4HGTA

Crystal structure of ck1d with compound 13
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
286
structure length
283
Chain Sequence
YRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYRDARTHQHIPYRENKNLTGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKAATKRQKYERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNMLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Casein kinase I isoform delta
publication title Structure-Based Design of Potent and Selective CK1 gamma Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 92
structure length 283
sequence length 286
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4hgtA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4hgtA01
1B39A 3OT3A 3FMKA 5EYCA 2QOLA 2SRCA 3VUDA 4NUSA 2DUVA 5M4CA 5EHYA 4ZZOA 4FSQA 3E88A 5K9IA 3UMXA 3KMUA 5K4IA 4XBRA 1AD5A 4V01A 3R7YA 4BGQA 1OIQA 3GCUA 2UW9A 4GUBA 3SXRA 3MS9A 4NH1A 3EN7A 2HCKA 3E8DA 2CLXA 3IGOA 5CVFA 4C33A 4WRGA 4YJQA 4O7SA 4CVAA 3F66A 4ENYA 4IH8A 1KV2A 1YXTA 3L9LA 4DH3A 3PY0A 4XOZA 4C4HA 2X8DA 3QQJA 4JBQA 5BVDA 2UV2A 2FSOX 4JS8A 4K6ZA 4G31A 4BN1A 4CFVA 3A8WA 1YHVA 3OW4A 3R21A 4JLCA 1OZ1A 4IJ9A 3QUPA 2J2IB 2OICA 4AE9A 4FT9A 5EHOA 5HBHA 2FVDA 4S31A 4DEIA 2YCRA 4FKUA 5HICA 3SW4A 2VWZA 2C5NA 1VR2A 2GNFA 3B2WA 4GV1A 2WU6A 5D1JA 4CKJA 2FO0A 4QTEA 1PRYA 4ACDA 3DFAA 5HE3A 3PRFA 4D58A 4ZLZA 3BGZA 2QG7A 5E8YA 3OROA 3OG7A 3GOPA 3SKCA 1OL1A 4I23A 4C35A 5GINE 2RFDA 1W84A 5HHWA 1PXOA 3CXWA 4A9SA 2JGZA 4D2TA 3RWQA 1H27A 4R3RA 4A07A 5JMSA 4DEAA 3PIYA 4MX9A 4BCHA 3TV6A 2I7QA 3HGKA 4YZBA 5JKGA 2OIBA 3H0ZA 3MDYA 4CYJA 2X39A 3D5VA 3A7FA 4FE2A 3GB2A 4V0GA 1PYXA 3EIDA 4QNYA 5AM6A 4GU6A 4BB4A 3ZUTA 5TE0A 1WAKA 2QCSA 4I93A 4OTWA 4TWNA 2XIRA 3TKHA 4AW1A 1JLUE 4EKKA 2PHKA 4W8DA 4FNZA 4S2ZA 3P4KA 5ANEA 3ORZA 3ZSGA 3E8NA 4MVFA 2VO3A 1ATPE 3D14A 4CFWA 3TXOA 3TN8A 4D2VA 4IAYA 2C5VA 2HYYA 2YLFA 4XV9A 3H9RA 5HG9A 3CS9A 4FTRA 3UVPA 3IOKA 2IPXA 4RIWA 3SRVA 1ZY5A 4MXYA 4BBEA 1DM2A 4CZTA 4JQEA 4DHFA 4Z7GA 5IH5A 4JL9A 4RWJA 2RF9A 2RG6A 