4H1MA

Crystal structure of pyk2 with the indole 10c
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
271
structure length
256
Chain Sequence
IAREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKNLDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYLESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSLPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of novel series of pyrazole and indole-urea based DFG-out PYK2 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Protein-tyrosine kinase 2-beta
total genus 83
structure length 256
sequence length 271
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4h1mA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4h1mA01
3D5XA 4X2NA 5HOAA 3RBWA 1PMUA 3LCKA 4GT5A 4H3QA 5AIRA 4OBQA 1FINA 4BDEA 4FGRA 4GKIA 3GU5A 3M2WA 4FOCA 1O6YA 3OTVA 3Q9WA 4IZAA 3RVGA 4FR4A 3ZZWA 4OUCA 2VTQA 5J9ZA 5AR7A 5J87A 4A4OA 2R3FA 3A61A 3LFAA 3KK9A 4J1RA 5EI8A 2ZV8A 4IQ6A 4R1VA 2Z7LA 3KN5A 2PE2A 4B7TA 5FBOA 4CFXA 4W4XA 2WMAA 2GDOA 4M66A 2VO0A 2VWZA 3MS9A 4NM5A 5JQ5A 5HU3A 3QA0A 4M97A 2JD5A 2BROA 2VZ6A 3E92A 4EH3A 4FZFB 3QZIA 1FGIA 3T9IA 4PTEA 4AFJA 3R9RA 5AAEA 2J0KA 3G9LX 4KAOA 5JZJA 5LVPA 4AP7A 1AD5A 5AP5A 3HP2A 4IAYA 4BDHA 1BLXA 3O50A 2FGIA 3AT3A 3FJQE 5CSXA 3LOKA 5B2MA 5I3RA 2PZYA 2VNWA 3UP7A 3RI1A 4FV3A 3DQXA 2CHLA 2X81A 4ZSEA 4EEVA 1SVGA 4CG9A 4MYGA 1W0XC 3OWJA 4JRNA 4FT0A 2V7OA 3UVQA 4IZ7A 3RK5A 3I4BA 5I9XA 1WVXA 3BYVA 1JKSA 2QOCA 1ZAOA 4M68A 5CU4A 3BBTB 1XQZA 4JDJA 3COKA 3QHWA 3ZZEA 4CZUA 4IE9A 3O8PA 2CSNA 3QHRA 4HCTA 5LQFA 2C6DA 4MXOA 3NRMA 4LRJA 1WBSA 3UOLA 4LFIA 3Q2JA 3E7VA 1F5QA 3PXZA 3KXNA 3Q60A 3VS4A 1HCKA 4K6ZA 2QI8A 2XUUA 5E8VA 5TO8A 3PUPA 2W1IA 3Q52A 4O0YA 1ZYJA 4XG2A 3OBJA 4TWNA 4EONA 2R3QA 4FMQA 4Z7GA 4FZDB 5EDQA 2BRBA 2BDJA 3KRJA 3CY2A 3QUPA 2W06A 4LGGA 2OICA 3LMGA 4MWIA 5CAUA 3H4JA 2Y9QA 3OVVA 3KRXA 4WBOA 2BHEA 3OF0A 5JKGA 2FB8A 3C13A 3W10A 3UNKA 2ZB0A 4GG7A 4ZTHA 1XHAA 4FV8A 2WTWA 3QCXA 5JT2A 3ZC6A 1Q62A 4V05A 2CLXA 3OFMA 5IUGA 4E8AA 3FL5A 4JX7A 5A6OA 