4HYIA

X-ray crystal structure of compound 40 bound to human chk1 kinase domain
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
272
structure length
269
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKRCPENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-based design and optimization of 2-aminothiazole-4-carboxamide as a new class of CHK1 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 83
structure length 269
sequence length 272
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-11-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4hyiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4hyiA01
3BELA 3NCZA 3V8TA 5GIOE 2IJMA 1J7LA 2BRBA 3MY0A 4QMMA 5IQBA 4H39A 4YJNA 3BU6A 4HCVA 3DAKA 4XV9A 4DINA 3PZEA 4PNIA 4EQUA 2YIWA 1PMNA 3A7JA 3PY1A 5EDQA 3CGOA 5E91A 4PF4A 4X2FA 4DC2A 2O2UA 2HW6A 3Q52A 3FV8A 4FT3A 5F1ZA 3T9TA 3FXWA 4FE2A 2HW7A 5LMAA 3AMAA 2IVUA 2XIZA 3VUMA 4IDTA 4YZMA 3PXQA 4LRJA 5ANOA 3D94A 5DT3A 2WIHA 3IQ7A 3VHKA 5FBOA 3FJQE 5J95A 2YHVA 3CE3A 2OXXA 2IW6A 3OCTA 4U41A 4LI5A 4E3CA 4QQTA 4FGBA 4KKEA 4FV5A 1KE5A 4IM2A 3HRBA 4ACCA 2F4JA 1YQJA 3UG1A 3DKFA 2A2AA 5KKRC 4ZZMA 3O8PA 4BTFA 1M52A 4BZOA 4E8AA 5CT7A 4FNWA 4EBWA 4F99A 2G2IA 3U9NA 5KBQA 3KEXA 4RIWA 4RVKA 2VZ6A 4AF3A 4R3RA 2ZYBA 2HYYA 5KBRA 4Q5EA 1APME 4JS8A 2GU8A 1YOJA 3G51A 4TZRA 4MD8E 5DYJA 3FLQA 2PMIA 2B9HA 5CEQA 2C3LA 3I60A 5DVRA 1H27A 2JD5A 4EOLA 5IPJA 2XIKA 3EKNA 4FA2A 4FTKA 1K2PA 2P33A 1OL2A 1Q24A 2UW9A 3ORLA 3HV6A 4BZNA 1O6KA 4ZAUA 5I3RA 3ZO1A 4O7VA 4AZEA 3QD4A 2WTCA 4EH2A 3QRUA 1Y6BA 3Q3BA 5AUXA 3RI1A 3BHVA 4QMPA 4DCEA 3VS4A 3GENA 4ZSLA 5HG8A 3UZRA 3RK5A 4FSTA 2R3JA 2HXQA 1WMKA 4NM3A 5EM6A 3HV5A 3UMWA 1Q62A 4FK3A 4QMOA 1FOTA 3LCKA 3R8UA 3W2PA 3V5LA 5DR6A 4C33A 4NCTC 3PJ2A 5E7RA 2PVJA 1PXMA 2J4ZA 4I5CA 5AR2A 3IDPA 1QPDA 2C6MA 4YC8A 3TZ8A 3KXGA 3AC5A 3MJ1A 3E93A 3BE9A 1V0BA 4IX5A 4YPSA 3EQGA 4DFBA 5L3AA 2XEYA 1BMKA 5J9LA 3UP7A 3EKKA 4U43A 4PNKA 4FG9A 3VJNA 3ZFYA 4NEUA 4TYEA 1UVRA 4U5JA 3TV4A 3DJ5A 4I5PA 