4H3PA

Crystal structure of human erk2 complexed with a mapk docking peptide
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
349
structure length
342
Chain Sequence
PEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLAFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDHEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLAQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein-peptide complex crystallization: a case study on the ERK2 mitogen-activated protein kinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 100
structure length 342
sequence length 349
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2012-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4h3pA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4h3pA01
3PA5A 2W99B 3KN6A 3H9FA 3K5VA 2ZB1A 4NKAA 4O38A 4M13A 2EXMA 2A4LA 2DS1A 2C1BA 2XBAA 2WTKC 1H26A 4CT2A 4NJDA 3W2RA 3UG1A 2W0JA 3BQRA 5FP5A 4MBJA 4GG5A 3NW6A 2QOHA 3RHKA 4OLIA 2C4GA 2BCJA 4E1ZA 5E8TA 4ZTMA 3TNWA 1NA7A 2KTYA 3PE2A 1WZYA 2BALA 5HX8A 3O0GA 2XIRA 4USFA 3PLSA 3DDQA 4IIRA 4M0YA 3OS3A 1YDSE 5IH4A 1H25A 4Z9LA 3UGCA 2J0JA 4RVTA 3OBJA 1KE5A 4GFOA 1SVGA 1UA2A 2XA4A 3DV3A 4FKUA 1Q8WA 4B7TA 2VO6A 3AC2A 3BE9A 2VWVA 4DTBA 4HZRA 3DJ5A 2NP8A 5AP6A 1WVYA 3RCJA 5DEWA 1Q8UA 2OXDA 3HP2A 3O96A 4IAFA 4HCUA 4RLLA 3VJNA 2HOGA 1JSUA 5A4CA 5FEEA 4L3JA 3COIA 1ZWSA 2HENA 1UU8A 3D5XA 3CQEA 3SX9A 4EOLA 5F9EA 4FEUA 3DBEA 3NW5A 1WBVA 3AMAA 4HZSA 4V01A 4AFEA 1B38A 4HNFA 4YPDA 5CNOA 1YI6A 4O27B 3TNHA 2ITOA 3BU3A 3KF4A 5IH6A 4HGTA 4L53A 4FV0A 3G90X 4DHFA 3ZDUA 1SZMA 2VNYA 4RVMA 4NFMA 3WIKA 3OF0A 3EKNA 3O17A 4YJOA 2CKPA 4X3FA 2GHMA 3R9RA 5H8GA 4C4HA 3O7LB 4U97A 4YZ9A 3RAKA 2UZEA 3ZYAA 3VS3A 2XNGA 4O91A 3F7ZA 3Q3BA 3TL8A 5I9VA 1WAKA 2VTPA 4CRLA 3WF5A 3BYUA 5TOZA 4L6QA 2PZIA 4GCJA 5CALA 4EHEA 1PXMA 3DK3A 5CX9A 5BUIA 3LMGA 4GK3A 4MF1A 4WUNA 4DITA 2W1DA 5JFXA 1OIYA 1RE8A 3W32A 4AAAA 4UXLA 4YJPA 5LCKA 4CZYB 3HMMA 4FNZA 2HY81 4LG4A 3IPHA 4W4WA 3C4XA 5CVFA 3SXRA 4NK9A 4CFFA 2UW6A 5AUUA 3D5UA 2GQGA 1KE9A 4L3PA 