4HGTA

Crystal structure of ck1d with compound 13
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
286
structure length
283
Chain Sequence
YRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-Based Design of Potent and Selective CK1 gamma Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase I isoform delta
total genus 92
structure length 283
sequence length 286
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4hgtA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4hgtA01
4ZK5A 4I5HA 2JIIA 4KA3A 4FNXA 4NCTC 2VTIA 3MA3A 5CAOA 2BDWA 4EZ5A 4EH3A 2GHMA 3D83A 4PMSA 4QTAA 3D2IA 4EK8A 4F1OA 3V3VA 1OL5A 3HAMA 1XH8A 3KC3A 4AZTA 4L52A 4DINA 5K5NA 4GFMA 5E7RA 4XG4A 4XG7A 3V6SA 3QA0A 4BWKA 5I3OA 4O22A 5CZIA 3K3JA 3SW7A 3BYSA 3R8MA 3HP5A 1JKKA 4EK5A 4AX8A 5L2TA 2HW7A 1IRKA 3PSCA 4LQMA 4X7QA 5EYCA 5IDPA 1ZAOA 2ZV2A 4E8AA 1Q3WA 2BUJA 1OZ1A 4J96A 2W4JA 4OBPA 3PVWA 4YO6A 2X6EA 4K2RA 4NWMA 2J0JA 5T68A 5CVFA 3P78A 4J1RA 3F7ZA 5LMBA 1R3CA 2HIWA 5D9HA 2YCSA 3MFTA 4JX7A 3UBDA 4QYHA 2PUUA 3MB7A 4HW7A 3WARA 4NK9A 5FRIA 5CEPA 3MFRA 3IS5A 2YM3A 4KB8A 2E9PA 1H26A 3C4WA 3SDJA 2CKQA 3QRJA 4KINA 4L6QA 5M56A 5GZAA 4UXQA 4TTHB 3TNPC 3ORIA 2PY3A 3KF4A 4KSQA 3ZSIA 4U9AA 2X39A 4JQ8A 4BRXA 4L7SA 2WMXA 2CCHA 2IVVA 1UU3A 1L8TA 1IA8A 1M2PA 3EIDA 4KKHA 4YNOA 2PE1A 2VNWA 4QP8A 3TI1A 2DYLA 2IVUA 4H58A 4H05A 3O51A 4M67A 3R73A 4NYEA 1V0OA 2JEDA 3MH2A 1FBNA 5H2UA 1REKA 2YDKA 4XUFA 4YTCA 1OIUA 4E6DA 4BN1A 2WQEA 4PWNA 3PJ2A 5L2WA 3PJ3A 3C4CA 4KRDA 4MK0A 3L9NA 3E8NA 1BI7A 3WF7A 1FOTA 1Q62A 2P0CA 3BLRA 2ZB1A 4GU6A 5TT7A 1KV2A 4RT7A 4ZOGA 5HO6A 3Q5IA 4Y72A 4UALA 3KL8A 3ODZX 4O0YA 2GFCA 2ONLC 3C9WA 4YJQA 3TZMA 5ANEA 2GNFA 4JAJA 5CANA 3WYYA 4I6BA 4FKQA 4EZ7A 5JQ5A 3QUPA 4F70A 3ZZWA 1MQ4A 3MIAA 3QRKA 3R6XA 4C4EA 3U4WA 3FKNA 3GNIB 4FICA 3MY0A 4K18A 1FVRA 3DZOA 4F08A 5JFWA 4R3CA 2ZV9A 3RHXA 5HVKA 3QHWA 5M4UA 3WF5A 5HE2A 1OIYA 4IX5A 4CFWA 3LE6A 2XEYA 3LLAA 3FLQA 3PP0A 4MNFA 5FM2A 5BMMA 2HY81 2QR7A 