4GEOA

P38a map kinase def-pocket penta mutant (m194a, l195a, h228a, i229a, y258a)
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
347
structure length
326
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLATRWYRAPEIAANWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDAADQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNAIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title P38a MAP kinase DEF-pocket penta mutant (M194A, L195A, H228A, I229A, Y258A)
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 109
structure length 326
sequence length 347
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-08-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4geoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4geoA01
3SA0A 2PY3A 5M55A 4AZTA 1QPDA 3KREA 4U80A 2QG7A 4LMNA 4RFMA 5ETCA 3C50A 2VWXA 5CF5A 2ITNA 4NTSA 2I1MA 3IECA 5FM2A 5HLPA 5JSMA 2RL5A 1WZYA 3BPRA 4YZ9A 4FF8A 4KIKB 3KXZA 4X3JA 2GFSA 2F57A 3HP5A 1KOBA 3FLSA 4KNBA 4RX9A 4B4LA 1JAMA 2ITZA 3BLQA 2XNOA 2YJRA 3LFFA 4QMWA 3UVQA 2V0DA 3VIDA 4QMSA 4FUYA 4FV2A 4OTIA 1B38A 2PZRA 3MH3A 4MK0A 2OZAA 3W2QA 4L53A 3TTJA 2Q0BA 2GQRA 3KFAA 3N9XA 4S31A 5H8EA 3D5WA 2C6LA 4I6FA 1S9JA 2FO0A 5H8BA 3GI3A 4TXCA 1STCE 2R3RA 5EW9A 2W96B 3D7TB 4YBJA 1UU7A 3M2WA 4GUEA 3ZSGA 5EOLA 5LMKC 3OY1A 5IUIA 1IASA 3HDMA 4OTPA 2P4IA 4IBMA 2IZUA 5AFVA 4UWYA 4XG2A 3LQ3A 2GS6A 3NNXA 2OXYA 3V04A 3EYHA 1Q97A 4YJTA 4HYUA 4AACA 5DG5A 3HKOA 3UVRA 1YXVA 5LCJA 4DLJA 5IEYA 3A7FA 5C01A 2R5TA 4EWHA 5HE2A 3V5TA 1H26A 4PRJA 4K9YA 2EXCX 1G5SA 2H96A 2UV2A 3COIA 4K33A 3ZXZA 5CU0A 3QZFA 3U8WA 2H6DA 3HRBA 3IOPA 2WELA 3JS2A 3P86A 4NCTC 4CFMA 4EOSA 4I21A 3TNIA 5M44A 5EW3A 4KRDA 3WIKA 3QD4A 2XK9A 5T68A 4AA5A 4ZSGA 3V6RA 4F9YA 3MH2A 2ERKA 2Y7JA 3UYSA 1H27A 5FDXA 4F9WA 2QOOA 2VTIA 4NTTA 3RHXA 4ZS4A 1BL7A 3S00A 2WIPA 2YJSA 5I9VA 1URWA 3JY9A 2HCKA 2ZB0A 1H01A 1PY5A 2GHGA 5GJGA 2CSNA 2EB3A 4BWPA 1QPEA 3E7OA 3MIYA 5GJFA 4FSYA 3NUAA 4L9IA 2J51A 4L3LA 1LR4A 2JIUA 4X2GA 1M17A 3B2WA 4X6QC 1Q5KA 4ARKA 1J7LA 5L8JA 