3GC7A 4CLIA 1IAHA 4GSBA 4TWNA 2WTVA 4ZTHA 3NYNA 2XJ2A 4YSJA 5AWMA 4EUUA 4BCHA 4C3PA 2BAJA 1XKKA 4H36A 4EORA 3WILA 4L43A 3AT4A 3TIZA 3JPVA 1WBSA 3FQHA 3E8CA 5CZIA 5EOBA 4ALUA 5CSHA 4BGGA 2JFMA 4JLCA 4QMTA 2A1AB 2JC6A 4OTPA 4LRKA 4R7BA 1H27A 2QOCA 4AUAA 3TNIA 4D4YA 3S95A 3S1HA 1H28A 1U5QA 4FV5A 2QOIA 4HW7A 2YZAA 3R0TA 3SRVB 5BUJA 5JN2A 4FICA 4YTHA 5D7AA 5M55A 3WF9A 5AEPA 3HECA 4M69B 3Q5ZA 3QZIA 4RVKA 5M4UA 4FV6A 2BVAA 4DTAA 5AMNA 5AV1A 4KKGA 2W1FA 3VUKA 4RIXB 3G15A 2ACXA 4RQVA 3QD2B 4EOSA 3AC4A 4BHNA 5EI8A 3MW1A 3KQ7A 4ZAUA 2XJ0A 3FHIA 1XHAA 2CJMA 2Y4IC 2EVAA 1KOBA 3AMYA 4BZNA 4B4LA 4QP2A 2UW9A 3QLFA 2PU8A 4IAKA 1J7IA 3BELA 3FMMA 3UNJA 1UWHA 2WTDA 3I81A 3CC6A 4BBFA 4EC9A 2I0EA 4WOVA 4CQGA 3MH1A 1J1CA 3PIZA 1V0OA 2G01A 4DH7A 4BDBA 4XMOA 2PY3A 3GC9A 2G2FA 4FV1A 4QMZA 3RPRA 1M17A 1XH7A 5M56A 2VU3A 2PWLA 4RJ3A 5AV2A 3V8TA 1SVHA 3PIYA 3TG1A 4QPMA 2WU6A 1ND4A 2E9VA 3VQHA 4MKCA 3CJGA 3GOPA 4QYGA 4BF2A 5L8JA 2VWIA 4WA9A 2P33A 3GUBA 4ERWA 3VC4A 5D7VA 5CEOA 3BBTB 3DQXA 3P78A 5CNNA 3R7VA 3LPBA 2FSOX 5FP6A 1H8FA 2JAVA 4UYNA 2GQRA 1Q4LA 1WBNA 2R64A 3FUPA 5CU6A 2XNOA 5IUHA 3GFWA 1K2PA 3KRLA 3P4KA 5BYLA 4ZSAA 4G16A 4AT3A 5EYMA 4D4SA 2XYNA 3FL4A 4Y5HA 4JDHA 2QOOA 2BHHA 3EFWA 3NUNA 4IZAA 1YVJA 3OTUA 4MQ2A 4E7WA 1OL5A 4JAJA 4APPA 4J96A 1WFCA 2VWZA 3K2LA 4JDIA 3ALOA 3P79A 2W5BA 3SC1A 4O0WA 4AF3A 2GS6A 4QMWA 5CT0A 5CU3A 4D9UA 2HWOA 2ITWA 2Y6MA 1MRVA 2J4ZA 4XP3A 5CSPA 4S33A 2E9UA 2PUIA 2OW3A 4JVGA 4GKIA 4IXPA 4YBKA 2BRMA 4WNPA 5KUPA 1UWJA 1REKA 1GZNA 4IH8A 4BDDA 3L9PA 4LFIA 4CVAA 4WKQA 1UNLA 4Y5QA 5ETCA 1M2QA 5DVRA 5HESA 4ALWA 4CG9A 4G5PA 2RFSA 3QU0A 3OWLA 5IA1A 5AA8A 2FSTX 4NCTC 5A54A 2ERKA 3CE3A 2QG7A 4DA5A 3AC8A 1JAMA 1JNKA 3CPCA 2VX0A 3DZOA 4WBBB 4TYIA 3W55A 4ENXA 3ZLSA 2QC6A 3AGMA 1CSNA 2UW0A 3PRIA 4JG8A 2WO6A 1CTPE 1P2AA 5B0XA 5AP1A 4DAWA 2BRNA 3U6HA 5AAGA 2WTCA 5HD7A 4M8TA 3DNEA 1ZY5A 2CPKE 3FZTA 2WMAA 5FXQA 4QP8A 5GJGA 3SLSA 5JZNA 4NU1A 3MV5A 3GCPA 1HOWA 3ORLA 3FQEA 4D2PA 1RJBA 4ZOGA 3KRJA 2B9JA 2QNJA 3SOAA 3IOKA 4GJ2A 3RI1A 5LVLA 5CAPA 