4I24A

Structure of t790m egfr kinase domain co-crystallized with dacomitinib
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
315
structure length
295
Chain Sequence
NQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDAD
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Insights into the Aberrant Activity of Mutant EGFR Kinase Domain and Drug Recognition.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
total genus 92
structure length 295
sequence length 315
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4i24A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4i24A01
2JAVA 2Y8OA 2ZVAA 3KL8A 1Q8ZA 3O23A 3R01A 3TDWA 1IA8A 1R0EA 3C51A 4FSQA 5E8ZA 5EI2A 5H8EA 1OPLA 3GBZA 3RBWA 1Q41A 3DK3A 3FZPA 2W06A 4XOZA 5A3XA 2WFYA 4IVAA 1JSVA 2VTAA 3FLYA 1WBTA 3FL4A 5EHYA 4FSYA 5M08A 2GNGA 4FTKA 4U42A 3IO7A 3HUBA 4JAIA 4D2WA 5C26A 2IWIA 2VTHA 1GZ8A 4I1ZA 2PUNA 3QD0A 1BI7A 3DDPA 4XBUA 4FTOA 2EU9A 4L46A 2IVVA 3OCGA 4W4YA 1CDKA 4YLJA 1PXKA 2QU5A 5IQFA 5KBRA 3ZSHA 2QCSA 2PVLA 3HDNA 4QMVA 1GOLA 3EKKA 4O1PA 4Z55A 2GNJA 1KV1A 1NVQA 1XH7A 2G15A 3F3TA 5K9IA 3IECA 2BKZA 3HRBA 4JT3A 1ZXEA 2C68A 3SW4A 2W1HA 1B6CB 4RFYA 1Y91A 3CGFA 4CGAA 3D4QA 5HQ0A 2NRUA 2BAQA 3QD4A 3LFEA 3PP0A 1SMHA 1U54A 1W98A 3C4XA 3PRIA 3HMOA 4M8TA 3QLGA 5K5NA 2QO9A 2I7QA 3NPCA 4QT1A 4ARKA 3VS1A 5CZIA 4QO9A 2W0JA 4RX8A 1CM8A 2QU6A 3GT8A 5GINE 5CAPA 4FIJA 3MV5A 4LFIA 4CEGA 3M1SA 3VJOA 3DTCA 4ENYA 2J2IB 5CAVA 4OTWA 1M52A 4QYYA 3OROA 3PZHA 3DTWA 3OG7A 3G2FA 3HRFA 1OI9A 2YAKA 2XNNA 3LZBA 5CT7A 4HVHA 4O7WA 4TN6A 2ZV2A 2UW8A 3BHTA 4RWJA 4RWLA 3S3IA 3ZRLA 5KKRB 3UNKA 2ITQA 2QLUA 5EYMA 4E1ZA 4EHVA 4A9TA 5EQPA 5D7AA 2ITTA 1WVYA 3HAMA 4I0RA 4IH8A 4OTPA 3PXKA 3FMHA 1RDQE 2P4IA 4G3FA 5M09A 4YJNA 2ZDTA 3KMWA 4A4LA 3F3VA 3EJ1A 4LOPA 3S95A 5AM7A 5JH6A 2XKCA 2PMLX 3WOWA 1ZARA 5FBNC 1UWHA 1PF8A 2IZUA 2BFYA 2OJ9A 3E3PA 3NR9A 4FKVA 5DBXA 3V04A 1OL1A 3V5PA 4AN9A 2VUWA 4WO5A 2Y4IC 5JFXA 1ZY4A 1J3HA 2QOIA 2QOLA 3UOLA 3OBJA 3MYGA 4FTLA 2UW0A 