1JAMA 5M53A 5HG7A 5BX0A 3UIUA 3SLSA 3RWPA 2KTYA 4LRKA 4IXPA 4FX3A 3G9LX 3MGYA 5FTGA 1GJOA 4PDOA 2O8YA 4JT3A 3PE1A 4I6QA 4QMVA 4QYEA 1K2PA 2ZV8A 4F4PA 5M4CA 4KD1A 5J9LA 2VTSA 4LUEA 3IDCA 4GEOA 3C13A 4YO4A 1B38A 4DCEA 3OTUA 2W96B 2B52A 3OMVA 2QI8A 3MSSA 3PIXA 3Q6UA 3LCKA 4UEUA 3V5LA 3WIGA 2XK7A 1H24A 3O71A 4J7BA 3PIYA 2X6DA 4GRBA 3V8SA 3ZRLA 1PYEA 1FPUA 5FXQA 2UZDA 3JYAA 2W1CA 3FL4A 4BBEA 3QRUA 3VS6A 4I0TA 1OITA 2YM5A 2Q0BA 2FYSA 4FIFA 4WBOA 3NVKI 4FSMA 3MA6A 1YXXA 4JIAA 4YHTA 3AC2A 3VF9A 2VTQA 4MNEB 5LWNA 5CQUA 1H1SA 2ETMA 2XYUA 5CY3A 3RNIA 4X3FC 3PWYA 3EWHA 5BYYA 2UZTA 2W9ZB 3ZSHA 3VUGA 4A9YA 5LMAA 3DK3A 5FQDC 5A14A 3A62A 4TWNA 2IW9A 5AR5A 4EYJA 1YWRA 4QTBA 3CE3A 1I44A 2JDOA 4JJRA 4KABA 3QKKA 4L3PA 3SAYA 2RGPA 5M44A 2UVXA 3FXWA 3VN9A 3A4OX 5J79A 1OM1A 2HXLA 4KAOA 4BIEA 3VBTA 4W9WA 5HORA 3BE2A 3OP5A 4RC2A 3TJDA 4MEDA 3R7OA 3ZO3A 5LVMA 4WBBB 3HEGA 1ZYCA 2C30A 3P23A 4LL0A 4CV9A 1FINA 2B9JA 3VQUA 3IW8A 3FQHA 4OTRA 2GFSA 2QU6A 4XJ0A 3OC1A 2XNOA 4FEXA 4QMNA 3IQ7A 5J8IA 3D0EA 3FZTA 3MB6A 4F6SA 3I1AA 2Z7QA 3W2SA 5JH6A 2EVAA 4MNEA 1W8CA 2PK9A 4QMZA 1YDSE 4P5QA 5HO8A 2XNBA 5ACBC 3U6JA 4RMZA 3PPZA 1ZARA 2R3KA 3FY0A 3OD6X 4YR8A 4LG4A 2PZYA 2QU5A 1PMNA 2OIQA 3MY1A 4HVSA 3U87A 4TY1A 4RVMA 2FUMA 4JRVA 1LR4A 4ZY5A 1PKDA 5ANOA 3RPYA 1VYZA 2Y8OA 1Y6BA 4AACA 4WUAA 2W1FA 4QNYA 4FSUA 5IKWA 4DLJA 2WMSA 3OT3A 2Y4IB 2OW3A 2VTMA 3BQRA 3RPOA 2VN9A 4IZYA 5CSWA 2HZ0A 2GNJA 2C6MA 3OCTA 5AWMA 4F6UA 3VS4A 3CC6A 3DV3A 3NYVA 3QYZA 4ZTLA 2PVLA 4B6LA 2W99B 3EYGA 1WBNA 1MRVA 4CQGA 4GFGA 5HX6A 5AUTA 4ANMA 5A9UA 4IMYA 4JNWA 2UW6A 5FBNC 2VU3A 3QQHA 4W4WA 5CSPA 5J7HA 2YA9A 4NH1A 4QPSA 3GC9A 4PQNA 4UWCA 1NVQA 3DTWA 3DY7A 4IACA 4XV2A 4XV9A 5GJDA 4FT3A 4LV8A 3NW7A 1PXOA 2XH5A 3FUPA 3IOKA 4MD9E 4BDKA 5HBJA 2CGWA 3ZYAA 1YVJA 2W1HA 4JX3A 4E73A 1UNLA 4ASXA 4WOVA 4Y73A 4KBCA 3DS6A 1CSNA 3CR0A 4RIXB 1V1KA 3NUXA 4UYAA 4ZZOA 4FE2A 1OL6A 1SMHA 2YABA 3Q52A 4WUNA 5HHWA 3UYTA 4P4CA 5IA1A 5G6VA 3BELA 2JIUA 3DK7A 