2W5AA 1NXKA 5EM8A 2XK6A 4D0WA 5CEOA 4C4FA 4CLJA 2PY3A 3FYKX 4WT6A 5E9EA 3VUHA 4IDVA 4FSZA 1BLXA 2VNYA 4A9UA 2B1PA 3F7ZA 5K0KA 2XK4A 4ZTHA 2HENA 1P2AA 5J7BA 4XP2A 1H1PA 3HV7A 3ZO3A 2WO6A 3OWPA 3FY0A 4WG4A 4D4YA 3MH2A 3QA0A 3EYHA 1HCKA 4O0TA 3FQEA 4EHEA 4FF8A 4OAVB 3EL7A 3QUEA 4DGGA 3AT4A 4CTBA 3H3CA 2X8EA 3RAKA 3CKWA 1J7LA 5A4TA 4W8EA 5DEYA 4LL5A 4FV4A 2VN9A 5HTBA 2PZ5A 1YI3A 3ANRA 2QOFA 4D2WA 4ZSAA 4FKIA 4GIIA 4G6NA 1XR1A 4I41A 3NUSA 3QLGA 4GRBA 1GZ8A 4QQCA 3VBWA 4JRNA 2WMAA 1P4OA 4JBPA 2VTPA 4FL2A 3FLYA 5FP6A 4O82A 1WCCA 3NNVA 4XX9A 4EZ5A 4QP9A 3GEQA 2RKUA 5AA9A 4PL5A 2YM4A 3DKOA 5DRDA 1GZNA 1K2PA 5TR6A 3WIKA 3EQCA 5GJDA 3B2TA 4TKSA 4XUFA 2PZRA 4H39A 5DNRA 4FKGA 2ZM3A 5CENA 4RX7A 3OEFX 4JIAA 2JBPA 3EZRA 2ITNA 4YZMA 3LCKA 4TPTA 5A4QA 5LVOA 2CGWA 4FTJA 4J8MA 5AUTA 3ZFXA 2PUIA 1YRPA 3ZDIA 3ORPA 4EOJA 5IA5A 3ATTA 3DJ7A 5HE2A 3HNGA 3UO6A 4FSMA 3PJ3A 3VULA 3O96A 1VYWA 3QC9A 3EFLA 3RHXA 5LWMA 2V7OA 1H0WA 2C3JA 2RSVA 3MVLA 4FTMA 4K11A 4O91A 4BDDA 4FNWA 4Y72A 4E6CA 2V55A 4S30A 5HD4A 5JH6A 5HIBA 5KZIA 3WF7A 3K3IA 5L2IA 5CAUA 3LMGA 2O2UA 3V04A 1U5QA 5A14A 4BBFA 1YWNA 4FNXA 5CU0A 5BVKA 4PDYA 3C9WA 4BCGA 1O9UA 1YHSA 5CI6A 5IEXA 4YP8A 5I3OA 4D0XA 4J1RA 4QP8A 3LM5A 5E8ZA 3R8LA 3ENHA 3VHEA 5A46A 3F3TA 3DBFA 3LE6A 1GY3A 4BTKA 2BDFA 2R2PA 4X2FA 2FSTX 4F1MA 2WTIA 5FP5A 1YQJA 3OF0A 3UQFA 3BHTA 4I3ZA 1MUOA 4I5HA 3JPVA 4JAIA 5HO6A 4O7TA 2FSLX 3LXLA 3UZPA 4C3FA 2R9SA 4B4LA 4MBIA 3U9NA 5BQ0A 3FUPA 3L8PA 4L3LA 5I0BA 4M0YA 3VS7A 2G2HA 4RIYA 5HESA 4JIKA 2E9PA 2J0LA 2WNTA 4LOPA 4D28A 5CAQA 2YCFA 3CEKA 5JT2A 4BIBA 2EXEA 4U81A 4YLLA 4JDKA 5A6NA 1OL7A 4H3PA 4TYGA 5D11A 3PXKA 5J8IA 3AQVA 4FVRA 3U8WA 4HVGA 2JIVA 4RVKA 3W8LA 1SNUA 4GVJA 3E8CA 3OS3A 3TNIA 4D55A 3PJ1A 3H30A 1IRKA 4HGTA 5CSHA 1Q41A 4BBMA 1V0PA 3HKOA 4PV0A 1SVGA 4JVGA 5J95A 2YIQA 3BI6A 2IW8A 3VN9A 3KRRA 4DEGA 3NAYA 4DCAA 5CLPA 2WOTA 3DBEA 2A4LA 4QMUA 3VUTA 1E1XA 3V8WA 1R0EA 4EOOA 3QQHA 4UMUA 2JDOA 5EH0A 3KB7A 4O38A 2E9OA 4RMZA 1NY3A 3A7IA 3FMEA 4XNEA 5KE0A 3RCDA 3PJ2A 5CS6A 4AF3A 