4G9CA

Human b-raf kinase domain bound to a type ii pyrazolopyridine inhibitor
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
276
structure length
265
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Pyrazolopyridine inhibitors of B-Raf(V600E). Part 4: Rational design and kinase selectivity profile of cell potent type II inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
total genus 64
structure length 265
sequence length 276
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4g9cA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4g9cA01
1YDRE 2VWZA 4OTFA 3P86A 4M8TA 3GU4A 3PXZA 3VUDA 3FKNA 5F9EA 3UQFA 3OWLA 5AP6A 1PXPA 3UMWA 3HEGA 5IU2A 3TDWA 4ZTQA 3RBWA 4S33A 2G01A 2JDRA 3EHAA 3TTIA 4F7SA 3OW4A 4I5CA 3RI1A 2XM8A 4HJOA 4LYNA 1KE8A 3O7LD 5HHWA 3VF8A 2VZ6A 2YHVA 2ZV9A 3QRUA 4LOPA 3ZTXA 2HXLA 3COMA 3L9LA 2XNOA 2VTTA 3A2CA 1H00A 3H10A 4GG7A 4KIOA 1JWHA 2EVAA 4PMTA 3F61A 4W4VA 5HG7A 4QYGA 2RG5A 3MTFA 3OCBA 1PKDA 4AGUA 5HVJA 3PVUA 4NJ3A 5GHVA 5J7HA 2BRBA 3ALOA 4O2PA 4DFZE 1OI9A 3OEFX 4USDA 3V6RA 4FOCA 3F3TA 2ZM4A 3P5KA 4MD7E 3MYGA 3OOGA 4A9TA 4CGAA 5CVHA 2X6DA 3OCGA 3ORIA 2AUHA 5DEWA 4FSTA 3W2SA 3G0FA 5KMLA 3NEWA 1UV5A 5A6OA 3ZU7A 4WD5A 3N9XA 2QG5A 2X8IA 3QHWA 5JKGA 4PMPA 3HDNA 5K0XA 1YXXA 4R78A 4G6LA 1CSNA 4F6SA 3A61A 2OFUA 4O81A 2CMWA 5CQWA 4NYEA 2WGJA 4XG8A 3W32A 3C7QA 4DLJA 3LQ5A 4EOSA 4N4SA 4MWIA 2IZSA 2BAJA 2PVLA 1LP4A 5AIKA 4ZJJA 4EK6A 5FUTA 5L8KA 1GZ8A 4RQVA 4IXPA 3RM7A 4C38A 4U3YA 4IFCA 4Y85A 2HZNA 4DTAA 1OPJA 3BHTA 3DBQA 3DAEA 5BVWA 5HKMA 1IEPA 4GU9A 2O8YA 5FWKK 4D5HA 4DH7A 1ZOHA 4UXQA 3KN6A 2VX3A 4RIXA 3OT8A 4GJ2A 5L2QA 3SDJA 1BL7A 3DLZA 4A9RA 4EWHA 3OF0A 3GEQA 3NUXA 3OUKA 3AG9A 4KIPA 3GFEA 3R73A 5G6VA 1REKA 1F0QA 4IBMA 3TKIA 2BHHA 5JQ5A 2UW8A 3BV2A 4TYGA 3VS5A 5DR2A 5FRIA 2PVYA 4XP0A 3W55A 1FMOE 3A7GA 3K3IA 4JBOA 4IAYA 2Z7RA 5T6KA 1PJKA 2GFCA 2RSVA 4EL9A 5JQ8A 3DCVA 3FZTA 4AOJA 4D1ZA 5L2SA 5HO6A 3NDMA 4CKRA 2B1PA 3T9IA 2J5EA 4XX9A 2BCJA 4YPDA 1GZKA 