4CD0A 3LMHA 3QA8A 4U5JA 3PXRA 4G5JA 3FZ1A 3ULIA 5IH5A 4JR7A 3RZFA 3V3VA 1K3AA 1PXJA 4MXXA 3PA4A 4J8NA 2I0VA 5A54A 4O7LA 3I5NA 1PXMA 4QNAA 4FL1A 5DPVA 5EYCA 3EKNA 3PWDA 5KZ0A 4IC8A 2HW7A 3GUBA 1DAYA 2QOIA 4KS8A 4WNPA 5CU2A 4XG7A 3R9NA 4CMTA 4DG0E 4BCJA 3IKAA 2XIKA 1OUKA 2JFLA 2Y7JA 5HTIA 2VAGA 3I7BA 2UW8A 4FG9A 4CQGA 5GJFA 1W84A 3MFUA 2E9PA 2H6DA 3P5KA 4FL3A 4JAJA 5CAVA 1WBNA 3I0QA 2FYSA 2JBOA 3EH9A 3GQLA 5BX0A 3O71A 1H08A 5JK3A 4ITHA 4JQ7A 4BGQA 4FT5A 3TT0A 1QPEA 4YBJA 3ANRA 1XH9A 1IG1A 3OW4A 5DFPA 5HVYA 3TI1A 1A48A 1DI8A 4FSYA 2OG8A 4NFMA 1OIUA 3U51A 4ANNA 4TTHB 4IVAA 3TNPC 5JQ8A 1BKXA 5LOHA 4R7HA 1H1PA 3KY2A 3C4EA 4LMNA 4V04A 5A3XA 5HVKA 2QD9A 5L2TA 5CEIA 3KCFA 4GUEA 5LJJA 4XP2A 4AGWA 3NWWA 3MFRA 5CNOA 3S1HA 3TUDA 5AUVA 5M08A 3P23A 3GFWA 4HZSA 3BGQA 4E6QA 5HE3A 5JGBA 4AE6A 3HV4A 3ORIA 4BL1A 5ICPA 2GNGA 4EKKA 4DYMA 4DH5A 2Y4IB 4EJ7A 4FTTA 3CQUA 3MB7A 4M12A 4QP7A 5ANEA 1NW1A 3ZEWA 3OY3A 4HYUA 1ZYLA 4FEVA 3TM0A 2HXLA 2A2AA 4YTIA 5FM3A 3N4TA 3FZTA 3GEQA 2YLEA 2C6TA 1U5RA 4C36A 1UWJA 2Y6OA 4W4YA 4D1ZA 3FMNA 4RIXA 3FWQA 4Z55A 5EDPA 1M2QA 3I7CA 4O7WA 2B53A 2HW6A 4B99A 3UIUA 3SW7A 5BQ0A 5CEKA 3EQDA 4YO4A 1YXTA 2WQEA 1LEWA 1U46A 4EH2A 3UYTA 5E9EA 1J7IA 5FM2A 1H26A 3OUKA 5E4HA 4H39A 4R1YA 3PRFA 1H1WA 3Q4TA 1APME 4ORKA 1Z9XA 4RT7A 4GT3A 4ZAUA 3MW1A 3ZCLA 2C5OA 1IA8A 4IM2A 1G8SA 4RVTA 2ONLC 4JQ8A 4IH8A 2X1NA 1T46A 3PXFA 4WG5A 5CWZA 4BIBA 5EQEA 4DC2A 4PNIA 5HD7A 3MSSA 4FIFA 4QMVA 1L8TA 1JPAA 3KULB 2JC6A 2YIYA 3N9XA 4FNYA 4RX9A 4RX8A 3RP9A 5HCXA 4KSQA 3E88A 1RJBA 2RG6A 2IVSA 5CQUA 3R8MA 3ZU7A 4OTWA 3RM6A 4RWJA 4XHKB 3EQFA 3EQHA 3W2PA 4GS6A 5I3OA 2R3JA 2WOTA 3HMIA 3QF9A 3TZ8A 4KIKB 4WKQA 2CKOA 2ZV7A 3A99A 2OXDA 2NNWB 2WMBA 1KOBA 3CE3A 3BIZA 3DNEA 3FC2A 2PVRA 4IWPA 4U40A 4UXQA 3SXFA 2YM7A 5DE2A 3GOPA 4BBMA 3U6IA 4QMYA 3SOAA 3MJ2A 4NJ3A 1CKPA 2CPKE 2CDZA 4YHFA 3GVUA 4EYMA 2PUUA 1Q97A 4NCTC 3AC1A 4FOBA 3LQ8A 3PVBA 4TYHA 4R6VA 4D2TA 3HVCA 1H24A 5BYYA 4QO9A 3VS1A 5CSPA 4U8ZA 2PVFA 4CG8A 3BZ3A 3HRFA 3QYWA 4Y85A 4GUBA 4BI1A 4F7LA 