4IADA

Low temperature x-ray structure of camp dependent protein kinase a in complex with high mg2+ concentration, adp and phosphorylated peptide psp20
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
337
structure length
334
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Insights into the Phosphoryl Transfer Catalyzed by cAMP-Dependent Protein Kinase: An X-ray Crystallographic Study of Complexes with Various Metals and Peptide Substrate SP20.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/peptide
source organism Mus musculus
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
total genus 108
structure length 334
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4iadA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4iadA02
2JKMA 1SM2A 4NJ3A 2I7QA 5M57A 2XCKA 2OSCA 2YN8A 2Z2WA 4NK9A 5BVNA 5M56A 2NRYA 1ZY4A 3A7FA 3PY3A 4JNWA 1YOMA 1ZOGA 3OHTA 4D4SA 4IC7A 4CTBA 2JFMA 4TXCA 4QMUA 2X4ZA 3S0OA 3FXXA 4BTMA 2QC6A 3QZFA 4LL0A 4AW5A 4WRGA 2IVSA 3F5XA 3O23A 2X0GA 3ACKA 4HNFA 4LOOA 4XJ0A 3GNIB 2UW3A 5E8YA 2HXQA 3AXWA 2VWIA 3JXWA 4HCVA 3MFUA 3ORTA 5CYIA 2OH4A 5F1ZA 3RM7A 4M13A 4JIKA 3V5QA 4QNYA 4BDIA 3SA0A 4EC8A 3R9HA 5EI2A 2CGVA 2CHLA 2ZOQA 3UQGA 3FZPA 1REKA 2G2HA 2W1CA 2Y7JA 5CZHA 3QQJA 5F9EA 5CI6A 2BKZA 2C5VA 3G33A 5HI2A 3I5ZA 3AC8A 1I09A 2QCSA 3BRBA 3G0EA 4JOAA 3VQUA 2YM6A 1QPJA 1U54B 5ANIA 3ZRKA 3TKUA 4FV3A 3V51A 3GENA 3FMNA 4F1TA 3OBJA 3WF8A 4RA4A 2O64A 2X9EA 4S32A 5L2TA 4DTAA 3IW8A 2O3PA 4AZWA 3KMMA 3FMEA 4FG9A 5DWRA 5LJJA 5IG1A 4YO6A 4W9WA 5CEPA 4F4PA 4JXFA 4LGDA 1YXXA 3HDNA 2UZUE 1GIHA 5CTPA 2GQSA 1S9IA 1YI6A 4JRNA 4CCUA 5CF4A 4LFIA 2YACA 2NO3A 3W32A 2OF4A 2PVLA 4C59A 2ZVAA 2RGPA 1YXTA 3QALE 2UW5A 2W4KA 3AOXA 4GU6A 4R3RA 4EH7A 3COKA 5IQAA 2C3KA 3FL5A 1OIUA 1WBTA 4IBMA 4KS8A 4BZOA 1PF8A 3TV6A 2B9FA 2VTMA 3ZO3A 3DAKA 3V5JA 2WU6A 3AC1A 3RK7A 4ANSA 1UV5A 3NNUA 1YHWA 2VTLA 4BTJA 2EUFB 2VU3A 3DU8A 3CKXA 4C02A 4XG7A 5JT2A 4FSNA 2X7GA 5C8NA 3U87A 4IVDA 4E6QA 4ZLOA 3IW5A 3QA8A 4QRCA 4DCAA 4RQVA 3T9TA 1H0VA 5AADA 