4IAAA

Crystal structure of ser/thr kinase pim1 in complex with thioridazine
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
273
structure length
272
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Ser/Thr kinase Pim1 in complex with thioridazine
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase pim-1
total genus 74
structure length 272
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4iaaA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4iaaA01
3P1AA 3UIUA 3WF7A 3I0OA 4FK3A 5F9EA 1R78A 4KABA 2REIA 3EN4A 1ZRZA 4AT3A 4D2SA 2IN6A 1H1WA 3BBWA 2OH4A 2OZAB 4ZSAA 3FL4A 4GVJA 5M08A 3ERKA 3SQQA 5K5XA 1O9UA 2JKMA 3OMVA 2R3HA 1J3HA 4JRNA 5ANIA 4DEHA 5G1XA 5LCJA 3RAHA 2R3NA 4NSTA 3BX5A 3NR9A 5K3YA 3MH3A 4K77A 3FMEA 4BDDA 1P4OA 3ETAA 3PPJA 1WBVA 3LQ5A 5CT0A 4YURA 1NXKA 3KN5A 1H1SA 4BBFA 2UZEA 3NDMA 3BIZA 4O7WA 3EQGA 2XIXA 4XG4A 4CVAA 4KD1A 2EU9A 3F61A 4DFYA 1OM1A 4IXPA 4J52A 3HNGA 5E4HA 4KIKB 3PA5A 3G6GA 4YSMA 3K5UA 1LP4A 5AP2A 5HE3A 2JDRA 5KZIA 4NL0A 3PXZA 2Z7RA 4FC0A 3NUSA 2VTRA 4IB3A 4MAOA 2PUPA 3EFWA 3QXOA 3E63A 3HV5A 4ENXA 1ERKA 3IPHA 4R7HA 5AUYA 2AC3A 2PVKA 4PP9A 2PZYA 3MH1A 2F7EE 1W8CA 5I5ZA 4GJ2A 2X2MA 1U59A 2ZM4A 3OW3A 2A1AB 3C4EA 4U44A 3ZLXA 4AE9A 3R73A 2GU8A 3QRKA 3W2CA 4QQTA 2XA4A 4CG8A 3F3VA 5K5NA 2FGIA 4FIJA 2O63A 4GK3A 3RNYA 5GNKA 2W1CA 3BYOA 1JLUE 1OIUA 3BQRA 5IG1A 2GTMA 2B9HA 3E8CA 2PE0A 3EFJA 3KF7A 4FOBA 4LRKA 4X3FA 3NNVA 5CTPA 3TZ7A 3WBLA 3G15A 4BCPA 3RINA 4CEGA 2F7XE 4GYGA 4WNMA 4FSQA 2QR7A 3FXXA 2YEXA 1P14A 3R8ZA 4HVSA 2JAMA 4O0TA 3LXLA 5CI6A 2BROA 3EN7A 3U55A 1R39A 2R64A 1HCKA 2XB7A 2PMOX 3QZFA 4R7IA 5CQUA 5FQDC 3QBNA 5ETAA 4QT1A 5ACBC 4NW6A 4PTGA 4A07A 3GOKA 4B8MA 4O7SA 3KULA 2B54A 2W4KA 2ZOQA 3D7TA 2XRWA 3V04A 2WU6A 4ZK5A 5HIEA 3COIA 3DZOA 3I81A 1A9UA 3S4QA 3H10A 1K2PA 4EK5A 5AV4A 4FE2A 3SG8A 1V0BA 3PYYA 4XLVA 2IW6A 4IC8A 2C3KA 3A62A 2FSOX 4D5HA 5L2WA 2OO8X 3NW5A 4RA4A 2FYSA 4E20A 5JMSA 5DT0A 4DH5A 1V1KA 