3LFBA 3TKUA 1PXJA 3V8SA 3BRBA 4U41A 1IR3A 5LVNA 4NCTA 4AZVA 4DEHA 4L7SA 5DLSA 1BL6A 4KRDA 4C0TA 4BYJA 4BI0A 2R0IA 1CDKA 4I4EA 3EQDA 4O7ZA 3CLYA 2YM4A 3WI6A 5AUWA 2WZJA 3UZTA 2JBPA 4RIOA 4RWKA 1JKSA 4PMPA 3VUGA 4J98A 2GSFA 4N0SA 3BYSA 4EBWA 3WF8A 4YHJA 4BCNA 4RMZA 2Q0BA 4K1BA 4E93A 4FYNA 3NVMB 1GZ8A 2PYWA 4KABA 1MRYA 4QMYA 2UVXA 1FVTA 1TQIA 4UEUA 1NVQA 3P08A 5AV0A 3VAPA 1URWA 2XBJA 2ZJWA 5E8WA 2WMTA 3KB7A 4RX5A 5CI6A 2YIWA 3GENA 4UWCA 5CYIA 3IGGA 5EDRA 2DYLA 4FTNA 3ZH8A 4PDOA 2GNIA 2Z2WA 5ETAA 5T68A 3ZFXA 4AXAA 4F1MA 3DPKA 5EKOA 5DWRA 1XO2B 3MN3A 4AZSA 2G9XA 2UZVA 4HYSA 5LOHA 3QX4A 4O0RA 2OF2A 4IVDA 4QMLA 3VVHA 5IF1A 2PMNX 4M3QA 3BHHA 4Y72A 3CJFA 5F94A 4UWBA 2E9OA 2O63A 2OG8A 2UZLA 4ZY4A 3HV5A 3NNUA 1Y6AA 4V05A 2QLUA 1Y91A 4MCVA 5HEZA 4CFMA 1H1RA 4UB7A 1VEBA 4HGSA 4QMPA 5AUXA 5LVOA 4Y85A 2ITVA 2WQEA 4YJTA 3PWDA 2XRWA 2YCFA 2WHBA 4QP9A 3NRMA 3LAUA 3R7EA 5EQEA 5EDQA 3TT0A 2EB2A 3PXKA 4JXFA 1ZOEA 3LW0A 3DKOA 4KBKA 4X0MA 3MFRA 3RP9A 3FY2A 3UNZA 4IBMA 2PHKA 2GCDA 4KINA 4BIEA 4BZDA 4ZY5A 2BUJA 4GW8A 3ZS5A 1FQ1B 3IW7A 3QRTA 3FMKA 3Q6UA 3GP0A 3HA8A 4K18A 1Q3WA 2YLFA 5HTBA 4L8MA 1XQZA 4E6CA 3FLWA 2RFDA 3CGFA 3R7IA 5H9BA 5J9LA 5CAUA 3M1SA 1G3NA 5M07A 4NEUA 4O7YA 5ACBC 2IZUA 3QBNA 3RJCA 3C4ZA 2O3PA 3AT3A 4OGRA 2NRYA 3PZHA 4ZJVA 1ZZ2A 4LL5A 4FEWA 1GAGA 4GIIA 3V04A 4EH7A 4PF4A 4DBNA 5A4LA 4MXOA 4XRLA 5LJJA 4E5AX 4TTHB 4GJ3A 5IPJA 3LM5A 4AOJA 3OWJA 5J7BA 3QKMA 4MHAA 3DTWA 4NTSA 4FA2A 3P7BA 2XB7A 5IMEA 4CCUA 5GJFA 3BLQA 1P5EA 4BN1A 4IX5A 4G9CA 3MWUA 3R8MA 5M53A 3SA0A 5E4HA 3C13A 4PL5A 5KKRB 1KWPA 4EH3A 4GUEA 1OIQA 5GZ8A 1JKLA 3Q96A 1IASA 1SNUA 2QO2A 3ORIA 3PP0A 3UOLA 4MBLA 2IJMA 3O2MA 2PE0A 2JGZA 3NLBA 4KD1A 2IVUA 3VUDA 4WRGA 2A19B 2QO7A 2YACA 4FZAB 4HYIA 4R6VA 5F1ZA 4C36A 4AGCA 3SG9A 4OUCA 2B9FA 3EN7A 2XK7A 4I0RA 4QRCA 4UALA 5EHLA 4FG8A 3OUNB 3MH3A 2W05A 2OIQA 3NUSA 1H1SA 4EK3A 5HLNA 1Q61A 2XIKA 3PJ1A 3FXXA 4RJ8A 3S4QA 4ACMA 3SAYA 4P2KA 3OY3A 1YHWA 3KF7A 4EQCA 5CF6A 3BU5A 2B9IA 5J9ZA 5KCVA 3LQ3A 2OH4A 2PVYA 4I21A 3R6XA 2ETKA 4FSTA 4W8DA 3W1FA 