3EB0A 3QU0A 4Y72A 5LVPA 4E8AA 2BAJA 4QYGA 4BCPA 3JS2A 3F3VA 4FKRA 4U7ZA 5M51A 3EOCA 4O0TA 4C62A 3QUEA 4TRLA 3KRWA 4XG4A 1B39A 3E8NA 4O22A 3EZRA 3F3ZA 4K1BA 5EKOA 3FMDA 1DAWA 5DLSA 5HBHA 3BYSA 4MXXA 3VULA 3ZC6A 5CALA 3SV0A 1BYGA 4RJ3A 4GU9A 4UWYA 4YJPA 4GT5A 5AIRA 4RJ5A 5EFQA 4EOOA 3MFSA 4IZYA 1URCA 3MJ1A 4C3PA 3AC5A 3GU6A 4FL1A 5D1JA 3QYZA 3T3UA 4TYHA 4FX3A 4X6RA 4ACGA 3UOLA 4XRJA 3G2FA 5JKGA 3V6RA 2UV2A 2WTCA 2ONLC 1VYZA 4O1PA 4AOTA 4IWQA 5HLNA 3EYHA 4DTKA 4CFNA 4QYFA 5FRIA 3LJ1A 2B9IA 1OECA 1WVYA 3A7GA 3R9RA 2W1HA 3EMGA 2HZ0A 2WNTA 3WYXA 3V5PA 1REJA 3WZDA 4A9YA 4FV9A 5IU2A 2YCRA 3I81A 1NVQA 4EK8A 2W4JA 2CKOA 4XLIA 4KUJA 2J0MB 2R0UA 4FK6A 4FTOA 1QPDA 1YDRE 4EKLA 3DXQA 5KZ0A 3GFEA 2PUNA 4MX9A 2I0YA 2J0JA 4V01A 3MH2A 4BDGA 3PSBA 2YM7A 3UQCA 2BRGA 4FYNA 3UP2A 4FODA 3ACJA 4KIQA 3ET7A 3FQSA 2CN8A 4I1ZA 4LL5A 2CLQA 3KA0A 2W9ZB 4D55A 5HTCA 2BFYA 4QP3A 4TYIA 1ZAOA 3FZ1A 4BTFA 5HVKA 3I5NA 1KE7A 4J71A 4RJ8A 3FE3A 4PMTA 3W2CA 3F9NA 3AT3A 5AR2A 4BCOA 3QD0A 4WBBB 4B99A 3ORPA 3NIEA 4YTHA 1OL7A 1YXSA 4B7TA 3KQ7A 1ZXEA 5EDPA 3Q5IA 3LFEA 4CFVA 4DEIA 3U4WA 2JDTA 3BX5A 5JRQA 2Z7LA 3KVWA 5FDPA 2LAVA 5AAEA 3F69A 4FKIA 1NY3A 5HNBA 3PG1A 4O6EA 4RC4A 5LARA 3VUKA 1H1WA 4DBNA 3PVWA 5AA8A 3R7EA 4YLJA 1T46A 3VUHA 3MIYA 4FIEA 3DDPA 4FKPA 3MH0A 4WIHA 4HCUA 4I24A 4GYIA 2QURA 1MRYA 1WAKA 2P3GX 4BI1A 4C0TA 2ZV9A 3L8PA 4BHNA 3U9NA 4OTGA 1FPUA 2CNQA 1PW2A 4LYNA 3FY0A 5M09A 4L43A 3NR9A 4I92A 2QKWB 4M69A 1XWSA 2HAKA 3EH9A 1MRUA 4ACCA 4KS7A 1XH8A 2I0HA 4H1MA 3CKWA 4GK4A 4XOZA 2GNFA 2XH5A 3ZC5A 3OCTA 5TR6A 2XK9A 3ZONA 4F6UA 5JQ8A 2WQBA 3PXYA 2UW7A 2W17A 3HUCA 4JT3A 4DEHA 3D7ZA 3POZA 3GCUA 3RPYA 4FV4A 4JDKA 4NM7A 3NGAA 2GS2A 2IZRA 1GY3A 1ZZLA 4DGLC 1XHAA 1TQPA 4JQ8A 2QG7A 2UW9A 2X8EA 5FG8A 4C58A 3WE8A 4FKLA 5HCYA 4BBMA 4NIFA 5FQDC 1WBPA 3GI3A 4FT0A 3C7QA 4BYJA 3HGKA 3OCBA 1LUFA 2VTRA 2JLDA 4FBXA 5BYZA 5IDNA 2XEYA 1J3HA 2WB8A 3SXSA 4XLVA 3NW6A 2XK6A 4NEUA 1B38A 4JIAA 4U41A 3HNGA 3JR1A 4O0WA 2JGZA 2VO7A 3B8RA 3R1NA 5AP4A 3RTPA 4C4FA 3BEAA 3LXPA 4G6OA 5I4NA 5K4IA 