3LCKA 4NM7A 2B9FA 3QUEA 1V0OA 4F9WA 5JZNA 2X7GA 2BPMA 3UODA 3WF5A 1WVWA 5ANGA 3TKHA 2WMWA 3ZS5A 4EOJA 4O7YA 5DR9A 3E7VA 5K0KA 3UPXA 4EH3A 5A4TA 5CEQA 4TRLA 4BI0A 4ZSLA 4D1SA 5A4CA 2PUIA 4GVJA 3BHVA 4ZSAA 4FSWA 4M97A 3DDQA 2UW9A 4JI9A 4I1ZA 3KREA 1HOWA 5E90A 5HO8A 2W5AA 3NNXA 2JIIA 4G3DA 3QQFA 2Z8CA 3AC5A 3KK9A 3PXYA 4I93A 4YJQA 4FEXA 2Y0AA 4OLIA 4S30A 3F3VA 3QUPA 4I21A 4RA4A 4OT6A 2OW3A 4S31A 5AEPA 1RE8A 4IDVA 2WTVA 3FZSA 3HL7A 4ZMEA 3EQFA 4F1OA 2HYYA 3AGLA 3FMDA 2GHMA 2XIXA 4ASDA 1BUHA 1OBGA 4LV8A 4XG7A 3HDMA 2XK9A 4BDJA 3MH1A 5HG5A 4AOIA 2IZTA 2J9MA 2AYPA 5M4FA 5E4HA 3NW6A 4BCJA 3LIJA 4QMOA 4H3QA 3R04A 4JRNA 3ZRMA 4BDFA 1OVEA 5LVNA 2I0EA 3NYXA 4CFNA 3ZEPA 2B4SB 2YM4A 2HK5A 3F2NA 3O0GA 4I6QA 4BCHA 5KMJA 3DXNA 3M1SA 3C0HA 4RMZA 5HCZA 5AFVA 3SV0A 3CCNA 3RKBA 2G15A 3KXGA 4W4YA 4BYIA 3QL8A 3C4ZA 3U51A 3QTUA 4PL3A 3IW7A 4OTGA 5EYKA 3G90X 4R3PA 2P55A 2VWWA 3RCDA 3BI6A 3MFTA 2JKOA 2O3PA 4CYIA 3R30A 4KRDA 4F9BA 4EYMA 3PFQA 3G51A 5TKDA 2BZJA 2P0CA 3L1SA 2BKKA 3TDVA 5CAUA 3V6SA 2PYWA 2WD1A 5DEYA 5BYZA 4CRSA 1F3MC 1NVSA 5IMXA 1GZOA 3DA6A 2E9UA 3ZZWA 4WIHA 3WYYA 4DGNA 4Q9ZA 4HVGA 4YC3A 3MIAA 4PPBA 1DAYA 4C2VA 1SM2A 5H8BA 3C4XA 2V5QA 2F7ZE 2JAVA 2PMLX 2QU5A 3FWQA 3EQPA 4H3BA 4OTDA 3BQCA 4GMYA 5AIRA 3H0ZA 4DH8A 2W17A 3BBWA 4IDTA 1OPLA 2QOCA 3MH0A 2VWYA 3I60A 3QQGA 1YWRA 1FGIA 2Y4PA 4NKAA 5CEOA 5HOAA 3W8LA 4EZ7A 2IZUA 4Y5HA 3P4KA 4F64A 4NSTA 4PDYA 4BDKA 4BBEA 2F7EE 1REJA 3DB6A 3ZM4A 3FQSA 3QXOA 2XRWA 5BUJA 2WIPA 1YXSA 2I1MA 2QOOA 4E93A 5B0XA 2Y4IC 3POZA 5HVYA 3NZ0A 1E1XA 4ALWA 2ITZA 3U6HA 4G5PA 4NTSA 4HVSA 4E1ZA 4E6QA 2OXDA 1G3NA 4FIGA 4RFYA 5DT4A 1QL6A 3NW5A 4FKVA 3F6XA 4MF1A 4C4GA 5CTPA 4K1BA 1OECA 3GXLA 2CKQA 1M14A 3TT0A 3UGCA 3F2AA 3N51A 5F94A 3SOCA 2HZ0A 4C3FA 1YKRA 3DBEA 5CZIA 3I7CA 4F9CA 3H30A 4M0YA 1H1SA 1M2QA 1XH4A 3R7UA 5HCYA 2WU6A 4DBXA 3VQHA 4BDHA 4QPMA 4FGRA 2CKEA 1ZZ2A 5J1WA 2PZPA 1XH9A 4GK4A 2UZNA 2HOGA 2VWVA 3RVGA 5FEEA 5J5SA 5LXMA 3LFQA 4RGJA 5M4IA 4UZDA 4PMMA 3KRLA 3A7JA 4ZZNA 