4J8MA 3RPSA 4R78A 4EK6A 2RFNA 2CNUA 2BROA 1MRUA 4C57A 1R0PA 3MA3A 4ANBA 3B8RA 3EHAA 4IAYA 4TYGA 5H3QA 4BRXA 2H8HA 3N4TA 4PQNA 4FKVA 1F3MC 4L00A 3G9NA 5JZJA 3U6IA 3OHTA 4PDPA 4BDHA 2YZLA 3NIEA 2EU9A 3P7AA 1YXXA 3F88A 1YDTE 3KULA 5GJDA 3F6XA 3KULB 1FMOE 4FX3A 2V7OA 2ZV7A 3DBFA 4CSVA 4QTEA 4RBLA 3EYHA 2ITNA 2X7GA 4QYHA 3VBYA 3LCKA 1NXKA 2VTOA 3FSFA 3G9LX 2OGVA 3I79A 3PUPA 5EI6A 3CQWA 4G5JA 3QTZA 3DKCA 3R04A 2PUPA 5K4JA 4R7IA 4CFWA 5IA5A 3QQKA 4IC7A 4BDCA 1BKXA 3HUCA 5CVHA 4F1OA 1TKIA 3QGWA 3W10A 1WBOA 5HNBA 4A9YA 3PVWA 3UYTA 2QLQA 4YU2A 2QKRA 3AQVA 2BRBA 4ITHA 3DU8A 2X8EA 4RFYA 5JRQA 3VW6A 4XG9A 4PNKA 5KBQA 2AC5A 3UVQA 3SV0A 4XG7A 3ZUTA 3QC9A 3PWYA 5J95A 2AUHA 2YIXA 3BI6A 5M06A 1I09A 4USEA 2VWWA 1XJDA 2BZJA 3D5WA 2J51A 2PL0A 2CGVA 2XKDA 4J1RA 4O6LA 3UYSA 3V5QA 4BFMA 5IA4A 4XV2A 3IDPA 3MH0A 4LV5A 4O0TA 4A07A 4BI2A 4O6EA 3DCVA 3QZFA 4UX9A 2Y9QA 4FOCA 5M09A 3KMUA 4J99A 2R3IA 4IW0A 3NIZA 2B52A 2YCRA 4TYJA 4EK5A 3SKCA 4EQUA 4D0XA 3D4QA 4DH5A 1QPCA 4IE9A 2W06A 3JY0A 4JBVA 3RPOA 2BTSA 4D2TA 5HVKA 2EUFB 5CEIA 1XBCA 1JSVA 2GMXA 4XP2A 5HCZA 5HI2A 4EOIA 5LMKC 1OBGA 3QCXA 4Z16A 2C0OA 3KY2A 3LMIA 3TDWA 1NW1A 4IDVA 5KMOA 5IU2A 1ZYDA 1FINA 4Y73A 5FXSA 1IEPA 4AOIA 3GEQA 3TACA 4JX7A 3BV3A 4J97A 4TY1A 3N9XA 5KE0A 1YXTA 3ANRA 4WSQA 4QQTA 4IVAA 2CLXA 2PE2A 4DN5A 4IDTA 2OU7A 1OI9A 4YJUA 2UZOA 2UZWE 4IANA 4YLKA 4JG6A 2BRGA 2PZYA 3BWJA 4BIDA 3A2CA 3P9JA 4QQCA 3ODZX 3LXNA 4LUEA 1RQQA 4YZMA 2C6DA 3U9NA 4F7JA 1YWNA 5ANKA 4ITJA 3F9NA 3QZHA 5IUGA 2R3PA 2YIQA 2QOKA 3V5TA 2BZHB 2GNLA 3BEGA 3ATTA 2YN8A 2C68A 2VTTA 3QRKA 4ZJIA 4IFCA 3TWJA 3U6JA 4RJ7A 4DH1A 3K5UA 2XK9A 4KWPA 4IFGA 3PPKA 4G3FA 4XNEA 2W4JA 3C4CA 4X2GA 5CU2A 1KSWA 3HVCA 3KMMA 4RZVA 4XRJA 3D94A 4E5WA 2AYPA 2V7AA 1HCLA 3MB6A 3PVBA 5HIDA 3VUTA 3H0ZA 3LE6A 4JAIA 4O7LA 3OOGA 3QTRA 4V0GA 4YO6A 3TZMA 3DB6A 4O81A 2OIDA 3DK6A 3RWPA 3W16A 1G8AA 2O64A 3ROYA 2NRUA 2ZDTA 3C0IA 4FYOA 3IOPA 3CBLA 3DB8A 3F5PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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