2PHKA 2Z2WA 5BUEA 2VGOA 3KREA 2G01A 5FDXA 3QXPA 2ZYBA 3CD8A 3W2OA 5CF6A 2WB8A 4HVDA 3OCGA 4JVGA 2QU5A 2OK1A 4IACA 3CTJA 3IW5A 4HYHA 4PL5A 1YHWA 4QOXA 3HRCA 4A4LA 4ZZNA 3CPBA 3TZ9A 1V0BA 2GHMA 1AGWA 3MFTA 4G3GA 4GRBA 3VUIA 3ZO4A 2B0QA 2WTJA 3FBVA 3KXGA 3PXQA 4FIHA 2VTHA 1NY3A 4HOKA 4KBCA 4AZFA 4RVLA 2X4FA 4AT3A 3L8PA 3JYAA 3PA5A 3Q5IA 4WO5A 3HV5A 3ZFXA 3V8WA 2YCSA 4BI0A 1R0PA 3OT8A 2V55A 2PK9A 4I93A 4CLIA 4JJRA 5AV0A 3G15A 3KMUA 5GJDA 4J8MA 3H9RA 3OWPA 2WMRA 5HESA 4USFA 5G1XA 3RPSA 4AN3A 3D4QA 5EH0A 4H05A 3PVGA 4CFVA 5DH3A 5HNIX 2XBAA 2Y4IC 2B9JA 5C8NA 2R3LA 3UC4A 4DGMA 3VS5A 4E73A 5ANDA 3BU3A 1Z57A 4J95A 4LG4A 5LMKC 4RVKA 5EKNA 3DAJA 4G3CA 3FMEA 4OT5A 2X9EA 4JI9A 5CAQA 2BCJA 3E5AA 3NUXA 4HNIA 4PMMA 1Z5MA 3QC4A 3EQIA 3TACA 3HGKA 3DU8A 3P08A 4R8QA 3RWPA 1YOLA 3UQCA 3WE4A 3A4PA 4RLKA 3PDTA 2XJ2A 4LQMA 4DINA 3I6WA 1Q8UA 3VWAA 3CQWA 3FSFA 4JAIA 3T3VA 5HKMA 2UVXA 3NCGA 1XO2B 4G31A 4NSTA 3TNQB 5B2LA 4DG3E 1KWPA 2X39A 4G3EA 1OVEA 4NW6A 4I5PA 2CNUA 4O22A 1JSUA 3V51A 3PG1A 3LW0A 3SOCA 4YNOA 3QTRA 3NLBA 4FI1A 4BTFA 4DTBA 1OM1A 3NS9A 4YTCA 3Q9ZA 4APCA 1P5EA 1ZLTA 4LOOA 5AX3A 4MWHA 4RLLA 3UQFA 4DG2E 2HWPA 2O65A 1OKYA 3VW6A 5HO7A 3KVWA 2GNIA 4LUEA 2G2FA 2VWXA 4D0XA 4L3JA 5JEBA 2FSTX 1AQ1A 5CU3A 4ACMA 3PY1A 5KX8A 2QHMA 5AP3A 3TJDA 3V8TA 3FQEA 3WIGA 2ITOA 3O8TA 4CFFA 2PZIA 5L2IA 3MWUA 4PDOA 3F3TA 4AT5A 4QP6A 1JKKA 1TQPA 4FZ6A 4RX5A 4AF3A 4C62A 4IAFA 4AFEA 4LV8A 2YEXA 4BCPA 1XH8A 1WBWA 4H1JA 4C4IA 5KCVA 1IEPA 3NR9A 3O51A 3P1AA 4OBOA 5JMSA 2VTAA 1OB3A 3QTSA 1V1KA 2JFMA 1PY5A 1J3HA 4IAIA 3F3ZA 4FTQA 1JLUE 1YWNA 4CTCA 3BLQA 3DCVA 4F9CA 5HBEA 3WIKA 3O96A 5DG5A 3Q5ZA 4R77A 3PIZA 3N51A 3RHXA 2HZIA 2BRMA 2ZV9A 4AX8A 2VV9A 2UW6A 4FKGA 5C9CA 2ERZE 3DFCB 4USDA 1NVQA 4MEDA 3QX4A 3KRRA 3HDNA 2RG5A 4FGBA 4IM0A 4LV5A 3G6GA 3LFSA 2GNJA 4DAWA 4Y83A 5DEYA 5LWMA 3ITZA 3LVPA 2X0GA 3FLSA 4U44A 4XYFA 4QMNA 4CT1A 3QKLA 1IRKA 5HX6A 5F20A 4D4VA 2YJSA 5FTQA 4FKSA 4QMZA 4LOPA 5CZIA 4HW7A 3GCUA 4Z9LA 1SNXA 4KSPA 3UMWA 4O0UA 1GZKA 4L00A 4J98A 2FA2A 