4G6NA

Crystal structure of the erk2
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
348
structure length
341
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of the ERK2 complexed with EK0
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
total genus 109
structure length 341
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4g6nA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4g6nA01
3NNUA 2W9ZB 4DT9A 4AZVA 1OIRA 1YHSA 3G6GA 3QLGA 1ZMVA 5AUWA 3CQWA 2F9GA 4EYJA 4C59A 5KZIA 3D5VA 3DQXA 4D58A 3I1AA 4GEOA 4IH8A 5KHWA 3DBQA 3DDQA 3RK7A 3K2LA 2QC6A 3CJGA 3EQHA 3F7ZA 4PPBA 5E8YA 4EOSA 2ERZE 4F0GA 2RL5A 4O7TA 4FEXA 4IHPA 1XBAA 5T6KA 2ITVA 2PUIA 3SD0A 3RM6A 4F70A 2GFSA 5DH3A 1H26A 4MTAA 3NIEA 1WAKA 1GZNA 1UWHA 2PVNA 3ORPA 5D7VA 3LLTA 4AA0A 3BE2A 4CMOA 1NA7A 2BIKB 5EHOA 3HZTA 3P08A 4BYIA 4YZ9A 4CXAA 3R83A 3VHKA 3U54A 2W96B 2HIWA 2QLQA 1K2PA 3VBVA 2PE1A 2ZV8A 4DA5A 5DMZA 1BI8A 4E5WA 2J0IA 4HGSA 4YBKA 3A7GA 3CXWA 5CI6A 2PVJA 1VEBA 2R2PA 4JRVA 1OUYA 3FZRA 4JBVA 3POOA 3FYJX 4II5A 4NKSA 5E9EA 2PVKA 3BHTA 2FH9A 2BRNA 3KF7A 4FTTA 2VU3A 3GQLA 4CFMA 2J0KA 2W5HA 3RCJA 2EB2A 4EYMA 5E8XA 4MXXA 4XV3A 3I6WA 3PJ2A 4IVCA 1YXUA 1QPDA 1UA2A 3ACKA 1M7NA 4QMWA 3EFWA 4QNYA 4TWCA 4GG7A 4JBQA 4MBJA 3RJCA 2JIIA 4OTGA 4DN5A 4ZJVA 1LP4A 3PXRA 5IQBA 5CXHA 3NW6A 2V55A 3H9FA 5BYLA 2CGWA 4RIXA 2V62A 3K5VA 4R7IA 5A46A 3QRKA 2VNWA 4L01A 3UIMA 3E63A 3SAYA 2XNNA 3UZPA 1R3CA 3HV3A 2W1CA 4LMNA 4IDTA 5GZ8A 4BRXA 5C9CA 4C4GA 3IGOA 4E1ZA 3PP1A 3V3VA 1PW2A 5HU9A 3C0GA 3K5UA 5JMSA 2YDIA 4LQMA 5HBJA 5F1ZA 3KN6A 5DE2A 4K18A 3V04A 5JN2A 4FT5A 5L2IA 3FMEA 2IZTA 2BR1A 5LARA 1UNHA 4YC3A 4CT2A 4D2WA 4MF1A 1WBWA 2BZKB 1QPJA 3MJ2A 5ICPA 3FMJA 5IH5A 5J7HA 5LVLA 5B7VA 2YEXA 4JLCA 1SM2A 4O1OA 4D5KA 3FLWA 4F64A 2OXDA 3FZTA 4I41A 2OU7A 4I4FA 1YOJA 3E93A 3Q4CA 3EQIA 2EU9A 2VWIA 3EJ1A 4DFUA 4FODA 4E6QA 2ZB0A 3AOXA 3EN5A 1V0OA 3EN4A 3RP9A 1ZYSA 2O0UA 1PY5A 5ANJA 1PJKA 2CHLA 4PNIA 2OK1A 