3F3UA 4UZHA 5IPJA 3LLAA 1Q8TA 1XO2B 4DFZE 3HMMA 4FT7A 3QKKA 3AG9A 4HYSA 3DA6A 4QQTA 3AD4A 4OBPA 5LVLA 3MPMA 4RIXA 2HOGA 3Q6WA 2ITVA 2XIRA 4K2RA 3RAKA 2Y6MA 3WF5A 4BKJA 2XJ1A 1ZMUA 4YP8A 3TV4A 4CFWA 4Y95A 1ZY5A 3CQUA 4KABA 4CNHA 1OL2A 3VBQA 5IQBA 4BCGA 3ORZA 3ZSHA 3P7AA 3ZOSA 4R6VA 3OT8A 4A4LA 3W18A 3NIZA 2DUVA 4QMYA 3EL7A 4F7NA 3POOA 2C6KA 3R6XA 4X2GA 3PJ1A 2HELA 1Q61A 3DBEA 1H1RA 4BCFA 2WGJA 3R2BA 4F7JA 4O7NA 3VS0A 3A8XA 3BCEA 4CKIA 3KRLA 2GQRA 4IC8A 2C68A 4ZTSA 4WG3A 2YCFA 3KMUA 3O0GA 3QHWA 2Q83A 5LCJA 3T3VA 2BAKA 1ZYCA 3D15A 2VTTA 1YXUA 3I1AA 2CSNA 3Q2JA 5IQCA 4E93A 3DDQA 3PDTA 5B2LA 3I6WA 3OC1A 4ANMA 3SG9A 5IUHA 3DGKA 3ZO4A 1FINA 2HZNA 3F2RA 3GC0A 4AP7A 2XNMA 5HVJA 3I7CA 5ETAA 4GYGA 4BICA 4JG6A 1PMEA 2R3PA 4L52A 1K2PA 4O91A 3EQIA 3HRFA 5FXQA 4NUSA 5H2UA 5C27A 3UPXA 4EH4A 3RCJA 4DHFA 4WRSA 1O6KA 3QQUA 3W55A 5CSPA 4MTAA 4RQKA 5EM5A 2VNWA 4S31A 4O7VA 2QLQA 4AZVA 2R3GA 3EIDA 4ITJA 5GZAA 4I5MA 4GVAA 4V05A 1WBVA 1J7LA 2YIXA 4C2VA 1H24A 1BL7A 4D2VA 4MWHA 4ACMA 3MY5A 4TNDA 4F0IA 5IMEA 4O82A 5E8UA 4RZWA 4PPCA 4J8NA 2E2BA 2R9SA 2RFNA 2GHGA 3IW6A 4PPAA 4EH8A 4FTMA 4FMQA 2B9HA 4Q9SA 3BE9A 3IW7A 2YCQA 4BY9E 3OXIA 3FKNA 2OFUA 2GCDA 5DIAA 4KKHA 1A06A 5DE2A 5AA9A 5C8MA 3F3TA 5FTGA 3HYHA 5FM3A 3PXFA 4EHZA 3KCKA 1W0XC 2JAMA 5IQIA 3K5UA 3AD6A 4O0XA 4PDPA 4JS8A 1OPJA 5ANKA 2VAGA 5L2SA 3FLZA 3LLTA 5FGKA 3UO4A 3FC2A 4C36A 3N51A 4ACHA 3ZLXA 3H30A 4KKEA 4NTSA 2OZOA 3IOKA 5EKNA 4PUZA 2YABA 4HPUE 5CS6A 3QRKA 3THBA 4Z16A 4YHTA 4JLCA 3RPRA 1GIJA 2QO7A 2Y4IC 4FIHA 4UMQA 4YR8A 3HMOA 4B8MA 1JBPE 3MWUA 5LQFA 4NTTA 4FKUA 5AV4A 2C3IB 2UW6A 3EYGA 1J1BA 4QPMA 4CMUA 1NT2A 3ZH8A 1UU9A 3LXKA 3E5AA 3LCKA 3TUDA 2OJ9A 1FGIA 2IJMA 3KXGA 2RG5A 3SG8A 1CKIA 5KKRC 1Q97A 2HK5A 3LQ3A 2PZ5A 1JOWB 2XP2A 4JR7A 4HVIA 1UNHA 4XYFA 2XS0A 4RFZA 5GIOE 4XV1A 5TE0A 4RPVA 5DR6A 4GFOA 2BR1A 2VRXA 4GCJA 2WMVA 3A60A 2E9NA 4IWDA 3L8SA 1M14A 4OT6A 3RKBA 3EQCA 4OW8A 4WBOA 2C6OA 4KAOA 3IS5A 2XIZA 4ASZA 4BCQA 1AQ1A 1Q4LA 3UVQA 3OMVA 4JBOA 4V04A 1K9AA 4LRMA 4ORKA 2XKFA 1MQ4A 4CKJA 1ZYLA 4HGEA 