2QOKA 2PUNA 4Q5EA 3ROCA 3F5UA 4U80A 4BHZA 4XG6A 4NTTA 3V5WA 2ZAZA 3BHYA 4F70A 3BX5A 4L53A 4YSJA 2X4ZA 1B39A 2C68A 2O8YA 5AUTA 5DT3A 4KKHA 4O7ZA 4AN9A 4IAZA 5E91A 1NVSA 4ZSGA 3GT8A 3CIKA 4ARKA 5ITAA 3EZRA 4RJ5A 4OW8A 5B0XA 4OBPA 4RIOA 4YJPA 3PE1A 3NUPA 5E90A 1UU8A 3DBFA 5EW9A 3OCBA 5DIAA 3D83A 4ZTRA 4ZEGA 4UY9A 4KKEA 3GU6A 5CU0A 1V0OA 5HX8A 2PMLX 4FIEA 4RC4A 4OTGA 3ETAA 3V6RA 2VX0A 3CP9A 3H0YA 1YKRA 3MVLA 3RPOA 4DHFA 1QL6A 3EJ1A 3S2PA 4CKRA 1KE7A 4DGOA 4A9YA 5FDPA 5M4CA 3R8LA 2YZLA 4RQVA 3F2NA 1VJYA 4NM3A 2CNQA 4GT4A 2R5TA 4ZZMA 3NNUA 3NUSA 1M17A 1IASA 1MUOA 5ETIA 4KBKA 3KB7A 4RWIA 4L42A 2HZ4A 3QRKA 4JBQA 2QOHA 3P7CA 5I9UA 3MPAA 3W18A 2RKUA 4QTDA 4FV4A 2J6MA 3EQPA 4WRGA 4ZJJA 3VUTA 3R8PA 2GFSA 1RE8A 3BBWA 4RG0A 4MD9E 3HMOA 4JDHA 4FTLA 3G33A 4QD6A 3PWYA 5KMLA 1CDKA 4CRLA 5LWNA 5DHJA 4RFZA 4E4MA 5K0XA 3TUBA 3ROYA 3UO6A 3UTOA 4ZLOA 4D4YA 2VO6A 4NEUA 3JS2A 4NH1A 3LLAA 3SRVA 4KB8A 4D1XA 4MNEB 3AXWA 4AA0A 2BKKA 1H25A 2ITQA 3NDMA 4O7RA 5CXZA 4NIFA 4LYNA 2PY3A 2WFYA 3VRYA 4BY9E 2UZDA 4FBXA 4KIQA 1ZARA 2IWIA 4MF0A 3NNXA 4RJ3A 4UMQA 4AQCA 4FTMA 3GU7A 3UOKA 1Q99A 5BUIA 4O2ZA 5EFQA 5FWKK 1A9UA 1KV2A 3G6HA 4L43A 2BRGA 5AP1A 4BGGA 3P4KA 3LE6A 4BDBA 4MAOA 2DYLA 4M84A 4AN2A 5TT7A 2A4LA 4XEYA 4NT4A 3MJ1A 5E8WA 5CX9A 5C26A 4O84A 4UWCA 2OJGA 3VUDA 4X3FA 2UVZA 1J7UA 3W33A 5IQGA 3IPHA 4EOQA 5CANA 4WRSA 3ID6C 1MQBA 5M07A 2RFSA 5ETFA 1WBOA 5TE0A 3BYOA 4KIOA 3VF9A 1H1QA 2HENA 2VTMA 4IANA 4AZWA 1JKTA 2W0JA 3DJ5A 2NP8A 4G1WA 4FIGA 4UB7A 4F1OA 4CLJA 4FV6A 2C6OA 2JAMA 3DY7A 3VIDA 4F7SA 4HCUA 4USEA 1P2AA 3IOPA 4P2KA 2Q0BA 3QQJA 2XNOA 4P90A 4RWLA 2PVLA 3H10A 5KMNA 1JSVA 2C1AA 2QLUA 1XWSA 3LZBA 4RPVA 3THBA 4K1BA 2PPQA 1M2RA 5CZHA 2CKEA 4RFMA 4ANOA 3B8QA 5EQPA 1UNHA 2P33A 3QWKA 3TV4A 5AAGA 2YWPA 2XA4A 4DEGA 3VBYA 4BF2A 3LQ5A 4IWOA 1F0QA 2FSOX 3DOGA 3R6XA 1IR3A 4PPCA 4FEUA 5J5TA 1J1BA 3MH2A 2HAKA 2GTMA 4MKCA 2VTPA 3ODZX 4O27B 5FTOA 4X2GA 4EQMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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