2JKOA 4FYNA 1M2RA 2QKWB 3DKFA 3F5PA 3OTVA 3R63A 4LRKA 3NPCA 3QFVA 3L9NA 4D9UA 5BMSA 4RT7A 2JKQA 3OD6X 4RC2A 5FG8A 4MKCA 3ROCA 1YW2A 1ZARA 2IVSA 4BIDA 4AG8A 4FL1A 4DT9A 5GZ8A 4DFYA 2JBOA 1R0PA 1U54A 4MD7E 5BPYA 4DE4A 4L42A 3VQHA 3VW8A 5CVGA 3G6HA 4M66A 4DGOA 4F65A 3D94A 3PP0A 5A54A 1CSNA 2PUPA 4BCKA 1Q3WA 2OH0E 5J1WA 4BHNA 5AV3A 2CKEA 2F9GA 2QHNA 4LMUA 4F9YA 2BTRA 4B0GA 2F7XE 3R1QA 3FZ1A 5BVNA 2WHBA 2X2MA 4QD6A 4EH8A 3GP0A 2Y6MA 2PVYA 3DY7A 3II5A 2HW7A 4I0SA 4IWQA 3FKOA 4O1OA 1UV5A 2OIDA 1WBSA 3CD3A 5CEQA 5A4CA 3E64A 2C6DA 4FSYA 4EH4A 5IDNA 3FI4A 3DU8A 2CJMA 4GT4A 4KB8A 5AEPA 1FQ1B 2XB7A 5EYKA 2YA9A 2JEDA 2VTSA 3CTQA 3TZ8A 3V5LA 2YIWA 2XA4A 4EQCA 4FEXA 2WMBA 3K2LA 4OTIA 5EI6A 1H1QA 3C7QA 1WZYA 1Z57A 4XOYA 2YIRA 4BDGA 3PDTA 4UBAA 4MXOA 1PKGA 5HD7A 4TL0A 4ZZNA 4PTCA 4FTTA 4GK2A 3R71A 4KKGA 4O2ZA 4FTLA 5HLWA 2WB8A 2R5TA 3VS2A 2ACXA 3UZRA 4IAFA 4JG6A 1H24A 2OH4A 2F49A 1XBCA 4KABA 4EQUA 1WFCA 1IASA 3BGPA 5E91A 1GIJA 4MNEA 4YZNA 4DEEA 2EVAA 4F0IA 5LCJA 4ERKA 5JFWA 1QPEA 2X9EA 1OECA 5L8JA 5E8WA 4FI1A 4M8TA 4UXQA 4P2KA 1OKZA 3GU4A 2QI8A 4RLLA 2BZIB 1BL6A 3FI2A 2VWIA 3ZC6A 4EI4A 5AUZA 2UW7A 3QTSA 4LFIA 1CTPE 1NVRA 4NW5A 4C02A 3D9VA 4ZOGA 3UQCA 4LMNA 4MF1A 3PA5A 4HCVA 3ZFMA 4LM5A 1GJOA 1A9UA 3KREA 3COHA 4RC3A 2Z60A 4F09A 1IEPA 3Q4UA 1FGIA 1SMHA 1UA2A 4O0VA 4UWYA 4UN0C 2WQBA 4M13A 4U42A 3BBWA 5KBQA 3PIZA 3Q53A 3E7VA 2V22A 3ORKA 4QMOA 3MBLA 4RJ3A 3P79A 4L3JA 2VWVA 3O2MA 3PA3A 2HXLA 5FXSA 2P33A 1MRVA 3FLZA 1UU9A 5FLFA 2DQ7X 4RPVA 2OFUA 2VX3A 3E7OA 1H07A 4BDCA 4CRLA 4AZTA 3LFQA 4CMOA 2JIUA 4EHGA 1MQ4A 3SAYA 5DH3A 2J0IA 4FSRA 5HCYA 5L6PA 2WTDA 4U7ZA 4DTAA 4EK6A 2XIZA 3HA8A 3VS1A 3FKNA 2UVZA 4OTFA 3WF8A 2GQSA 5K5XA 2BHHA 3DXNA 3BWJA 4CD0A 5L6WL 4O84A 4EK4A 2Q0BA 4TWCA 3WYYA 4EOKA 2F2UA 3IKAA 4BWPA 2R4BA 2BRNA 4M67A 5BUJA 4ZS0A 2WGJA 4DLIA 3TL8A 3TUCA 4EHZA 3JS2A 3ZFYA 2CKQA 1NA7A 1SVHA 2P2IA 3BGQA 3G51A 3NNUA 5EKNA 4QTDA 2A2AA 1LUFA 3VF9A 3I0QA 4AOTA 2C6TA 5FEDA 5JZJA 1S9JA 2ZAZA 3TV7A 3IDBA 1RW8A 4KIOA 2ITPA 3Q04A 5JEBA 4I24A 3EQFA 