2ZJWA 3C0HA 2V62A 2HWPA 3TKUA 4BTMA 3I5NA 4EEVA 4NKAA 4CVAA 1Y6BA 2BILB 4AZFA 5JK3A 2B0QA 4BCMA 5C27A 4FL1A 4ZY4A 3ZEPA 4PDSA 1R3CA 3F7WA 3NNUA 5HO8A 2C69A 1FINA 3EQCA 5KMIA 4D58A 4NEUA 2HAKA 4BBMA 4BL1A 4FKGA 2FUMA 3F7ZA 3LCKA 1V1KA 4EK8A 4TL0A 2CCIA 3DCVA 4Z16A 2R3FA 4O6LA 4IAZA 1IR3A 5IH6A 3I81A 2UZDA 3TDVA 4CFWA 2OZOA 3LFDA 1CKPA 3QYZA 4O2PA 3CCNA 1KV1A 5KKRC 5DFPA 4ASXA 1RE8A 4FIGA 3CQEA 1V0BA 3ZLYA 5EQPA 2PMOX 4EK4A 4R1VA 5HG5A 4C4GA 1KE5A 3CD3A 3UQGA 2BUJA 2QI8A 4MVFA 2F2CB 4J95A 4XCUA 4BFMA 5JFXA 5I9ZA 2OI4X 5IQBA 2XBJA 4BB4A 2VTRA 3MFRA 4IWDA 3QQUA 4XJ0A 4O0VA 1UU3A 2UZVA 2JEDA 4MXOA 2NPQA 4FIIA 3V8TA 4I5HA 1Z57A 3G2FA 3I1AA 1H25A 4FV6A 3NSZA 4WNMA 5JMSA 2GNHA 3R7VA 3PRIA 5M09A 4FV0A 4CRLA 4AZEA 2P2IA 2VTPA 3TV4A 4EQMA 5BX0A 1YWRA 1G8SA 5EHLA 1H07A 2ZV2A 4NT4A 3GQIA 4GK3A 1UNGA 3I0OA 2ITPA 3PXYA 4FTKA 4I4EA 1RDQE 4R5YA 3FKLA 3KKVA 1BLXA 3CEKA 4YPSA 4C0TA 4BDGA 3P0MA 1OIYA 2XJ2A 4LRJA 1OVEA 5LARA 2YA9A 4HVGA 1SM2A 2OKRA 4DGOA 4EOMA 3O7LD 3QZHA 3M42A 1YOMA 3TG1A 3QQLA 4JG6A 5IQFA 4APCA 2BTSA 4F7SA 4KWPA 1J7IA 1UKHA 5CALA 4OBOA 4JDJA 3HV6A 1YWVA 4O27B 3FMHA 4AS0A 3CBLA 5M51A 4KIKA 2IW8A 4UMTA 5J95A 5HBHA 3RAKA 4I0SA 2G9XA 2CN5A 3BBTB 3OHTA 4TKSA 4RIXB 5CEIA 2RFSA 2EVAA 2YDIA 4EOOA 4A06A 3S2PA 2P2HA 3F5UA 4FK6A 1MUOA 4O1OA 5IISA 5HICA 4PPAA 4EJNA 3ZFYA 3A7HA 5AAGA 2G2HA 3VUKA 2XIRA 3U9NA 4DFLA 2Y9QA 2X6DA 4FV1A 4FT9A 3LFNA 4IWOA 2GU8A 2J5EA 3D7TA 4FVPA 2BDFA 4OBQA 2A4LA 3ZFMA 4AU8A 3DNEA 5CAOA 3IPHA 4U79A 5LQFA 2F4JA 4YTHA 4WG5A 5DNRA 2W5AA 4LV8A 4FMQA 4BY9E 1OL6A 3BYSA 4GK2A 2WTDA 4YJSA 3QQGA 3EN7A 4QQ5A 4E6DA 5CXZA 3EFLA 4E6AA 3G15A 3FY2A 4RWIA 5IUHA 1JKTA 3OXIA 3PWDA 1NA7A 4IB3A 3DGKA 4RIYB 3CE3A 3CPCA 4XOZA 2UZLA 4QPAA 3VUDA 5F1ZA 4ZZNA 2FSOX 2O64A 2VTSA 3DAKA 1Y6AA 5AM6A 4Q9SA 2V55A 5JZNA 4AN9A 3L9PA 5GNKA 2W1FA 4RWJA 2XNGA 3FPQA 4YJOA 3UPZA 1B6CB 5DR9A 3BU5A 3CGFA 4RSSA 2QKRA 4XG7A 2GNFA 1YOLA 4NFMA 4QP2A 4RMZA 3RAWA 1TKIA 3VF8A 2OJFE 1PXJA 4XYFA 2EXMA 1Z5MA 3L8SA 3ZRMA 3WF9A 4LM5A 5HBJA 4BGGA 5JFSA 4FEVA 1A9UA 