2GS7A 3R2YA 5HNIX 4F63A 2IW8A 3H0YA 4CFUA 3AMAA 2B1PA 4IDTA 4QQTA 3F66A 3IECA 3QKLA 2VTRA 4E7WA 5AADA 5JFXA 2J0LA 4QTCA 5D7AA 3GXLA 3ZH8A 3PFQA 4FKLA 4HPTE 4QMWA 5GINE 4I20A 4WSQA 3R7GA 3EQBA 3FC2A 4FSRA 3RCJA 4B8LA 3ETAA 3I5NA 4BKYA 1ERKA 3A7IA 5AP6A 3BV3A 2X7OA 3KVWA 4D2VA 4DITA 4F7LA 4I22A 5AR2A 3S2PA 2C0OA 4ORKA 3P08A 3ZMMA 4LRJA 2OKRA 3ORMA 3Q4CA 4DT9A 3L9LA 4MWHA 4IVCA 4G9CA 4RIXA 2ITZA 4G1WA 5EOBA 4QPAA 5TR6A 1OBDA 3C4XA 2WB8A 4CRLA 3NEWA 3RGFA 3B8RA 3O8UA 3DTCA 2JKKA 3GU4A 2QQ7A 3Q3BA 2I6LA 2OBJA 4L44A 5EOLA 4FNZA 3E7OA 5FUTA 2GTMA 5KZIA 5EYDA 4M69B 3RBWA 4OTHA 4EOPA 1YOLA 3D7TB 4RZWA 1JNKA 3NIEA 4FIEA 4FKSA 4U3YA 3Q53A 3CCNA 2JD5A 2PZ5A 2YLEA 3C0GA 3EN9A 4XG6A 2PULA 3LM5A 1ZYSA 1Q97A 2XZSA 4MAOA 4CFMA 3FPMA 1AGWA 3SHEA 1UU9A 5DFPA 2W17A 4GKIA 3DGKA 5HI2A 4K11A 2CN5A 1MUOA 2BIKB 5IEVA 4DLIA 5E90A 3PLAE 1TQPA 2B7AA 4RWJA 3DBFA 3Q4ZA 2O64A 2WEIA 4OW8A 4USDA 2XKDA 4ZTQA 1HOWA 3ZBXA 4UZDA 4FL3A 5AM7A 1OMWA 3IW6A 3ITZA 4QP9A 5EDPA 2OH0E 4DH8A 3QCXA 4DEBA 3CQEA 2UW8A 3TKUA 4XH6A 5IMEA 2R3MA 3KREA 4PL5A 5HCXA 1LUFA 2WIPA 2Z7RA 3DBCA 5DOSA 4E3CA 3D7TA 2ERKA 2YAKA 4Z9LA 3KF7A 4QMQA 3GU7A 1WVXA 4IWDA 3BYOA 5ANDA 5E1EA 2W4OA 1IR3A 5EH0A 3JUHA 4F0FA 3I7BA 2PU8A 2QHNA 5KO1A 3D7ZA 1PYXA 4NJ3A 4F9WA 1OKWA 4PL3A 2ZM3A 2BR1A 2RF9A 2R9SA 2XNNA 5LMKA 3VIDA 4AS0A 5T6KA 2BZKB 4M97A 2R3FA 3EOCA 5BVNA 5JSMA 1WMKA 3PG3A 3EZRA 4BTFA 4KBAA 5CNOA 4ZLZA 2V7AA 2JIVA 4YMJA 4NJDA 3MJ2A 2YZAA 2JDVA 4BL1A 3VNTA 4LOOA 5FP5A 3BWFA 4BCNA 1E1VA 3TZ9A 2GNIA 4EHZA 5AUUA 2Z02A 4WNMA 4EC9A 2PTKA 3V5JA 4C34A 3S1HA 3ODYX 4FKTA 1CMKE 3HMNA 1WVWA 1PXJA 1ND4A 4RIYB 5E8XA 4YJNA 5FM3A 1YHSA 4GIIA 4LFIA 2GTNA 4U40A 4O6LA 3RP9A 3PXQA 4O91A 4QMTA 2JKMA 5ETFA 4DTKA 3K2LA 4OR5A 3UQCA 4YBJA 3UVRA 1BUHA 2FSLX 2BHEA 1GAGA 4IZ7A 4JRNA 4XP0A 3RK5A 5A54A 3DDPA 5ANGA 1SNXA 5EQEA 3DKFA 4DEIA 4DT8A 1Z57A 2XBJA 3E63A 3NAXA 5A3XA 4P5ZA 5EG3A 3RAHA 3MJ1A 3C7QA 3FLYA 3OW3A 3GOKA 3K3IA 5EHYA 3PXZA 4BDCA 2QODA 4XOZA 2OXDA 