QLGA 3NRMA 1L3RE 4FSYA 3ZOSA 4AW0A 3BV2A 4H1JA 4G6LA 1JVPP 2AC5A 2VTQA 5BMMA 2CN5A 4CZTA 1FINA 1PRYA 4YSJA 4YNEA 4RC4A 2BIYA 4O22A 2EUFB 3OBJA 4MKCA 1R0EA 3UIUA 5TKDA 1UV5A 1H4LA 4NM5A 3FPQA 5HO8A 1U5RA 2QNJA 2VZ6A 4PX6A 3CKWA 2JEDA 2V22A 2ZV7A 3R1YA 4PL5A 4RJ3A 1ZYCA 3SHEA 3ETAA 2A27A 2YWPA 3KXHA 4OT6A 4KKHA 5EK7A 2ESMA 5BYYA 1Q99A 3UVRA 5IUIA 2GS6A 5FEDA 5EOLA 3OF0A 4KRCA 4EOPA 3R7GA 3PE1A 4UV0A 5IQCA 2FUMA 4DEGA 2HIWA 3R63A 3PY0A 4AACA 5BNJA 2CKPA 1Z5MA 2QURA 1ZYJA 5JGDA 3QQFA 5ANJA 2X0GA 2IWIA 5HI2A 2VU3A 3ZUVA 3S1HA 4ZTMA 3NZ0A 3QRJA 4DEEA 4ZLYA 3KCFA 4FF8A 4FX3A 3OCTA 2UW8A 1LP4A 1ZZ2A 5GZ9A 4ENXA 4FK6A 4BN1A 3HMIA 4EHZA 2NRYA 4GVJA 2XBAA 3W32A 4QTBA 4U43A 2J7TA 5CVHA 3VS6A 4BCOA 3F69A 3W10A 4M13A 4FV1A 3LXPA 2WXVA 4IVDA 2WU7A 4PDOA 4PMTA 4F7LA 1XH9A 4DTBA 4QYYA 4EK3A 4EQCA 2Z7RA 4QMPA 1J3HA 1PXMA 3QD0A 4HYUA 5BVKA 4P5ZA 1PXPA 1GIIA 3Q52A 4O2PA 5TE0A 4EOMA 3R1NA 3DBQA 4FL1A 3SW7A 3AC3A 3AMBA 1BI7A 3K5VA 4I21A 3OXIA 2FH9A 4FKTA 3AD6A 3LFFA 3FZPA 4JXFA 4ZSAA 3POOA 4YJRA 3OCBA 4U44A 2IZRA 3UOKA 5HVYA 2RGPA 3VBYA 4A9RA 4PDYA 3ZONA 5JK3A 2YIYA 3PUPA 4O1OA 2XIRA 4U5JA 4RZVA 3S3IA 4YJPA 4AN2A 2R4BA 4KUJA 5HORA 5CF8A 4M97A 4AFEA 1OPLA 4O84A 4V0GB 4PP9A 4O27B 2WMSA 3CXWA 4ZXTA 2JITA 2B55A 5T68A 4RT7A 2XYUA 3HDNA 1U46A 4E7WA 4UMUA 2OLCA 4EBVA 4JVGA 2QOCA 5DHJA 4FSZA 5D7VA 1GZ8A 1G3NA 4OTDA 3ZO3A 4J52A 3CD8A 3MJ1A 3GCSA 2W99B 2GQGA 3DKFA 3E92A 4B0GA 4GU9A 5FDPA 4M12A 3BEAA 4RLKA 3V5TA 3VS4A 1YI4A 2W5BA 2QO9A 2X4FA 4L3JA 2VAGA 3NIZA 4LL0A 2YDIA 3UMXA 2UZTA 3W1FA 3EYGA 3IDBA 3DY7A 3MB6A 4TWPA 2XS0A 3CGFA 4FKGA 3BHVA 5JZNA 2LAVA 4CFXA 2VO7A 3I60A 5HNBA 3R73A 5DN3A 3IGOA 3HVCA 4WRSA 3OT3A 1FBNA 5DRBA 2VTAA 4F64A 4EYMA 3BPRA 4OTGA 2BRNA 3MA3A 4YTHA 2X9EA 1PW2A 3FJQE 5LVMA 5CNOA 2V55A 2XRUA 4A07A 4L43A 3MB7A 4RIOA 5CVGA 2EU9A 3UG1A 3PWDA 3H9FA 4F1MA 5DWRA 3KRWA 3K2LA 4I92A 2X2MA 2YIXA 5DGZA 1XH7A 3FI3A 5GJDA 3R9HA 5KMKA 4C4JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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