2ZM1A 2E2BA 5I9XA 2WHBA 4N70A 5J95A 3UNZA 4DG0E 2B7AA 4XP3A 3UIXA 3TJDA 1O6KA 3N4UA 3P0MA 4O0YA 4ARKA 4E4NA 3NRMA 3SGCA 3PIXA 5FBNC 2XBJA 4FV2A 3ZSIA 4HZSA 5A9UA 1PMEA 4K33A 2YITA 3O71A 3QD3A 4JG7A 4NM5A 4YC8A 2CHLA 3HX4A 1OPKA 4ITIA 3DV3A 1JSTA 4KIKB 2YCRA 2R7IA 4FKQA 5AAFA 4HCTA 4ZTHA 4BDBA 3PY0A 3RWQA 3VQUA 3OS3A 4BR3A 4KB8A 2ITXA 4AGCA 1Z5MA 4WSYA 5M4UA 2PZYA 1WBSA 4EHZA 3NCGA 4M84A 2ITQA 4X6RA 5KCVA 5L6WL 2XM9A 4UMQA 3QHRA 3QQUA 3ROYA 2FO0A 2WAJA 4FBXA 4O6LA 4D1XA 2Y7JA 1IA9A 2ACXA 3BEAA 3EFJA 4LL5A 3KEXA 2RFSA 3G9LX 4ZIMA 2J0JA 2P4IA 1E1VA 2UW3A 4ZY5A 4E20A 3KB7A 4QQTA 3SG8A 1ZYCA 3RWPA 3VW8A 1ND4A 3R8MA 4CMOA 4H39A 5HIEA 1ZMWA 4J53A 5M56A 3SG9A 4DFLA 2QR8A 4C57A 4BTJA 4TT7A 2GNLA 3LFDA 3PRFA 5BX0A 4YLJA 3ENMA 4N6YA 5AR4A 4MD8E 4Q5HA 4R5SA 3LCSA 3VN9A 5L4QA 4LOOA 4IH8A 2RG6A 3VAPA 2Q0BA 5LWNA 1V0BA 3KRJA 1ZYLA 2W1EA 3KMUA 1LR4A 4G6NA 1XH5A 4RX9A 2X8EA 3ZZEA 4AG8A 5DRBA 4PQNA 3OCTA 5DVRA 5HD7A 3LFSA 4OTHA 1MQ4A 4W4XA 3QUDA 4KIQA 2XKEA 1OIQA 4JJRA 3V5PA 2OIQA 2UVYA 1YXUA 4D2PA 4CNHA 4F7JA 1OL7A 2G2IA 3LM5A 4NH1A 3V8WA 3COHA 3D5UA 2GNFA 1JSUA 2E9VA 3Q4TA 2W4JA 3FPMA 1J7IA 4MKCA 2HWPA 2ERZE 1OKYA 3MH2A 3LM0A 2QG7A 1H8FA 4MX9A 5EM7A 1XBBA 1PF8A 3DDPA 1Z9XA 3GP0A 4L43A 1TQMA 5BYLA 4BC6A 2WQBA 3LE6A 3NR9A 3OWPA 4HYIA 4BWKA 5HX6A 3N4VA 4A9YA 1OUKA 3A7IA 1W7HA 5DMZA 3U55A 4FT0A 5JRSA 3AMBA 3D4QA 3RPVA 3WZJA 1IASA 2R3LA 4XCUA 3R1YA 3MBLA 4C35A 4GS6A 2WKMA 2BMCA 4FKIA 1XH8A 3VUHA 3F3WA 3PJ1A 5KMKA 5L3AA 3S95A 2XCHA 3I5NA 4B7TA 4G3EA 4LL0A 3KRXA 3HLLA 5ANOA 4FT5A 4BCIA 2X2KA 4RX7A 4V04A 1GIIA 1ZY4A 1WFCA 3EZRA 4QMXA 3TUBA 3DXQA 2B9JA 2ZM3A 3FL5A 1FINA 2X4ZA 5I9YA 4PV0A 2J0MB 3R71A 4E6DA 4ZY6A 3OT3A 1H1QA 4L68A 4Y83A 4ENXA 4RSSA 2GS7A 2VU3A 1YOJA 2YAAA 1OGUA 4FSZA 4EH2A 3PLSA 5LVOA 3IGGA 5BUEA 3IW8A 4AZFA 2HZ4A 5A6NA 3E87A 5D1JA 3NGAA 2BR1A 4EK4A 2V55A 5AWMA 3MB6A 4BVUA 4WNKA 4YJOA 3F3UA 4F7NA 4X6QC 5KO1A 4Z7HA 4YLLA 3LZBA 3GT8A 4MXCA 1VZOA 2V7AA 3TWJA 2PPQA 2XIZA 3BKBA 3KCKA 4WRSA 