4O91A 3MB6A 4TNDA 4DCAA 4KS7A 2BROA 4Z7HA 5EHYA 3KC3A 4AACA 4CNHA 3FI3A 3TNQB 3UO6A 4O7WA 2EXEA 4FTJA 5HO7A 3PE1A 3P86A 3FXXA 4GSBA 5EOBA 4O7SA 1O6LA 1OVEA 2W1EA 5HOAA 5CNOA 4MNFA 2JIIA 1XH7A 2J0KA 2ZV9A 3PVWA 3VF8A 4FIFA 4EH4A 2JIUA 3DV3A 4K77A 4JXFA 5GZ8A 4QQ5A 4MNEA 2Z60A 1DS5A 5J79A 4YJRA 4ZSEA 2ITOA 5CU6A 4W4XA 4RMZA 4G6NA 3VS0A 2WMAA 2F2CB 4ZS0A 3GCSA 2HWPA 3QD3A 3VUHA 4NTTA 5LWMA 4RFMA 3FLWA 2LGCA 3PG3A 4FTOA 5IQEA 3KCFA 1M14A 3PXKA 1HCLA 1MQBA 4YNEA 5GNKA 3QRKA 2W4KA 4RFYA 3E7OA 4MWHA 4FSQA 2REIA 1M2RA 5DLSA 3CTJA 5DR2A 3UIXA 2OU7A 2C69A 4EK6A 5I3OA 4IE9A 4CKJA 2IO6A 2HELA 1M2PA 4FZAB 3BGQA 3LFQA 4QMYA 3RWPA 3QUPA 3BLHA 3W2CA 3UGCA 4C2WA 3UODA 3VS6A 1WVXA 4FTLA 3PP1A 3EZVA 4WNPA 4XMOA 3RMFA 5DH3A 1XH6A 3EQCA 3QL8A 1OKYA 4YLJA 3K54A 4EONA 5FTQA 2FA2A 2B53A 3FQEA 4IAKA 4O2PA 5EK7A 2UW0A 5AR7A 4BDEA 4II5A 4M15A 2UW7A 4Z3VA 5CI6A 2EU9A 2AUHA 4IWPA 4JQEA 4AS0A 2UZWE 2XRWA 3BYUA 1OECA 3EQHA 1V0PA 2X81A 5IMXA 3EFWA 3ODYX 4I22A 3MESA 3Q5IA 2B7AA 4CFUA 4A07A 3HX4A 2YCRA 2CGXA 2O64A 4XEYA 3ZS5A 5C03A 2R3IA 4DHFA 2ZB0A 3R7UA 4ZZOA 5FEEA 4PY1A 3D15A 3GB2A 3MGYA 3DS6A 4Q9SA 4D9TA 5BVNA 4J52A 5I0BA 4I5HA 5IA1A 4EQCA 2OJFE 5IUHA 4DBNA 3NGAA 5CSVA 4WIHA 4FTUA 4GG5A 3CQWA 4F7NA 3D7TA 4U0IA 4QP1A 3R9DA 1Y91A 2B1PA 4K33A 5HIEA 5HBEA 4I5MA 4HVDA 4MBLA 4O6EA 3R73A 4OW8A 4L00A 2I40A 3S00A 3TG1A 3FHIA 3WZJA 2OH4A 4XV3A 3ZTXA 2C0TA 4LL5A 3R8LA 2VTJA 3TIYA 1WBOA 2R5TA 3MH0A 4HYHA 5AIRA 4DGNA 3LOKA 3RZBA 1NW1A 1BX6A 4IIRA 3L1SA 4I6HA 4WG4A 3IW5A 4JG7A 3PA4A 4JIKA 4YLKA 3Q53A 3CGFA 3GBZA 2OF2A 4DFZE 4RX9A 2OF4A 3RPOA 4M68A 3PE2A 5L2WA 3VS2A 1U5QA 3HDNA 3I7CA 5CVGA 3WIGA 3QTSA 4EHEA 5AV1A 4C3RA 3DB8A 4B9DA 4TPTA 2P0CA 4AT5A 2Y9QA 4OGRA 4OTRA 4E93A 3DA6A 3R7OA 1ZARA 4MHAA 2YWVA 5JEBA 2B9IA 3ZH8A 4IWQA 3JPVA 2VV9A 4HZSA 4Q2AA 5HICA 2QOLA 4RIOA 4UMTA 1ZLTA 5T3QA 3RBWA 4QMLA 2OKRA 4NKAA 2Y8OA 2ERZE 3G33A 2OK1A 2WMXA 4PPBA 2F49A 4QPAA 4R3CA 3M2WA 4QMZA 4F0GA 2GQSA 3DXQA 2UZTA 2AC5A 3D4QA 4JJRA 3F3TA 4LOOA 3TV6A 3PSBA 