1DS5A 3NW7A 4FV0A 2XUUA 3JY0A 4GFMA 4RVTA 3U55A 3GCQA 5HU9A 3GGFA 4DFXE 4BBMA 3PJ1A 3F5UA 1YI3A 3Q9ZA 4GW8A 1WBVA 4I4EA 3VJNA 2PZIA 2GQRA 4FV2A 3L1SA 4X2FA 3TEIA 4IX5A 1GIJA 5ANIA 1OL7A 3FMLA 2PUUA 2EUFB 5FEDA 1GJOA 4H3BA 5B7VA 3CY3A 4U79A 2OI4X 2BRNA 1OKYA 5FM2A 4XEYA 4BHZA 4Q5HA 3DJ5A 4MF1A 4GUEA 3R9RA 1HOWA 2YABA 1YRPA 3UO6A 3MPAA 1OPJA 4U5JA 5JQ8A 3ODYX 3NVMB 4O7SA 3UODA 1R3CA 3OTVA 4JQ7A 4NW5A 3EWHA 4MD7E 2W5HA 4FTMA 3WF6A 5BQ0A 3E64A 4ASZA 5A4LA 2ONLC 4PTGA 2R3LA 2FSMX 4R1YA 3LM0A 4APPA 3HV5A 4D5HA 4I3ZA 4L53A 3BHHA 5JZNA 3WF9A 4QOXA 3TWJA 4TNBA 4DG2E 3CP9A 3FBVA 4FZAB 4G2FA 4GYGA 4L8MA 2IW8A 4FYOA 3UOHA 3FLSA 4RIOA 4K77A 3F3UA 4DFLA 4F4PA 3V5QA 5IG1A 4U41A 3E93A 3NAYA 5BMMA 3L8VA 4FV4A 4U45A 3DA6A 5B2MA 1UNGA 2FGIA 5ANKA 4UMRA 1WVXA 2HW6A 4S32A 4CMUA 2XA4A 3KRWA 4U40A 4EH2A 3NCZA 3PFQA 2VN9A 2R3PA 4C57A 4C34A 3Q6WA 5I4NA 5J5TA 4O7YA 1UKIA 1XH8A 1OIRA 4RQKA 2WMTA 2Y9QA 3U51A 3IW8A 5AUYA 3VAPA 5CF6A 3N9XA 4R1VA 4JX7A 3DJ7A 2O63A 2VTMA 3NLBA 4J7BA 1XQZA 2E9PA 2JDTA 3A7FA 2HXLA 4GT4A 1FGKA 4RIYB 1ZMWA 2B4SB 4UYAA 3BV3A 4CRLA 2W9ZB 4LGGA 5LXMA 2XJ0A 1OITA 4G3CA 3SQQA 4NSTA 3BU6A 3MH2A 4YGAA 3SAYA 5I9WA 5EDQA 5AAFA 4D4RA 4ZMEA 2O3PA 5EI6A 1O6YA 3COKA 5HBJA 4TWPA 3ROYA 5CYIA 3MFUA 3DQWA 3V01A 3WE4A 4E73A 4CMOA 4QMSA 4FT5A 2CNVA 3KQ7A 4R7HA 3C13A 3ZYAA 4M68A 4RBLA 4L6QA 4RLLA 4BRXA 4CV8A 4QMQA 3AT4A 4RIWB 3RK5A 5K0KA 3A8WA 3VQHA 5CSHA 3VW8A 2PUIA 4AUAA 4O0SA 3H0ZA 4E4MA 1V0PA 2YCQA 3IG7A 3G6GA 2EB3A 4XUFA 3ZSIA 3TV4A 4IAFA 2IJMA 4DH1A 4BIBA 5GHVA 3R9NA 2GHMA 4J98A 4BWPA 2A1AB 4GT5A 4CLJA 3F9NA 4ZSJA 3OWKA 5B2LA 2QNJA 3CJFA 3BWJA 1W8CA 2FH9A 4B4LA 1ATPE 4EOQA 4TL0A 3AC3A 4QTCA 1MUOA 1Q5KA 2P0CA 4ZK5A 5M07A 4XJ0A 3GFEA 1YVJA 4BCKA 3GEQA 3MTFA 2Y0AA 3UC3A 5I9VA 4GFGA 3DAJA 4H39A 5AV3A 3TZ9A 3DBQA 5T68A 4YZCA 1Q4LA 3ZONA 5AEPA 5AP5A 3PPZA 3Q04A 4E5AX 2R3MA 2QO7A 2VNWA 5AUZA 2PK9A 2WMVA 4FKLA 4FEXA 4KA3A 4XBRA 3HZTA 5FXSA 3V6RA 4RIYA 4KIQA 4QP2A 3DS6A 2R5TA 4AOTA 4F0IA 4BDIA 4C4EA 4FKSA 5FWKK 