5K0KA 1XH5A 3F3UA 4S2ZA 4BWXA 3EHAA 1H25A 5HE2A 2PL0A 2O8YA 3KB7A 4DEGA 4RFZA 5CXHA 3UOKA 3EQIA 2R3LA 3PG1A 4KBKA 2WZJA 2G2FA 4LYNA 4AOIA 2W99B 2R3QA 2OZAA 4KIQA 2UW5A 4APCA 1OIQA 1BI7A 5M53A 4BCFA 4AW5A 3QD3A 4D2VA 4O38A 3NYXA 2Y6OA 4C3PA 3PVUA 2QLUA 3SW7A 5DHJA 5DEWA 5DE2A 3LXPA 4H3QA 4IBMA 2YWVA 5AMNA 3C13A 2OI4X 1ZYSA 4HOKA 5IQEA 4RRVA 5HD4A 4Y95A 4QNYA 1CSNA 3R7EA 4ANQA 5BVDA 5LWNA 3GU6A 2C0OA 5EYDA 3MJ2A 4F0FA 4FSNA 4KIKA 5CLPA 3TN8A 3C4WA 3R63A 4CTBA 1YRPA 2R3KA 3QLFA 1QL6A 4E6DA 4F99A 1H24A 3TIZA 2ONLA 2OXXA 3A2CA 4C34A 4RJ4A 5T6KA 2QO2A 1XBBA 2BZKB 2QOKA 2CNQA 5J1WA 3RM7A 3LMGA 4DYMA 4O0SA 3WI6A 5I3RA 5EW9A 2VTQA 3FKLA 3VQUA 4GK4A 2HZ0A 3ZFXA 4GFGA 4FG7A 3KN6A 3OY3A 4GEOA 4H3BA 1YI4A 3DBDA 2OF4A 3HGKA 3MB6A 4ANSA 5I9ZA 5IA3A 4HPTE 1R0EA 4QTEA 4EH5A 4O7VA 5GIOE 3IW8A 5H2UA 5E90A 3W8LA 5D1JA 5IEXA 4EK3A 4FV0A 2SRCA 5IH4A 3G9NA 3E92A 4XV1A 4J53A 5FWKK 3ORZA 3UIXA 2IZRA 2YAKA 2VWUA 4NM5A 4FTKA 4HGTA 3N51A 4O82A 4EOSA 3DBEA 3QTSA 5FTGA 4HZRA 3BGQA 2XH5A 4FKPA 2CKOA 4R77A 4O27B 2AC5A 5C8MA 4I21A 4RIWB 4EL9A 4IMYA 5D7AA 4BDKA 2HOGA 3H4JA 2Z8CA 4L44A 2AUHA 5DGZA 3VHEA 3PPZA 4R3PA 2PZ5A 4EK4A 4RX9A 4MNEB 3R8UA 5HCZA 5IQFA 2XIRA 4U3YA 4KSPA 5KMJA 4AZSA 5A46A 4FV3A 2I0HA 2VTNA 5HVKA 2W06A 5CAVA 4DN5A 3MY1A 1PRYA 2WTJA 2ZYBA 1JOWB 1JBPE 5IA2A 3NZ0A 5IH6A 3VN9A 4O7TA 2I1MA 4NH1A 2QG5A 4Y85A 5IU2A 5CSHA 1MRVA 4IM2A 1W7HA 3QTZA 4BDHA 3DV3A 3ZBFA 4CMTA 3PP0A 4HGEA 3ULZA 5JFWA 5ANKA 3E3PA 2OBJA 3ODYX 4HZSA 4YO4A 5FTQA 3F3WA 4V0GB 4S32A 1UU8A 4FIHA 2E9PA 4FKLA 4MYGA 1AQ1A 4OBQA 4ZP5A 3VBTA 4AWIA 2HENA 4RX7A 3BLHA 4F70A 2YIXA 5FTOA 1XH4A 4C3RA 4R1VA 1H26A 1XWSA 3CS9A 3KXGA 4AGCA 2XNNA 2YIRA 4FF8A 4YNEA 4EJNA 2QLQA 5A6OA 3V51A 2I0EA 2CGWA 2R3PA 2YITA 3T9TA 2ZJWA 2W7XA 3QQJA 3QKLA 3R04A 4YLLA 2ITXA 3UZTA 4FTQA 3AT4A 3EQDA 2WEIA 3TJDA 4AXAA 3R9HA 1FVVA 1KE8A 5A4LA 4OTHA 1GZOA 1MP8A 4RLKA 4TY1A 4QP2A 5HE0A 5DWRA 3W8QA 2QO7A 3L8VA 1H08A 3EZRA 3QTRA 4W4YA 4ZMFA 