3NWWA 2C0TA 1YWVA 4FIGA 4PQNA 3R8VA 2ERKA 2IWIA 3F82A 4R8QA 4EK8A 3EFJA 2UW3A 2WTKB 1U5QA 4BZNA 3R00A 5LVPA 2VWZA 3CD3A 3MFUA 4C33A 2UZWE 3JPVA 5I9WA 3UDBA 4E6AA 2XM9A 4HYIA 3ORKA 1YXVA 3BHVA 4FTUA 4J7BA 2YIWA 4JQ7A 1H1WA 3CQUA 4M15A 4RA5A 3ETAA 4EBVA 2WMBA 4AGWA 3OTVA 4J53A 1Y6BA 4KAOA 3DJ7A 4BWKA 5I0BA 5HU3A 3QQKA 2QOIA 4R5YA 3NSZA 3VF9A 3IS5A 2WMWA 5EH0A 4BDBA 4PPAA 4BWPA 5M4FA 3FKOA 1M2PA 1R39A 5J1VA 1M2QA 4F9BA 2PVHA 2ZAZA 2W4OA 4W8EA 3H9RA 4S2ZA 2WAJA 3DTWA 4QQJA 4FKLA 3Q52A 3RWQA 3QRIA 3BZ3A 1OMWA 2RKUA 2R3FA 2Y0AA 4AW5A 2CDZA 4FA2A 2C3IB 3EN7A 5LMKA 3NAXA 3TJCA 5ITAA 3VS0A 2REIA 4YC6A 3UYSA 1QMZA 4TN6A 3BCEA 4BGQA 4B8MA 4O21A 3W2SA 4EHZA 3VN9A 3LFDA 3IK3A 2VV9A 3KMMA 4CKIA 5CASA 3TZ8A 4B7TA 3P1AA 4U5JA 4FEUA 3I0QA 5L2QA 3TKHA 4BY9E 2WMUA 5HGIA 3P79A 4TZRA 5HICA 1BMKA 3E92A 4TNDA 4Y5HA 4R3RA 3BWFA 4F6WA 1M52A 4NEUA 3R1NA 2NP8A 3UO6A 3GU5A 1YW2A 3O17A 2PZIA 2XM8A 1JLUE 5KNJA 4Z16A 4C36A 1WVXA 3IW8A 4BZDA 4CFFA 5EKOA 4FX3A 4CNHA 5DN3A 2QKRA 3O2MA 3GB2A 2XBAA 3H4JA 3ITZA 4FZAB 4NU1A 1XH5A 5DR9A 3FSKA 3VUKA 4EOKA 2J4ZA 4FGRA 4KKHA 3NYVA 3LVPA 5JGDA 3C5UA 5J5TA 1RE8A 2E9OA 1PHKA 4WRGA 3PVWA 2ETMA 2V7AA 5CVGA 3ZMMA 3S2PA 1I44A 2O65A 2YAAA 2GQSA 3NYXA 5E1EA 2NRUA 5JK3A 4NM3A 3V5TA 4C57A 3KQ7A 3KRLA 3DBDA 4U79A 5ETIA 4I92A 3D2IA 3VJNA 4AU8A 5C8NA 5IUIA 4IAFA 4CQGA 4XP0A 2CJMA 5AFVA 2XS0A 4QP7A 5HCXA 1V1KA 3O71A 4L8MA 3F2RA 3IONA 4HYSA 4BVUA 4USFA 2WIHA 1AGWA 2DWBA 4H1JA 1IR3A 5GNKA 3R7OA 2BMCA 1JOWB 1CM8A 1J91A 2V22A 2ETRA 4LG4A 2OFUA 3PXZA 2OH0E 1OKVA 3R63A 4H3QA 3W55A 2QG5A 3C4FA 4KBKA 3VO3A 3OY1A 3QWJA 1LR4A 4V01A 4XRLA 5EM5A 3W2OA 3ROYA 2W1GA 4AT4A 2O2UA 4BF2A 3DFCB 3ZM9A 1YI4A 1XBCA 4ENXA 4BL1A 3I4BA 4AWIA 4YTFA 2C0OA 4FSMA 4PMPA 3ENMA 3SXRA 4FC0A 3FC2A 2GHGA 1XWSA 4EH9A 5IQAA 1R0EA 3PP0A 2HZ0A 4QPMA 1OI9A 3QQFA 3Q5ZA 4PUZA 3HV6A 4RA4A 3P0MA 4NCTC 2R5TA 4YJVA 2WU7A 4ZTRA 3OP5A 3SRVB 3OOGA 1E1XA 2X0GA 5JRQA 1ZAOA 3KRRA 2RFDA 1H0WA 