4YURA 2YDJA 3OY3A 4PL4A 3RWPA 2KTYA 2VRXA 2WTIA 2OZAB 1Q8UA 3LFNA 4FTAA 4DH3A 3FI4A 3QZHA 1HCKA 4LL0A 2XM9A 4NEUA 4DH7A 2EXEA 4GS6A 4O0XA 3PY3A 4ZZOA 1JKTA 3BEAA 3Q60A 3NYNA 3Q6UA 4PY1A 4KSQA 3E63A 5L2TA 3MVMA 4MXAA 4QP1A 2IVTA 3HDMA 2RKUA 3ZLWA 3PY0A 4RIWA 4CCUA 4I5HA 2RF9A 1PXIA 2PZYA 3GC7A 4YO6A 3CPCA 3ULZA 4H1JA 2ITOA 4JXFA 4UWCA 2IO6A 2ETMA 3FMKA 5CVHA 4I22A 5I9UA 2G2IA 5E1EA 3ORTA 3TNIA 2CNQA 4JBPA 3TDVA 4ERWA 2WTVA 2IVUA 5EM8A 5J87A 4M13A 1Z57A 2C3JA 3FXWA 3NS9A 4RZVA 2WXVA 3RPRA 2Z7SA 5M51A 3QCQA 3PIZA 3POZA 4DYMA 4UXLA 4EOKA 5CEMA 4EWHA 1YHWA 5ETFA 2R3OA 1URCA 4FTTA 4PQNA 1UU7A 4O81A 4ENXA 5BVDA 4D5KA 3E8DA 4Y95A 1IA9A 3K5VA 3OTUA 3HMPA 1CTPE 3W2RA 3ZDUA 3MVJA 1Y57A 2HW7A 3IGOA 5KZ0A 4IMYA 3RINA 4OTFA 4FC0A 4QMZA 3QQUA 4EH5A 3DPKA 4MF0A 4CQGA 3B8QA 4YSJA 3UVQA 3TKUA 4Z7GA 4HCUA 2UVXA 4AZSA 3TNWA 3NNUA 3O0GA 4QQ5A 1JOWB 3SC1A 1BL6A 2WQOA 5JT2A 1KUTA 5F94A 2A27A 1JKLA 3OUNB 3KN5A 3FQEA 3U9CA 4S31A 5BVWA 2VTOA 4X0MA 3Q2MA 5EM6A 4RC3A 4ZJVA 3ZO2A 5CSWA 3P79A 5AR3A 1PMUA 4KIKB 3TIYA 3AC4A 2OZAA 4C62A 5FXRA 4QMXA 3ZO3A 3R6XA 4N70A 4OBPA 5CEPA 5DPVA 2OGVA 5AA9A 4FUYA 5AADA 3N4UA 4V05A 3MPTA 3HMIA 4MNEA 2VTJA 4DGOA 3FC2A 5C8NA 4M84A 1CSNA 4GU6A 3G0EA 3CS9A 3FY0A 3MY1A 5EOBA 5GZ9A 2WTDA 2VU3A 4GT3A 4BBFA 4EK5A 2FSTX 3BWFA 3F88A 5CXHA 3ZZWA 5AV4A 5LMKC 4IHPA 4WG5A 5EKOA 2X7GA 1DAWA 3FE3A 3KXZA 3QLFA 3NIEA 4NTSA 4EK6A 2YWVA 3QZIA 4F09A 4FSUA 4BIDA 3L8SA 1S9IA 3BEGA 3GENA 4HNIA 5IUGA 3QX4A 1XR1A 3GOPA 3H9FA 4AT5A 3OT8A 4DFNA 3G15A 4ALWA 5CY3A 2LAVA 2J6MA 4FG9A 2W1DA 1ZMUA 5IQDA 2HIWA 3A8XA 4FVRA 2WQMA 1SZMA 3AT3A 4P5ZA 3VO3A 3P7CA 4IFGA 1U5QA 4FG8A 2FO0A 5F20A 3EQRA 4BDJA 5HU3A 4MH7A 4WD5A 4H1MA 3TV6A 1P4FA 1ZYCA 3P08A 1WBSA 4KBKA 2PULA 1STCE 3UP2A 2PE1A 4YZ9A 2XNPA 3CQEA 4DN5A 3KXGA 4O38A 3D15A 4EL9A 5HO8A 4K1BA 5LMAA 4C59A 3E8EA 3LE6A 3QKLA 3K2LA 4E6AA 3I5ZA 2QOQA 4KIKA 3RVGA 3WI6A 2XNEA 4YLLA 2QHMA 3Q4TA 3PXYA 4JG6A 4L00A 2C69A 4W4VA 3DNEA 4EOIA 3OW3A 2UZTA 5M55A 5CALA 5IF1A 2JDVA 3LXPA 