4R7BA 4YJUA 3PSBA 2QU6A 3LFSA 3LXNA 3MV5A 1SNXA 3H9FA 3RNIA 3ZS5A 5BUEA 5I9XA 3BQRA 3QGWA 5TT7A 4RJ7A 5CSVA 2JFMA 3EZVA 4YGAA 4EWHA 2XS0A 2V0DA 2R7BA 3GQLA 4JX7A 4QRCA 4U8ZA 3MSSA 2NPQA 4M3QA 4ZLYA 3BYVA 3KGAA 3OCTA 2Q0NA 4YZ9A 1OKWA 4FV5A 2Y7JA 3VIDA 3HDMA 1QL6A 4DFUA 3VQUA 3V8TA 5IQIA 4XJ0A 4F64A 3Q9YA 5H8GA 4JDJA 3RGFA 4LGGA 2XYNA 3TNPC 1ZOHA 3Q9XA 1QMZA 5TOZA 3TZ7A 4TT7A 5EQEA 3LM0A 4I6BA 3O50A 4ASXA 2IN6A 4NL0A 2A19B 4L8MA 3ORXA 4O7LA 2WAJA 4JI9A 3A7HA 3QTRA 4HVDA 4EZ7A 2GMXA 4MAOA 2BZJA 3ORNA 3D5UA 5CWZA 4GKHA 2WTKB 4FV1A 3RCJA 5CALA 4FGBA 4QPMA 4R78A 3FSFA 4XRLA 3V5PA 4FL3A 1OPKA 3W33A 3QL8A 3B8RA 3AMYA 4CV8A 1G3NA 2Y0AA 5DR9A 2P2HA 3IW5A 3DXPA 3VUMA 4F7LA 3AC4A 2KTYA 4DFXE 4DH8A 3PVUA 4FTAA 3ZM4A 1SM2A 2ESMA 2W4KA 3D5XA 5AM7A 5CF8A 3TDVA 3LMHA 3ZC5A 4ID7A 4TZRA 5K4JA 3EB0A 4ZJIA 2R3MA 3NYXA 3OZ6A 4QP3A 3WBLA 3HEGA 3PFQA 1CMKE 2XKDA 4U3ZA 2FYSA 3AT3A 3MWUA 4ZTLA 4PY1A 4JBOA 4E8AA 4O83A 4EOPA 4OUCA 5AJQA 5HOAA 2XM9A 5DOSA 4JX3A 1NVSA 2VTQA 4MHAA 5E90A 4QYHA 5ITAA 5KUPA 3BKBA 1TKIA 3BCEA 4JJRA 4I0RA 1M7NA 3NEWA 4YTFA 3FZRA 1Z5MA 4OTPA 4O7RA 3WYXA 1UKIA 3E5AA 3G9LX 3I81A 4BVUA 3LXKA 4YJTA 4FKLA 4B9DA 5B7VA 2VNWA 4ZZMA 4Y5QA 1JKSA 4AA0A 2VZ6A 3H10A 5J5SA 1M7QA 2X2LA 4DH7A 1PXKA 3RNYA 3ZEWA 4YLJA 2HZ0A 4C0TA 2OJFE 4YJOA 3QC4A 2PU8A 4L52A 4NKAA 2PK9A 2XJ2A 4O22A 3N9XA 1OKYA 1FBNA 2OXYA 4WNOA 3RBWA 2VO7A 2WMRA 3DFCB 1J1CA 3K54A 3F2RA 3HECA 5EOLA 5DHJA 4G3EA 4RQKA 4RRVA 3FMMA 4X3FC 3FPMA 4EOMA 4DTBA 1PW2A 2QOCA 3DA6A 2XMYA 4JBVA 5I9YA 4NWMA 5EG3A 1PKDA 3E92A 2W9FB 3EOCA 4F6UA 2GNHA 3VBTA 5DPVA 2IZSA 4WG5A 5F1ZA 3GC0A 2GS2A 4E4LA 3V51A 3OCSA 3S95A 5DEWA 2ETMA 4QMNA 4GJ3A 3W2CA 4FV3A 4MYGA 4S34A 2WQMA 4ZS4A 2BIYA 4FKSA 4ANNA 4AX8A 4O21A 3QU0A 4NK9A 3NYOA 4FZ6A 4FX3A 3GCPA 4P5ZA 4Y73A 3QQUA 2CCIA 4ZIMA 5FQDC 4IFGA 3SA0A 5KZ0A 1W7HA 4FTNA 2BR1A 4NJDA 3BHUA 1YOMA 2ZM4A 3A99A 4G34A 3GXLA 4U0IA 5L2QA 3VJOA 5IMEA 2BDWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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