3LKMA 1HOWA 5K0KA 1PXLA 5A6OA 3KB7A 3OF0A 4ERKA 2J50A 3AQVA 4DLIA 4BKJA 3TACA 5CANA 4RX7A 4G6NA 4F65A 3A7JA 4FVPA 4L9IA 1FGIA 5CVFA 3EQRA 4IVAA 5AP7A 3RBWA 2ZM1A 1OKZA 2Y7JA 5B2KA 5CF4A 4DE4A 2P0CA 3ET7A 4J99A 3Q60A 4L46A 3CQEA 3QD4A 3EL7A 2JFLA 3PUPA 5EYMA 1SYKA 4PV0A 5C03A 3V5QA 4U45A 2BZIB 2QLUA 4DCEA 4PTGA 2G01A 4MCVA 5FM3A 4JL9A 1PMEA 2QKWB 3ZBXA 4YTIA 3T9IA 3Q2JA 4EK3A 4KIQA 5HG9A 4BR3A 3NVKI 2HW6A 3QGYA 4F7JA 1GZKA 5CT0A 2JBOA 4TL0A 5FQDC 3DV3A 5KMKA 4JX3A 2WEVA 2X8EA 4O86A 3RKBA 2Z60A 3BYOA 4LL5A 4Z9LA 4EH6A 4RIWB 3DXQA 3G15A 2W1HA 2ZB1A 2VNYA 3D5UA 1R78A 3TXOA 3OEFX 1CKPA 3C5IA 3D94A 2JKKA 3OTUA 3R8ZA 1OL2A 3RZFA 2GPHA 3B8RA 3KY2A 5IKWA 4DEGA 4OT6A 2IW9A 3MH2A 3QGWA 3QQJA 3Q32A 4L42A 4O1PA 5D12A 4W8DA 5CAPA 3ENHA 3FHRA 4NM7A 4Z7GA 5H3QA 4FIEA 2OF2A 4MD7E 2YISA 1H25A 2JITA 4KA3A 3PIZA 4NSTA 3MGYA 5H9BA 4QTAA 4XLIA 5CU3A 1AQ1A 4ENYA 3R9RA 4CKJA 2CSNA 1ZMUA 5GJGA 3GBZA 1YOLA 3H0ZA 1XR1A 3MH1A 3VULA 2E9NA 4A06A 4RFMA 4XRJA 5IEYA 4M0YA 4AZWA 5H8BA 1BYGA 5LJJA 2GHLA 4YU2A 3I7CA 1Q41A 1UKIA 3HV5A 3UO4A 2BILB 2WQMA 3HLLA 3PWDA 4FYNA 5IUHA 5LXMA 5M4IA 5M53A 4HCTA 4GKHA 4MXOA 3U9CA 5BVOA 4EUUA 4IZAA 4PDPA 3O51A 3LMHA 5IQGA 3R1QA 2I7QA 4YLLA 1U5RA 1WVYA 3B8QA 1ZMWA 5AP1A 2G9XA 3QYZA 5JFSA 1JKSA 1H8FA 4PP9A 5KX8A 5FM2A 2C1BA 5HTCA 3LFEA 3QCYA 1PMVA 4R7BA 2PYWA 2IVTA 4MX9A 5HTIA 5IA4A 2B52A 2IVSA 2CLQA 3FLZA 2E2BA 4QOXA 5HG5A 5HG8A 4FIFA 2B9FA 5JQ8A 3CTJA 3RGFA 4BGGA 3Q04A 3VVHA 4HVIA 3NUXA 2ITYA 3IDCA 4TWNA 1LUFA 3W8QA 4CZTA 4ZP5A 3EHAA 4YPSA 1YVJA 3LXPA 4DG0E 4F9YA 4ACGA 2XJ1A 3DJ5A 3RM7A 5GJDA 3Q6UA 3Q9WA 5FTQA 5AM6A 4KIKA 1M7QA 2JC6A 3TIZA 4MEDA 4AG8A 5AWMA 1YDTE 2BDWA 4L6QA 1MRYA 2Y4PA 1PXPA 1VR2A 4IIRA 3W32A 4B8LA 4F4PA 2PUPA 3C0HA 2BFXA 3AD4A 3ZFXA 2P55A 2X7FA 4TNBA 4OAVB 2YN8A 3FZ1A 5KMNA 3SA0A 2FYSA 2PU8A 3RVGA 1P14A 3OXZA 2W4JA 4X3FB 3MTFA 4FBXA 3PSBA 5I3OA 3TUDA 3EB0A 5E92A 2VWBA 3KKVA 4P5ZA 4RC3A 3FXXA 2YHVA 3HEGA 4HYUA 2PVRA 5L8JA 