3N4VA 3LCSA 4QP8A 3UG2A 4Y8DA 4DC2A 2CGVA 4J8NA 5IUIA 4KSPA 4AOJA 3D9VA 3D83A 3BYUA 4AF3A 1J7UA 1LEWA 5HG7A 4IB3A 4JX3A 2W4OA 2J50A 4BI0A 3PXRA 3D2KA 2J0IA 3B2TA 2X7OA 2GQSA 1YHVA 5HI2A 3BHVA 1FVRA 4AT3A 3KXNA 1P5EA 3IS5A 4J71A 2CCIA 1H0WA 4FIGA 2DUVA 4L3JA 4NJ3A 4XG2A 4DBXA 5KMJA 3PXFA 1M2RA 1WZYA 4BZNA 3F7WA 3FV8A 5M4UA 2OIQA 4KKEA 3FY2A 5HICA 3R7UA 3UQFA 2QVSE 3Q5ZA 4AXAA 3MESA 5JGAA 3KREA 3LFCA 4Q9SA 5ANGA 4IC7A 3I0QA 2IVSA 3RK9A 2WTJA 3TG1A 3FDNA 5F1ZA 2X4FA 4GVAA 3TUCA 2UW5A 4L01A 2BCJA 4BFMA 4C4JA 1Q8TA 2VWIA 4IZAA 1ZMVA 3BLHA 1F3MC 2O65A 2C5YA 2XIRA 4O0TA 2V7AA 4Y72A 3TUBA 5E9EA 1H25A 3EB0A 4FKQA 4FKJA 4EK3A 3DKOA 3MJ2A 5TOZA 5JMSA 1XKKA 3MS9A 4NKSA 3MB7A 3NUPA 4Y83A 5DLSA 3CQWA 3UZTA 2Y6OA 2B9JA 1G3NA 2GSFA 2XK7A 3FMNA 4NM5A 5CSPA 4A9RA 3SXFA 2Y4PA 3A62A 4W9XA 2UZUE 3QTXA 2C6LA 4FF8A 5GJGA 4FKWA 2WU7A 2WTKC 4NWMA 4J8MA 4YBKA 5FBOA 5LQFA 1OBGA 2FVDA 2GPHA 4O96A 2GMXA 2VZ6A 5KKRC 1U4DA 1Y6AA 4MKCA 2JKMA 2WHBA 4KBCA 4LUEA 5HVKA 5AFVA 4R3RA 4KIOA 3V3VA 4Q9ZA 2P2IA 3QHWA 3VULA 3ZSGA 4G34A 2XNBA 5D12A 3NYXA 5A6OA 3PSBA 5DT0A 5JFWA 1K3AA 5IKWA 3W2CA 3G33A 4M69B 3ZLSA 2EVAA 3R7OA 4YTFA 5CXZA 4YPSA 2OWBA 3HKOA 1KOBA 4HVIA 3FKNA 4CQEA 2JDRA 2CGWA 2PMIA 1R39A 3NWWA 4QP4A 5CT0A 2WMXA 2XP2A 5HVJA 5CZHA 4AE9A 2VAGA 4YMJA 5HEZA 3P7BA 5JN2A 4UZHA 3R71A 4UXQA 4BB4A 5AR8A 4I93A 3U9NA 3O8PA 3RWQA 1LP4A 3QYZA 3DKGA 4BCQA 2YISA 4PP9A 2FA2A 2SRCA 2QG7A 1H8FA 3ZXZA 1PXNA 2GTMA 1XJDA 4X7QA 5CF5A 4IX4A 3BV2A 3IW5A 5CWZA 2VWVA 4GUBA 4L43A 5I3OA 3VQUA 3I4BA 1J91A 2OO8X 4F0GA 5LVPA 1QPJA 5EW3A 2PVRA 3NUYA 4FMQA 2FYSA 4FK6A 3F2RA 3NSZA 2XBAA 3ODZX 4IB1A 4AE6A 4BCFA 1SYKA 2J51A 4DEEA 4TRLA 4ZSEA 3SX9A 2ZV9A 4P4CA 3D5XA 3AG9A 4GJ3A 4RLKA 4XV1A 5AIRA 3BKBA 4O83A 2BDFA 4C37A 2YIQA 1ERKA 4IZYA 4AW2A 4BZOA 3DZOA 3COIA 4OTHA 4DEDA 5CASA 3EQGA 3V5JA 3P0MA 4R7BA 3DGKA 1QPCA 4GVJA 1A9UA 1PXOA 5AV2A 3RPYA 3W8LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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