4ALVA 2CGWA 1BUHA 2VTOA 4QOXA 5BMMA 2C30A 5CZIA 2XB7A 3IW6A 5DEWA 3UIXA 1QCFA 2HY0A 3JYAA 3FMLA 3D5VA 2GSFA 4FZ7A 1H1WA 4AZSA 2VU3A 3K2LA 4XEYA 3ALNA 3ELJA 4FE2A 1OUYA 3VBTA 4PDYA 1FMOE 2V22A 4IAIA 3V51A 5BYYA 4AGUA 3H3CA 5JN2A 3QQJA 3OCGA 1OPLA 4K77A 4WG3A 4EH6A 1H0WA 2BPMA 4F08A 2UW9A 3Q5IA 4FKWA 2OXDA 2C1BA 3QFVA 3PXFA 3QCSA 4LUDA 3R83A 4D2RA 1OBGA 4ZLYA 1NVRA 3R00A 3RINA 5JGDA 4ZZMA 1JQHA 5AP1A 4QRCA 2EU9A 4ASZA 4TYJA 4HNIA 3R8PA 4CSVA 5FDPA 5L8KA 5C8MA 3RBWA 3GB2A 3FLNC 4EI4A 3GC8A 4DN5A 5CEKA 4LRMA 4GU9A 3FUPA 4B8MA 1ZYSA 4HNFA 3E3PA 4FKJA 4B9DA 4FKQA 4PNIA 4UX9A 4ZOGA 2BROA 2X7OA 4XG4A 3CJGA 3QCYA 4BDEA 5HVJA 1M52A 3NDMA 4DF3A 4GW8A 3NUPA 4UXQA 4DG2E 4JOAA 1T45A 2ONLC 5JKGA 4OAVB 2IJMA 1WBOA 4I6QA 4ALWA 5AV1A 5EI2A 3FMDA 4EL9A 4CV8A 1P5EA 4XUFA 4D2PA 2YFXA 2KULA 3H30A 4PPCA 4ENXA 4ANBA 1PXNA 4AW5A 4R3CA 2WTVA 3DA6A 2WHBA 5CEQA 3P7CA 1JKLA 4BN1A 5CAUA 2CNUA 3GENA 5C1QB 4IVDA 5BVEA 3PXKA 3NUSA 5L2IA 4L7FA 5J1VA 1H0VA 4Z9LA 2CPKE 3BHTA 3IGGA 4AP7A 5DRBA 4GVAA 3TZMA 3EQRA 5CEOA 4DFXE 4XV1A 4EOLA 1FGIA 3CTQA 3P9JA 2OBJA 5KBQA 3FZSA 3KC3A 4EWQA 1SVEA 3BEGA 2BVAA 2V5QA 5L2QA 4YJQA 3RALA 4A9SA 3EB0A 1MRYA 3MY0A 4NJ3A 3DKCA 3FLQA 4I20A 4QTBA 2OIBA 3K5VA 1REKA 3LOKA 3ZEWA 3VS6A 3E63A 3NYVA 4L3PA 3S3IA 4AN2A 4CMOA 4V05A 3C5IA 4QT1A 3UIBA 3L8VA 1T46A 4G3GA 3DB6A 5EYKA 4RIXA 3WZUA 5EQEA 1U54B 3O51A 1XH9A 4QMNA 4GYGA 4FTQA 3AT4A 1UNHA 3E7VA 4JG8A 4HVIA 2VTMA 4FIJA 4CYIA 4NFNA 4ALUA 3NRMA 4CMTA 3DFAA 1WCCA 3GFWA 1X8BA 1J1CA 4FSNA 4LMUA 2W0JA 4Y85A 2C1AA 1KV2A 3OT3A 3VS4A 1ZY5A 3RM7A 5FD2A 3V5PA 3AD5A 3GP0A 1NVSA 1OL2A 2XYNA 3FEGA 2XRUA 2VWVA 2W1HA 1DAYA 5L3AA 2PUUA 1PMEA 2XJ1A 4DA5A 4E4LA 2PZ5A 5IDNA 3KRLA 2QODA 2A27A 3LCTA 3OC1A 5HO6A 5I9XA 3CC6A 4DCEA 3QXOA 2P3GX 3SHEA 5M4IA 3ALOA 1YQJA 2OXXA 3LMGA 1PYXA 2YACA 5TE0A 4UB7A 1VJYA 3KL8A 4FT7A 4MBJA 4IVBA 4K6ZA 4EHVA 4QMZA 4KD1A 3TUBA 4CT2A 4RIYA 3HMIA 2C3IB 5ANOA 2A1AB 3FMNA 4F9BA 5KZ0A 5HTBA 3HV3A 2OO8X 2E2BA 2XK7A 3NNVA 2PZPA 4NUSA 4GJ2A 2A2AA 2VO7A 4G3CA 3ZFXA 2GDOA 4J96A 3G5DA 