3HP5A 2GMXA 1F0QA 2BAJA 3TZ9A 4RA4A 2X1NA 3PPKA 4FIEA 4CFMA 1VEBA 5J5SA 2C5XA 4M66A 3VBXA 4YZCA 2GS7A 2BZIB 4RJ6A 4IAFA 3PP0A 2OFUA 5CAOA 2OW3A 4FTAA 3KREA 3P4KA 4CFFA 5J9ZA 2C6LA 3FKNA 3PY0A 3GQLA 3HMOA 4C61A 1NXKA 5HNBA 4MXZA 5CXZA 4QMUA 4CKRA 3I5NA 3LMIA 3IPHA 4LG4A 4F7SA 3F82A 4CZUA 5F94A 3D5XA 3MIYA 3N4VA 2ZJWA 3BX5A 2CNQA 4E7WA 2XK7A 4AFJA 2VTPA 4CV9A 3QXPA 4F9CA 2WEIA 4GYGA 4TT7A 5EI2A 1YXXA 3TDWA 3MBLA 4WD5A 3QQKA 4AN9A 4DFXE 3UC4A 4EK3A 4F70A 3OTUA 5CI7A 5FP5A 4XCUA 3R7GA 4S2ZA 5IQDA 3N4UA 4IC8A 2C68A 4Y95A 4GT5A 1LR4A 3FLNC 3MV5A 4HPUE 3ZRKA 5ICPA 4ITIA 2OFVA 2YIQA 4FMQA 5HLPA 3FZ1A 2C47A 4XG9A 4CT2A 3UPZA 2WMRA 5CVHA 5JK3A 1ZMWA 5E8SA 4N6YA 3LJ1A 3MA6A 4ZY4A 4JG8A 4E20A 3PY3A 3EN4A 3BV2A 4WKQA 4FF8A 4HVIA 4O86A 4I93A 4JQ8A 2O8YA 3DY7A 4RIXA 4QTCA 4FV3A 4RVMA 4XYFA 4CCBA 4UMQA 3PWDA 2XH5A 2HIWA 5KE0A 2FH9A 3FYJX 2WB8A 3F7WA 3JS2A 3LM5A 4GG7A 5J7HA 2WAJA 1DAWA 3FZRA 3UQFA 4GJ3A 3ZBXA 3KULA 2VAGA 5H8BA 3PRIA 2YM7A 3UJGA 4O21A 5LQFA 4YJOA 3Q4UA 1WZYA 5D10A 5DWRA 3G6HA 4IFGA 2F7EE 5D7VA 2J9MA 3KMMA 4LMUA 3TV7A 5IU2A 5KMOA 1PMVA 4BCOA 3B2TA 3EMGA 2GNIA 5FGKA 1QMZA 1H01A 3IOKA 3DFAA 1KUTA 2OG8A 3WE4A 4DFLA 4F9BA 1OM1A 2IZUA 3GCQA 1REJA 4O0XA 2BAQA 4ZSGA 5HHWA 3SV0A 4N57A 5LVPA 3FLZA 4FIJA 2XJ1A 3ZC6A 3JY9A 4F6WA 1MRYA 4RVTA 2G15A 3VUDA 4A06A 2VWVA 4D9UA 4E4XA 5LCJA 4PWNA 3CTQA 2QHMA 4JNWA 2OIDA 5CNNA 2J0IA 5E8ZA 4L8MA 4EI4A 5BUJA 3P9JA 4KKGA 4KA3A 5K0XA 2OJJA 4JBQA 3ERKA 5L8JA 4JBOA 3KN5A 3ZXZA 3OTVA 4DBXA 3W32A 1H08A 3B8RA 4W9WA 3FC1X 5BYZA 4GK2A 4FOCA 4U97A 4UYNA 4MYGA 4QMNA 4C7TA 5C26A 3F69A 1H28A 3QTQA 4FTIA 4LUDA 4QYHA 4WSYA 4G17A 1OPJA 5EOLA 3IGGA 2JFMA 4KRDA 2Z7SA 1DM2A 1KSWA 4O0TA 1R0PA 4AW0A 2OIBA 2X8EA 4W4WA 4I4EA 4FEVA 3K3IA 5HBHA 5C8NA 4IX4A 4EL9A 4ZTMA 5AX9A 5BX0A 4ANOA 5HTCA 1J7UA 3NUAA 3DK6A 2BALA 3W55A 1H24A 1ZWSA 3UVQA 1JKLA 1T45A 4BYJA 3E3PA 1RE8A 1H00A 2OICA 3MY1A 3OBGA 4RFZA 3TKUA 2IZSA 1JKKA 3CJFA 3KMUA 5LWNA 4C59A 4UMUA 4F6SA 3BGPA 4GK4A 4GS6A 3LKMA 2J0MB 4F0FA 4YU2A 