2BRNA 3ZDIA 4BKZA 3ROCA 2IZTA 2HYYA 4QP6A 4ERKA 2C5VA 3QCYA 1SM2A 3IW4A 3OCBA 3A99A 3QTIA 2XRUA 4JG6A 3VULA 2WELA 5BUEA 4IM0A 3MVMA 5CVHA 5CLPA 4RWKA 2X2KA 3VBXA 3I0QA 4APPA 5L2IA 2V0DA 3HV5A 3L8VA 3BBWA 3MH1A 1QPJA 5AP4A 5DVRA 4B9DA 4C0TA 3OWJA 1ZZLA 2VTOA 4RIYA 4HGLA 3F82A 5CS6A 3PA5A 5HG8A 3UG2A 3LW0A 3VRZA 1TQIA 2VV9A 3MV5A 4FL2A 3IG7A 4ZJVA 3UOLA 2HAKA 2UW4A 2WNTA 2YITA 3AMBA 4ZY4A 4E4NA 3UNKA 4FTOA 5A4TA 1H1RA 2FO0A 4F6WA 3LVPA 1G3NA 1NY3A 5LCKA 4FZAB 3WYXA 4FV4A 4E4LA 5EKNA 3R9OA 2C3KA 3GU6A 3R9RA 2J5FA 4G17A 1U54B 3P0MA 3LMIA 4JOAA 3TTJA 5I3RA 3ORLA 3FPQA 2W4KA 1BKXA 3FLSA 3T3UA 4ASEA 4ENXA 3R8VA 4TKSA 3H10A 2ZAZA 3FC1X 4ZSGA 2C6LA 3HMPA 4BGQA 4E26A 1R0EA 3Q9YA 2UZLA 4NM0A 3ACKA 2QG7A 1R39A 1YI3A 2DWBA 3PPKA 3POOA 2JC6A 3G33A 4FTIA 4PDPA 2OJGA 5DA3A 5AV3A 5LJJA 3OG7A 3NUYA 2X2MA 2VWUA 2WOUA 2CPKE 2R3RA 3Q9WA 4JBQA 4LV5A 4QQ5A 2ITXA 5D11A 1W0XC 5ANJA 3HMOA 5IISA 3TIZA 4E5AX 3BLHA 4FEUA 4OTGA 3REPA 4A9TA 2ZDTA 4OBOA 2C5XA 3WZUA 1AD5A 2VWZA 2O5KA 4FV1A 4W4VA 5EHOA 4TYHB 3OEFX 4NKAA 2OZAB 5HU3A 3ZSGA 2AYPA 3HV6A 5C8NA 4MX9A 5F9EA 4EONA 5BQ0A 3IGOA 4O0XA 3L9MA 1U54A 3ORPA 4GL9A 3D9VA 3AT3A 3QQJA 3QZHA 2YZLA 2A4LA 3WE8A 2XKCA 1PMEA 1Q8YA 4U43A 4HVDA 2OH4A 5EI2A 2R3JA 4O7LA 2WQOA 1BX6A 1J1BA 1SVEA 2F49A 3AD6A 4Z3VA 3NNXA 4GVJA 4JBPA 4FV0A 4A4OA 3HDNA 4BYJA 3P5KA 4FA2A 5CU6A 1J1CA 3JY9A 4FTCA 3ZC5A 5J9ZA 3KB7A 4XLIA 3DBDA 3PIZA 3VUMA 4O0RA 2RKUA 3F5UA 4JBOA 3A4PA 4RLKA 4R6VA 4G5JA 4FZDB 3R8LA 3PXKA 4BWXA 3WZJA 3BGQA 4DBXA 4DN5A 4D4YA 2W1IA 2WAJA 3DAEA 3BIZA 4GT5A 5BVEA 1YXVA 3AT4A 4TYHA 2PPQA 4XMOA 2QO2A 2OZAA 4PTEA 3RPSA 2F7ZE 3BRBA 3KRLA 3GFEA 1BMKA 5JRSA 4BHNA 3KA0A 4EYMA 4BIBA 4U44A 4L3JA 5HG9A 1CKJA 4U3ZA 4ZLYA 4NFMA 4TNBA 5F20A 4BYIA 3NCZA 5BMSA 2VNYA 1CKIA 4FOCA 3P4KA 3C5UA 4AW5A 1J3HA 5JZJA 5L8KA 4O0UA 3TNHA 2JDSA 4CKIA 4FYOA 4GK3A 3H9RA 3ZLYA 4BB4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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