1ZZ2A 3IDBA 3MI9A 3MW1A 3QUDA 4ZJIA 3ZZWA 3R30A 5GIPE 4GG5A 1WMKA 1QPJA 4MTAA 2XKCA 4FL2A 2W1ZA 3REPA 1O6YA 5A4LA 3NEWA 3E93A 4H3BA 2XMYA 3RM6A 1KUTA 3QUEA 1UVRA 4BI0A 4FNYA 1OITA 4W9XA 3QQHA 4Y5QA 4HW7A 1W98A 3U6IA 3KMWA 5HNIX 1KE7A 3CLYA 3LQ5A 3VVHA 4BVUA 5HTCA 5E8VA 4XLVA 3DLSA 3U87A 4I92A 3LW0A 5AUVA 2UW5A 3SLSA 4GSBA 5GZ8A 4IMYA 1PYEA 4ANLA 2O3PA 2Y4IB 4PTGA 2OH4A 4IZYA 2ZMCA 3G6HA 5EM6A 2XUUA 4RJ6A 3R73A 5KMOA 4Q5HA 3OUNB 3AD4A 2CLXA 1H8FA 3KN5A 3PJ2A 4CMUA 4YMJA 3QYWA 3KRJA 4DFBA 4ANNA 2Z7SA 4FTJA 4DEBA 3U55A 3A8WA 4AA4A 2XM9A 2B54A 3LZBA 3HGKA 3LMIA 4KINA 5EM5A 4MBIA 1J3HA 3BZ3A 3NMUF 2YLEA 3LLAA 4KIPA 3FZ1A 4TYEA 1JWHA 3G0EA 3LJ0A 4XBUA 5DR6A 4DBNA 4OTWA 1FBNA 2QOQA 2YZLA 3I79A 3F3WA 3FZOA 3U4WA 3HAVA 2ZOQA 3C4FA 4AAAA 3IDCA 3OROA 5TOZA 4YZDA 3V3VA 4D4YA 1HOWA 1FQ1B 3UPXA 4M14A 3ULIA 3SQQA 4FVQA 5D9HA 2Y0AA 5EM7A 4KA3A 4YJRA 5HI2A 1ATPE 3SDJA 5FUTA 2WTWA 5AP0A 3QF9A 2ZMDA 5B2KA 1XBBA 4JAJA 4YC8A 3IW4A 1R0PA 3QBNA 4KBKA 5BMSA 1GIJA 4C61A 1OECA 4JX7A 1OIQA 4O7ZA 4F1TA 3CTHA 2WMTA 2CN8A 1JSTA 2P55A 2RKUA 3PY3A 2Q83A 3N51A 4BF2A 4U3ZA 2WTKC 4G6LA 1JKSA 5E8XA 2XZSA 3OBGA 3P1AA 4CKRA 4MBLA 3RK7A 3FBVA 4R5SA 5TT7A 3NIEA 3A7JA 4ONAA 3VW6A 1OKZA 3OCBA 4M7IA 5CNOA 5DT4A 2R3PA 4G2FA 3KULB 3PSCA 1GOLA 4EZ5A 2ITQA 3QGYA 4ENYA 3IO7A 4X6RA 3Q4ZA 3ATTA 4IQ6A 4O21A 2W9ZB 3KA0A 1B39A 4GMYA 5L2SA 3R01A 1YKRA 5LVPA 5D12A 4WUAA 4RIWB 4C33A 4EH4A 5A6NA 3KCKA 3R63A 4OUCA 4AFEA 3QLFA 5GIOE 2BRHA 4D2TA 4NSTA 4KUJA 3D0EA 2IVUA 2VTHA 4UALA 3V5WA 4CYJA 4FI1A 2F49A 2X1NA 4RX7A 3RAIA 2IWIA 2UZUE 3D2IA 2PSQA 5LWNA 1U54A 3ITZA 5F20A 2WMAA 4QD6A 4BYJA 2QR8A 1U5RA 5DWRA 4AOIA 2CGVA 3OTVA 4WBOA 3TUCA 3Q5ZA 3UQCA 3JR1A 2JITA 2A19B 2WQBA 1Q24A 4RX5A 3ZO3A 4FZFB 4ACGA 1IAJA 4MNFA 1YHVA 3UNZA 4EOIA 3TCPA 3VF9A 2EWAA 4OTRA 4PMMA 4L01A 4RVTA 5CSXA 5EYCA 5AWMA 3KU2A 4FEXA 2VGPA 2P33A 2R3JA 3WYYA 3ODYX 4L46A 3WZDA 5CXHA 2FA2A 2RFEA 1YDRE 5CEMA 4FYOA 3ZBXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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