5A4TA 3D7TA 2HW6A 2ZV2A 5E7RA 2ERKA 5L2WA 1FVTA 1QCFA 3RK5A 5FLFA 4LUEA 2P0CA 1Q8YA 2V22A 1Z5MA 2PE2A 3GFWA 3OT3A 4QQCA 3S4QA 3DAEA 5KZIA 4XRLA 4XV2A 4FZDB 4M7IA 4ZSJA 5AP7A 4ZMEA 4I3ZA 2XIKA 3JPVA 2H96A 4KWPA 5JFSA 4ZJJA 5C8KA 5J7HA 5CVHA 3PXQA 4MQ1A 2CKEA 4OTFA 3FLQA 1H27A 3RAIA 5KMLA 4BZDA 4ZSLA 4E6DA 2WQEA 1E1XA 1P4OA 3FHIA 3MI9A 4KSPA 5DEWA 4AW1A 4UMPA 5I9XA 3LFQA 2BZKB 1Q99A 2HWOA 3PXRA 3VBXA 3N4UA 4FK3A 1DI8A 1Y8YA 2YDJA 2ZB1A 3PE1A 4BCJA 4F9CA 3LMIA 2WELA 4R78A 3OXTA 3WILA 2B54A 3W2RA 2GNJA 1XJDA 4EC9A 4F0FA 4QO9A 1YWVA 3NLBA 5EI6A 4AN2A 2R5TA 4OTIA 3Q6UA 5M07A 4HOKA 4RBLA 2GHLA 4MD8E 4IMYA 4ZTHA 4DINA 5E9EA 2OWBA 4ZK5A 2FH9A 2PVMA 4U5JA 3EZVA 5J9ZA 4QMPA 3NW7A 3W33A 2B7AA 4L3LA 1F5QA 4O38A 5HQ0A 3S1HA 4GFGA 4Q9ZA 1FVRA 3TKHA 4O83A 3K5VA 3V5TA 2ETRA 4YLLA 5BVDA 1YI4A 5L6PA 3LCSA 1IR3A 1RJBA 5CAVA 3KK9A 1UU3A 3ENHA 4O27B 3VS3A 5H8BA 3S2PA 3EWHA 3LQ5A 2Y4IB 3GOKA 3G51A 2J5EA 4J1RA 1KE8A 3C4XA 3M2WA 2JDRA 3VW6A 2RL5A 2SRCA 3H4JA 4IE9A 2JDOA 3IDBA 2A4LA 3TN8A 3VHEA 3CIKA 3ZM4A 4BFMA 5AUYA 2OG8A 3R7VA 4ACDA 1PRYA 5AP2A 4XOYA 4YZCA 5HGIA 3U51A 2YAKA 5KKRB 4D2PA 2W1IA 5HG8A 4EH2A 5IA1A 5M4FA 4PMPA 4M97A 1GIIA 5E8XA 5JFWA 2VD5A 3BELA 4XMOA 3E64A 4PRJA 5AP5A 5BVWA 5E8WA 4EOIA 3F3WA 3QGYA 4R8QA 2EXMA 3CR0A 4YZBA 5AP3A 3IONA 5CAUA 4BDFA 4EOJA 4LGGA 4AXAA 3A99A 3QCXA 3T9IA 5C4LA 4CXAA 4IB5A 4UY9A 2R3JA 3L9LA 3VS6A 3QFVA 4DT9A 3G9NA 2OZAB 4HYIA 4QT1A 4IFGA 4L3JA 3V6SA 4BYIA 5KMOA 1NA7A 4FT5A 2Z7SA 3R30A 5AMNA 2BILB 3HL7A 1OIQA 4R1YA 4YGAA 2V7AA 4TZRA 4C38A 2ZM1A 2P4IA 4L45A 3O7LD 5A4EA 1OPLA 4RZVA 5F95A 3RNIA 4W4YA 3PSDA 4IM3A 3R7GA 3VVHA 2F7ZE 2YZAA 3BYOA 2QOHA 4FKQA 4JDHA 1FGKA 4TNBA 2W7XA 3ZZWA 4Q5EA 4YSJA 2XNGA 5C4KA 2RSVA 5JGDA 4P5ZA 5L8LA 5GIPE 2X7OA 5HCZA 4MBLA 5FDXA 4AFEA 4EOKA 4D2WA 1DI9A 1GJOA 4KD1A 3KL8A 4QMLA 3ZXZA 3PXKA 3GC8A 3R22A 5CX9A 4DFUA 1CM8A 1H0WA 5DT4A 3A4OX 3GU7A 3I0OA 3LXNA 3U6JA 3BLHA 4BF2A 5BPYA 3HV3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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