2R0IA 2H34A 2HY0A 4AE9A 3KC3A 4GV1A 5HNBA 2VO7A 3OTVA 2WTKC 2YAKA 3FLZA 4TYIA 3SW4A 4L3LA 2QOFA 3UIUA 1H4LA 1P5EA 1YHWA 3BRBA 3E62A 4XG3A 3CTHA 3K54A 4D4SA 5HVKA 2W9ZB 5AR7A 5M53A 2VTRA 4JVGA 3R8VA 5IQGA 2XCKA 4IEBA 2X39A 3S4QA 4BKYA 3ZRKA 4UZHA 3QD4A 1MRVA 2XK3A 5KE0A 4DH3A 3Q9WA 1QPCA 2QKRA 3UVRA 3UE4A 4F0GA 5IA1A 2OJGA 3BQRA 3CKXA 3LFAA 3TV7A 3EFWA 4KSPA 3LQ8A 3E88A 1H28A 2OU7A 3AGMA 2FVDA 1KE5A 3MY5A 3O23A 2R3PA 4FR4A 4FSUA 4LG4A 4QMUA 5B2LA 5C8KA 3AT4A 4ANMA 4MEDA 4JRVA 4F9YA 3VBQA 5A4QA 4RVTA 3GQLA 2ZDTA 4RJ6A 4FKGA 5KZIA 5IH5A 5CAVA 4IWDA 3QX4A 3UYTA 4EBVA 2PVJA 2JD5A 3CJFA 2RKUA 3CY3A 3QLGA 4E5WA 2Y8OA 5I5ZA 2C3LA 1UWJA 2PE1A 4FZFB 4E8AA 3R2YA 4YTFA 3PJCA 4RJ4A 4YGAA 2C0IA 4RZWA 4LQMA 4KIKA 4FSRA 3Q96A 4DG2E 4R77A 3D2IA 3RK7A 5IQDA 4U43A 4YHTA 4E3CA 3RHXA 3ULIA 2VWIA 3QF9A 1ZZLA 4I0TA 1GOLA 4IMYA 3EN4A 4K77A 5ANKA 5CEMA 4X3FB 3QQKA 4Z3VA 3CSVA 1PXJA 4O0SA 1U54B 5HBEA 3C5UA 3SD0A 1Q24A 2WELA 3PZHA 4PF4A 2W1FA 2PMOX 3C4WA 4P5ZA 3S3IA 4EKLA 4PUZA 4QMSA 2CPKE 1UU3A 4AACA 2GHGA 3ZUTA 5KMIA 3RGFA 4FTKA 4YNOA 3JPVA 1P14A 5HORA 2OGVA 2IVUA 1JOWB 4MQ2A 4FIIA 3AC2A 2C6EA 4ACHA 4EOMA 3DZQA 3LKMA 3CR0A 4MWHA 5C26A 1TVOA 3G6HA 4EH6A 3AMYA 4DCEA 1YDTE 4F6WA 5DWRA 5AUZA 2OXXA 3GUBA 3H9RA 4L42A 5A46A 3AC4A 4D9UA 4F0FA 3FMKA 4XLIA 2LGCA 2O5KA 4X2KA 4IADA 2H8HA 3HRCA 3NX8A 4ASXA 2EU9A 5DH3A 4TKSA 2C0OA 2YIXA 4AZTA 4EC8A 2QOQA 3RPYA 3QA8A 5HE3A 4D28A 1GAGA 4C0TA 3Q32A 4K8AA 5IUIA 2WU7A 1R0PA 2IW8A 4NFNA 3SLSA 3VS2A 4BY9E 3E92A 2DYLA 3P7AA 4RFMA 3SXFA 1M17A 5HE1A 1O6LA 2PUPA 4I5HA 1NXKA 2ETKA 4OBPA 4DGOA 2YWPA 1KE7A 3QU0A 3GFWA 3RAKA 3W2PA 3FQEA 4ANLA 4ANQA 4C58A 4IAAA 3U4UA 3AC8A 4WOVA 3VJNA 2W5HA 3CGOA 2YDKA 5H8GA 5KHWA 3S0OA 3TI1A 4ITJA 3LFCA 5H2UA 4MXYA 1J1BA 3BE2A 4QD6A 4C3PA 1CTPE 4IVBA 4IJ9A 2R5TA 5K5XA 4G16A 5K5NA 4RWLA 3O8UA 4LM5A 4F9AA 2XYNA 5C1QB 5J5TA 4IZ7A 5DYJA 3QCYA 4FG8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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