5LCKA 2WMSA 4S33A 3NGAA 2CKEA 2GS7A 3A60A 5M4UA 3PIZA 4NW5A 2XM9A 1OZ1A 1HOWA 4I4FA 4CCUA 1BKXA 4D4RA 3TM0A 3HUCA 4QP3A 3II5A 3TKUA 4KINA 2ZMDA 4FV4A 4H36A 2YDKA 3E7OA 4KNBA 4ZAUA 4UWCA 4QRCA 3JVRA 4H05A 4LV8A 2R2PA 2WPAA 5LARA 5ACKA 1Y91A 3GUBA 4DITA 4BZOA 2C3LA 4P4CA 1REJA 2VTAA 3OHTA 3R02A 4O22A 1NY3A 3P23A 2QOBA 4FG9A 4WNOA 4IB0A 4BKYA 5JFSA 4UALA 3FMDA 1Q8WA 1T45A 2BPMA 4EBVA 4B9DA 3C0HA 4Q9SA 4RJ3A 5LVPA 1OUYA 4OTWA 3UOLA 5TR6A 4U7ZA 2VNWA 5CSVA 3R8PA 2YWPA 3JUHA 4EHZA 3PZHA 3G0FA 3QRJA 5IDNA 4TYJA 4EUTA 4L45A 3PA4A 5L8JA 4B0GA 3FMHA 4JT3A 3VS2A 2PUNA 3D2IA 5AP3A 3KXMA 5AR3A 4MNFA 4BTKA 4DA5A 2NO3A 3KL8A 4YPDA 3DKOA 4QMUA 4GT3A 4J8MA 3RPRA 2ZDUA 4QP1A 4BHZA 4WBBB 3CY3A 1OKVA 1G8SA 3MFTA 5CU4A 2UW7A 2VX0A 2WOUA 3ACKA 4YJVA 5AM6A 2VTLA 4FSWA 3RNIA 4DEEA 4FIEA 1Q8ZA 4AQCA 2EVAA 3R1SA 4C3FA 4RZWA 1BI8A 2H6DA 3QXPA 4YZDA 5FDXA 5F94A 2OJFE 3NUNA 5J9YA 4M7IA 3VBXA 3E88A 3S95A 1G5SA 5KMOA 4JRVA 5AAGA 1PMEA 5J7BA 5L8KA 3COKA 4PL4A 4F08A 1Z9XA 3JS2A 3M1SA 4M14A 3PXFA 4K8AA 4RBLA 4C57A 4G34A 2BDFA 4CCBA 4IB1A 3QC9A 4V0GA 3UQGA 3U6JA 3MGYA 4BWPA 4FKVA 4ID7A 2CLQA 1SZMA 3BPRA 5HBJA 4FUXA 2FSTX 3GGFA 3PUPA 5AR7A 5LMAA 4ASZA 1XR1A 4OBOA 4E7WA 4FNZA 4FT0A 4JXFA 2GTNA 5JRQA 3B8RA 3VC4A 1KOAA 3H9OA 1ND4A 3HA6A 2JITA 2W5AA 3BU6A 3P4KA 3O8UA 3A4PA 5IISA 3RHKA 4FEQA 3FI3A 4FT3A 5AAFA 2RFDA 3DDQA 5C27A 2XK6A 3NW7A 5HGIA 3CGOA 4BGQA 1DAYA 4BWKA 3MVJA 1JSUA 3RWQA 3Q52A 2JDSA 4GU9A 4FV5A 2HIWA 4G3EA 4Q9ZA 3FDNA 2YA9A 5CX9A 4FL1A 4CG9A 1G8AA 5CNOA 2PSQA 2YM4A 5LMKC 5EQPA 1OBGA 4DINA 3NNUA 4IAYA 3HRFA 2XNEA 2W1GA 4D2TA 3F2AA 4FKSA 3WF9A 3FI8A 1V0PA 5BVEA 2CCIA 2XEZA 3BHTA 1BX6A 4EH9A 4YC3A 4BIDA 3RPVA 1CKIA 1KE9A 5AV1A 3UP7A 2JEDA 4G31A 4G2FA 3R7UA 4KIPA 3KMMA 4G17A 3LCKA 3KREA 4ITHA 4AP7A 3TI1A 2B1PA 3GNIB 3GQLA 1V0OA 4PL3A 4ZOGA 4D0WA 4DE4A 1PXIA 4DBNA 2IJMA 3O71A 3AC1A 5L2QA 3SDJA 4RWJA 4JG6A 1H8FA 1ZY5A 4L7FA 3Q4ZA 4XRJA 3CPBA 5CI7A 4D1ZA 2QOIA 1PKGA 5HEZA 