3MY0A 3COKA 3LFNA 3AC1A 2JIUA 5AA8A 3FI4A 3QCSA 4EH5A 4ZSJA 2YLFA 1JAMA 4IX3A 3GU8A 4B9DA 5IA1A 1Q3DA 3F61A 4DFNA 1H27A 1A06A 4I6QA 4LGGA 2BPMA 4PMSA 1G8SA 4E4LA 3ZZWA 4FTNA 4TTHB 5F20A 4BIEA 2ZYBA 3SXSA 2BTSA 1U54B 2P33A 2B1PA 2CGVA 4O7SA 5J9LA 1FOTA 3ELJA 4EH2A 4F9WA 3UZTA 3RMFA 5D1JA 2P2IA 2IZUA 4QMOA 3HUBA 3FQHA 4D2VA 5TE0A 5IZFA 4RIXB 2XIZA 2IG7A 2G15A 4IE9A 5DYJA 3QQLA 5AV1A 3VS4A 5K4IA 2OXXA 4IVBA 3NS9A 4IWQA 3NCGA 5J87A 3LJ1A 2CN5A 1P4OA 3A61A 2A2AA 3ZUTA 2PVFA 4WUNA 4YC8A 5HVYA 3NUPA 2W1IA 5J9YA 1J7UA 3F66A 3ERKA 4CLIA 5M09A 4C3PA 3LW0A 5HE3A 2VX0A 4FV9A 3NNXA 1YRPA 4ZY4A 4GU9A 4RC2A 4FKVA 2PZRA 4DITA 2X39A 4XG2A 5HE2A 4M13A 4J8NA 2C6IA 3PXYA 4Q5EA 3UPZA 4WT6A 2XNOA 5AA9A 4ARKA 3UQCA 2F2UA 4DBNA 4NM5A 4YJQA 4DGOA 3W2QA 5B2LA 3ORTA 4KINA 4Q5HA 3ORNA 3HDMA 2VUWA 4JRNA 3HRCA 2ZV7A 3U9NA 4YJUA 4KS8A 4LRJA 4XG6A 2QD9A 2GNJA 3QYWA 2V5QA 3OOMA 3QCQA 4JR7A 3V01A 1FQ1B 1IAJA 3D0EA 4U81A 5I9VA 2WTIA 3PY3A 2DYLA 5A4CA 5IPJA 1UU3A 3QRUA 4M3QA 3GC7A 2NRYA 3M42A 4FL2A 5H2UA 1KE6A 2R0UA 3MVLA 2WD1A 2PMIA 3MN3A 1FVRA 4I23A 4WHZA 4U0IA 1XKKA 3A8XA 2H8HA 3HDNA 4KB8A 2QQ7A 2XK8A 4FMQA 4FZ6A 4P7EA 2OI4X 5GZ9A 4OBPA 3R30A 3GFEA 4ITJA 3KXZA 2XYNA 3L9PA 4HZSA 3PA5A 3BX5A 2OLCA 3VJOA 4CZYB 5FLFA 5AX9A 4DLJA 2EXMA 4K11A 5HNGA 3SG9A 2QURA 3G9LX 5FD2A 3Q5IA 3EZVA 4ID7A 2VWUA 3W2PA 2ZV2A 2IW8A 5BVNA 4NCTA 1W7HA 4ACCA 4X21A 4M7IA 4A9TA 3FY0A 2V7OA 5A6NA 2H96A 4BN1A 4AW1A 2EWAA 2UW0A 3OS3A 5H8EA 4MK0A 1MRUA 3O23A 5BVKA 3UP2A 4FKSA 2Y4IC 2ETKA 4ANNA 1BI7A 5CTPA 3ZHPC 4FYOA 3WF5A 5J79A 2QONA 4BDKA 4L45A 4RVLA 3PVUA 4W4YA 3IW4A 2ZM4A 4OTPA 2YITA 4GIIA 4BDJA 1OPLA 5HO7A 3E7OA 4IAIA 4ITIA 4ZZOA 3VC4A 5A54A 4L3LA 4C38A 4D0XA 3AMYA 3PPJA 3BV2A 4M68A 3UMWA 2X2LA 3WIGA 3OXTA 4RWLA 2PHKA 4BB4A 2B55A 3P9JA 4MXYA 1PXNA 3ODYX 5HORA 1Q97A 1KOBA 3IW6A 4UMQA 4PF4A 5L3AA 5I9YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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