4BCMA 5DN3A 4QYYA 4UMRA 4LGDA 3R7YA 3G5DA 5TF9A 4A4XA 4DH1A 5BVFA 3ET7A 3NIZA 4DH3A 3EN9A 5CEOA 4AE9A 3QC9A 5B2LA 4DGMA 4CFNA 3HUBA 2J5FA 5KMJA 4CFVA 4KNBA 4U8ZA 5CEPA 1RJBA 2Z7QA 4FKVA 1GNGA 3JVSA 2X7FA 5ANGA 1XWSA 4PP7A 5K3YA 3PLAE 4I41A 3SGCA 3A4OX 3GU7A 4FV8A 5A54A 5LVLA 2GHLA 4H1MA 4ZY6A 1LP4A 4J98A 3OOMA 3U6JA 2YIXA 2C5YA 4O0UA 2PZIA 5FDXA 3SC1A 3UYSA 2WQMA 4EOMA 3F66A 1PXLA 3ZFMA 3KRXA 3MPTA 3H4JA 4G3CA 4NIFB 4IW0A 1YI3A 4RLLA 4GEOA 5D7AA 3R1NA 4YJSA 4ASEA 2EXMA 4CTCA 2ITQA 2PMNX 2ZV7A 3SW7A 4HVSA 5IQGA 3RJCA 2J51A 2I0YA 4RBLA 5CAUA 5BQ0A 5FXSA 4NH1A 2X4FA 3UOHA 4IJ9A 4C38A 4A9SA 3CPCA 3DBEA 5AA9A 1QPCA 2ETKA 2WMWA 2WNTA 3DTWA 3BHHA 4OTWA 2DYLA 3Q04A 1FGKA 4TWOA 4HGLA 4IX3A 1PMEA 1JSTA 3KXMA 4DLJA 3QCQA 4K8AA 2WTDA 2Z8CA 1Z5MA 2QURA 3FZPA 2W96B 2QG5A 3MH2A 4DEAA 4AA4A 2C30A 2V5QA 4HYUA 2BCJA 2O63A 3SKCA 2UVYA 1U5RA 4DITA 3AOXA 4R3PA 1YHSA 5LMKC 1JOWB 4UN0C 4D4YA 4W9XA 3VS3A 4DG0E 1W98A 5HZNA 5TO8A 4ACGA 2JBPA 3R02A 5HTBA 1FINA 3OUKA 5EKOA 3N9XA 4S33A 4H3QA 3RGFA 2XEZA 2XNBA 5M44A 3EFLA 4IFCA 1BL6A 4V0GB 3QKLA 3MVMA 4X3FA 4FTCA 4GK3A 1XR1A 3ZCLA 2X4ZA 3LMHA 4BF2A 4A7CA 2R3MA 3VQUA 5I5ZA 1DI9A 3QWJA 4R7HA 5ETCA 4C2VA 3OCSA 3OWLA 3RALA 5FEQA 1PYXA 2QOIA 4NM7A 3RHKA 3FMKA 5BNJA 4BCPA 4BIDA 3OXIA 2R0IA 4HJOA 4ZS4A 1BL7A 4J71A 4WSQA 5C4LA 3JVRA 5AM6A 4MVFA 3HUCA 3G9NA 1H1QA 1GIJA 4KB8A 1OL5A 4YGAA 4C37A 3F3VA 5A4LA 2BDWA 4NYEA 4CRLA 3LIJA 4NFMA 5EW8A 3UO4A 2IVSA 5IH4A 5EDRA 2GS6A 3NNXA 4AG8A 2BUJA 4HYIA 3TJDA 4CFWA 3AT4A 3C4FA 4XG8A 5A4TA 2H6DA 5A6OA 4ZP5A 2ZM3A 3DDQA 4EYMA 3BPRA 4FTNA 5JMSA 4ZSAA 3GT8A 3LQ8A 4I4FA 3P08A 3UC3A 5EYMA 3W2OA 4BWXA 5M08A 2JITA 1F3MC 2W5AA 4BI2A 4JDJA 5A46A 4MBJA 5AP4A 4ZZNA 4XOYA 3NUYA 2R9SA 2B9JA 3F5UA 5IUIA 4I6QA 3V6SA 4TYIA 5JGAA 3VUTA 2ZDUA 3E8EA 5E8WA 4AUAA 4KS8A 3QQFA 3THBA 4BICA 4KIOA 3OEZA 1REKA 2FVDA 4PUZA 4XG7A 2V55A 3EN5A 4RG0A 4BGQA 3MH3A 3O0GA 4IBMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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