2X6DA 3KFAA 5EDPA 3RZBA 3CP9A 3JY0A 4D4SA 4FSRA 2J5EA 4RQKA 4QO9A 4D1XA 1UU9A 4L6QA 3VO3A 1O6KA 1B39A 3TNQB 3ORMA 5BYYA 3Q32A 2O64A 2VTMA 3ORPA 5HD7A 1QPCA 2JIUA 5I9VA 2UZBA 2VUWA 3PLSA 4FYNA 5JZNA 2XF0A 2YACA 4CZTA 4F09A 5AR5A 2DQ7X 4TNDA 3BYSA 4EWHA 4ZSEA 2BTRA 2H96A 4C4HA 1OL1A 3CJGA 3LHJA 4K1BA 3P08A 3AGLA 3EQBA 3U6IA 3RGFA 2FSLX 5LMBA 5A9UA 2X2KA 2UW8A 4GH2A 5BUIA 1BL6A 4BTJA 3RAWA 1LUFA 3DJ7A 4G3FA 3PY1A 4O0YA 3SLSA 5AEPA 2CPKE 4NIFB 3LCOA 4JR3A 2PVHA 4GYIA 4AGWA 4IAFA 1LR4A 5AP5A 4AS0A 4XRLA 4IHPA 4BZNA 3N4UA 2OXYA 2OH0E 2ZB1A 3V5WA 3LFDA 2IZTA 3TNHA 4C37A 3RCDA 4KSQA 5L3AA 4ANNA 4GL9A 5CNNA 2GPHA 3R21A 4QD6A 5IA0A 5L4QA 3HMIA 5T3QA 4C59A 4QQJA 2C3IB 3AXWA 3PWDA 1XH7A 2CLXA 2R3OA 2XK3A 4O86A 4IQ6A 4G3CA 4IX5A 1ZAOA 3EOCA 4OBPA 2WQBA 4L01A 5M09A 2X8IA 3F7ZA 5JSMA 2WU7A 4MD8E 2ZV2A 3PDTA 2OZOA 1LEZA 5KBRA 5AA9A 1STCE 3ORKA 4YU2A 4BCJA 1PXOA 4WSQA 2OFVA 2VU3A 4I5MA 5FEDA 4JDJA 4H3PA 2NNWB 1A06A 2R4BA 3ET7A 3QGYA 4I20A 3TV6A 2OW3A 2XKCA 3QQHA 3AG9A 4AZWA 2PVNA 3QX2A 4MH7A 2HW6A 4XV9A 4IZ5A 2VGPA 5F1ZA 4I6HA 4G6LA 5CVGA 5DH3A 1B38A 4PL5A 3F66A 5I3OA 2VWZA 3ALOA 3LZBA 3D15A 4R5YA 4FZ6A 3VVHA 5LJJA 1W98A 3UE4A 2WFYA 5E1EA 3KY2A 2I6LA 1JQHA 2UZUE 4GIHA 4ANLA 1FBNA 1H1RA 2IW9A 3C7QA 4I6QA 2GQSA 1OVEA 3OWKA 4IWQA 4QOXA 2BUJA 1Y8GA 2XK4A 4NKAA 5A14A 3N9XA 4H1JA 1NVSA 5I9XA 1WBOA 2BFYA 3EWHA 3NRMA 4W8DA 4ZTMA 3F5GA 3E7VA 4IZYA 3FWQA 2YERA 3O2MA 4GUEA 2UW6A 4PDYA 1IAHA 2KULA 3DKCA 4DH1A 2WQNA 5EDQA 2JD5A 4FTUA 3T3UA 4RJ7A 3RWPA 1NVRA 3TKHA 2C6MA 1NT2A 3A7JA 4RGJA 3MIAA 4IIRA 1UU7A 2OGVA 2VO3A 3EQCA 4I23A 2QCSA 5JN2A 5J1VA 5IQDA 2QO9A 3D2KA 1Q8YA 4K6ZA 4LGDA 4N70A 4YHTA 4ZXTA 3VS3A 4AFJA 2OG8A 3VUTA 3VQHA 4CKRA 2GNHA 1GIJA 3I7CA 4RSSA 4Y5HA 1B6CB 3MFSA 4ZSGA 3NYVA 2VTIA 4F63A 2BIYA 2Y8OA 4AG8A 1URWA 2HZNA 1UVRA 1CKJA 3P9JA 5AM7A 2BAKA 3M42A 1JSVA 1YWNA 3QTWA 5I0BA 3IW6A 3TL8A 2HWOA 3EQFA 2X8DA 4B7TA 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